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Effets du programme de rééducation cognitive Réflexe sur le fonctionnement exécutif de jeunes de 12 à 17 ans
Full text linkLes fonctions exécutives regroupent un ensemble de processus cognitifs, incluant la mémoire de travail, l’inhibition, la flexibilité cognitive et la planification. Elles permettent d'atteindre des objectifs et de s’adapter à des situations complexes ou nouvelles. Des altérations des fonctions exécutives affectent le fonctionnement quotidien, tant sur les plans scolaire, social et émotionnel, particulièrement chez les adolescents chez qui ces fonctions sont encore en développement. En raison de l’importance de ces fonctions, des interventions de rééducation cognitive ont été développées de sorte à soutenir les individus ayant des déficits exécutifs et ainsi diminuer les répercussions fonctionnelles. À ce jour, les études se sont principalement intéressées à l'entraînement cognitif, un type de rééducation cognitive. Ces études démontrent des effets positifs sur la fonction exécutive ciblée (transfert proximal), mais peu de généralisation vers d'autres fonctions exécutives ou dans la vie quotidienne (transfert distal). Compte tenu de cette limite, certaines études plus récentes ont cherché à améliorer le transfert distal en intégrant une approche basée sur la métacognition, visant à aider les individus à comprendre et à gérer leurs déficits exécutifs grâce à l'apprentissage de différentes stratégies. Bien que ces interventions soient pertinentes pour une clientèle adolescente, qui présente des caractéristiques distinctes des autres tranches d'âge, les études spécifiquement axées sur la rééducation des fonctions exécutives chez les adolescents demeurent plus limitées. Cette étude évalue les effets sur le fonctionnement neurocognitif du programme de rééducation cognitive « Réflexe », basé sur la métacognition, chez des adolescents présentant des déficits exécutifs. Trente-trois jeunes ont participé à l’étude. Les participants sont répartis avec appariement en deux groupes : le groupe expérimental (n = 19) et le groupe contrôle (n = 14). Le fonctionnement neurocognitif a été évalué à l’aide du questionnaire Behavior Rating Inventory of Executive Functions (version parent et jeune) mesurant les comportements quotidiens associés à des difficultés exécutives, et de cinq tests neurocognitifs mesurant quatre processus des fonctions exécutives (mémoire de travail, inhibition, flexibilité cognitive et planification). Les analyses de modèles linéaires mixtes ont permis de comparer les résultats pré et post-intervention, et ce, pour les deux groupes et pour toutes les variables continues de l’étude. Les résultats des groupes ont ensuite été examinés afin d’évaluer si une différence significative était présente chez l’un des deux groupes. Les parents des participants du groupe expérimental ont rapporté une amélioration de la régulation comportementale, possiblement liée à des caractéristiques clés du programme (métacognition et pauses sensorielles). Cependant, les jeunes ont signalé une baisse perçue de leurs capacités de planification et d'organisation, pouvant potentiellement s’expliquer par une plus grande conscience de leurs difficultés. Aucun effet n’a été observé sur les tests neurocognitifs, à l’exception d’une légère amélioration de l’inhibition et de la planification dans le groupe contrôle, probablement attribuable à un effet de pratique. Ces résultats mettent en lumière certaines forces et limites du programme Réflexe, soulignant de potentiels ajustements et l'importance de poursuivre les recherches pour optimiser son efficacité
Intervention de formation auprès des personnes superviseures cliniques, incluant une boîte à outils, pour favoriser un meilleur encadrement des personnes étudiantes en situation de handicap lors de stages en soins infirmiers
No full textLe nombre de personnes étudiantes ayant des besoins spécifiques a considérablement augmenté dans les établissements postsecondaires. En sciences infirmières, cette croissance est aussi notée. Leur accompagnement en milieu clinique constitue un enjeu fondamental pour les personnes superviseures cliniques. Ces dernières rapportent ne pas se sentir bien préparées à superviser ces personnes étudiantes en situation de handicap (PESH), alors qu’elles jouent un rôle clé dans cette dynamique. Elles disent manquer de guides ou de ressources spécifiques pour adapter leur accompagnement en stage, bien qu’elles expriment leur motivation à bien les soutenir. De leur côté, les stagiaires ayant des troubles d’apprentissage et TDA/H ne révèlent pas toujours leur handicap et leurs besoins aux personnes superviseures cliniques par peur d’être étiquetés ou mal vus, entre autres par les personnes superviseures, leurs pairs et le personnel en milieu clinique. Le projet en pratique infirmière avancée avait pour objectif de concevoir et de diffuser une intervention sur mesure afin de soutenir les personnes superviseures cliniques d’un Cégep, responsables de l’encadrement des PESH lors des stages en soins infirmiers. À la lumière des connaissances actuelles sur les interventions ou stratégies potentiellement utiles pour soutenir à la fois les personnes superviseures et les PESH en milieu clinique, ainsi que de l’analyse des besoins exprimés par les personnes superviseures cliniques du milieu de stage en pratique infirmière avancée et des ressources et processus de soutien existants, une formation spécifique, accompagnée d’une boîte à outils, a été élaborée. Cette formation visait à améliorer la compréhension des besoins des PESH et à fournir des stratégies concrètes pour favoriser leur réussite lors de stages en soins infirmiers
Physiopathology and hyperinsulinemia of human vascular smooth muscle cells of men and women
No full textHyperinsulinemia refers to an elevated level of circulating insulin (80 and 100 µU/mL), often leading to metabolic disorders such as obesity, insulin resistance, and type 2 diabetes (T2D). Elevated insulin levels can directly affect vascular function and contribute to the pathophysiology of the cardiovascular system, including secondary arterial hypertension (SAH) and atherosclerosis. It is well known that hyperinsulinemia induced remodeling of the heart. However, there is no information on whether intrinsic differences exist between human vascular smooth muscle cells (VSMCs) and if in vitro hyperinsulinemia induces human VSMCs morphological and intracellular homeostasis remodeling in a sex and sex hormones dependent manner. Our in vitro cultured human VSMCs coupled to quantitative 3D confocal imaging results show that intrinsic differences exist between VSMCs of young men and women. Chronic hyperinsulinemia (80 µU/mL,48-hour treatment) increases cell and nuclear volumes associated with increased intracellular calcium (Ca2+) and ROS and decreased glutathione. In the absence of hyperinsulinemia, pretreatment of VSMCs with testosterone in men and oestradiol in women had no effect. Both sex hormones partially but not completely prevented hyperinsulinemia-induced remodeling of VSMCs in young men and women. The increase in VSMCs volume may increase the thickness of the intima-media, leading to a decrease in the lumen of the blood vessel, which promotes the development of SAH and atherosclerosis in a sex-dependent manner. This work was the subjet of a publication (Jazzar et al., 2025)L'hyperinsulinémie désigne un taux élevé d'insuline circulante (80 et 100 µU/mL), qui entraîne souvent des troubles métaboliques tels que l'obésité, la résistance à l'insuline et le diabète de type 2 (T2D). Des niveaux élevés d'insuline peuvent affecter directement la fonction vasculaire et contribuer à la physiopathologie du système cardiovasculaire, y compris l'hypertension artérielle secondaire (HSA) et l'athérosclérose. Il est bien connu que l'hyperinsulinémie induit un remodelage du cœur. Cependant, on ne sait pas s'il existe des différences intrinsèques entre les cellules musculaires lisses vasculaires humaines (VSMC) et si l'hyperinsulinémie in vitro induit un remodelage morphologique et de l'homéostasie intracellulaire des VSMC humaines en fonction du sexe et des hormones sexuelles. Nos cultures in vitro de VSMCs humaines couplées à des résultats quantitatifs d'imagerie confocale 3D montrent qu'il existe des différences intrinsèques entre les VSMCs d'hommes et de femmes jeunes. L'hyperinsulinémie chronique (80 µU/mL, traitement de 48 heures) augmente les volumes cellulaires et nucléaires associés à une augmentation du calcium intracellulaire (Ca2+) et des ROS et à une diminution du glutathion. En l'absence d'hyperinsulinémie, le prétraitement des VSMC avec de la testostérone chez les hommes et de l'œstradiol chez les femmes n'a pas eu d'effet. Les deux hormones sexuelles ont partiellement, mais pas complètement, empêché le remodelage des VSMC induit par l'hyperinsulinémie chez les jeunes hommes et les jeunes femmes. L'augmentation du volume des VSMC peut accroître l'épaisseur de l'intima-média, entraînant une diminution de la lumière du vaisseau sanguin, ce qui favorise le développement de l'HSA et de l'athérosclérose de manière sexo-dépendante. Ce travail a fait l’objet d’une publication (Jazzar et al., 2025)
Mouvements de résistance : mobilité, agentivité et chronotope au féminin dans le roman québécois de 1930 à 1985
No full textCette thèse porte sur les évolutions (progressions et ressacs) des représentations de la mobilité au féminin en rapport avec l’agentivité dans le roman québécois de 1930 à 1985. À travers un cadre d’analyse féministe, constructionniste et intersectionnel (Bilge) puisant à la géographie (Rose, Massey, Domosh et Saeger, Cresswell et Uteng), à la sociologie (Guillaumin, Condon, Lieber et Maillochon) et aux théories du chronotope (Bakhtine, Collington, Peeren, Salaün), j’étudie plus précisément la dimension agentive des trajectoires féminines dans neuf romans publiés au cours de trois décennies (1930, 1960, 1980). Partant de l’idée que les sujets sont à la fois assujettis et subjectivés par les normes, et que par conséquent ils se trouvent dotés de la faculté de déroger aux normes dans l’élan même de leur conformation (Butler), je mets au jour les dispositifs (Foucault, Agamben) et dispositifs spatiaux (Lussault, Borghi) représentés et examine la manière dont les protagonistes répondent aux normes et assignations sociospatiales, si les personnages se meuvent en accord ou en dépit de leurs volontés.
La théorie du chronotope de Mikhaïl Bakhtine s’avère propice à l’analyse diachronique des représentations de l’espace et du temps dans leur dimension genrée (Cave, Gasbaronne), de même qu’à l’étude des processus de subjectivation, lesquels sont toujours ancrés spatialement (Peeren). Pour chacune des périodes sondées, je cible les concordances spatio-temporelles entre les romans et identifie les chronotopes bakhtiniens qui leur sont corolaires, ceux-ci constituant un cadre au devenir sujet et à la capacité d’agir. Après une première partie introductive exposant le cadre théorique, je consacre un chapitre à l’étude de trois textes publiés dans les années trente (La chair décevante de Jovette Bernier (1931), L’initiatrice de Rex Desmarchais (1932), En marge de la vie de Lucie Clément (1934)), qui se déploient sous le sceau du seuil chronotopique. S’ensuit un deuxième chapitre portant sur des romans des années soixante (Simone en déroute de Claude Mathieu (1963), Les remparts de Québec d’Andrée Maillet (1964), Une forêt pour Zoé de Louise Maheux-Forcier (1969)), que j’ai associés à deux chronotopes enchevêtrés : celui de la petite ville de province et celui des aventures et de mœurs. Dans le troisième et dernier chapitre, je m’attache à l’analyse de récits parus dans les années quatre-vingt (Ah, l’amour l’amour de Noël Audet (1981), Visions d’Anna ou le vertige de Marie-Claire Blais (1982), Volkswagen Blues de Jacques Poulin (1984)), placés sous l’égide du chronotope de la route.
Il se dégage de cette étude que l’émancipation sociospatiale des personnages féminins suit, dans l’ensemble, un courbe chronologique, s’accroissant au fil du vingtième siècle. Apparaît toutefois que l’empreinte des pouvoirs patriarcaux est perceptible dans l’ensemble du corpus, que le statut conjugal et familial infléchit considérablement ces trajectoires émancipatoires, de même que l’orientation sexuelle, l’appartenance raciale et de classe
The discourse on epistolary norms: oscillations, transitions and interactions between description and prescription
No full textThis contribution focuses on metalinguistic and metaepistolary discourse in seventeenth-and early eighteenth-century France. By analysing six epistolography manuals using S. Große’s model of normative discourse, it seeks to determine how these texts articulate norms, whether they differ in this respect, and whether any diachronic evolution can be observed. The study shows that all the texts contain a wide range of (rather) prescriptive and (rather) descriptive formulations. It is also shown that these formulations must nevertheless always be read in context to capture their full prescriptive force. Moreover, more recent printed texts seem to tend to use explicitly prescriptive formulations more frequently. Finally, the paper outlines a possible future quantitative analysis supported by digital tools, which could provide even more accurate results.Notre contribution porte sur le discours métalinguistique et méta-épistolaire au XVIIe et au début du XVIIIe siècle en France. En analysant six manuels épistolographiques à l’aide du modèle du discours normatif établi par S. Große, nous cherchons à savoir comment ces textes articulent les normes, s’ils diffèrent les uns des autres à cet égard et si une évolution diachronique peut être constatée. Il ressort de notre étude que tous les textes présentent une grande richesse de formulations (plutôt) prescriptives et (plutôt) descriptives, mais que ces formulations doivent néanmoins toujours être lues dans leur contexte afin de saisir leur pleine force prescriptive. En outre, les textes imprimés plus récents semblent avoir tendance à recourir plus souvent à des formulations explicitement prescriptives. Enfin, nous esquissons les grandes lignes de la forme que pourrait prendre une future analyse quantitative assistée par ordinateur, susceptible de fournir des résultats encore plus précis
Caractérisation cryogénique de transistors industriels pour la co-intégration quantique
No full textCe mémoire présente une étude de différentes technologies de transistors CMOS modernes, visant à évaluer leur potentiel pour des applications en électronique cryogénique ainsi que pour la co-intégration avec des processeurs quantiques.
Le premier chapitre présente en premier lieu les avancements de la technologie CMOS au cours des dernières décennies qui a permis la miniaturisation et l'augmentation de l'efficacité des transistors dans les processeurs de nos ordinateurs. Par la suite, une brève explication des principes physiques en lien au fonctionnement d'un transistor est présentée en portant une attention particulière sur le comportement des porteurs de charge, de la tension de seuil, de la pente sous le seuil, et de la mobilité lorsque la température est fortement réduite jusqu'à 4,2 K et moins. Le premier chapitre se finalise avec quelques motivations reliées à l'informatique quantique pour développer des modèles cryo-CMOS ainsi qu'un état de l'art sur les mesures à basse température de différentes technologies CMOS ainsi que quelques modèles théoriques cryogéniques qui permettent de décrire physiquement le comportement d'un transistor.
Le deuxième chapitre présente une étude détaillée du transport électrique de 300 K jusqu'à 4,2 K sur des dispositifs FinFET de type n et p avec des longueurs de grille de 36 nm et de 250 nm ainsi que des dispositifs Nanosheet et Forksheet de type n avec une longueur de grille de 14 nm. Le chapitre débute par une description de la méthode d'analyse à l'aide de courbes I_D-V_G ainsi que les méthodes pour extraire la tension de seuil (V_th), la pente sous le seuil (SS) et les courants ouvert (I_ON) et fermé (I_OFF). Les trois technologies fabriquées chez l'IMEC sont ensuite présentées suivies du montage de mesure à la station sous pointe. Ensuite, les courbes I_D-V_G en température sont présentées sur tous les types de dispositifs accompagnés d'une analyse qualitative des courbes. Le chapitre se termine par les courbes des principaux paramètres extraits en fonction de la température, accompagnées de l'interprétation physique des résultats.
Le troisième et dernier chapitre étudie la présence de boîte quantique dans les dispositifs Nanosheet et Forksheet à 1,2 K et 10 mK ainsi qu'une analyse du bruit de charge à basse fréquence. Un bref rappel du transport en régime de blocage de Coulomb est d'abord présenté suivi des différents montages de mesure pour réaliser les expériences. Les mesures de boîtes quantiques sont ensuite présentées et interprétées à l'aide de diagrammes de stabilité. Finalement, une étude sur le bruit de charge est réalisée en expliquant d'abord son origine et son importance dans les performances des qubits de spin suivies de la méthode de mesures et des résultats obtenus sur les dispositifs mesurés
Création d’un matériel pédagogique permettant de développer les compétences psychosociales et socio-émotionnelles chez les élèves atteints de mutisme sélectif du 3e cycle du primaire : essai inspiré du programme HORS-PISTE
No full textLe présent essai de maîtrise porte sur le soutien aux élèves de 3e cycle primaire atteints de mutisme sélectif en milieu scolaire. Classé parmi les troubles anxieux, ce trouble reste peu documenté et peu connu de la population, ce qui laisse les professionnels scolaires et les parents démunis face aux interventions à privilégier. Cet essai vise la conception et la validation d’un matériel pédagogique favorisant le développement des compétences socio-émotionnelles et psychosociales de ces élèves. La méthodologie repose sur une approche qualitative et sur la consultation d’un groupe d’experts composés d’enseignants et de professionnels du milieu de l’éducation. L’objectif est de concevoir un matériel pédagogique structuré autour de six compétences socio-émotionnelles et psychosociales, puis d’en faire l’évaluation auprès d’experts du milieu de l’éducation, afin de répondre aux besoins spécifiques des élèves atteints de mutisme sélectif. Les activités proposées dans le cadre de ce matériel intègrent les éléments de la pédagogie de la créativité. Un total de neuf séquences d'apprentissage s'étalant sur une période de neuf semaines est prévu. Les retombées éducatives attendues visent à outiller concrètement le milieu scolaire face aux besoins de ces élèves et à la problématique entourant leur réussite
Le syndrome post-COVID-19 et l’impact de l’exercice sur son évolution à long terme
No full textIntroduction :
Le syndrome post COVID-19 (SPC) est une complication diagnostiquée lorsque les symptômes de l’affection au COVID-19 persistent après 12 semaines. Les symptômes, notamment la fatigue, peuvent entrainer une diminution de la capacité physique et de la qualité de vie des patients. Aucun traitement spécifique n’existe à ce jour, mais les protocoles d’exercice semblent contribuer à l’amélioration de cette condition. Une étude interventionnelle randomisée contrôlée ayant testé un protocole d’exercice mixte a eu lieu dans notre laboratoire de 2021 à 2023 (le projet COVEX) et a montré des améliorations significatives de la capacité physique après 8 semaines d’entrainement du groupe réentraîné par rapport au groupe témoin. À notre connaissance, aucune étude n’a examiné ce qui advient de la récupération de ces patients à la suite d’un programme d’exercice, si les améliorations de la capacité physique perdurent, si la qualité de vie s’en trouve améliorée et même, si la pratique d’exercice (ou le niveau d’activité physique) est maintenue quelques mois après la fin de l’intervention. Le projet COVEXtension, suite du projet COVEX, s’est déroulé au printemps 2025.
Objectifs du projet COVEXtension:
Objectif 1 : Chez des patients ayant le syndrome post-COVID-19, déterminer les changements de la capacité physique, des symptômes et de la pratique d’activité physique environ deux ans après la participation au projet COVEX.
Objectif 2 : Déterminer l’association entre le niveau d'activité physique (AP) au moment du suivi et la capacité physique, les symptômes, la qualité de vie et le statut fonctionnel.
Méthodes :
Neuf participants du projet COVEX ont accepté de participer au projet de suivi (7 femmes et 2 hommes). La moyenne d’âge des participants était de 49±13 ans. Les mesures suivantes avaient été effectuées lors du projet COVEX : les cinq tests physiques (tirés du senior fitness test et le test de marche de 6 minutes [TDM6] : Timed-up-and go [TUG], test d’assis-debout sur 30 secondes [STS-30], flexion du coude, force de préhension [FP]) ont été effectués pour mesurer la capacité physique, deux questionnaires portant sur la pratique d’activité physique ([AP] Physical activity questionnaire for the elderly [PASE], Menez une vie plus active [Q-MVPA]) ainsi qu’un questionnaire sur les symptômes de SPC. Ces mesures ont été reprises à la visite COVEXtension pour établir une comparaison de la condition. De plus, des questionnaires sur la qualité de vie (EQ-5D-5L) et la pratique d’activité physique (Actualisation du questionnaire d’activité physique [AQAP]), ainsi qu’un test d’estimation de répétition maximale à la presse à cuisse ont été ajoutés pour compléter le portrait de la condition physique générale des participants.
Résultats :
Les résultats montrent que les résultats aux tests de capacité physique ont diminué pour 4 des 5 tests (temps au STS-30 (p=0,028), distance de marche au TDM6 (p=0,008), nombre de répétitions de flexion du coude (p=0,017), temps au TUG (p=0,038)). Aucun changement significatif n’a été noté pour les symptômes et la pratique d’activité physique entre la dernière visite COVEX et la visite du projet COVEXtension. Des corrélations sont établies entre certains résultats aux tests de capacité physique et le niveau d’activité physique pour répondre à l’objectif 2, notamment entre la pratique d’AP (PASE) et le STS-30 (r=0,866, p=0,03), entre la pratique d’AP (Q-MVPA) et la distance de marche au TDM6 (r=0,814, p=0,008), entre la pratique d’AP (PASE) et le nombre de répétitions au test de flexion du coude (r=0,895, p=0,001) et une tendance d’association entre la pratique d’AP (Q-MVPA) et le temps au TUG (r=-0,661, p=0,053) suggérant que plus les niveaux de pratique d’activité physique sont élevés, meilleure est la condition physique.
Conclusion :
En moyenne 27 mois après la fin du programme d’exercice, les participants ont généralement une moins bonne performance aux tests physiques par rapport à leur performance juste après la participation au projet COVEX, ce qui pourrait indiquer une diminution de la capacité physique générale. De plus, les résultats montrent que les personnes plus actives au moment du suivi ont mieux performé aux tests physiques que les personnes moins actives. Nos résultats ajoutent aux connaissances scientifiques portant sur le suivi de la condition chez les personnes atteintes de SPC après une intervention en exercice et renforcent la pertinence de l’activité physique chez cette population. Toutefois, l’interprétation de nos résultats doit être faite avec prudence considérant la taille de l’échantillon.Introduction: Post-COVID condition (PCC) is diagnosed when symptoms of COVID-19 persist after 12 weeks. Symptoms, including fatigue, can lead to a decrease of physical capacity and quality of life. No treatment for PCC has been proven to be effective yet, but a few mixed exercise protocols have been studied in the last years as possible adjunct treatment and have shown generally encouraging results. The COVEX study, which aimed to determine if a mixed exercise training program (3x/week for 8 weeks) would improve the clinical condition of PCC patients, showed significant improvements in physical capacity and symptomatology. This study took place from 2021 to 2023. To this date, however, no studies evaluated the long-term effects of exercise intervention in PCC patients. The COVEXtension study, following the COVEX study, took place in 2025. Aims: Objective 1 : In PCC patients, determine changes in physical capacity, symptoms and physical activity levels since the end of the COVEX study. Objective 2 : Determine associations between physical activity levels at the follow up with physical capacity, symptoms, quality of life and functional status.
Methods: 9 participants from the COVEX study were included in the COVEXtension study (7 women, 2 men). Participant’s mean age was 49±13 years. The following measures had been previously taken in the COVEX study and were taken as comparative for the COVEXtention study: five physical capacity tests (6-minute walk test [6MWT], Timed-up-and-go [TUG], Grip strength [GS], bicep curl [BC], 30 seconds sit-to-stand test [30-STS]) and physical activity level [PAL] (including PASE questionnaire and Get active questionnaire) and the presence of common PCC symptoms are used to compare patient’s condition for ~2 years follow-up. In addition, three variables were added in the COVEXtension study to complete the physical capacity and physical activity portrait : perceived quality of life and health (EQ-5D-5L), functional status (post-COVID functional status scale) and estimated 1RM at leg press. The following methods were used in the COVEX study: physical capacity, PASE, Get active questionnaire and symptoms questionnaire. Results: We observed a decrease in the performance for 4 out of 5 physical tests : numbers of repetitions at the 30-STS (p=0,028), walking distance after 6MWT (p=0,008), number of repetitions of bicep curls (p=0,017), time of completion of the TUG (p=0,038). No change for symptoms or physical activity level were observed (get active questionnaire and PASE). Correlations were established between tests and questionnaires. PAL (PASE) and lower limb strength (30-STS) (r=0,866, p=0,03), PAL (Q-MVPA) and walking distance (6MWT) (r=0,814, p=0,008), and PAL (PASE) and number of repetitions of bicep curls (r=0,895, p=0,001) showed significant correlations and a tendency was established for PAL (Get active questionnaire) and time of completion of the TUG (r=-0,661, p=0,053), suggesting that higher PAL is associated to a greater physical capacity.
Conclusion: Twenty-seven months after participation to the intervention, participants showed a general decrease in physical capacity. This decrease was less pronounced in more active participants and a greater decrease was observed in less active participants. This needs to be confirmed in a larger sample. Our results add to the scientific knowledge on exercise intervention follow-up in PCC and reinforce the importance of physical activity in this population
Automatic detection of mild intracranial stenosis in the Circle of Willis from magnetic resonance angiography (TOF-MRA)
No full textLe Cercle de Willis (CW) est une structure artérielle centrale située à la base du cerveau. Il joue un rôle fondamental dans l’approvisionnement sanguin cérébral, en assurant la compensation en cas de réduction du flux dans une artère majeure. Parmi les pathologies pouvant affecter cette région, les sténoses intracrâniennes légères (MIS), définies comme un rétrécissement artériel entre 20% et 50%, sont fréquemment sous-diagnostiquées en pratique clinique. Bien que souvent asymptomatiques, ces sténoses peuvent représenter un facteur de risque pour des événements cérébrovasculaires ultérieurs. L’angiographie par résonance magnétique en temps de vol (TOF-MRA) est une modalité d’imagerie non invasive permettant de visualiser les artères cérébrales sans injection d’agent de contraste. Grâce à sa résolution élevée, elle constitue un outil de choix pour l’étude du CW. Nous proposons dans ce mémoire une méthode automatisée pour la détection des MIS à partir d’images TOF-MRA du CW. En nous appuyant sur la segmentation du CW issue de l’application eICAB, nous reconstruisons la surface en 3D, ce qui permet d’extraire précisément des caractéristiques géométriques fines, telles que le diamètre et la surface en coupe transversale, au niveau des principales artères du CW, dans le but d’identifier automatiquement les segments présentant une sténose légère. Une contribution essentielle de ce travail est l’intégration d’un algorithme de correction des vaisseaux en contact, qui permet de traiter les artéfacts fréquents dans les zones où les surfaces vasculaires se touchent, notamment dans les segments tortueux de l’artère carotide interne (ICA). Grâce à cette approche, nous parvenons à extraire correctement les lignes centrales. De plus, notre méthode permet de détecter les MIS avec une précision élevée dans l’ensemble des artères du CW, en moins d’une minute par sujet, et ce sans intervention manuelle. Les résultats montrent que notre méthode permet une détection rapide, fiable et reproductible des MIS, ouvrant la voie à des études à grande échelle sur des cohortes de patients, et à une meilleure identification précoce du risque vasculaire chez les individus asymptomatiques.Abstract: The Circle of Willis (CW) is a central arterial structure located at the base of the brain. It plays a fundamental role in cerebral blood supply by providing compensatory flow in cases of reduced perfusion in a major artery. Among the vascular pathologies that can affect this region, mild intracranial stenosis (MIS), defined as an arterial narrowing between 20% and 50%, is frequently underdiagnosed in clinical practice. Although often asymptomatic, MIS may represent a risk factor for future cerebrovascular events. Time-of-Flight Magnetic Resonance Angiography (TOF-MRA) is a non-invasive imaging modality that enables the visualization of cerebral arteries without the use of contrast agents. Thanks to its high spatial resolution, TOF-MRA is particularly well-suited for investigating the CW. In this thesis, we propose a fully automated method for detecting MIS from TOF-MRA images in the Circle of Willis. Based on CW segmentations provided by the eICAB application, we reconstruct the arterial surface in 3D, allowing for the precise extraction of fine geometric features, such as arterial diameters and cross-sectional areas, in the main arteries of the CW, with the aim of automatically identifying segments affected by mild stenosis. A key contribution of this work is the integration of a kissing vessel correction algorithm, which resolves common artifacts in areas where arterial surfaces are in contact, particularly in tortuous segments of the ICA. This approach enables accurate centerline extraction. Moreover, our method detects MIS with high accuracy across all CW arteries in less than one minute per subject, without any manual intervention. The results demonstrate that our method allows for fast, reliable, and reproducible detection of MIS, paving the way for large-scale cohort studies and earlier identification of vascular risk in asymptomatic individuals
Analyse des ARN non codants
No full textLa bioinformatique est aujourd’hui un domaine clé de la recherche en sciences de la vie. Elle fournit des méthodes computationnelles essentielles pour l’analyse et l’interprétation des données biologiques massives issues du séquençage à haut débit. Dans ce contexte, l’annotation des Acides RiboNucléiques non codant (ARNnc) constitue aujourd’hui un défi majeur en génomique fonctionnelle et en biologie computationnelle. Ces molécules, longtemps considérées comme du bruit transcriptionnel, sont désormais reconnues comme des acteurs essentiels de la régulation génétique et de l’évolution des génomes. Pourtant, leur grande diversité et l’absence de signaux protéiques clairs rendent leur classification et leur annotation particulièrement ardues.
Ce mémoire s’inscrit dans la continuité des travaux de Chegrane et al. (2023), qui ont proposé le pipeline LSC-ncRNA, basé sur une représentation vectorielle des séquences par motifs (k-mers) et une classification supervisée. Notre objectif a été d’automatiser et d’enrichir cette approche afin de la rendre à la fois reproductible, performante et plus explicable pour la communauté scientifique.
Dans une première étape, nous avons repris et documenté le pipeline initial, en évaluant différents modèles de classification supervisée. L’accent a été mis sur l’analyse de l’importance des motifs discriminants à l’aide d’arbres de décision et de forêts aléatoires. Cette étape a permis d’identifier un sous-ensemble réduit de motifs contribuant significativement à la différenciation entre familles d’ARNnc.
La seconde partie du travail s’est attachée à explorer la qualité des regroupements obtenus. Différentes approches ont été mobilisées : réduction de dimension (ACP), métriques de qualité de regroupement (Silhouette, Davies–Bouldin), et méthodes non supervisées comme k-moyennes. Les résultats ont montré que si les motifs de séquence portent une information discriminante, la séparation stricte entre familles reste limitée.
Ces observations ont motivé une analyse à l’échelle des clans définis par la base Rfam. L’étude de la cohésion et de la séparation intra et inter-clans, complétée par des visualisations (cartes thermiques, dendrogrammes), met en évidence des regroupements robustes mais aussi des zones de transition biologiquement complexes.
En conclusion, ce travail propose une approche explicable pour l’annotation des ARNnc, conciliant performance algorithmique et interprétation biologique, et ouvre des perspectives intégrant séquence, structure et évolution