Hatay Mustafa Kemal University Institutional Repository
Not a member yet
2946 research outputs found
Sort by
Determination of yield, yield components and oil content of different safflower varieties grown under Hatay conditions
Bazı aspir çeşitlerinde verim, verim unsurları ve yağ içeriğinin tespit edilmesi amacıyla yapılan bu çalışma, 2017-2018 ekim sezonunda kışlık olarak Hatay Mustafa Kemal Üniversitesi Ziraat Fakültesi uygulama alanında yürütülmüştür. Araştırma, tesadüf blokları deneme desenine göre 3 yinelemeli olarak kurulmuştur. Denemede materyal olarak 8 aspir çeşidi (Olas, Asol, Linas, Zirkon, Göktürk, Balcı, Dinçer, Olein) kullanılmıştır. Yapılan istatistiki analiz sonucunda incelenen özelliklerin farklı seviyelerde önemli olduğu; tohum verimi (262.78 kg da-1), ham yağ oranı (%38.49) ve ham yağ verimi (101.17 kg da-1) değerleri bakımından Asol çeşidinin, bitki başına tabla sayısı (16.20 adet) ve bin tane ağırlığı (45.56 g) bakımından Dinçer çeşidinin, ilk dal yüksekliği (115.90 cm) ve bitki boyu (163.67 cm) bakımından Linas çeşidinin üstün olduğu belirlenmiştir. Tablada tohum sayısı (23.70 adet) bakımından Göktürk üstün olurken, Balcı çeşidinde bitki başına dal sayısı (8.50 adet) fazla olduğu halde tohum ve ham yağ veriminin düşük olduğu tespit edilmiştir. Araştırma sonuçları Hatay koşullarında Asol çeşidinin başarı ile yetiştirilebileceğini göstermiştir.This study was conducted to determine yield and yield components and oil content of some safflower varieties during winter season of 2017-2018, in Hatay Mustafa Kemal University Research Field. The experimental design was a randomized block design with three replications. Eight safflower varieties (Olas, Asol, Linas, Zirkon, Göktürk, Balcı, Dincer, Olein) were used as plant material. The result of this study showed that the investigated plant parameters were significant among the tested safflower varieties. According to the results; seed yield (262.78 kg da-1), crude oil content (38.49%) and crude oil yield (101.17 kg da-1) were greater in Asol variety, number of heads per plant (16.20 pieces) and 1000 seed weight (45.56 g) were greater in Dinçer variety, first branch height (115.90 cm) and plant height (163.67 cm) were greater in Linas variety. Göktürk was a superior variety in terms of number of seeds provided per head (23.70 pieces). Although the number of branches per plant (8.50 pieces) was greater in Balci variety, seed and crude oil yield were lower in the same variety. The results indicated that safflower variety Asol can be successfully cultivated in Hatay conditions
Kurkumin demir (III) kompleksinin demir şelasyonunun in vitro etkileri
Purpose: The aim of this study was to investigate the cytotoxicity effect, iron chelator and antioxidant activities of iron (III) ions with curcumin ligand that may be used in the treatment of iron overload. Materials and Methods: The cytotoxic activities of the ligand and the complex were evaluated by the MTT assay. The SOD activity of the complex of curcumin was determined by using its ability to inhibit the reduction of NBT. The catalytic activity studies of Fe(III) complex in DMSO towards the disproportionation of hydrogen peroxide were also performed. Results: The IC50 values are found in 6.8 μM catalase activity was measured. Where at a concentration of 2.0 mM, the activity was equivalent to 183.30 U/L. The complex shows a catalase activity. The complex showed minimal toxicity. IC50 values found 5.3 mg/ml. The observed cytotoxicity could be pursued to obtain a potential drug. The iron chelator effects were determined by Ferrozine reagent. Curcumin, the most active extract interfered with the formation of ferrous and ferrozine complex. It demonstrated strong chelating activities. The result showed that the complexes possess considerable SOD activity. This finding indicates that the iron complex is capable of removing free radicals. Conclusion: The study results revealed that the iron(III) complex of curcumin with an appropriate potential drug may act as a protector against oxidative stress. Therefore, all results suggest that curcumin may represent a new approach in the treatment of iron overload.Amaç: Bu çalışmanın amacı, aşırı demir yüklenmesinin tedavisinde kullanılması muhtemel olan kurkumin ligandı ve demir(III) iyonlarının sitotoksik etkisini, demir şelatörünü ve antioksidan etkinliğini araştırmaktır. Gereç ve Yöntem: Ligandın ve kompleksin sitotoksik etkileri MTT yöntemi kullanılarak değerlendirildi. Kurkumin kompleksinin SOD etkinliği, kompleksin NBT azaltımını inhibe etme kabiliyetine göre belirlendi. Buna ilaveten, demir(III) kompleksinin DMSO’daki hidrojen peroksitin disproporsiyonu reaksiyonuna yönelik katalitik etkinliği de çalışıldı. Bulgular: IC50 değerleri, 6.8 μM katalaz etkinliğinde ölçüldü. Konsantrasyonun 2.0 mM, olduğu durumda etkinlik seviyesi 183.30 U/L olarak ölçüldü. Kompleksin katalaz etkinliği gösterdiği ve minimal seviyede toksisiteye sebep olduğu görüldü. IC50 değerlerinin, 5.3 mg/ml’ye denk geldiği görüldü. Gözlenen sitotoksisitenin takip edilmesiyle, potansiyel bir ilacın elde edilmesinin muhtemel olduğu görüldü. Demir şelatörün etkileri Ferrozin reaktif bileşiği ile belirlendi. Demir ve Ferrozine kompleksinin oluşmasına müdahale eden en aktif ekstraktın kurkumin olduğu görüldü. Ayrıca, kurkuminin güçlü şelasyon etkinliğine sahip olduğu görüldü. Elde edilen bulgular bu komplekslerin önemli derecede SOD etkinliğine sahip oldukları görüldü. Dolaysıyla bu bulgular demir kompleksinin serbest radikalleri yok etme gücüne sahip olduğuna işaret etmektedirler. Sonuç: Bu çalışmada elde edilen bulgular, uygun bir potansiyel ilaç ile beraber kullanıldığında demir(III) kurkumin kompleksinin oksidatif strese karşı bir koruyucu olarak işlev görebileceğini göstermektedir. Dolayısıyla elde edilen bütün bulgular, kurkuminin aşırı demir yüklenmesinin tedavisinde yeni bir yaklaşım olabileceğine işaret etmektedirler
Cicadellidae family species obtained from light trap in Hatay province and their population densities
Amaç: Hatay ilinde 2013 yılının haziran-kasım ayları arasında yürütülen çalışmada ışık tuzakları kullanılarak farklı kültür bitkilerinin yetiştirildiği tarımsal bir alanda Cicadellidae familyasına ait türlerin belirlenmesi amaçlanmıştır. Yöntem ve Bulgular: Hatay Mustafa Kemal Üniversitesi Ziraat Fakültesinin uygulama arazisinde, farklı bitki parsellerinin (mısır, pamuk, patates, tatlı patates, nohut, ayçiçeği, defne ve bazı sebze türleri) bulunduğu bir agroekosisteme Robinson tipi sabit ışık tuzağı yerleştirilmiş ve haftalık olarak elde edilen Cicadellidae familyasına bağlı böceklerin tür teşhisleri ve sayımları yapılmıştır. Ayrıca 25 haftalık örneklemeden elde edilen türlerin yoğunlukları ile popülasyonlarının durumu değerlendirilmiştir. Çalışma sonucunda 18 farklı cinsten 30 tür belirlenmiş olup, bu türlerden bazılarının önemli bitki zararlısı veya fitoplazma vektörü oldukları bilinmektedir. Belirlenen türler içerisinde Cicadulina bipunctella (% 30.45), Zyginidia pullula (%20.75), Balclutha punctata (%15.23) ve Psammotettix provincialis (%13.26) en yoğun bulunan türler olmuştur. Genel Yorum: Işık tuzağı ile Cicadellidae familyasına bağlı 30 tür belirlenerek bu yöntemin cicadellid türlerin belirlenmesi için kullanılabilecek bir yöntem olduğu sonucuna varılmıştır. Çalışmanın Önemi ve Etkisi: Bu çalışma ile belirli habitatlardaki Cicadellidae familyası türlerinin ve popülasyonlarının belirlenmesinde, türlerin biyolojileri ile ilgili çalışmalarda ışık tuzaklarının, kullanılan yöntemlere ilave olarak tamamlayıcı bir yöntem olarak kullanılabileceği kanaatine varılmıştır.Aims: This study conducted in the province of Hatay between June and November 2013. it was aimed to determine the species belonging to Cicadellidae family in an agricultural area where different cultural plants were grown by using light traps. Methods and Results: The Robinson type light trap was placed in an agroecosystem where various plant parcel (maize, cotton, potato, sweetpotato, chickpea, sunflower, daphne) were present in application field of Hatay Mustafa Kemal University, Agricultural Faculty. The cicadellid species obtained from the light traps were identified and counted weekly. Additionally, density of species of cicadellids obtained from the 25-weeklysampling and their population levels were evaluated. As a result, 30 species have been determined from 18 different genus. It’s known that some of these species are important pest or phytoplasma vectors. Among the obtained species, Cicadulina bipunctella (% 30.45), Zyginidia pullula (%20.75), Balclutha punctata (%15.23) and Psammotettix provincialis (%13.26) were the most abundant species. Conclusions: Thirty species of Cicadellidae family were identified by light trap and it was concluded that this method can be used for the determination of cicadellide species. Significance and Impact of the Study: In this study, it has been concluded that light traps can be used as a complementary method in addition to the methods used to determine the species and their populations of Cicadellidae family in certain habitats
İvesi kuzularında sütten kesim ağırlığı ve bazı morfolojik özellikler arasındaki ilişkinin path analizi
In this study, Path analysis was used to determine the direct and indirect effects of some morphological traits such as wither height, sacrum height, body length, chest depth, chest girth and chest width
on the weaning weight of sheep. The data was obtained from 200 heads of Awassi lambs raised in Gaziantep province. The results of the path analysis indicated that the variants of sacrum height and
body length sustained the most significant effect on the weaning weight. Consequentely, chest girth and body length were the most favorable measurements to estimate weaning weight in Awassi and
could be used as a reliable criteria for practical selection in Awassi lambs.Bu çalışmada, koyunların sütten kesim ağırlığı üzerine sağrı yüksekliği, cidago yüksekliği, vücut uzunluğu, göğüs derinliği, göğüs çevresi gibi bazı morfolojik özelliklerin doğrudan ve dolaylı etkilerini
belirlemek amacıyla path analizi kullanılmıştır. Çalışmanın verileri, Gaziantep ilinde yetiştirilen 200 baş İvesi kuzulardan elde edilmiştir. Path analiz sonuçlarına göre, cidago yüksekliği ve vücut uzunluğu değişkenlerinin İvesi kuzularında sütten kesim ağırlığı üzerinde önemli etkiye sahip olduğu ve göğüs çevresi ve vücut uzunluğunun İvesi kuzularında sütten kesim ağırlığını tahmin etmede en uygun ölçümler ve pratik seçim için güvenilir bir kriter olarak kullanılabileceği belirlenmiştir
Kurumsal sosyal sorumluluğun inovasyon ve firma değeri arasındaki ilişkide aracılık etkisi
Corporate social responsibility (CSR) is becoming increasingly an integral part of business practice. This study aims to explain the relationship between CSR practices and firm value by adding two key variables: invest in innovation and invest in marketing. The sample of empirical study consists of manufacture firms registered in Borsa Istanbul/Turkey.
Research findings indicated that the CSR practices influence directly and positively to firm value. Higher marketing expenditures leads to less firm profitability and no impact on firm value. Investing in R&D impacts positively to CSR practices and profitability. CSR plays a mediating role between R&D intensity and firm value relationship. There isn’t significant mediating effect of marketing intensity between CSR and firm value.Kurumsal sosyal sorumluluk (KSS), giderek iş uygulamalarının ayrılmaz bir parçası haline gelmektedir. Bu çalışma, KSS uygulamaları ile firma değeri arasındaki ilişkiyi iki temel değişken ekleyerek açıklamayı amaçlamaktadır: inovasyona yatırım ve pazarlamaya yatırım. Ampirik çalışmanın örneklemi Borsa İstanbul / Türkiye'de kayıtlı imalat firmalarından oluşmaktadır. Araştırma bulguları, KSS uygulamalarının firma değerine doğrudan ve olumlu yönde etkilediğini göstermiştir. Daha fazla pazarlama harcamaları
daha az firma karlılığına yol açmaktadır ve firma değeri üzerinde bir etkisi yoktur. Ar-Ge'ye yatırım yapmak, KSS uygulamalarına ve karlılığa olumlu yönde etki etmektedir. KSS, Ar-Ge yoğunluğu ve firma değeri ilişkisinde aracılık rolü oynamaktadır. Pazarlama yoğunluğunun, KSS ile firma değeri arasında önemli bir aracılık etkisi yoktur
Nurses’ occupational professional Life quality and Influencing factors
Amaç: Tanımlayıcı türde olan bu araştırma, bir devlet hastanesinde çalışan hemşirelerin iş yaşam kalitesini ve etkileyen faktörleri belirlemek amacıyla yapılmıştır. Gereç ve Yöntemler: Araştırmada örneklem seçimine gidilmeden, çalışmaya katılmayı kabul eden tüm hemşirelere ulaşılması planlanmıştır (N=360). Bu doğrultuda araştırmaya katılmayı kabul eden 284 hemşireye ulaşılmıştır. Araştırmanın verileri “Kişisel Bilgi Formu” ve “Hemşirelik İş Yaşamı Kalitesi Ölçeği-HİYKÖ” kullanılarak toplanmıştır. Verilerin analizi SPSS-21 istatistik paket programında yapılmıştır. Veriler Independent Sample t test, OneWay ANOVA ve Kruskal Wallis analizi ile değerlendirilmiştir. Bulgular: Araştırmaya katılanların çoğunluğunun (%81.7) “kadın”, %45.8’nin 25-38 yaş grubunda, %56’sının lisans mezunu olduğu ve büyük çoğunluğunun da (%91.2) klinik hemşiresi olduğu bulunmuştur. Çalışmada Cronbach alfa katsayısı 0.75 ve hemşirelerin HİYKÖ ortalama puanı iyi düzeyde (103.21±12.82 ) saptanmıştır. Hemşirelerin tanıtıcı özelliklerinden yaş grubu, çalıştığı birim, çalışma yılı ve çalıştığı vardiya şekli durumlarının HİYKÖ alt boyutlarını etkilediği ve aralarında istatistiksel olarak anlamlı fark olduğu saptanmıştır(p<0.05). Sonuç: Hemşirelerin yaş grubunun, çalıştığı birimin, çalışma yılının ve çalıştığı vardiya şeklinin, çalıştığı birimde kendi isteği ile çalışma durumunun, aldığı eğitime uygun birimde çalıştığı düşüncesinin ve aldığı ücreti yeterli bulma düşüncesinin iş yaşam kalitesini etkilediği saptanmıştır. Bu sonuçlara istinaden iş yaşam kalitesini iyileştirmek adına yasalar ve uygulamaların yeniden gözden geçirilerek hemşirelerin desteklenmesi ve hemşirelerin iş doyumlarını geliştirebilecek standartların oluşturulması ve uygulamaya geçirilmesi önerilebilir. Ayrıca hemşirelerin fiziki çalışma koşulları gözden geçirilmeli, otonomi, kariyer ve terfi edebilme fırsatları tanınmalıdır.Aim: This descriptive research was performed with the aim of determining the working quality and related influencing factors for the nurses who work at The Public Hospital. Material and Methods: It was planned to reach all of the nurses who accept to participate in the study without any sample selection (N=360). The study was conducted with 284 nurses who agree to participate in the study accordingly. The research data were collected with the “Personal Information Form” and “Quality of Nursing Work Life ScaleQNWLS”. The data were evaluated through Independent Sample t test, One-Way ANOVA, and Kruskal Wallis analysis at SPSS-21 statistics pocket program as well as descriptive statistics. Results: It has been found that most of the participants were “female” (81.7%), 45.8% was belong to the age group of 25-38, 56% had bachelor’s degree and a great majority ( 91.2%) were working as clinic nurse. The QNWLS Cronbach’s alpha coefficient of the nurses was found to be 0.75 and total mean score for the scale was determined to be at a good level (103.21±12.82). It has been determined that the descriptive features of nurses including age group, working department, experience and shift type affected the QNWLS subscales and there was a statistical significant difference between them (p<0.05). Conclusion: It has been determined that the factors of age group, working department, experience and shift type, choosing the working department willingly, working in a related department with their field of expertise and the opinion of fee sufficiency were effective on the working life quality. Based on these results, it may be recommended to review the laws and practices in order to improve the quality of work and to support nurses and to establish and implement standards that can improve nurses' job satisfaction. In addition, the physical working conditions of nurses should be reviewed and autonomy, career and promotion opportunities should be given
Doğal serin iklim buğdaygil yembitkilerinin bitki gelişme dönemlerine bağlı yem kalitesi değişimi ve çiftlik hayvanlarının günlük ihtiyacını karşılayabilme yetenekler
Aims: For a proper range management and livestock feeding operations need to detailed chemical analyses and knowledge on pasture composition. Methods and Results: Seven native cool-season grasses that are Festuca arundinaceae L., Brachypodium pinnatum (L.) Beauv., Phleum pretense L., Dactylis glomerata L., Bromus inermis Leyss., Lolium perenne L. and Hordeum bulbosum L. were evaluated for their nutritive value at five different phenological stages. The chemical composition, quality and therefore their feeding value so the animal performance are directly under control of the stage of plant phenology. Stage of plant maturity decreases dry matter digestibility, dry matter intake and protein content, but increases in lignocellulosic structure with the advance phenology of the whole investigated perennial species. Conclusions: The species which have thickand longer leaves, and higher leaf/stem ratio determined as the more digestible, and also the metabolizable energy of the fast growing ones was considerably higher. The vast majority of the minerals’ concentration was distinctly reduced at stem elongation to flowering and then increased remarkably from that point to developing seed stalks. The fast growing species accumulated the minerals more. Grass Tetany risk (K/(Ca+Mg)) of the investigated species increased remarkably at head emergence and flowering stage. Most of the species were detected within the boundaries of the recommended Ca/P ratio for diet. Significance and Impact of the Study: The native pastures seem to satisfy the daily maintenance requirements of most livestock in respect to most minerals without any supplementation via correct timing for feeding.Amaç: Doğru bir mera yönetimi ve hayvan besleme ilkeleri açısından mera kompozisyonu üzerinde detaylı kimyasal inceleme ve yoğun bir bilgiye ihtiyaç vardır. Yöntem ve Bulgular: Mevcut araştırmada; doğal çok yıllık serin mevsim buğdaygil türleri, Festuca arundinaceae L., Brachypodium pinnatum (L.) Beauv., Phleum pretense L., Dactylis glomerata L., Bromus inermis Leyss., Lolium perenne L. ve Hordeum bulbosum L. beş farklı bitki gelişim döneminde hayvan besleme kalitesi açısından değerlendirilmiştir. Bitki kimyasal kompozisyonu, kalite ve dolayısıyla besleme değerleri yani hayvan performansı bitki gelişim dönemlerinden doğrudan etkilenmektedir. İncelenen tüm türlerde kuru maddenin sindirilebilirliği, alımı ve protein içerikleri bitki olgunlaşması ile birlikte azaltırken, lignifikasyon artmıştır. Genel Yorum: İnce uzun yapraklı ve yaprak/sap oranı yüksek olan türlerin sindirilebilirlik oranlarının daha yüksek oldukları belirlenmiştir. Hızlı büyüyen türlerde ise metabolize olabilir enerji içeriğinin yüksekliği dikkate değer bulunmuştur Mineral elementlerin büyük çoğunluğunun konsantrasyonu sapa kalkma ve çiçeklenme dönemi arasında belirgin şekilde azalırken, bu dönemden başak/salkım çıkarma aşamasına kadar önemli bir artış saptanmıştır. Hızlı büyüyen türlerde mineral element birikimi de daha fazla gerçekleşmiştir. İncelenen türlerde çayır tetanisi riski (K/(Ca+Mg)) çiçeklenme aşamasında belirgin bir şekilde artış göstermiştir. Hesaplanan Ca/P oranının, tüm türler için rasyonda olması önerilen sınırlar içinde bulunduğu değerlendirilmiştir. Çalışmanın Önemi ve Etkisi: Araştırma bulguları incelenen doğal mera bitkilerinin, çoğu mineral element açısından çiftlik hayvanlarının günlük gereksinimlerini, herhangi bir ilaveye gerek olmaksızın karşılayabilecek kapasitede olduklarını ortaya koymuştur
Türkiye’de farklı aromatik bitkilerin üretilmesinde Sera Gazı Emisyonlarının (GHG) belirlenmesi
The release of greenhouse gas emissions is a source of great concern for Turkey. However, agriculture is among the key actors in terms of environmental impact in Turkey, as agriculture not only consumes energy but it also produces it and it can have both positive and negative effects on the environment. This study was conducted in order to determine GHG emissions for four different medical, aromatic and pleasure plants production (guar, lavender, sesame and tobacco) in the different provinces of Turkey. For this purpose, the first data was collected from references. The results indicated that total GHG emissions for four different aromatic
plants production (guar, lavender, sesame and tobacco) production were computed as 1488.50 kgCO2-eqha–1 , 494.81 kgCO2-eqha–1 , 907.13 kgCO2-eqha–1 , 6604.58 kgCO2-eqha–1 respectively. The GHG ratios were computed as 0.65 kgCO2-eqkg–1 , 0.10 kgCO2-eqkg–1 , 1.88 kgCO2-eqkg–1 , 6.29 kgCO2-eqkg–1
respectively.Sera gazı emisyonlarının salınması, Türkiye için büyük bir endişe kaynağıdır. Ancak, sadece enerji tüketmekle kalmayıp aynı zamanda çevre üzerinde hem olumlu hem de olumsuz etkileri olabileceği için Türkiye'de tarım çevresel etkilerin en önemli aktörleri arasında yer almaktadır. Bu çalışma, Türkiye'nin farklı illerinde dört farklı tıbbi, aromatik ve keyif bitkisinin (guar, lavanta, susam ve tütün) üretimi sırasında oluşan
sera gazı emisyonlarının belirlenmesi amacıyla yapılmıştır. Bu amaçla ilk veriler referanslardan toplanmıştır. Sonuçta, dört farklı aromatik bitkinin (guar, lavanta, susam ve tütün) üretimi sırasında oluşan toplam sera gazı
emisyonları sırasıyla 1488.50 kgCO2-eşha–1 , 494.81 kgCO2-eşha–1
, 907.13 kgCO2-eşha–1 ve 6604.58 kgCO2-eşha–1 olarak, GHG oranları ise sırasıyla 0.65 kgCO2-eşkg–1 , 0.10 kgCO2-eşkg–1 , 1.88 kgCO2-eşkg–1 ve 6.29 kgCO2-eşkg–1 olarak hesaplanmıştır
Science teaching laboratory practice on teaching path : a case study
Bu çalışmada, fen bilgisi öğretmenliği lisans programında verilen Fen Öğretimi Laboratuvar
Uygulamaları (FÖLU) dersinin öğretimine ilişkin öğretmen adaylarının eğitim ihtiyaçlarının belirlenmesi
amaçlanmıştır. Çalışmada nitel araştırma desenlerinden durum çalışması kullanılmıştır. Araştırma birimini
Türkiye’nin güneyindeki bir üniversitede FÖLU dersini alan öğretmen adayları oluşturmaktadır. Veri
toplama sürecinde yarı yapılandırılmış görüşme formu hazırlanmış ve toplam on iki öğretmen adayıyla
görüşülmüştür. Verilerin analizinde tümevarımsal içerik analizi yaklaşımı kullanılmıştır. Analiz
sonucunda, FÖLU dersi öğretim programı ögelerinin (amaç, içerik, öğretme-öğrenme süreci ve ölçme ve
değerlendirme) öğretim sürecini destekleyen etmenler dikkate alınarak geliştirilmesi gerektiği
belirlenmiştir. Araştırma sonuçları doğrultusunda uygulamadaki programın geliştirilmesine ve derse ilişkin
örtük programın etkililiğini artırmaya yönelik önerilerde bulunulmuşturThis study aims to identify the educational needs of prospective science teachers regarding the
course ‘Science teaching laboratory practice (STLP)’ taught in the undergraduate program of science
teaching. The case study which is among the qualitative research designs was utilized in the study.
Prospective science teachers who took the course “Science teaching laboratory practice” and studying in
the south of Turkey participated in the study. Semi-structured interview form was used in the data collection process. The interview was conducted on twelve prospective science teachers. Inductive content analysis approach was used to analyze the data. It was determined that the elements of STLP curriculum (aim, content, teaching-learning process, and assessment and evaluation) should be developed by considering the factors that support the teaching process. In line with the results of the research, suggestions were provided to improve the current program and to increase the effectiveness of the implicit program
Investigation of polymerase chain reaction method in patients with suspected chronic cutaneous leishmania of negative microscopy
Leyşmanyazis, enfekte dişi tatarcıkların ısırmasıyla insanlara bulaşan paraziter bir hastalıktır. Kutanöz
leyşmanyazisin (KL) tanısında dermal kazıntıdan alınan örneklerde, mikroskopta parazitin gösterilmesi
altın standart bir yöntem olarak yerini korumaktadır. Ancak bir yıl ve daha uzun süreli lezyonu bulunan
kronik olgularda amastigot sayısı çok az sayıda olduğundan saptamak zordur. Hastaların öncelikle vücutlarında çıkan bu lezyonları dikkate almamaları, sağlık kurumlarına başvurmamaları veya geç başvurmaları,
yanlış tedavi almaları gibi birçok nedenden ötürü tanı ve tedavi gecikmektedir. Ayrıca, lezyonlar üzerine
sekonder enfeksiyon eklenerek prognoz kötüleşmekte ve yaralar kronikleşmektedir. Bu nedenle, kronik
KL şüpheli olgularda mikroskop ile inceleme yöntemine ek olarak moleküler yöntemlerden faydalanılmaktadır. Bu çalışmada, mikroskop incelemesi sonucunda Leishmania amastigotları görülmeyen ancak
klinik olarak KL açısından değerlendirilmesi rapor edilmiş şüpheli kronik KL Türkiye başlangıçlı olgulara ait
dermal kazıntı preparatları seçilerek polimeraz zincir reaksiyonu (PCR) yöntemi kullanılarak leyşmanyazis
tanısında moleküler yöntemin tanı değerinin ortaya konması amaçlanmıştır. Hatay Mustafa Kemal Üniversitesi Tıp Fakültesi Parazitoloji Laboratuvarına farklı polikliniklerden gelen KL şüphesi ile başvurmuş ve mikroskop incelemesi sonucunda endemik bölgelerden geldikleri kaydedilmiş (Hassa, Altınözü, Yayladağı gibi), klinik olarak kronik KL açısından değerlendirilmesi rapor edilmiş Türk hastaya ait dermal kazıntı preparatları (n= 50) çalışmaya dahil edilmiştir. Örneklerden DNA izolasyonu yapılarak tüm Leishmania türlerine özgü kinetoplastit DNA (kDNA) bölgesini hedefleyen 13A, 13B primerleri kullanılmıştır. PCR ile pozitif bulunan örnekler internal transcribed spacer (ITS-1) bölgesini hedefleyen LITSR ve L5.8S primerleri kullanılarak “polymerase chain reaction-restriction fragment length polymorphism (PCR-RFLP)” yöntemi ile tür tayini yapılmıştır. Toplam 50 adet dermal kazıntı örneğinden 17 (%34)’si kDNA bölgesini hedefleyen 13A, 13B primerleri ile pozitif olarak bulunmuştur. Pozitif bulunan örnekler ITS-1 bölgesini hedefleyen LITSR ve L5.8S primerleri ile de pozitif olarak saptanmıştır. ITS-1 gen bölgesiyle yapılan PCR sonucunda elde edilen ürünler BsuRI (HaeIII) enzimi kullanılarak kesilmiştir. PCR-RFLP analizi sonucunda 17 örneğin 11’i Leishmania tropica, biri Leishmania major ve beşi Leishmania infantum/donovani olarak tanımlanmıştır.
Kronik KL; sarkoidoz, tüberküloz, malign tümörler gibi deri hastalıklarıyla karışabilmektedir. Özellikle,
kronik KL olguları doğru tanı konulamaması, mikroskop deneyiminin yeterli olmaması, parazit sayısının
az olması nedeniyle görülememesi gibi pek çok sebepten gözden kaçabilmektedir. Bu nedenle kronik KL
şüphesi olan ancak mikroskop inceleme yöntemi ile parazit saptanamayan örneklerde moleküler yöntem
olan PCR’nin kullanılmasının gerektiği sonucuna varılmıştırLeishmaniasis is a parasitic disease that is transmitted to humans by the bites of infected female phlebotomine sandflies. In the diagnosis of cutaneous leishmaniasis (CL), in the smear samples, the demonstration of the parasite by microscope remains a gold standard method. However, it becomes difficult to
diagnose the parasite since the number of amastigotes in chronic cases with a lesion of one year or longer is very low. Due to many factor such as patients primarily do not to take any notice these lesions in their bodies, do not apply to health institutions or late applied, receive wrong treatment; the diagnosis and
treatment are delayed. In addition, it is been worse prognosis by add secondary infection to lesions and
wounds become chronic. For this reason, molecular methods are used in addition to microscopic examination in chronic suspected CL cases. It was aimed to reveal of the molecular diagnostic value in chronic suspected CL cases by polymerase chain reaction (PCR) in the smear belonging to Turkish patients that reported to be evaluated clinically because it can not be seen Leishmania amastigotes in microscopic examination. Smear of 50 Turkish patients who were clinically reported of the evaluation of chronic CL were selected. These samples were smears belonging to suspected CL patients that applied Hatay Mustafa Kemal University, Faculty of Medicine, Parasitology laboratory from different polyclinics and were decided to be evaluated clinically as a result of microscopic examination because they came from endemic regions (such as Hassa, Altınözü, Yayladağı). DNA was isolated from selected samples and PCR was performed using 13A, 13B primers targeting the kinetoplastid DNA (kDNA) region. The samples found positive by PCR were typed by polymerase chain reaction-restriction fragment length polymorphism
(PCR-RFLP) analysis using LITSR and L5.8S primers targeting internal transcribed spacer (ITS-1) region. Of the 50 smear samples, 17 (34%) were determined positive with 13A, 13B primers targeting the kinetoplastid DNA (kDNA) region. Positive samples were also found to be positive with LITSR and L5.8S primers targeting ITS-1 region. The PCR products obtained from PCR with ITS-1 gene region were digested with the restriction endonucleases BsuRI (HaeIII). As a result of PCR-RFLP analysis, it was determined that 11 of Leishmania tropica, one of Leishmania major and five of Leishmania infantum/donovani out of 17 samples. Chronic CL can be confused with skin diseases such as sarcoidosis, tuberculosis, malignant tumors. In particular, chronic CL cases can be escaped the attention for many reasons such as failure to diagnose correctly, insufficient microscope experience, fail to see due to low number of parasites. For this reason, it was concluded that PCR, which is a molecular method, should be used in chronic suspected CL samples which are negative for the parasite by microscopic examination