National Museum of Natural History
Publications scientifiques du Muséum national d'Histoire naturelle, ParisNot a member yet
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We are the Crystal Gems: taxonomic revision of the gem-fruited species of <i>Commelina</i> L. (Commelinaceae, Commelinales) and their allies
No full textWe present a taxonomic revision of the gem-fruited species of Commelina and their allies. We address misapplied names, taxonomic confusion, and undescribed taxa based on a combination of macro- and micromorphological characters, ecological and reproductive data, and preliminary molecular data for Commelina. We recognise a total of 14 species, including two new species, Commelina almandina M.Pell. & Cornejo sp. nov. and C. sugariae M.Pell. sp. nov., and five reestablished ones previously treated as synonyms. We provide an identification key to the gem-fruited species of Commelina and their closest allies, as well as complete morphological descriptions, images, comments, and distribution maps for all recognised species. Species are recognised based on a unique combination of discrete vegetative (i.e., root and rhizome morphology, stem posture and growth pattern, leaf-sheath morphology, phyllotaxy, and leaf-blade morphology) and reproductive (i.e., synflorescence architecture, inflorescence position, spathe morphology, upper cincinnus development and flower production, pedicel pubescence, sepal morphology, petal morphology, filaments’ posture at anthesis, anthers and antherodes morphology, gynoecium and fruit morphology, fruit dehiscence, and seed morphology) morphological characters. We also provide comments and corrections on the taxonomy, application, and nomenclature of names historically associated with or confused with species of gem-fruited Commelina. Finally, we provide a general overview of poorly explored characters and issues plaguing the taxonomy of Commelina.</p
An Xper3 reference guide for taxonomists: a collaborative system for identification keys and descriptive data
No full textThe Xper3 software enables collaborative management of descriptive data on taxa. This paper focuses on the essential information about the knowledge model that underlies the software, its features and user interface which has been evolving since 2014. The best practices for representing taxonomic descriptions, managing polymorphism and missing data in a consistent way are also presented. Its ease of use and the versatility of its data model mean that the software can be used to create and distribute identification keys for all types of taxa</p
Confirmation d’une nouvelle espèce d’<i>Amalthea</i> D’Archino & W.A.Nelson (Halymeniales, Rhodophyta) de la zone mésophotique d’Hawai‘i par la taxogénomique
No full textL’ordre d’Halymeniales représente un nombre important d’espèces dans la flore d’algues rouges mésophotiques d’Hawaï, avec de nombreux taxons non décrits. La culture et la restauration d’espèces d’Halymeniales à Hawaï, en particulier des membres de Grateloupia C.Agardh et Halymenia C.Agardh, ont attiré une attention considérable sur ces taxons, soulignant l’incertitude quant à la diversité génétique au sein de ce groupe. Dans cette étude, nous adoptons une approche taxogénomique intégrant des analyses taxonomiques, phylogénétiques et phylogénomiques. Nous présentons le premier rapport du genre Amalthea D’Archino & W.A.Nelson à Hawai‘i, en nous concentrant sur la description de l’espèce Amalthea mahilanii F.P.Cabrera & A.R.Sherwood, sp. nov. Notre analyse rbcL initiale suggérait la présence de deux lignées au sein des spécimens hawaïens d’Amalthea, mais le solide soutien des phylogénies à l’échelle du plastome contredisait cette analyse, soulignant la valeur de la taxogénomique pour clarifier la diversité cryptique. Morphologiquement distinct des congénères Amalthea freemaniae D’Archino & W.A.Nelson et A. rubida H.W.Lee & M.S.Kim, A. mahilanii F.P.Cabrera & A.R.Sherwood, sp. nov. présente des lames rugueuses et coriaces avec un arrangement unique de cellules corticales et médullaires, comprenant 9 à 10 couches de cellules corticales ovoïdes et un arrangement dense de filaments médullaires. Ses lames maintiennent une épaisseur uniforme. La présence de cystocarpes ostiolés plus grands (300 à 500 μm de diamètre) distingue encore A. mahilanii F.P.Cabrera & A.R.Sherwood, sp. nov. de ses congénères du Pacifique. Les comparaisons synténiques des plastomes publiés au sein des Halyméniales ont révélé des similitudes remarquables dans le contenu génétique, sans réarrangements détectés, indiquant une évolution plastidienne conservée au sein de l’ordre. Dans l’ensemble, cette étude fait progresser considérablement notre compréhension de la diversité d’Halymeniales dans les écosystèmes mésophotiques, mettant en lumière la remarquable biodiversité des macroalgues dans les récifs mésophotiques hawaïens. Nous soulignons la nécessité d’une étude plus approfondie d’Halymeniales et proposons des efforts continus en taxogénomique pour améliorer la résolution taxonomique, en particulier dans les habitats mésophotiques.The order Halymeniales represents a significant number of species in the mesophotic red algal flora of Hawai‘i, with numerous undescribed taxa. The cultivation and restoration of species in the Halymeniales in Hawai‘i, particularly members of Grateloupia C.Agardh and Halymenia C.Agardh, have focused substantial attention on these taxa, highlighting uncertainty in the genetic diversity within this group. In this study, we adopt a taxogenomic approach integrating taxonomic, phylogenetic and phylogenomic analyses. We present the first report of the genus Amalthea D’Archino & W.A.Nelson in Hawai‘i, focusing on the species description of Amalthea mahilanii F.P.Cabrera & A.R.Sherwood, sp. nov. Our initial rbcL analysis suggested the presence of two lineages within Hawaiian Amalthea, but robust support from plastome-wide phylogenies contradicted that analysis, emphasizing the value of taxogenomics in clarifying cryptic diversity. Morphologically distinct from congeners Amalthea freemaniae D’Archino & W.A.Nelson and A. rubida H.W.Lee & M.S.Kim, A. mahilanii F.P. Cabrera & A.R.Sherwood, sp. nov. features rough, leathery blades with a unique cortical and medullary cell arrangement, including 9-10 layers of ovoid cortical cells and a dense arrangement of medullary filaments. Its blades maintain uniform thickness. The presence of larger ostiolate cystocarps (300-500 μm diameter) further distinguishes A. mahilanii F.P.Cabrera & A.R.Sherwood, sp. nov. from its Pacific conspecifics. Syntenic comparisons of published plastomes within the Halymeniales revealed remarkable similarities in gene content, with no detected rearrangements, indicating conserved plastidial evolution within the order. Overall, this study significantly advances our understanding of Halymeniales diversity in mesophotic ecosystems, shedding light on the remarkable biodiversity of macroalgae in Hawaiian mesophotic reefs. We emphasize the need for further study of Halymeniales and propose ongoing efforts in taxogenomics to enhance taxonomic resolution, particularly in mesophotic habitats.</p
De quelques types à l’herbier le plus riche en types de <i>Veronica</i> L. (Plantaginaceae) – L’effet de la numérisation de l’herbier du Muséum national d’Histoire naturelle de Paris
No full textLa numérisation des herbiers a révolutionné la taxonomie, en mettant à la portée du chercheur des spécimens types dispersés dans le monde entier. Cependant, il faut des connaissances taxonomiques approfondies pour identifier les spécimens comme types et souvent la détermination au niveau de l’espèce est très difficile voire impossible en raison des limites de la résolution des photos en ligne. La numérisation de l’herbier du Muséum national d’Histoire naturelle de Paris (P) a mis en ligne certaines des collections de plantes les plus anciennes et les plus riches en types. Après avoir étudié et redéterminé les quelque 16 000 spécimens de Veronica L. de P, j’ai vérifié le statut type de ceux-ci. Alors qu’auparavant seuls huit spécimens types de Veronica étaient connus de P, mes recherches ont révélé plus de 100 spécimens types, y compris ceux des noms publiés par Vaillant, Lamarck et Humboldt, Bonpland et Kunth ainsi que de nombreux doublons de collections utilisées par Boissier et des botanistes français plus récents. Dans de nombreux cas, la taxonomie du nom respectif a été clarifiée, dans d’autres, elle le sera certainement à l’avenir. Les spécimens respectifs proviennent de collections du monde entier et témoignent de l’importance et de la collecte intensive de l’herbier général, ainsi que des collectionneurs de ses principaux sous-herbiers comme Cosson et Drake. L’étude devrait encourager d’autres taxonomistes à prêter davantage attention à la riche collection de P.Digitization of herbaria has revolutionized taxonomy, bringing type specimens dispersed globally to within a mouse-click of the researcher. Still, it requires in-depth taxonomic knowledge to identify the specimens as type and often determination on the species level is difficult or impossible due to the limitations of the resolution of photos online. The digitization of the herbarium Muséum national d’Histoire naturelle in Paris (P) has brought some of the oldest and type-rich collections of plants online. After investigation and redetermination of the about 16 000 specimens of Veronica L. in P, I checked the type status of these. Whereas previously only eight type specimens of Veronica were known from P, my investigations revealed more than 100 type specimens, among them 34 new lectotypes and 177 new isolectotypes. These include those of names published by Vaillant, Lamarck and Humboldt, Bonpland and Kunth to many duplicates of collections used by Boissier and more recent French botanists. In many instances the taxonomy of the respective name has been clarified, in others they will certainly do so in the future. The respective specimens are from collections worldwide and attest to the importance and intensive collection of the general herbarium, as well as the collectors of its major subherbaria like Cosson and Drake. The study should encourage other taxonomists to pay more attention to the rich collection in P.</p
Late Viséan (Mississippian) ammonoids (Cephalopoda) from the Central Moroccan Meseta
No full textLate Viséan (Mississippian) ammonoids (Cephalopoda) from the Central Moroccan Meseta are described monographically for the first time. Several localities have yielded low-diversity assemblages, consisting mainly of species already known from southern Portugal, Ireland, northern England and the Rhenish Mountains. This clearly places the Moroccan Meseta within the Rhenohercynian-Subvariscan Province. The assemblages from the Moroccan Meseta are confined to a narrow stratigraphic interval, likely representing the Goniatites crenistria Zone, Goniatites sphaericus Zone, Goniatites spirifer Zone and Arnsbergites gracilis Zone. The new species Goniatites amarensis sp. nov. is described.</p
New species and new records of the genus <i>Thubana</i> Walker (Lepidoptera: Lecithoceridae) from China, with a checklist of the genus in the country
No full textFive species of the genus Thubana Walker, 1864 (Lepidoptera, Lecithoceridae, Torodorinae) from China are described as new: Th. porcata sp. nov., Th. quadrilatera sp. nov., Th. rongjiangensis sp. nov., Th. similidalgona sp. nov. and Th. yingjingensis sp. nov. Two species are newly recorded for China: Thubana circularis Park, 2006 and Thubana fangensis Park, 2003. The female of Th. felinaurita Li, 2010 is described for the first time. Images of dorsal habitus and genitalia for all the treated species are presented and a checklist of the Chinese species of Thubana is included in this article.</p
First record of the millipede family Haplodesmidae (Diplopoda: Polydesmida) from Colombia: two new species of <i>Inodesmus</i> Cook, 1896 from the Northern Andes
No full textThe millipede family Haplodesmidae is reported from Colombia for the first time, represented by Inodesmus mesibovi sp. nov. and Inodesmus miconiae sp. nov. Their presence in primary and secondary oak forests suggests their native origin in Colombia. This discovery represents the first record of the genus Inodesmus Cook, 1896 in South America, with potential implications of further records of the genus and family from the continent. We also present the first record of teratologies in haplodesmid millipedes.</p
<i>Ixora gadgiliana</i> sp. nov. (Rubiaceae: Ixorideae), une espèce nouvelle des Ghats occidentaux méridionaux, Inde.
No full textIxora gadgiliana Balan & Robi, sp. nov, une espèce nouvelle de Rubiaceae, est décrite des Ghats occidentaux méridionaux, Inde (États du Kerala). Elle est apparentée à I. lawsonii Gamble par son inflorescence en corymbe terminal, dense, à pédoncule court, mais se distingue de cette dernière par son port arborescent, ses feuilles courtes, obovales-oblancéolées avec 7-9 paires de nervures secondaires, ses fleurs blanches relativement petites avec des lobes de calice courts et deltoïdes et des anthères à bec.Ixora gadgiliana Balan & Robi, sp. nov., a new species of Rubiaceae is described from the Kerala part of Southern Western Ghats, India. It is allied to I. lawsonii Gamble in its terminal, dense, short-peduncled corymbose inflorescence, but distinct from the latter by the arborescent habit, short, obovate-oblanceolate leaves with 7-9 pairs of secondary veins, comparatively small, white flowers with short, deltoid calyx lobes and beaked anthers.</p
Étude diachronique de l’impact des Goélands leucophées (<i>Larus michahellis</i> Naumann, 1840) sur le sol et la flore des îles de Marseille : quels constats après la diminution de leurs effectifs ?
No full textLes colonies d’oiseaux marins nicheurs impactent la physico-chimie des sols ainsi que les communautés végétales sur les îles. Ces écosystèmes insulaires sont caractérisés par des plantes endémiques adaptées aux conditions stressantes (xéricité, salinité, sol superficiel, vent). Plusieurs études ont permis d’évaluer les effets de l’augmentation démographique d’oiseaux marins, mais peu ont réalisé un suivi sur le long terme en prenant en compte leur déclin après explosion démographique. L’objectif de la présente étude (sur 24 ans) a consisté à mesurer les changements physico-chimiques des sols, de la composition des communautés végétales en relation avec la diminution démographique des Goélands leucophées (Larus michahellis Naumann, 1840) sur les archipels insulaires du Frioul et de Riou (Marseille, France). Les enjeux conservatoires de ce contexte insulaire ont été analysés en caractérisant les types fonctionnels des plantes (formes de croissance de Raunkiaer et stratégies de vie de Grime) et en étudiant la variation des plantes à enjeu de conservation, puisque l’apport de nutriments et de polluants, tels que les éléments traces métalliques, via les goélands peut entraîner leur disparition. Pour cela, des analyses de sol (en 1997 et 2021) ainsi que des relevés floristiques (en 1997, 2008 et 2021) ont été réalisés sur 78 placettes permanentes situées sur neuf îles et sur le littoral continental du Parc national des Calanques. Depuis 1997, les teneurs en nitrogène et le pH ont augmenté, alors que le carbone organique ainsi que le rapport C/N ont diminué. En 2021, les mesures des concentrations en éléments traces révèlent des niveaux de contamination relativement faibles sur le continent et les archipels. De 2008 à 2021, les communautés végétales des îles ont été caractérisées par une augmentation du nombre de plantes rudérales. Le déclin des effectifs de Goélands leucophées n’a pas engendré de diminution des plantes tolérantes aux perturbations ni d’augmentation très significative de la flore à enjeu de conservation, mais a entraîné une augmentation des chamaephytes et du recouvrement total de la strate herbacée. Nos résultats suggèrent donc une rémanence des altérations des paramètres des sols ainsi que des communautés végétales toujours rudéralisées. Cependant, une résilience s’opère en termes de recouvrement de la strate herbacée lorsque la pression des goélands diminue.These island ecosystems are characterized by endemic plants adapted to stressful conditions (xericity, salinity, oligotrophic soil, wind). Several studies have measured the effects of the demographic increase of seabirds, but few have carried out a long-term monitoring by taking into account their demographic decline following an important increase. The aim of the study (over 24 years) was to measure physico-chemical changes of soils, composition of plant communities in relation to the demographic decline of yellow-legged gulls (Larus michahellis Naumann, 1840) on the archipelagos of Frioul and Riou (Marseille, France). Island conservation issues were analyzed by characterizing the functional types of plants (growth forms of Raunkiaer and Grime life-form strategies) and by studying the modification of plants with conservation concern, since the supply of nutrients and pollutants, such as trace metal elements, via gulls can lead to their disappearance. Soil analyzes (in 1997 and 2021) as well as floristic surveys (in 1997, 2008 and 2021) were carried out on 78 permanent plots located on nine islands and on the continental coast of the Calanques National Park. Since 1997, nitrogen levels and pH have increased, while organic carbon and the C/N ratio have decreased. In 2021, measurements of trace element concentrations reveal relatively low levels of contamination on the continent and the archipelagos. From 2008 to 2021, plant communities on the islands have been characterized by an increase in the number of ruderal plants. The decline of yellow-legged gulls population has not led to a reduction in disturbance-tolerant plants neither a significant increase in flora of conservation concern. However, it has led to an increase in chamaephytes and the total herbaceous stratum cover. Our results therefore suggest a persistence of alterations in soil parameters as well as the ruderalized plant communities. However, resilience occurs in terms of recovery of the herbaceous layer when gull pressure decreases.</p
Un nouveau <i>Ceratosphys</i> Ribaut, 1920 (Diplopoda, Chordeumatida, Opisthocheiridae) d’Espagne : taxonomie, phénologie et développement postembryonnaire
No full textLe genre Ceratosphys Ribaut, 1920 (Diplopoda, Chordeumatida) comprend 26 espèces, dont 21 sont signalées dans la péninsule ibérique et les îles Baléares. Cette étude décrit une nouvelle espèce, Ceratosphys dissensionis Gilgado & Andrés n. sp., du centre de l’Espagne. Pour la première fois, des informations sur le développement postembryonnaire et la phénologie sont fournies pour un Chordeumatida Pocock, 1894 ibérique. Les spécimens ont été collectés dans une forêt mixte à Somosierra (Madrid, Espagne) par échantillonnage mensuel de 30 litres de litière pendant un an, récoltés grâce à des Berlèse et conservés dans de l’éthanol à 70 %. Un total de 1050 spécimens de tous les stades, à l’exception du stade I, a été obtenu. La morphologie a été étudiée au microscope optique et au microscope électronique à balayage. Les adultes ont 30 segments et subissent huit mues au cours du développement postembryonnaire, atteignant l’âge adulte au neuvième stade. L’espèce est univoltine avec un cycle de vie d’environ un an, muant approximativement une fois par mois. Les adultes apparaissent en automne et leur présence dans la litière est probablement liée aux conditions environnementales.The genus Ceratosphys Ribaut, 1920 (Diplopoda, Chordeumatida) includes 26 species, with 21 recorded in the Iberian Peninsula and the Balearic Islands. This study describes a new species, Ceratosphys dissensionis Gilgado & Andrés n. sp., from central Spain. For the first time, information on its postembryonic development and phenology is provided for any Iberian Chordeumatida Pocock, 1894. Specimens were collected in a mixed forest in Somosierra (Madrid, Spain) through monthly sampling of 30 litres of leaf litter over a year, processed using Berlese devices, and preserved in 70% ethanol. A total of 1050 specimens of all stages, except stadium I, were obtained. Morphology was studied with optic and scanning electron microscopy. Adults have 30 segments and undergo eight moults during postembryonic development, reaching adulthood in the ninth stadium. The species is univoltine with a life cycle of about one year, moulting approximately once per month. Adults appear in autumn, and their presence in leaf litter is likely related to environmental conditions.</p