Universidad Industrial de Santander: Revistas Institucionales UIS
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Academy, data and science reproducibility
Get PDFThe COVID-19 pandemic has catalyzed several academic practices, and when it ends, the geography and especially the dynamics of research groups will be completely different. We will have other practices, and, in many cases, we will be more effective. Perhaps the most indelible feature of that change will be the day-to-day incorporation of open, repeatable, and replicable science practices. The qualitative change from research to “e-research” describes a new way to produce and disseminate knowledge. It also imposes new methodologies to manage, administer, analyze and preserve this “data deluge”. The repeatability and reproducibility of scientific results in data-centred science become a growing and significant issue. Undoubtedly, academic publications should be transformed, demanding open access to data and direct availability to computer codes and applications that support the results. In this editorial, we comment and reflect on some of the methodologies and tools available to promote the repeatability/reproducibility of experiments.La pandemia de COVID-19 ha catalizado una serie de prácticas académicas y cuando la superemos, la geografía y, sobre todo la dinámica de los grupos de investigación será otra. Quizá seremos más eficaces, pero el rasgo que será más indeleble de ese cambio lo constituirá la incorporación cotidiana de prácticas de ciencia abierta, repetible y reproducible. El cambio cualitativo de la investigación a la “e-investigación”, describe nuevas formas de producción y diseminación del conocimiento e impone nuevas metodologías para manejar, administrar, analizar y preservar este “diluvio de datos”. La repetibilidad y la reproducibilidad de los resultados científicos en la ciencia centrada en datos ha sido detectado como un un problema creciente. Las publicaciones académicas están llamadas a transformarse, exigiendo acceso a los datos y aplicaciones computacionales que soportan los resultados. En esta nota editorial comentamos y reflexionamos sobre algunas de las metodologías y herramientas que se disponen para promover la repetibilidad/reproducibilidad de los experimentos. Discutimos el enfoque metodológico que emerge del Instituto Turing del Reino Unido. Presentamos una evaluación de las herramientas para construir repositorios de datos que existen actualmente
Mathematical modelling for malaria under resistance and population movement
Get PDFIn this work, two mathematical models for malaria under resistance are presented. More precisely, the first model shows the interaction between humans and mosquitoes inside a patch under infection of malaria when the human population is resistant to antimalarial drug and mosquitoes population is resistant to insecticides. For the second model, human–mosquitoes population movements in two patches is analyzed under the same malaria transmission dynamic established in a patch. For a single patch, existence and stability conditions for the equilibrium solutions in terms of the local basic reproductive number are developed. These results reveal the existence of a forward bifurcation and the global stability of disease–free equilibrium. In the case of two patches, a theoretical and numerical framework on sensitivity analysis of parameters is presented. After that, the use of antimalarial drugs and insecticides are incorporated as control strategies and an optimal control problem is formulated. Numerical experiments are carried out in both models to show the feasibility of our theoretical results.En este artículo se presentan dos modelos matemáticos para la enfermedad de la malaria bajo la hipótesis de resistencia. Más precisamente, el primer modelo muestra la interacción entre humanos y mosquitos de una región con presencia de infección, considerando que los humanos son resistentes a la droga antimalárica y los mosquitos resistentes a los insecticidas. En el segundo modelo, se consideran las mismas hipótesis del modelo anterior, y adicionalmente movimiento de ambas poblaciones entre regiones. Para el primer modelo, se establecen condiciones de existencia y estabilidad para las soluciones de equilibrio en términos del número básico de reproducción. Estos resultados revelan la existencia de una bifurcación hacia adelante y la estabilidad global del equilibrio libre de enfermedad (DFE por sus siglas en inglés). Para el segundo modelo, se presenta un enfoque teórico y numérico de análisis de sensibilidad de parámetros. Además, se incorporan el uso de droga antimalárica e insecticidas como estrategias de control, con lo cual se formula un problema de control óptimo. A lo largo de este trabajo, los resultados teóricos se validan mediante simulaciones numéricas usando datos reportados en la literatur
Lecciones del pasado. ¿podemos aprender algo de las epidemias anteriores?
Get PDFDesde el comienzo de la actual pandemia de COVID 19, atribuida a un nuevo agente viral identificado como SARS-CoV-2, la referencia a otras epidemias no se hizo esperar. Ya fuese para resaltar lo novedoso de la actual o, por el contrario, para mostrar las continuidades o reiteraciones en la historia, los sucesos del pasado han estado muy presentes en las reflexiones del ahora. Y no es para menos, dado que la incertidumbre y angustia del presente nos ha puesto en una situación especial, proclive a buscar enseñanzas tanto en los logros como en las equivocaciones del pasado. Desde el comienzo de la actual pandemia de COVID 19, atribuida a un nuevo agente viral identificado como SARS-CoV-2, la referencia a otras epidemias no se hizo esperar. Ya fuese para resaltar lo novedoso de la actual o, por el contrario, para mostrar las continuidades o reiteraciones en la historia, los sucesos del pasado han estado muy presentes en las reflexiones del ahora. Y no es para menos, dado que la incertidumbre y angustia del presente nos ha puesto en una situación especial, proclive a buscar enseñanzas tanto en los logros como en las equivocaciones del pasado. Desde el comienzo de la actual pandemia de COVID 19, atribuida a un nuevo agente viral identificado como SARS-CoV-2, la referencia a otras epidemias no se hizo esperar. Ya fuese para resaltar lo novedoso de la actual o, por el contrario, para mostrar las continuidades o reiteraciones en la historia, los sucesos del pasado han estado muy presentes en las reflexiones del ahora. Y no es para menos, dado que la incertidumbre y angustia del presente nos ha puesto en una situación especial, proclive a buscar enseñanzas tanto en los logros como en las equivocaciones del pasado. 
Porosity prediction from X-ray computed tomography logs (RHOB and PEF) using Artificial Neural Networks (ANN)
Get PDFEste trabajo presenta un método para la predicción de la porosidad de la roca, a partir de los registros de tomografía computarizada de rayos X (CT) obtenidos mediante un enfoque de doble energía, específicamente, densidad aparente (RHOB) y factor fotoeléctrico (PEF). El método propuesto busca correlacionar la porosidad conocida de los Análisis básicos (RCAL) con los registros de alta resolución RHOB y PEF, ya que la respuesta de estas dos mediciones depende de la cantidad volumétrica de diferentes materiales de roca y del volumen de su espacio poroso. Redes Neuronales Artificiales (ANN) son entrenadas para que puedan predecir la porosidad a partir de estos registros CT a una alta resolución (0,625 mm). Los gráficos de validación y regresión de las ANN muestran que las predicciones de porosidad son buenas. Los modelos de porosidad de alta resolución vinculados a imágenes de CT podrían contribuir a mejorar el modelo de petrofísica del pozo, ya que permiten una identificación más refinada de los intervalos de interés debido a su medición detallada.This work presents a method for rock porosity prediction from the X-ray computed tomography (CT) logs obtained using a double energy approach, bulk density (RHOB) and photoelectric factor (PEF). The proposed method seeks to correlate the known porosity from the Routine Core Analysis (RCAL) with RHOB and PEF high-resolution logs, as the response of these two measurements depends on the volumetric quantity of different rock materials and of the volume of its porous space. Artificial Neural Networks (ANNs) are trained so they can predict porosity from CT logs at a high resolution (0.625 mm). The ANNs validation and regression plots show that porosity predictions are good. High-resolution porosity models linked to CT images could contribute to enhancing the petrophysics model as they allow a more refined identification of intervals of interest due to the detailed measurement
Manejo del paciente crítico en coma tóxico
No full textSolo el 20% de las consultas a un servicio de urgencias son verdades urgencias; y dentro de éstas el 20% se deben a intoxicaciones agudas y comas tóxicos. En la verdadera urgencia se debe tener siempre en cuenta el ABC de resucitación por que todo depende de lo que se realice en los primeros quince minutos de haber ocurrido la intoxicación. 
Neurotoxicidad por plaguicidas
No full textEl sistema nercioso central comoo periférico reacciona de manera especial al ser agredido por sustancias tóxicas. Hasta hyace poco tiempo se consideraban dos tipos de neurotixicidad: aguda y crónica. Recientemente se ha aceptado de una forma subaguda, que se caracteriza por cambios fisiológicos en el sistema nercioso. Generalmente no producen una degeneración celular. El daño se debe a una dosis única muy grande, como en el intento suicida o cuando hay una intoxicación accidental. 
Diagnóstico de la situación nutricional en los servicios de medicina interna y cirugía del HURGV
No full textSe estudió un corte longitudinal, un grupo de 91 pacientes con edad promedio de 42 años, que ingresaron al servicio de Medicina Interna y Cirugía del Hospital Universitario Ramón González Valencia, con el objeto de evaluar la situación alimentaria, nutricional y determinar la prevalencia de desnutrición. Para ello se utilizaron técnicas de evaluación nutricional objetivas, subjetivas y encuestas alimentarias. En la evaluación antropométrica se encontró un 73% con depleción de masa grada y el 85% de tejido muscular. Los parámetros bioquímicos en promedio estaban en los valores considerados normales, con excepción de la hemoglobina, donde se encontró que el 65% de los pacientes presentaban déficit. El 27%de los sujetos presentó deterioro en los valores de la albumina. El análisis de la ingesta reveló diferencias significativas entre lo programado y lo entregado al paciente. El aporte de nutrientes de la dieta hospitalaria no satisface las necesidades nutricionales. A partir de esta investigación, se concluye que la prevalencia de desnutrición es alta, entre 60% y 70% , en los servicios de Medicina Interna y cirugía. Los pacientes presentan gran depleción de su masa muscular y niveles muy bajos de hemoglobina. 
Methodology and application of seismic attributes in modeling facies for potentially gas producing areas. Santa Cruz-Jibacoa oilfields area, Cuba
Get PDFHistorically the Cuban exploration strategy has been characterized by discovering productive oil intervals and to use its associated gas by conventional methods. The objective of this study was to create a methodology to detect reservoirs with free gaseous hydrocarbons contain, by seismic attributes. Were chosen two oilfields located in the Cuban Northern Oil Belt; (main Cuban oil region); Santa Cruz del Norte (learning pattern) and Jibacoa oil fields (predictive pattern). Were studied the Vega Alta Formation, a synogenic sequence of Paleocene-Middle Eocene age, with great lithological complexity and considered as a regional seal, but paradoxically, with significant hydrocarbons presence. A microfacial analysis was carried out, with the information of the cuttings, building a ternary model for clastite rocks and another model for carbonated and siliceous rocks. Were studied 1921 m by cuttings samples, predominantly clastic lithofacies. An exploratory data analysis was carried out, which permitted obtaining information about the unknown relationship between lithofacies and seismic attributes. The seismic signatures of lithofacial classification were determined, and with the assistance of data mining methods were adjusted the seismic attributes to differentiate lithofacies. These were discretized in 4130 standard patterns intervals. Probability values were calculated applying a geostatistics sequential simulation algorithm. The inverse task (conversion of seismic attributes to lithofacies) was executed, through a supervised classification, into a 350000 cells matrix (approximately 43750 km3), with the selected seismic attributes and finally, an exploration risk analysis was calculated for estimate the economic strategy.Históricamente, la exploración petrolera en Cuba, se ha apoyado en estudios geoquímicos, petrofísicos y de ingeniería de yacimientos en los pozos para caracterizar los intervalos productores de hidrocarburos y la explotación del gas disuelto. El objetivo de este estudio es detectar en esos reservorios, las acumulaciones comerciales de gases húmedos a partir del uso de los atributos sísmicos con la instrumentación de una metodología de trabajo. Se escogieron dos yacimientos que se encuentran en la Franja Norte Petrolera Cubana; el Santa Cruz del Norte (patrón de aprendizaje) y Jibacoa (patrón predictivo). Como objeto se estudió la Formación Vega Alta, secuencia sinorogénica de edad Paleoceno-Eoceno Medio, con gran complejidad litológica, considerada sello regional, pero paradójicamente, con apreciables manifestaciones de hidrocarburos, principalmente de gas. Se realizó un análisis microfacial, fundamentalmente con la información de los cuttings (1921 m), construyéndose un modelo ternario para las rocas clásticas y otro para las carbonatadas y silíceas, con predominio de las primeras. Para obtener información sobre la relación entre las litofacies y los atributos sísmicos, se efectuó un análisis exploratorio de los datos. Se establecieron las firmas sísmicas para cada litotipo y con la aplicación de métodos de minería de datos, se ajustó la capacidad de esos atributos para diferenciar cada litofacies. Fueron discretizados 4130 intervalos patrones en pozos. Para trabajar dentro de un dominio con gran incertidumbre, se empleó un algoritmo geoestadístico de simulación secuencial de indicadores para calcular las probabilidades. Se ejecutó la conversión de atributo sísmico a litofacies, mediante una clasificación supervisada, en una matriz de 350000 celdas (aproximadamente 43750 km3 en total), con los atributos sísmicos seleccionados como significativo y por último se estableció un cálculo de riesgo-recompensa que pronostica el alcance económico de esta estrategia
Introducción al Geopatrimonio kárstico del municipio de El Peñón (Santander), Colombia
Get PDFKarstic systems constitute one of the most vulnerable environments to climate change and human actions, the tourist activities not suitables in areas with karstic systems (speleotourism) have shown that it can be a danger to their conservation, nevertheless, tourism could also be an effective way of conservation contributing to the sustainable development of rural territories. The youngest municipality in Santander, El Peñón, located on calcareous rocks of the Rosablanca Formation constitutes an extensive and important karstic system that houses a great geological, landscape, archeological and biotic wealth. The karstic development of the region is governed by the tectonic control of the area evidenced in the preferential orientations NW-SE and NE-SW acquired by the exo and endo karst units. The almost pristine state of the great majority of these underground manifestations allows its study for the contribution to the approach of alternatives that see this heritage as a resource with great potential to contribute to the sustainable development of this territory with a recent past of violence.
Advances are made in the inventory of the karstic geological heritage that El Peñón has, and the valuation through the M-GAM methodology of the first 6 identified geosites: Panama canyon, Los Carracos Cavern, Golden Cave, Virgin´s Cave, Karst Town and La Tronera Cavern. The evaluation through this methodology allowed an evaluation of tourism in the region and confirm that these places have a unique wealth with vast opportunities for the development of geotourism and speleotourism. The application of the standardized index of sensitivity of caves also allowed us to have a better understanding of the richness of these ecosystems, indicating the greater control that should exist over human activities that take place in the lower gallery of Los Carracos Cavern and Golden Cave.Los sistemas kársticos constituyen uno de los ambientes más vulnerables al cambio climático y las acciones humanas, así mismo las actividades turísticas mal desarrolladas en áreas con sistemas kársticos (espeleoturismo) han demostrado que pueden ser una amenaza para su conservación, sin embargo, el turismo también podría ser una forma efectiva de conservación aportando a su vez al desarrollo sostenible de los territorios rurales. El municipio más joven de Santander, El Peñón, ubicado sobre rocas calcáreas de la Formación Rosablanca constituye un extenso e importante sistema kárstico que alberga una gran riqueza geológica, paisajística, arqueológica y biótica. El desarrollo kárstico de la región está regido por el control tectónico de la zona evidenciado en las orientaciones preferenciales NW-SE y NE-SW que adquieren las unidades exo y endokársticas. El estado casi prístino de la gran mayoría de estas manifestaciones subterráneas permite su estudio para la contribución al planteamiento de alternativas que vean este patrimonio como un recurso con gran potencial para aportarle al desarrollo sostenible de este territorio.
Se presentan avances en el inventario del patrimonio geológico kárstico con el que cuenta el municipio de El Peñón, y la valoración por medio de la metodología M-GAM de los primeros 6 geotopos identificados: Cañón de Panamá, Caverna Los Carracos, Cueva del Oro, Cueva de La Virgen, Karst Town y Caverna La Tronera. La evaluación por medio de esta metodología permitió conocer la situación actual del turismo en la región y confirmar que estos lugares poseen una riqueza única con vastas oportunidades para el desarrollo del geoturismo y espeleoturismo. La aplicación del índice estandarizado de sensibilidad de cuevas permitió conocer el grado de sensibilidad a las acciones antrópicas de estos ecosistemas, indicando el mayor control que debe existir sobre las actividades que se desarrollen en la galería inferior de la Caverna Los Carracos y la Cueva del Oro