REDI - Digital Repository of the National Agency of Research and Innovation
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Sustainable food production: The contribution of genome editing in livestock.
No full textABSTRACT - The growing demand for animal source foods to feed people has been pushing the livestock industry to increase productivity, a tendency that will continue throughout this century. The challenge for the coming years is to increase the food supply to ensure equity in access to high quality food, while maintaining global sustainability including combating climate change, avoiding deforestation, and conserving biodiversity, as well as ensuring animal health and welfare. The question is, how do we produce more with less? Classical methods to enhance livestock productivity based on the improvement of animal health, nutrition, genetics, reproductive technologies and management have made important contributions; however, this is not going to be enough and thus disruptive approaches are required. Genome editing with CRISPR may be a powerful contributor to global livestock transformation. This article is focused on the scope and perspectives for the application of this technology, which includes improving production traits, enhancing animal welfare through adaptation and resilience, conferring resistance to infectious diseases, and suppressing pests and invasive species that threaten livestock. The main advantages and concerns that should be overcome by science, policy and people are discussed with the aim that this technology can make a real contribution to our collective future. This review is part of the special issue "Genome Editing in Animal Systems to Support Sustainable Farming and Pest Control". © 2021 by the author. Licensee MDPI, Basel, Switzerland
Banco de ADN genómico animal - plataforma de evaluación genómica.
No full textA nueve años de su inauguración oficial, el B Banco de ADN Genómico Animal se ha expandido como plataforma de investigación, desarrollo e innovación en genómica animal y se proyecta hacia la inclusión de nuevas ?ómicas? para dar respuesta a futuros desafíos
Oportunidades para la transición agroecológica en tomate bajo invernáculo en el sur de Uruguay: una metodología para evaluar el avance hacia sistemas más sostenibles. (Capítulo 16).
No full textA partir de la Revolución Verde, una parte importante de la agricultura a nivel mundial adoptó un modelo de producción altamente dependiente del combustible fósil y de insumos de origen químico industrial. Desde finales del siglo pasado, la sostenibilidad y la búsqueda de una producción más sostenible se han convertido en temas clave. ---- 1. Introducción. -- 2. Línea de base de la producción de tomate bajo cubierta en Uruguay. -- 3. Detalle de la tecnología propuesta y metodología para suevaluación. -- 3.1. Resultados de la implementación de la metodología propuesta. -- 3.1.1 Uso de pesticidas para el manejo sanitario. -- 3.1.2 Manejo y estado del suelo. -- Prácticas de manejo. -- Balance de nutrientes. -- Estado del suelo. -- 3.1.3 Índice integrador. -- 4. Mejoras a partir del uso o de la implementación de las tecnologías. -
Daños por frío en la producción de cítricos de Uruguay.
No full text1. Aspectos generales del cultivo. -- 2. Daños por frío. -- 3. Variables que explican la intensidad de los daños. -- 4. Efecto de las heladas en la sanidad de los árboles. -- 5. Efecto de las heladas sobre las principales plagas. -- 6. Condiciones de calidad, cosecha y poscosecha. -- 7. Posibles consecuencias de los daños. -- 8. Manejo pasivo y activo. -- 9. Recomendaciones para el manejo de los montes. -- 10. Comentarios finales. -- 11. Fuentes de información. -- 12. Referencias bibliográficas
Canonical correlations among morphological and yield traits in primocane-fruiting raspberries.
No full textABSTRACT.Raspberry (Rubus idaeus) is an economically important crop, and its cultivation has expanded recently across temperate and subtropical regions of Brazil. There is no brazilian raspberry cultivar so far. Therefore, the indirect selection can be an useful tool to help during the breeding process. We evaluated linear and canonical correlations in primocane-fruiting raspberry cultivars in 2013 and 2014, in a completely randomized experimental design, with eight replications. The genotypes ?Alemãzinha?, ?Heritage? and ?Fallgold? were evaluated during two harvesting seasons, autumn and spring. Canonical groups were established among morphological (Group 1) and yield (Group 2) traits. In Group 1, plant yield and fruit weight were evaluated; in Group 2 the productive period, plant height, stem diameter, dry mass of pruning and plant leaf area were assessed. The linear and canonical correlations among morphological, phenological, and yield traits varied according to harvesting season. The phenological and morphological traits had greater linear correlation with yield traits in autumn than in spring. Based on our findings, to obtain more productive raspberry genotypes, plant leaf area and dry mass of pruning should be prioritized in the indirect selection. © FUNPEC-RP
Plasmid Library Construction From Genomic DNA
Get PDFFunctional genomic approaches have been effective at uncovering the function of uncharacterized genes and identifying new functions for known genes. Often these approaches rely on an in vivo screen or selection to associate genes with a phenotype of interest. These selections and screens are dependent upon the expression of proteins encoded in genomic DNA from an expression vector, such as a plasmid. Despite the utility of genomic DNA plasmid libraries, the protocols for their construction have remained unchanged in the past 40 years. Here, we present a procedure for constructing plasmid libraries from genomic DNA. This procedure is scalable and relies on simple techniques and common laboratory equipment and reagents. Briefly, the genomic DNA is extracted and then physically fragmented with a g-TUBE, overhangs are repaired, and fragments are selectively purified with magnetic beads to obtain an average fragment size of 2.5 kb. Blunted fragments are ligated into a blunt-end-digested and dephosphorylated vector. Finally, the library is amplified by electroporating the ligation into a high-transformation-efficiency Escherichia coli strain and extracting the plasmid DNA from the transformants. As a proof of concept, we built and sequenced three genomic libraries from different genomes and calculated their coverage using a next-generation sequencing (NGS) workflow. © 2025 The Author(s). Current Protocols published by Wiley Periodicals LLC. Basic Protocol: Plasmid library construction Alternate Protocol: Selection of gDNA fragments using SageELF gel fractionator Support Protocol 1: Extraction of gDNA with phenol/chloroform Support Protocol 2: Vector preparation.Agencia Nacional de Investigación e InnovaciónNew England Biolabs, Inc.Programa de Desarrollo de las Ciencias Basicas, Universidad de la Republica, Urugua
The implications of the intensification of a temperate rice-livestock rotation, in terms of nitrogen. P-926 [poster].
No full textThe Uruguayan rice-livestock system is one of the most productive worldwide, adding meagre amounts of N as fertiliser and reaching a very tight nitrogen (N) balance (N-BAL), low N surplus (N-SUR) and a high system N use efficiency (NUE), being a good example of a circular economy system
Alternativas para el manejo de patógenos de suelos en los sistemas hortícolas. (Capítulo 5)
No full textLa horticultura es una actividad intensiva en el uso de recursos y especializada. En general, se realiza más de un cultivo por año, o un cultivo de ciclo largo en un mismo cuadro o invernáculo, lo que implica varias labores de preparación del suelo, una alta extracción de nutrientes y pérdida de materia orgánica, necesidad de riego, entre otras medidas de manejo. Este manejo conduce al deterioro del recurso suelo y consecuentemente, al aumento de patógenos que limitan la productividad de los cultivos. ---- 1. Introducción. -- 2. Métodos de desinfección de suelos. -- 3. Alternativas físicas y biológicas utilizadas para la desinfección de suelos hortícolas en Uruguay. -- 3.1. Solarización. -- ¿Cómo se realiza la solarización?. -- 3.1. Biosolarización y biofumigación. -- Experiencias de solarización y biosolarización para la desinfección desuelos hortícolas en Uruguay. -- 4. Consideraciones finales. -
Genética y tecnología para una producción ovina sostenible.
No full textEsta publicación es un vehículo para comunicar parte del conocimiento generado en Proyecto RUMIAR (financiación INIA). El proyecto tuvo como objetivo generar información que permitiera identificar y seleccionar animales eficientes, productivos y resilientes para el Uruguay; y paralelamente generar pautas para una produccióncomercial amigable con el medio ambiente. Para esto, el proyecto se basó en tres componentes: a) identificación de animales eficientes de alto desempeño, b) caracterización de animales resilientes en ambientes desafiantes, y c) valorización de los ecosistemas ganaderos
Perfil genético de majadas comerciales para rasgos productivos y ambientales en Merino.
No full textLos valores de cría (EBV, estimated breeding values), también expresados como diferencias esperadas en la progenie (DEP=EBV/2), son estimaciones del méritogenético de los animales. Los valores de cría se obtienen mediante métodos estadísticos, aplicando modelos mixtos (Henderson, 1973) mediante el modelo BLUP (best linear unbiased prediction). Este modelo se utiliza a nivel internacional y emplea como fuentes de información datos fenotípicos (productivos) y genealógicos (pedigrí de los animales). Estos valores expresan la diferencia esperada en el promedio de los hijos de un animal evaluado en comparación con el promedio de la población