Digital Repository of Hellenic Managing Authority of the Operational Programme "Education and Lifelong Learning" (EDULLL)
Not a member yet
3537 research outputs found
Sort by
Μελέτη και κλινική αξιολόγηση νέων μοριακών δεικτών καρκίνου του μαστού
Get PDFΠρόσφατες μελέτες συμπεριλαμβάνουν το γονίδιο PALB2 (Partner and localizer of BRCA2) στην συνεχώς αυξανόμενη λίστα των γονιδίων κληρονομούμενου καρκίνου του μαστού. Εντοπίζεται στη χρωμοσωμική περιοχή 16p12.1 και αποτελείται από 13 εξόνια που μεταγράφουν mRNA περίπου 3,5 Kb που κωδικοποιεί μια πρωτεΐνη 1186 αμινοξέων. Τα εξόνια 4 και 5 είναι αισθητά μεγαλύτερα από όλα τα άλλα (65 % του γονιδίου). Οι παθογνωμικές μεταλλάξεις του προσδίδουν έναν σοβαρό κίνδυνο καρκίνου του μαστού στους ετεροζυγώτες και αναιμία Fanconi στους φορείς διαλληλικών μεταλλάξεων (γι’ αυτό αλλιώς ονομάζεται και FANCN). Οι μεταλλάξεις του είναι σπάνιες και έχουν ανιχνευθεί στο 1-2 % των BRCA αρνητικών γυναικών με καρκίνο του μαστού. Η πρωτεΐνη PALB2 αποτελεί τον συνδετικό κρίκο των BRCA2 και BRCA1 που εντοπίζονται στον πυρήνα και συμμετέχει στην επιδιόρθωση των σπασιμάτων της διπλής έλικας του DNA μέσω του αλάθητου ομόλογου ανασυνδυασμού. Η σημαντική του συνεισφορά θα μπορούσε να περιοριστεί αρκετά, εκτός από την ύπαρξη μεταλλάξεων, εάν επηρεαζόταν από επιγενετικούς μηχανισμούς όπως την μεθυλίωση των CpG νησίδων του υποκινητή. Σ’ αυτή την περίπτωση, οι ασθενείς θα μπορούσαν να ωφεληθούν από θεραπευτική αγωγή με PARP αναστολείς.
Σκοπός της εργασίας ήταν: Α) η πλήρη γενετική μελέτη του γονιδίου PALB2 για την εύρεση τυχόν μεταλλάξεων σε δείγματα DNA περιφερικού αίματος ασθενών με κληρονομούμενο καρκίνο του μαστού και των ωοθηκών Β) η ανάλυση έκφρασης του γονιδίου PALB2 σε δείγματα ιστού ασθενών με σποραδικό καρκίνο του μαστού για τον εντοπισμό τυχόν επιγενετικών μηχανισμών που να εμποδίζουν την έκφρασή του.
Recent reports have included PALB2 (Partner and localizer of BRCA2) in the growing list of hereditary cancer genes. PALB2 is located in the chromosome region 16p12.1 and consists of 13 exons transcribing approximately 3.5Kb mRNA, which encodes a protein of 1186 amino acids. Exons 4 and 5 are much larger than all the others (65% of the coding area). Its deleterious mutations confer a moderate breast cancer risk in heterozygotes and Fanconi anemia in biallelic mutation carriers (hence its other name: FANCN) and are rare: 1-2 % of BRCA negative breast cancer patients in most populations. PALB2 protein co-localizes with BRCA2 and BRCA1 in nuclear structures and enables error-free homologous recombination DNA repair of doublestranded breaks. This important contribution could be severely diminished, not only by mutations, but also by epigenetic mechanisms such as promoter CpG island methylation. In such a case, patients could benefit from therapeutic treatment with PARP inhibitors.
The aim of the study was: A) The genetic analysis of the PALB2 gene for identification of mutations in DNA from peripheral blood samples of patients with familiar breast and ovarian cancer B) the expression analysis of PALB2 gene in tissue samples of patients with sporadic breast cancer for identification of epigenetics mechanisms that might silence gene’s expression
On the origin of extrusion instabilities: Linear stability analysis of the viscoelastic die swell
Get PDFIt is well-known that, increasing the flow rate in polymer extrusion, the flow becomes unstable and the smooth extrudate surface becomes wavy and disordered to an increasing degree. In order to investigate the mechanisms responsible for these instabilities we perform a linear stability analysis of the steady extrusion of a viscoelastic fluid flowing through a planar die under creeping flow conditions. We consider the Phan-Thien-Tanner (PTT) model to account for the viscoelasticity of the material. We employ the mixed finite element method combined with an elliptic grid generator to account for the deformable shape of the interface. The generalized eigenvalue problem is solved using Arnoldi’s algorithm. We perform a thorough parametric study in order to determine the effects of all material properties and rheological parameters. We investigate in detail the effect of the interfacial tension and the presence of a deformable interface. It is found that the presence of a finite surface tension destabilizes the flow as compared to the case of the stick-slip flow. We recognize two modes, which become unstable beyond a critical value of the Weissenberg number and perform an energy analysis to examine the mechanisms responsible for the destabilization of the flow and compare against the mechanisms that have been suggested in the literature
Micellar and Fractal Aggregates formed by two Triblock Terpolymers with different arrangements of one Charged, one Neutral Hydrophilic and one Hydrophobic Block
Get PDFWe have studied the self-assembled structures of two triblock amphiphilic polyelectrolytes of different topologies, containing a charged poly[sodium(sulfamate/carboxylate)isoprene] (SCPI)
block, a polystyrene (PS) hydrophobic block and a hydrophilic neutral poly(ethylene oxide) (PEO) block in aqueous solutions, using Small Angle Neutron Scattering (SANS) and Light Scattering (LS). SANS reveals micellar and fractal aggregates in coexistence for both systems. In the case of SCPI-b-PS-b-PEO there is a higher content in fractal aggregates in comparison with PS-b-SCPI-b-PEO. In both cases the micellar aggregates are stable under different solution conditions, whereas the fractal aggregates appear to break upon addition of salt in the PS-b-SCPI-b-PEO system. The detailed picture of the micellar aggregates is consistent with the anticipated morphology of charged and neutral spherical macromolecular brushes, extended to mixed and sequential brushes. The analytical description obtained by SANS is used to interpret the LS data which is very sensitive to the presence of two species and therefore provides information on average values of the measured parameters
Report of functional trait inter-relationships
Get PDFThis report presents the statistical techniques and methods applied to the MEDIT dataset, aiming at revealing important trait relationships and thus identify potential conversion of life history strategies, as expressed via functional traits. A functional description of the key forest species found in Greece is presented, which can be used as a first proxy to describe important ecological processes. In addition the functional relationships identified here were used to parameterise and constrain key algorithms of the vegetation dynamics models used in deliverables D6.1 and D6.2. For the small scale vegetation dynamics model (GREFOS) species specific values of the traits of interest were used to parameterise the allometric relationships and the mortality function. For the large scale JULES models a set of plant functional types was defined and used to simulate gross primary productivity and net primary productivity across the Mediterranean basin. Finally for the hybrid TFS model the identified functional relationships were directly plugged into the model in order to simulate vegetation dynamics under both current and climate change conditions. All analyses were made with the R programming language (R Development Core Team, 2015)
Π8 Πρώτο πρωτότυπο της «Σύνθεση»
Get PDFΣτόχος της «Σύνθεσης» είναι ο σχεδιασμός και η
ανάπτυξη μιας πλατφόρμας η οποία θα ικανοποιεί τις ανάγκες των επισκεπτών του Ιδρύματος Β&Μ Θεοχαράκη με τέτοιο τρόπο που το παιχνίδι θα συναντά την εκπαίδευση. Οι επισκέπτες ενός μουσείου ,εκτός από τη φυσική τους παρουσία στο χώρο του μουσείου, τείνουν να περιηγούνται και στον κυβερνοχώρο προσδοκώντας
την παρουσία του μουσείου και εκεί. Η πύλη έχει σκοπό να ενοποιεί όλες τις δυνατότητες που προσφέρονται στο πλαίσιο του έργου «Σύνθεση», κατά κύριο λόγο
τις διαδικτυακές εκπαιδευτικές εφαρμογέ
Σύστημα Κεντρικής Υποστήριξης της Πρακτικής Άσκησης Φοιτητών Α.Ε.Ι.: Παραδοτέο: Αναφορά Αξιολόγησης και Ποιοτικού Ελέγχου: Αναφορά αξιολόγησης
Get PDFΣτο παρόν παραδοτέο παρουσιάζεται αναλυτικά η λειτουργικότητα της αξιολόγησης των συμμετεχόντων στη δράση όπως αυτή ενσωματώθηκε στην Πληροφοριακή υποδομή του προγράμματος «Άτλας», που αποτελεί το Σύστημα Κεντρικής Υποστήριξης της Πρακτικής Άσκησης Φοιτητών ΑΕΙ. Μεταξύ άλλων, αναλύεται η ανάγκη για τη διαδικασία αξιολόγησης, οι διαφορετικές κατηγορίες αξιολόγησης, οι λειτουργίες αλλά και η τεχνική υλοποίηση των εφαρμογών της δράσης ΑΤΛΑΣ όσον αφορά τη λειτουργικότητα της αξιολόγησης. Στη συνέχεια παρατίθενται τα αποτελέσματα που προέκυψαν από τη χρήση της λειτουργικότητας της αξιολόγησης των Θέσεων Πρακτικής Άσκησης.
Στόχος του παραδοτέου είναι η αποτύπωση των διαδικασιών και των λειτουργιών αξιολόγησης που παρέχονται από το ΠΣ ΑΤΛΑΣ μέσω σχετικών ερωτηματολογίων στους χρήστες του ΠΣ, καθώς και η αποτύπωση της εικόνας που έχουν όλες οι κατηγορίες χρηστών σε σχέση με τη συνεργασία τους με τους υπόλοιπους χρήστες στα πλαίσια της πρακτικής άσκησης, τις επιμέρους παραμέτρους αυτής της συνεργασίας αλλά και τις τυχόν παρατηρήσεις και προτάσεις που ενδεχομένως έχουν για περαιτέρω βελτίωση της συνεργασίας και εξέλιξη της Πρακτικής Άσκησης
Ενότητα εργασίας ΕΕ5: Παραδοτέο 5.3: Έκθεση αποτελεσμάτων για τη χρήση νανοδομών σε αισθητήρες
No full textΣτη συγκεκριμμένη ενότητα εργασίας εξετάστηκαν, μεταξύ άλλων, τα φαινόμενα αλληλεπίδρασης συμπολυμερών με πρωτεΐνες και ειδικότερα οι έρευνες επικεντρώθηκαν στην μελέτη σχετικών εφαρμογών μέσω της πειραματικής ανάπτυξης αισθητήρων ανίχνευσης πρωτεϊνών, από επιστρώσεις συμπολυμερών κατά συστάδες ή τυχαίων πάνω σε πολυμερικές ή γυάλινες οπτικές ίνες. Ειδικότερα στο παραδοτέο αυτό αξιολογήθηκαν τα διάφορα πρωτόκολλα εναπόθεσης του πολυμερούς πάνω σε πολυμερικές ή γυάλινες οπτικές ίνες. Αρχικά χρησιμοποιήθηκε με επιτυχία το συμπολυμερές PtBS-SPS για την ανίχνευση της λυσοζύμης κάνοντας χρήση της ηλεκτροστατικής αλληλεπίδρασης του πολυμερικού στρώματος με την πρωτεΐνη. Η προσρόφηση της λυσοζύμης στο πολυμερικό στρώμα επιφέρει αλλαγές στο οπτικό σήμα (αλλαγές στην ένταση της δέσμης φωτός που διαπερνά την ίνα), οι οποίες συσχετίζονται με την συγκέντρωση της πρωτεΐνης στο υπερκείμενο υδατικό διάλυμα.
Υλοποιήθηκε επίσης ανάλογη μελέτη και πειράματα και με συμπολυμερή PS-P2VP (κατά συστάδες και τυχαία) προς ανίχνευση πρωτεϊνης BSA σε φυσιολογικές τιμές pH. Το παραδοτέο περιγράφει την πειραματική ανάπτυξη αισθητήρων πρωτεϊνών από επιστρώσεις συμπολυμερών συμπολυμερές PS-P2VP (κατά συστάδες και τυχαίο) πάνω σε πλαστικές οπτικές ίνες. Η προσρόφηση επίσης της BSA στο πολυμερικό στρώμα επιφέρει αλλαγές στη διάδοση του οπτικού σήματος, οι οποίες είναι δυνατόν να συσχετιστούν με την συγκέντρωση της πρωτεΐνης στο υπερκείμενο διάλυμα. Για την βελτιστοποίηση ανάπτυξης του αισθητήρα πραγματοποιήθηκε φυσικοχημικός και μορφολογικός χαρακτηρισμός των επιστρώσεων. Αναπτύχθηκαν πρωτόκολλα παρασκευής και οπτικού χαρακτηρισμού των επιστρώσεων, καθώς και της λειτουργικότητάς τους σε διαφορετικές συνθήκες. Αξιολογήθηκε η απόκριση των νανοδομών παρουσία διαφορετικών συγκεντρώσεων πρωτεϊνών όπως BSA και λυσοζύμης. Πραγματοποιήθηκε επίσης λεπτομερής μελέτη της εκλεκτικότητας ανίχνευσης των υπό ανάπτυξη αισθητήριων συστημάτων ως προς τη σύμπλεξή τους με τις δύο πρωτεΐνες, με σκοπό να αναγνωριστεί ο μηχανισμός και να ελεγχθεί η διαδικασία συμπλοκοποίησης στην επιφάνεια