REDI - Digital Repository of the National Agency of Research and Innovation
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First report of root and crown rot caused by Dactylonectria novozelandica on strawberry in Uruguay. [Primer reporte de Dactylonectria novozelandica causando necrosis de raíz y corona en frutilla en Uruguay]. [Primeiro relato de Dactylonectria novozelandica causando necrose de raiz e coroa em morangos no Uruguay].
No full textABSTRACT.- Since 2015, a high mortality rate of strawberry plants has been observed in the north of Uruguay related to crown and root diseases caused by a pathogens complex. In 2016, associated with the death of plants, Cylindrocarpon spp. was isolated with a frequency of 42.4 %, ranking third, preceded by Neopestalotiopsis sp. and Fusarium spp. Aiming to increase the knowledge of the pathogens that integrate the complex, three isolates of Cylindrocarpon spp. were characterized by molecular, morphological and pathogenicity analyses in strawberry plants. Dactylonectria novozelandica was identified as causal agent of crown and root necrosis of strawberry in Salto, Uruguay. .-.-.-.-.-.-.-.-.-.-..-RESUMEN.- Desde 2015, se observó una alta mortandad de plantas de frutilla en el norte de Uruguay relacionada con enfermedades de corona y raíz causadas por un complejo de patógenos. En 2016, asociado con la muerte de plantas, Cylindrocarpon spp. se aisló con una frecuencia de 42,4 %, ocupando el tercer lugar, precedido por Neopestalotiopsis sp. y Fusarium spp. Con el objetivo de incrementar el conocimiento de los patógenos que integran el complejo, se caracterizaron tres aislados de Cylindrocarpon spp. mediante análisis moleculares, morfológicos y de patogenicidad en plantas de frutilla. Se identificó Dactylonectria novozelandica como agente causal de necrosis de corona y raíz de frutilla en Salto, Uruguay. .-.-.-.-.-.-.-.-.-.-.-.-.-.-.-.RESUMO.- A partir do ano 2015 um número significativo de mortes se observou em plantas de morango no norte do Uruguai devido a doenças da coroa e raiz causadas por um complexo de patógenos. Associado à morte, Cylindrocarpon spp foi isolado com uma frequência de 42,4% no 2016, ocupando o terceiro lugar de incidência depois de Neopestalotiopsis sp. e Fusarium spp. O objetivo do trabalho foi caracterizar três isolados de Cylindrocarpon spp por meio de análises moleculares, morfológicas e patogênicas em morangueiro. Dactylonectria novozelandica causou necorsis de cora e raiz em uma plantas de morango em Salto, Uruguai. Copyright (c) 2022 Agrociencia Urugua
Avances técnicos en el crecimiento de bovinos para carne.
No full textEl crecimiento es definido como un aumento del tamaño, del número de células o de la masa corporal a lo largo del tiempo (Arango y Van Vleck, 2002; Murdoch et al., 2005). En los animales consiste en la acumulación de proteínas, grasas y huesos que, normalmente, se mide como la variación en el peso o en la masa corporal y, por otro lado, la retención de nutrientes se estima a través del peso corporal vacío y su composición (Owens et al., 1995). El crecimiento implica aumentos tanto en el número de células (hiperplasia) como en el tamaño de las células (hipertrofia; Owens et al., 1993; Murdoch et al., 2005)
URUTRIGO: estrategias para viabilizar el trigo uruguayo mediante la mejora de su calidad.
No full textMediante una amplia colaboración entre instituciones d de nuestro país, el proyecto URUTRIGO realizó una fuerte apuesta a la mejora de la calidad e inocuidad en la producción de trigo. El presente artículo describe los principales rasgos de laestrategia implementada y los resultados alcanzados
Phenotypic and genotypic survey of antibiotic resistance in Salmonella enterica isolates from dairy farms in Uruguay.
No full textSalmonella enterica is an important zoonotic pathogen that is frequently identified in dairy farming systems. An increase in antibiotic resistance has led to inadequate results of treatments, with impacts on animal and human health. Here, the phenotypic and genotypic susceptibility patterns of Salmonella isolates from dairy cattle and dairy farm environments were evaluated and compared. A collection of 75 S. enterica isolates were evaluated, and their phenotypic susceptibility was determined. For genotypic characterization, the whole genomes of the isolates were sequenced, and geno-serotypes, sequence types (STs) and core-genome-sequence types were determined using the EnteroBase pipeline. Copyright © 2023 Casaux, D'Alessandro, Vignoli and Fraga
Exploring alternatives for sustainable development of mixed vegetable beef-cattle family farm systems in southern Uruguay. [Exploración de alternativas para el desarrollo sostenible de sistemas de producción hortícola-ganaderos familiares en el sur de Uruguay]. [Special Issue 25 Years Agrociencia].
No full textABSTRACT.- Sustainability of most vegetable family farms in Southern Uruguay is threatened by low income and the deterioration of natural resources. This study quantified the effect of the inclusion of different alternatives of livestock production in the structure, and economic and environmental performance of different types of vegetable farms. Based on two farms as case studies, we conducted a model based exploratory study at farm scale. The results suggested that the inclusion of livestock production in vegetable family farms is a key factor in reducing erosion of the cultivated area. To reduce erosion, the model reduced the area of vegetables per farm, while expanding the area of forage production. As a consequence, family farm income (IF) was reduced between 12 % and 31 % depending on the case studied. However, we could design production systems with erosion lower than the tolerance limit for the soil type and higher IF, relative to the target, in both farms. From the livestock production alternatives evaluated, the most appropriate ones to include in vegetable production systems are fattening steers or heifers in cycles of 14 to 18 months, due to lower cost for restocking and less use of concentrates, reducing capital requirements and dependence on external inputs. .-.-.-.-.-.-.-.-.-.-.-.-.-.-.-.-.-.-. RESUMEN.- La sostenibilidad de la mayoría de los predios hortícolas familiares en el sur de Uruguay está amenazada por ingresosin-suficientes y por el deterioro de los recursos naturales. En este estudio se cuantificó el efecto de la inclusión de diferentesactividades de producción ganadera en la estructura y en los resultados económico-productivos y ambientales de diferentestipos de sistemas de producción (predios) hortícolas. Se realizó un estudio exploratorio a escala predial con modelos desimulación utilizando dos predios como estudio de caso. Los resultados sugieren que la inclusión de actividades de producciónganadera en los sistemas de producción hortícolas es un factor determinante para reducir la erosión promedio del áreacultivada. Para reducir la erosión el modelo diseñó predios que reducen el área de hortalizas al tiempo que expanden larotación forrajera. Como consecuencia de esto, también se redujo el ingreso familiar (IF) entre 12 % y 31 % según el casoestudiado. Sin embargo, pudimos diseñar sistemas de producción con erosión menor a la tolerable para el tipo de suelo e IFmayor al objetivo, en los dos predios. De las actividades ganaderas evaluadas las más apropiadas para incluir en predios hortícolasson el engorde de novillos o vaquillonas en ciclos de 14 a 18 meses, debido al menor costo para reposición de animales y al menoruso de concentrados, lo que disminuye las necesidades de capital y la dependencia de insumos externos. Copyright (c) 2022 Agrociencia Urugua
Informe final del proyecto: Identificación de TMEM176B como nuevo punto de control intrínseco de las células Th17
No full textLas células T helper 17 (Th17) son células T CD4 con funciones importantes en respuestas contra bacterias y hongos extracelulares en barreras mucosas. Las células Th17 juegan un rol clave en diferentes patologías, siendo ampliamente estudiadas en enfermedades autoinmunes. Sin embargo, el rol de estas células en el cáncer aún es controvertido, reportándose tanto efectos anti-tumorales como pro-tumorales. Esta controversia puede explicarse por una característica remarcable de las células Th17, su gran plasticidad. Las células Th17 pueden tener propiedades reguladoras o inflamatorias dependiendo del ambiente de citoquinas en el que se diferenciaron. Las bases moleculares que determinan la función reguladora o efectora de las Th17 son aún muy mal comprendidas. En el presente proyecto estudiamos un nuevo regulador intrínseco de las células Th17. Este nuevo regulador es TMEM176B, un canal iónico con capacidades inmunorreguladoras. Nuestro grupo tiene amplia experiencia en el estudio de TMEM176B a nivel de las células dendríticas. Sin embargo, el rol que cumple en las células Th17 no había sido abordado hasta el momento. Resultados preliminares mostraban que TMEM176B determina la diferenciación hacia el fenotipo regulador. Por lo tanto, nos propusimos caracterizar a TMEM176B como conductor de dicho fenotipo. Estudiamos los mecanismos por los cuales TMEM176B determina el fenotipo regulador, así como su relevancia en células humanas in vitro y en modelos murinos de cáncer in vivo. La inhibición de Tmem176b resultó en células Th17 con un fenotipo más efector, con aumento en producción de IFNg, aumento en la fosforilación de AKT y de la glicólisis, y disminución de las capacidades regulatorias. En humanos, encontramos que la expresión de Tmem176b en células Th17 en tumores de pacientes con cáncer colorrectal se asociaba a un peor pronóstico. Por lo tanto, aportamos un nuevo blanco para la modulación farmacológica de las células Th17, pudiendo tener aplicabilidad en cáncer.Agencia Nacional de Investigación e Innovació
Suplementación infrecuente: ¿es posible reducir la frecuencia de suplementación sin afectar el desempeño productivo de los animales?.
No full textDesde el año 1999 INIA comenzó la búsqueda de estrategias de manejo que faciliten el uso eficiente de la mano de obra asignada a la tarea de entrega del suplemento a los animales. En un escenario con recursos humanos y disponibilidad de tiempo cada vez más limitantes, mejorar la eficiencia en el uso de los recursos facilita la adopción de la tecnología de suplementación en sistemas pastoriles (La Manna et al., 2007). En ese escenario surge la alternativa de suplementación infrecuente, distribuyendo el equivalente semanal de suplemento en menos días efectivos de suministro
Detection and genetic characterization of bovine Torovirus in Uruguay.
No full textABSTRACT.- Bovine torovirus (BToV) is an enteric pathogen that may cause diarrhea in calves and adult cattle, which could result in economic losses due to weight loss and decreased milk production. This study aimed to report the presence, the genetic characterization and the evolution of BToV in calves in Uruguay. BToV was detected in 7.9% (22/278) of fecal samples, being identified in dairy (9.2%, 22/239) but not beef (0.0%, 0/39) calves. BToV was detected in both diarrheic (14%, 6/43) and non-diarrheic (13.2%, 5/38) dairy calves. In addition, BToV was detected in the intestinal contents of 14.9% (7/47) of naturally deceased dairy calves. A complete genome (28,446 nucleotides) was obtained, which was the second outside Asia and the first in Latin America. In addition, partial S gene sequences were obtained to perform evolutionary analyses. Nucleotide and amino acid substitutions within and between outbreaks/farms were observed, alerting the continuous evolution of the virus. Through Bayesian analysis using BEAST, a recent origin (mid-60s) of BToV, possibly in Asia, was estimated, with two introductions into Uruguay from Asia and Europe in 2004 and 2013, respectively. The estimated evolutionary rate was 1.80 × 10-3 substitutions/site/year. Our findings emphasize the importance of continued surveillance and genetic characterization for the effective management and understanding of BToV's global epidemiology and evolution.Copyright: © 2024 by the authors. Licensee MDPI, Basel, Switzerland
Site index estimation using airborne laser scanner data in Eucalyptus dunnii Maide stands in Uruguay.
No full textIntensive silviculture demands new inventory tools for better forest management and planning. Airborne laser scanning (ALS) was shown to be one of the best alternatives for high-precision inventories applied to productive plantations. The aim of this study was to generate multiple stand-scale maps of the site index (SI) using ALS data in the intensive silviculture of Eucalyptus dunnii Maide plantations in Uruguay. Forty-three plots (314.16 m3) were established in intensive E. dunnii plantations in the departments of Río Negro and Paysandú (Uruguay). ALS data were obtained for an area of 1995 ha. Linear and Random Forest models were fitted to estimate the height and site index, and OrpheoToolBox (OTB) software was used for stand segmentation. Linear models for dominant height (DH) estimation had a better fit (R2 = 0.84, RMSE = 0.94 m, MAPE = 0.04, Bias = 0.002) than the Random Forest (R2 = 0.85, RMSE = 1.27 m, MAPE = 7.20, Bias=-0.173) model when including only the 99th percentile metric. The coefficient between RMSE values of the cross-validation and RMSE of the model had a higher value for the linear model (0.93) than the Random Forest (0.75). The SI was estimated by applying the RF model, which included the ALS metrics corresponding to the 99th height percentile and the 80th height bicentile (R2 = 0.65; RMSE = 1.62 m). OTB segmentation made it possible to define a minimum segment size of 2.03 ha (spatial radius = 30, range radius = 1 and minimum region size = 64). This study provides a new tool for better forest management and promotes the need for further progress in the application of ALS data in the intensive silviculture of Eucalyptus spp. plantations in Uruguay. © 2023 by the authors. Licensee MDPI, Basel, Switzerland
Assessing dependence between land use/land cover and water quality: A comparison at a small and a large watershed in Uruguay. [Evaluación de la dependencia entre el uso/cobertura del suelo y la calidad del agua: comparación entre una cuenca pequeña y una grande en Uruguay.]. [Avaliação da dependência entre uso/cobertura do solo equalidade da água: comparação entre uma pequena e um agrande bacia no Uruguai.]
No full textABSTRACT.- Changes in land use/land cover (LULC) directly or indirectly affect water quality in watercourses and impoundments. Sustainable management strategies aimed to enhance ecosystem health and community well-being require an accurate water-quality evaluation. This study looks into the correlation between temporal changes in LULC, represented by selected landscape variables (land cover area and proportion, patch density, Euclidean nearest-neighbor distance, mean shape index, and Shannon index), and water quality variables (nitrate, total phosphorus, and total suspended solids) at catchment scale. To compare the watershed-size influence, this analysis was performed at two different spatial scales represented by two Uruguayan basins of different sizes, San Salvador (3,118 km2) and Del Tala (160 km2). Partial Least Squares and Random Forest unsupervised machine-learning models were employed for this analysis. By exploiting a non-model-biased method based on game theory (SHAP), the LULC characteristics were quantified and ranked based on their level of importance in the water-quality evaluation. The main outcomes of this study proved that patch density is one of the most influencing metrics in both watersheds and for both models. Agricultural land use is the most critical one at both catchments and agricultural with a forage crop land uses are the most important ones for both algorithms. Furthermore, it is possible to state that the adopted techniques are valuable tools that can provide an adequate overview of the water‐quality behavior in space and time and the correlations between water-quality variables and LULC. .-.-.-.-.-.-.-.-.-.-.-. RESUMEN.- Los cambios en el uso del suelo y la cobertura del suelo (LULC) afectan directa o indirectamente la calidad del agua en cursos de agua y embalses. Las estrategias de gestión sostenible destinadas a mejorar la salud del ecosistema y el bienestar de la comunidad requieren una evaluación precisa de la calidad del agua. Este estudio analiza la correlación entre los cambios temporales en LULC, representados por variables de paisaje seleccionadas (área y proporción de cobertura del suelo, densidad de parches, distancia euclidiana al vecino más cercano, índice de forma promedio e índice de Shannon), y las variables de calidad del agua (nitrato, fósforo total y sólidos suspendidos totales) a nivel de cuenca. Para comparar la influencia del tamaño de la cuenca, este análisis se realizó a dos escalas espaciales diferentes representadas por dos cuencas uruguayas de diferentes tamaños, San Salvador (3118 km2) y Del Tala (160 km2). Se emplearon modelos de aprendizaje automático no supervisados de Mínimos Cuadrados Parciales y Bosque Aleatorio para este análisis. Al aprovechar un método no sesgado basado en teoría de juegos (SHAP), las características de LULC se cuantificaron y clasificaron según su nivel de importancia en la evaluación de la calidad del agua. Los principales resultados de este estudio demostraron que la densidad de parches es una de las métricas más influyentes en ambas cuencas y para ambos modelos. El uso agrícola del suelo es crítico en ambas cuencas, y los usos agrícolas con cultivos forrajeros son los más importantes para ambos algoritmos. Además, es posible afirmar que las técnicas adoptadas son herramientas valiosas que pueden proporcionar una visión adecuada del comportamiento de la calidad del agua en el espacio y el tiempo, así como las correlaciones entre las variables de calidad del agua y LULC. .-.-.-.-.-.-.-.-.-.-.-. RESUMO.- Alterações no uso do solo/cobertura do solo (LULC) afetam diretamente ou indiretamente a qualidade da água em cursos d'água e reservatórios. Estratégias de gestão sustentável voltadas para melhorar a saúde do ecossistema e o bem-estar da comunidade requerem uma avaliação precisa da qualidade da água. Este estudo examina a correlação entre mudanças temporais no LULC, representadas por variáveis de paisagem selecionadas (área e proporção de cobertura do solo, densidade de manchas, distância euclidiana até o vizinho mais próximo, índice de forma média e índice de Shannon), e variáveis de qualidade da água (nitrato, fósforo total e sólidos suspensos totais) em escala de bacia hidrográfica. Para comparar a influência do tamanho da bacia hidrográfica, essa análise foi realizada em duas escalas espaciais diferentes, representadas por duas bacias uruguaias de tamanhos diferentes, San Salvador (3118 km2) e Del Tala (160 km2). Modelos de aprendizado de máquina não supervisionados de Mínimos Quadrados Parciais e Floresta Alea-tória foram empregados para essa análise. Ao explorar um método não enviesado pelo modelo baseado na teoria dos jogos (SHAP), as características de LULC foram quantificadas e classificadas com base em seu nível de importância na avaliação da qualidade da água. Os principais resultados deste estudo mostraram que a densidade de manchas é uma das métricas mais influentes em ambas as bacias hidrográficas e para ambos os modelos. O uso agrícola da terra é crítico em ambas as bacias hidrográficas, e o uso agrícola com cultivo forrageiro é o mais importante para ambos os algoritmos. Além disso, é possível afirmar que as técnicas adotadas são ferramentas valiosas que podem fornecer uma visão adequada do comportamento da qualidade da água no espaço e no tempo e das correlações entre as variáveis de qualidade da água e LULC. @2023 Agrociencia Urugua