REDI - Digital Repository of the National Agency of Research and Innovation
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Genomic Organization of Trypanosoma cruzi tRNA Genes
Full text linkA frequently overlooked category of genes in large-scale genome analyses is the nonprotein-coding genes. Specifically, the genomic organization of tRNA genes in Trypanosoma cruzi—a unicellular eukaryotic pathogen responsible for causing the debilitating human disease Chagas disease—has largely remained uncharted due to the previous incompleteness of the genome assembly. By utilizing advanced genomic techniques and improved assembly methods, the quality of genome assemblies has significantly improved, making these studies feasible. Here, we analyzed the genic content and distribution of tRNA genes in the nuclear genome of various strains compared with the genome organization of other related trypanosomatids. We found synteny in most of the tDNAs clusters between T. cruzi and Trypanosoma brucei, highlighting the significance of the genomic location of these Pol III-transcribed genes. A vast majority of the isoacceptor species are encoded by two genes, except for tDNASeC, which comprises a tandem of 11 copies in the core compartment associated with well-positioned nucleosomes. Finally, we describe a group of tRNA genes located at chromatin folding domain boundaries, potentially acting as chromatin insulators in T. cruzi.Agencia Nacional de Investigación e InnovaciónComisión Sectorial de Investigación CientíficaResearch Council United Kingdom Grand Challenges Research Funder (GCRF)Fondo para la Convergencia Estructural del Mercado Común del Sur (FOCEM)Pasteur Networ
Informe final del proyecto: Senderos de transición hacia la bioeconomía forestal en Uruguay
No full textLa investigación se propuso identificar la existencia de distintos senderos de transiciones hacia la bioeconomía forestal en Uruguay. Se planteó un diseño exploratorio para dar cuenta de la emergencia de posibles interacciones que propendan a la generación de soluciones en áreas relevantes de problemas relacionados a la red de la bioeconomía forestal. Se adoptó un enfoque de métodos mixtos, centrado en la identificación de capacidades y potenciales acumulaciones para la construcción de soluciones e innovaciones, con especial interés en la comprensión de los procesos y sus tendencias y posible evolución. Además, se adoptó el enfoque de perspectiva multinivel (Geels, 2001) para estudiar las transiciones. Se detectaron dos senderos de transición de la bioeconomía forestal. El primer sendero, denominado “sendero celulosa-madera”, es considerado el statu quo, es decir que tiene a su disposición el régimen socio-técnico imperante. Se constató que los actores de este sendero, motores de la diversificación productiva, no son las mulitinacionales de pulpa a partir de eucaliptus instaladas en el país. Los actores pioneros de la bioeconomía forestal en Uruguay son actores del sector de madera mecánica para la construcción en madera de edificaciones y productores en el sistema de silvopastoreo. Otros actores potenciales (no hay aún inversiones productivas, pero si investigación a nivel de mercado) son los de producción de papel y cartón a partir de pulpa marrón de pino. El sendero alternativo al modelo forestal se caracteriza por un importante tendido de actores cuyas innovaciones se pueden caracterizar como “experimentos de sostenibilidad”. Este sendero está compuesto por pequeños productores que tienen una valoración del territorio muy diferente al del statu quo. Conforman redes, movimientos, compartiendo saberes entre personas, redes de colectivos temáticos y tienen importantes articulaciones con la academia. La trama recorre distintos tipos de espacios rurales-urbanos en el territorio tejiendo una red de alcance nacional.Agencia Nacional de Investigación e Innovació
Análisis transcriptómicos de dos isolíneas de tomate en respuesta al hongo Stemphylium lycopersici: mecanismos de resistencia mediados por el locus Sm
No full textEl tomate (Solanum lycopersicum L.) es un cultivo de gran relevancia global y el segundo más importante en Uruguay. La mancha gris de la hoja, causada por hongos del género Stemphylium, es una enfermedad devastadora que provoca importantes pérdidas en las variedades susceptibles. En el marco del programa de mejoramiento del INIA, se generaron isolíneas de tomate con diferentes niveles de resistencia a Stemphylium mediante la incorporación del locus de resistencia Sm. Para identificar los mecanismos asociados a esta resistencia, se inocularon las isolíneas con un aislado virulento de S. lycopersici (UYSLS32). Se observaron síntomas claros en la isolínea susceptible a los 5 días post inoculación (dpi), con progresión hacia necrosis y clorosis a los 9 dpi. En contraste, la isolínea resistente mostró solo pequeñas manchas a los 9 dpi y sin síntomas significativos a los 5 dpi.
Se analizaron los transcriptomas de ambas isolíneas en plantas sin tratamientos, y a los 5 y 9 dpi comparándolos con un control tratado solo con agua. En plantas sin tratamiento, se identificaron 320 genes diferencialmente expresados (DEGs) entre las isolíneas. El análisis de enriquecimiento de ontología de genes (GO) reveló que, en comparación con la susceptible, la isolínea resistente mostró una inducción de DEGs en procesos biológicos como exportación de proteínas desde el núcleo, síntesis de cumarina, respuesta a estímulos bióticos, respuesta a estrés y regulación del ácido jasmónico. A los 5 dpi, la isolínea resistente presentó un aumento en la expresión de 257 DEGs, mientras que la susceptible mostró 688 DEGs. En la resistente, se observaron DEGs enriquecidos en funciones moleculares como actividad antioxidante, actividad catalítica y unión de ácido abscísico, así como en procesos biológicos como catálisis de componentes de la pared celular, detoxificación, respuesta a estrés y estímulo biótico, y proceso catabólico de quitina. A los 9 dpi, la resistente mostró 136 DEGs inducidos, mientras que la susceptible tuvo 384 DEGs inducidos. En la isolínea resistente, se observó enriquecimiento de genes asociados a vías de señalización de hormonas y sistemas de transducción de señales. Por otro lado, la isolínea susceptible mostró un enriquecimiento en funciones moleculares como unión de polisacáridos y quitina, actividad oxido-reductasa, actividad de proteína tirosina quinasa, y factores de transcripción. Estos resultados demuestran que la isolínea resistente presenta una activación de genes relacionados con la defensa, lo que podría explicar la resistencia observada frente a S. lycopersici. También se observó por microscopía confocal cambios en la pared celular del tejido vegetal durante la infección, producción de especies reactivas de oxígeno (ROS), así como también el avance del patógeno.ANIIPedecib
HyUruguay: Development of a Green Hydrogen R&D Roadmap for Uruguay
Full text linkEl informe HyUruguay presenta una Hoja de Ruta de Investigación y Desarrollo (I+D) en Hidrógeno Verde y Productos Power-to-X (PtX) para Uruguay, desarrollada por el Fraunhofer Institute for Energy Economics and Energy System Technology (IEE) y la Universidad de la República (UdelaR). El documento analiza el contexto energético nacional, la disponibilidad de recursos renovables, la infraestructura existente, la regulación y los mecanismos de financiamiento público-privado. A partir de un diagnóstico FODA y de entrevistas a actores clave, identifica fortalezas como la estabilidad política, la matriz eléctrica renovable y la cooperación internacional, junto con desafíos vinculados a la infraestructura, la capacidad de investigación y la formación de recursos humanos. La hoja de ruta propone tres fases: fundación y primeras acciones (2026–2028), escalamiento y demostración (2029–2033) e integración y competitividad global (2034–2040). Cada etapa incluye metas de desarrollo tecnológico, formación de capacidades, alianzas estratégicas y seguimiento mediante indicadores (KPIs) alineados con estándares internacionales. El documento busca fortalecer el ecosistema nacional de I+D, promover la cooperación entre el sector público, la academia y la industria, y posicionar a Uruguay como actor competitivo en la economía global del hidrógeno verde.Agencia Nacional de Investigación e InnovaciónMinisterio Federal de Educación e Investigación de Alemani
Encuesta sobre manejo de malezas en sistemas agrícola-ganaderos de Uruguay.
No full textEste artículo pone el foco en la visión de productores y asesores técnicos sobre la problemática de malezas en cultivos agrícolas y pasturas. Los resultados de este trabajo ofrecen información clave para orientar la investigación y la toma de decisiones en el manejo de malezas en Uruguay
Informe final del proyecto: Desarrollo de un procedimiento de biopsia líquida para evaluación de la respuesta a la inmunoterapia en cáncer
No full textLa inmunoterapia del cáncer utilizando anticuerpos contra PD1/PD-L1 constituye uno de los mayores progresos terapéuticos de la última década. PD-L1 se encuentra en células tumorales e inmunitarias del microambiente tumoral. Al unirse al receptor PD-1, inhibe la activación de linfocitos T. Actualmente se investiga intensamente buscando biomarcadores precisos que identifiquen pacientes que respondan mejor a este tipo de inmunoterapia. La biopsia líquida puede ser una muy buena posibilidad. El PD-L1 en sangre incluye diferentes fracciones, como soluble (sPD-L1) y en exosomas (exo-PD-L1). El aumento de sPD-L1 y exo-PD-L1 puede inhibir linfocitos T, afectando la respuesta a la inmunoterapia. Aún no se ha definido el mejor procedimiento para evaluar PD-L1 en biopsia líquida. En este trabajo comparamos dos estrategias de ELISA para cuantificar sPD-L1 y exo-PD-L1, una con anticuerpos anti-PD-L1/anti-PD-L1 y otra con anti-antígeno Tn/anti-PD-L1. Se obtuvo plasma de 10 individuos controles sanos y de 37 pacientes con cáncer, incluyendo tumores de pulmón, riñón, piel, orofaríngeo, estómago y cuello uterino, previo al inicio de la inmunoterapia. La purificación de microvesículas se demostró mediante microscopía electrónica. Los dos tipos de ELISA mostraron capacidad para detectar PD-L1 en sangre, tanto en plasma total como en exosomas. La mayor especificidad se observó para exo-PD-L1 con anti-PD-L1/anti-PD-L1 y con antígeno Tn/PD-L1 en plama. En pacientes con cáncer, la mayor sensibilidad se vio para ambos métodos en plasma. En algunos pacientes los cambios en los niveles de sPD-L1 mostraron buena correlación con la respuesta al tratamiento. Conclusiones: la detección de sPD-L1 utilizando el método antígeno Tn/PD-L1 mostró la mejor relación sensibilidad/especificidad, que podría predecir la respuesta a la inmunoterapia. Este método aparece como una nueva estrategia para detectar PD-L1 en biopsia líquida. Se requiere de una casuística mayor, con seguimiento prolongado, para concluir sobre la utilidad clínica de los métodos utilizados.Agencia Nacional de Investigación e Innovació
La producción familiar y sus aportes en los territorios.
No full textEste artículo apunta a conceptualizar la Producción Familiar desde algunos aspectos centrales, identificando sus diferentes dimensiones, cualidades y valores como sujeto colectivo que posibilita el desarrollo rural
New draft genome sequence of the ergot disease fungus claviceps paspali.
No full textABSTRACT.Here, we report a new draft genome sequence of an isolate of the ascomycete Claviceps paspali that is responsible for ergot disease in grasses of the Paspalum genus. This new draft genome sequence will provide useful data for evaluating intraspecies and interspecies genome variation in C. paspali and other Claviceps genus members. © 2020 Oberti et al. This is an open-access article distributed under the terms of the Creative Commons Attribution 4.0 International license
Valorización de la producción ovina: animales, personas y ambiente.
No full textEste trabajo, tiene como objetivo compartir experiencias de investigación y desarrollo que buscan hacer uso de las oportunidades y agendar los desafíos, pudiendo agregar valor a la producción (y a la cadena de valor), atendiendo aspectos de las personas, los animales, y el ambiente
Prohibition of hormones in animal reproduction: what to expect and what to do?.
No full textAs our understanding of ovarian function in cattle has improved, our ability to control it has also increased. The development of Fixed-Time Artificial Insemination (FTAI) protocols at the end of the 20th century has increased exponentially the number of animals inseminated over the last 20 years. The main reasons for this growth were the possibility of obtaining acceptable pregnancy rates without heat detection and, above all, the induction of cyclicity in suckled cows in postpartum anestrus and prepubertal heifers at the beginning of the breeding season. Most FTAI treatments in South America have been based on the use of progesterone (P4) releasing devices and estradiol to synchronize both follicular wave emergence and ovulation, with pregnancy rates ranging from 40 to 60%. These protocols are implemented on a regular basis, allowing producers access to high-quality genetics, and increasing the overall pregnancy rates during the breeding season. In addition, it provided the professionals involved in these programs with a new source of income and the diversification of their practices into activities other than their usual clinical work. Many of these practices are now apparently at risk from restrictions on the use of estradiol by the European Union (EU) and other countries. However, the development of alternative protocols based on GnRH, with P4 devices and eCG and other new products that are not in the market yet will allow us to adapt to the new times that are coming. Logically, the challenge has already been raised and we must learn to use alternative protocols to try to continue increasing the use of this technology in beef and dairy herds. The objective of the present review is to describe the main aspects of banning estradiol in livestock production, the negative impacts on reproductive efficiency, and to present some alternative FTAI protocols for dairy and beef cattle. © The Author(s)