Complex Issues of Cardiovascular Diseases (E-Journal) / Комплексные проблемы сердечно-сосудистых заболеваний
Not a member yet
    784 research outputs found

    Механическая тромбэктомия при остром ишемическом инсульте: опыт одного центра

    Get PDF
    Aim. Mechanical thrombectomy is standard of care for the treatment of acute ischemic stroke. The objective of this study is to analyze the results of our own experience of endovascular treatment in Federal State Budgetary Institution “Research Institute for Complex Issues of Cardiovascular Diseases” Kemerovo.Methods. 12 patients with AIS and underwent mechanical thrombectomy with «Trevo» stent-retriever were included in this analysis. Primary outcomes included 90-day modified Rankin scale (mRS) score, first pass effect (FPE) and recanalization rate (TICI score), the combined incidence of postintervention hemorrhages and mortality at 90 days.Results. Among 12 patients (66.7% male, age 59.5 [57.5; 66.5] years) hypertension were in 100%, 61.5% had an ischemic heart disease, 53.8% was current smoking and atrial fibrillation. Median of the NIHSS scale was 13 points, mRS≥4 was in 75% of patients. In 33.3% was a tandem lesion (internal carotid artery terminus and middle cerebral artery) and 25% required stenting of the carotid artery. Good clinical outcomes (mRS≤2 at 90 days) were achieved in 77.8% (7/9) among surviving patients. The 90-day NIHSS score – 4 [1; 5]. The first pass effect and recanalization rate (TICI Scores 2b-3/3) was achieved in 50% and 91.7% of patients. The combined incidence of postintervention hemorrhages and mortality at 90 days was 33.3% and 25% respectively.Conclusion. Despite the small sample size, stent retriever mechanical thrombectomy in AIS provides satisfactory clinical results.Цель. Проанализировать результаты собственного опыта эндоваскулярного лечения острого ишемического инсульта (ОИИ) в контексте современных литературных данных.Материалы и методы. B анализ вошли 12 пациентов с ОИИ, пролеченных на базе Федеральное государственное бюджетное научное учреждение «Научно-исследовательский институт комплексных проблем сердечно-сосудистых заболеваний» г. Кемерово. Всем пациентам выполнена механическая тромбэктомия стент-ретривером «Trevo». Показатели и конечные точки: (1) Хороший клинический результат по шкале Ренкина (mRS≤2), (2) уровень достижения эффекта первого прохождения, (3) уровень достижения кровотока 2b-3/3 по шкале TICI, (4) частота осложнений и (5) летальность через 90 дней.Результаты. Большинство были мужского пола (66,7%), и в возрасте 59,5 лет [57,5; 66,5]. У всех установлен диагноз гипертоническая болезнь, 8 (61,5%) имели в анамнезе ишемической болезни сердца, в 7 (53,8%) случаях отмечен факт курения, нарушения ритма и проводимости. Тяжесть по шкале NIHSS составила – 13 баллов, инвалидизация по шкале Ренкина 4–5 степени – 75%. В 33,3% случаях выявлено тандемное поражение артерии каротидного бассейна и 25% потребовало стентирование сонной артерии. Клинический хороший результат (mRS≤2) через 90 дней достигнут в 77,8% (7/9) среди выживших пациентов. Тяжесть по шкале NIHSS – 4 [1; 5]. Эффект первого прохождения в выборке достигнут у 50% пациентов. Уровень достижения кровотока mTICI 2b-3/3 составил 91,7%. 90 дневная летальность – 25%.Заключение. Механическая тромбэктомия с использованием стент-ретривера демонстрирует убедительные клинические результаты в небольшой когорте пациентов с ОИИ

    Влияние биоцидных растворов и влажного хранения тканей на биологические свойства стенки аорты у свиней

    Get PDF
    Aim.To evaluate the effects of long-term wet treatment of porcine aortic wall fragments with biocidal solutions (glutaraldehyde, antibiotics, alcohol-glycerin mixture, complex alcohol solution (CAS)) on the severity of degradation of samples’ connective matrix and their long-term ability to accumulate calcium during subcutaneous implantation in laboratory rats (1 and 3 months).Methods.Histological analysis of freshly collected material was performed after 50 days of treatment with various biocidal solutions and after subcutaneous implantation of samples in small laboratory animals at 1 and 3 months. Calcium was measured with the atomic absorption spectroscopy after 3 months of subcutaneous implantation.Results.Histological analysis reported that connective matrix of samples treated with glutaraldehyde, antibiotics, and CAS was similar to the native one (with the exception of partial loss of cellular components in samples). After 1 month of implantation, a moderate degradation of connective tissue was found. The treatment with the alcohol-glycerin mixture was associated with the most severe degradation. After 3 months of implantation, glutaraldehyde-treated samples had the most preserved connective matrix, while alcohol-glycerin-treated samples demonstrated severe connective matrix injury. However, severe calcific deposits were found in samples treated with glutaraldehyde, whereas mild ones were detected in samples treated with alcohol-glycerin. Atomic absorption spectroscopy reported that calcific deposits in Cas- and alcohol-glycerin-treated samples were 2.3 and 1.8 times lower than those in glutaraldehyde-treated samples. The calcium content in samples treated with antibiotics did not differ significantly from those in glutaraldehyde-treated samplesConclusion.The comprehensive analysis of the effects of various treatment media on the stability of connective matrix to subsequent degradation and its ability to accumulate calcium found that CAS was the most preferred medium for long-term wet treatment of xenoprosthetic vascular tissue.Цель.Оценить влияние длительного влажного хранения фрагментов стенок аорт свиньи в биоцидных растворах (глутаральдегиде, коктейле антибиотиков, смеси спирта-глицерина, комплексном спиртовом растворе) на выраженность деградации соединительнотканного каркаса образцов и его способность аккумулировать соли кальция при подкожной имплантации мелким лабораторным животным в динамике (1 и 3 мес.).Материалы и методы.Проведен гистологический анализ свежезабранного материала по истечении 50 сут. хранения в различных биоцидных растворах и после подкожной имплантации образцов крысам WAG на 1 и 3 мес. Количественное определение содержания кальция выполнено методом атомно-абсорбционной спектроскопии после 3 мес. подкожной имплантации экспериментальной ткани.Результаты.По данным гистологического анализа образцов после хранения в экспериментальных средах выявлено, что в группах глутаральдегида, антибиотиков и комплексного спиртового раствора состояние соединительнотканного каркаса наиболее близко к норме (за исключением некоторой утраты клеточности в образцах). После месяца имплантации отмечалось прогрессирование деградации соединительной ткани, максимально выраженное в группе спирта-глицерина. После 3 мес. имплантации наиболее внешне сохранным соединительнотканный каркас выглядел в образцах группы глутаральдегида, в то время как материал группы спирта-глицерина имел самые выраженные нарушения. Однако именно в группе глутаральдегида кальцификация стромы препарата визуально была максимальной, в группе спирта-глицерина – минимальной. Методом атомно-абсорбционной спектроскопии установлено, что содержание кальция в группах комплексного спиртового раствора и спирта-глицерина статистически значимо ниже, чем в группе глутаральдегида. Содержание кальция в группе антибиотиков не имело статистически значимых отличий от группы глутаральдегида.Заключение.На основании данных комплексной оценки влияния различных сред хранения на устойчивость соединительнотканного каркаса к последующей деградации и его способности накапливать кальций можно сделать вывод, что предпочтительной средой для длительного влажного хранения ксенопротезной сосудистой ткани является комплексный спиртовой раствор

    Исторические аспекты и современное состояние проблемы лечения сочетанного атеросклеротического поражения коронарных и сонных артерий

    Get PDF
    In this study the primary focus will be on the problem of choosing the treatment tactic in patients with multifocal atherosclerosis. Nowadays, optimal timing of surgical interventions in these patients is controversial. In clinical practice it is usually determined by the severity of the combined coronary and carotid artery disease and the symptoms in patients. There are two main strategies: a staged approach, in which the most affected arteries are primarily revascularized, and a synchronous approach, in which carotid endarterectomy (CEA) and coronary revascularization are performed simultaneously. The presence of severe carotid artery disease is an important incremental risk factor for myocardial infraction after coronary artery bypass grafting (CABG) and needs either concomitant or staged surgical correction. In the absence of randomized controlled trials, guidelines regarding the management of these patients are based on data from single-center retrospective studies. The article indicates historical aspects and current research on multifocal atherosclerosis, as well as clinical guidelines for the management of these patientsВ работе сделан акцент на проблеме выбора тактики лечения пациентов с мультифокальным атеросклерозом. Сложность состоит в том, что на сегодняшний день объем и этапность хирургических вмешательств у данных пациентов являются спорными. В клинической практике тактику лечения определяют степень поражения коронарных и сонных артерий, а также симптоматика пациентов. Существуют две крупные стратегии лечения: этапный подход, при котором в первую очередь вмешательство происходит в наиболее пораженном бассейне, и синхронный, при котором каротидную эндартерэктомию и аортокоронарное шунтирование выполняют одномоментно во время одного наркоза. Пациенты с ишемической болезнью сердца, которым проводят каротидную эндартерэктомию, имеют высокий риск периоперационного инфаркта миокарда. В то же время атеросклероз сонных артерий увеличивает риск инсульта во время аортокоронарного шунтирования. При этом до сих пор отсутствуют крупные рандомизированные исследования, посвященные данной проблеме. В обзоре проанализированы исторические аспекты и современные исследования, посвященные мультифокальному атеросклерозу, а также клинические рекомендации по ведению данной когорты пациентов

    Коронавирусная инфекция - актуальная проблема XXI века

    Get PDF
    A series of unexplained cases with pneumonia have been reported in China since December 2019. Subsequent studies have found a novel strain of coronavirus, SARS-CoV-2, as the causative agent of acute infectious disease that has been named as coronavirus disease 2019 (COVID-19). COVID-19 has outbroken as a global pandemic affecting over 200 countries. This review focuses on a novel coronovirus disease, reporting all available data on its etiology, epidemiology, pathogenesis, clinical manifestations, principles of diagnosis and treatment. In addition, the impact of COVID on the cardiovascular system is highlighted.В декабре 2019 г. в Китае зарегистрирована серия необъяснимых случаев пневмонии. Последующие исследования выявили новый штамм коронавируса - SARS-CoV-2, который является возбудителем острого инфекционного заболевания Coronavirus disease 2019 (COVID-19). За короткий период времени эпидемия новой коронавирусной инфекции переросла в пандемию, охватившую более 200 стран мира. Представленный обзор включает актуальные данные по этиологии, эпидемиологии, патогенезу, клиническим проявлениям, принципам диагностики и лечения коронавирусной инфекции нового типа, а также отражает представления о влиянии COVID-19 на сердечно-сосудистую систему

    Микрореологические свойства крови и капиллярный кровоток при артериальной гипертензии и сахарном диабете второго типа: исследование оптическими методами in vitro и in vivo

    Get PDF
    Aim. To study microrheological properties of RBCs and capillary blood flow parameters using optical methods in patients with arterial hypertension (AH) and type 2 diabetes mellitus (DM2).Methods. RBCs aggregation properties were evaluated in vitro using laser aggregometry and optical trapping. Сapillary nail refill was evaluated in vivo using nailfold digital capillaroscopy.Results. The aggregation of RBCs in patients suffering from AH was higher compared to healthy subjects who demonstrated a decrease in the aggregation time by 29±9%. A similar trend was observed in patients with AH and DM2. The comparison of the results obtained by different methods showed that patients with AH with a high capillary blood flow velocity measured in vivo reported a decrease in the aggregation index by 14±4% compared to patients with low velocity.Conclusion. The comparison of microrheological blood properties in patients with AH and AH+DM2 versus the control group showed statistically significant differences in the aggregation index that was higher in AH patients. These differences were more pronounced in patients with AH and DM2. The results obtained by in vitro and in vivo methods were consistent.Цель. Анализ агрегационных свойств эритроцитов и параметров капиллярного кровотока, измеренных различными оптическими методами, у пациентов с артериальной гипертензией (АГ) и сахарным диабетом второго типа (СД2).Материалы и методы. Измерения агрегационных свойств проводились invitro методами лазерной агре-гометрии и оптического захвата. Анализ кровотока в капиллярах ногтевого ложа испытуемых выполнен in vivo с использованием цифровой капилляроскопии.Результаты. Агрегация эритроцитов у пациентов с АГ повышена по сравнению со здоровыми испытуемыми: характерное время агрегации уменьшено на 29±9%. Эта же тенденция к усилению агрегации видна в группе пациентов с АГ и СД2. Сопоставление результатов, полученных с использованием различных методов измерения, показало, что в группе пациентов с АГ с повышенной скоростью кровотока, измеренной in vivo, индекс агрегации, измеренный invitro, снижен на 14±4% по сравнению с группой с пониженной скоростью.Заключение. Сравнение значений микрореологических параметров крови, характерных для групп пациентов с АГ, в том числе при наличии СД2, и здоровых доноров, показывает статистически значимые отличия: у пациентов с АГ агрегация эритроцитов повышена. Эти отличия выражены сильнее у пациентов с АГ и СД2. Кроме того, результаты, полученные различными оптическими методами in vitro и in vivo, согласуются между собой

    Кардиореабилитация при синдроме старческой астении

    Get PDF
    To date, the rate of cardiac surgeries among elderly patients with significant comorbidities is gradually increasing, thereby proving the need for developing differentiated approaches to the management ofthese patients to optimize the course of the postoperative period. The healthcare systems in the Russian Federation and abroad have focused their efforts to improve the quality and duration of life for the elderly and advanced age patients. Therefore, the diagnosis and prevention of geriatric syndromes, including frailty, is taking on new significance. Recent evidence of the prognostically unfavorable potential of frailty in patients with cardiovascular diseases has emerged the need for precise approaches to the management of this group of patients. Thus, cardiac rehabilitation seems to be one of the effective measures. However, its use is currently limited due to the absence of safe and effective approaches for the elderly and advanced age patients with frailty. The review reports the key results of using cardiac rehabilitation in frail patients who have undergone cardiac surgery. Current limitations are highlighted.В современных условиях кардиохирургические вмешательства все чаще выполняют пациентам пожилого возраста со значимой коморбидной патологией, что определяет необходимость разработки дифференцированных подходов к ведению данной категории больных с целью оптимизации течения послеоперационного периода. Усилия, направленные системами здравоохранения в России и за рубежом, на повышение продолжительности и качества жизни, акцентируют внимание на проблеме пациентов пожилого и старческого возраста. В этой связи значимость приобретают диагностика и профилактика гериатрических синдромов, в том числе синдрома старческой астении (ССА). Представленные доказательства прогностически неблагоприятного потенциала ССА у лиц с сердечно-сосудистыми заболеваниями актуализируют необходимость создания методов ведению данной категории пациентов. Таким образом, кардиореабилитация представляется как одна из эффективных мер, однако на сегодняшний день не разработаны безопасные и эффективные подходы для больных пожилого и старческого возраста с признаками «хрупкости». В обзоре представлены основные результаты использования программ кардиореабилитации у пациентов, в том числе после кардиохирургических вмешательств, при наличии ССА. Обозначены нерешенные проблемы реабилитации данной группы пациентов

    Нейрофизиологический статус пациентов с неклапанной фибрилляцией предсердий

    Get PDF
    Aim. To evaluate the neuropsychological parameters from the main cognitive domains (neurodynamic functions, attention and short-term memory) and the brain electrical activity in patients with non-valve atrial fibrillation (AF).Methods. 21 patients with the mean age of 61 [56; 67] years with non-valve AF who were admitted to the Department of Interventional Diagnosis and Treatment at the Research Institute for Complex Issues of Cardiovascular Disease were included in the study. The control group consisted of 17 healthy individuals with the mean age of 55 [49; 62] years. All patients underwent neuropsychological screening and computerized testing of neurodynamic functions, attention and short-term memory along with electroencephalographic studies. Statistical analysis was performed using the STATISTICA 10.0 software package.Results. Mild cognitive impairment was observed in 43% of patients with non-valve AF accompanied by ischemic brain matter changes according to the findings of magnetic resonance imaging. Patients with AF had slower complex sensorimotor reaction, more errors, worse directed attention, memorization of words and meaningless syllables in comparison with healthy individuals. In addition, patients with AF and healthy subjects had differences in the fronto-occipital gradient of theta-2 rhythm. The worst neurodynamic parameters were associated with a greater power of theta rhythms predominantly in the posterior parts of the brain only in patients with AF.Conclusion. Patients with non-valve AF had cognitive deficit with impaired executive control, attention and short-term memory as well as the slowing of cortical electrical activity in comparison to healthy individuals. The data obtained in our study are beneficial for developing an individual approach to prevent the development and progression of cognitive impairment in patients with AF.Цель. Исследование имело целью изучение нейропсихологических показателей, отражающих деятельность основных когнитивных доменов (нейродинамических функций, внимания и кратковременной памяти) и показателей электрической активности коры у пациентов с неклапанной фибрилляцией предсердий (ФП).Материалы и методы. В исследование был включен 21 пациент с неклапанной ФП, госпитализированный в отделение рентгенхирургических методов диагностики и лечения НИИ КПССЗ, средний возраст составил – 61 [56; 67] года. Группу контроля составили 17 относительно здоровых лиц, средний возраст 55 [49; 62] лет. Всем пациентам проводился нейропсихологический скрининг и компьютеризированное тестирование нейродинамических функций, внимания и кратковременной памяти, электроэнцефалографическое исследование. Все виды статистического анализа были выполнены с помощью программного пакета STATISTICA 10.0.Результаты. Синдром умеренных когнитивных расстройств, сопровождавшийся признаками дисциркуляторных изменений вещества головного мозга, по данным магнитно-резонансной томографии, наблюдался у 83% пациентов с неклапанной ФП. Обнаружено, что пациенты с ФП имеют более низкую скорость сложных сенсомоторных реакций, большее количество ошибок, худшие показатели направленного внимания, запоминания слов и бессмысленных слогов по сравнению со здоровыми. Кроме того, установлено, что между пациентами с ФП и здоровыми имеются различия в выраженности фронто-окципитального градиента тета-2-ритма и только у пациентов с ФП худшие показатели нейродинамических тестов были ассоциированы с большей мощностью тета-ритмов преимущественно в задних регионах коры.Заключение. Пациенты с неклапанной ФП в сравнении с относительно здоровыми лицами имеют когнитивный дефицит по показателям исполнительного контроля, внимания и кратковременной памяти, ассоциированный с «замедлением» корковой электрической активности. Полученные в нашем исследовании данные могут быть полезны в разработке целенаправленного подхода к профилактике развития и прогрессирования когнитивных нарушений у пациентов с ФП

    Отдаленные исходы реваскуляризации миокарда и мозга при помощи чрескожных коронарных вмешательств и каротидной эндартерэктомии в гибридном и поэтапном режимах

    Get PDF
    Aim To evaluate in-hospital and long-term outcomes of myocardial and cerebral revascularization with combined or staged PCI and carotid endarterectomy.Methods.263 myocardial and cerebral revascularizations with PCI and CEA in patients with combined cerebral and coronary artery lesions in the period from 2011 to 2017 were performed. Patients were divided into two groups depending on the surgical strategy. Patient (n = 133) who underwent a staged intervention (CEA and PCI) were included in Group 1, whereas patients (n = 130) who underwent a hybrid intervention (CEE+PCI CA) were included in Group 2. The mean follow-up was 3.5 years.Results.100% of patients in Group 2 underwent coronary and internal carotid revascularization according to the results of in-hospital and long-term follow-up. 81.35% of patient in Group 1 underwent PCI and CEA, whereas 3.01% of patients underwent only PCI and 6.77% of patients – CEA. 1.5% of patients in Group 1 did not receive any surgical treatment. The most common causes of incomplete revascularization were the subsequent change of the initially defined treatment for myocardial (6.02%) or cerebral revascularization (0.75%). The rest refused the second stage, or it was associated with extremely high risk and the strategy was switched to the conservative therapy.Conclusion.100% of patients received hybrid myocardial and cerebral revascularization during one hospitalization. It allowed reducing mortality from MI and stroke during the waiting period for the next stage of the treatment in Group 1 (almost 5%). Hybrid interventions can be used in patients with high risk for open-heart surgery, severe comorbidities (obesity, diabetes, renal dysfunction), significant coronary and cerebral artery lesions with high risk of MI and stroke. However, hybrid approach was associated with high rate (almost 7%) of non-fatal MI in the long-term follow-up.Цель.Оценка госпитальных и отдаленных исходов реваскуляризации головного мозга и миокарда при помощи чрескожного коронарного вмешательства (ЧКВ) и каротидной эндартерэктомии (КЭЭ) в поэтапном и гибридном режимах.Материалы и методы.С 2011 по 2017 г. выполнено 263 реваскуляризации миокарда и головного мозга с использованием ЧКВ и КЭЭ у пациентов с мультифокальным атеросклерозом с сочетанным поражением церебральных и коронарных артерий. В зависимости от выбранных стратегий лечения пациенты были разделены на две группы: 1-я группа (n = 133) – поэтапные вмешательства (КЭЭ и ЧКВ); 2-я группа (n = 130) – гибридные вмешательства (КЭЭ + ЧКВ). Средний период наблюдения составил 3,5 года.Результаты.В группе гибридных операций реваскуляризация двух сосудистых бассейнов (коронарных и внутренних сонных артерий) выполнена в 100% случаев. В группе поэтапной тактики полный объем запланированной реваскуляризации получили лишь 81,35% пациентов, тогда как в 3,01% случаев выполнено только ЧКВ, в 6,77% случаев – только КЭЭ, а в 1,5% – не выполнен ни один этап реваскуляризации. Самыми распространенными причинами неполной реваскуляризации явились изменение тактики реваскуляризации миокарда (6,02%) или головного мозга (0,75%), в оставшихся случаях пациенты не являлись на второй этап лечения по субъективным причинам или его выполнение было сопряжено с крайне высоким риском, в связи с чем тактика была пересмотрена в пользу консервативной терапии.Заключение.Гибридные вмешательства продемонстрировали 100% доступность реваскуляризации миокарда и головного мозга в течение одной госпитализации, что значительно сокращало летальность пациентов от инфаркта миокарда и острого нарушения мозгового кровообращения в период ожидания следующего этапа лечения при поэтапной стратегии (почти на 5%). Гибридные вмешательства могут применяться у пациентов с высоким риском «открытых» операций на сердце, тяжелой сопутствующей патологией (ожирением, сахарным диабетом, нарушением функции почек), значимым поражением коронарных и церебральный артерий с высоким риском инфаркта миокарда и острого нарушения мозгового кровообращения. Недостатком гибридной стратегии явилась более высокая частота (почти на 7%) нефатального инфаркта миокарда в отдаленном периоде наблюдения

    Метод организации образовательного процесса по программе специалитета «кардиология и сердечно-сосудистая хирургия» в условиях карантина

    Get PDF
    Distant-learning methods combined with the generally accepted methods of e-learning increase the involvement of medical students in the educational process.Aim. To describe interactive learning as a core component of distance education.Methods. We selected free educational tools and online services to support our distance learning.Results. The third-year students successfully completed the course using the selected methods. 81.9% of respondents preferred the uploaded educational material in the VKontakte social network. 75% of the respondents liked the interactive intermediate tests. 62.5% of respondents were satisfied with the resource book uploaded for them.Conclusion. The proposed tools support the use of the electronic educational environment and increase students’ involvement in the learning process.Описанный формат дистанционного образования студентов медицинского университета эффективно дополняет общепринятые методы электронного обучения и увеличивает вовлеченность обучающихся в образовательный процесс.Цель. Представить метод коммуникации в условиях дистанционного обучения студентов, оценить преимущества и недостатки подхода.Материалы и методы. Педагогические инструменты и онлайн-сервисы, использование которых не требует дополнительных финансовых затрат.Результаты. Обучение с применением предложенных методов успешно прошли студенты 3-го курса лечебного факультета. Размещение материала в группе во «ВКонтакте» сочли удобным 81,9% обучающихся, промежуточный контроль посредством тестирования – 75%, методическое пособие стало полезным инструментом систематизации теоретических знаний для 62,5% студентов.Заключение. Предложенный алгоритм дополняет электронную информационную образовательную среду, а также повышает вовлеченность в процесс обучения.

    Параметры праймеров, коррелирующие с коэффициентом детерминации и эффективностью количественной полимеразной цепной реакции

    Get PDF
    We performed a correlation analysis between primer parameters and qPCR efficiency/coefficient of determination in two independent samples from in vitro functional experiments.Primer parameters do not define qPCR efficiency and coefficient of determination significantly if primers are designed according to the optimised PRIMER-BLAST settings.Aim. To find the correlation between the primer parameters, efficiency, and coefficient of determination (R2 ) in quantitative polymerase chain reaction (qPCR) conditions.Methods. Upon RNA isolation from primary human coronary artery endothelial cells, we performed reverse transcription-qPCR (RT-qPCR) utilising SYBR Green chemistry to measure the expression of the following genes: IL1B, IL6, CXCL8, IL12A, IL23A, PECAM1, VWF, KDR, FAPA, ACTA2, SMTN, VIM, COL4A1, MMP2, SNAI2, TWIST1, ZEB1, SCARF1, CD36, LDLR, VLDLR, VCAM1, ICAM1, SELE, SELP, CDH5, IL1R1, IL1R2, TNFRSF1A, TNFRSF1B, NOS3, PXDN. Primers were designed employing Primer-BLAST software using optimised settings. For the correlation analysis, Spearman's rank correlation coefficient was applied (GraphPad Prism).Results. Coefficient of determination correlated with the primer pair rating by Beacon Designer, amplicon melting temperature, and GC content in the reverse primer. Reaction efficiency did not correlate with the Beacon Designer rating, yet being associated with length and GC content of the reverse primer. Abovementioned correlation coefficients ranged from 0.4 to 0.5 or from -0.4 to -0.5 indicative of moderate positive or negative correlation. Other parameters did not affect reaction efficiency and coefficient of determination. Conclusion Primer parameters do not define qPCR efficiency and coefficient of determination significantly if primers are designed according to the optimised PRIMER-BLAST settings. Проведен корреляционный анализ параметров праймеров и эффективности и коэффициента детерминации кПЦР на двух независимых массивах экспериментальных данных.При соблюдении основных правил разработки праймеров их параметры не влияют на эффективность и коэффициент детерминации кПЦР.Цель. Выявить, существует ли корреляция между параметрами праймеров, эффективностью и коэффициентом детерминации количественной полимеразной цепной реакции (кПЦР).Материалы и методы. Выделение РНК производили из первичных эндотелиальных клеток коронарной артерии с последующим синтезом одноцепочечной комплементарной ДНК при помощи обратной транскрипции. Методом кПЦР с детекцией результата в режиме реального времени (флуоресцентный краситель SYBR Green I) определяли экспрессию следующих генов: IL1B, IL6, CXCL8, IL12A, IL23A, PECAM1, VWF, KDR, FAPA, ACTA2, SMTN, VIM, COL4A1, MMP2, SNAI2, TWIST1, ZEB1, SCARF1, CD36, LDLR, VLDLR, VCAM1, ICAM1, SELE, SELP, CDH5, IL1R1, IL1R2, TNFRSF1A, TNFRSF1B, NOS3, PXDN. Праймеры разработаны в программе Primer-BLAST. Корреляционный анализ по Спирмену выполнен в программе GraphPad Prism.Результаты. Коэффициент детерминации коррелировал с количественной оценкой качества праймеров, разработанных в программе Beacon Designer, температурой плавления ампликона и содержанием гуанина – цитозина в обратном праймере. Эффективность кПЦР, напротив, не коррелировала с количественной оценкой качества созданных в Beacon Designer праймеров, но коррелировала с длиной, а также процентным содержанием GC в обратных праймерах. Все указанные коэффициенты корреляции находились в диапазоне от 0,4 до 0,5 либо от -0,4 до -0,5, отражая корреляционную связь средней силы. В то же время остальные параметры (как для пар, так и отдельно прямого и обратного праймеров) не влияли на эффективность и коэффициент детерминации кПЦР.Заключение При соблюдении основных правил разработки праймеров их параметры не влияют на эффективность и коэффициент детерминации кПЦР.

    721

    full texts

    784

    metadata records
    Updated in last 30 days.
    Complex Issues of Cardiovascular Diseases (E-Journal) / Комплексные проблемы сердечно-сосудистых заболеваний
    Access Repository Dashboard
    Do you manage Open Research Online? Become a CORE Member to access insider analytics, issue reports and manage access to outputs from your repository in the CORE Repository Dashboard! 👇