OpenMETU (Middle East Technical University)
Not a member yet
110280 research outputs found
Sort by
Two decades later: letter transpositions within and across morpheme boundaries in L1 and L2 speakers
This study examined the influence of letter transpositions on morphological facilitation in L1 English and L1 Chinese-L2 English speakers. Morphological priming effects were investigated by comparing morphologically complex primes that either contained transposed-letters (TL) within the stem or across the morpheme boundary, relative to a substituted-letter (SL) control. Within two masked primed lexical decision experiments, the same stem targets were preceded by morphologically related, TL-within, SL-within, TL-across, SL-across, or unrelated primes. Reaction time analyses with morphologically intact primes revealed facilitation in both L1 and L2 English. In L1, TL-within priming was significant, while the magnitude of TL-across priming varied as a function of positional specific bigram frequency and spelling proficiency. In L2, TL-priming was entirely absent. These findings support models of complex word recognition that accommodate relative flexibility in letter position encoding
Malign Hipertermi İçin Teşhisi Yeni İnvazif Olmayan Ekstraktif Probların Geliştirilmesi
Malignant hyperthermia (MH) is a genetic disorder that leads to uncontrolled calcium release from muscle cells and can be fatal if left untreated. A contracture test using a freshly cut muscle is performed for diagnosis, but the invasiveness of the test necessitates a novel test to diagnose MH in a minimally invasive way.
This study aims to develop a sensitive analytical tool that can be used to identify MH susceptibility without biopsy. For this purpose, a low-invasive technique, solid phase microextraction was chosen. To determine the extractive phase that should be used, hydrophilic-lipophilic balanced (HLB) polymer, HLB with strong cation and anion exchangers, polydivinyl benzene, and polymethacrylic acid were synthesized, characterized and immobilized on micro-sized nitinol wires using dip-coating.
To determine the best extractive phase, their extraction performances were investigated in two different scenarios using targeted analysis approach for model compounds in PBS and untargeted metabolomic approach in plasma. Both results showed that HLB is the most successful extractive phase. In addition, targeted studies showed that methanol containing 0.1% formic acid or 0.1% ammonia are the best eluants for nonpolar and polar analytes, respectively. Since the goal of this study is developing a sampler for sensitive in-vivo extraction, HLB was also coated on fiber using electrospinning to investigate if this might result in enhanced extraction kinetics. Extractions performed in agarose gel (mimicking tissue) with both types of fibers did not show an overall advantage for electrospun-coated fibers which could be associated with structural blockage of fibrous structure by used glue.Malign hipertermi (MH), kas hücrelerinden kontrolsüz kalsiyum salınımına neden olan ve tedavi edilmediği takdirde ölümcül olabilen genetik bir hastalıktır. Hâlihazırda MH tanısı yeni kesilmiş bir kas kitlesine uygulanan kontraktür testi ile yapılmaktadır fakat bu testin oldukça invaziv olması daha az invaziv alternatif teşhis yöntemlerinin geliştirilmesi ihtiyacını doğurmaktadır.
Bu çalışma, biyopsi olmadan MH tanısında kullanılabilecek hassas bir analitik teknik geliştirmeyi amaçlamaktadır. Bu amaçla minimal invaziv katı faz mikroekstraksiyon tekniği seçilmiştir. Kullanılacak uygun ekstraktif fazı seçebilmek için hidrofilik- lipofilik dengeli (HLB) polimer, güçlü katyon ve anyon değiştiricili HLB, polidivinil benzen ve polimetakrilik asit parçacıkları sentezlenmiş, karakterize edilmiş ve daldırarak kaplama yöntemi kullanılarak mikrometre boyutlu nitinol teller üzerine sabitlenmiştir.
En iyi ekstraktif fazı belirleyebilmek için, hazırlanan SPME fiberlerinin ekstraktif performansları öncelikle hedefli analiz yaklaşımı ile model bileşiklerin PBS’den ekstraksiyonları ile çalışılmış ve ardından hedefsiz analiz yaklaşımı kullanılarak plazma metabolomu çalışılmıştır. Her iki sonuç da HLB’nin en başarılı ekstraktif faz olduğunu göstermiştir. Ayrıca hedefli çalışmalar, %0,1 formik asit veya %0,1 amonyak içeren metanolün sırasıyla apolar ve polar analitler için en iyi elüent olduğunu göstermiştir. Bu çalışmanın amacı hassas in-vivo ekstraksiyon yapmak için bir örnekleyici geliştirmek olduğundan, HLB parçacıkları ayrıca elektroeğirme yöntemi kullanılarak fiber üzerine kaplanmış ve hızlı ekstraksiyon kinetiği sağlama potansiyeli değerlendirilmiştir. Her iki tip fiber ile agaroz jelde (dokuyu taklit eden) gerçekleştirilen ekstraksiyonlar, elektroeğirme ile kaplanan fiberler için genel bir avantaj göstermemiştir. Bu sonuç kullanılan yapıştırıcının fibröz yapıdaki kaplamayı bloke etmesiyle ilişkilendirilebilir.M.S. - Master of Scienc
Besin zinciri biyobirikim modellemesi kullanarak insanların organik kimyasallara balık tüketimi yoluyla maruziyetinin tahmini
In this study, the Aquatic Foodweb and TMF Model was used to predict bioaccumulation potentials of hydrophobic organic pollutants monitored in lakes in Türkiye. Data available in the literature was used for predicting specie chemical concentrations in pelagic, demersal and combined food webs. These data were then used to assess risks to human health via consumption of fish. Sensitivity analysis yielded logKow and chemical concentration in water as sensitive parameters for all species, whereas lipid content of detritus and phytoplankton had a great impact on the chemical concentration in organisms. Model was validated with data from Lake Ontario, Canada, and Lake Efteni and Lake Karaboğaz from Türkiye. Overprediction was observed, which was attributed to lack of: (i) site-specific information on food web and other environmental data, (ii) elimination mechanisms, (iii) incorporation of bioavailability of chemicals. The model was applied to determine organochlorine pesticide concentrations in tench and common carp from Lake Sapanca and sand smelt from Lake İznik. Human health risk assessment was conducted for both carcinogenic and non-carcinogenic health impacts on adults, adolescents and children. The outcomes reveal that the carcinogenic and non-carcinogenic risks associated with the consumption of fish from Lake Sapanca and Lake İznik are above acceptable limits, although overestimation potential is present. Chemical concentrations in these water resources are above the environmental quality standards, which result in potential health risks associated with fish consumption, as per model results. This thesis study underscores potential chemical related dangers originating from these lakes.Bu çalışmada, Türkiye'deki göllerde izlenen hidrofobik organik kirleticilerin biyobirikim potansiyellerini tahmin etmek için “Aquatic Foodweb and TMF Model” modeli kullanıldı. Literatürde mevcut veriler, kullanılan modelin pelajik, demersal ve birleşik besin ağlarında türlerin kimyasal konsantrasyonlarını tahmin etmek için kullanıldı. Bu veriler daha sonra balık tüketiminin insan sağlığına yönelik riskleri değerlendirmek için kullanıldı. Duyarlılık analizi, tüm türler için logKow ve sudaki kimyasal konsantrasyonunu hassas parametreler olarak belirlerken, detritus ve fitoplanktonun lipid içeriğinin organizmalardaki kimyasal konsantrasyonu üzerinde büyük bir etkisi olduğunu ortaya koydu. Model, Kanada'daki Ontario Gölü ve Türkiye'deki Efteni Gölü ve Karaboğaz Gölü verileriyle doğrulandı. Aşırı tahmin gözlemlendi, bu da şu eksikliklere atfedildi: (i) besin ağı ve diğer çevresel verilerle ilgili bölgeye özel bilgilere, (ii) eliminasyon mekanizmalarına, (iii) kimyasalların biyoyararlanabilirliğinin dahil edilmesine. Model, Sapanca Gölü'nden kadife balığı ve sazandaki, İznik Gölü'nden gümüş balığındaki organoklorlu pestisit konsantrasyonlarını belirlemek için uygulandı. İnsan sağlığı risk değerlendirmesi, yetişkinler, ergenler ve çocuklar üzerindeki hem kanserojenik hem de kanserojenik olmayan etkileri için yapıldı. Sonuçlar, aşırı tahmin ihtimali olsa da Sapanca Gölü ve İznik Gölü'nden balık tüketiminin kanserojenik ve kanserojenik olmayan risklerinin kabul edilebilir limitlerin üzerinde olduğunu olduğunu ortaya koymaktadır. Bu göllerdeki kimyasal konsantrasyonlarının çevre kalite standartlarının üzerinde olması, bu çalışmanın sonuçları gösterdiği üzere balık tüketiminin potansiyel sağlık riskleri taşımasına sebep olmuştur. Bu tez çalışması, bu göllerden kaynaklanan potansiyel kimyasal tehlikeleri vurgulamaktadır.M.S. - Master of Scienc
TCC+ VE GİZLİ ÇARMONYUM 1+- VE 0++ TETRAKUARKLARIN QCD TOPLAM KURALLARINDA ÇALIŞILMAS
Recently, exotic hadrons have become a very important and interesting topic for particle physics, especially after the observation of the exotic particle X(3872).
The Tcc+ tetraquark, which has a very similar structure to X(3872), was observed in the LHCB experiment of CERN in 2021. However, this new particle has different properties than the previously observed exotic hadrons, as it contains two heavy quarks and no heavy antiquark. In this study, the masses of the double open charm Tcc+ tetraquark, and hidden charm states with JPC=1+- and JPC=0++, and with the motivation taken from heavy-quark spin symmetry, their mass relations are studied.QCD sum rules method, which allows successful results in hadron phenomenology, is used in the calculations. As a result of the analyses, by determining the most appropriate values of the parameters required for the QCD sum rules, the mass of the Tcc+ tetraquark is obtained in a manner comparable to the experiments and as predicted by heavy-quark spin symmetry, the mass differences of the 1+- and 0++ states are found to be small enough, only a few MeV, as expected.Son zamanlarda, egzotik hadronlar, özellikle X(3872) egzotik parçacığının gözlemlenmesinden sonra, parçacık fiziği için çok önemli ve ilginç bir konu haline gelmiştir.
X(3872) ile oldukça benzer bir yapıya sahip olan Tcc+ tetrakuark, 2021 yılında CERN'in LHCB deneyinde gözlemlenmiştir. Ancak bu yeni parçacık, iki ağır kuark içerdiği ve antikuark içermediği için, daha önce gözlemlenen egzotik hadronlardan farklı özelliklere sahiptir. Bu çalışmada açık çift çarm Tcc+ tetrakuark ve gizli çarm JPC=1+- ve JPC=0++ durumlarının kütleleri ve ağır kuark spin simetriden alınan motivasyonla, onların kütle ilişkileri çalışılmıştır. Hesaplamalarda hadron fenomolojisinde başarılı sonuçlar elde edilmesine olanak sağlayan KRD toplam kuralları yöntemi kullanılmıştır. Analizler sonucunda KRD toplam kuralları için gerekli olan parametrelerin en uygun değerleri belirlenerek, Tcc+ tetrakuarkın kütlesi, deneylerle kıyaslanabilir bir şekilde elde edilmiş ve ağır kuark spin simetrisinin öngördüğü gibi, 1+- ve 0++ durumlarının kütle farkının yeterince küçük, sadece bir kaç MeV civarında olduğu görülmüştür.Ph.D. - Doctoral Progra
Energy and Reserve Scheduling of Distribution Network in Presence of Electric Vehicle Aggregators: A Decentralized Approach
Bilateral energy transactions between electric vehicles (EVs) and the power grid are managed by entities called aggregators (AGGs) who work as private or network operator’s agents. The remarkable effects of the AGG’s behavior on network parameters entail the provision of coordinated schedules and consideration of network conditions and constraints. In this paper, a novel approach is presented for independent coordinated scheduling of EV charge/discharge via private AGGs, distributed generators (DGs), and the distribution network operator (DSO). The goal is the maximization of AGG profit from energy transactions along with the least network operation costs and improvement of network indices. The objective function of the proposed approach also includes AGG capability to provide the network with spinning reserve which brings incentive payments. For realistic addressing of the problem, the uncertainties related to EV arrival/departure times and their initial State of Charge (SOC) are simulated via different scenarios. The problem is solved using the fast alternating direction method of multipliers (FADMMs) which is well suited for independent-objective optimizations with a fast convergence rate. The proposed distributed algorithm is tested and evaluated on a standard distribution network consisting of AGG and DGs. The results indicate that ignoring network conditions and constraints leads to impractical decisions whereas consideration of DSO requirements by the distributed algorithm will deliver a profitable schedule for AGGs while protecting their privacy and fulfilling DSO’s economical and technical objectives
ÜÇÜNCÜ SINIF DİSKALKULİK BİR ÖĞRENCİNİN SAYI DUYUSUNUN GELİŞİMİ
This study investigates the development of number sense of a 3rd-grade student with dyscalculia through a series of teaching experiment sessions incorporating subitizing, place value, and addition activities. A 3rd-grade student diagnosed with specific learning difficulties and attending a special education institution in Ankara was selected as the participant of the study. Data were collected from multiple sources, including pre-test and post-test interviews, video recordings of teaching experiment sessions, student worksheets, and field notes. The results of the qualitative analysis revealed that the progressively structured teaching experiment sessions guided by the zone of proximal development and Dienes' Mathematical Learning Theory contributed to the development of number sense of the third-grade student with dyscalculia. The findings revealed that the student developed conceptual subitizing skill as he progressed through the teaching experiment sessions. In addition, there was a significant improvement in his understanding of place value and addition with carry. The support provided during the teaching experiment sessions also enabled the student to use reasoning strategies. It was
observed that subitizing skill and place value understanding supported addition. Therefore, it was concluded that sequentially structured teaching experiment sessions in the order of subitizing, place value, and addition could be beneficial for students with dyscalculia. In that respect, the study has valuable implications for teachers and researchers who aim to develop the number sense of students with dyscalculia.Bu çalışmada, diskalkuli tanısı almış bir 3. sınıf öğrencisinin sayı duyusunun gelişimi şipşak sayılama, basamak değeri ve toplama işlemi etkinliklerini içeren bir dizi öğretim deneyi oturumu aracılığıyla incelenmiştir. Çalışmanın katılımcısı olarak Ankara'da bir özel eğitim kurumuna devam eden ve özgül öğrenme güçlüğü tanısı almış bir 3. sınıf öğrencisi seçilmiştir. Veriler, ön-test ve son-test görüşmeleri, öğretim deneyi oturumlarının video kayıtları, öğrenci çalışma kâğıtları ve saha notları gibi çoklu kaynaklardan toplanmıştır. Nitel analiz sonuçları, yakınsal gelişim alanı ve Dienes'in Matematiksel Öğrenme Kuramı rehberliğinde aşamalı olarak yapılandırılan öğretim deneyi oturumlarının diskalkulisi olan üçüncü sınıf öğrencisinin sayı duyusunun gelişimine katkıda bulunduğunu ortaya koymuştur. Bulgular, öğrencinin öğretim deneyi oturumları boyunca ilerledikçe kavramsal şipşak sayılama becerisini geliştirdiğini göstermiştir. Ayrıca, basamak değeri anlayışında ve eldeli toplama işleminde belirgin bir ilerleme kaydedilmiştir. Öğretim deneyi oturumlarında sağlanan destek, öğrencinin akıl yürütme stratejilerini kullanabilmesine de olanak tanımıştır. Şipşak sayılama becerisi ve basamak değeri anlayışının, toplama işlemini desteklediği gözlemlenmiştir. Bu nedenle, şipşak sayılama, basamak değeri ve toplama işlemi şeklinde sıralı olarak yapılandırılmış öğretim deneyi oturumlarının, diskalkuli tanılı öğrenciler için faydalı olabileceği sonucuna ulaşılmıştır. Bu çalışma, sayı duyusunu geliştirmeyi hedefleyen öğretmenler ve araştırmacılar için önemli doğurgular sunmaktadır.Ph.D. - Doctoral Progra
İzomalt bazlı sert şekerlemenin formülasyonu ve karakterizasyonu
In the confectionery industry, the demand for sugar-free products is increasing day by day. In hard candies, the quality parameters of sugar-free products are based on many physical and sensory properties. The preservation of these quality parameters throughout the shelf life of sugar-free hard candies is directly related to the selection of raw materials in the formulation along with the selection of an optimum formulation and process. This study covers the characterization and optimization studies of sugar-free hard candy formulations based on isomalt concentration, citric acid concentration and sugar alcohol differences. In the study, sugar-free hard candies were produced in 27 different formulations and the properties of these candies such as crystallinity, total soluble solids, color, water activity and glass transition temperature were examined with different methods. TD-NMR analyses, DSC analysis, XRD analysis and total soluble solids measurements were performed. There was no difference observed between the samples in terms of water activity and color. DSC analysis results showed that increase in Tg values was observed as increase in isomalt concentration and decrease in citric acid concentration (p<0.05). The crystal structure of the raw materials and sugar-free hard candy samples were investigated in XRD analysis, and it was observed that the presence of crystal structures in the amorphous structure negatively affected the product stability. Additionally, a strong correlation (r=0.825) was found between the measured Tg values and the prediction using the Couchman–Karasz equation, which is an empirical equation that is used to predict Tg of materials (p<0.05).Şekerleme sektöründe şekersiz ürünlere olan talep her geçen gün artmaktadır. Sert şekerlerde şekersiz ürünlerin kalite parametreleri birçok fiziksel ve duyusal özelliğe dayanmaktadır. Şekersiz sert şekerlerin raf ömrü boyunca bu kalite parametrelerinin korunması, formülasyonda kullanılan hammaddelerin seçimi ve optimum formülasyon ve proses seçimi ile doğrudan ilişkilidir. Bu çalışma, şekersiz sert şeker formülasyonlarının izomalt konsantrasyonu, sitrik asit konsantrasyonu ve şeker alkolü farklılıklarına dayalı karakterizasyon ve optimizasyon çalışmalarını kapsamaktadır. Çalışmada 27 farklı formülasyonda şekersiz sert şekerler üretilmiş ve bu şekerlerin kristallik, toplam çözünür katı madde, renk, su aktivitesi ve camsı geçiş sıcaklığı gibi özellikleri farklı yöntemlerle incelenmiştir. TD-NMR analizleri, DSC analizi, XRD analizi ve toplam çözünür katı madde ölçümleri yapılmıştır. Numuneler arasında su aktivitesi ve renk açısından bir fark gözlenmemiştir. DSC analiz sonuçları, Tg değerlerindeki artışın izomalt konsantrasyonundaki artış ve sitrik asit konsantrasyonundaki azalma olarak gözlemlendiğini göstermiştir (p<0.05). Hammaddelerin ve şekersiz sert şeker örneklerinin kristal yapıları XRD analizinde incelenmiş ve amorf yapıdaki kristal yapıların varlığının ürün stabilitesini olumsuz yönde etkilediği görülmüştür. Ayrıca ölçülen Tg değerleri ile malzemelerin Tg'sini tahmin etmek için kullanılan ampirik bir denklem olan Couchman-Karasz denklemi kullanılarak yapılan tahmin arasında güçlü bir korelasyon (r=0.825) bulunmuştur (p<0.05).M.S. - Master of Scienc
Antibiotics disrupt bacteria-phytoplankton symbioses: unveiling ecological risks in aquatic ecosystems
Antibiotic pollution in natural water bodies has reached alarming levels, posing a significant threat to the delicate balance of aquatic ecosystems. Bacteria and phytoplankton are foundational components of these ecosystems, playing crucial roles as decomposers and primary producers, respectively, and their symbiotic relationships are essential for maintaining ecological stability. Despite accumulating research focusing on the direct toxic effects of antibiotics, disruptions of complex bacteria–phytoplankton symbioses remain largely underexplored. In this review, we first introduce the symbiotic mechanisms between bacteria and phytoplankton, highlighting the processes underlying the formation of these relationships. We then examine the antibiotic sensitivity of bacteria and phytoplankton, highlighting the heightened vulnerability of bacteria. Finally, we explore the mechanism by which antibiotics disrupt bacteria, leading to altered interactions with phytoplankton. These disruptions cause shifts in phytoplankton population community structure and dynamics with implications for ecosystem functions, including higher risk of exacerbation of harmful algal blooms. Our study reveals that even if environmental concentrations of antibiotics do not directly impact phytoplankton populations, they can affect phytoplankton populations and communities by altering symbiotic bacteria. Understanding bacteria–phytoplankton symbioses is thus essential for unraveling the ecological impacts of antibiotics. This underexplored field demands greater attention from pollution ecology researchers, as it is key to defining environmental thresholds for pollutants