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Genomic analysis of the first isolate of KPC-2-producing Klebsiella pneumoniae from Uruguay
No full textSince KPC-2-producing Klebsiella pneumoniae are associated with successful dissemination of a major clone, defined as sequence type 258 (ST258), the aim of this study was to perform whole-genome sequencing (WGS) of the first colistin-resistant K. pneumoniae strain (Kpn666) carrying blaKPC-2 identified in Uruguay in 2011 in order to identify genomic and phylogenetic traits
Genotypic Features of Clinical and Bovine Escherichia coli O157 Strains Isolated in Countries with Different Associated-Disease Incidences
No full textFil: Pianciola, Luis. Subsecretaría de Salud de Neuquén. Laboratorio Central; Argentina.Fil: Rivas, Marta. ANLIS Dr.C.G.Malbrán. Instituto Nacional de Enfermedades Infecciosas. Servicio Fisiopatogenia; Argentina.There is great geographical variation in the frequency of Escherichia coli O157 infections that correlates with important differences in the bovine reservoir of each country. Our group carried out a broad molecular characterization of human and bovine E. coli O157 strains circulating in Argentina using different methodologies. Our data allows us to conclude that in Argentina, a high homogeneity is observed in both cattle and human strains, with almost exclusive circulation of strains belonging to the hypervirulent clade 8 described by Manning. The aim of this review was to compare the genetic background of E. coli O157 strains isolated in countries that have conducted similar studies, to try to correlate specific O157 genotypes with the incidence and severity of E. coli O157 associated diseases. The characteristics of the strains that cause disease in humans reflect the predominant genotypes in cattle in each of the countries analyzed. The main features clearly linked to high incidence or severity of E. coli O157 infections are lineage-specific polymorphism assay-6 lineage I/II, clade 8 strains and probably, clade 6 strains, the stx2a/stx2c genotype, the presence of q933 and q21 simultaneously, and putative virulence factor EC_3286. In countries with an absence of these features in O157 strains, the overall incidence of O157 disease is low. Argentina, where these characteristics are detected in most strains, shows the highest incidence of hemolytic uremic syndrome (HUS) worldwide
Cementoin-SLPI fusion protein binds to human monocytes and epithelial cells and shows higher biological activity than SLPI
No full textFil: Maffía, Paulo C. Universidad Nacional de Quilmes. Laboratorio de Microbiología Molecular; Argentina.Fil: Guerrieri, Diego. Universidad de Buenos Aires. Facultad de Medicina. Departamento de Microbiología, Parasitología e Inmunología; Argentina.Fil: Villalonga, Ximena. Universidad de Buenos Aires. Facultad de Medicina. Departamento de Microbiología, Parasitología e Inmunología; Argentina.Fil: Caro, Fiorella. Centro de Estudios Farmacológicos y Botánicos; Argentina.Fil: Gómez, Sonia. ANLIS Dr.C.G.Malbrán. Instituto Nacional de Enfermedades Infecciosas. Servicio Antimicrobianos. Departameno Bacteriología; Argentina.Fil: Tateosian, Nancy. Universidad de Buenos Aires. Facultad de Ciencias Exactas y Naturales. Departamento de Química Biológica; Argentina.Fil: Bogado, Betiana P. Universidad Nacional de Quilmes. Laboratorio de Microbiología Molecular; Argentina.Fil: Sánchez, Mercedes L. Centro de Estudios Farmacológicos y Botánicos; Argentina.Fil: Ambrosi, Nella. Centro de Estudios Farmacológicos y Botánicos; Argentina.Fil: Chuluyan, H. Eduardo. Universidad de Buenos Aires. Facultad de Medicina. Departamento de Microbiología, Parasitología e Inmunología; Argentina.Secretory Leukocyte Proteinase Inhibitor (SLPI) is an antiinflammatory peptide that blocks the activity of serine proteases, primarily the neutrophil elastase. In an attempt to direct the activity of SLPI on inflamed sites, a chimera consisting of the transglutaminase II substrate domain of trappin 2 (cementoin), and the mature SLPI protein was constructed. Cell attachment and biological activity were compared between SLPI and this chimera. By using whole cell ELISA, fluorescence microscopy and flow cytometry assays we observed that the cementoin-SLPI fusion protein (FP) but not SLPI attached to a human lung epithelial cell line and monocytes. A maximum attachment was achieved 15 min after FP was added to the cell cultures. In an elastase activity assay, we observed that FP retained its antiprotease activity and that at equimolar amount of proteins, FP was more efficient than SLPI in the inhibition. Both, FP and SLPI inhibits IL-2-induced lymphocyte proliferation, however, lower amounts of FP were required to achieve this inhibition. Furthermore, FP binds to mycobacteria and maintained the bactericidal activity observed for SLPI. Overall, these results show that this new chimera is able to attach to the cell surfaces retaining and improving some biological activities described for SLPI
Caracterización de cepas de Coccidioides spp. circulantes en la República Argentina
No full textFil: Motter, Andrea Nora. ANLIS Dr.C.G.Malbrán. Unidad Operativa Centro de Contención Biológica; Argentina.Fil: Suárez Álvarez, Roberto Osvaldo. ANLIS Dr.C.G.Malbrán. Instituto Nacional de Enfermedades Infecciosas. Departamento Micología; Argentina.Fil: Canteros, Cristina Elena. ANLIS Dr.C.G.Malbrán. Instituto Nacional de Enfermedades Infecciosas. Departamento Micología; Argentina.Coccidioides es un género de hongos dimorfos, agentes causales de la coccidioidomicosis (CDM). A pesar de su restricción a las regiones geográficas áridas y semiáridas del continente Americano, esta micosis desatendida tiene un impacto sustancial en la salud pública. En los últimos veinte años se ha observado un aumento en la incidencia de la enfermedad e inclusive se han descripto nuevas áreas endémicas.
El género Coccidioides está compuesto por dos especies solo identificables por métodos moleculares: C. immitis, restringido a California, EE.UU. y estados aledaños, y C. posadasii en todas las Américas.
En Argentina, las regiones precordilleranas norte y central poseen las características ecológicas compatibles con el hábitat de Coccidioides spp. y es de donde provienen la mayoría de los casos de CDM del país. Hasta el momento, los pocos estudios realizados en donde se identificaron los aislados sugieren que en Argentina la especie circulante es C. posadasii, sin embargo, en otras regiones de América alejadas de California se detectaron casos clínicos autóctonos de CDM donde se aisló C. immitis.
El objetivo de este trabajo fue reconocer las especies y feno-genotipos de Coccidioides spp. circulantes en la República Argentina.
Se analizaron 47 cepas pertenecientes a 43 pacientes provenientes de diferentes regiones geográficas de Argentina aisladas desde 1967 a 2017 y siete cepas de pacientes mexicanos caracterizadas en origen como C. immitis, todas ellas depositadas en la colección de cultivos del Departamento Micología (DMic) de la ANLIS. Se realizó la identificación microbiológica clásica (observación microscópica, producción de exoantígeno y conversión de micelio a esférulas) y molecular, utilizando la secuenciación parcial del gen Ag2/PRA y de las regiones ITS1 e ITS2. Las secuencias obtenidas de cada región se alinearon y analizaron utilizando el programa BioEdit y se compararon cada una de ellas con las depositadas en el GenBank utilizando la herramienta BLAST/n. Se construyeron los árboles para cada grupo de secuencias y también un árbol consenso con las tres regiones analizadas, utilizando el método de máxima verosimilitud y el modelo de sustitución nucleotídica más acorde para el análisis con el programa MEGA v6.0. Se incluyeron secuencias depositadas en GenBank para enriquecer el análisis
First assessment of all-cause acute diarrhoea and rotavirus-confirmed cases following massive vaccination in Argentina
No full textFil: Degiuseppe, J I. ANLIS Dr.C.G.Malbrán. Instituto Nacional de Enfermedades Infecciosas. Laboratorio de Gastroenteritis Virales; Argentina.Fil: Stupka, Juan A. ANLIS Dr.C.G.Malbrán. Instituto Nacional de Enfermedades Infecciosas. Laboratorio de Gastroenteritis Virales; Argentina.Argentina incorporated rotavirus massive vaccination in 2015. No specific strategy has been designed to accurately measure the impact of this recent introduction on the diarrhoeal disease burden in our country. We assessed post-vaccine introduction data (all-cause acute diarrhoea and rotavirus laboratory-confirmed cases, and genotype distribution), compared with pre-vaccination period in children under 5 years of age in Argentina. Cross-sectional ecologic analysis was conducted with data from the Argentine Surveillance Health System. Endemic channel and global and seasonal incidence rates of pre- and post-vaccination periods were calculated and further compared. Conventional binary genotypification on rotavirus-positive samples was also performed. In post-vaccination period, a global decrease of 20.8% in the rate of all-cause acute diarrhoea cases was found. The endemic channel showed that declination was more significant in the autumn/winter season. Rotavirus laboratory-confirmed cases showed 61.7% of reduction and the weekly distribution analyses indicated a significant flattening of the expected seasonal peak. G2P[4] was the most prevalent circulating genotype (57.2%). This study represents the first assessment of diarrhoeal disease burden since rotavirus massive vaccination strategy was implemented in Argentina. This introduction represented a successful intervention due to the significant decrease in all-cause acute diarrhoea cases and rotavirus laboratory-confirmed cases
Surveillance of microcephaly and selected brain anomalies in Argentina: Relationship with Zika virus and other congenital infections
No full textFil: Tellechea, Ana Laura. ANLIS Dr.C.G.Malbrán. Centro Nacional de Genética Médica. Registro Nacional de Anomalías Congénitas; Argentina.Fil: Luppo, Victoria. ANLIS Dr.C.G.Malbrán. Instituto Nacional de Enfermedades Virales Humanas; Argentina.Fil: Morales, María Alejandra. ANLIS Dr.C.G.Malbrán. Instituto Nacional de Enfermedades Virales Humanas; Argentina.Fil: Groisman, Boris. ANLIS Dr.C.G.Malbrán. Centro Nacional de Genética Médica. Registro Nacional de Anomalías Congénitas; Argentina.Fil: Baricalla, Agustin. ANLIS Dr.C.G.Malbrán. Instituto Nacional de Enfermedades Virales Humanas; Argentina.Fil: Fabbri, Cintia. ANLIS Dr.C.G.Malbrán. Instituto Nacional de Enfermedades Virales Humanas; Argentina.Fil: Sinchi, Anabel. ANLIS Dr.C.G.Malbrán. Instituto Nacional de Enfermedades Virales Humanas; Argentina.Fil: Alonso, Alicia. ANLIS Dr.C.G.Malbrán. Instituto Nacional de Enfermedades Infecciosas; Argentina.Fil: González, Cecilia A. ANLIS Dr.C.G.Malbrán. Instituto Nacional de Enfermedades Infecciosas; Argentina.Fil: Ledesma, Bibiana A. ANLIS Dr.C.G.Malbrán. Instituto Nacional de Enfermedades Infecciosas; Argentina.Fil: Masi, Patricia. Neonatology Service, Dalmacio Velez Sarsfield Hospital, Ciudad Autónoma de Buenos Aires; Argentina.Fil: Silva, María. Neonatology Service, Dalmacio Velez Sarsfield Hospital, Ciudad Autónoma de Buenos Aires; Argentina.Fil: Israilev, Adriana. Neonatology Service, Teodoro Alvarez Hospital, Ciudad Autónoma de Buenos Aires; Argentina.Fil: Rocha, Marcela. Department of Neonatology, Instituto de Maternidad y Ginecología Nuestra Señora de las Mercedes, San Miguel de Tucumán; Argentina.Fil: Quaglia, Marcela. Neonatology Service, Materno Neonatal Hospital, Córdoba Capital; Argentina.Fil: Bidondo, María Paz. ANLIS Dr.C.G.Malbrán. Centro Nacional de Genética Médica. Registro Nacional de Anomalías Congénitas; Argentina.Fil: Liascovich, Rosa. ANLIS Dr.C.G.Malbrán. Centro Nacional de Genética Médica. Registro Nacional de Anomalías Congénitas; Argentina.Fil: Barbero, Pablo. ANLIS Dr.C.G.Malbrán. Centro Nacional de Genética Médica. Registro Nacional de Anomalías Congénitas; Argentina.Zika virus (ZIKV) vertical transmission may lead to microcephaly and other congenital anomalies. In March and April 2016, the first outbreak of ZIKV occurred in Argentina. The objective was to describe the surveillance of newborns with microcephaly and other selected brain anomalies in Argentina, and evaluation different etiologies
Toxocariasis in Carnivora from Argentinean Patagonia: Species molecular identification, hosts, and geographical distribution
No full textFil: Vega, R M. Laboratorio de Parasitología, INIBIOMA (CONICET-UNCo), Quintral 1250, 8400, Bariloche, Río Negro; Argentina.Fil: Gonzalez Prous, C L. ANLIS Dr.C.G.Malbrán. Instituto Nacional de Enfermedades Infecciosas. Departamento de Parasitología; Argentina.Fil: Krivokapich, Silvio. ANLIS Dr.C.G.Malbrán. Instituto Nacional de Enfermedades Infecciosas. Departamento de Parasitología; Argentina.Fil: Gatti, Graciana Mabel. ANLIS Dr.C.G.Malbrán. Instituto Nacional de Enfermedades Infecciosas. Departamento de Parasitología; Argentina.Fil: Brugni, N L. Laboratorio de Parasitología, INIBIOMA (CONICET-UNCo), Quintral 1250, 8400, Bariloche, Río Negro; Argentina.Fil: Semenas, L. Laboratorio de Parasitología, INIBIOMA (CONICET-UNCo), Quintral 1250, 8400, Bariloche, Río Negro; Argentina.Twenty four specimens of seven species belonging to the families Felidae, Mustelidae, and Canidae were obtained in Lanín and Nahuel Huapi National Parks from March 1996 to April 2016. Specimens were processed by necropsy in order to contribute to the knowledge of toxocariasis in wild carnivores of Argentinean Patagonia. The only Puma concolor and the seven Leopardus geoffroyi were positive for Toxocara cati. Polymerase chain reaction-restriction fragment length polymorphism (PCR-RFLP) of the ITS-1 region from larval and adult DNA was carried out to confirm parasite species identification. This is the first molecular determination of T. cati from wild felids in Argentina and the study also fill gaps about the spatial distribution and hosts for Toxocara cati
Bacteriemia por Mycoplasma hominis: un agente etiológico subestimado
No full textFil: Posse, Tamara. ANLIS Dr.C.G.Malbrán. Instituto Nacional de Enfermedades Infecciosas. Departamento de Bacteriología. Servicio de Bacteriología Clínica; Argentina.Fil: Prieto, Monica. ANLIS Dr.C.G.Malbrán. Instituto Nacional de Enfermedades Infecciosas. Departamento de Bacteriología. Servicio de Bacteriología Especial; Argentina.Fil: Cipolla, Lucia. ANLIS Dr.C.G.Malbrán. Instituto Nacional de Enfermedades Infecciosas. Departamento de Bacteriología. Servicio de Bacteriología Especial; Argentina.Fil: Kaufman, Sara. ANLIS Dr.C.G.Malbrán. Instituto Nacional de Enfermedades Infecciosas. Departamento de Bacteriología. Servicio de Bacteriología Clínica; Argentina.Resumen
Mycoplasma hominis es una bacteria de cultivo exigente y forma parte de la microbiota comensal de la zona urogenital en adultos. Puede ocasionar infecciones del tracto genitourinario, en particular en mujeres, e infecciones sistémicas en neonatos. Además, puede causar infecciones extragenitales graves, en especial en pacientes inmunocomprometidos. Describimos un caso de bacteriemia por M. hominis en una paciente inmunocompetente, luego de un legrado uterino por aborto incompleto. M. hominis está subestimado como agente etiológico de infecciones extragenitales debido a su difícil diagnóstico, ya que al carecer de pared celular no se visualiza por la coloración de Gram, requiere una incubación prolongada en atmósfera de anaerobiosis para su desarrollo y los métodos convencionales de detección pueden fallar. Este es el primer reporte de señal positiva en hemocultivo automatizado (BD BACTEC) con aislamiento de M. hominis.
Abstract
Mycoplasma hominis is a fastidious bacterium, which usually colonizes the lower urogenital tract and may cause systemic infections in neonates and genital infections in adults. It can also be the cause of serious extra-genital infections, mainly in immunosuppressed or predisposed subjects. Case Presentation: We describe a case of bacteremia caused by M. hominis in a previously healthy woman after uterine curettage due to incomplete abortion. M. hominis could be an underestimated cause of bacteremia in immunocompetent patients. Mycoplasma organisms have fastidious growth requirements, are often difficult to culture on a cell-free medium and have no cell wall. The conventional method for detection may fail. This is the first report of M. hominis isolation from a positive automated blood culture (BD BACTEC, USA)
One hundred years after the "Spanish" flu
No full textFil: Lüthy, Isabel Alicia. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Instituto de Biología y Medicina Experimental; Argentina.Fil: Ritacco, Viviana. ANLIS Dr.C.G.Malbrán. Instituto Nacional de Enfermedades Infecciosas; Argentina.Fil: Kantor, Isabel N. Medicina (Buenos Aires). Comité de Redacción; Argentina.La pandemia de gripe “española”, de la que se cumplen 100 años, es considerada la más devastadora de la historia. Se estima que afectó a un tercio de la población mundial, y más del 2.5% de los enfermos murieron. Esta pandemia se presentó en dos oleadas principales, en 1918 y 1919, y la morbimortalidad por edades tuvo una curva en W. En general, la muerte no ocurría como consecuencia directa de la gripe, sino por bronconeumonías bacterianas, para las que se carecía de tratamiento. Hubo, además, una mayor mortalidad en enfermos con tuberculosis preexistente con respecto al resto de los afectados de influenza. En Argentina la epidemia también se presentó en dos oleadas principales, con amplias variaciones en la mortalidad por regiones. El tratamiento disponible incluía dieta, antisepsia de garganta, valerianato de quinina, salicilato, codeína para la tos y aceite alcanforado. También se aplicaban primitivas vacunas y sueros anti-neumococos. Con la disponibilidad de la secuencia de ARN completa del genoma del virus de la influenza 1918 ha sido posible ensamblar, mediante genética inversa, partículas virales semejantes a las de la pandemia mortal. El virus reconstituido demostró ser extraordinariamente virulento para ratones. En la actualidad, la vacunación contra la gripe estacional reduce el riesgo de otra pandemia, pero por el momento no puede eliminarlo. El desarrollo de vacunas “universales” contra la gripe, que confieran inmunidad confiable y duradera, podrá evitar en el futuro su propagación mundial.
(EN) The "Spanish" flu pandemic, which occurred a century ago, is considered the most devastating in human history. An estimated one third of world population fell ill with flu and more than 2.5% of them died. The course of the epidemic had two main waves (1918 and 1919) and showed an unusual W-shaped morbidity/mortality distribution. Death was not a direct outcome of flu itself but rather a consequence of secondary bacterial bronchopneumonia, for which antibiotics had not yet been discovered. Pre-existing pulmonary tuberculosis was also accountable for increased flu death rates during the pandemic. As it happened in Europe, in Argentina the epidemic had two main waves, with ample variation in mortality by region. Available treatment at the time included diet, throat antiseptic rinses, low doses of quinine valerianate, salicylates, codeine as a cough suppressant, and camphor oil. Primitive anti-pneumococcal vaccines and immune sera were also applied. Upon the disclosure of the whole RNA sequence of the 1918 influenza virus genome, by means of reverse genetics it was possible to assemble viral particles resembling those of the deadly pandemic. The reconstituted virus proved to be extraordinarily virulent for mice. Current seasonal flu vaccines help to reduce, but not to abolish, the risk of another pandemic. The ongoing development of "universal" vaccines against influenza conferring reliable and long-lasting immunity may prevent its global spread in the future
National Health Care Network for children with oral clefts: organization, functioning, and preliminary outcomes
No full textFil: Cassinelli, Agustina. ANLIS Dr.C.G.Malbrán. Centro Nacional de Genética Médica. Registro Nacional de Anomalías Congénitas; Argentina.Fil: Pauselli, Nadia. ANLIS Dr.C.G.Malbrán. Centro Nacional de Genética Médica. Registro Nacional de Anomalías Congénitas; Argentina.Fil: Piola, Agustina. ANLIS Dr.C.G.Malbrán. Centro Nacional de Genética Médica. Registro Nacional de Anomalías Congénitas; Argentina.Fil: Martinelli, Claudia. Ministerio de Salud de Argentina. Programa Sumar; Argentina.Fil: Alves de Azeved, José L. Ministerio de Salud de Argentina. Programa Sumar; Argentina.Fil: Bidondo, María P. ANLIS Dr.C.G.Malbrán. Centro Nacional de Genética Médica. Registro Nacional de Anomalías Congénitas; Argentina.Fil: Groisman, Boris. ANLIS Dr.C.G.Malbrán. Centro Nacional de Genética Médica. Registro Nacional de Anomalías Congénitas; Argentina.Fil: Barbero, Pablo. ANLIS Dr.C.G.Malbrán. Centro Nacional de Genética Médica. Registro Nacional de Anomalías Congénitas; Argentina.Fil: Liascovich, Rosa. ANLIS Dr.C.G.Malbrán. Centro Nacional de Genética Médica. Registro Nacional de Anomalías Congénitas; Argentina.Fil: Sala, Ana. Ministerio de Salud de Argentina. Programa Sumar; Argentina.Introduction: Oral clefts are major congenital anomalies that may affect the lip and/or palate, and that may also involve the nose and nostrils. In Argentina, their prevalence is approximately 15 per 10 000 births. In 2015, the Ministry of Health of Argentina created a national health care network for children with oral clefts in Argentina through the joint work with the National Registry of Congenital Anomalies (Red Nacional de Anomalías Congénitas, RENAC) (coordinating center for the national network) and the SUMAR Program. The objective of this study was to describe the health care network and its preliminary outcomes.
Population and methods: A total of 61 centers that provided a comprehensive treatment for oral clefts or in collaboration with other centers were identified and accredited. Maternity centers were connected with treating centers grouped in health care network nodes.
Results: In the period between March 2015 and February 2016, 550 newborn infants who were exclusively covered by the public health care system were identified. Among these, 18% had a cleft lip; 62%, cleft lip and palate; and 20%, cleft palate only; 75% were isolated cases and 25%, in association with other congenital anomalies.
Conclusion: Approximately 70% of children were assessed by a certified treating institution and are receiving treatment. The network seeks to improve data systematization, include the largest number of centers possible, strengthen interdisciplinary team work, and promote high-quality standards for treatments.
(ES) Introducción: Las fisuras orales son anomalías congénitas mayores que comprometen la integridad del labio y/o paladar, y pueden también afectar la nariz y las fosas nasales. La prevalencia enArgentina esde, aproximadamente, 15 afectados cada 10 000 nacimientos. El Ministerio de Salud de la Nación implemento, a partir del año 2015, una red nacional para la atención de niños/as con fisuras orales en Argentina a través de un trabajo conjunto entre la Red Nacional de Anomalías Congénitas (RENAC) (centro coordinador de la red nacional) y el Programa SUMAR. El objetivo de este trabajo es describir la red de atención y sus primeros resultados.
Población y métodos: Se identificaron y acreditaron 61 instituciones que realizaban el tratamiento de fisuras orales de manera integral o articuladamente con otras instituciones. Se conectaron las maternidades con las instituciones tratantes, que se agruparon en nodos de la red de atención.
Resultados: En el período entre marzo de 2015 y febrero de 2016, se identificaron 550 recién nacidos con cobertura exclusiva del sector público de salud. De ellos, un 18% presentó fisura de labio; 62%, fisura de labio y paladar; y 20%, fisura de paladar únicamente; en un 75% se presentaron de forma aislada y, en un 25%, asociadas a otras anomalías congénitas.
Conclusión: Un 70% de los niños fue evaluado por una institución tratante acreditada y se encuentran en tratamiento. Se busca mejorar la sistematización de los datos, incorporar mayor cantidad de instituciones, fortalecer el trabajo interdisciplinario de los equipos y promover estándares de calidad para los tratamientos