Alberto Sols Biomedical Research Institute
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Valorización material y energética de residuos ganaderos y lignocelulósicos mediante carbonización hidrotermal y digestión anaerobia
No full textTesis Doctoral inédita leída en la Universidad Autónoma de Madrid, Facultad de Ciencias, Departamento de Ingeniería Química. Fecha de Lectura: 24-05-2024Esta tesis tiene embargado el acceso al texto completo hasta el 24-11-2025La realización del presente trabajo ha sido posible gracias al apoyo
económico de la Comunidad Autónoma de Madrid (IND2019/ AMB AMB-17092) y
la empresa Arquimea Arquimea–AgrotechAgrotec
Dual-Stream CoAtNet models for accurate breast ultrasound image segmentation
Get PDFThe CoAtNet deep neural model has been shown to achieve state-of-the-art performance by stacking convolutional and self-attention layers. In particular, the initial layers of CoAtNet apply efficient convolutions for extracting local features out of the input image and the initial fine-resolution feature maps. In turn, the final layers apply more cumbersome Transformers in order to extract global features from the coarse-resolution feature maps. The model’s outcome directly depends on those final global features. This paper proposes an extension of the original CoAtNet model based on the introduction of a dual stream of convolution and self-attention blocks applied at the final layers of CoAtNet. In this way, those final layers automatically aggregate both local and global features extracted from the initial feature maps. Two dual-stream topologies have been proposed and evaluated. This Dual-Stream CoAtNet model exhibits a significant improvement on the segmentation accuracy of breast ultrasound images, thus contributing to the development of more robust tumor detection methodsThe Spanish Government partly supported this research through Project
TED2021-130081B-C21, and Project PDC2022-133383-I0
Estrategia multi-ómica y de genómica funcional para la mejora del diagnóstico de enfermedades neurometabólicas
No full textTesis Doctoral inédita leída en la Universidad Autónoma de Madrid, Facultad de Ciencias, Departamento de Biología Molecular. Fecha de Lectura: 09-04-2024Esta tesis tiene embargado el acceso al texto completo hasta el 09-10-2025La secuenciación masiva ha revolucionado el diagnóstico de las enfermedades metabólicas hereditarias, ya que permite confirmar la sospecha clínica y/o bioquímica en pacientes detectados mediante cribado neonatal o mediante estudios de clínica y genética bioquímica. Sin embargo, a pesar de los avances, la tasa diagnóstica en muchas patologías no supera el 70 %, debido tanto a la inespecificidad fenotípica y a la ausencia de marcadores patognomónicos, como a la detección de variantes de significado clínico incierto (VUS). En este trabajo, tomando como ejemplo dos grupos de patologías fenotípica y genéticamente muy heterogéneas, mostramos como una estrategia basada en una aproximación multi-ómica (fenómica, genética bioquímica, genómica y transcriptómica dirigida) combinada con genómica funcional y la difusión de los datos, en bases de datos de enfermedades raras, puede mejorar la tasa diagnóstica.
En este trabajo, describimos el estudio de dos patologías con tasas de diagnóstico extremadamente reducidas, el síndrome de deficiencia del transportador de glucosa 1 (GLUT1DS) y los defectos congénitos de glicosilación (CDG). GLUT1DS es un trastorno neurometabólico causado por una haploinsuficiencia de la proteína GLUT1, lo que produce un transporte defectuoso de glucosa al cerebro. Se han incluido 32 casos con sospecha de GLUT1DS, el 90.6 % con hipoglucorraquia. El estudio ha revelado una menor relación de este fenotipo con variantes en SLC2A1, un 18.1 % de los pacientes frente al 70 % descrito en otras poblaciones. El 34.4 % presentaban variantes en otros genes (SCN8A, SETD1B, SLC9A6, NKX2-1, ATP1A3, KCNQ2, CSNK2B, DNM1, NEXMIF y UNC13A), todos ellos relacionados con canales iónicos, factores de transcripción, enzimas, receptores de membrana o transportadores. Seis, de las once variantes detectadas, son nuevas, siendo tres de ellas VUS. El estudio de la expresión del mRNA de SLC2A1 ha sido valioso para verificar la patogenicidad de variantes en dicho gen y para proceder a la búsqueda de variantes más allá del exoma, pudiendo identificar una inserción de un elemento móvil de tipo LINE (Long Interspersed Nuclear Element), detectada por secuenciación de lecturas larga (LRS). En otros casos, los resultados sugieren que los niveles reducidos de mRNA pueden no estar asociados a variantes que afecten a SLC2A1 (pacientes con variantes en SLC9A6 y MAN2B2).
En el caso de CDG, un grupo de enfermedades causadas por defectos en la síntesis, en el procesamiento o la unión de glicanos que se encuentran en glicoproteínas o glicolípidos, se ha detectado que el 18.2 % de los pacientes presentaban variantes en genes previamente asociados a este síndrome (COG5, DPAGT1, PIGN, PMM2 y SRD5A3). Además, el 18.2 % de los pacientes presentaban variantes en otros genes (AIRE, CACNA1E, CPA6, DGUOK, FBN1, KCNJ8, OCRL, POLR3A y TARS2) y dos pacientes presentaron variantes en dos genes no asociados a enfermedad hasta el momento (KRTCAP2 y YIF1B). En total, describimos diez variantes nuevas, ocho de ellas VUS. La patogenicidad de la variante detectada en KRTCAP2 parece confirmarse mediante la recuperación funcional parcial del proceso de glicosilación, y en el caso de YIF1B, la agrupación y globalización de los resultados ha evidenciado que es un nuevo gen asociado a patología. Estos resultados ponen de manifiesto la heterogeneidad clínica y genética de los CDG, cuyo número de genes está en continuo crecimiento. Mediante estudios funcionales, hemos definido la patogenicidad de variantes detectadas en los genes COG5, DPAGT1 y PIGN.
Finalmente, destacamos el estudio de un caso de la cohorte de GLUT1DS por presentar rasgos fenotípicos compatibles con dicho síndrome y niveles bajos de mRNA de SLC2A1. Los estudios realizados (SNP array, secuenciación de genoma completo, LRS y genómica funcional) sugieren que este caso es una deficiencia en MAN2B2, gen incluido en el grupo de CDGEste trabajo ha sido posible gracias a un contrato de la red RAREGenomics, la Consejería de Educación, Juventud y Deporte de la Comunidad Autónoma de Madrid y el Fondo Social Europeo (B2017/BMD-3721) y un contrato concedido por la Asociación Española para el Estudio de las Metabolopatías Congénitas (AEPEMEC
Funciones adicionales del genoma viral en el ensamblaje y estabilidad de la cápsida de virus RNA
Get PDFTesis Doctoral inédita leída en la Universidad Autónoma de Madrid, Facultad de Ciencias, Departamento de Biología Molecular. Fecha de Lectura: 06-09-2023Esta Tesis tiene embargado el acceso al texto completo hasta el 06-03-2025La visión de los virus como un contenedor proteico, la cápsida, que protege el genoma viral es inadecuada. Mientras que la cápsida es un complejo macromolecular dinámico implicado en múltiples etapas del ciclo viral, el genoma no sólo es el cargo con la información genética, sino que también participa en otras funciones indispensables para la viabilidad de las siguientes generaciones de virus. En este trabajo hemos analizado las estructuras por crio-microscopía electrónica del rinovirus humano B-14 (HRV-B14), un virus RNA de cadena sencilla (ssRNA), y del virus del hongo Penicillium chrysogenum (PcV), un virus RNA de cadena doble (dsRNA).
El virión de HRV-B14, resuelto a 2.9 Å de resolución, está formado por una cápsida icosaédrica (~30 nm de diámetro) con un número de triangulación T=1 (P=3), constituida por 4 proteínas, VP1, VP2, VP3 y VP4. El ssRNA genómico se encuentra parcialmente organizado (~12%) en segmentos de dsRNA de14 pb en los ejes de simetría icosaédrica de orden 2, formando una caja dodecaédrica interna que contribuye a la estabilidad del virión mediante numerosas interacciones. Específicamente, las bases de los extremos del dsRNA están desapareadas e interaccionan con el Trp38 de VP2, y la Lys52 de VP2 interacciona en la interfaz entre el dsRNA y la cápsida; VP1 interacciona con el dsRNA con los aa Ser22, Lys13, Lys26 y Lys30. La cápsida vacía de HRV-B14, resuelta a 3.8 Å de resolución, está expandida un ~3% y presenta poros en forma de Z de distinto tamaño alrededor de los ejes de simetría icosaédrica de orden 2. Mientras que la localización del genoma en el virión está relacionada con su mecanismo de liberación posterior, donde interviene activamente la Lys52, la apertura asincrónica de los poros sugiere una salida preferencial del ssRNA viral por uno de ellos hacia el citoplasma de la célula huésped.
El chrysovirus PcV se ha resuelto a 2.14 Å de resolución. La cápsida T=1, de ~40 nm de diámetro, está constituida por 60 copias de un heterodímero de las versiones maduras de las proteínas P2 y P4, ambas procesadas en su región C-terminal. P2 y P4 tienen un plegamiento similar, compartido con las proteínas de la cápsida de otros micovirus dsRNA como totivirus y quadrivirus. El ~60% del genoma se dispone como una capa de filamentos de dsRNA, de ~20 Å de diámetro y separados entre si ~35 Å, en estrecho contacto con la superficie interna de la cápsida, donde las cargas negativas y positivas están representadas de manera similar. P4, en 18 (de 20) ejes de simetría icosaédrica de orden tres, está implicada en la organización del dsRNA genómico. Las cápsidas vacías de PcV, resueltas a 2.3 Å de resolución, indican cambios conformacionales en los ejes de orden 3 y tienen una menor rigidez mecánica que las cápsidas llena
Ayuno de corta duración como potenciador de la eficacia antitumoral: Perspectivas Inmunológicas y Sexuales
No full textTesis Doctoral inédita leída en la Universidad Autónoma de Madrid, Facultad de Ciencias, Departamento de Biología. Fecha de Lectura: 29-09-2023Esta tesis tiene embargado el acceso al texto completo hasta el 29-03-2025Fasting and fasting-mimicking diets (FMD) during chemotherapy treatment delay tumor progression in mice and show multiple beneficial effects on human cancer patients. Three reports in immunocompetent female mice demonstrated that these therapies increase anti-tumor CD8+ T cell infiltration in tumors and reduced immunosuppressive regulatory T cells (Treg) and M2 macrophages. In humans, fasting and FMD regimens have been used in combination with chemotherapy, reporting reduced side effects. Also, one report of FMD and chemotherapy combination showed an increased anti-tumor immune response in blood.
In mice, fasting shows a marked sexual dimorphism in its metabolic effects and non-metabolic aspects, such as the immune system. Therefore, we undertook an investigation to determine the influence of sex in the anti-tumor immune responses of 48 hours of fasting in combination with chemotherapy. Using a model of B16-F10 melanoma allografts, we observed that fasting strongly improved doxorubicin anti-tumor effects in males, but not in females. This sexual dimorphism was partly lost when mice were treated with oxaliplatin. Using castration in males and testosterone pellets in females, we show that testosterone levels are critical for the fasting-mediated benefits in this model. In contrast, mice bearing colon carcinoma MC38 allografts and treated with oxaliplatin displayed no sexual dimorphism in their response to fasting. We performed an in-depth immunological characterization of the B16-F10 and MC38 tumor models, analyzing tumor-draining lymph nodes, peripheral blood, and tumor samples. Fasting enhanced Natural Killer (NK) and Natural Killer T (NKT) infiltration in the B16-F10 tumors specifically in male mice, while fasting females showed increased exhaustion of tumor-infiltrating CD8+ T cells. In the MC38 model, fasting led to increased effector CD8+ T cells and Th1 CD4+ cells in the tumors, and limited the accumulation of tumor-associated macrophages in both sexes. These immune changes intratumorally are not always reflected in systemic tissues. Together, our results reveal that fasting can promote a different immune response depending on the tumor and chemotherapeutic agent used. Additionally, we provide evidence of sexual dimorphism in the anti-tumor effects of fasting under certain conditions, raising important clinical implications.
In human cancer patients, fasting or FMD studies are diverse regarding tumor and chemotherapy types. We performed a small clinical trial, that represents a first approximation in exploring the effect of 48 hours of fasting in combination with FOLFOX or XELOX in colorectal cancer patients. We observed some positive tendencies over the time. Fasting was well-tolerated and patients exhibited an improvement in the mental dimension of the SF-36. Immunologically, the response of fasting is similar to chemotherapy in peripheral blood, likewise in some populations in blood from mice treated with 48 hours fasting and oxaliplatin. Further research is needed to establish more robust conclusions in cancer patientsThis work has been supported by the following fellowships and grants:
• IMDEA Food PhD program. Andrés Pastor Fernández. 2018-2019.
• Spanish Association Against Cancer Scientific Foundation Fellowships. AECC. Andrés Pastor Fernández. PRDMA18011PAST. 2019-2023.
• RETOS Program. Pablo José Fernández Marcos. Spanish Ministry of Science, Innovation and Universities, SAF2017-85766-R (2018-2021), and Spanish Ministry of Science and Innovation, PID2020-114077RB-I00 (2021-2024), and Agencia Estatal de Investigación 10.13039/50110001103
CCT como modulador de la producción de vesículas extracelulares y el metabolismo de linfocitos T mediante las dinámicas de kinesina
No full textTesis Doctoral inédita leída en la Universidad Autónoma de Madrid, Facultad de Medicina, Departamento de Bioquímica. Fecha de Lectura: 22-09-2023Esta tesis tiene embargado el acceso al texto completo hasta el 22-03-2025Cell proteostasis includes gene transcription, protein translation, folding of de novo proteins,
post-translational modifications, secretion, degradation and recycling. One of the main mechanisms
of protein homeostasis maintenance involves the action of the endolysosomal system (ELS). ELS
includes lysosome-mediated degradation pathway, but also extracellular vesicles (EVs) biosynthesis
and release as a clearance mechanism. EVs contain proteins, lipids, nucleic acids and metabolites in
their composition. Another relevant modulators of cell proteostasis are chaperonins. The eukaryotic
chaperonin complex CCT has been described to be involved in the folding of key proteins related to
cytoskeleton dynamics, intracellular signalling and cell cycle regulation. CCT implication in T cell
metabolism, organelle positioning and cell activation through the T cell receptor (TCR) has remained
unexplored until now.
We found that all the CCT subunits and associated co-chaperones are loaded into EVs of T cells
by profiling the proteome of these vesicles. By limiting CCT cell-content and functionality employing
specific siRNAs, we studied the proteome of lymphoblastoid T cells and their released EVs. We showed
that CCT controls the proteins that are loaded into EVs and regulates the proteomic profile of these
cells. Our lipidomic and metabolic analyses demonstrated that CCT silencing also causes an altered
lipid composition and metabolic rewiring towards a lipid-dependent metabolism. Moreover, we
detected an increased glycolysis rate and peroxisome number and activity under CCT limited-content
conditions. Lipid droplets, other relevant organelles involved in lipid metabolism, were also smaller
and in lesser amounts in these conditions. These changes were accompanied by a dysregulation of the
dynamics of interorganelle contacts between lipid droplets, mitochondria, peroxisomes and the ELS.
This process accelerates the maturation of multivesicular bodies, leading to higher EVs production. CCT
was involved in the dynamic regulation of microtubule-based kinesin motors through the posttranslational
modification acetylation. Due to this microtubule and kinesin dynamics dysregulation, an
altered organelle distribution was observed. These findings relate chaperonin functioning with
organelle positioning and cellular metabolism regulation. Since organelle redistribution and metabolic
reprogramming are key events to a successful T cell activation, we studied the role of CCT on this
process. We observed an altered centriolar and microtubule organization, and an impaired TCR
downstream signalling, including mTORC1-depending pathways dysregulation upon T cell activation
when cells expressed limited amounts of CCT. Moreover, CD3 clustering at the immune synapse area
was deficient under CCT limited functioning. Altogether, our findings reveal an unexpected role of CCT
in organelle distribution, cellular metabolism regulation and, consequently, T cell activation through
cytoskeleton dynamics contro
Role of immune checkpoint receptors in myocarditis
Get PDFTesis Doctoral inédita leída en la Universidad Autónoma de Madrid, Facultad de Medicina, Departamento de Bioquímica. Fecha de Lectura: 21-09-2023Esta Tesis tiene embargado el acceso al texto completo hasta el 21-03-202
Mecanismos moleculares subyacentes a la CPVT2: calpaína como nueva potencial diana terapéutica
No full textTesis Doctoral inédita leída en la Universidad Autónoma de Madrid, Facultad de Medicina, Departamento de Bioquímica. Fecha de Lectura: 10-10-2023Esta tesis tiene embargado el acceso al texto completo hasta el 10-04-2025Catecholaminergic polymorphic ventricular tachycardia (CPVT) is an inherited
arrhythmogenic disease associated with sudden death in children and young adults.
CPVT2 is caused by loss-of-function (LoF) mutations in the gene encoding cardiac
calsequestrin (CASQ2), which along with triadin (TRDN) and junctin (JNT) regulates the
release of calcium ions from the sarcoplasmic reticulum via the cardiac ryanodine
receptor (RyR2). The homozygous mouse model Casq2R33Q/R33Q closely mimics the
clinical phenotype of CPVT2 patients. CASQ2, TRDN and JNT levels are markedly
reduced and the mechanisms underlying the decrease of these proteins are not fully
understood. Currently available treatments are not entirely effective and new therapeutic
options for CPVT patients are needed. The aim of this study was to identify the molecular
mechanisms regulating the decrease of these proteins in Casq2R33Q/R33Q mice, and to
explore their functional involvement in the disease.
Mass spectrometry proteomics revealed that Casq2-/- mice have a different adaptive
pattern from Casq2R33Q/R33Q mice, suggesting a specific effect of the R33Q mutation.
RyR2 inhibition in Casq2R33Q/R33Q mice treated with flecainide showed an increase in
CASQ2 and TRDN, suggesting an important role of SR Ca2+ leak in the mechanism
underlying their drop. Increased endoplasmic reticulum stress (ER stress) and UPR
pathway activity were observed in Casq2R33Q/R33Q mice which also exhibited alterations in
the major cellular proteolytic pathways: ubiquitin proteasome system (UPS), autophagy
and calpain. Experiments on isolated neonatal cardiomyocytes and adult mice treated
with inhibitors of these mechanisms showed that all of them were involved in CASQ2
degradation, whereas TRDN and JNT proteins levels were only increased when calpain
was inhibited. Calpain inhibition is the only treatment that increases CASQ2, TRDN and
JNT levels. In addition, VT episodes were reduced with this treatment in Casq2R33Q/R33Q
mice. Our results suggest that there is a crosstalk between these three proteolytic
mechanisms and identified calpain as a new promising therapeutic target for CPVT
patient
IF1 como regulador de la función bioenergética mitocondrial y su implicación en el sistema inmune
No full textTesis Doctoral inédita leída en la Universidad Autónoma de Madrid, Facultad de Ciencias, Departamento de Biología Molecular. Fecha de Lectura: 27-10-2023Esta tesis tiene embargado el acceso al texto completo hasta el 27-04-2025Mitochondria play a central role in cellular physiology, acting as metabolic and signaling
hubs. Mitochondrial ATP synthase integrates many of these functions, including ATP synthesis
by oxidative phosphorylation, the execution of cell death and the production of signaling
molecules. The ATPase inhibitory factor 1 (IF1) is the main physiological inhibitor of ATP
synthase. One goal of this study has been to elucidate the function of IF1 in the regulation of ATP
synthase and its implications on mitochondrial bioenergetics and structure. To this aim, we have
generated two knockout human cell lines for IF1 and a global IF1-knockout mouse model. We
demonstrate that in cells and tissues where IF1 is expressed, active and inactive fractions of IF1-
bound ATP synthase coexist in the same mitochondria. The interaction of IF1 with ATP synthase
regulates the activity of the enzyme, the rate of mitochondrial respiration, mitochondrial
membrane potential (ΔΨm), and the production of reactive oxygen species. Furthermore, IF1
controls the oligomerization of ATP synthase in IF1-expressing cells and influences the structure
of mitochondrial cristae. Lastly, we demonstrate that the intramitochondrial distribution of IF1
correlates with cristae microdomains of high ΔΨm, partially explaining the heterogeneous
distribution of ΔΨm in mitochondria.
IF1 exhibits a tissue- and species-specific expression pattern. Moreover, it is overexpressed
in cell types that acquire a proliferative phenotype and undergo metabolic reprogramming towards
an increased glycolysis, such as cancer cells or reprogrammed stem cells. Immune cells adopt a
similar phenotype upon activation. Therefore, another objective of this study has been to
characterize the expression and function of IF1 in the innate and adaptive immune systems,
specifically in murine bone marrow-derived macrophages (BMDM) and CD4+ T lymphocytes.
Quiescent CD4+ lymphocytes do not express IF1, but its expression is induced upon activation
and differentiation into the effector Th1 subtype. To study the implications of IF1 in the activation
of T lymphocytes, we have generated the first specific knockout mouse model of IF1 in T
lymphocytes (CD4-IF1-KO). Murine IF1-deficient CD4+ lymphocytes cannot activate and
proliferate properly, both in vitro and in vivo, due to the dysregulation of the ATP synthase
activity. As a result, CD4-IF1-KO mice have a compromised survival against infections. On the
contrary, quiescent, inflammatory and anti-inflammatory BMDM, despite presenting large
differences in metabolic activity, show no differences in the high expression levels of IF1.
However, genetic ablation of IF1 in BMDM alters their mitochondrial structure and bioenergetics,
predisposing them towards a more inflammatory phenotype. Overall, these results position IF1-
mediated regulation of ATP synthase activity as a key mechanism to understand the metabolic
and functional versatility of immune cellsEste trabajo ha sido financiado por una beca predoctoral del Ministerio de Economía y
Competitividad de España (FPU18/02234), El proyecto ha sido financiado por el Ministerio de
Economía y Competitividad de España (PID2019-108674RB-I00
Structural biology of Ca2+-mediated responses to abiotic stress in plants
No full textTesis Doctoral inédita leída en la Universidad Autónoma de Madrid, Facultad de Ciencias, Departamento de Biología Molecular. Fecha de Lectura: 23-11-2023Esta tesis tiene embargado el acceso al texto completo hasta el 23-05-2025El incremento de la salinidad de los suelos, agravado por el cambio climático y la escasez
de recursos, supone una grave amenaza para la agricultura a nivel global. Nuestra
dependencia de las cosechas para alimentar a la población evidencia la necesidad de
explorar nuevas herramientas y alternativas biotecnológicas que permitan mejorar la
respuesta de las plantas frente a la salinidad. Un aspecto clave para alcanzar ese objetivo
consiste en comprender y estudiar los sistemas adaptativos y regulatorios de las plantas
frente al estrés abiótico causado por el exceso de sal, que fundamentalmente incluye la
activación de rutas de respuesta a estrés que controlan la homeostasis iónica
intracelular. En este sentido, las plantas disponen de dos mecanismos de respuesta a
estrés salino: en las raíces, la ruta SOS bombea el Na+ al espacio extracelular; mientras
que en las hojas la ruta NHX1/CML18 asegura el equilibrio Na+/K+ y mantiene el
equilibrio homeostático a través de la vacuola. Este trabajo se ha centrado en el estudio
de las principales proteínas reguladoras de estas rutas: CBL4/SOS3 y CML18,
respectivamente.
Por un lado, en el trabajo se ha realizado una exhaustiva caracterización de la proteína
CBL4/SOS3, describiendo por primera vez la importancia de la singularidad de sus
motivos-EF de unión a Ca2+ y descubriendo su funcionamiento como sensor de Na+
intracelular en concentraciones fisiológicas. Para ello, se ha purificado la proteína
expresada en E. coli y se han empleado técnicas de cristalografía de proteínas, de
fluorescencia y de dicroísmo circular. Además, también se ha abordado la
caracterización de la interacción de CBL4/SOS3 con sus proteínas diana CIPK24/SOS2,
describiendo la formación del complejo incluso en ausencia de Ca2+ y Na+ y
caracterizando el papel de los sitios de unión a cationes en la estabilización y activación
del complejo; y con el antiportador SOS1, caracterizando la formación del complejo a
través de un dominio SOS-BD y estudiando el complejo CBL4/SOS1 en el contexto de la
proteína completa a través de su predicción estructural. Finalmente, se incluyen
también los resultados preliminares de una campaña de cribado de fragmentos a gran
escala realizada en colaboración con la Universidad de Oxford y el Sincrotrón Diamond
de Reino Unido, que han permitido identificar veinte fragmentos con el potencial de
interaccionar con y regular la actividad de CBL4/SOS3.
Por otro lado, el trabajo incluye un estudio de la proteína CML18. Esta proteína, que no
había sido estudiada en profundidad hasta la fecha, también ha sido purificada,
cristalizada, y empleada en ensayos bioquímicos y biofísicos de fluorescencia, dicroísmo
y calorimetría isotérmica de titulación. Así, los resultados obtenidos han permitido
resolver la estructura de esta proteína, y demostrar que CML18 no es sólo un sensor de
Ca2+ a concentraciones fisiológicas, sino que también juega un papel fundamental como
sensor de pH. Importantemente, su rol como sensor de pH resulta clave en su capacidad
para interaccionar con y regular al antiportador NHX1. El trabajo recoge experimentos
realizados con un péptido sintético que incluye la región CML-BD de interacción de NHX1
con CML18, y demuestra que la unión de CML18 a NHX1 debe ser inhibitoria y limitada
a pH ácidos. Además, se adjunta un análisis estructural de la interacción entre ambas
proteínas producido a partir de predicciones realizadas con AlphaFold. Estos resultados
han sido validados en plantas por nuestros colaboradores del laboratorio del Dr. José
Manuel Pardo y el Dr. Francisco Javier Quintero (IBVF-CSIC).
Como conclusión, los resultados presentados en este trabajo suponen un importante
avance en el conocimiento sobre la respuesta frente al estrés salino en plantas, y se
espera que este conocimiento sea útil para diseñar nuevas estrategias que permitan
mejorar el rendimiento de las cosechas en condiciones de estrés por salinidadEste trabajo ha sido posible gracias a una Ayuda a Contratos
Predoctorales para la Formación de Doctores (FPI PRE2018-083280) y al proyecto del
Programa Estatal de I+D+I Orientado a los Retos de la Sociedad de la Agencia Estatal de
Investigación PID2020-119805EB-I0