Baghdad Science Journal
Not a member yet
3064 research outputs found
Sort by
Green Synthesis and Evaluation of ZnO NPs and study the effect of Their toxic on Honey Bee (Apis mellifera)
Get PDFالخلاصة:
إن الاهتمام البحثي لتحضير المواد النانوية من المنتجات الطبيعية كطريقة التصنيع الخضراء واستخدمها في مختلف التطبيقات الميدانية ، نال اهتمام كبير من خلال التركيب الأخضر للجسيمات النانوية. يمكن اعتبار جسيمات ZnO أكسيد الزينك أحد أكاسيد المعادن الأكثر استخدامًا لمعظم متطلبات المنتجات المستخدمة يوميًا. في هذا البحث تم تحضير جزيئات اكسيد الزينك النانويه باستخدام مستخلص البقدونس Petroselinum crispum) ) ولإجراء الدراسة الأولى للتقييم السام لمركب جزيئات اكسيد الزينك النانويه وجوانب تأثيرها على نحل العسل Apis mellifera) ) . تم تشخيص جزيئات اكسيد الزنك النانويه باستخدام SEM و EDX و XRD و UV-Vis و FTIR الطيفي. تم تطبيق التقييم السمي لـجزيئات اكسيد الزينك النانويه في نحل العسل. تم الحصول على تركيز اكسيد الزنك القاتلة ، وتم تغيير قيم حساب نطاق LC50 خلال 288 ساعة من التغذية لجسيمات اكسيد الزنك النانوية بتركيزات مختلفة (25 ، 50 ، 250 ، 500 مجم لكل 100 مل) وتغيرت قيم التركيز المميت النصفي التي تم الحصول عليها من 275 ، تتناقص إلى 162.55 لمدى البحث بعد كل 24 ساعة من اجراء حسابات التغذية التعرضية . بالإضافة إلى ذلك ، بالنسبة للمجموعة التي عولجت بـ 500 مجم من اكسيد الزنك لكل 100 مل ، لوحظ معدل وفيات أكبر بلمقارنة مع التركيزات الأخرى حيث زادت أكثر من جميع العناصر الأخرى التي تشير إلى التركيزات المذكورة أعلاه ولكن ليس مع المجموعة الضابطة. تم تقديم التصميم الاساس لإنشاء خلية النحل العسل لأول مرة ولم يتم العثور على دراسات سابقة مماثلة في الأدبيات.The research interest in nanomaterials preparation from natural products as a green method and their application in various fields applications, tremendous attention has been taken to the green composition of nanoparticles. ZnO can be considered one of the most widely used metal oxides for most requirements of daily used products. In this research ZnO NPs prepared by using Petroselinum crispum (parsley) extract and to make the first study of toxicological evaluation of ZnO NPs their effect aspects on Honey bees (Apis mellifera). ZnO NPs have been charactarized by using SEM, EDX, XRD, UV-Vis and FTIR Spectroscopy. The toxicological evaluation of ZnO NPs has been applied to a honey bee. The lethal ZnO concentration was obtained, and the LC50 range calculation values were changed during 288 hours of feeding to ZnO nanoparticles at different concentrations (25, 50, 250, 500 mg per 100 ml) and the obtained LC50 values changed from 275, decreasing to 162.55 for the research range times after every 24 hours of exposure feeding calculations. In addition, for the group treated with 500 mg of ZnO per 100 ml, higher mortality was observed compared to other concentrations as it increased more than all other items indicating the above concentrations but not with the control group. The ergonomic design for creating a honey bee shelter was first introduced and no similar investigations were found in the literature
A comparative study of preimplantation embryos development of young and aged mice treated with L-carnitine
Get PDFيعد التقدم في السن لدى الإناث أحد العوامل الرئيسية التي تؤثر على الخصوبة والتكاثر. تهدف الدراسة الحالية لدراسة تأثير العلاج بالكارنتين اليساري على وزن الفئران البالغة اليافعة والمتقدمة في السن وتكوين الأجنة قبل الانغراس . أشتملت هذه الدراسة على أربعين فأرًا أنثى بالغة 8-10 أسابيع و 26-28 أسبوعًا. تم وزن الفئران ألاناث وقسمت إلى أربع مجموعات حسب عمرها (كل مجموعة تحوي عشراناث) وهي مجموعتي السيطرة اليافعة والمتقدمة في السن ومجموعتي المعاملة بالكارنتين اليساري اليافعة والمتقدمة في السن. جرعت مجموعتي السيطرة فمويا بالماء المقطر ، بينما جرعت مجموعتي المعاملة فمويا بالكارنتين اليساري بـ 10 مجم / كجم من الكارنتين اليساري يوميًا لمدة دورتين الى ثلاث دورات شبق.ثم تزاوجت جميع إلأناث مع ذكور بالغين. وزنت الفئران الحوامل بعد يوم واحد من الجماع ثم شرحت الامهات لجمع الأجنة في المراحل الاولية قبل الانغراس. تم فحص وتصنيف الأجنة وتقييم تكوينها وفقًا للدرجات A و B و C و D.
أظهرت النتائج أن التجريع الفموي للكارنتين اليساري يقلل من وزن الجسم لدى الفئران في كل من مجموعتي المعاملة بالكارنتين اليساري اليافعة والمتقدمة في السن معنويا (P≤0.01) وكما عززمن التكوين الجنيني للأجنة من الدرجة A في مجموعتي المعاملة بالكارنتين اليساري اليافعة والمتقدمة في السن بشكل معنوي (P≤0.01). ومع ذلك ، فإن نسبة تكوين الأجنة من الدرجة A في المجموعة اليافعة المعاملة بالكارنتين اليساري أظهرت زيادة معنوية (P≤0.01) بالمقارنة مع مجموعة المعاملة بالكارنتين اليساري المتقدمة في السن. استنتج من هذه الدراسة أن التجريع الفموي للكارنتين اليساري بتركيز10 مجم / كجم يوميا لمدة 2-3 دورات شبق يمكن أن يقلل من وزن الجسم ويزيد نسبة التكوين الجنيني المبكر قبل الانغراس.Female aging is one of the main factors influencing reproductive fertility. The existing experimental study was planned to investigate the L-carnitine (LC) treatment effect on the body weight of adult young 8–10 weeks old and aged 26–28 weeks old female mice and the preimplantation embryonic development of their embryos. This study involved 40 mature young (n=20) and aged (n=20) old female mice. The animals were weighed and divided into 4 groups according to their age (n = 10). The control groups of young and aged mice groups were orally administered distilled water, while the young and aged mice that were treated orally with 10 mg/kg LC daily for 2-3 estrous cycles were considered as treated groups. Then, all female mice were mated with adult males. The weight of pregnant mice on 1-day post coitum was recorded and then euthanized to harvest early cleavage embryos. The embryo development was examined and evaluated their grading according to A, B, C and D. The results showed that the body weight of mice in both young LC and aged LC groups reduced significantly (P≤0.01). The grade A embryo in 1-day post coitum in young and aged LC groups improved significantly (P≤0.01). However, the development of embryos grade A in the young LC group was higher than that of the aged LC group. It was concluded from these findings that the oral supplementation of LC can reduce body weight and improve the preimplantation embryonic development proportions
Acoustic and Gamma-ray attenuation studies of K2O-PbO-SiO2 glass system
Get PDFتم إجراء فحوصات صوتية وأشعة جاما لنظام الزجاج K2O-PbO-SiO2 لاستكشاف بنيته وخصائص التوهين بأشعة جاما. أجريت دراسات صوتية لدراسة تأثير تركيز أكسيد الرصاص على توصيل الهيكل الزجاجي. تم تقدير الخصائص المرنة للحصول على معلومات تتعلق بأبعاد الشبكة وصلابةها. تم حساب معامل التوهين الشامل لأشعة جاما نظريًا وتجريبيًا عند قيم طاقة الفوتون 511 كيلو فولت، 662 كيلو فولت و1274.0 كيلو فولت. تم مقارنة القيم التجريبية لمعاملات توهين أشعة جاما بالقيم النظرية المحسوبة باستخدام برنامج NIST-XCOM. تمت مقارنة نتائج طبقة نصف القيمة (HVL) للزجاج المحضر مع خرسانة الفريت لاستكشاف نطاق الزجاج الذي يحتوي على الرصاص كمرشح مناسب لمواد الحماية من الإشعاع.Acoustic and gamma ray investigations of K2O-PbO-SiO2 glass system have been carried out to explore their structure and gamma-ray attenuation properties. Acoustic studies are carried out to study the effect of concentration of lead oxide on the connectivity of the glass structure. Elastic properties are estimated for getting information regarding the dimensionality and rigidity of the network. Gamma -ray mass attenuation coefficient is calculated theoretically as well as experimentally at 511KeV, 662KeV &1274.0KeV photon energy values. Experimental values of Gamma-ray attenuation coefficients are compared to theoretical values computed using NIST-XCOM software. Results of half value layer (HVL) for prepared glasses are compared with ferrite concrete to explore the scope of lead-based glasses as suitable candidates for radiation shielding materials
Study the Effects of Pure Tin Oxide Nanoparticles Doped with Cu, Prepared by the Biosynthesis Method, on Bacterial Activity
Get PDFفي هذه الدراسة ، تم تشويب جسيمات SnO2 النانوية بنسبة 2٪ بالوزن من النحاس بطريقة التخليق الحيوي. تم استخدام المواد الحيوية SnCl2.2H2O و CuCl2.2H2O و ESM كأغشية قشر البيض كمواد خام. تم تلدين العينات عند 550 درجة مئوية لمدة 3 ساعات. تم الحصول على الفعالية البكتيرية ضد سلالات المكورات العنقودية الذهبية سالبة الجرام و S. aureus إيجابية الجرام وتثبيط أعلى لتركيزات المكورات العنقودية الذهبية من E- coli. تم استخدام طريقة MIC لأدنى تركيز مثبط. أظهرت نتائج XRD أن العينات تبلورت ضمن النوع رباعي الزوايا الروتيل وأن متوسط حجم البلورة ل SnO2 النقي و SnO2: Cu كان (24.2 ، 16.6 )نانومتر على التوالي ، كذلك تم اجراء اختبارات SEM و AFM.كشفت دراسات UV-vis التحليل الطيفي للانعكاس عند فجوة الطاقة لـ SnO2 ، و SnO2: Cu 2٪ هو (4.30،4.35) الكترون فولت على التوالي ، وأظهرت نتائج AFM معدل الخشونة للعينات المحضرة حيث كان(6.34،9.13) نانومتر على التوالي. كما تم أجراء فحص ال EDX للعينات المعدة. الهدف من العمل هو إنشاء جزيئات نانوية SnO2 نقية من خلال التخليق الحيوي النشط ودراسة تأثير تعاطي المنشطات ب Cu ودراسة تاثيرها على خواصها التركيبية والبصرية وايضا في كيفية استخدامها كمضاد بكتيري.In this study, pure SnO2 nanoparticles were doped with 2% at wt. of copper by biosynthesis method. As raw materials, SnCl2.2H2O, CuCl2.2H2O, and ESM biomaterial were used as eggshell membranes. Samples were annealed at 550 ° C for 3 h. The bacterial activity against E-coli Gram-negative and S. aureus Gram-positive strains and higher inhibition of concentrations in S.a-ureus was obtained from E-coli. The MIC method was used for the minimum inhibitory concentration. The results of XRD showed that the samples crystallized within the tetragonal rutile type and that the average crystal size is pure SnO2 and SnO2: Cu (24.2, 16.6) nm respectively .SEM and AFM tests were also carried out.The UV-Vis studies revealed reflection spectroscopy at the energy gap of SnO2, and SnO2: Cu 2% is (4.30, 4.35) eV respectively. The AFM results showed the roughness rate of the prepared samples (6.34, 9.13) nm respectively. An EDX test was also performed for the prepared samples. The aim of the work is to create pure SnO2 nanoparticles through active biosynthesis study the effect of doping it with Cu and study its effect on its structural and optical properties as well as how to use it as an antibacterial
The Significance of Carbohydrate Antigen 19-9, Carcinoembryonic Antigen, Calcium and Zinc as Biomarkers in Sera of Colorectal Cancer Patients
Get PDFسرطان القولون والمستقيم هو اضطراب يبدأ حصريا في القولون والمستقيم وينجم عن تكاثر الشاذ للخلايا الظهارية الغدية في القولون. من المعلوم أن مستضد الكربوهيدرات 19-9 والمستضد السرطانى المضغى والكالسيوم والزنك يلعبون دورا هاما فى امراض ورم القولون والمستقيم. الهدف من هذه الدراسة هو التحقيق في مستويات مصل لمستضد الكربوهيدرات 19-9 و المستضد السرطاني المضغي والكالسيوم والزنك فى مرضى سرطان القولون والمستقيم. في هذه الدراسة تم البحث عن الأهمية الحيوية لمستضد الكربوهيدرات 19-9 ومستضد السرطاني المضغي والكالسيوم والزنك في تطور السرطان من خلال مقارنة مستويات مصل مرضى المصابين بسرطان القولون والمستقيم مع مجموعة الاصحاء في مستشفى ناناكالي في اربيل. تم فحص مستويات مستضد الكربوهيدرات 19-9 و مستضد المصل السرطاني المضغي و الكالسيوم والزنك في 50 مريضا مصابا بسرطان القو لون والمستقيم و 50 من مجموعة الاصحاء. تم العثور على علاقة أيجابية كبیرة بين المستضد الكربوهيدرات 19-9 ومستضد السرطانى المضغي.( P<0.0165, r= 0.37230) و ارتباط سلبي غير معنوي بين المستضد الكربوهيدرات 19-9 مع الكالسيوم (P=0.77, r= -0.0471) والزنك .(P=0.6334r= -0.07676) وفقا لهذه الدراسة ، هناك علاقة مباشرة بين سرطان القولون والمستقيم ومستويات مصل الدم لكل من مستضد الكربوهيدرات 19-9 ، مستضد السرطانى المضغي ، الكالسيوم والزنك. و تظهر النتائج بشكل ملحوظ القيمة العالية لمصل المستضد الكربوهيدرات 19- 9 (p<0.0001) و مستضد السرطانى المضغي P<0.0001)) و انخفاض كبير في قيم كل من الكالسيوم 0.0011) ( والزنك (0.0046) في مرضى سرطان القولون والمستقيم عند مقارنتها بمجموعة الاصحاء. النتائج التي توصلنا اليها تظهر ان زيادة مستويات المستضد الكربوهيدرات 19-9 ومستضد السرطاني المضغي و انخفاض مستويات الكالسيوم والزنك يمكن ان التسبب في ظهورسرطان القولون والمستقيم وتطوره.Colorectal cancer (CRC) is a disease that begins exclusively in the colon or rectum and is caused by an abnormal proliferation of glandular epithelial cells in the colon. Carbohydrate antigen 19-9 (CA19-9), carcinoembryonic antigen (CEA), calcium (Ca), and zinc (Zn) are recognized to play a significant role in colorectal tumor pathogenesis. The aim of this study is to detect serum concentrations of carbohydrate antigen 19-9, carcinoembryonic antigen, calcium, and zinc in CRC. The current study investigated the vital roles of carbohydrate antigen 19-9, carcinoembryonic antigen, calcium, and zinc in cancer development by comparing serum levels of colorectal cancer patients with those of the healthy control group at Erbil's Nanakaly Hospital. The concentrations of serum carbohydrate antigen 19-9, carcinoembryonic antigen, calcium, and zinc in 50 colorectal cancer patients and 50 from the healthy control group have been examined. A significant positive correlation was found between CA19-9 and CEA (p<0.0165, r = 0.3723). Also, a non-significant negative correlation between CA19-9 and calcium (P=0.77, r= - 0.0471) and zinc (P=0.6334, r= - 0.07676) was found. This study demonstrates a direct relationship between CRC and serum levels of (CA19-9, CEA, Ca, and Zn). The result showed significantly high values of serum CA19-9 (p<0.0001), CEA (p<0.0001) and significant decreases in Ca (p=0.0046) and Zn (p=0.0011) in patients with CRC when compared with healthy group. Our findings demonstrate that increased levels of CA19-9 and CEA, and decreased levels of Ca and Zn can be associated with the pathogenesis and progression of CRC
A Comparison between Backpropagation Neural Network and Seven Moments for More Accurate Fingerprint Video Frames Recognition
Get PDFفي العصر الحديث للتداخلات الإلكترونية ، ظهرت الحاجة إلى طرق أكثر أمانًا لحماية المعلومات الحيوية. كلمات السر هي بالفعل وسيلة بارزة وآمنة ، لكنها عرضة للنسيان ، خاصةً إذا كانت طويلة ومعقدة. الطريقة الأكثر فعالية هي استخدام بصمات الأصابع البشرية. بصمات الأصابع تكون وحيده من نوعها لكل شخص. لا يوجد شخصان لهما نفس البصمة حتى لو كانا توأم. هذا يجعلها طريقة آمنة للغاية والتي لا يمكن تكرارها أو نسيانها. الهدف من هذا البحث هو المقارنة بين الشبكه العصبيه ((BPNN و العزوم السبعه للتعرف على بصمات الأصابع بشكل أكثر دقة داخل إطارات الفيديو. الطريقة الأولى هي تطبيق "العزوم السبعه" والطريقة الثانية هي تطبيق الشبكه العصبيه) على نقاط الاهتمام المستخرجة من كل إطار. تم استخدام كاشف الزاوية SUSAN لاستخراج نقاط الاهتمام من كل إطار. تم تطبيق المقارنة على عدة عينات من إطارات الفيديو وأظهرت النتائج أن طريقة BPNN أثبتت أنها أكثر دقة حتى لو كانت بصمة الإبهام تحتوي على الكثير من البيانات المشوهة أو وحدات البكسل غير الواضحة.In this modern age of electronic interactions, more secure methods are required to protect vital information. Passwords are indeed a prominent and secure method, but they are subject to being forgotten, especially if they are long and complex. A more efficient way is the use of human fingerprints, which are unique to each person. No two people would have the same fingerprint even if they were a twin, which makes it a very secure method that cannot be duplicated or forgotten. This research aims to compare seven moments and backpropagation for more accurate fingerprint recognition within video frames. The first method is the "seven moments," and the second method is the Backpropagation Neural Network (BPNN), both applied to the interest points that are extracted from each frame. For extracting the interest points from each one of the frames, Smallest Univalue Segment Assimilating Nucleus (SUSAN), a corner detector, was employed. Multiple examples of video frames were used in comparison, and the findings demonstrated that the BPNN approach was more accurate even when the fingerprint had a significant amount of corrupted data or unclear image pixels
Radioactive Source-Detector System: Design and Monte Carlo Opinion
Get PDFتم في البحث الحالي تصميم و كتابة برنامج محاكاة حاسوبي وفقاً لطريقة مونت كارلو ليكون بمثابة نظام عملي إفتراضي بديلاً عن النظام الحقيقي. تم إختبار البرنامج إحصائياً و هندسياً وعددياً لنظام إفتراضي لمصدر مشع- كاشف. تم تنفيذ البرنامج لكاشف آيوديد الصوديوم ولعداد كايكر لمدى من الطاقة يصل إلى 10 MeV. تم استخدام قانون الأعداد الكبيرة (LLN) ونظرية النهاية المركزية (CLT) لاختبار دقة وضبط سير عمل البرنامج والإشارة إلى مدى قرب النتائج من متوسطاتها، وإحصائيًا، إلى أي مدى تميل إلى التوزيع الطبيعي. بشكل عام، أظهرت نتائج عدد من أنواع كفاءة الكاشف توافقاً كبيراً مع النتائج التجريبية المنشورة ونتائج عدد من البرامج العالمية ضمن نسبة خطأ 0,02-5% (أي دقة 95-99,98%) و بمستوى دلالة إحصائية يعكس إحكام خوارزمية المحاكاة. إن التخمين الدقيق والمضبوط للمحاكاة الحالية يمنحها الموثوقية المطلوبة. كما أظهر برنامج المحاكاة الحالي مرونة و فعالية عالية في تصميم أي نظام مصدر- كاشف نووي و تزويد العاملين أو المجربين ذات العلاقة بمؤشرات تساعد في التصميم الأمثل للمنظومة من حيث المكونات و هندسية النظام بأقل مدة زمنية. والتي قد تستغرق من بضعة ثواني الى بضعة دقائق لزمن تنفيذ بإستخدام حاسوب شخصي بمواصفات عادية. على عكس التجارب المختبرية التي قد تستغرق من عدة دقائق الى عدة ساعات. إضافة الى توفير بيئة عمل مثالية خالية من الإشعاع تماما". كما يقدم البرنامج الحالي فهماً عميقاً لما يحدث من تفاعلات في النظام الفيزيائي العملي الحقيقي.In the current research, a computer simulation program was designed and written according to the Monte Carlo method to serve as a virtual practical system instead of a real one. The program has been statistically, geometrically and numerically tested for virtual radioactive source-detector setup. The simulation program is carried out for NaI(Tl) detector, and once for Gieger-Muller counter, for a range of energy up to 10 MeV. The Law of Large Numbers and the Central Limit Theorem were used to test the accuracy and precision of the program’s workflow and an indication of how the results are close to their averages and, statistically, how they tend to a normal distribution. Generally, results of a number of detector efficiency types showed a high agreement with published experimental and several global codes results within a percentage error of ~ 0.02-5% (i.e. the accuracy ~ 95-99.98%) and the significance level reflects the precise of the algorithm of simulation. The accurate and precise estimation of the current simulation gives it the desired reliability. The current simulation program also showed flexibility and effectiveness in designing any nuclear source-detector system and providing the relevant workers or experimenters with indicators that help in the optimal design of a system in terms of equipment and geometrical configuration with the least time. It may take a few seconds to a few minutes of execution time for a personal computer with normal specifications. Unlike laboratory experiments which may take from several minutes to several hours. In addition, it provides an ideal work environment that is completely free of radiation hazards. Also, the current simulation provides a deep understanding of the interactions that occur in a real physical practical system
Deep Learning based Models for Drug-Target Interactions
Get PDFيعتبر منهج تطوير الأدوية بطيئًا ومكلفًا ويحتمل الفشل - يختبر العلماء ملايين المركبات ، لكن القليل منها فقط ينجح في إجراء الاختبارات قبل السريرية أو السريرية. يعتبر التعلم الآلي وهو فرع من الذكاء الاصطناعي ، موضوعًا سريع التوسع تستخدمه العديد من شركات الأدوية بشكل متزايد. يمكن أن يساعد دمج تقنيات التعلم الآلي في عملية تطوير الأدوية في أتمتة عمليات المعالجة والتحليل المتكررة للبيانات ، ويمكن استخدام تقنيات ML في عدة مراحل من تطوير الأدوية ، بما في ذلك التفاعلات الدوائية المستهدفة. وهي عنصر مهم في عملية تطوير الدواء. عندما يرتبط عقار (جزيء كيميائي) بهدف (بروتينات أو أحماض نووية) ، يُقال إنه يرتبط ، ويغير سلوكه / وظيفته البيولوجية ، ويعيده إلى طبيعته. يُعد تنبؤ DTI جزءًا أساسيًا من عملية DD لأنه قد يؤدي إلى تسريع التكاليف وتقليلها ، ولكنه يمثل تحديًا ومكلفًا لأن المقايسات التجريبية لا تستغرق وقتًا طويلاً فحسب ، بل تكون باهظة الثمن أيضًا. أظهرت الأساليب القائمة على التعلم العميق نتائج مشجعة في التنبؤ بالتفاعلات المستهدفة للأدويةDTI) ) في السنوات الأخيرة. في هذه الورقة ، نقترح هيكلين جديدين للتعلم العميق للتنبؤ بالتفاعلات المستهدفة للدواءDTI) ). يستخدم النموذج الأول الشبكات العصبية لتمرير الرسائل MPNN) ) لتشفير الأدوية والوحدات المتكررة ذات البوابات ثنائية الاتجاه Bi-GRU)) لتشفير البروتين. بينما يستخدم النموذج الثاني Bi-GRU لتشفير الأدوية وترميز البروتين. تم تدريب النموذجين وتقييمهما على مجموعة بيانات معيارية. توضح نتائجنا أن نماذجنا تتفوق في الأداء على أحدث أساليب التنبؤ DTI وهي نهج واعد للتنبؤ ب DTI بدقة عالية.The typical drug development approach is slow, costly, and fraught with failure - scientists examine millions of compounds, but only a few make it to preclinical or clinical testing. Machine learning (ML), a subset of AI, is a fast-expanding subject many pharmaceutical businesses increasingly utilize. Incorporating machine learning technologies into the drug development process can aid in automating repetitive data processing and analysis processes. ML techniques may be used at several stages of drug development, including drug property prediction, drug-target interaction (DTI) prediction, and De Novo drug design. DTIs are a critical component of the drug development process. When a drug (a chemical molecule) attaches to a target (proteins or nucleic acids), it is said to bind; it alters its biological behavior/function, returning it to normal. DTI prediction is an essential part of the Drug Discovery process since it may speed up and decrease costs, but it is challenging and costly because experimental assays take a long time and are expensive. In recent years, deep learning-based approaches have demonstrated encouraging results in predicting DTI. This paper developed two deep-learning architectures to predict drug-target interactions. The first model uses message-passing neural networks (MPNN) for drug encoding and bidirectional gated recurrent units (Bi-GRU) for protein-encoding. The second model uses Bi-GRU for drug encoding and protein encoding. The two models were trained and evaluated on several benchmark datasets. Our results demonstrate that our models outperform state-of-the-art DTI prediction methods and are a promising approach for predicting DTI with high accuracy
Limit Cycles of the Three-dimensional Quadratic Differential System via Hopf Bifurcation
Get PDFتم في هذه الدراسة النظر في النظام التفاضلي التربيعي ثلاثي الأبعاد، حيث يصبح نقطة الأصل الإحداثيات نقطة توازن هوبف. تم دراسة وجود واستقرار الدورات النهائية التي تنبثق من نقطة هوبف. يتم حساب معاملات ليبانوف المرتبطة بنقطة هوبف باستخدام طريقة الإسقاط. أولاً، تم تحديد أربع عائلات من شروط المعلمات التي من خلالها يمكن للنظام التفاضلي التربيعي ثلاثي الأبعاد أن يظهر البعد الثالث لتشعب هوبف. تم إعطاء الدليل التحليلي لكل مجموعة من الحالات المعلمية عن طريق حساب معاملات ليبانوف، تصفير لقيمة معاملات ليبانوف الأولى و الثاني و غيرالصفري لمعاملات ليبانوف الثالثة. تم تقديم الشروط الواضحة لوجودية واستقرارية ثلاث دورات النهائية ناشئة عن كل عائلة من تشعبات هوبف. يُظهر ناتج الوجود نقطة هوبف مستقرة (غير مستقرة)، مصحوبة بظهور دورتين حديتين مستقرتين (غير مستقرة) جنبًا إلى جنب مع دورة حدية واحدة غير مستقرة (مستقرة) في جوار النقطة الأصل غير المستقر (المستقر) لنظام المعادلة التربيعية ثلاثية الأبعاد. بالإضافة إلى ذلك، يتم استخدام النتيجة لاستكشاف الدورات النهائية لنظام الجذب الفوضوي n-scroll، والذي له العديد من الاستخدامات العملية، بما في ذلك الاتصال الآمن، والتشفير، وتوليد الأرقام العشوائية، والروبوتات المتنقلة المستقلة. تم اشتقاق الشروط التي بموجبها تصبح نقطة الأصل لهذا النظام هي نقطة هوبف، ويمكن أن توجد ثلاث دورات نهائية حول نقطة هوبف. وأخيرًا، توضح العروض العددية أن النظام يخضع لتشعب هوبف فوق الحرج، مما يؤدي إلى دورتين حديتين مستقرتين وواحدة غير مستقرة. وعلاوة على ذلك، تم التحقق من كافة النتائج.In this study, the quadratic 3-dimensional differential system is considered, in which the origin of the coordinate becomes the Hopf equilibrium point. The existence and stability of limit cycles that emerge from the Hopf point are being investigated. The Lyapunov coefficients connected to the Hopf point are calculated using the projection method. First, four families of parameter conditions are driven by which the quadratic 3-dimensional differential system can exhibit codimension three of the Hopf bifurcation. The analytical proof of each parameter family of conditions is given by calculating the Lyapunov coefficients, the vanishing of the first, sconed Lyapunov, and the non-zero of the third Lyapunov coefficients. The explicit conditions are presented for the existence and stability of three limit cycles arising from each family of Hopf bifurcations. The output of existence displays a stable (unstable) Hopf point, accompanied by the emergence of two stable (unstable) limit cycles alongside one unstable (stable) limit cycle in the neighborhood of the unstable (stable) origin of the coordinated 3-dimensional quadratic system. In addition, the outcome is utilized for exploring the limit cycles of the n-scroll chaotic attractor system, which has many practical uses, including secure communication, encryption, random number generation, and autonomous mobile robots. The conditions are derived under which the origin point of this system becomes the Hopf point, and three limit cycles can exist around the Hopf point. Finally, the numerical demonstrations show that the system undergoes a supercritical Hopf bifurcation, resulting in two stable and one unstable limit cycle. Furthermore, all results are verified.
The Effect of Piracetam Administration on Cerebral Palsy Prevention in Rat Fetuses Born To Pregnant Rats by Determining Bdnf Levels in Brain Tissue
Get PDFالشلل الدماغي هو السبب الأكثر شيوعًا للإعاقة لدى الأطفال في جميع أنحاء العالم، ويقدر معدل انتشاره بـ 1.5-4 لكل 1000 طفل؛ ارتفاع معدل الانتشار بين السكان ذوي الموارد المنخفضة (ما يصل إلى 10 لكل 1000 طفل). عامل التغذية العصبية المشتق من الدماغ (BDNF) هو مُعدِّل قوي للعديد من الوظائف العصبية التي تحمي الوليد أو الدماغ النامي من الإصابة الإقفارية. يتم تحفيز التعبير عن GluN3A، الذي يلعب دورًا وقائيًا للأعصاب، بسرعة أثناء نقص تروية الدماغ ونقص الأكسجة. قيمت هذه الدراسة تأثير إعطاء البيراسيتام على مستويات BDNF وGluN3A في أنسجة المخ لتحديد قدرته على الوقاية من الشلل الدماغي. في هذه الدراسة التجريبية مع تصميم مجموعة مراقبة بعد الاختبار فقط، تم إنشاء نموذج فأر للشلل الدماغي عن طريق حقن الفئران الحوامل بـ LPS في أيام الحمل 15 و17 و19؛ تم إعطاء البيراسيتام عن طريق الفم في اليوم 10.5. تم تقييم مستويات البروتين BDNF وGluN3A وتعبير mRNA في أنسجة المخ الجنينية لـ 36 شخصًا باستخدام مقايسة الامتصاص المناعي المرتبط بالإنزيم (ELISA) وتفاعل البوليميراز المتسلسل في الوقت الحقيقي (RT-PCR). اختلفت مستويات البروتين BDNF وGluN3A في دماغ الجنين بشكل كبير بين مجموعتي التحكم والعلاج (P <0.05). ولوحظ انخفاض في مستويات الرنا المرسال ومستويات البروتين لـ BDNF وGluN3A في جميع مجموعات العلاج، لكن التحليل الإحصائي لـ RT-PCR لم يكشف عن فروق ذات دلالة إحصائية بين مجموعتي المراقبة والعلاج (p > 0.05). تشير هذه النتائج إلى أن البيراسيتام يمكن أن يمنع الشلل الدماغي في نموذج الفئران الجنينية الذي تم إنشاؤه عن طريق حقن LPS قبل الولادة، كما تم تقييمه من خلال التعبير البروتيني لـ BDNF وGluN3A mRNA.Cerebral palsy is the most common cause of disability in children worldwide, estimated prevalence of 1.5–4 per 1000 children; the higher prevalence in low-resource populations (up to 10 per 1000 children). Brain-derived neurotrophic factor (BDNF) is potent modulator of many neuronal functions that protect the newborn or developing brain from ischemic injury. The expression of GluN3A, which plays a neuroprotective role, is rapidly induced during cerebral ischemia and hypoxia. This study assessed the effect of piracetam administration on BDNF and GluN3A levels in the brain tissue to determine its potential to prevent cerebral palsy. In this experimental study with a post-test-only control group design, a rat model of cerebral palsy was established by injecting pregnant rats with LPS on gestation days 15, 17, and 19; piracetam was administered orally on day 10.5. BDNF and GluN3A protein levels and mRNA expression in the foetal brain tissue of 36 subjects were evaluated with enzyme-linked immunosorbent assay (ELISA) and real-time polymerase chain reaction (RT-PCR). BDNF and GluN3A protein levels in the foetal brain differed significantly between the control and treatment groups (p < 0.05). A decrease in the mRNA and protein levels of BDNF and GluN3A was observed in all treatment groups, but the statistical analysis of RT-PCR did not reveal significant differences between the control and treatment groups (p > 0.05). These results indicate that piracetam can prevent cerebral palsy in a foetal rat model established via prenatal LPS injection, as assessed by the protein expression of BDNF and GluN3A mRNA