Alberto Sols Biomedical Research Institute
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Evolución Reticulada en Plantas Endémicas de la Península Ibérica
Tesis Doctoral inédita leída en la Universidad Autónoma de Madrid, Facultad de Ciencias, Departamento de Biología. Fecha de Lectura: 21-05-2025Esta Tesis tiene embargado el acceso al texto completo hasta el 21-11-2026Natural hybridization is now recognized as a widespread phenomenon with diverse evolutionary consequences. The Iberian Peninsula, a biodiversity hotspot, provides an ideal setting for studying plant hybridization. This thesis explores the role of homoploid hybridization in the diversification of Phalacrocarpum, an Iberian endemic angiosperm. It aims to establish a phylogenetic, temporal, and biogeographic framework and assess factors influencing diversification and hybridization. The findings contribute to evolutionary biology, taxonomy, and conservation strategies.
Chapter I reconstructs the evolutionary history of the Anthemideae tribe using high-throughput sequencing. It highlights ancient hybridization, plastid capture, and incomplete lineage sorting, leading to a revised classification. Chapter II investigates Phalacrocarpum evolution using molecular, genomic, and morphometric analyses, revealing cryptic diversity and confirming hybridization. Chapter III expands on these results, analyzing 261 samples with genomic techniques. It confirms multiple hybridization events, showing that hybridization between subsp. anomalum and subsp. hoffmannseggii gave rise to subsp. oppositifolium and introgressed populations. Additionally, hybridization between subsp. hoffmannseggii and subsp. oppositifolium contributed to a distinct lineage in the Galician-Portuguese border region. Chapter IV assesses ecological and geographic influences on hybridization. Niche modeling indicates climatic overlap between subspecies, supporting genomic evidence of recurrent hybridization, while niche divergence in hybrid lineages underscores environmental isolation. Geographic isolation during climatic fluctuations also played a key role in diversification. Additional analyses reveal genome size variation across lineages, influenced by introgression and repetitive DNA elements. Hybrid populations exhibit intermediate morphologies, supporting their hybrid origin. The Sanabria Valley hybridization is attributed to repeated backcrossing rather than an active hybrid zone.
The thesis concludes that integrating nuclear and plastid genomic data enhances understanding of Anthemideae phylogeny and Phalacrocarpum evolution. Hybridization, climatic changes, and geographic factors have driven diversification in Phalacrocarpum evolutionary history, necessitating taxonomic adjustments to reflect the identified lineage
SDFR: Synthetic Data for Face Recognition competition
Artículo escrito por un elevado número de autores, solo se referencian el que aparece en primer lugar, el nombre del grupo de colaboración, si le hubiere, y los autores pertenecientes a la UAMLarge-scale face recognition datasets are collected by crawling the Internet and without individuals' consent, raising legal, ethical, and privacy concerns. With the recent advances in generative models, recently several works proposed generating synthetic face recognition datasets to mitigate concerns in web-crawled face recognition datasets. This paper presents the summary of the Synthetic Data for Face Recognition (SDFR) Competition held in conjunction with the 18th IEEE International Conference on Automatic Face and Gesture Recognition (FG 2024) and established to investigate the use of synthetic data for training face recognition models. The SDFR competition was split into two tasks, allowing participants to train face recognition systems using new synthetic datasets and/or existing ones. In the first task, the face recognition backbone was fixed and the dataset size was limited, while the second task provided almost complete freedom on the model backbone, the dataset, and the training pipeline. The submitted models were trained on existing and also new synthetic datasets and used clever methods to improve training with synthetic data. The submissions were evaluated and ranked on a diverse set of seven benchmarking datasets. The paper gives an overview of the submitted face recognition models and reports achieved performance compared to baseline models trained on real and synthetic datasets. Furthermore, the evaluation of submissions is extended to bias assessment across different demography groups. Lastly, an outlook on the current state of the research in training face recognition models using synthetic data is presented, and existing problems as well as potential future directions are also discussedThe organization of this competition was supported by the H2020 TReSPAsS-ETN Marie Skłodowska-Curie early training network (grant agreement 860813) as well as the Hasler foundation through the “Responsible Face Recognition” (SAFER) project.
The work of BioLab team received funding from the European Union's Horizon 2020 research and innovation program under Grant Agreement No. 883356.
The submitted solution by the IGD-IDiff-Face team has been funded by the German Federal Ministry of Education and Research and the Hessian Ministry of Higher Education, Research, Science and the Arts within their joint support of the National Research Center for Applied Cybersecurity ATHENE.
The work of BiDA-PRA team was supported by INTER-ACTION (PID2021-1265210B-I00 MICINN/FEDER), Cátedra ENIA UAM-VERIDAS en IA Responsable (NextGenerationEU PRTR TSI-100927-2023-2), and R&D Agreement DGGC/UAM/FUAM for Biometrics and Cybersecurity. The work of BiDA-PRA team was also supported by the European Union - Next Generation EU through the Italian Ministry of University and Research (MUR) within the PRIN PNRR 2022 - BullyBuster 2 - the ongoing fight against bullying and cyberbullying with the help of artificial intelligence for the human wellbeing (CUP: F53D23009240001
Estudio contrastivo de la fraseología china y española en relación con la simbología de los términos de color
Tesis Doctoral inédita leída en la Universidad Autónoma de Madrid, Facultad de Filosofía y Letras, Departamento de Filología Española. Fecha de Lectura: 30-05-2025Esta Tesis tiene embargado el acceso al texto completo hasta el 30-11-2026La presente tesis tiene como objetivo explorar el simbolismo de las cinco palabras básicas de color: blanco, negro, amarillo, rojo y verde, y se centra en las similitudes y diferencias de estos términos cromáticos relativos a las unidades fraseológicas del chino y del español.
La metodología combina enfoques cualitativos y cuantitativos. En el nivel cualitativo, se establece una comparación entre los sistemas teóricos de la fraseología en ambas lenguas, y se realiza el análisis de los mecanismos semánticos y metafóricos que funcionan en las unidades fraseológicas que contienen términos cromáticos. En el nivel cuantitativo, se construye un corpus de 300 expresiones idiomáticas del chino y del español que contienen las cinco palabras de color, utilizando la herramienta del análisis de sentimiento para evaluar su equivalencia emocional.
Los resultados evidencian que el desarrollo de la fraseología en chino y español presenta ciertas similitudes, facilitando un sólido soporte teórico para futuros estudios contrastivos. Por otra parte, se desvela que el simbolismo de los términos cromáticos en las expresiones fraseológicas varía según las motivaciones culturales: por ejemplo, el símbolo de luto del blanco en chino resulta ausente en español, ya que en este idioma recae sobre el color negro. No obstante, el análisis de sentimiento evidencia una alta equivalencia emocional entre las expresiones de ambas lenguas, mostrando una motivación psicológica universal en la percepción de color.
En definitiva, esta tesis proporciona una nueva perspectiva para el estudio del simbolismo de los términos de color dentro de las unidades fraseológicas en distintas lenguas, considerando las influencias culturales y emocionales. La metáfora conceptual ayuda a revelar la diferencia cultural en el simbolismo de los colores, mientras que el análisis de sentimiento demuestra la convergencia emocional en ambas lenguas. Estimamos, modestamente, que este enfoque abre una nueva vía al estudio de los términos de color dentro de las unidades fraseológicas, por lo que puede aportar un innovador punto de vista al análisis de la comunicación en medios específicos, como el impacto del uso de este tipo de expresiones en la prensa digita
Interferon stimulated gene 15 (ISG15) modulates phenotype of vascular smooth muscle cells and pathological vascular remodeling
Introduction: Inflammation is a major determinant of abdominal aortic aneurysms (AAA). Interferon stimulated gene 15 (ISG15) has a role in vascular remodelling in AAA. This study investigates the mechanisms whereby ISG15 might affect vascular remodeling and function. Methods: We used vascular smooth muscle cells (VSMC) from wild type (ISG15+/+) o ISG15 knockout (ISG15−/−) mice, aorta from ISG15+/+ and ISG15−/− mice infused with angiotensin II (1.44 mg/kg/day, sc, 14 days), and human AAA. We also performed a model of recombinant ISG15 infusion (rISG15, sc, 100 and 500 ng/day, 14 days) in mice. Results: In VSMC, ISG15 deficiency increased the expression of contractile (Acta2, Tagln) and synthetic (Fn1, Col1a2, Col3, Col4) markers and decreased the expression of the calcification marker Spp1. Ang II infusion changed the expression of phenotype markers differently in aorta from ISG15+/+ or ISG15−/− mice. ISG15 expression showed a negative correlation with expression of contractile markers (ACTA2, CNN1), and with COL3a1, in human samples from patients with AAA or with stenotic aorto-iliac pathology. rISG15 infusion induced hypotrophic vascular remodelling in mesenteric arteries without affecting vascular mechanics. Aorta of ISG15−/− mice contracted more to thromboxane A2 analogue U46619, compared to ISG15−/−mice. Both aorta and mesenteric arteries from rISG15-treated mice showed less contractility than control mice. Conclusions: ISG15 participates in pathological vascular remodeling probably by modulating VSMC phenotype. These changes could also impact in the vascular functionEste trabajo ha sido realizado gracias a la financiación obtenida a través de la Fundación Española de Arteriosclerosis (Beca FEA 2021-Investigación Básica). Además, el estudio ha contado con financiación MCIN/AEI/10.13039/501100011033 y por “ERDF A way of making Europe”, PID2020-116498RB-I00, por las Redes de Investigación RED2022-134541-T financiada por MICIU/AEI/10.13039/501100011033 y por PI21/00084, del Fondo de Investigaciones Sanitarias de la Seguridad Socia
Subvertir y organizar Resistencia colectiva de las mujeres frente a las violencias en Rojava, Kurdistán sirio
Tesis Doctoral inédita leída en la Universidad Autónoma de Madrid, Facultad de Filosofía y Letras, Departamento de Estudios Árabes e Islámicos y Estudios Orientales. Fecha de Lectura: 04-12-2024Esta tesis tiene embargado el acceso al texto completo hasta el 04-06-2026En Rojava, Kurdistán sirio, las mujeres han enfrentado diversas formas de violencia,
principalmente d e carácter estructural y de género género. Durante los regímenes de Hafez al al-Asad
y, posteriormente, de Bas Bashar al al-Asad se implementaron políticas y medidas que afectaron a la población kur a en términos de acceso a derechos fundamentales. Est a marginación y ostra cismo político impactaron negativamente en diversos aspectos de la vida social,
económica y política del conjunto de la población, en donde las mujeres, además, enfrentaban
específicas formas de violencia de género género.
Desde el inicio de la denominada “Revolución de Rojava Rojava” (Şoreşa Rojava ), las
mujeres han impulsado activamente la transformación política de la región y la lucha frente
a las violencias que, históricamente, han contribuido a su exclusión política y social. En este
sentido, el objetivo de este trabajo es identificar cómo las mujeres en Rojava han resistido
colectivamente frente a las violencias estructural y de género. Con este propósito, se propone
un análisis e en dos esferas, que he denominado , de la "macropolítica", mediada por el Estado
y sus instituciones, y de la " micropolítica”, constituida por la familia y las relaciones
interpersonales , con el objetivo de identificar las formas en que se ha ejercido la violencia en
cada una de ellas.
Este análisis de las violencias en ambas esferas permitirá comprender cómo se
articulan y de qué forma las mujeres les han hecho frente. Un o de los argumentos centrales
que se discuten en este trabajo es que a partir de la Revolución de Rojava, la construcción de
organizaciones autónomas por parte de las mujeres l es ha permitido articular estrategias
diversas para identificar y hacer frente a las violencia violencias, y a su vez, reivindicar su “derecho a
la aparición” en la esfera político y social social, desde donde impulsan el fortalecimiento de la
autonomía y promueven formas de socialización no patriarcales.
La estructura de esta investigación se organiza en cinco capítulos capítulos. El primero presenta
la aproximación teórica a los conceptos de violencia, resistencia, derecho a la aparición y sujeto político como categorías analítica s centrales par para el desarrollo de la investigación. El
segundo capítulo, dividido en dos partes, examina las formas de resistencia protagonizadas
por el pueblo kurdo en las distintas regiones del Kurdistán, así como las violencias estructural
y de género que han sufrido
y de género que han sufrido tanto el pueblo kurdo en su conjunto tanto el pueblo kurdo en su conjunto como las mujeres en como las mujeres en particular, bajo los regímenes de Hafez al particular, bajo los regímenes de Hafez al-Asad y Bashar alAsad y Bashar al-Asad.Asad.
El tercer capítulo analiza analiza los cambios producidos los cambios producidos en la región en la región tras el inicio de io de la Revolución de Rojava ; El cuarto capítulo analiza El cuarto capítulo analiza los esfuerzos organizativos delos esfuerzos organizativos de las mujeres las mujeres en Kongra Star, Mala Jine, Jinwar y Jineolojî para enfrentar las violencias estructurales y de Kongra Star, Mala Jine, Jinwar y Jineolojî para enfrentar las violencias estructurales y de género. Finalmente, el quinto capítulo Finalmente, el quinto capítulo analiza analiza los retos que enfrenta la que enfrenta la Administración Autónoma del Norte y del Norte y Este de SEste de Siria frente al asedio permanente de frente al asedio permanente de diversos actores actores de la de la regió
Caracterización de las propiedades fisiológicas y metabólicas de los enterocitos durante la etapa neonatal
Tesis Doctoral inédita leída en la Universidad Autónoma de Madrid, Facultad de Ciencias, Departamento de Biología Molecular. Fecha de Lectura: 13-12-2024Esta tesis tiene embargado el acceso al texto completo hasta el 13-06-2026Durante la etapa neonatal de los mamíferos, los enterocitos enriquecidos en lisosomas (LREs) llevan a cabo la captación y la digestión intracelular de los nutrientes de la leche materna; en la región distal del intestino delgado. Al final de la lactancia, los LREs son reemplazados por enterocitos maduros al mismo tiempo que una serie de enzimas modulan su expresión génica para adaptarse a una dieta sólida. Sin embargo, los mecanismos que regulan estos procesos no han sido completamente descritos. Mediante análisis de transcriptómica (RNA-Seq) y modelos de ratón genéticamente modificados, esta tesis profundiza en estas cuestiones.
En primer lugar, utilizamos los modelos de ratón PllptKO y PllpcKO, que muestran un fenotipo de deficiencia en endocitosis similar al observado en modelos de pez cebra pllpKO, para validar la analogía funcional entre los LREs de ambos modelos. A continuación, describimos que los LREs presentan unos altos niveles de autofagia, acordes con su intensa actividad lisosomal. A través de RNA-Seq comparativo entre LREs, enterocitos neonatales no absorbentes (no-LREs), y enterocitos maduros (MECs), esclarecimos rutas críticas genéticamente reguladas en los LREs.
En base a la alta autofagia de los LREs, desarrollamos el ratón Atg16cKO para inhibir la autofagia en estas células. Los enterocitos neonatales Atg16cKO perdieron la capacidad de endocitar macro-proteínas, redujeron su contenido lisosomal, y acumularon gotas lipídicas (LDs), mitocondrias disfuncionales y especies reactivas de oxígeno (ROS).
Para confirmar y complementar los resultados de Atg16cKO, generamos el ratón TfamcKO para afectar la homeostasis mitocondrial de los LREs. Los enterocitos neonatales TfamcKO mostraron un aumento de mitocondrias dañadas y disfuncionales, así como de ROS; perdieron la capacidad de endocitar macro-proteínas, disminuyeron el tamaño y contenido de sus lisosomas, y acumularon ingentes cantidades de LDs en su citoplasma.
Dadas las analogías con los MECs, se estudió si el metabolismo de los enterocitos neonatales Atg16cKO y TfamcKO, era también más maduro. En ambos modelos KO, se observó una anticipación de la transición metabólica mediada por Blimp1, posiblemente debido al incremento observado en los niveles de ROS.
En conclusión, la interacción dinámica entre lisosomas y mitocondrias en los LREs resulta crucial para la adaptación metabólica y nutricional del intestino posnatal, contribuyendo al correcto desarrollo de un epitelio intestinal sano y maduroDuring the neonatal stage of mammals, lysosomal-enriched enterocytes (LREs) carry out the uptake and intracellular digestion of nutrients from breast milk, in the distal region of the small intestine. At the end of lactation, LREs are replaced by mature enterocytes while a series of enzymes modulate their genetic expression to adapt to a solid diet. However, the mechanisms that regulate these processes have not been fully described. Using transcriptomic analysis (RNA-Seq) and genetically modified mouse models, this thesis delves into these questions.
First, we use the PllptKO and PllpcKO mouse models, which exhibit a phenotype of deficient endocytosis similar to the one observed in pllpKO zebrafish models, in order to validate the functional analogy between the LREs of both models. Next, we describe that LREs present high levels of autophagy, consistent with their intense lysosomal activity. By conducting comparative RNA-Seq between LREs, non-absorptive neonatal enterocytes (non-LREs), and mature enterocytes (MECs), we were able to elucidate critical genetically regulated pathways in LREs.
Building on the high autophagy levels of LREs, we developed the Atg16cKO mouse to inhibit the autophagy in these cells. Atg16cKO neonatal enterocytes lost the ability to endocytose macroproteins, reduced their lysosomal content, and accumulated lipid droplets (LDs), dysfunctional mitochondria, and reactive oxygen species (ROS).
To confirm and complement the Atg16cKO results, we generated the TfamcKO mouse to affect mitochondrial homeostasis of LREs. TfamcKO neonatal enterocytes showed an increase in damaged and dysfunctional mitochondria and ROS, an abrogation of the ability to endocytose macro-proteins, decreased size and content of their lysosomes, and accumulation of substantial cytoplasmic LDs.
Given the analogies with MECs, we studied whether the metabolism of Atg16cKO and TfamcKO neonatal enterocytes was also more mature. In both KO models, an anticipation of the Blimp1-mediated metabolic transition was observed, possibly due to the observed increased in ROS levels.
In conclusion, the dynamic interaction between lysosomes and mitochondria in LREs performs a crucial function for the metabolic and nutritional adaptation of the postnatal intestine, contributing to the correct development of a healthy and mature intestinal epitheliumEste trabajo ha sido financiado por la ayuda al Proyecto de Investigación “Análisis molecular y biomecánico de la formación y el modelado del tubo intestinal en vertebrados” (BFU2017-83243-P), otorgada por el Ministerio de Ciencia, Innovación y Universidade
Tasa de complicaciones en drenajes ventriculares externos tipo Bactiseal® y Camino®: estudio comparativo unicéntrico
Tesis Doctoral inédita leída en la Universidad Autónoma de Madrid, Facultad de Medicina, Departamento de Cirugía. Fecha de Lectura: 16-12-2024Esta Tesis tiene embargado el acceso al texto completo hasta el 16-06-202
Aspectos internacionales de la protección de datos en los procedimientos de insolvencia: la posición del administrador del concurso
Subconjuntos funcionales de astrocitos en el núcleo accumbens
Tesis Doctoral inédita leída en la Universidad Autónoma de Madrid, Facultad de Ciencias, Departamento de Biología Molecular. Fecha de Lectura: 31-01-2025Esta tesis tiene embargado el acceso al texto completo hasta el 31-07-2026To fully understand how information is processed in the brain, we need techniques able
to specifically target and control the activity of those elements involved, including astrocytes.
These cells are key elements of brain circuits involved in regulating different aspects of neuronal
and synaptic physiology. However, they have been traditionally overshadowed by the emphasis
on neuronal activity when regulating behavior, being relegated to supporting elements. Unlike
neurons, organized into ensembles that encode different brain representations, astrocytes have
long been considered a homogeneous population. Taking into account that recent research has
started to evidence their rich heterogeneity, the main goal of this doctoral thesis is to understand
to which extent astrocytes are functionally specialized into distinct subsets within the same brain
region. To address this, nucleus accumbens (NAc) circuits have been dissected. The NAc is an
important integrator center in which converge for instance different glutamatergic signals coming
primarily from the medial prefrontal cortex (mPFC), basolateral amygdala (Amyg), and ventral
hippocampus (vHipp).
Using mice as experimental model, astrocytic calcium activity within the NAc has been
studied by a combination of multidisciplinary experimental and analytical methods, including
i) tool implementation to identify and manipulate functionally-specific astrocytes; ii) calcium
imagining recordings in astrocytes, ex vivo in acute slices and in vivo with fiber photometry; iii)
spatial analysis methods for mapping astrocytic activation; iv) patch-clamp electrophysiological
recordings ex vivo and in vivo with custom probes; v) optogenetic manipulations of neurons; vi)
selective expression of gain and loss of function actuators in astrocytes; vii) immunohistochemical
analysis.
The results include the implementation of two different tools to study astrocytic
functional subsets within entire circuits. Using them, they demonstrate ex vivo the specialization
of NAc astrocytes with respect to the main glutamatergic and dopaminergic inputs. Astrocytes
respond in a pathway-specific manner and show non-linear calcium activity in response to the costimulation
of simultaneous glutamatergic afferences. These integrative responses are not
observed in the entire astrocytic population, but in a subset of functionally specific astrocytes,
defined as astrocyte ensembles. Moreover, the existence in vivo of these ensembles was addressed,
revealing the presence of behavior-related astrocyte ensembles in the context of a Pavlovian
conditioning task. Gain and loss-of-function manipulations of the task ensemble demonstrate that
this subset of astrocytes is necessary for tuning a specific cue-reward association related to NAc
function. Our results show that this ensemble is related to such output only after a learning
process, pointing to astrocytes as brain memory encoders of specific representations.
In conclusion, this thesis presents novel tools for the functional study of astrocytes within
specific circuits and behaviors, demonstrating that these cells do not act in homogeneous
populations but that their activity is specialized into distinct astrocyte ensembles necessary for
the functional outputs of the mouse nucleus accumbensPara entender en profundidad cómo el cerebro procesa información, necesitamos técnicas
capaces de capturar y controlar específicamente la actividad de aquellos elementos involucrados,
incluyendo a los astrocitos. Estas células son clave en los circuitos cerebrales regulando diversos
aspectos de la fisiología sináptica y neuronal, sin embargo, han sido tradicionalmente relegados
como células de soporte a la hora de estudiar cómo la actividad cerebral modula nuestro
comportamiento. A diferencia de las neuronas, que se organizan en diferentes ensembles con los
que el cerebro codifica representaciones específicas, los astrocitos se han considerado un grupo
celular uniforme. Teniendo en cuenta que recientes investigaciones empiezan a dar evidencia de
la rica heterogeneidad presente en estas células, el principal objetivo de esta tesis doctoral es
entender hasta qué punto los astrocitos están funcionalmente especializados en subconjuntos
dentro de una misma región cerebral.
Para abordar esto, se han estudiado los circuitos del núcleo accumbens (NAc), un
importante centro integrador en el que confluyen diferentes señales como las glutamatérgicas
provenientes principalmente de la corteza prefrontal medial (mPFC), la amígdala basolateral
(Amyg) y el hipocampo ventral (vHipp). Utilizando como modelo experimental el ratón, se ha
estudiado la actividad de calcio en astrocitos del NAc mediante una combinación multidisciplinar
de métodos experimentales y analíticos, incluyendo: i) la implementación de herramientas
para identificar y manipular astrocitos funcionalmente específicos; ii) registros de imagen de
calcio en astrocitos, tanto ex vivo utilizando cortes agudos como in vivo mediante fotometría de
fibra óptica; iii) métodos de análisis espacial para mapear la activación de los astrocitos; iv)
registros electrofisiológicos patch-clamp ex vivo e in vivo mediante implantes fabricados; v)
manipulaciones optogenéticas de neuronas; vi) expresión selectiva de moléculas que permiten
ganancia y pérdida de función en astrocitos; vii) análisis de inmunohistoquímica.
Los resultados incluyen la implementación de dos herramientas distintas, diseñadas para
discernir de entre toda la población subgrupos de astrocitos funcionalmente específicos. Mediante
su uso se demuestra ex vivo que la actividad de calcio de los astrocitos del NAc está especializada
con respecto a las principales vías de entrada glutamatérgicas y dopaminérgicas. En este contexto,
se muestra que los astrocitos responden de manera específica a los estímulos provenientes de
cada una de estas aferencias, adaptando sus respuestas de manera no lineal cuando la información
proviene de la co-estimulación simultánea de distintas vías glutamatérgicas. Estos patrones
integradores no se observan en el total de los astrocitos del accumbens, sino en subgrupos
funcionales definidos como ensembles de astrocitos. La existencia de estos ensembles también se
estudió in vivo, revelando la presencia de ensembles comportamiento-específicos en el contexto
de una tarea Pavloviana. Experimentos de ganancia y pérdida de función demostraron que el
subgrupo de astrocitos asociado a dicha tarea es necesario para modular una asociación estímulorecompensa
específica y que está relacionada con la funcionalidad del NAc. Los resultados
muestran que la función de este ensemble sólo se observa tras pasar por un proceso de
aprendizaje, posicionando a los astrocitos como elementos de memoria capaces de codificar
representaciones específicas dentro del cerebro.
En conclusión, este trabajo presenta nuevas herramientas para el estudio funcional de los
astrocitos con respecto a circuitos y comportamientos específicos, demostrando que estas células
no actúan en poblaciones homogéneas, sino que su actividad está especializada en diferentes
ensembles astrocíticos, necesarios para las funciones emergentes del núcleo accumbens del ratónThis work has been funded and supported by the Ramón y Cajal Program (RYC-2016-20414) and
the Ministerio de Ciencia, Innovación y Universidades (RTI2018-094887-B-100 and PID2021-
122586NB-I00). Moreover, the PhD candidate has been awarded with an EMBO Scientific
Exchange Grant and with the second prize of the dissemination contest “Yo Investigo. Yo soy CSIC”
(CSIC) used to complete a 3 months’ internship at the laboratory of Prof. George Malliaras
(University of Cambridge, United Kingdom
Bioinformatic analyses of midkine-driven deregulation of melanoma and immune cells
Tesis Doctoral inédita leída en la Universidad Autónoma de Madrid, Facultad de Medicina, Departamento de Bioquímica. Fecha de Lectura: 31-01-2025Esta Tesis tiene embargado el acceso al texto completo hasta el 31-07-2026El melanoma cutáneo es un tumor intrínsecamente agresivo, en el que cerca de la mitad de los pacientes metastásicos presentan o desarrollan resistencia a la inmunoterapia. Los mecanismos subyacentes de esta neoplasia siguen siendo poco conocidos, aunque se han asociado parcialmente a una marcada «reeducación» del microambiente tumoral que afecta a diversos componentes del sistema inmunitario. Elucidar las bases moleculares de esta reorganización es un reto importante en el melanoma, que se complica en gran medida por la notable heterogeneidad de estas células. Varios estudios genéticos, computacionales y funcionales han abordado esta heterogeneidad, identificando diferentes subpoblaciones tumorales que pueden influir en la progresión y la respuesta a la terapia. Sin embargo, aún existe una discrepancia significativa en cuanto a la relevancia funcional y, en particular, la regulación dinámica y la modulación de esta variabilidad. Nuestro grupo ha identificado previamente la proteína Midkine (MDK) como un factor de crecimiento pro-metastásico secretado por el melanoma, que actúa en parte vía la expansión de la vasculatura linfática. Además, hemos descubierto que MDK reconfigura el microambiente de los melanomas cutáneos hacia fenotipos inmunosupresores e inmunotolerantes. Esta tesis doctoral se propuso para definir hasta qué punto MDK puede ejercer nuevas funciones sobre distintas subpoblaciones celulares en el melanoma, en su caso, delinear posibles nuevos puntos de interacción con distintos componentes del sistema inmunitario. Los objetivos específicos fueron (1) definir el impacto de MDK en la heterogeneidad del melanoma, centrándonos en las fases premetastásicas, y (2) caracterizar su interacción con el microambiente inmunitario. Para ello, seleccionamos un modelo celular (la línea B16-R2L), en el que habíamos identificado previamente funciones pro-tumorales de MDK. Con línea celular realizamos un análisis exhaustivo mediante secuenciación de RNA de célula única, que creemos es el primero de su tipo con respecto a MDK y fases premetastáticas en el melanoma. Además, (3) para asegurar la relevancia fisiológica de nuestro modelo y aumentar su posible impacto, los datos obtenidos se evaluaron en el contexto de la literatura sobre melanoma y otros tipos tumorales. En última instancia, demostramos que, antes de la diseminación metastásica, MDK promueve un fenotipo asociado a hipoxia/estrés con enriquecimiento de las cascadas del metabolismo de la glucosa, mientras que reprime varias vías de presentación de antígenos. También hemos descubierto redes inesperadas de comunicación entre el melanoma y las células inmunitarias, en las que intervienen SEM3A, MIF y la señalización asociada al MHC, entre otras. Además, hemos identificado una firma «maligna» asociada a MDK (MDK-MAL) que define una mala supervivencia global en pacientes con melanoma no tratados y tratados con inmunoterapia. En conjunto, esta tesis informa sobre los mecanismos moleculares por los que MDK contribuye a la progresión del melanoma, y pone de relieve posibles dianas para la intervención terapéutic