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    Utiliser la modélisation non linéaire hiérarchisée et la simulation pour planifier des études cliniques complexes

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    Clinical studies are becoming increasingly complex in their design, implementation, and analysis. Their planning often faces intractable mathematical estimations. To avoid oversimplifying the design due to a lack of suitable formulas, one solution is to break down models into successive levels, using numerical approximations at each stage, and integrating them through computer simulations. We present three applications of this approach. First, in cancer pharmacology, we integrate pharmacokinetics, pharmacodynamics, and toxicity sub-models to construct an in silico model of patients, incorporating realistic inter-patient variability. This model enables virtual trials on the combined use of primary culture-based, phenotypic companion diagnostics, and therapeutic drug monitoring, an effective yet underutilized intervention in oncology. By modelling treatment evolution month by month, we account for oncologists' management of toxicity and dose adjustments. We estimate expected gains in progression-free survival and define a performance threshold that these innovations should meet before clinical translation. Second, in clinical trials with multiple candidate interventions, we introduce distributive randomization, where each patient receives a predefined number of randomly selected interventions. Our simulations show that this design is effective except in certain specific cases. We propose variations to address these exceptions. For this study, we developed an adaptive algorithm for sample size calculation by iterative simulations around the target value, which has then shown itself useful for other complex designs. We extend this method to a varying continuous design parameter, with preliminary results obtained at speeds allowing iterative exploration without needing any specific analytical formula. Third, in observational studies on healthcare quality using medico-administrative databases, we analyze the impact of heterogeneous data validity on mortality comparisons adjusted for case-mix. We use a centrally recoded sample to standardize the interpretation of comorbidities and apply a hierarchical Bayesian model to explicitly quantify the tendency to exaggerate or minimize comorbidities. We integrate this tendency into adjusted mortality regressions, demonstrating a significant impact on these comparisons. This highlights a general issue in database studies: failing to adjust lacks medical relevance, yet adjusting introduces biases related to heterogenous data validity. In these three examples, we demonstrate that breaking down complex clinical problems into explicitly simulatable steps allows for sophisticated study planning, providing greater flexibility for methodologists and paving the way for faster, more intensive clinical research.Les études cliniques deviennent de plus en plus complexes, que ce soit dans leur conception, leur mise en œuvre ou leur analyse. Leur planification se heurte souvent à des estimations mathématiques intraitables. Pour éviter de sursimplifier le design faute de formules adaptées, une solution consiste à décomposer les modèles en niveaux successifs, en utilisant des approximations numériques à chaque niveau, puis à les intégrer par simulation informatique. Nous présentons trois applications de cette approche. Premièrement, en pharmacologie du cancer, nous intégrons des sous-modèles de pharmacocinétique, pharmacodynamie et toxicité pour construire un modèle in silico des patients, avec une variabilité inter-patient réaliste. Ce modèle permet de mener des essais virtuels sur l'utilisation conjointe de diagnostics compagnons basés sur le phénotypage en culture primaire, et du suivi thérapeutique pharmacologique, une intervention efficace mais sous-utilisée en oncologie. En modélisant l'évolution du traitement mois par mois, nous intégrons la gestion de la toxicité par l'oncologue et l'adaptation des doses. Nous estimons les gains attendus sur la survie sans progression et définissons un seuil de performance que ces innovations doivent atteindre avant leur transfert en clinique. Deuxièmement, dans les essais cliniques avec de nombreuses interventions candidates, nous introduisons la randomisation distributive, où chaque patient reçoit un nombre prédéfini d'interventions, choisies aléatoirement. Nos simulations montrent que ce design est efficace, sauf dans certains cas particuliers. Nous proposons des variations pour gérer ces exceptions. Pour cette étude, nous avons développé un algorithme adaptatif de calcul de la taille de l'échantillon, par simulations successives autour de la taille cible, qui s'est révélé d'utilité générale pour les essais complexes. Nous avons aussi étendu cette méthode pour faire varier un paramètre continu du design, avec des résultats préliminaires obtenus à des vitesses permettant une exploration itérative sans formule analytique spécifique. Troisièmement, dans les études observationnelles sur la qualité des soins à partir de bases médico-administratives, nous analysons l'effet de la validité hétérogène des données sur les comparaisons de mortalité ajustées sur le case-mix. Nous utilisons un échantillon recodé centralement pour homogénéiser l'interprétation des comorbidités et appliquons un modèle bayésien hiérarchique pour quantifier la propension à exagérer ou minimiser les comorbidités. Nous intégrons cette propension dans les régressions de mortalité ajustées, montrant un impact significatif sur ces comparaisons. Ceci met en lumière un problème des études sur bases de données : ne pas ajuster n'a pas de sens médical, mais ajuster introduit des biais liés à la validité hétérogène des données. Dans ces trois exemples, nous montrons que décomposer des problèmes cliniques complexes en étapes successives simulables permet de planifier des études sophistiquées, offrant plus de flexibilité aux méthodologistes et ouvrant la voie à une recherche clinique plus rapide et intensive

    Développement d'inhibiteurs peptidiques du virus de la grippe

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    Seasonal influenza viruses cause hundreds of thousands of deaths every year while zoonotic strains can generate serious pandemics. The high rate of virus genetic mutation limits the use of currently available antivirals and creates a demand for new molecules targeting alternative mechanisms with low resistance potential. Host-directed antivirals target host proteins that are essential for virus replication and should have a low resistance potential. Here we present our development of peptides that block the assembly of a non-core component of the 1.7 MDa human spliceosome. This is essential for influenza replication as it catalyses the pre-mRNA splicing of the viral NS segment into NS1 and NS2 forms. The non-core component comprises the RED-SMU1 complex with which the viral polymerase interacts. Disruption of the RED-SMU1 interaction reduces NS pre-mRNA splicing and inhibits virus replication with no detectable effect on cell viability. We built structure-guided phage display libraries of 10^8 random variants of the natural RED peptide and selected for high affinity binders to SMU1. This was complemented by a neural network-based protein design approach. Multiple hits were characterised using ELISA, NGS and biophysical methods, revealing nanomolar affinities and alternative binding motifs. Biophysical, structural and cell-based methods have been used to characterise the binding and inhibition mechanisms of these synthetic peptides.La grippe saisonnière cause la mort de centaines de milliers d’individus chaque année, tandis que les souches zoonotiques provoquent régulièrement de graves pandémies. Le haut taux de mutation du génome viral limite l’utilisation d’antiviraux ciblant directement influenza, il est donc nécessaire de développer de nouvelles molécules ciblant des mécanismes viraux ou cellulaires différents et ayant un faible potentiel de mutation. Les antiviraux dirigés contre l’hôte ne cible pas le virus mais plutôt des protéines de l’hôte nécessaires à la réplication du virus, ainsi, l’apparition de résistance est beaucoup moins probable. Nous avons donc développé des peptides qui bloquent l’assemblage d’un complexe protéique accessoire du spliceosome humain. Ce complexe est essentiel pour le prolifération du virus car il catalyse l’épissage des ARNs pré-messagers du segment NS en ARNm codant pour les protéines NS1 et NEP. Ce complexe protéique comprend les protéines RED et SMU1, interagissant directement avec la polymérase virale. La rupture de l’interaction entre RED et SMU1 inhibe l’épissage des pré-ARNm de NS, sans qu’aucun effet sur la viabilité cellulaire ne puisse être détecté. Des bibliothèques de 10^8 peptides différents ont été conçues, en étudiant la structure du complexe RED-SMU1 sauvage et en imitant un domaine de fixation naturel de RED. Les peptides les plus affins pour SMU1 ont été sélectionnés par phage display. Des peptides supplémentaires ont également été générés par une approche bioinformatique utilisant un neural network. Les peptides les plus prometteurs ont été caractérisés par ELISA et NGS, puis des méthodes biophysiques, structurales et cellulaires ont permis d’identifier des peptides ayant une affinité de l’ordre du nanomolaire pour SMU1 tout en présentant des motifs différents

    Ecologie des communautés des mares et étangs alpins dans un contexte de changement climatique

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    In the context of an unprecedented decline in biodiversity, exacerbated by accelerating global warming, one-third of species dependent on aquatic ecosystems are threatened with extinction. The effect of climate change on the biodiversity in some of these ecosystems is still poorly understood. This is the case for alpine ponds, which are home to endemic, rare and endangered species. Alpine zones (i.e. above the tree line) are present on every continent and provide important refuge for cold adapted species. Alpine zones are less exposed to direct pressure from Homo sapiens than other areas of the planet due to lower population densities and limited habitat destruction. Alpine zones are therefore a highly relevant area of study to better understand the effects of climate change on biodiversity. The study of alpine zones offers a unique opportunity to study the effects of climate change on biodiversity, while more easily disentangling them from the local effects of direct Homo sapiens related pressures. In addition, due to the altitudinal gradient, species movements associated with climate warming occur over shorter distances than in the lowlands: an altitudinal shift of 10 to 60 m corresponds to a latitudinal shift of 30 to 70 km per decade. The aim of this study is to improve our understanding of the effects of climate change (such as changes in temperature or more intense and frequent droughts) on the distribution of alpine pond species. Based on bibliographic and original field work in the French Alps and Pyrenees, this thesis has three main objectives. 1) Chapter 1 aims to develop a conceptual model of the effects of climate change on alpine pond species, based on an analysis of the scientific literature. This chapter also identifies the main challenges and research perspectives to improve our understanding of the effects of climate change on these species. Three main factors are highlighted: temperature, hydroperiod and connectivity. 2) Chapter 2 aims to quantify the effects of these three factors (temperature, hydroperiod and connectivity) on the occurrence of species belonging to three biological groups (odonates, amphibians and macrophytes) in 73 ponds in the French Northern Alps (Haute-Savoie). This chapter highlights the importance of shorter hydroperiods in driving lower occupation probabilities of most of the studied species. 3) Chapter 3 aims to identify the main environmental gradients structuring the aquatic communities of 500 ponds in three geographical areas of the alpine biogeographical zone of the French Alps and the Pyrenees. This chapter demonstrates the key role of hydroperiod in structuring these communities along the altitudinal gradient. In conclusion, the occurrence of alpine pond species varies under the influence of three factors related to climate change (temperature, hydroperiod and connectivity). This work shows that the hydroperiod and connectivity (minimum topographic distance between patches) of ponds influence the occupancy probabilities of 93% and 83% of the species in these environments, respectively. Our results demonstrate the importance of accounting for temperature, hydroperiod and connectivity in predictive species distribution models for alpine pond species. These models will make it possible to identify areas of conservation concern and to develop adaptive management measures to mitigate the effects of climate change on these species. Finally, our results show that it is also essential to account for the structuring role of environmental gradients for different biological groups within different geographic zones (within the same biogeographical zone) if local conservation management actions are to be effective for all alpine pond communities.Dans le cadre d’un déclin sans précédent de la biodiversité, amplifié par un réchauffement climatique global qui s’accélère, un tiers des espèces inféodées aux écosystèmes aquatiques sont menacées d’extinction. Les effets du changement climatique sur la biodiversité des mares et étangs alpins sont peu étudiés, alors que ces milieux hébergent des espèces endémiques, rares et menacées. La zone alpine, située au-dessus de la limite des arbres, représente un refuge pour les espèces adaptées à des températures froides. Présente sur tous les continents, cette zone est moins directement soumise à la pression directe de Homo sapiens, en raison de densités de population généralement plus faibles et d’une destruction des habitats plus limitée. Elle offre ainsi l’opportunité d’étudier les effets du changement climatique sur la biodiversité, tout en les dissociant plus facilement de ceux liés à la pression directe de Homo sapiens. De plus, du fait du gradient altitudinal, les déplacements des espèces en lien avec le réchauffement climatique s’opèrent sur des plus courtes distances qu'en plaine: une progression altitudinale de 10 à 60 m équivalente à une progression latitudinale de 30 à 70 km par décade. L’objectif de cette thèse est de faire progresser notre compréhension des effets du changement climatique, tels que les changements de température ou les événements de sécheresse plus intenses et plus fréquents, sur la distribution des espèces des mares et étangs alpins. S’appuyant sur un travail bibliographique et de terrain à l’échelle des Alpes et des Pyrénées françaises, cette thèse aborde trois objectifs principaux. Le chapitre 1 vise à développer un modèle conceptuel des effets du changement climatique sur les espèces des mares et étangs alpins, à partir d’une analyse de la littérature scientifique. Dans ce chapitre nous identifions également les grands défis et les perspectives de recherche pour mieux comprendre les effets du changement climatique sur ces espèces. Trois facteurs principaux sont notamment mis en évidence: la température, l’hydropériode et la connectivité. Le chapitre 2 a pour objectif la quantification des effets de ces trois facteurs (température, hydropériode et connectivité), sur l'occurrence des espèces d’odonates, amphibiens et macrophytes sur 73 mares et étangs des Alpes françaises. Ce chapitre met en évidence l’importance des effets de la diminution de l’hydropériode sur la baisse des probabilités d’occupation de la plupart des espèces étudiées. Le chapitre 3 vise à identifier les principaux gradients environnementaux structurant les communautés aquatiques de 500 mares et étangs sur trois zones géographiques de la zone biogéographique alpine française. Ce chapitre démontre le rôle clé de l’hydropériode dans la structuration de ces communautés le long du gradient altitudinal. En conclusion, l'occurrence des espèces des mares et étangs alpins varie sous l’influence des trois facteurs liés au changement climatique (température, hydropériode et connectivité). Cette thèse montre que l’hydropériode et la connectivité (distance topographique minimale inter-patch) des mares et étangs ont respectivement des effets sur les probabilités d’occupations de 93% et 83% des espèces de ces milieux. Nous suggérons d’intégrer ces variables dans les modèles de prédiction de la distribution des espèces des mares et étangs alpins. Ces modèles permettront d’identifier les zones à enjeux de conservation et de développer des actions d’adaptation et de gestion, afin d'atténuer les effets du changement climatique sur ces espèces. Enfin, nos résultats mettent en évidence qu’il est également indispensable de prendre en compte la structuration par les gradients environnementaux de différents groupes biologiques au sein de différentes zones géographiques (à l’intérieur d’une même zone biogéographique), pour que les actions de gestion conservatoires locales soient efficaces pour l’ensemble des communautés des mares et étangs alpins

    Approches de modélisation inverse pour un modèle de dispersion atmosphérique lagrangien stochastique : application à la caractérisation de sources en milieu industriel complexe

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    The ability to quickly characterize air pollutant sources is crucial, particularly in an industrial context, for ensuring safety, minimizing environmental impact, and optimizing emergency response strategies. To this end, this PhD work focuses on developing efficient inversion methodologies for pollutant source characterization (position and flow rate) in complex industrial environments, addressing the challenge of performing accurate and rapid identification of their characteristics with limited computational resources.A review of the numerical modelling approaches for atmospheric pollution highlights a critical gap in existing techniques. Most inverse methods struggle to offer an efficient combination of a pollutant transport and dispersion model with an inversion algorithm, capable of accounting for complex terrains with obstacles while maintaining reasonable computation times on a standard computer, making them unsuitable for industrial applications where rapid response is essential. To address this, two complementary inversion methodologies are developed and applied to a Lagrangian stochastic particle dispersion model using the SLAM software. Such a model ensures reliable turbulence modelling in a complex environment while maintaining reasonable computation time.The first developed approach, the backward inverse method, exploits the reciprocity principle to reconstruct the source term without requiring an iterative minimization process. This technique proves robust and straightforward to implement, making it suitable for industrial applications. However, its reliance on storing one backward concentration field per sensor presents scalability issues, particularly as modern measurement acquisition techniques provide ever larger data sets.To overcome these limitations, the adjoint state method is introduced as an alternativestrategy. Its application to a Lagrangian dispersion model is a novelty. Such a method significantly reduces memory requirements by storing only a single adjoint field per iteration of the minimization process, while allowing the computation of the cost function gradient independently of the number of source parameters to be determined, thus drastically reducing computation cost. The application to a Lagrangian model also allows for the parallelization of this computation. To compensate for the use of an iterative resolution process, a hybrid inversion strategy is suggested, first applying the backward inverse method to a reduced dataset, providing an initial estimate of source characteristics, which is then refined using the adjoint method to achieve higher accuracywhile maintaining computational efficiency.The backward inverse method is validated through numerical sensitivity tests carried out on two academic case studies, representing a surface boundary layer on a flat open ground and an idealized industrial site with complex-shaped obstacles. These tests aim at assessing the influence of various parameters on inversion results, including sensor spatial sampling, measurement uncertainty and plume complexity. They allow confirmation that the backward inverse method is well suited for rapid, relatively accurate estimation of source localization and flow rate, while the adjoint state method shows a promising potential in refining inversion results.Overall, this PhD work advances inverse modeling techniques for atmospheric pollutantsource characterization by developing two complementary strategies resulting from a compromise between computational efficiency and accuracy. These methodologies provide a foundation for improved efficient source characterization in complex industrial sites, with future developments needed to consolidate the results obtained and improve the robustness and applicability of the methods in real-life scenarios.Caractériser rapidement les sources de polluants de l'air est cruciale, notamment en milieu industriel, pour garantir la sécurité, minimiser l'impact environnemental et optimiser les stratégies de réponse d'urgence. A cette fin, cette thèse se concentre sur le développement de méthodologies d'inversion efficaces pour la caractérisation de ces sources dans des milieux industriels complexes, en répondant au défi d'une identification rapide et précise de leurs caractéristiques avec des ressources informatiques limitées.Une revue des approches de modélisation de la pollution atmosphérique met en lumièreun manque critique dans les techniques existantes. La plupart des méthodes inverses peinent à proposer un couple modèle de transport et dispersion des polluants-algorithme d'inversion efficace, capable de tenir compte de terrains complexes avec obstacles tout en gardant des temps de calcul raisonnables sur un PC standard, ce qui les rend inapplicables pour des applications industrielles où la rapidité de réponse est cruciale. Pour y remédier, deux méthodologies d'inversion complémentaires sont développées et appliquées à un modèle de dispersion lagrangien stochastique grâce au logiciel SLAM. Un tel modèle garantit une modélisation fiable de la turbulence dans des environnements complexes tout en assurant des temps de calcul raisonnables.La première approche développée, la méthode d'inversion par rétropropagation, permet de reconstruire le terme source sans nécessiter de processus de minimisation itératif. Cette technique s'avère robuste et facile à implémenter, la rendant adaptée aux applications industrielles. Cependant, sa dépendance au stockage d'un champ de rétro-concentration par récepteur pose un problème de scalabilité, d'autant plus que certaines techniques d'acquisition de mesure modernes peuvent fournissent des jeux de données très volumineux.Pour contrer ces limitations, la méthode adjointe est introduite comme stratégie alternative. Son application à un modèle lagrangien est une nouveauté. Cette technique permet de réduire drastiquement les besoins en mémoire en stockant un seul champ adjoint par itération du processus de minimisation, tout en permettant de calculer le gradient de la fonction coût indépendamment du nombre de paramètres de source à déterminer, réduisant fortement le coût de calcul. L'application à un modèle lagrangien permet aussi de paralléliser ce calcul. Pour compenser le recours à un processus de résolution itératif, une stratégie d'inversion hybride est suggérée, appliquant d'abord la méthode inverse sur un ensemble de données réduit, fournissant une estimation initiale des caractéristiques de source ensuite affinée avec la méthode adjointe pour avoir une meilleure précision tout en maintenant l'efficacité computationnelle.La méthode de rétropropagation est validée numériquement grâce à des tests de sensibilité menés sur deux cas tests académiques, représentant une couche limite de surface sur un terrain ouvert plat et un site industriel idéalisé avec des obstacles de forme complexe. Ces tests visent à évaluer l'influence de divers paramètres sur les résultats d'inversion. Ils permettent de confirmer que l'inversion par rétropropagation est bien adaptée pour une localisation rapide et relativement précise de la position et du débit de la source, tandis que la méthode adjointe montre un potentiel prometteur pour affiner les résultats d'inversion.Dans l'ensemble, cette thèse fait progresser les techniques de modélisation inversepour la caractérisation des sources de pollution atmosphérique, en développant deux stratégies complémentaires résultant d'un compromis entre efficacité computationnelle et précision. Ces méthodologies constituent une base pour caractériser plus efficacement ces sources sur des sites industriels complexes, avec des développements futurs nécessaires pour consolider les résultats obtenus et améliorer la robustesse et l'applicabilité des méthodes dans des scénarios réels

    Les figures de sorcières en ligne, une subculture numérique

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    This thesis analyzes the constructions of the witch myth, particularly its contemporary reactivations on social media platforms. The aim is to demonstrate how various mythological stratifications applied to this figure are reused and redefined today. More specifically, this research focuses on individuals who identify as witches in the digital space and who stage a universe connected to the figure of the witch. These "creations" are also akin to subcultural practices and indicate that self-identified witches are forming an oppositional subculture. Thus, this thesis is structured in three parts. Firstly, it details a genealogy of the figure of the witch by tracing the tutelary figures that have shaped social imaginaries. A dichotomous relationship between fascination and repulsion for this figure—and more broadly for women—emerges subtly. From the earliest mentions of female magicians to American TV shows about teenage witches, this figure occupies imaginations and continues to embody an identificatory role.Secondly, this study examines contemporary practices of reactivating this figure. An online ethnography of self-identified witches' profiles and a discourse analysis of their statements, through individual interviews, support this empirical section. This field chapter reveals the practices and beliefs of a population almost exclusively composed of women. The witch myth thus nourishes a distinctly female community. This chapter interrogates the notion of the group and uncovers a tension between individual intentions and communal dynamics. The interest in studying this variety of discourses and representations lies in showing the circulation of a trivial object like the witch through a semiotic-discursive analysis. Finally, in the final phase, the thesis offers a reflection on the question of subcultures, specifically examined in the context of contemporary digital culture. The hypothesis of this research is to characterize the group of self-identified witches as an oppositional digital subculture. Indeed, platformization, algorithmic systems, and their uses prompt a re-examination of Cultural Studies and its stakes. Moreover, this research aims to show the intertwining of subcultures with the cultural industries in our contemporary economy and to adopt a less Manichean view of the power dynamics between dominant and marginalized cultures. This case study thus allows for a more theoretical reflection on media cultures, subcultures, and their digital resignifications. Finally, gender dynamics in subcultural practices constitute a perspective within this work, offering an approach to some overlooked aspects of Cultural Studies. By using the concept of girl culture, this thesis proposes the idea of a reappropriation of counter-hegemonic online spaces. The value of studying this variety of discourses and representations from a semiotic-discursive analysis is to show the circulation of a trivial object like the figure of the witch, as well as to offer a more theoretical reflection on media cultures, subcultures, and their digital resignifications.Cette thèse analyse les constructions du mythe de la sorcière et, en particulier, ses réactivations contemporaines sur les plateformes socionumériques. L’objectif est de montrer de quelles manières les différentes stratifications mythologiques appliquées à cette figure sont réutilisées et resignifiées de nos jours. Plus précisément, cette recherche s’intéresse à des personnes qui se revendiquent sorcières dans l’espace numérique et qui mettent en scène un univers renvoyant à la figure de la sorcière. Ces « bricolages » s’apparentent, par ailleurs, à des pratiques subculturelles et indiquent que les sorcières autodésignées constituent / se constituent en une subculture juvénile contestataire. Ainsi, cette thèse se découpe en trois temps. Elle détaille en premier lieu une généalogie de la figure de la sorcière, en retraçant les figures tutélaires ayant marqué les imaginaires sociaux. En filigrane se dessine un rapport dichotomique entre fascination et répulsion pour cette figure et, plus largement, pour les femmes. Depuis les premières mentions de magiciennes jusqu’aux séries américaines sur la vie d’adolescentes sorcières, cette figure habite les imaginaires et continue d’incarner un rôle identificatoire.Cette étude s’intéresse, dans un second temps, aux pratiques contemporaines de réactivation de cette figure. Une ethnographie en ligne sur des profils de sorcières autodésignées ainsi qu’une analyse de discours de celles-ci, via des entretiens individuels viennent étayer cette partie empirique. Ce chapitre de terrain montre les pratiques et croyances d’une population constituée quasi exclusivement de femmes. Le mythe de la sorcière nourrit alors une communauté proprement féminine. Ce chapitre interroge la notion de groupe et révèle une tension entre volontés individuelles et dynamiques communautaires. L’intérêt d’étudier cette variété de discours et de représentations est de donner à voir les circulations d’un objet trivial comme la sorcière à travers une analyse sémio-discursive.Enfin dans la dernière phase, la thèse propose une réflexion sur la question des subcultures, plus particulièrement saisies dans le contexte numérique contemporain. L’hypothèse de cette recherche est de qualifier le groupe des sorcières autodésignées comme une subculture juvénile contestataire numérique. En effet,la plateformisation, les systèmes algorithmiques et leurs usages enjoignent à réinterroger les cultural studies et ses enjeux. Par ailleurs, ce travail de recherche s’attache à montrer l’intrication des subcultures aux industries culturelles dans notre économie contemporaine et à s’inscrire dans une vision moins manichéenne des rapports de pouvoir entre culture dominante et marges. Cette étude de cas permet donc une réflexion plus théorique sur les médiacultures, les subcultures ainsi que leurs resignifications numériques. Enfin, les enjeux de genre dans les pratiques subculturelles constituent une perspective du travail, qui permet d’aborder certains impensés des Cultural Studies. Par le recours à la notion de de girl culture, cette thèse avance l’idée d’une réappropriation d’espaces en ligne contre-hégémoniques. L’intérêt d’étudier cette variété de discours et de représentations depuis une analyse sémio-discursive est de donner à voir les circulations d’un objet trivial comme celui de la figure de la sorcière, mais aussi de proposer une réflexion plus théorique sur les médiacultures, les subcultures et leurs resignifications numériques

    Coût résidentiel et enquêtes mobilité, mariage d'amour ou mariage forcé ? : un système technique et politique territorial à l'épreuve de l'appropriation d'une notion transversale

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    How can the phenomena of fuel poverty, car dependency and suburbanisation, which appear to be different symptoms of the same social and territorial inequalities, be studied together? Since the beginning of the 21st century, a number of authors have been proposing that the cross-disciplinary thinking on urban planning and travel of the 1980s should be revisited by refocusing on the lived experience of a region's residents. This has led to the emergence of an interesting concept that can help local authorities in their territorial deployment and households in their residential choices: residential cost.The restructuring of the French Household Travel Surveys into Cerema Certified Mobility Surveys (EMC²) has provided a link in the quantification of residential costs. In their new format, the EMC² can add a specific module for exploring residential costs. By studying the successive implementation of two ‘residential cost' modules tested within the 2019-2020 Grenoble EMC² and the 2022-2023 Clermont-Ferrand EMC², we question the capacity of the territiorial technical and political system to appropriate the notion of residential cost. Based on a corpus of interviews and observations, we analyse these two experiments using a socio-historical approach and an Advocacy Coalition Framework. This twofold approach enables us to study the technical and political solidity of the residential cost module, and to take into account the resistance and the levers for development of the EMC². This thesis also proposes a particular methodological approach, involving the interweaving of different approaches to study, in a context of imposed social distancing (Covid-19 pandemic period), an object under construction where academic actors and practitioners, as well as local and national logics, come together. Our functional proximity to certain stakeholders led us to pay particular attention to our positioning as a researcher.As well as shedding light on the definition and use of the notion of residential cost and refining our understanding of what underlies the transformation of Household Travel Surveys, this work makes it possible to consider the quantification of cross-cutting notions as a way of strengthening our sector-based statistical system. In addition, this thesis presents avenues for a better conceptualisation of residential cost as a public, or even political, issue, as this notion appears to be a way of thinking about the sustainability of residential way of life on both an individual and collective scale.Comment étudier de manière articulée les phénomènes de précarité énergétique, de dépendance automobile, ou de périurbanisation, qui apparaissent comme différents symptômes de mêmes inégalités sociales et territoriales ? Certains auteurs proposent, de manière renforcée depuis le début du XXIe siècle, de renouveler les réflexions transversales urbanisme-déplacement des années 1980 en se recentrant sur le vécu des situations résidentielles des habitants d'un territoire. Une notion apparaît alors intéressante pour outiller les collectivités dans leur déploiement territorial et les ménages dans leur choix résidentiel : le coût résidentiel. Elle consiste à considérer ensemble les dépenses de logement et de mobilité quotidienne des ménages en fonction de leur localisation résidentielle. Néanmoins, cette notion transversale peine à devenir un concept opératoire par manque de support statistique standardisé à l'échelle territoriale qui appréhende à la fois le logement, la mobilité quotidienne et le revenu des ménages. Face à ce constat, ce travail de recherche déplace les réflexions sur la notion de coût résidentiel de sa définition à notre capacité collective à l'outiller. Plus fondamentalement, cette thèse alimente les réflexions sur les espaces de conceptualisation de notions dont le caractère transversal se heurte à l'organisation sectorielle et multiniveaux de l'action publique, prégnante jusque dans les processus de prise de décision de l'appareillage statistique des territoires.Un point d'articulation dans la quantification du coût résidentiel est apparu avec la restructuration des Enquêtes Ménages Déplacements (EMD) en Enquêtes Mobilité Certifiées Cerema (EMC²). Dans leur nouveau format, les EMC² peuvent adjoindre un module spécifique à l'exploration du coût résidentiel. Par l'étude de la mise en œuvre successive de deux modules « coût résidentiel » testés au sein de l'EMC² 2019-2020 de Grenoble et de l'EMC² 2022-2023 de Clermont-Ferrand, nous questionnons la capacité du système technique et politique territorial à s'approprier la notion de coût résidentiel. À partir d'un corpus d'entretiens et d'observations, nous analysons ces deux expérimentations avec une approche socio-historique et une Advocacy Coalition Framework. Cette double lecture permet l'étude de la solidité à la fois technique et politique du module coût résidentiel, et concilie la prise en compte des résistances et des leviers d'évolutions des EMC². Cette thèse propose par ailleurs une démarche méthodologique particulière du fait de l'imbrication de différentes approches pour étudier dans un contexte de distanciation sociale imposée (période de pandémie à la Covid-19) un objet en construction où se mêlent acteurs académiques et praticiens, ainsi que des logiques locales et nationales. La proximité fonctionnelle avec certaines parties prenantes nous a amenée à accorder une attention particulière au positionnement tenu en tant que chercheuse.Au-delà d'apporter des éclaircissements sur la définition et l'usage de la notion de coût résidentiel et d'affiner la compréhension de ce que sous-tendent les transformations des EMD en EMC², ce travail permet de penser la quantification de notions transversales comme une manière de renforcer notre système statistique sectorisé. De plus, cette thèse présente des pistes pour une meilleure conceptualisation du coût résidentiel comme enjeu public, voire politique, alors que cette notion apparaît comme une manière de penser la soutenabilité de modes de vie résidentiels tant à l'échelle individuelle que collective

    Thèmes d'Analyse : sous-espaces invariants et approximation dans les espaces de fonctions holomorphes

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    This thesis explores two independent problems related to analytic function spaces, and their properties. In the first part of the thesis the main object of interest is the shift operator M_z, defined on the Bloch space, and little Bloch space, on which the corresponding lattice of invariant subspaces is studied. Closed, shift invariant subspaces are constructed in the Bloch space that can have arbitrarily large index, including countably infinite. Next, focus is passed onthe little Bloch space, providing a construction of closed, shift invariant subspaces that have arbitrary large index, including countably infinite. Additionally, since the Blochspace being non-separable, it allows for the construction of an invariant subspace of indexequal to the cardinality of the unit interval [0, 1]. Finally, several results are established concerning the index for the weak-star topology of a Banach space and prove a stability theorem for the index when passing from (norm closed) invariant subspaces of a Banach space to their weak-star closure in its second dual. This is then applied to prove the existence of weak-star closed invariant subspaces of arbitrary index in the Bloch space. In the second part of the thesis interest is turned to a minimization problem involving partial fractions. The framework is set on the class of standard weighted Bergman spaces A^2_{alpha}(mathbb{D}) on which the set SF^N(mathbb{T}) of simple partial fractions of degree N, with poles on the unit circle, may be studied. Firstly, the relationship between the partial fractions of order N, and a classical theorem of Korevaar is reviewed, which connects the approximation properties of partial fractions with restriction on their poles to approximation properties of polynomials with restriction on their zeros. Furthermore, inspiration is drawn from along standing conjecture of Chui. It is proved that under certain conditions, the simple partial fractions of order N, with n poles on the unit circle, attain minimal norm if and only if the points are equidistributed on the unit circle. It is also shown that the above isn not generally the case if the imposed conditions are not met, exhibiting a new interesting phenomenon. Subsequently, sharp asymptotics for the norms are calculated. Finally, theclosure of the partial fractions of order N in the standard weighted Bergman spaces is studiedCette thèse explore deux problèmes indépendants liés aux espaces de fonctions holomorphes et à leurs propriétés.Dans la première partie de la thèse, l'objet principal d'étude est l'opérateur de décalage M_z, défini sur l'espace de Bloch et le petit espace de Bloch, dont on examine le treillis des sous-espaces invariants associés. Nous construisons des sous-espaces fermés invariants par décalage dans l'espace de Bloch pouvant présenter un indice arbitrairement grand, y compris infini dénombrable. L'analyse se poursuit ensuite sur le petit espace de Bloch, où nous fournissons une construction de sous-espaces fermés invariants par décalage d'indice arbitrairement grand, incluant également le cas infini dénombrable. Par ailleurs, la non-séparabilité de l'espace de Bloch permet de construire un sous-espace invariant dont l'indice égale la cardinalité de l'intervalle unité [0,1]. Enfin, nous établissons plusieurs résultats concernant l'indice pour la topologie faible-étoile d'un espace de Banach et démontrons un théorème de stabilité de l'indice lors du passage des sous-espaces invariants (fermés en norme) d'un espace de Banach à leur adhérence faible-étoile dans son bidual. Ce résultat est ensuite appliqué pour prouver l'existence, dans l'espace de Bloch, de sous-espaces invariants faible-étoile fermés d'indice arbitraire. Dans la deuxième partie de la thèse, l'attention se porte sur un problème de minimisation impliquant des fractions partielles. Le cadre est celui des espaces de Bergman pondérés standards A^2_{alpha}(mathbb{D}), sur lesquels on étudie l'ensemble SF^N(mathbb{T}) des fractions partielles simples de degré N, à pôles situés sur le cercle unité. Dans un premier temps, la relation entre les fractions partielles d'ordre N et un théorème classique de Korevaar est examinée. Ce théorème établit un lien entre les propriétés d'approximation des fractions partielles (sous contrainte de localisation de leurs pôles) et celles des polynômes (sous contrainte de localisation de leurs zéros). Par ailleurs, nous nous inspirons d'une ancienne conjecture de Chui. Il est démontré que, sous certaines conditions, les fractions partielles simples d'ordre N à n pôles sur le cercle unité atteignent une norme minimale si et seulement si ces pôles sont équidistribués sur le cercle. Nous montrons également que ce résultat cesse d'être vrai en l'absence de ces conditions, mettant ainsi en évidence un phénomène nouveau et intéressant. Des asymptotiques précises pour les normes sont ensuite calculées. Enfin, nous étudions l'adhérence des fractions partielles d'ordre N dans les espaces de Bergman pondérés standard

    Etude numérique multi-échelle de l'écoulement d'un fluide chargé en matériaux à changement de phase micro-encapsulés à travers un milieu poreux

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    In recent years, there has been growing interest in the development of reversible thermal storagesystems for urban infrastructure. The CONVINCES project, of which this thesis is a part, aims to study thermal control systems that exploit the flow of liquids carrying capsules containing phase change material in porous media. The objective of this study is to develop a theoretical framework for modeling this system using a multiscale approach. Theorical models are developedat the three scales identifiable in the system. A numerical study at the scale of a phase change material capsule characterizes the relationship between the melting rate, the temperature at the capsule surface, and the dimensionless numbers of the problem. A second study associated with the pore scale focuses on the dynamics of the suspension in the porous matrix. Finally, several theoretical models of the system at the macroscopic scale are proposed and compared in light of the information provided by the studies carried out at lower scales.Ces dernières années, le développement de systèmes de stockage thermique réversibles pour les infrastructures urbaines a suscité un intérêt croissant. Le projet CONVINCES, dans lequel s'inscrit cette thèse, vise à étudier des systèmes de contrôle thermique exploitant l'écoulement de liquides transportant des capsules contenant un matériau à changement de phase dans des milieux poreux. L'objectif de la présente étude est le développement d'un cadre théorique permettant de modéliser ce système au moyen d'une approche multi-échelle. Des modèles physiques sont développés aux trois échelles identifiables dans le système. Une étude numérique à l'échelle d'une capsule de matériau à changement de phase permet de caractériser la relation entre la vitesse de fusion, la température à la surface de la capsule, et les nombres sans dimensions du problème. Une seconde étude associée à l'échelle du pore permet d'étudier la dynamique de la suspension dans la matrice poreuse. Enfin, plusieurs modèles théoriques du système à l'échelle macroscopique sont proposés et comparés à la lumière des informations fournies par les études réalisées aux échelles inférieures

    Lier les changements structurels et fonctionnels dans la dégénérescence maculaire liée à l'âge au stade présymptomatique

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    This doctoral thesis investigates the subtle interactions between retinal structure and visual function in individuals at risk for age-related macular degeneration (AMD), a leading cause of vision loss in older adults. The late stage of dry AMD, the most common form of the disease, is currently incurable; thus, earliest possible detection is critical. This work focuses on presymptomatic AMD, a stage during which individuals are not yet medically diagnosed but exhibit early anatomical changes detectable only through high-resolution retinal imaging. These individuals are statistically at greater risk of progression. The novel hypothesis is that small foveal drusen, subretinal deposits of extracellular material linked to AMD onset, cause detectable changes in high-acuity vision. From a methodological standpoint, a recent gaze-dependent imaging protocol was used to detect small drusen and extract precise information about their position and size. This method was applied for the first time to link visual functions to retinal structure. A key focus of the thesis is on fixational eye movements (FEM), small involuntary movements occring during visual fixation. They were measured using cutting-edge retinal imaging tools enabling high-precision, non-invasive tracking. Specifically, a research-grade Adaptive Optics Flood-Illumination Ophthalmoscope (AO-FIO), developed at aerospace research lab ONERA, was converted into one of the most precise existing eye-trackers. High-speed high-resolution distortionless recordings of ocular dynamics allowed fine characterization of FEM components, including microsaccades, drift, and microtremor, the latter rarely studied due to stringent tracking requirements on precision. Thanks to these methodological advances, several findings emerged. First, microsaccades, drift, and overall fixation stability were unaffected by drusen-free aging, resolving conflicting prior evidence. On the other hand, tremor showed significant age-related attenuation. Tremor was also found to increase in amplitude in aged subjects during high-acuity tasks, suggesting a compensatory mechanism and offering novel insight into its unknown function. Finally, statistically significant differences in microsaccade amplitude, drift, and fixation stability were observed in individuals with presymptomatic AMD compared to young and age-matched controls. A compelling finding correlated centrality of the drusen with increasingly larger microsaccades.Given limited accessibility of advanced imaging systems, the thesis also evaluated whether these findings could be replicated using more widely available eye-trackers and psychophysical tasks .As expected, eye tracking precision was considerably worse, making a reliable drift and tremor characterization impossible. However, microsaccade amplitudes still showed statistical differences between control and drusen subjects. Additionally, hyperacuity test performance was sensitive to the presence of drusen, and a strong correlation was found between total foveal drusen area and hyperacuity thresholds. From a vision science perspective, these results enhance understanding of visual changes during normal and pathological aging in both passive and active fixation. Clinically, they demonstrate the potential for FEM characteristics as sensitive functional markers for early retinal changes in presymptomatic AMD. It also opens up the possibility of also using more accessible tools such as widespread eye trackers and psychophysical tests. This work integrates vision science, ophthalmology, and retinal imaging to better understand how aging affects visual function and to characterize the subtle functional transition towards AMD.Cette thèse doctorale examine les interactions fines entre la structure rétinienne et la fonction visuelle chez des individus à risque de développer une dégénérescence maculaire liée à l'âge (DMLA), principale cause de perte de vision chez les personnes âgées. Le stade avancé de la DMLA sèche, forme la plus courante, reste incurable et une détection précoce est donc essentielle. Ce travail se concentre sur la DMLA présymptomatique, un stade non diagnostiqué médicalement mais caractérisé par des altérations anatomiques précoces détectables uniquement par imagerie rétinienne à haute résolution. Ces sujets présentent un risque accru de progression. L'hypothèse centrale est que de petits drusens fovéolaires, dépôts extracellulaires liés à l'apparition de la DMLA, entraînent des altérations détectables de la vision de haute acuité. Un protocole récent d'imagerie se basant sur la direction du regard a permis d'identifier précisément ces drusens et d'en extraire position et taille. Cette approche a été utilisée pour la première fois afin d'établir un lien structure-fonction. Un axe majeur de la thèse porte sur les FEM (Fixational Eye Movements), les micro-mouvements oculaires involontaires durant la fixation. Ceux-ci ont été mesurés à l'aide d'outils d'imagerie rétinienne de pointe, dont un Adaptive Optics Flood Illumination Ophtalmoscope (AO-FIO) développé par l'ONERA et modifié pour devenir un eye-tracker d'une très grande précision. Les enregistrements haute vitesse haute résolution et sans distorsion ont permis d'analyser avec finesse les composantes des FEM : microsaccades, drift et microtremor, ce dernier rarement étudié en raison des exigences techniques élevées. Les résultats révèlent que les microsaccades, le drift et la stabilité de fixation ne sont pas impactés par le vieillissement normal en l'absence de drusens, clarifiant des résultats antérieurs contradictoires. En revanche, une diminution significative du tremor avec l'âge a été observée. Il a aussi été remarqué que son amplitude augmente lors de tâches nécessitant une haute acuité visuelle chez les sujets âgés, suggérant un mécanisme compensatoire. Chez les individus atteints de DMLA présymptomatique, des différences significatives sont observées dans l'amplitude des microsaccades, le drift et la stabilité de fixation par rapport aux sujets jeunes et âgés contrôles. Un lien fort a été établi entre la centralité des drusens et l'amplitude accrue des microsaccades. La thèse évalue également la possibilité d'identifier ces altérations avec des eye-trackers plus accessibles. Si la précision était insuffisante pour caractériser le drift et le tremor, les microsaccades restaient discriminantes entre sujets avec ou sans drusens. De plus, les performances à des tests d'hyperacuité se sont révélées sensibles à la présence de drusens, avec une forte corrélation entre leur surface totale et les seuils mesurés. Ces résultats approfondissent la compréhension des changements visuels associés au vieillissement normal et pathologique, en fixation passive comme active. Cliniquement, ils suggèrent que les caractéristiques des FEM pourraient constituer des biomarqueurs fonctionnels précoces de la DMLA. Enfin, ils ouvrent la voie à l'utilisation d'outils plus accessibles comme les eye-trackers grand public et les tests psychophysiques, contribuant à une détection fonctionnelle précoce de la DMLA. Ce travail interdisciplinaire allie sciences de la vision, ophtalmologie et imagerie rétinienne afin de mieux comprendre et caractériser les prémices fonctionnels de la maladie

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