727 research outputs found
Sort by
Inter-Nucleosomal Potentials from Nucleosomal Positioning Data [Research Data]
No full textThis dataset accompanies the paper "Inter-Nucleosomal Potentials from Nucleosomal Positioning Data." In this paper, a systematic method to develop inter-nucleosomal potentials between nucleosomes along a chromosome is focused. To this purpose, a modified Lennard-Jones potential is applied based on nucleosomal positioning data. The method is tested on the Candida albicans genome. The calculated potentials for all chromosomes for Candida albicans and their compressibility derived from potential-based simulations are included.
In this dataset:
"Potential01_100000.like_bed" contains the inter-nucleosomal potentials between nucleosomes for Candida albicans. Potentials are represented by four crucial parameters: parameter sigma is the scale for the modified Lennard-Jones potential; epsilon is the amplitude; delta is the exponents for the first term; and nu is the exponents for the second term.
The meaning of columns are: chromosome_name, start_position, end_posiiton, section_index, sigma, epsilon, delta, nu, compressibility.
“compress01_100000.out” contains the block density result for chromosome 2. The header is three “0” + the number of bins in the separation. The rest is section_index, slope, intercept + the block density result of the corresponding bin separation.
"ICPC-source.tar.gz" is the source code.<br
Synthetic renal ASL MRI [data]
No full textSynthetic renal ASL data sets simulating in-vivo acquisitions were generated using body models from the XCAT phantom, the general kinetic model and literature values for tissue properties. Sequence and ASL parameters were set in accordance with the current renal ASL consensus. Five PASL and five PCASL data sets with healthy perfusion and one PCASL data set with abnormal perfusion are available
Ergänzungsdaten zu: Rhenish glass – A chemical investigation
No full textDie Analyse (EPMA, LaICPMS) zahlreicher archäologisch gut datierter Gläser aus römischem und frühmittelalterlichem Kontext aus Köln und weiteren Handelsorten erweitert unsere Erkenntnisse zur Erzeugung von Gebrauchsglas im Rheinland. Die fränkischen Werkstätten im Bereich des Hafens von Köln führen die Glasverarbeitung aus römischer Zeit fort. Mit der erneuten Analyse der Gläser des Gräberfeldes Krefeld-Gellep (römisch-fränkisch), der Glaswerkstatt Hasselsweiler (fränkisch) dem Glas der Hambacher Hütten (römisch) liegen nun verbesserte umfangreiche Datensätze auch zu Spurenelementen vor. Die aus inzwischen zahlreichen Arbeiten bekannten chemischen Variationen innerhalb der einzelnen Produktionsgruppen des Soda-Kalk-Glases (SLG) können für die untersuchten archäologischen Glasbefunde weitgehend bestätigt werden. Die Produktionsgruppen werden in ihrem zeitlichen Kontext sowohl allgemein für eine große Anzahl in einer Datenbank vorhandener Analysen (n = 15 270, Stand Juni 2022), als auch für die Gläser im Rheinland, besonders Köln, vorgestellt. Dabei werden auch Kriterien genutzt, um den Anteil rezyklierten Glases in den jeweiligen Zeitabschnitten zu ermitteln. Römisches Gebrauchsglas wurde in Hambach als Massenware überwiegend aus den SLG-Typen HIMT-1 und HIMT-2 (Foy série 3.2) gefertigt, während Antimon- und Manganentfärbtes Glas (Typ »Roman«) in Kölner Werkstätten zur Erzeugung hochwertigerer Glaswaren diente. In Hambach ist der Anteil von rezykliertem Altglas recht gering, sodass davon ausgegangen werden kann, dass überwiegend Rohglas als Ausgangsmaterial verwendet wurde. Im 5./6. Jahrhundert ist der Anteil von Altglas in den Werkstätten des Kölner Hafens sehr hoch, Hasselsweiler verarbeitete wohl ausschließlich Altglas. Für das im Kölner Hafen verarbeitete Glas gibt es Anteile ohne Rezyklierungs-Anzeiger, sodass ein Warenfluss von frischem Rohglas aus der Mittelmeerregion auch für die nachrömische Zeit zu fordern ist. Dieser Warenstrom bestand für das Rheinland überwiegend aus einer Produktionsgruppe, die wir als HIMT-2 zusammenfassen. Die Glastypen HIMT-1 und die reinen Roman-(Sb-Mn) Typen verschwinden in den ersten nachrömischen Jahrhunderten relativ rasch, sind aber noch in wenigen Fällen zu beobachten. Das Levantine-1 hat nur eine untergeordnete Bedeutung für den Kölner Hafen und ist, wie HIMT-1, in nachrömischer Zeit fast ausschließlich als Glasrezyklierung bzw. als ererbtes römisches Glas zu interpretieren. Glas der Egypt-Typen tritt nur in wenigen Ausnahmefällen auf, sodass davon ausgegangen werden kann, dass dieser Produktionstyp in den Kölner Werkstätten selbst nicht verarbeitet wurde. Bis in das 9. Jahrhundert dominiert das SLG die Glaswerkstätten im Rheinland, während in Gegenden vor allem rechts des Rheines bereits erstes Holzascheglas hergestellt und verarbeitet wird. Allgemein steigt der Anteil von genutztem Altglas in karolingischer Zeit stark an. Dabei tauchen auch im Rheinland im 8./9. Jahrhundert Gläser mit Roman- oder HIMT-typischer Zusammensetzung wieder auf. Das deutet auf die beginnende Verknappung des Soda-Kalk-Glases hin, da man größere Mengen Altglas aus den antiken Ruinen bezog
Prediction and Comparative Analysis of CTCF Binding Sites based on a First Principle Approach [Research Data]
No full textThe file contains the CTCF-DNA binding sites for complete genome of Homo sapiens (human), Mus musculus (mouse), Sus scrofa (pig), Capra hircus (goat), Aedes aegypti (dengue and yellow fever mosquito) and Drosophila melanogaster (fruit fly) using electronic nucleotide alignment. The data analysis is described in NN Oiwa, K Li, CE Cordeiro and DW Heermann, 2022 [arXiv:2110.10508]. Detailed description of the Electronic Nucleotide Alignment method can be found in NN Oiwa, CE Cordeiro, DW Heerman (2016). We also add Caenorhabditis elegans (worm), Plasmodium falciparum (protozoan) and Arabidopsis thaliana (plant) as negative test, since there is not CTCF in these species
Test data for the Pooch library
No full textPooch is an open-source Python library for data download. This archive contains testing data for Pooch's DataVerse download functionality
Ergänzungsmaterial zu: Die schwarzen Perlen in Osteria dell’Osa (Rom, Italien). Ein Beitrag zu den ersten Glasperlen der frühen Eisenzeit in Latium
No full textSupplementary table
Physicians’ Attitudes towards Secondary Use of Clinical Data for Biomedical Research Purposes. Results of a Quantitative Survey. [Research Data]
No full textThis is the research data from the publication "Physicians' Attitudes toward Secondary Use of Clinical Data for Biomedical Research Purposes. Results of a Quantitative Survey." The research data includes the questionnaire, the data set used, and a description of the data preparation
Neuartige Azaacene – Synthese und Anwendung in organischen Feldeffekttransistoren [Data]
No full textDie vorliegende Dissertation befasst sich mit der Synthese und Charakterisierung neuartiger Azaacene und Aza-acenoacene aus Acridonen. Dabei steht der Einfluss der Regioisomerie auf die Kristallpackung und die potentielle Anwendung als Halbleitermaterial in organischen Feldeffekttransistoren im Fokus
Does Happiness Increase in Old Age? Longitudinal Evidence from 20 European Countries [Dataset]
No full textSeveral studies indicate that happiness follows a U-shape over the life cycle: Happiness decreases after the teenage years until reaching its nadir in middle age. A similar number of studies views the U-shape critically, stating that it is the result of the wrong controls or the wrong model. In this paper, we study the upward-pointing branch of the U-shape, tracing the happiness of European citizens 50 and older over multiple waves. Consistent with a U-shape around middle age, we find that happiness initially increases after the age of 50, but commonly stagnates afterwards and eventually reverts at high age. This pattern is generally observed irrespective of the utilized happiness measure, control variables, estimation methods, and the consideration of selection effects due to mortality. However, the strength of this pattern depends on the utilized happiness measure, control variables, and on mortality effects. The general pattern does not emerge for all countries, and is not always observed for women
Catalogue of Costume Books, Albums, and Print Series
No full textThis catalogue lists European costume books, albums or print series produced in the sixteenth and seventeenth centuries. As well as providing bibliographical data, the catalogue records known holdings of these works in the collections of different institutions. Hyperlinks to institutional catalogue entries and digitalized copies are provided.
Repeat entries for single titles record the cases in which multiple printed copies are known to survive in different institutional collections.
The catalogue is not a complete, exhaustive record yet provides researchers with a functional tool for finding and sourcing a large quantity of the costume material that characterised the visual culture of early modern Europe