50140 research outputs found
Sort by
Le respect de la dignité des femmes dévoilant une agression à caractère sexuel:perspectives d'intervenantes sociales et communautaires Montréalaises
No full textThe present study seeks to document the perspectives of psychosocial workers from the community sector, institutional setting or private practice in Montreal (Quebec, Canada), in regard to the social responses that respect the dignity of female sexual assault survivors. Perspectives on social responses covered variety of settings, including the health and social services network, law and order institutions, schools, the mainstream media or governments. This qualitative study included eight individual interviews and one focus group with a total of 11 female psychosocial workers. The thematic analysis shed light on three main aspects of the data collected: 1) the way these workers define dignity in relation to their clinical work and beyond; 2) their concerns regarding the ways in which sexual assault disclosures are managed across different settings, and 3) their recommendations in order to better respect dignity in sexual assault survivors.Keywords : dignity, sexual assault, feminism, psychosocial interventions.La présente étude a cherché à documenter les perspectives d’intervenantes en relation d’aide, provenant du milieu communautaire, social et privé montréalais (Québec, Canada), quant aux réponses sociales qui respectent la dignité des femmes agressées sexuellement. Ces réponses sociales incluaient une diversité de secteurs tels que le réseau de la santé et des services sociaux, les institutions d’ordre et de la justice, les écoles, les médias ou encore les gouvernements. S’appuyant sur les principes de l’analyse qualitative, huit entretiens et un groupe de discussion ont été réalisés avec un échantillon total de 11 intervenantes. L’analyse thématique réalisée sur les données colligées a permis de mettre en lumière : 1) la manière dont ces intervenantes définissent une intervention digne auprès de la population ciblée; 2) les inquiétudes partagées quant à la gestion des dévoilements réalisés par des femmes survivantes d’agression à caractère sexuel et 3) leurs suggestions afin de mieux respecter la dignité des femmes agressées sexuellement.Mots-clés : dignité, agressions sexuelles, féminisme, interventions psychosociales
Dynamic and reverse transformation of Ti-6Al-4V alloy in the two-phase region
No full textThe dynamic and reverse transformations were studied in Ti-6Al-4V. Isothermal torsion tests were performed in the two-phase region. Dynamic transformation was observed to occur at 880°C, 940°C, 960°C, 980°C and 1000°C and continuous straining led to an increase in the beta phase fraction. The extent of this type of dynamic transformation increased when the temperature approached the transus temperature. Based on data from the torsion tests, the energy barriers and driving forces associated with dynamic transformation are evaluated. It is shown that the stored energy is less than the forces inhibiting transformation and insufficient to initiate the phenomenon. By contrast, the driving force derived from the net softening is greater than the opposing force and is responsible for initiating the reaction. The hot deformation reduces the transus temperature and leads to the formation of a thermodynamically metastable state.In order to investigate the reverse transformation, isothermal holding experiments were performed after compression at 940°C, 970°C and 1000°C in the two-phase region. The reverse transformation is controlled by diffusion and its rate is independent of temperature when the holding time is 18s. By contrast, it depends on temperature when the holding time is increased to 180 s and 1800s. The dilatometer results show that the transformation occurs in two stages; the first involves transformation on dislocations; the second growth of the alpha structure.The effects of dynamic transformation on the flow stress were evaluated using compression testing and self-consistent modeling. Dynamic transformation from alpha to beta was observed in both microstructures (globular and colonies) at different strain rates with temperatures ranging from 815 °C to 950 °C. The extent of dynamic transformation and the associated flow softening in Ti-6Al-4V by transformation were approximately independent of the initial microstructure. However, the measured flow softening in the globular microstructure was much greater than in the colony microstructure. The best strain rates for observing dynamic transformation are in the range: 0.01 s-1 - 0.001 s-1. The roles of dynamic and reverse transformation were further studied using multipass torsion testing. Flow softening was observed during the isothermal multipass deformation tests as indicated by the evolution of the mean flow stress (MFS). The results indicate that the MFS values increase with interpass time from 2s to 32s. The alpha phase transforms into beta during straining, but it retransforms statically into alpha by amounts that increase with interpass time. The flow softening observed is the net result of softening by dynamic transformation and hardening by reverse transformation.Les transformations dynamiques et inverses ont été étudiées pour le Ti-6Al-4V. Des essais de torsion isotherme ont été menés dans la région bi-phasée. La transformation dynamique a été observée à 880°C, 940°C, 960°C, 980°C et 1000°C et la déformation continue a conduit à une augmentation du pourcentage de phase beta. L’ampleur de ce type de transformation dynamique a augmenté quand la température a approché de la température de transus. Grâce aux données des essais de torsion, les barrières énergétiques et les forces motrices associées avec la transformation dynamique ont pu être évaluées. Il a été démontré que l’énergie stockée est plus faible que les forces inhibant la transformation et qu’elle est insuffisante pour initier le phénomène. En revanche, la force motrice dérivée de l’adoucissement net est supérieure à la force opposée et est responsable de l’initiation de la réaction. La déformation à chaud réduit la température de transus et conduit à la formation d’un état thermodynamiquement métastable.Afin d’étudier la transformation inverse, des essais de maintien isotherme ont été menés après compression à 940°C, 970°C et 1000°C dans la région bi-phasée. La transformation inverse est controlée par la diffusion et sa vitesse est indépendante de la température quand les durées de maintien sont de 18s. En revanche, cette vitesse dépend de la température quand les durées de maintien sont augmentées à 180s et à 1800s. Les résultats de dilatométrie montrent que la transformation se produit en deux étapes; la première implique une transformation au niveau des dislocations; la deuxième, une croissance de la phase alpha.Les effets de la transformation dynamique sur la contrainte de déformation ont été évalués par des essais en compression et par de la modélisation automne. La transformation dynamique de la phase alpha à beta a été observé dans les deux microstructures (globulaire et colonies) à différentes vitesses de déformation avec des températures allant de 815°C à 950°C. L’ampleur de la transformation dynamique et l’adoucissement de la déformation plastique que l’on y associe, étaient approximativement indépendants de la microstructure initiale. Cependant, l’adoucissement mesuré de la déformation plastique dans la microstructure globulaire était largement supérieur à celui dans la microstructure de colonies. Les vitesses de déformation optimales pour observer la transformation dynamique se situaient entre 0.01 s-1 et 0.001 s-1. Les rôles des transformations dynamiques et inverses ont été approfondis avec des essais de torsion multi-passes. L’adoucissement de la déformation plastique a été observée pendant les multiples essais de déformation isotherme tel qu’indiqué par l’évolution de la contrainte de déformation moyenne (CDM). Les résultats indiquent que les valeurs de CDM augmentent avec la durée entre les passes, de 2s à 32s. La phase alpha se transforme en phase beta pendant la déformation, mais elle se retransforme statiquement en phase alpha, en quantités croissantes avec la durée entre les passes. L’adoucissement de la contrainte de déformation observée est le résultat net de l’adoucissement obtenu par la transformation dynamique et le durcissement obtenu par la transformation inverse
Independence of graphs associated to supersingular elliptic curves
No full textWith the advent of quantum computers, most of our current security infrastructures will become completely insecure. Many new propositions have thus been made to create new security systems that will be resistant to quantum computers. One very promising area of research is isogeny based cryptography, which mainly relies on the study of elliptic curves and isogeny graphs. In 2006, Charles, Goren and Lauter proposed a new hash function based on the hard problem of factoring isogenies in supersingular isogeny graphs. In this thesis, we will introduce definitions with the aim of measuring the similarity between two given supersingular isogeny graphs. To do so, we will discuss definitions based on graph theoretic, number theoretic and probabilistic notions. An important part of our work is the introduction and calculation of the R-th bi-route number of two graphs. This notion will allow us to have a better understanding of how close the paths on the two graphs can be.Avec l’avènement des ordinateurs quantiques, la plupart de nos infrastructures de sécurité actuelles ne resterons plus du tout sécuritaires. De nouvelles propositions ont ainsi été faites pour créer de nouveaux systèmes de sécurité qui seront résistants aux ordinateurs quantiques. La cryptographie basée sur les isogénies s’avère être un domaine de recherche très prometteur. Ce domaine repose principalement sur l’étude de courbes elliptiques et des graphes d’isogénies. En 2006, Charles, Goren et Lauter ont proposé une nouvelle fonction de hachage basée sur la factorisation des isogénies dans les graphes d’isogénies supersingulières, qui est largement considérée comme étant un problème difficile. Dans cette thèse, nous introduirons des définitions dans le but de mesurer la similarité entre deux graphes d’isogénies supersingulières. Pour ce faire, il sera question de définitions basées sur les notions de théorie des graphes, de théorie des nombres et de probabilités. Une partie importante de notre travail est l’introduction et le calcul du R-ième nombre de bi-routes entre deux graphes. Cette notion nous permettra de mieux comprendre à quel point les chemins des deux graphes peuvent être proches
Decadal variability of Arctic minimum sea ice extent
No full textUncertainty in the timing of a seasonal ice cover in the Arctic Ocean depends on uncertainty in model physics and natural variability on decadal timescales. We use the Gridded Monthly Sea Ice Extent and Concentration, 1850 Onward together with the Community Earth System Model Large Ensemble to assess whether longer term variability in the CESM is well represented, particularly in the Pacific, Eurasian and Atlantic sector of the Arctic where a longer observational record exists in an attempt to provide better estimate of the uncertainty associated with natural variability for an Atlantic, Eurasian and Pacific-centric sea ice retreat. We find that sea ice decadal (8-16 years) variability in CESM is underestimated in the Eurasian sector of the Arctic, specifically in the East-Siberian Sea, slightly overestimated in the Greenland Sea and in agreement with the observational record in the Pacific sector of the Arctic. Result also show an increased variability at interannual and decadal timescales in the transition period between a perennial and a seasonally ice free Arctic. If the sea ice retreat continues to be Pacific-centric in the future, results from the CESM suggest that uncertainty in the timing of an ice-free Arctic associated with natural variability may be realistic.Incertitudes dans le moment où l’Arctique deviendra saisonnièrement libre de glace dépendent d’incertitudes dans la physique des modèles et de variabilité naturelle à des échelles temporelles décennales. Nous utilisons Gridded Monthly Sea Ice Extent and Concentration, 1850 Onward et le Community Earth System Model Large Ensemble pour évaluer si la variabilité à long terme est bien représentée dans le CESM, particulièrement dans les secteurs Atlantique, Eurasien et Pacifique de l’Arctique, où des données observationnelles existent depuis plus longtemps, afin de fournir un meilleur estimé des incertitudes associées à la variabilité naturelle pour un retrait des glaces centré sur l’Atlantique, l’Eurasie et le Pacifique. Nous trouvons que la variabilité décennale (8-16 ans) de la glace de mer est sous-estimée dans le secteur Eurasien de l’Arctique, plus spécifiquement dans la mer de Sibérie orientale, est surestimée dans la mer du Groenland et est en accord avec les observations dans le secteur Pacifique de l’Arctique. Nos résultats montrent une augmentation de la variabilité à des échelles temporelles interannuelles et décennales pendant la période de transition entre un Arctique couvert de glace et un Arctique saisonnièrement libre de glace. Si le retrait de la glace de mer continue d’être centré sur le secteur Pacifique dans le futur, les résultats du CESM suggèrent que l’incertitude dans le moment où l’Arctique deviendra saisonnièrement libre de glace associées à la variabilité naturelle seraient realiste
Network architecture enforced symmetry
No full textDeep reinforcement learning has only been recently used to control characters with continuousaction space and high degrees of freedom. The locomotion produced by policiesthat are generated from the direct application of deep reinforcement learning are seldomsymmetric. As such a direct application does not provide a mechanism to impart symmetry.One of the ways to generate more human-like locomotion is to introduce a reward to mimicmotion-capture data and the other way is to introduce symmetry constraints.This thesis proposes a novel method that is hard-constrained to be state-action spacesymmetric and enforces temporal-state symmetry while penalizing for energy usage. Thismechanism can generate a variety of natural looking gait patterns that capture the correctlevel of symmetry for the given task in an automated fashion. The proposed method isrobust to learning a variety of desired gaits even on rugged terrain. This level of diversityis greater than an existing state-of-the-art work that uses deep reinforcement learning forsymmetric locomotion. In quantitative comparisons, our method generates policies that arecomparable in visual appeal and show lower variance in evaluation metrics compared tothe state-of-the-art.Ce n’est que depuis peu que l’apprentissage par renforcement profond s’est montré utilepour contrôler des personnages évoluant avec un espace d’action continu doté nombreuxdegrés de liberté. Cependant, utiliser les outils de l’apprentissage par renforcement telsquels produit une démarche qui est rarement symétrique. En effet, aucune contrainte n’estimplémentée pour forcer la symétrie. Une façon d’atteindre une locomotion plus semblableà la démarche humaine est d’introduire une récompense qui pousse à imiter des donnéesde références préalablement acquises; une autre est d’imposer des contraintes de symétrie.Cette thèse propose une nouvelle méthode qui contraint l’espace des actions à êtresymétrique, force une symétrie temporelle des actions possibles, en pénalisant l’énergie dela locomotion. Ainsi, de nombreuses démarches naturelles peuvent être générées, chacuneayant le bon niveau de symétrie pour la tâche présentée, et ce par un choix automatique.Cette méthode est robuste, permettant d’apprendre un large spectres d’allures, même surterrain accidenté. Le nombre de démarches pouvant être générées est supérieur à celuides méthodes actuelles de l’apprentissage par renforcement. Des comparaisons quantitativesmontrent que les stratégies générée par notre méthode sont comparable visuellementà celles de l’état de l’art, tout en présentant une variance moindre sur les métriquesd’évaluation
Food insecurity among the elderly in developed countries: Insights from a multi-national analysis
No full textBackground: Food insecurity is an intricate phenomenon, which makes it difficult to fully understand it along with its causes and consequences. While the effects of food insecurity in elderly populations show their own distinct characteristics in demographic and physiological features, including functional impairments, social isolation, and higher demand for healthcare services, there are fewer independent studies conducted on food insecurity in the elderly. Objective: This study aims to estimate the prevalence of food insecurity and its association with demographic and socioeconomic factors that characterized elderly survey respondents in 51 developed countries and to discuss similarities and differences across regions.Methods: Cross-sectional data are taken from the Gallup World Poll (4-year file for 2014-2017) based on respondents aged ≥ 65 (n = 33,692). Food insecurity, the main outcome variable, was assessed using the Food Insecurity Experience Scale, a direct measure of experience-based food insecurity. Descriptive statistics of target populations and the prevalence of food insecurity are produced. Demographic variables include age, gender, marital status, household size, education level, social support, subjective health status, and affective well-being. For socioeconomic variables, income, employment status, urbanicity, and community environments are evaluated. Adjusted logistic regression is used to compute odds ratios for elderly food insecurity and the level of statistical significance is set at 5%.Results: Globally, young seniors had higher odds of being food insecure than older seniors, and great heterogeneity of the prevalence of food insecurity among seniors was found between regions, ranging from OR 0.25 (Australia and New Zealand) to OR 3.25 (Middle East). At the individual level, food insecure seniors were more likely to live alone (OR 1.65, 95%CI: 1.42, 1.88), not have a partner (OR 1.42, 95%CI:1.27, 1.60), and tended to have poorer scores on social support (OR 2.05, 95%CI:1.81, 2.31) and well-being. Also, poor community infrastructure (OR 1.70, 95%CI: 1.54, 1.87) was associated with food insecurity of elderly people, and there were more food insecure elderly people in urban areas.Conclusions: This study concludes that not only personal factors but also social conditions could prevent the elderly from achieving full food security status. These findings emphasize the need for various approaches to address food insecurity issues among seniors through both the community level and the individual level.Contexte: L’insécurité alimentaire est un phénomène complexe étroitement lié aux enjeux de société et de santé publique, rendant ainsi difficile aussi bien la compréhension de ses causes que de ses conséquences. Alors que les effets de l’insécurité alimentaire chez les populations vieillissantes touchent aussi bien la démographie que les caractéristiques physiologiques entre autres troubles fonctionnels, isolation sociale ou encore une forte demande des services de santé, il y a toutefois de moins en moins d’études indépendantes réalisées à ce sujet. Objectifs: Basée sur un sondage réalisé dans 51 pays développés auprès de personnes âgées, cette étude vise à mesurer la prédominance de l’insécurité alimentaire et son rapport aux facteurs démographique et socio-économique auprès de ces populations tout en discutant des similitudes et des differences entre ces pays. Méthodologie: En se basant sur l’échelle de mesure de l’insécurité alimentaire, le sondage international Gallup (Gallup World Poll) a réalisé entre 2014 et 2017 un sondage auprès de 33,692 personnes âgées de 65 ans et plus. Les résultats de ce sondage, utilisés pour cette étude croisée, ont permis d’obtenir des statistiques descriptifs de la population ciblée et la predominance de l’insécurité alimentaire. En ce qui concerne les données démographiques, ont été pris en compte l’âge, le sexe, le statut marital, la taille du foyer, le niveau d’éducation, l’aide sociale, l’état de santé et le bien-être. Quant aux données socio-économiques, le revenu, l’employabilité ainsi que le voisinnage avaient été pris en compte. Ainsi, le rapport de cotes (RC) avait été calculé utilisant le modèle de régressions logistiques avec un niveau de signification statistique à 5%. Résultats: D’une manière générale, pour un groupe de personnes ayant entre 65 et 75ans, il y avait un plus grand risque de souffrir d’insécurité alimentaire qu’un groupe de personnes dont l’âge variait entre 75 et 85ans; de plus on remarquait une grande hétérogénéité de la prédominance de l’insécurité alimentaire parmi ces groups de personnes avec un RC allant de 0.245 (Australie et Nouvelle-Zélande) à 3.249 (Moyen-Orient). Au niveau plus individuel, les personnes âgées souffrant d’insécurité alimentaire avaient plus tendance à vivre seule, à ne pas être couple et à recevoir le moins d’aide sociale et de bien-être. De même, le manque d’infrastructures communautaires avait un impact sur l’insécurité alimentaire chez ces personnes; de plus celles vivant en milieu urbain étaient plus sujettes à l’insécurité alimentaire. Conclusion: Cette étude a permis de montrer que tout comme les facteurs personnels, les conditions sociales aussi peuvent empêcher les personnes âgées d’atteindre le seuil de sécurité alimentaire. Ces recherches ont aussi permis de voir la nécessité de la mise en place de politiques spécifiques en matière d’insécurité alimentaire chez les personnes âgées aussi bien sur le plan communautaire qu’individuel
Deep learning as an investigation tool in neuroimaging
No full textFollowing the successful use of deep learning (DL) in the field of computer vision and natural language processing, Convolutional Neural Networks (CNN) have been increasingly applied to neuroimaging studies to differentiate diseased population from healthy subjects. DL has been applied to datasets acquired from different modalities such as electroencephalography (EEG), Magnetic Resonance Imaging (MRI) and magnetoencephalography (MEG). Although DL models have outperformed competing methods in various contexts, the usefulness of the trained models to improve our understanding of the underlying neural substrates remains limited. This is primarily due to the difficulty associated with visualizing and interpreting the predictive features learned by DL models.Our main aim was to leverage DL models to reveal subtle discriminative brain patterns from neuroimaging data and subsequently develop methods to visualize these patterns. We investigated the applicability of DL to 2 specific studies: (1) an EEG dataset obtained from a small number of participants to understand the add-on effects of cardiovascular exercise on motor learning in healthy subjects, (2) a large-scale MRI and MEG study to characterize the process of healthy brain aging.This thesis is comprised of two distinct experiments. (1) We leveraged the end-to-end learning ability of CNNs to investigate the differences in EEG activity between an exercise and a control group from data collected while subjects performed isometric handgrips. Subsequently, we developed a method to visualize the task-specific, discriminatory EEG patterns between the two groups. (2) We investigated machine learning models coupled with several multivariate associativity techniques to predict the age of healthy individuals from their T1-weighted MRI and resting-state MEG data. We also explored Graph Convolutional Networks (GCNs) to incorporate the topological information of the data into the prediction models.We found that CNNs can be reliably trained on a dataset collected from a relatively small number of participants using an adversarial training strategy. In addition, we were able to identify relevant frequency bands and brain regions that were modulated by exercise. We observed (i) a finer frequency band within the wider beta-band that was modulated by exercise, as well as (ii) a significant modulation of the event-related desynchronization in this frequency band located in bilateral sensorimotor cortices and contralateral prefrontal regions to the moving hand. Therefore, our approach demonstrates the feasibility of identifying subtle discriminative features in a completely data-driven manner using deep learning. In the context of brain age prediction, we found that the subcortical regions were more reliable predictors of age as compared to cortical regions. In addition, we also observed how the functional organization of the brain changed with age.Our approach demonstrated the feasibility of identifying subtle discriminative features in a completely data-driven manner using DL. We believe these results hold a significant contribution to the methodological advances for small-scale neuroimaging studies where a small number of subjects are traditionally tested, e.g. neurorehabilitation. Our findings from the brain age prediction expanded upon previous work in the field and provided useful insights into the brain areas that are reliably affected with age. In addition, the graph network architecture demonstrated ways to include the topology of the brains functional organization while analyzing age-related effects on a diverse set of neuroimaging features. Collectively, the findings and methods presented in this thesis demonstrated the wide scope of using DL models in the analysis of various modalities of neuroimaging data.Suite à l’utilisation réussie de l’apprentissage en profondeur (DL) dans le domaine de la vision par ordinateur et du traitement du langage naturel, les réseaux de neurones à convolution (CNN) ont été de plus en plus utilisés dans les études en neuroimagerie afin de différencier les populations en santé de celles présentant une maladie neurodégénérative. Des modèles d’apprentissage en profondeur ont été appliqués à des ensembles de données acquis à partir de différentes modalités telles que l’électroencéphalographie (EEG), l’imagerie par résonance magnétique (IRM) et la magnétoencéphalographie (MEG). Bien que les modèles DL aient surperformé les méthodes concurrentes dans divers contextes, l’utilité des modèles conus pour améliorer notre compréhension des substrats neuronaux sous-jacents reste limitée. Notre objectif principal était dexploiter des modèles DL pour révéler des caractéristiques cérébrales subtiles discriminantes à partir de données de neuroimagerie, puis de développer des méthodes permettant de les visualiser. Nous avons étudié l’applicabilité des modèles DL dans le cadre de deux études spécifiques utilisant la neuroimagerie soient: (1) un ensemble de données EEG obtenu à partir d’un nombre restreint de participants afin d’étudier les effets additifs de l’exercice cardiovasculaire aigu sur l’apprentissage moteur auprès de sujets en santé, et (2) une étude à partir de données dIRM et de MEG à grande échelle pour caractériser le processus du vieillissement cérébral sain.Cette thèse est composée de deux expériences distinctes. (1) Nous avons exploité la capacité dapprentissage de bout en bout des CNN pour étudier les différences dans les activités EEG entre un groupe assujetti à lexercice cardiovasculaire et un groupe contrôle. Les données ont été collectées pendant que les sujets exécutaient des contractions manuelles isométriques. Par la suite, nous avonsdéveloppé une méthode permettant de visualiser les formes EEG pouvant discriminer les deux groupes et étant spécifiques à la tâche. (2) Nous avons étudié des modèles dapprentissage machine associés à divers techniques dassociativité à variables multiples pour prédire lâge des individus en bonne santé à partir de leurs données dIRM et de MEG. Nous avons constaté que les CNN peuvent être entraı̂nés de manière fiable sur un ensemble de données collecté auprès d’un nombre relativement restreint de participants à l’aide d’une stratégie de formation contradictoire. De plus, nous avons pu identifier des bandes de fréquences pertinentes et des régions du cerveau modulées par l’exercice. En utilisant le pipeline basé sur les CNN sur le même ensemble de données, nous avons observé (i) une bande de fréquence plus fine modulée par l’exercice dans la bande bêta, ainsi que (ii) une modulation significative de la désynchronisation liée à l’événementdans cette bande de fréquence située dans les cortex sensorimoteurs bilatéraux et les régions préfrontales controlatérales à la main en mouvement. Dans le contexte de la prédiction de l’âge du cerveau, nous avons constaté que les régions sous-corticales étaient des prédicteurs plus fiables de l’âge en comparaison aux régions corticales. Notre approche a démontré la faisabilité d’identifier des caractéristiques discriminantes subtiles d’une manière entièrement basée sur les données en utilisant la DL. Nous pensons que ces résultats apportent une contribution significative aux avancées méthodologiques pour les études en neuroimagerie à petite échelle dans lesquelles un nombre habituellement restreint de sujets est testé. Nos conclusions tirées de la prédiction de l’âge du cerveau complémentent celles détudes antérieurs se penchant sur la même question et ont fourni des informations utiles sur les zones du cerveau systématiquement affectées par l’âge. Ensemble, les résultats et les méthodes présentés dans cette thèse ont démontré le large champ dutilisation des DL dans lanalyse de diverses modalités de données de neuroimagerie
Exploring mitochondrial fusion mechanism in mammals
No full textS-acylation is a very common post-translation protein modification: attaching a long fatty acid chain to the thiol group of a cysteine residue. Given its hydrophobic nature, S-acylation plays a critical role in membrane fusion and vesicle trafficking. Mitofusins 1 and 2 are mitochondrial outer membrane proteins, and the major factors mediating mitochondrial outer membrane fusion. MFNs span the outer mitochondrial membrane by one transmembrane domain, exposing its GTPase and HR1 domains to the cytosol and the HR2 domain to the inter-membrane space of mitochondria. Using biochemical approaches, we confirmed that both Mfn1 and Mfn2 are acetylated, and identified the predicted cysteine 534 of MFN2 (C534) as the S-acylated residue. A biophysical model analysis shows that MFN2 C534 S-acylation can bring the HR1 domain close to outer mitochondrial membrane bilayer fusion. Loss of the acetylated cysteine in MFN2, with a C534A mutation does not affect the import of MFN2 into mitochondria, however, compared to wild type MFN2 and other MFN2 cysteine mutants, the ability of MFN2 C534A to rescue mitochondrial fusion in MFN2 null MEFs is largely impaired. This study identifies a critical element of MFN structure, providing new insights for understanding outer mitochondrial membrane mechanism.La s-acylation est une modification protéique post-traduction très courante: elle consiste à attacher une longue chaîne d’acides gras au groupe thiol d’un résidu de cystéine. Compte tenu de sa nature hydrophobe, la S-acylation joue un rôle essentiel dans la fusion membranaire et le trafic vésiculaire. MFN2, une protéine de la membrane externe mitochondriale, est l'un des principaux facteurs de la fusion de la membrane externe mitochondriale. MFN2 recouvre la membrane mitochondriale externe d'un domaine transmembranaire, exposant ses domaines GTPase et HR1 au cytosol et le domaine HR2 à l'espace inter-membranaire des mitochondries. En utilisant des analyses biochimiques, nous avons confirmé que la cystéine prévue pour 534 de MFN2 (C534) était de manière stable S-acylée. Une analyse de modèle biophysique montre que la S-acylation de MFN2 C534 peut rapprocher le domaine HR1 de la fusion de la bicouche de la membrane mitochondriale externe. Fait intéressant, une mutation de MFN2 C534A n’affecte pas l’importation de MFN2 dans les mitochondries. Toutefois, par rapport à MFN2 de type sauvage et à d’autres mutants de la cystéine MFN2, la capacité de MFN2 C534A à sauver la fusion mitochondriale dans les MEF nuls de MFN2 est largement réduite. Cette étude fournit de nouvelles informations pour comprendre le mécanisme de la membrane mitochondriale externe
Entrainment
No full textEntrainment is a composition for six percussionists. The piece is in seven movements which explore different aspects of rhythmic and metric perception and cognition. In order to express the different rhythmic techniques used in the Entrainment, I develop a theoretical apparatus that allows the analysis of concurrent temporal streams. The first two movements deal with how the brain reconstrues rhythmic material into different meters based on context. The third and fourth movements explore how the brain understands meter when given very little rhythmic information. The fifth and sixth movements explore how the brain understands meters which are out of phase with one another. The final movement serves as a culmination of the various rhythmic techniques used throughout the piece. In addition to the rhythmic elements, the movements contribute to numerous large-scale trajectories pertaining to tempo, timbre, and dynamics, leading to the final movement.Entrainment est une oeuvre pour six percussionnistes. L’oeuvre en sept mouvements explore plusieurs éléments de la perception et de la cognition du rythme et du mètre. Afin d’exprimer les différentes techniques rythmiques utilisées dans Entrainment, j’ai développé un modèle théorique qui permet l’analyse des strates temporelles simultanées. Les deux premiers mouvements examinent comment le cerveau réinterprète un matériel rythmique donné dans une nouvelle organisation métrique en s’appuyant sur le contexte. Les troisième et quatrième mouvements étudient la façon dont le cerveau comprend le mètre quand il y a peu d’information rythmique. Les cinquième et sixième mouvements examinent comment le cerveau comprend le décalage métrique entre les différentes strates temporelles. Le dernier mouvement utilise toutes les techniques employées dans les mouvements précédents. En dehors des éléments rythmiques, le timbre, les nuances et le tempo forment des trajectoires à grande échelle qui mènent au dernier mouvement
Analyzing semantic trace links using network science and machine learning
No full textTraceability is a useful tool for reasoning about many aspects of software by means of the connections between the artifacts that constitute the software. For example, stakeholders can use traceability to appraise the software quality along many different dimensions including regulatory compliance. The semantic content of these trace links or what they communicate to a stakeholder however, remains significantly unexplored. Additionally, issue tracking systems provide a wealth of data about traceability events and their context, particularly in the case of open source and agile software projects. In this work we investigate semantic traceability from two perspectives using trace links found in the issue trackers of open source software projects. Firstly, most of the state-of-the-art traceability solutions rely on a pair-wise comparison of artifact attributes. This approach ignores the characteristics that result from the entire connected structure of the trace links. To address this, we investigate the use of network science techniques on the issue trackers of sixty-six open source projects. From this perspective we show that two properties of networks, namely scale free degree distributions and triadic closure manifest in traceability networks. We then use these properties to showcase the high level reasoning that can be done by observing the traceability problem from a network perspective and in doing so, motivate the trace link semantic recovery problem. Secondly, we attempt to approach the trace link semantic recovery problem by using machine learning and the attributes of the issue trace links. We experiment with a number of models, tuning approaches and formulations of these attributes including the textual content of each issue, as well as other metadata items. We observe promising results from this task specification and show even higher performance when incorporating data both internal and external to the project's issue tracker.La traçabilité est un outil utile pour raisonner à propos de nombreux aspects d’un logiciel grace aux connections entre les artéfacts qui constituent ce logiciel. Par exemple, les parties prenantes peuvent utiliser la traçabilité pour évaluer la qualité d’un logiciel selon de nombreuses dimensions, comme la conformité réglementaire. Le contenu sémantique de ces liens ou, ce qu’ils communiquent à une partie prenante reste cependant notablement inexploré. De plus, les systèmes de suivi des problèmes fournissent une grande quantité de données sur les événements de traçabilité et leur contexte, en particulier dans le cas des projets logiciels en source libre ou agiles. Dans cette thèse, nous étudions la traçabilité sémantique de deux points de vue. Nous utilisons des liens de traçabilité trouvés dans les trackers de problèmes des projets de logiciels en source libre. Tout d’abord, l’état de l’art des solutions aux problèmes liés à la traçabilité, reposent sur la comparaison par paire des attributs des artefacts. Cette approche ne considère pas des caractéristiques qui émergent de l’ensemble de la structure connectée des liens. Pour y remédier, nous utilisons des techniques développés pour la théorie des réseaux dans les systèmes de suivi de problèmes de soixante-six projets en source libre. Nous montrons que deux propriétés des réseaux, à savoir une distribution de degrés invariante d’échelle et la fermeture triadique, se manifestent dans les réseaux de traçabilité. Nous utilisons ensuite ces propriétés pour mettre en évidence le raisonnement de haut niveau qui peut être fait en observant le problème de traçabilité comme un réseau et, ce faisant, motiver le problème de récupération des liens sémantiques. Deuxièmement, nous essayons d’aborder le problème de récupération sémantique des liens en utilisant l’apprentissage automatique et les attributs des liens en question. Nous explorons différents modèles, approches d’ajustement des paramètres et formulations de ces attributs, y compris le contenu textuel de chaque artéfact, ainsi que d’autres métadonnées. Nous observons des résultats encourageants à partir de cette spécification de tâche et nous montrons des performances encore plus élevées lorsque nous intégrons des données internes et externes au système de suivi de problèmes du projet