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Escaneamento a laser aerotransportado aplicado a inventário de povoamentos de eucalipto ao nível de árvores individuais
No full textThe objective of this work was to evaluate the application of airborne laser scanning (ALS) to a large-scale eucalyptus stand inventory by the method of individual trees, as well as to propose a new method to estimate tree diameter as a function of the height obtained from point clouds. The study was carried out in a forest area of 1,681 ha, consisting of eight eucalyptus stands with ages varying from four to seven years. After scanning, tree heights were obtained using the local maxima algorithm, and total wood stock by summing up individual volumes. To determine tree diameters, regressions fit using data measured in the inventory plots were used. The results were compared with the estimates obtained from field sampling. The equation system proposed is adequate to be applied to the tree height data derived from ALS point clouds. The tree individualization approach by local maxima filters is efficient to estimate number of trees and wood stock from ALS data, as long as the results are previously calibrated with field data.O objetivo deste trabalho foi avaliar a aplicação do escaneamento a laser aerotransportado (ALS) na realização de inventário de povoamentos de eucalipto, em larga escala, por meio do método de individualização de árvores, bem como propor um novo método para estimativa dos diâmetros das árvores em função das alturas obtidas a partir da nuvem de pontos. O estudo foi conduzido em floresta de 1,681 ha, composta por oito povoamentos de eucalipto com idades entre quatro e sete anos. Após o escaneamento, foram obtidas as alturas das árvores pelo algoritmo de máximos locais, e o estoque total de madeira, pela soma dos volumes individuais. Para determinar os diâmetros das árvores, foram utilizadas regressões ajustadas a partir de dados medidos em parcelas de inventário. Os resultados foram comparados às estimativas obtidas via amostragem de campo. O sistema de equações proposto é adequado para ser aplicado aos dados de altura derivados da nuvem de pontos do ALS. O método de individualização de árvores com o filtro de máximos locais é eficiente para estimar o número de árvores e o estoque de madeira a partir dos dados do ALS, desde que os resultados sejam previamente calibrados com o inventário de campo
Adaptabilidade e estabilidade de genótipos de trigo de acordo com índice fenotípico de vigor de sementes
No full textThe objective of this work was to evaluate the adaptability and multi-trait stability of wheat (Triticum aestivum) genotypes according to the phenotypic index of seed vigor (PIV). Thirty wheat genotypes were grown in seven environments in the state of Rio Grande do Sul, Brazil, during one crop season. In each environment, a randomized complete block design with three replicates was used. The PIV was elaborated from the following traits: first germination count, germination percentage, accelerated aging, and electrical conductivity. The evaluated phenotypic index makes it possible to define macroenvironments for the production of wheat seeds with high physiological potential and to understand the implications of the genotype x environment interaction. The phenotypic index of seed vigor is effective to rank genotypes considering multi-trait selection related to the vigor of wheat seeds produced in Southern Brazil.O objetivo deste trabalho foi avaliar a adaptabilidade e a estabilidade multicaráter de genótipos de trigo (Triticum aestivum) de acordo com índice fenotípico de vigor de sementes (IFV). Trinta genótipos de trigo foram cultivados em sete ambientes, no Estado do Rio Grande do Sul, durante uma safra. Em cada ambiente, utilizou-se o delineamento de blocos ao acaso, com três repetições. O IFV foi elaborado a partir das seguintes características: primeira contagem da germinação, percentagem de germinação, envelhecimento acelerado e condutividade elétrica. O índice fenotípico avaliado possibilita definir macroambientes para a produção de sementes de trigo com alto potencial fisiológico e compreender as implicações da interação genótipo x ambiente. O índice fenotípico de vigor de sementes é efetivo para classificar os genótipos ao se considerar a seleção de múltiplas características relacionadas ao vigor de sementes de trigo produzidas na região Sul do Brasil
Corridas em homozigose para estimativa de autozigosidade e análise genômica em animais de produção
No full textRuns of homozygosity (ROHs) are long stretches of homozygous genomic segments, identifiable by molecular markers, which can provide genomic information for accurate estimates to characterize populations, determine evolutionary history and demographic information, estimate levels of consanguinity, and identify selection signatures in production animals. This review paper aims to perform a survey of the works on the efficiency of ROHs for these purposes. Factors such as genetic drift, natural or artificial selection, founder effect, and effective population size directly influence the size and distribution of ROHs along the genome. Individually, genome estimates of consanguinity based on ROHs can be obtained using the FROH index, which is generally considered more accurate than indexes based on other types of genomic or genealogical information. High frequencies of specific ROHs in a population can be used to identify selection signatures. The results of recent studies with ROHs in domestic animals have shown the efficiency of their use to characterize herds in a reliable and accessible way, using genomic information.As corridas em homozigose (ROHs) são longos trechos genômicos em homozigose, identificáveis por meio de marcadores moleculares, que podem fornecer informações genômicas para estimativas precisas, utilizadas para caracterizar populações, determinar história evolutiva e informações demográficas, estimar níveis de consanguinidade e identificar assinaturas de seleção em animais de interesse zootécnico. Este artigo de revisão tem por objetivo fazer um levantamento dos trabalhos sobre a eficiência de ROHs para essas finalidades. Fatores como deriva genética, seleção natural ou artificial, efeito fundador e número efetivo da população influenciam diretamente o tamanho e a distribuição das ROHs pelo genoma. Individualmente, a estimativa genômica de consanguinidade baseada em ROHs pode ser realizada por meio do índice FROH, que, em geral, é considerado mais preciso do que índices baseados em outros tipos de informações genômicas ou genealógicas. Altas frequências de ROHs específicas em uma população podem ser utilizadas para identificar assinaturas de seleção. Os resultados de trabalhos recentes com ROHs em animais domésticos têm mostrado a eficiência de seu uso para caracterização de rebanhos, de forma confiável e acessível, a partir de informações genômicas
Digestibilidade ileal de cálcio e fósforo em frangos de corte alimentados com rações com diferentes fitases e relações cálcio:fósforo disponível
No full textThe objective of this work was to determine the apparent ileal digestibility of calcium and phosphorus in broilers fed diets with different phytases and calcium:available phosphorus (Ca:aP) ratios. Two experiments were carried out: one with broilers with 22 to 33 days of age, and the other with broilers with 35 to 42 days. The Ca:aP ratios used were 4.5:1.0, 6.0:1.0, and 7.5:1.0 in the first period, and 3.5:1.0, 5.0:1.0, and 6.5:1.0 in the second. All diets were supplemented with 1,500 units of phytase activity per kilogram of six different sources of microbial phytase. At the end of each experiment, two broilers per replicate were slaughtered to collect the ileal content. In the samples of digested food, the Ca and P contents were determined for later calculation of the apparent ileal digestibility coefficients of these minerals. The Ca:aP ratio influenced the activity of phytases, and the highest digestibility was observed with lower ratios, in both experiments. The phytases that provided greater digestibility coefficients were A, D, and E. In both ages evaluated, the inclusion of phytases in the feed improved the digestibility of Ca and P, which was also affected by the content of calcium and by the phytase source used.O objetivo deste trabalho foi determinar a digestibilidade ileal aparente do cálcio e do fósforo em frangos de corte alimentados com rações com diferentes fitases e relações cálcio:fósforo disponível (Ca:Pd). Foram realizados dois experimentos: um com frangos de 22 a 33 dias de idade, e outro com frangos de 35 a 42 dias. As relações Ca:Pd usadas foram de 4,5:1,0, 6,0:1,0 e 7,5:1,0, no primeiro período, e de 3,5:1,0, 5,0:1,0 e 6,5:1,0, no segundo. Todas as dietas foram suplementadas com 1.500 unidades de atividade de fitase por quilograma de seis diferentes fontes de fitase microbiana. Ao final de cada experimento, duas aves por repetição foram abatidas para a coleta do conteúdo ileal. Nas amostras de digestas, foram determinados os teores de Ca e P para posterior cálculo do coeficiente de digestibilidade ileal aparente destes minerais. A relação Ca:Pd influenciou a atividade das fitases, e a maior digestibilidade foi observada nas menores relações, em ambos os experimentos. As fitases que proporcionaram os maiores coeficientes de digestibilidade foram A, D e E. Em ambas as idades avaliadas, a inclusão de fitases às dietas aumentou a digestibilidade de Ca e P, a qual também foi afetada pelo teor de cálcio e pela fonte de fitase utilizada
Formulações comerciais de Bacillus spp. para o controle da podridão-abacaxi e a promoção de crescimento em cana-de-açúcar
No full textThe objective of this work was to evaluate the commercial formulations of Bacillus subtilis QST-713 and Bacillus pumilus QST-2808 on mycelial growth inhibition of Thielaviopsis paradoxa, for the control of the pineapple disease and growth promotion in sugarcane. The inhibition of mycelial growth was evaluated in paired culture tests. Bacillus isolates were transferred to Petri dishes 48 hours before the pathogen, and the zone of inhibition was determined. The direct effect of the autoclaved commercial formulations at 0, 0.001, 0.01, 0.1, 1.0, and 10.0% on the inhibition of pathogen mycelial growth was evaluated. Bacillus spp. potential in controlling the disease and promoting plant growth was evaluated in assays on plant development and disease severity, both under controlled conditions and in the field. Bacillus isolates inhibited pathogen mycelial growth; however, the isolates did not control the disease effectively in the growth chamber and in the field. In the field assay without infestation by the pathogen, all treatments with biocontrol agents and fungicide increased the yield of cane stalks and sugar per hectare, compared with the control. In the assay with infestation by the pathogen, the B. pumilus-based product (2.0 L ha-1) and fungicide differed from the control only for the variable number of tillers.O objetivo deste trabalho foi avaliar formulações comerciais de Bacillus subtilis QST-713 e Bacillus pumilus QST-2808 na inibição do crescimento micelial de Thielaviopsis paradoxa, para o controle da podridão-abacaxi e a promoção de crescimento em cana-de-açúcar. A inibição do crescimento micelial foi avaliada em cultura pareada. Os isolados de Bacillus foram transferidos para placas de Petri 48 horas antes do patógeno, e o halo de inibição foi determinado. O efeito direto das formulações comerciais autoclavadas a 0, 0,001, 0,01, 0,1, 1,0 e 10,0% foi avaliado quanto à inibição do crescimento micelial do patógeno. O potencial de Bacillus spp. em controlar a doença e promover o crescimento das plantas foi avaliado em ensaios quanto ao desenvolvimento das plantas e à severidade da doença, em condições controladas e em campo. Os isolados de Bacillus inibiram o crescimento micelial do patógeno; no entanto, não apresentaram controle efetivo da doença em câmara de crescimento e em campo. No ensaio de campo, sem infestação do patógeno, todos os tratamentos com agentes de biocontrole e fungicida aumentaram a produção de colmos e açúcar por hectare, em comparação à testemunha. No ensaio com infestação pelo patógeno, o produto à base de B. pumilus (2.0 L ha-1) e o fungicida diferiram da testemunha somente quanto à variável número de perfilhos
Qualidade do solo e produtividade de soja em sistema de integração lavoura-pecuária em plantio direto
No full textThe objective of this work was to evaluate the quality of the soil and its relation with soybean (Glycine max) yield in an integrated crop-livestock system (ICLS), with intercropping between grasses and legumes in the pasture phase. The experiment was carried out in the state of Mato Grosso, Brazil, on a dystrophic Oxisol, in which grasses (Megathyrsus maximus \u27BRS Tamani\u27 and Urochloa brizantha \u27BRS Piatã\u27), intercropped with cowpea (Vigna unguiculata \u27BRS Tumucumaque\u27) and pigeon pea (Cajanus cajan \u27BRS Mandarim\u27), were cultivated after soybean harvest. A randomized complete block design was used, with three replicates, in a split-plot arrangement, in which grasses were considered as plots, and legumes as subplots. Legume intercrops provided increases of C and total N stocks. The intercrops caused the increase of C and N of the microbial biomass, whereas the single cultures contributed to stress in the soil microbiota. The activity of the urease enzyme was sensitive to management changes in the short term, but acid phosphatase and β-glucosidase were poorly sensitive indicators. Soil quality is high with intercropping between grasses and legumes, with positive effects on soybean grain yield.O objetivo deste trabalho foi avaliar a qualidade do solo e sua relação com a produtividade de soja (Glycine max) em sistema de integração lavoura-pecuária (ILP), com consórcio entre gramíneas e leguminosas na fase pastagem. O experimento foi realizado no Estado de Mato Grosso, em um Latossolo Vermelho distrófico, em que gramíneas (Megathyrsus maximus \u27BRS Tamani\u27 e Urochloa brizantha \u27BRS Piatã\u27), consorciadas com feijão-caupi (Vigna unguiculata \u27BRS Tumucumaque\u27) e feijão-guandu (Cajanus cajan \u27BRS Mandarim\u27), foram cultivadas após a colheita da soja. Um delineamento experimental de blocos ao acaso foi utilizado com três repetições, em arranjo de parcelas subdivididas, em que as gramíneas foram consideradas como parcelas, e as leguminosas, como subparcelas. Os consórcios com leguminosas proporcionaram incrementos dos estoques de C e N total. Os consórcios causaram o aumento de C e N da biomassa microbiana, enquanto os cultivos solteiros contribuíram para o estresse da microbiota do solo. A atividade da enzima urease foi sensível às alterações de manejo em curto prazo, porém a fosfatase ácida e a β-glucosidase foram indicadores pouco sensíveis. A qualidade do solo é elevada com os consórcios entre gramíneas e leguminosas, com efeitos positivos sobre a produtividade de grãos de soja
Detecção e avaliação de assinaturas de seleção em ovinos
No full textThe recent development of genome-wide single nucleotide polymorphism (SNP) arrays made it possible to carry out several studies with different species. The selection process can increase or reduce allelic (or genic) frequencies at specific loci in the genome, besides dragging neighboring alleles in the chromosome. This way, genomic regions with increased frequencies of specific alleles are formed, caracterizing selection signatures or selective sweeps. The detection of these signatures is important to characterize genetic resources, as well as to identify genes or regions involved in the control and expression of important production and economic traits. Sheep are an important species for theses studies as they are dispersed worldwide and have great phenotypic diversity. Due to the large amounts of genomic data generated, specific statistical methods and softwares are necessary for the detection of selection signatures. Therefore, the objectives of this review are to address the main statistical methods and softwares currently used for the analysis of genomic data and the identification of selection signatures; to describe the results of recent works published on selection signatures in sheep; and to discuss some challenges and opportunities in this research field.O recente desenvolvimento de painéis de “single nucleotide polymorphisms” (SNPs) distribuídos ao longo do genoma possibilitou a realização de diversos trabalhos com diferentes espécies. O processo seletivo promove o aumento ou a diminuição da frequência alélica (ou gênica) em loci específicos do genoma, além de promover o arrasto dos alelos próximos no cromossomo. Desta forma, são formadas regiões do genoma com o aumento na frequência de determinados alelos na população, o que caracteriza a assinatura de seleção. A detecção destas assinaturas é importante para a caracterização dos recursos genéticos, bem como a identificação de genes ou regiões envolvidos no controle e na expressão de características de importância produtiva e econômica. Os ovinos são uma importante espécie para estes estudos, uma vez que encontram-se amplamente dispersos em diferentes ambientes e apresentam grande diversidade fenotípica. Devido à grande quantidade de dados gerados nas análises genômicas, são necessários métodos estatísticos e programas específicos para a detecção de assinaturas de seleção. Assim, os objetivos deste artigo de revisão são apresentar os principais métodos estatísticos e os programas atualmente utilizados para análise de dados genômicos e a detecção de assinaturas de seleção; descrever os resultados dos recentes trabalhos publicados sobre assinaturas de seleção em ovinos; e discutir alguns desafios e oportunidades nesta área de pesquisa
Características morfofisiológicas dos frutos e das sementes de guanandi durante a maturação e o ponto de coleta
No full textThe objective of this work was to determine the relationship of the morphological and physiological characteristics of guanandi (Calophyllum brasiliense) fruit and seeds with ripening and harvesting time. The reproductive cycle of a native plant population, located in the coast of the state of Paraná, Brazil, was monitored from anthesis until fruit dispersion, during three years. Monthly harvests were performed, and the morphological and physical aspects (color, size, dry mass, and moisture content) of fruit and embryos were evaluated, as well as the physiological ones (germination and vigor) of seeds. The ripening process of guanandi seeds occurred between 200 and 240 days after anthesis (DAA), with anthesis peak in February and fruit dispersion in October. The maximum dry matter mass accumulation was not synchronized with the maximum physiological potential of the seeds. Germination potential was reached close to the middle of the maturation process, and maximum vigor at the end of the cycle. Fruit external color did not change from 110 DAA onwards. The morphological characteristics related to harvesting time are fruit pulp and embryo weakly adherent to the endocarp and to the tegument, respectively, as well as the dark-brown color of these tissues.O objetivo deste trabalho foi determinar a relação das características morfológicas e fisiológicas do fruto e da semente de guanandi (Calophyllum brasiliense) com a maturação e o ponto de coleta das sementes. O ciclo reprodutivo de uma população de plantas nativas, localizada no litoral do Estado do Paraná, foi monitorado da antese até a dispersão dos frutos, durante três anos. Realizaram-se coletas mensais, tendo-se avaliado aspectos morfológicos e físicos (cor, tamanho, massa de matéria seca e teor de água) dos frutos e dos embriões, bem como os fisiológicos (germinação e vigor) das sementes. O processo de maturação das sementes de guanandi ocorreu entre 200 e 240 dias após antese (DAA), com pico da antese em fevereiro e dispersão dos frutos em outubro. O máximo acúmulo de massa de matéria seca não esteve sincronizado com o máximo potencial fisiológico das sementes. O potencial germinativo foi atingido próximo à metade do processo de maturação, e o máximo vigor no final do ciclo. Não houve mudanças na coloração externa dos frutos a partir de 110 DAA. As características morfológicas relacionadas ao ponto de coleta são a fraca adesão da polpa do fruto e do embrião ao endocarpo e ao tegumento, respectivamente, além da coloração marrom-escura desses tecidos
Infectividade in vitro de Spodoptera frugiperda multiple nucleopolyhedrovirus a diferentes linhagens celulares de insetos
No full textThe objective of this work was to evaluate the response of an in vitro host range to Spodoptera frugiperda multiple nucleopolyhedrovirus (SfMNPV), a pathogenic virus to the fall armyworm (Spodoptera frugiperda, Lepidoptera: Noctuidae), for the further development of a biopesticide based on cell culture systems. The cell lines from Bombyx mori (BM-5), Lymantria dispar (IPLB-LD-625Y), Trichoplusia ni (BTI-Tn-5B1-4), Anticarsia gemmatalis (UFL-AG-286), and S. frugiperda (IPLB-SF-21AE and Sf9) were tested for their susceptibility to a highly-virulent Brazilian isolate of SfMNPV. The cytopathic effects induced by the virus, the production of viral particles, and the synthesis of viral polypeptides were examined and compared. Both S. frugiperda cell lines showed hypertrophy of cell nuclei and production of many polyhedra. The SDS-Page of radiolabed proteins showed that the cell protein synthesis was shutoff, while an intense band of about 30 kDa, recognized as polyhedrin, was synthesized. The other cell lines did not show polyhedra production, although some of them underwent morphological changes and protein synthesis shutdown in response to virus infection. The SF-21 and Sf9 cell lines are recommended for further in vitro production of SfMNPV.O objetivo deste trabalho foi avaliar uma gama de hospedeiros, in vitro, quanto à resposta a Spodoptera frugiperda multiple nucleopolyhedrovirus (SfMNPV), um vírus patogênico à lagarta-do-cartucho (Spodoptera frugiperda; Lepidoptera: Noctuidae), para o posterior desenvolvimento de um biopesticida baseado em sistema de cultura de células. As linhagens celulares de Bombyx mori (BM-5), Lymantria dispar (IPLB-LD-625Y), Trichoplusia ni (BTI-Tn-5B1-4), Anticarsia gemmatalis (UFL-AG-286) e S. frugiperda (IPLB-SF-21AE e Sf9) foram testadas quanto a sua suscetibilidade a um isolado brasileiro de SfMNPV altamente virulento. Os efeitos citopáticos induzidos pelo vírus, a produção de partículas virais e a síntese de polipeptídeos virais foram examinados e comparados. Ambas as células de S. frugiperda apresentaram hipertrofia dos núcleos celulares e produção de muitos poliedros. O SDS-Page de proteínas com radiomarcação mostrou que as proteínas celulares apresentaram inibição de síntese, enquanto uma intensa banda de cerca de 30 kDa, reconhecida como poliedrina, era sintetizada. As outras linhagens celulares não apresentaram produção de poliedros, apesar de algumas terem apresentado alterações morfológicas e inibição de síntese proteica em resposta à infecção viral. As linhagens celulares SF-21 e Sf9 são recomendadas para a posterior produção in vitro de SfMNPV.
Crescimento e qualidade de pimentas ornamentais em vaso tratadas com paclobutrazol
No full textThe objective of this work was to evaluate the action of paclobutrazol (PBZ) on the growth and ornamental value of two pepper accessions and two commercial cultivars of ornamental pepper – Biquinho Vermelha and Bode Amarela. A PBZ aqueous solution (250 mL) was used to soak the substrate at 0, 20, 40, and 60 mg L-1 a.i. concentrations when the plants had 12 cm height. At the end of plant growth, the follwoing parameters were evaluated: plant height, chlorophyll content in leaves, number of fruit and leaves, and canopy compactness at the time the plants reached maturity to be marketed, with 30% of ripe fruit. Irrespective of the applied PBZ concentration, plant height diminished, and chlorophyll content increased. PBZ did not improve the ornamental characteristics of the genotypes \u27Biquinho Vermelha\u27 and 2334PB, which resulted in unsuitable plants for market requirements. For the genotypes 2345PB and \u27Bode Amarela\u27, the application of 20 mg L-1 of PBZ is the most indicated, and it results in plants with adequate ornamental characteristics required by the national market of flowers and ornamental plants.O objetivo deste trabalho foi avaliar a ação do paclobutrazol (PBZ) sobre o crescimento e valor ornamental de dois acessos e duas cultivares comerciais de pimenta ornamental – Biquinho Vermelha e Bode Amarela. Uma solução aquosa de 250 mL de PBZ foi adicionada aos vasos com 0, 20, 40 e 60 mg L-1 i.a., quando as plantas apresentavam 12 cm de altura. Ao final do crescimento, determinaram-se os seguintes parâmetros: a altura das plantas, o teor de clorofila das folhas, o número de frutos e de folhas, e a compacidade da parte aérea no estádio de maturidade das plantas, com 30% de frutos maduros. Independentemente da concentração de PBZ aplicada, houve redução da altura das plantas e aumento da concentração de clorofila nas folhas. O PBZ não melhorou as características ornamentais dos genótipos \u27Biquinho Vermelha\u27 e 2334PB, o que resultou em plantas inadequadas aos requisitos do mercado. Para os genótipos 2345PB e \u27Bode Amarela\u27, a aplicação de 20 mg L-1 de PBZ é a mais indicada e resulta em plantas com características ornamentais adequadas requeridas pelo mercado nacional de flores e plantas ornamentais