Vietnam Academy of Science and Technology: Journals Online
Vietnam Academy of Science and Technology: Journals OnlineNot a member yet
7064 research outputs found
Sort by
Expression of the recombinant single chain variable fragments recognizing blood antigen fused with thioredoxin in Escherichia coli
The technology of recombinant single chain variable fragments (scFvs) expression has been used in research, diagnosis and treatment of diseases. In the previous study, we studied the expression of a recombinant single chain variable fragment recognizing blood A antigen (antiA-scFv) in E. coli. However, the protein was insoluble form resulting in difficulty for purification, refolding and activity assesment. Here, we present the study on fused expression of the recombinant scFv -specific blood A antigen with thioredoxin (Trx) in the expression vector pET32a (+). The results showed that the Trx/antiA-scFv fusion protein was expressed with molecular weight of 49 kDa in a soluble form reaching 40% of the total recombinant protein. This result facilitates the optimal condition of soluble protein expression, purification and bioactivity determination of the antiA-scFv recombinant antibody.
New records of ring nematodes, Bakernema enormese n. sp. and Criconema (Nothocriconemella) graminicola Loof, Wouts & Yeates, 1997 (Nematoda: Criconematidae) from natural forests of Vietnam
Bakernema enormese sp. n., collected from rhizosphere of forest wood trees in Muong Phang, Dien Bien Province (north Vietnam) is described and illustrated. The new species is characterized by large body size and stylet. In general, this new species is close to two existing species of the same genus, B. inaequale and B. dauniense by cuticle structure in transparent membranous projections which appear in lateral view as spine-like structures on each annulus. These structure arranged into several rows along the body. In morphology, the new species differs from B. inaequale and B. dauniense by body and stylet length, i.e. 609–842 µm and 143.5–150 µm vs. 391–578 µm and 59–74 µm for B. inaequale and vs. 391–461 µm and 65–74 µm for B. dauniense. In addition, new species can be distinguished from B. inaequale by the longer membranous projection, 8–12 vs. 6–10 µm and vagina shape, curved vs. sigmoid. From B. dauniense, the new species differs by the much longer membranous projection, 8–12 vs. 1.4–2.2 µm and less number annules between vulva and tail end (RV), 3–4 vs. 7.8 annules. The presence of Criconema (Nothocriconemella) graminicola Loof, Wouts Yeates, in Vietnam with morphometrics, illustrators and remarks given
Biodegradation of 2,4-dichlorophenoxyacetic acid and 4-chlorophenol in contaminated soils by Pseudomonas fluorescens strain HH
Herbicides with 2,4-dichlorophenoxyacetic acid (2,4D) has been commonly used to control weeds and widely detected in environments. In this study, biodegradating activity of Pseudomonas fluorescens HH on 2,4D and 4-chlorophenol (4CP) in soil was carried out. The inoculation with Pseudomonas fluorescens HH in soils increased the degradation of 4CP and 2,4D by from 47.0% to 51.4% and from 38.4% to 47.4%, respectively, compared to the degradation by autochthonous microorganisms. Pseudomonas fluorescens HH could degrade well 2,4D and 4CP in various soils, but the most efficient chemical removal was observed when they were in the loamy soil. Moreover, the efficiency of chemical degradation was significantly affected by the moisture contents with the highest performance of degradation at 10 and 20% soil moisture. Also, the addition of nitrogen (N), phosphorous (P) and potassium (K) stimulated the dissipation rates. The determination of degradation pathway for 2,4D in Pseudomonas fluorescens HH indicated that 2,4-dichlorophenol (2,4DCP) and 4CP were formed as metabolites
EFFICIENT STARCH RECOVERY FROM CASSAVA BAGASSE: ROLE OF CELLULASE AND PECTINASE
In this paper, the bagasses were treated with single pectinase (Pectinex Ultra SP-L, Novozymes) and cellulase (NS22192, Novozymes) or their mixture at various enzyme ratio. The response surface methodology was used to fit the experimental data and investigate the enzyme ratio influence on the starch recovery yield. The highest starch yield was achieved in the treatment of bagasse with 15 CMCU and 9PGU per gram of dry bagasse at 450C and pH 5 for 4 hours at the solid loading 5%, attained 86.55% of the residue starch
DƯ LƯỢNG HÓA CHẤT BẢO VỆ THỰC VẬT CƠ CLO TRONG MỘT SÓ SINH VẬT VÙNG TRIỀU PHÍA BẮC VIỆT NAM
Organochlorinated pesticides (OCPs) had been used widely in agriculture for protecting crop, eliminating insects. However, OCPs are banned in most countries because of their toxicity, long persistence and bio-accumulation. They are listed in carcinogen group and POP group (Persistent organic pollutants). In Vietnam, OCPs were banned in 1990s, but their residues are still found in the environments, including seawater, sediment and organisms. This paper presents the survey data of residues of OCPs in some organisms living in tidal flats in the northern part of Vietnam during the year 2013–2014. The results show that the total residue of OCPs in shellfish ranged from 5.57 µg/kg to 116.04 µg/kg dry weight. Compared with the American Guide for mollusk shellfish (2007), it is found that the organisms living in the tidal flats were not polluted by OCPs. However, these compounds can be accumulated in fat tissue even in very low concentration. Therefore, their presence in organism is alarming.Hóa chất bảo vệ thực vật (HCBVTV) cơ clo đã từng được sử dụng rộng rãi trong nông nghiệp để bảo vệ mùa màng, loại trừ sâu bệnh. Tuy nhiên, chúng đã bị cấm sử dụng ở nhiều quốc gia trên thế giới do tính độc cao, bền vững với môi trường và có khả năng tích lũy sinh học. Chúng được liệt vào nhóm chất có khả năng gây ung thư và nhóm các chất hữu cơ bền vững (POP). Tại Việt Nam, HCBVTV cơ clo đã bị cấm sử dụng từ những năm 1990, nhưng dư lượng của chúng vẫn được tìm thấy trong các hợp phần môi trường biển như nước biển, trầm tích biển và sinh vật biển. Bài báo này trình bày số liệu nghiên cứu về dư lượng HCBVTV cơ clo trong một số loài sinh vật sống trong các bãi triều Vịnh Bắc Bộ thời điểm 2013 -2014. Các kết quả nghiên cứu cho thấy, tổng dư lượng HCBVTV cơ clo trong các sinh vật vùng triều Vịnh Bắc Bộ dao động từ 5,57 – 116,04 g/kg khô. So sánh với các GHCP đối với sinh vật biển của Mỹ (2007) thì hàm lượng này vẫn an toàn đối với người tiêu dung. Tuy nhiên, những hợp chất này vẫn có thể tích lũy và đi vào cơ thể con người qua các chuỗi thức ăn dù ở nồng độ rất nhỏ. Vì vậy, sự có mặt của các hợp chất này trong các sinh vật vùng triều Vịnh Bắc Bộ cũng cần được chú ý và theo dõi
PHÂN TÍCH VÀ ĐÁNH GIÁ QUÁ TRÌNH XÓI LỞ VÀ BỒI TỤ Ở KHU VỰC CỬA SÔNG ĐỒNG TRANH - CẦN GIỜ (TP.HCM)
Study site is a part of Can Gio mangrove biosphere reserve in Can Gio district, Ho Chi Minh City. At present, this area is eroded strongly due to the effects of hydrodynamic impact. Based on the field measurements of coastal profile and shoreline changes from 2013 to 2017 and combination of remote sensing method and GENESIS model, the erosion and deposition processes in 5 years are evaluated and analyzed. The results show that the study site keeps eroding over time and trend to continue in the future. Moreover the study also shows that the erosion rate in the northeast monsoon is higher than that in the southwest monsoon. These results are very important in contribution to shoreline change studies.Khu vực nghiên cứu thuộc khu dự trữ sinh quyển rừng ngập mặn Cần Giờ, huyện Cần Giờ, Thành phố Hồ Chí Minh. Khu vực này hiện đang diễn ra quá trình xói lở mạnh mẽ do tác động của các yếu tố động lực. Trong nghiên cứu này, dựa vào kết quả thực đo mặt cắt đường bờ và đường bờ từ năm 2013 – 2017, đồng thời kết hợp với ảnh viễn thám và mô hình GENESIS để đánh giá và phân tích quá trình xói lở và bồi tụ trong 5 năm. Kết quả cho thấy khu vực khảo sát đang diễn ra quá trình xói lở theo thời gian và từ đó có xu hướng tiếp diễn trong tương lai. Mức độ xói lở vào mùa gió Đông Bắc lớn hơn mùa gió Tây Nam. Đây là những kết quả quan trọng, đóng góp vào lĩnh vực nghiên cứu sự thay đổi đường bờ
THỰC VẬT PHÙ DU VÙNG BIỂN VEN BỜ ĐÀ NẴNG
Phytoplankton, especially community characteristics, in coastal waters of Da Nang have not been well studied. This present study analyzed data of phytoplankton for diversity and abundance from surveys from 2002 to 2016 at 44 stations in the coastal Da Nang waters. A total of 316 taxa from 9 classes were identified: Dinophyceae (134 taxa), Mediophyceae (77 taxa), Coscinodiscophyceae (44 taxa), Bacillariophyceae (36 taxa), Cyanophyceae (3 taxa), Dictyochophyceae (2 taxa), Bacillariophyta classis incertae sedis (1 taxon), Conjugatophyceae (1 taxon) and Thecofilosea (1 taxon). A list of 36 species of potentially harmful microalgae was recorded in coastal waters of Da Nang. In which, Pseudo-nitzschia spp. often had higher cell densities in some locations during the northeast monsoon. Analyzing diversity indices in different locations showed that there were significance differences of Margalef and Shannon indices, low in estuarine area (CS) and higher in the south of Son Tra peninsula (NST). Meanwhile no strong differences of Pielou and Simpson indices were found among the locations. However, there were strong differences of Margalef, Simpson and Pielou indices, which were found over the three studied years (2004, 2005, and 2006), mainly in NST, the northeast of Son Tra peninsula (DBST) and Da Nang bay (VDN). Analysis of species accumulation curves indicated that only 56–95% of species was found compared to maximal expected species richness in all studied locations. DMS analysis showed that there was year-based similarity among the years (ca. 50% of similarity) of phytoplankton communities. Among the studied years, average phytoplankton cell densities in Da Nang bay and the northeast of Son Tra were higher than those in other years and locations. This present study on species richness, expected species richness and variation in phytoplankton abundance suggested that there is a need of increasing sampling efforts, especially in riverine area and DBST for better understanding of characteristics of phytoplankton communities in coastal Da Nang waters.Thực vật phù du là đối tượng ít được nghiên cứu ở vùng biển ven bờ Đà Nẵng, nhất là những đặc trưng về thành phần loài và cấu trúc quần xã. Trong bài báo này, chúng tôi phân tích số liệu về đa dạng loài và sự phong phú của thực vật phù du thu thập được trong các chuyến khảo sát từ năm 2002 đến năm 2016 ở 44 trạm trong vùng biển ven bờ Đà Nẵng. Kết quả phân tích đã xác định được 316 loài và dưới loài thuộc 9 lớp tảo khác nhau. Trong các loài thực vật phù du ghi nhận được, có 36 loài tảo có khả năng gây hại, trong đó mật độ của Pseudo-nitzschia spp. cao hơn tại một số khu vực trong thời kỳ gió mùa Đông Bắc. Phân tích các chỉ số theo từng khu vực, có thể thấy chỉ số giàu có loài Margalef và chỉ số đa dạng Shannon khác nhau đáng kể giữa các khu vực, thấp ở cửa sông trong vịnh Đà Nẵng và cao ở nam bán đảo Sơn Trà. Trong khi các chỉ số cân bằng Pielou và đa dạng Simpson lại không khác biệt giữa các khu vực. Tuy nhiên, sự đa dạng và độ giàu có loài lại có sự khác biệt giữa các năm 2004, 2005 và 2016, chủ yếu ở nam bán đảo Sơn Trà, đông bắc bán đảo Sơn Trà và vịnh Đà Nẵng. Phân tích độ giàu có loài cho thấy hầu hết các khu vực đều chỉ ghi nhận được từ 56% đến 95% số loài mong đợi. Phân tích cấu trúc quần xã thực vật phù du thu thể hiện sự biến động giữa các năm nghiên cứu với mức độ tương đồng trong năm xấp xỉ 50%. So sánh trung bình mật độ thực vật phù du thu của từng khu vực cho thấy mật độ vào năm 2005 cao hơn hẳn so với các năm khác ở vịnh Đà Nẵng và đông bắc Sơn Trà. Các phân tích về độ giàu có loài, loài mong đợi và biến động mật độ thực vật phù du thu cho thấy dù vùng biển nghiên cứu được ghi nhận thành phần loài thực vật phù du thu cao, nhưng số lượng trạm và thời gian thu mẫu ở vùng biển Đà nẵng nhất là khu vực cửa sông cần được thu thập nhiều hơn, vẫn cần thu thập thêm vật mẫu ở tất cả các khu vực, nhất là vùng cửa sông trong vịnh Đà Nẵng và đông bắc bán đảo Sơn Trà
EVALUATION OF STERCULIA FOETIDA L. GUM AS NATURAL BASED CONTROLLED RELEASE EXCIPIENT
Therefore, the physicochemical properties of Sterculia foetida L. gum, including solubility, scanning electron micrographs, melting point, swelling index, pH, viscosity, loss on drying were determined. Furthermore, compressed tablets were successfully prepared for in vitro studies at many different particle sizes, concentrations of gum, rotational speeds and media in order to evaluate the effects of these parameters on the rate of drug release. Besides, SFG tablets were compared with the tablets prepared with Hydroxymethylcellulose E15. The findings indicated that Sterculia foetida L. gum exhibited an excellent potential in managed release dosage forms.
APPLICATION OF AN AUTOMATED IDENTIFICATION AND QUANTIFICATION SYSTEM WITH A GC/MS DATABASE (AIQS-DB) FOR SIMULTANEOUS ANALYSIS OF PHTHALATE ESTERS AND STEROLS IN AIR PARTICLES
The aim of this study is to apply an automated identification and quantification system with a GC-MS database (AIQS-DB) for simultaneous analysis of phthalate esters (PAEs) and sterols in air particles. Air particles samples were collected on the roof of building located by the side of a busy street with heavy traffic load (Pham Van Dong street) (AP1) and in a highly populated residential area (Phu Do town) (AP2). At each sampling location, day and night samples were collected separately (around 10 h for each sample) continuously 6 d using a Kimoto high-volume air sampler. Air particle samples were then extracted by dichloromethane and determined and quantified by GC/MS instrument with the AIQS-DB. Analytical results of 12 PAEs and 13 sterols in air particles samples showed that five out of 12 PAEs and seven out of 13 sterols were detected. Di(2-ethylhexyl)phthalate (DEHP), di-n-butyl phthalate (DBP) and di-iso-butyl phthalate (DiBP) concentrations were highest, contributed 94% of the total detected phthalates concentration. Cholesterol and beta-sitosterol were detected in all the samples and accounted more than 70% of the total detected sterols concentration at Phu Do town. This is the first study on the application of AIQS-GC for simultaneous determination of PAE and sterols in the air particle, especially results obtained from this study provides new important information about the level and occurrence of sterol in air in Vietnam
EROSION FEATURES ALONG CUA DAI BEACH, HOI AN CITY, QUANG NAM PROVINCE, VIETNAM
Hoi An is a famous tourist city in Central Vietnam with Cua Dai beach which is a long beautiful swimming beach. In recent years, tourism of the city is developing very fast. The southern part of Cua Dai beach was covered by many resorts which were located close to the beach and protected by hard structures such as seawall, revetment, groin,… At present, all properties closed to the beach and hard protection structures of resort system were destroyed by wave action. And the northern part of Cua Dai beach (public beach) was seriously eroded and has been protected by “Soft structure”. Cua Dai coast erosion problem becomes the hot topic in communication system from central to local governments and it becomes the big concern of Vietnamese and international scientists. This paper presents the initial study results of Cua Dai beach erosion features. Study results show that Cua Dai beach erosion/deposition phenomenon occurred for a long time but the rate of accretion was larger than that of erosion. From the year of 2000 to present the rate of erosion was larger than that of accretion. The main causes of Cua Dai beach erosion are the interaction between hard protection structures and wave action, dredging operation in Thu Bon river mouth... which reduced the longshore sediment transport rate from Thu Bon river mouth to eroded beach