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Identificación de integrinas como blancos farmacológicos para el diseño de terapias contra el cáncer colorrectal
Full text link66 p.El cáncer colorrectal (CRC) es el tercer cáncer más diagnosticado en el mundo,
con probabilidades de supervivencia muy bajas si no es detectado en un estado
temprano. En este contexto es que se buscan alternativas eficientes, y
complementarias a las aproximaciones quirúrgicas y de quimioterapia que ya
existen, para tratar este tipo de patologías. La identificación de proteínas que
inciden en procesos celulares asociados a CRC resulta esencial para definir
blancos farmacológicos que faciliten la unión de formulaciones médicas. Proteínas
pertenecientes a la familia de integrinas, un tipo de estructuras heterodiméricas
compuestas por una subunidad α y una subunidad β, participan en los pasos
fundamentales para la reproducción y supervivencia celular. Variadas isoformas
de estas proteínas están sobreexpresadas en diversos tipos de cáncer.
Específicamente, las isoformas α5β1, αVβ6 y αVβ3 están vinculadas directamente
a cáncer colorrectal. En este contexto, el objetivo general del presente trabajo
consistió en evaluar la unión de estas proteínas a fragmentos peptídicos que en su
secuencia presentan los motivos RGD y NGR, los cuales han mostrado alta
afinidad por integrinas. Para ello, se realizaron estudios bioinformáticos que
permitieron identificar residuos claves en la interacción proteína-péptido mediante
análisis de secuencia y estructura. Inicialmente, se modeló una serie de péptidos
de interés, cuya afinidad con las integrinas fue evaluada a través de estudios de
acoplamiento molecular. Posteriormente, se llevaron a cabo simulaciones de
dinámica molecular y estimaciones de energía libre de unión de los complejos
integrina-péptido mediante el método MM-GBSA (MM, mecánica molecular; GB,
Born generalizado; SA, área de superficie). La finalidad de estos estudios fue
identificar complejos de alta afinidad que puedan servir como blancos farmacológicos para diseñar adyuvantes contra el cáncer colorrectal. // ABSTRACT: Colorectal cancer (CRC) is the third most diagnosed cancer in the world, with very
low suspicion of survival when is not detected at an early stage. In this context,
efficient alternatives are sought, and complementary to the surgical and
chemotherapy approaches that already exist, to treat this type of pathology. The
identification of proteins that affect cellular processes associated with CRC is
essential to define pharmacological targets that facilitate the binding of medical
formulations. Proteins belonging to the family of integrins, a type of heterodimeric
structure composed of an α subunit and a β subunit, participate in the fundamental
steps for cell reproduction and survival. Various isoforms of these proteins are
overexpressed in various types of cancer. Specifically, the α5β1, αVβ6, and αVβ3
isoforms are directly linked to colorectal cancer. In this context, the general
objective of this work was to evaluate the binding of these proteins to peptide
fragments that have the RGD and NGR motifs in their sequence, which have
shown a high affinity for integrins. For this, bioinformatic studies were carried out
that allowed the identification of key residues in the protein-peptide interaction
through sequence and structure analysis. Initially, a series of peptides of interest
were modeled, whose affinity with integrins was evaluated through docking studies.
Subsequently, molecular dynamics simulations and binding free energy estimates
of integrinpeptide complexes were carried out using the MM-GBSA method (MM,
molecular mechanics; GB, generalized Born; SA, surface area). The purpose of these studies was to identify highaffinity complexes that can serve as drug targets
for designing adjuvants against colorectal
Análisis de la productividad parcial del agua de riego en las regiones de Valparaíso, Metropolitana, O'Higgins y Maule
Full text link44 p.Este estudio está enmarcado dentro del proyecto FONDECYT Nº 1180556 que se
denomina “Del individualismo a la acción colectiva para la conservación de los
recursos Hídricos: sus impactos e implicaciones”. Este proyecto tiene como
enfoque evaluar el impacto del uso del agua en la agricultura. La encuesta fue
aplicada a 378 agricultores ubicados en las regiones de Valparaíso, Metropolitana;
O’Higgins y Maule. Se planteó la hipótesis de que la eficiencia del sistema de riego
aumenta la productividad de agua independiente del sistema productivo y su
localización. Los objetivos fijados se resumen en dos, en los cuales primero se
quiere determinar la productividad parcial de agua para la muestra de agricultores
y en segundo lugar analizar la productividad de agua según sistema de riego y
sistema productivo. Para efecto de esta investigación, se hizo un análisis
descriptivo de los datos de manera de caracterizar la muestra de agricultores
según productividad parcial del agua en base a 3 ejes principales: Zona geográfica
(región), Sistema productivo (tipo cultivo) y sistema de riego (tipo de riego) y
posteriormente un análisis estadístico entre sistema productivo y riego dando
como resultado 5 grupos: Frutales por goteo; Frutales por aspersión; Frutales por
gravitacional; Hortalizas por gravitacional y cereales por gravitacional. Para
analizar la normalidad del conjunto de datos se utilizó el Test de Shapiro-Wilk,
mientras que la homogeneidad de varianzas fue analizada según el test de
Levene’s. Como el conjunto de datos no logró cumplir los objetivos se optó por
crear un ranking de datos para luego ser analizados en base a test no
paramétricos de Kruskall-Wallis. Por último, se realizó una comparación de medias
a partir del ranking de los 5 grupos utilizando el método de Tukey. Todo este
análisis se realizó con el programa IBM SPSS 26. Con los resultados obtenidos se
pudo concluir que efectivamente el sistema de riego utilizado afecta de manera considerable la productividad parcial del agua, más aun, sistemas de riego de tipo presurizado ofrecen una utilización más eficiente del recurso hídrico a diferencia de sistemas no presurizados. // ABSTRACT: The study developed and funding by FONDECYT Nº 1180556 project entitled:
"From individualism to collective action for the conservation of water resources: its
impacts and implications". The focus of this project is to evaluate the impact of
water use in agriculture. The survey was applied to 378 farmers located in the
Valparaíso, Metropolitan, O'Higgins and Maule regions. It was hypothesized that
the efficiency of the irrigation system increases wáter productivity regardless of the
production system and its location. The objectives are summarized in two, in which
first we want to determine the partial water productivity for the sample of farmers
and secondly to analyze the water productivity according to irrigation system and
production system. For the purpose of this research, a descriptive analysis of the
data was made in order to characterize the sample of farmers according to partial
wáter productivity based on 3 main axes: geographic area (region), production
system (type of crop) and irrigation system (type of irrigation) and then a statistical
analysis between production system and irrigation resulting in 5 groups: Fruit trees
by drip; Fruit trees by sprinkling; Fruit trees by gravity; Vegetables by gravity and
cereals by gravity. The Shapiro-Wilk test was used to analyze the normality of the
data set, while the homogeneity of variances was analyzed according to the
Levene's test. Since the data failed to meet the objectives, a ranking of the data
was created and then analyzed using the Kruskall-Wallis nonparametric test.
Finally, a comparison of means was made from the ranking of the five groups using
Tukey's method. All this analysis was carried out with the IBM SPSS 26 program.
With the results obtained, it was possible to conclude that the irrigation system
used does indeed have a considerable effect on partial water productivity; moreover, pressurized irrigation systems offer a more efficient use of water resources than non-pressurized systems
Efecto de dos métodos de riego sobre el comportamiento fisiológico y rendimiento en variedades de arroz (Oryza sativa L.) de ciclo corto, intermedio y largo
Full text link54 p.En Chile anualmente se cultivan alrededor de 26 mil hectáreas de arroz, donde el
80-90% de la superficie cultivada se maneja bajo el sistema de riego por
inundación permanente. El uso de este sistema de riego genera un consumo de
agua aproximado de 14.000 a 18.000 m3/ha durante toda la temporada de
desarrollo del cultivo, lo que debido a la mega sequía que está sufriendo la zona
central de Chile es cada vez más difícil de suministrar. En una región tan austral
como la zona arrocera de Chile una lámina de agua permanente en el cultivo de
arroz es de suma importancia, ya que esta actúa como regulador de la
temperatura (buffer térmico) y como controlador de ciertas malezas. Bajo este
contexto se evaluó el efecto de dos sistemas de riego (intermitente e inundado
optimizado) sobre el intercambio gaseoso de las plantas y los componentes del
rendimiento en cuatro variedades de arroz de distinto ciclo de crecimiento, en la
zona de Retiro, Región del Maule, Chile. Los resultados obtenidos indican que
bajo el sistema de riego por intermitencia la mayor Tr fue alcanzada por el Híbrido
1 con 0,0012 mol m⁻² s⁻¹, en cuanto a la An fue Esfera con una media de 27,68
μmol m⁻² s⁻¹ y nuevamente el Híbrido 1 con medias entre 0,86 y 0,66 mol m⁻² s⁻¹
de gs. Por su parte, bajo el sistema de riego por inundación optimizado, los
mayores valores de Tr fue de 0,015 mol m⁻² s⁻¹ alcanzado el mismo día por las
variedades Esfera, Loto y Zafiro, mientras que para la An solo Loto mostró medias
entre 31,92 y 22,88 μmol m⁻² s⁻¹ y finalmente, Esfera fue la variedad que presentó
el mayor valor de gs con una media de 1,32 mol m⁻² s⁻¹. Por otra parte, los
resultados obtenidos de los componentes del rendimiento mostraron que bajo el
sistema de riego por intermitencia la variedad que destacó fue Esfera con un
rendimiento promedio de 9.863 kg/ha, seguida por el Híbrido 1 con 2.126 kg/ha, luego Zafiro con 1.618 kg/ha y por último Loto con 627 kg/ha. Mientras que, bajo el sistema de riego por inundación optimizado, no se observaron diferencias
significativas de rendimiento, sin embargo, si se registraron en el N° Granos
vanos/Panícula y el Peso de 1000 granos, siendo Loto la variedad más destacada.
En conclusión, las variedades de ciclo intermedio (Esfera e Híbrido 1) mostraron la
mejor respuesta al estrés hídrico y/o bajas temperaturas, convirtiéndose en las más adecuadas para ser implementadas bajo un sistema de riego por intermitencia. // ABSTRACT: In Chile, around 26 thousand hectares of rice are cultivated annually, where 80-
90% of the cultivated area is managed under the permanent flood irrigation
system. The use of this irrigation system generates an approximate water
consumption of 14,000 to 18,000 m3/ha during the entire growing season, which
due to the mega drought that is suffering the central zone of Chile is increasingly
difficult to supply. In such a southern region as the rice-growing area of Chile, a
permanent sheet of water in the rice crop is of utmost importance, since it acts as a
temperature regulator (thermal buffer) and as a controller of certain weeds. In this
context, the effect of two irrigation systems (intermittent and optimized flooded) on
plant gas exchange and yield components was evaluated in four rice varieties of
different growth cycles in the Retiro area, Maule Region, Chile. The results
obtained indicate that under the intermittent irrigation system the highest Tr was
reached by Híbrido 1 with 0.0012 mol m-² s-¹, as for An was Esfera with a mean of
27.68 μmol m-² s-¹ and again Híbrido 1 with means between 0.86 and 0.66 mol m-²
s-¹ of gs. On the other hand, under the optimized flood irrigation system, the
highest values of Tr was 0.015 mol m-² s-¹ reached on the same day by the
varieties Esfera, Loto and Zafiro, while for An only Loto showed means between
31.92 and 22.88 μmol m-² s-¹ and finally, Esfera was the variety that presented the
highest value of gs with a mean of 1.32 mol m-² s-¹. On the other hand, the results
obtained from the yield components showed that under the intermittent irrigation
system the variety that stood out was Esfera with an average yield of 9,863 kg/ha,
followed by Híbrido 1 with 2,126 kg/ha, then Zafiro with 1,618 kg/ha and finally Loto
with 627 kg/ha. While, under the optimized flood irrigation system, no significant
yield differences were observed, however, they were recorded in the number of
empty grains/panicle and 1000-grain weight, with Loto being the most outstanding
variety. In conclusion, the intermediate cycle varieties (Esfera and Híbrido 1)
showed the best response to water stress and/or low temperatures, making them the most suitable for implementation under an intermittent irrigation system
Propuesta de sectorización de la red de agua potable de Curicó bajo criterios de ahorro energético y disminución de fugas
Full text link109 p.Hoy a nivel mundial se vive una crisis hídrica, en donde las empresas sanitarias
deben ayudar a disminuir esta, debido a que en las redes de distribución de agua (RDAP) se tienen altos volúmenes de agua fugada, estos pueden ir desde un 30% a más del 60% del volumen total inyectado a la red. Otro problema en las redes es el gasto energético, en donde los grupos de bombeo son los que producen la mayor cantidad de consumo. Para reducir las fugas y aumentar la eficiencia
energética en las RDAP se emplea la sectorización, que consiste en dividir estas
en sectores delimitados por válvulas, consiguiendo controlar las presiones del
sector y su gestión. Debido a lo anterior, el objetivo principal de esta memoria es aplicar metodologías de sectorización a la red de distribución de Curicó para disminuir las fugas y/o ser más eficientes energéticamente. El tipo de investigación es de diseño experimental y la muestra es una parte de la RDAP de la ciudad de Curicó con su patrón de demanda del fin de semana y se define la sectorización de esta en base al criterio de eficiencia energética tanto directa como
indirectamente (a través de estratos de presión). En primer lugar, se determinaron
las tuberías principales con la teoría de grafos y el algoritmo de búsqueda en anchura, con el criterio de que se agregan a la red principal tuberías con diámetro mayor a 250 mm. y estén conectadas desde el embalse, esto se realizó a través de PyCharm (con lenguaje de programación Python) junto con el toolkit de Epanet llamado owa-epanet. Luego, se realiza la sectorización por el método manual de estratificación de presiones, en donde se ven las presiones a través de Epanet 2.2
y se hizo la sectorización en base a los rangos de presión, obteniendo 5 sectores
que conectan a la red principal. Después se realiza el método automático basado en la maximización de la eficiencia energética, para ello se aplica el algoritmo de Dijkstra, encontrando los caminos más cortos (CMC) entre la red principal y el resto de los nodos (el CMC se define con la suma de eficiencias energéticas de las tuberías). A través de los mínimos CMC a los nodos, se logró realizar grupos de nodos y así generar 5 sectores. Por último, con PyCharm, se hizo la programación para calcular el promedio de presiones, caudal de fugas y la eficiencia energética de las redes y sectores. Como resultados se tiene que el promedio de las presiones en la red pasa de 36,60 mca a 24,40 y 23,33 mca en el método manual y automático, respectivamente. Las fugas en la red original
corresponden a un 30% del caudal de demanda y disminuyen a un 18,63% en la sectorización manual y 17,84% en la sectorización automática. Finalmente, la eficiencia energética de la red aumenta un 8,99% para el método manual y 10,6% para el método automático. Por tanto, se considera que la sectorización bajo criterios de eficiencia energética utilizada directamente es un método más efectivo para disminuir las fugas en la red y aumentar la eficiencia energética, además que facilita la gestión de estas. // ABSTRACT: Today there is a water crisis worldwide, where the sanitation companies must help to reduce this, because in the water distribution networks (RDAP) there are high volumes of leaked water, these can range from 30% to more than 60% of the total volume injected into the network. Another problem in the networks is the energy
cost, where the pumping groups are the ones that produce the greatest amount of
consumption. To reduce leaks and increase energy efficiency in the RDAP, sectorization is used, which consists of dividing them into sectors delimited by valves, managing to control the pressures of the sector and its management. Due to the above, the main objective of this report is to apply sectorization methodologies to the Curicó distribution network to reduce leaks and/or be more energy efficient. The type of research is experimental design, and the sample is a part of the RDAP of the city of Curicó with its weekend demand pattern and the sectorization of this is defined based on the criteria of energy efficiency both
directly and indirectly (through pressure strata). In the first place, the main pipes
were determined with the graph theory and the width search algorithm, with the criterion that pipes with a diameter greater than 250 mm and are connected from the reservoir are added to the main network, this was done through PyCharm (with Python programming language) together with the Epanet toolkit called owa-epanet. Then, the sectorization is carried out by the manual method of pressure
stratification, where the pressures are seen through Epanet 2.2 and the sectorization was made based on the pressure ranges, obtaining 5 sectors that connect to the main network. Afterwards, the automatic method based on the
maximization of energy efficiency is carried out, for this the Dijkstra algorithm is
applied, finding the shortest paths (CMC) between the main network and the rest of
the nodes (CMC is defined with the sum of energy efficiencies of the pipes). Through the CMC minimums to the nodes, it was possible to make groups of nodes and thus generate 5 sectors. Finally, with PyCharm, the programming was done to calculate the average pressure, leak flow and the energy efficiency of the networks and sectors. As a result, the average of the pressures in the network goes from 36.60 mca to 24.40 and 23.33 mca in the manual and automatic method, respectively. Leaks in the original network correspond to 30% of the demand flow and decrease to 18.63% in manual sectorization and 17.84% in automatic sectorization. Finally, the energy efficiency of the network increases by 8.99% for the manual method and 10.6% for the automatic method. Therefore, it is considered that sectorization under energy efficiency criteria used directly is a more effective method to reduce leaks in the network and increase energy efficiency, in addition to facilitating their management
Políticas de prevención de la violencia de género en la gestión educativa de instituciones de educación superior en región del Maule
Full text link245 p.La investigación aborda la problemática de la implementación de las Políticas de
Prevención de la Violencia de Género y su incidencia en las prácticas de aula en
instituciones de Educación Superior, plantea como necesidad el que los centros
formativos incorporen el enfoque de género en sus políticas de convivencia
institucional, implementación curricular y prácticas educativas. El objetivo del
estudio es analizar las prácticas de trabajo que desarrollan los equipos educativos,
a partir de las políticas gubernamentales de igualdad y equidad de género, y los
planes de intervención educativa destinados a la prevención de la violencia de
género, reproducción de estereotipos y sesgos. La metodología de investigación
utilizada es de enfoque mixto, de análisis de evidencia normativa, teórica y
empírica de tipo exploratorio/explicativo, permitiendo obtener una perspectiva más
extensa y profunda respecto a la incidencia que tienen las políticas en la gestión
aula de las académicos/as de la Región del Maule. Entre los principales resultados
se visualiza la necesidad de proporcionar formación pedagógica con enfoque de
género a los académicos, además de comprometer a todos los estamentos en el
cumplimiento de los procesos que las casas de estudios ejecutarán con el objetivo de cumplir las nuevas exigencias legales en género
Modelamiento tridimensional del volumen del dosel mediante un vehículo aéreo no tripulado (VANT) de bajo costo en un huerto intensivo de avellano europeo (Corylus avellana L.)
Full text link54 p.En esta memoria de título, se presenta la estimación de la arquitectura del dosel
mediante modelamiento 3D de las temporadas 2019-2020 y 2020-2021 en un huerto intensivo de avellano europeo (Corylus avellana L.). El objetivo fue describir el modelamiento 3D en base a imagen RGB tomadas con un vehículo aéreo no tripulado (VANT) de bajo costo y su posterior procesamiento en el software Pix4D.
El uso de VANT puede estimar el volumen del cultivo de avellano y por tanto ser una opción económica y rápida de estimar este parámetro. Los resultados indicaron que en la temporada 2019-2020 se obtuvieron estimaciones ajustadas a la curva de crecimiento foliar y posterior defoliación del avellano. Sin embargo, en la temporada 2020-2021 existió una tendencia de valores muy irregulares en la estimación del volumen debido a que no existió poda invernal provocando una mayor irregularidad en la arquitectura del dosel. Los resultados muestran que, sí se puede lograr una correcta estimación del volumen del dosel, pero factores como un mal manejo del huerto en cuanto a poda afecta de forma negativa la
estimación del volumen. // ABSTRACT: In this title report, the estimation of the canopy architecture is presented through 3D modeling of the 2019-2020 and 2020-2021 seasons in an intensive European hazelnut orchard (Corylus avellana L.). The objective was to describe the 3D modeling based on RGB images taken with a low-cost unmanned aerial vehicle
(UAV) and its subsequent processing in Pix4D software. The use of UAV can estimate the volume of hazelnut trees and therefore be an economical and fast option to estimate this parameter. In the comparative description of the seasons, it was obtained as a result that in the 2019-2020 season estimates adjusted to the leaf growth curve and subsequent hazel defoliation were obtained, while the 2020-
2021 season had a trend, but this had values very irregular in the estimation of the
volume, for the second season there was no winter pruning, which caused a greater irregularity in the architecture of the canopy. The results show that, if a correct estimation of the volume of the canopy can be achieved, but factors such as poor management of the orchard in terms of pruning negatively affect the estimation of the volume
Medidas de detección tempranas de riesgos en la planificación de proyectos de construcción
Full text link92 p.La industria de la construcción en Chile cumple un papel muy importante respecto
al desarrollo del país, representa aproximadamente el 7% del PIB. Para que una
obra de construcción se desarrolle de acuerdo con los estándares que exigen sus
mandantes es necesario contar con una planificación estratégica, respetar plazos
y adecuarse a las situaciones que pueden afectar su desarrollo, este escenario es
el ideal y no siempre se alcanza. Casi la totalidad de las obras de construcción
incumplen sus plazos, lo que generalmente va ligado con bajos índices de
productividad, mayor gasto de mano de obra, entre otros Este trabajo busca
contribuir a aumentar la productividad en obras de construcción de edificaciones
de baja altura, utilizando una herramienta de generación de alertas tempranas que
permita maximizar recursos y de esta manera disminuir los tiempos de desarrollo
de las obras logrando cumplir con los plazos estipulados inicialmente en las
planificaciones. Esta herramienta de generación de alertas de atrasos de forma
temprana de planificación de obras de construcción, permite la toma de decisiones
de manera oportuna y con antelación; esta se basa en el análisis de tres diferentes
obras de edificación de baja altura destinadas finalmente a viviendas familiares,
donde se analizaron sus planificaciones (carta Gantt), rendimientos, tiempos
empleados, ruta crítica y las actividades que la componen; creando de esta
manera indicadores estratégicos en los cuales se basa el análisis entregando
alertas tempranas considerando aproximadamente los primeros 4 meses de
desarrollo del proyecto con el fin de tomar decisiones de manera informada para
de esta forma evitar atrasos en el plazo. Se concluye con esta investigación que el
uso de la herramienta de generación de alertas en futuros proyectos de edificación
de baja altura contribuirá a la toma de decisiones inteligentes y a tiempo de esta
manera ayudando a disminuir tiempos de desarrollo, lo que aumentará la productividad en la obra a diferencia de si no se incorporara el uso de esta. Finalmente disminuye el riego de quiebre de la empresa, aumentan utilidades y
aporta positivamente en el desarrollo del proyecto siendo un beneficio para todos
los involucrados en esta, trabajadores, mandante, usuario final, entorno y comunidades. // ABSTRACT: The construction industry in Chile plays a very important role regarding the national
development, representing around 7% of the GDP. For a construction work to be
developed according to the standards demanded by its principals, it is necessary to
have a strategic planning, respect deadlines and adapt to the situations that may
affect its development. This is the ideal scenario, and it is not always achieved.
Almost all construction works fail to meet their deadlines, which is usually
associated with low productivity rates, high labor costs, among others. This work
seeks to contribute to increasing productivity in low-rise construction works, using
an early warning generation tool that allows maximizing resources. Thus, the
development times of the works would be reduced, making possible to meet
deadlines initially stipulated in the schedules. This tool for generating alerts of
delays early in the planning of construction works, allows making decisions in
advance and in a timely manner; It is based on the analysis of three different lowrise
building works that are finally destined for family dwellings, where their
planning (Gantt chart), yields, times used, critical path and the activities that
compose it were analyzed. This way, strategic indicators on which the analysis is
based are created, delivering early warnings considering approximately the first 4
months of project development in order to make informed decisions to avoid delays
in the term. It is concluded with this research that the use of the alert generation
tool in future low-rise building projects, will contribute to making on time and smart
decisions, thus, helping to reduce development times, which will increase worksite
productivity, unlike when not incorporating the use of it. Finally, the risk of
bankruptcy of the company decreases, profits increase and contributes positively
to the development of the project, being a benefit for all those involved in it: workers, client, end user, environment and communities
Estudio de la frecuencia predominante de los suelos de la ciudad de Curicó mediante mediciones in-situ con dispositivos de bajo costo
Full text link130 p.Ante la gran actividad sísmica que presenta nuestro país se ha evidenciado la
necesidad de contar con estudios del comportamiento dinámico de los suelos,
debido a la diversa respuesta sísmica en una misma localidad. La ejecución de
estos estudios depende un alto costo económico, por ello se realiza un estudio de
la geología superficial del suelo de la ciudad de Curicó mediante un dispositivo de
bajo costo económico, conformado por una Raspberry Pi y acelerómetro MPU
6050 que permitan medir las frecuencias asociadas al suelo en estudio. Para
minimizar las incertezas de las mediciones, se realiza una extensa campaña de
campo donde se estudiaron 100 puntos con 244 mediciones de microvibraciones
ambientales de 10 a 15 minutos, dividendo la ciudad en 11 sectores de estudio.
Estas señales fueron procesadas utilizando la técnica HVSR o Nakamura, método
que se ha utilizado ampliamente en la estimación de la frecuencia predominante
de los suelos. La adquisición, procesamiento e interpretación de resultados se
realizó en base a la guía de SESAME (Site EffectS using AMbient Excitations).
Posteriormente se construyeron mapas de frecuencias fundamentales del suelo
mediante la aplicación de técnicas basadas en sistemas de información
geográfica. Los resultados obtenidos corresponden a curvas H/V de las cuales se
obtiene el periodo y la frecuencia predominante de un depósito de suelo. A través
de estos datos es posible estimar el contraste de impedancia entre las capas de
suelo, una aproximación de la tipología y la amplificación sísmica del suelo. Los
resultados del presente estudio fueron superpuestos en un mapa de geología
superficial de la ciudad y comparados con el estudio de Leyton et al. 2013,
realizado con un geófono de 3 componentes. Las mediciones del dispositivo
arrojaron grandes errores en depósitos blandos, con gran dispersión de frecuencias, distante de los resultados a comparar, lo que se correlaciona a las bajas frecuencias que estos suelos producen y no son captados por el
acelerómetro. Sin embargo, su uso en suelos competentes, compuestos por
gravas arenosas y/o arcillosas, especialmente los suelos de la zona sur de Curicó,
demuestra resultados aproximados, con una dispersión de frecuencias similar al
estudio de Leyton et al. 2013. Un análisis de sensibilidad del dispositivo en sus
componentes y programación, acompañado de unas pruebas en tipologías de suelos conocidas, beneficiaria a determinar si los datos entregados son robustos para fomentar su utilización. // ABSTRACT: Given the great seismic activity that our country presents, it has been evidenced
the need to have studies of the dynamic behavior of the soils, due to the diverse
seismic response in the same locality. The execution of these studies depends on
a high economic cost, so a study of the surface geology of the soil of the city of
Curicó is made using a low-cost device, formed by a Raspberry Pi and
accelerometer MPU 6050 to measure the frequencies associated with the soil
under study. To minimize the uncertainties of the measurements, an extensive field
campaign was carried out where 100 points were studied with 244 environmental
microvibration measurements of 10 to 15 minutes, dividend the city in 11 study
sectors. These signals were processed using the HVSR or Nakamura technique, a
method that has been widely used in estimating the predominant frequency of
soils. The acquisition, processing and interpretation of results were carried out
based on the SESAME (Site EffectS using AMbient Excitations) guide.
Subsequently, fundamental frequency maps of the soil were constructed using
techniques based on geographic information systems. The results obtained
correspond to H/V curves from which the period and fundamental frequency of a
soil deposit is obtained. Through these data it is possible to estimate the
impedance contrast between the soil layers, an approximation of the typology and
the seismic amplification of the soil. The results of this study were superimposed
on a map of the surface geology of the city and compared with the study by Leyton
et al. 2013, conducted with a 3-component geophone. The measurements of the
device showed large errors in soft deposits, with high frequency dispersion, distant
from the results to be compared, which correlates to the low frequencies that these
soils produce and are not captured by the accelerometer. However, its use in
competent soils, composed of sandy and/or clayey gravels, especially the soils of
southern Curicó, shows approximate results, with a frequency dispersion similar to
the study by Leyton et al. 2013. A sensitivity analysis of the device in its
components and programming, accompanied by tests in known soil typologies, would benefit to determine whether the data delivered are robust to encourage its use
Predicción de sitios de unión al ADN en la superfamilia Fur mediante inteligencia artificial y descriptores moleculares
Full text link71 p.La Superfamilia Fur se compone de proteínas reguladoras de absorción de iones,
estas poseen una similitud funcional y capacidad de unión al ADN, varían según el
cofactor metálico que utilicen dentro de las cuales podemos encontrar del tipo Fur,
Zur, Mur, Nur y PerR. El estudio del sitio de unión en proteínas de la Superfamilia
Fur y factores de transcripción es un tema de gran interés debido a que este tipo
de proteínas pueden ser potencialmente utilizadas en desarrollos y aplicaciones
antimicrobianas. En este estudio se caracterizaron 63 sitios de unión al ADN de
organismos bacterianos pertenecientes a Fur y diversos factores de transcripción,
mediante descriptores moleculares de secuencia y estructura. Utilizando técnicas
de inteligencia artificial se realizó la identificación de características relevantes
para entrenar los modelos predictivos SVM y RF. Del análisis realizado se
determinó que el mejor modelo entrenado con características de secuencia es
SVM logrando un rendimiento de exactitud (Accuracy) de 84.6%, mientras que
utilizando características estructurales el modelo RF es el que logra un mejor
rendimiento con una exactitud (Accuracy) de 77.3%. Los resultados de la
predicción indican que es posible desarrollar un modelo predictivo de zonas de unión al ADN en proteínas con una alta precisión utilizando solo la información de secuencia. // ABSTRACT: The Fur superfamily is composed of ion absorption regulatory proteins. These have
functional similarities and DNA binding capacity. The diversity depends on the
metal cofactor used, among which they can find Fur, Zur, Mur, Nur, and PerR
types. The study of metal binding site proteins in the Fur superfamily and
transcription factors is a very interesting topic because these types of proteins can
potentially be used in antimicrobial development and its applications. In this
investigation, 63 DNA-binding sites of bacterial organisms belonging to the Fur
family and various transcription factors were characterized by molecular
descriptors of sequence and structure. The use of intelligent artificial intelligence
techniques made it possible to identify relevant characteristics for training SVM and
RF predicting models. The performed analysis determined that the best predicting
model using sequence characteristics is SVM, achieving a performance of 84.6%
accuracy while using structural characteristics the RF model achieved the best performance with 77.3% accuracy. The results of the prediction indicate that it is
possible to develop a DNA-binding site predictive model in proteins with high
accuracy using only sequence information