Alberto Sols Biomedical Research Institute

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    Resonadores basados en nanohilos para espectrometría nanomecánica

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    Tesis Doctoral inédita leída en la Universidad Autónoma de Madrid, Facultad de Ciencias, Departamento de Química Física Aplicada. Fecha de Lectura: 03-02-2025Esta tesis tiene embargado el acceso al texto completo hasta el 03-08-2026La espectrometría nanomecánica es una técnica de caracterización emergente capaz de medir las propiedades mecánicas de una amplia variedad de analitos, proporcionando una combinación única de resolución suficiente para medir partículas individuales junto con un alto rendimiento. El análisis de dichas propiedades, principalmente masa y rigidez, juega un papel crucial en muchos problemas de investigación en múltiples disciplinas, incluidas la biomedicina, bioquímica, química analítica, física, ciencia de materiales, nanotecnología y las aplicaciones medioambientales. El objetivo general de esta tesis es la aplicación de resonadores mecánicos basados en nanohilos como sensores de masa y rigidez en espectrometría nanomecánica. Las características específicas de los resonadores basados en nanohilos hacen que este tipo de dispositivos sean particularmente adecuados para la detección de masa y rigidez de analitos nanoparticulados como nanopartículas inorgánicas, nanoestructuras tipo core-shell, micelas poliméricas y vesículas extracelulares o liposomas, con el fin de su caracterización, detección o identificación. Sin embargo, no se ha descrito previamente un enfoque integral y sistemático que aborde esta línea de investigación. Esta investigación está particularmente centrada en la detección de nanopartículas suspendidas en soluciones líquidas. Este enfoque es relevante para la aplicación de la espectrometría nanomecánica a una amplia variedad de analitos nanoparticulados, ya que dichos materiales a menudo se generan en entornos líquidos o requieren de estos para su preservación. Una aplicación particularmente significativa de cara al futuro es el desarrollo de una tecnología capaz de detectar virus de manera rápida, sensible y no selectiva, con la capacidad de proporcionar también información sobre la infectividad viral, dadas las características singulares de masa y rigidez que tienen las partículas virales. Como primer paso hacia el objetivo general, se examinan los fundamentos que describen el funcionamiento de los resonadores basados en nanohilos como sensores de masa y rigidez de nanopartículas, con el fin de proporcionar un marco teórico simplificado, integral y analítico. Este estudio desarrolla un modelo capaz de predecir el rango dinámico mecánico intrínseco de los nanohilos, alcanzando valores destacadamente elevados—hasta 100 dB—para dispositivos con dimensiones relevantes desde una perspectiva tecnológica. La expresión del rango dinámico permite obtener los límites fundamentales de detección en masa y rigidez para este tipo de resonadores, que se encuentran alrededor de cinco y dos órdenes de magnitud por debajo de los efectos de masa y rigidez respectivos predichos para analitos nanoparticulados representativos. Este marco proporciona un conjunto de reglas de diseño para la optimización de los sensores de cara a la detección de analitos específicos. Además, se ha desarrollado una nueva metodología experimental para la implementación de sensores nanomecánicos a partir de resonadores basados en nanohilos. El enfoque presentado permite la caracterización de la respuesta dinámica de nanohilos de silicio fabricados mediante el mecanismo vapor-líquido-sólido en la configuración más sencilla posible —crecidos verticalmente y con una distribución arbitraria sobre un sustrato de silicio—, tras el desarrollo de un método innovador de transducción óptica que es lineal a lo largo de todo el rango dinámico intrínseco de los dispositivos. Esta caracterización permite validar el modelo del rango dinámico y medir ligeras fluctuaciones en la frecuencia de resonancia de los dispositivos, las cuales determinan su resolución experimental en aplicaciones de detección, típicamente degradada en uno o dos órdenes de magnitud con respecto a los límites fundamentales de detección. Finalmente, esta metodología ha sido demostrada en esta tesis para dos aplicaciones particulares. Primero, para la detección nanomecánica de caudal de masa en nanofluídica abierta, al operar los nanohilos simultáneamente como sensores de masa y como canales nanofluídicos abiertos para controlar el caudal de líquidos en la nanoescala mediante la aplicación de potenciales eléctricos, alcanzando una precisión sin precedentes. Segundo, para la caracterización de nanopartículas suspendidas en volúmenes de líquido extremadamente pequeños, permitiendo el desarrollo de una espectrometría nanomecánica en la que las nanopartículas son capturadas por el sensor directamente desde un pequeño reservorio de líquido. Ambas aplicaciones se benefician de la introducción de líquidos iónicos como elementos innovadores para la realización de medidas de alta resolución en resonadores basados en nanohilos interactuando con líquidos, ya que la presión de vapor extremadamente baja de los líquidos iónicos a temperatura ambiente permite operar en alto vacío con pérdidas insignificantes por evaporación. Este enfoque ofrece una estrategia alternativa frente al desafío que supone la transferencia de analitos a la superficie microscópica de los resonadores de manera individual y eficiente, lo que se demuestra experimentalmente mediante la detección y caracterización precisa de la masa de poblaciones de nanopartículas suspendidas en un reservorio con un volumen de nanolitros. En conclusión, los resultados presentados demuestran la operación combinada de nanohilos como sensores nanomecánicos de alta precisión y como canales nanofluídicos abiertos controlables, abriendo una puerta al desarrollo de tecnologías innovadoras para la implementación de espectrometría nanomecánica de analitos nanoparticulados suspendidos en líquidos. El análisis completo de los límites de detección y del funcionamiento de esta aproximación sugiere que es particularmente apropiada para la detección y caracterización de virus individuales contenidos en un volumen reducido de muestra líquida, con un alto rendimiento y pérdidas de muestra insignificantesThis work was supported by the ERC CoG Grant 681275 “LIQUIDMASS”; by the Spanish Science, Innovation and Universities Ministry through Projects “EXOFLUX” (PGC2018-101762-B-I00) and “MOMPs” (TEC2017-89765-R); project PID2021-128395OB-I00 funded by MCIN/AEI/10.13039/501100011033/FEDER, UE; Projects PDC2022-133944-I00 and PLEC2021-007892 funded by MCIN/AEI/10.13039/501100011033 and European Union “NextGenerationEU”/PRTR; Projects S2022/BMD-7437 and Y2020/BIO-65194 funded by Comunidad de Madrid; Project AES (DTS21/00136) funded by ISCIII/Unión Europea/FEDER. We also acknowledge the service from the Micro and Nanofabrication Laboratory at IMN-CNM, funded by the Comunidad de Madrid (Project S2018/NMT-4291 TEC2SPACE) and by MINECO (project CSIC13-4E-1794 with support from FEDER, FSE

    El Túmulo 1 de la necrópolis de Las Cumbres en el Puerto de Santa María (Cádiz). Análisis arqueológico, histórico-cultural, ritual y simbólico

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    Tesis Doctoral inédita leída en la Universidad Autónoma de Madrid, Facultad de Filosofía y Letras, Departamento de Prehistoria y Arqueología. Fecha de Lectura: 21-02-2025Esta tesis tiene embargado el acceso al texto completo hasta el 21-08-2026Este trabajo de investigación se efectúa sobre el material procedente de las excavaciones arqueológicas realizadas en el Túmulo 1 de la necrópolis de Las Cumbres, en El Puerto de santa María (Cádiz), Se incluyen en el programa de investigación de la ciudad fenicia del Castillo de Doña Blanca, que ha ofrecido una visión distinta de los fenicios e indígenas en la Bahía Gaditana. En este sentido, el Túmulo 1 ofrece muchas novedades en el conocimiento de las necrópolis del Bronce Final y del Periodo Orientalizante o tartesico, en los aspectos relativos al conocimiento de las costumbres funerarias, tipos de tumbas y los materiales que la acompañan, y de modo muy especial el tema de los rituales, prácticamente desconocidos en esta época arcaica. Y sobre todo las relaciones entre los fenicios y los habitantes autóctonos en el proceso de integración o interacción entre ambas sociedades. Las excavaciones efectuadas metódicamente y con objetivos concretos han proporcionado importantes resultados en el mundo funerario de las sociedades indígenas y fenicias del siglo VIII a.C. Se dan a conocer las tumbas del túmulo, los materiales cerámicos y de metal que integran las tumbas y rituales en torno a la muerte por ahora muy desconocidos, el cerramiento del túmulo y el banquete funerario que se realizó en su clausura, por ejemplo. Y asimismo, la vida en esta necrópolis colectiva durante el tiempo que estuvo en uso. Este trabajo es el primero que se realiza y se estudia con muchos datos y argumentos para conocer este período importante en Occidente que dio lugar a Tarteso. Se completa con una importante documentación de dibujos de materiales, planos de los rituales, estratigrafías de las tumbas y del túmulo, que constituyen novedades y la tesis de la importancia de los indígenas en la fundación de Gadir y el desarrollo posterior hasta el surgimiento de TartesoThis research work is carried out on the material from the archaeological excavations carried out in Tumulus 1 of the necropolis of Las Cumbres, in El Puerto de Santa María (Cádiz), which are included in the research program of the Phoenician city of Castillo de Doña Blanca, which has offered a different vision of the Phoenicians and natives in the Bay of Cadiz. In this sense, Tumulus 1 offers many novelties in the knowledge of the necropolis of the Final Bronze Age and the Orientalizing or Tartessian Period, in the aspects related to the funerary customs, types of tombs and the materials that accompany it, and in a very special way the rituals, practically unknown in this archaic epoch. And above all the relations between the Phoenicians and the native inhabitants in the process of integration or interaction between both societies. The excavations carried out methodically and with specific objectives have provided important results in the funerary world of the indigenous and Phoenician societies of the 8th century BC. This research presents the tombs of the tumulus, the ceramic and metal materials from the tombs and death rituals largely unknown until now, such as the enclosure of the tumulus and the funeral banquet that took place at its closure. And also, the life in this collective necropolis during the time it was in use. This work is the first to be carried out and studied with many data and arguments to know this important period in the West that gave rise to Tartessus. It is completed with an important documentation of drawings of materials, plans of the rituals, stratigraphies of the tombs and the tumulus, which constitute novelties and the thesis of the importance of the natives in the foundation of Gadir and the subsequent development until the emergence of Tartes

    Detección y segmentación en imágenes con datos sintéticos

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    Tesis Doctoral inédita leída en la Universidad Autónoma de Madrid, Escuela Politécnica Superior, Departamento de Tecnología Electrónica y de las Comunicaciones. Fecha de Lectura: 07-02-2025Esta Tesis tiene embargado el acceso al texto completo hasta el 07-08-2026En esta tesis presentamos contribuciones en el campo de segmentación semántica con un foco en el uso de datos sintéticos para entrenar modelos robustos y generalizables para su aplicación. Nuestra investigación explora múltiples aproximaciones, incluyendo combinaciones de modelos, funciones de pérdida y algoritmos diseñados para aliviar los costes de entreno en términos de recursos computacionales y de datos. Además, nos centramos en problemas intrínsecos de segmentación semántica como desbalanceo de clases, robustez de modelos y generalización a objetos no vistos durante entreno. La tesis se organiza en tres principales áreas de contribución. En primer lugar, proponemos técnicas para reducir los costes computacionales en el entrenamiento de modelos de segmentación semántica. Introducimos una estrategia de etiquetado suave que optimiza el rendimiento del modelo a resoluciones reducidas, logrando resultados comparables al estado del arte, pero con un uso significativamente menor de recursos. En segundo lugar, abordamos los requisitos de datos mediante el uso de datos sintéticos, presentando métodos para entrenar modelos con acceso limitado o nulo a datos reales etiquetados. Esto incluye soluciones para mitigar el desbalanceo de clases mediante el uso de ponderación adaptativa, mejorando significativamente la precisión del modelo incluso sin datos del mundo real. Finalmente, abordamos el problema inherente al entrenamiento con datos sintéticos: predicciones de baja entropía, incluso para categorías de objetos no vistas durante el entrenamiento. Este comportamiento compromete la fiabilidad de los modelos en entornos reales, donde se espera cierta incertidumbre. Para resolver esta limitación, proponemos el primer marco de adaptación de dominio no supervisado que permite a los modelos generalizar a clases no vistas. Al integrar modelos de visión-lenguaje con datos sintéticos, superamos los resultados de referencia anteriores, reduciendo a su vez la dependencia de grandes conjuntos de datos etiquetados. Los métodos propuestos son validados mediante una exhaustiva experimentación en múltiples conjuntos de datos, demostrando un rendimiento superior a las aproximaciones existentes tanto en segmentación semántica como panóptica. Esta investigación abre el camino hacia un entrenamiento más accesible, eficaz y flexible de modelos, contribuyendo al futuro de las aplicaciones que dependen del razonamiento visual. Todos los codigos estan disponibles en GitHubIt was supported by the Autonomous Univiersity of Madrid FPI grant programme and by the SEGA-CV (TED2021-131643A-I00) and the HVD (PID2021125051OB-I00) projects of the Ministerio de Ciencia e Innovación of the Spanish Governmen

    La confusa experiencia del paisaje de la periferia: invisibilidad, menosprecio y olvido

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    La investigación se integra en el proyecto Paisajes de la desigualdad en las periferias de las ciudades del Programa Estatal de Generación de Conocimiento y Fortalecimiento Científico y Tecnológico del Sistema de I+D+I, referencia PGC2018-098209-B-10

    Microbioma intestinal y sus asociaciones con la infección por SARS-CoV-2, la dieta y la polimedicación. Estudio metagenómico y computacional en población anciana institucionalizada y pacientes con persistencia viral

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    Tesis Doctoral inédita leída en la Universidad Autónoma de Madrid, Facultad de Ciencias, Departamento de Química Física Aplicada. Fecha de Lectura: 07-05-2025Esta Tesis tiene embargado el acceso al texto completo hasta el 07-11-2026Este trabajo ha sido financiado por el Ministerio de Ciencia, Innovación y Universidades. Proyecto de investigación NextGenerationEU, SGL2021-03-056. Proyecto de investigación 202470E05

    Strategic lawsuits against public participation (SLAPP’s) and access to justice

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    El trabajo analiza la Directiva 2024/1069, relativa a la protección de las personas que se implican en la participación pública frente a pretensiones manifiestamente infundadas o acciones judiciales abusivas («demandas estratégicas contra la participación pública»). Advierte de casos en los que se utilizan las acciones judiciales con la intención de silenciar el debate público. Por lo tanto, el acceso a la justicia tiene un objetivo intimidatorio y se aleja del ejercicio de los derechos reconocidos en la ley. Para ello, se promueven medidas procesales como la constitución de una caución por el demandante para responder de daños y perjuicios causados por la demanda, y también la desestimación temprana de pretensiones manifiestamente infundadas, además de otras. Los mecanismos procesales toman como punto de referencia las reglas de la buena fe procesal y el abuso del derecho al procesoThe paper analyses Directive 2024/1069, on protecting persons who engage in public participation from manifestly unfounded claims or abusive court proceedings (‘Strategic lawsuits against public participation’). It warns of cases where legal actions are used with the intention of silencing public debate. Therefore, access to justice has an intimidating objective and moves away from the exercise of the rights recognized in the law. To this end, procedural safeguards are promoted, such as security to cover the costs of the proceedings and, where applicable, to cover damages, early dismissal of manifestly unfounded claims. The procedural mechanisms take as their point of reference the rules of procedural good faith and abuse of procedural right

    Estrategias para la generación y explotación de datos de entrenamiento sintéticos en visión artificial a nivel de píxel

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    Tesis Doctoral inédita leída en la Universidad Autónoma de Madrid, Escuela Politécnica Superior, Departamento de Tecnología Electrónica y de las Comunicaciones. Fecha de Lectura: 20-03-2025Esta Tesis tiene embargado el acceso al texto completo hasta el 20-09-2026In recent years, the introduction of machine learning in computer vision methods has increased the demand for data that can be used to train them. Labeling data can be an expensive process, particularly for computer vision tasks such as semantic segmentation, where images have pixel-level labels for classification. For this reason, synthetic data plays a crucial role in the field of computer vision by offering data at scale, with automatic, perfect labels without the costs associated with data collection and labeling, enabling researchers and developers to create large-scale datasets with precise annotations, that cover a wide range of scenarios, including rare or dangerous situations that would be impractical to capture otherwise. Additionally, synthetic data helps mitigate privacy concerns, as it does not involve real individuals or sensitive information. However, synthetic data also has some notable drawbacks: A reduced variability compared to the real world, along with inherent differences between synthetic and real images, can substantially reduce the transferability and generalization of models trained exclusively on synthetic data. To address these challenges, this thesis explores different approaches to synthetic data generation and its applications in computer vision. It examines different techniques for creating synthetic datasets, starting with hand-crafted algorithms to generate synthetic data for semantic segmentation. Then, it explores how to adapt and exploit different simulation tools with multiple purposes: from generating a novel semantic segmentation dataset to discussing alternate methods to generate data that can produce more general models and finally introducing a novel simulation tool designed from scratch for generating spacecraft imagery with navigation tasks in mind. This work closes with a proposal on how to effectively utilize generative artificial intelligence to complete datasets for training computer vision models with novel, previously unseen classes, and investigates how these methods can be integrated into existing workflows to enhance model performance and generalizationThe work was supported by the Spanish Government(HVD project PID2021-125051OB-I00 and SEGA-CV project TED2021-131643A-I00

    The provision of quality public services as a tool to fight rural depopulation

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    Existe consenso en considerar que, entre los factores que inciden sobre el fenómeno de la despoblación rural, se encuentra la prestación de los servicios que demandan los ciudadanos y que inciden sobre su calidad de vida. Partiendo de esta premisa, parece evidente que las políticas de lucha contra la despoblación deberían incluir medidas destinadas a garantizar el acceso a los servicios públicos esenciales. Este estudio pretende abordar un análisis de los planes autonómicos de lucha contra la despoblación para verificar si tienen en cuenta esta variable dentro de su contenido y cómo la recogen. Y, adicionalmente, comprobar si se reserva un papel decisivo a los municipios en su implantaciónThere is a consensus that one of the factors affecting the phenomenon of rural depopulation is the provision of services demanded by citizens and which affect their quality of life. Based on this premise, it seems clear that policies to combat depopulation should include measures aimed at guaranteeing access to essential public services. This study aims to analyse the regional plans to combat depopulation in order to verify whether and how they take this variable into account in their content. And, additionally, to check whether a decisive role is reserved for the municipalities in their implementatio

    Efecto de la fertilización y el manejo del cultivo en la eficiencia de uso del nitrógeno y la sostenibilidad económica de sistemas agrícolas mediterráneos

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    Tesis Doctoral inédita leída en la Universidad Autónoma de Madrid, Facultad de Ciencias, Departamento de Química Agrícola y Bromatología. Fecha de Lectura: 08-04-2025Esta Tesis tiene embargado el acceso al texto completo hasta el 08-10-2026El desarrollo de esta tesis ha sido financiado mediante una beca FPI-SGIT2018-5, así como a través de proyectos competitivos de la Agencia Estatal de Investigación (ROTANDO, AGL2017-83283-C2-2-R, Orgamin-Plus CPP2021-008323; BIOFeRT PID2022-141721OB-C21, RTI2018-096268-B-I00 y RESUENA, PID2021-124041OB-C21), la Comisión Europea (EJP SOIL, Grant 862695) y de la Comunidad de Madrid (AGRISOST, P2018/BAA-4330

    Identificación de nuevos mediadores del remodelado vascular y la hipertensión artertial dependientes de calcineurina

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    Tesis Doctoral inédita leída en la Universidad Autónoma de Madrid, Facultad de Ciencias, Departamento de Biología Molecular. Fecha de Lectura: 03-04-2025Esta Tesis tiene embargado el acceso al texto completo hasta el 03-10-2026Cardiovascular diseases (CVD) are a leading cause of death worldwide, with arterial hypertension being the primary risk factor. The complex regulation of blood pressure through multiple mechanisms makes hypertension a challenging condition to treat, with a healthy lifestyle currently being the most effective approach. A deeper understanding of the molecular mechanisms underlying this pathology is crucial for the development of new therapies and the improvement of existing ones. The Renin-Angiotensin- Aldosterone System (RAAS) is a key regulator of blood pressure, with angiotensin II (AngII) acting as the main hypertensive agent, driving the activacion of several molecular pathways, including the calcineurin (Cn) pathway. Our previous studies highlighted the essential role of Cn in vascular smooth muscle cells (VSMCs) for inducing contractility and promoting arterial hypertension through vascular remodeling. In this thesis, we have explored the proteomic changes in the aorta caused by the absence of Cn in smooth muscle cells, identifying 70 proteins differentially regulated by Cn, with over half of these closely associated with arterial hypertension. Among these, we focused on the significance of two proteins, MYLK and vimentin, in vascular contractility and pathology. Pharmacological inhibition of MYLK using ML7 both prevented and reversed AngII-induced hypertension, as well as hypertension induced by other hypertensive agents such as norepinephrine (NE), by inhibiting myosin light chain (MLC) phosphorylation by MYLK. However, this inhibition alone leads to an increase in aortic diameter and exacerbates AngII-induced aortic dilation. Conversely, vimentin-deficient mice seem to resist AngII-induced vascular remodeling and hypertension, marking the first association between vimentin and these conditions. We propose that Cn-mediated induction of vascular contractility and cytoskeleton-related proteins could be associated with an increase in oxidative stress, which plays a major role in hypertension. Supporting this, smooth muscle-specific Cn-deficient mice exhibit lower expression of NOX4, a key contributor to oxidative stres

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