211 research outputs found
Reaching out for the other end with p53-binding protein 1
No full textCorrect joining of broken chromosomes is indispensable to prevent cell death, ageing and cancer. Two recent papers highlight the importance of p53-binding protein 1 (53BP1) in connecting distant sites in T-cell receptor loci and dysfunctional telomeres. These studies refine our understanding of the specific subset of DNA double-strand breaks that require the accessory end-joining factor 53BP1
Plangebied middenspanning Ameland en Holwerd
No full textTijdens het veldwerk is gebleken dat op Ameland zeer waarschijnlijk voorafgaand aan de aanleg van de Zuidergrieweg de voormalige binnendijk is afgetopt door een minimaal 2,4 m dik dijkpakket af te graven. Aangenomen wordt dat er van deze binnendijk geen restant meer aanwezig is. De rest van deelgebied 1 op Ameland bestaat uit natuurlijke kwelder- en wadafzettingen waarin geen archeologisch relevant niveau aanwezig is. Ook in deelgebied 2 te Holwerd bestaat de ondergrond uit natuurlijke kwelder- en wadafzettingen. Dit geldt voor de noordwestelijke hoek van het deelgebied. In de bocht van de Ternaarderwei toont boring 44 een afwijkende (ophogings)laag die mogelijk in verband staat met de randzone van de dorpsterp van Holwerd. Ook ter plaatse van de boringen die gestaakt zijn vanwege de (verharding van de) oude weg kan deze afwijkende ophogingslaag nog binnen 0,80 m –mv aanwezig zijn. Daarnaast is de dijk waar de Ternaarderwei op is aangelegd een archeologisch relevant niveau. In de boringen zijn zowel de puinlaag uit 1853 als de oudere zeedijk waargenomen maar een onderscheid tussen beide lagen is moeilijk te maken
Archeologische begeleiding in de Geldershofstraat en Pastoor van Laakstraat te Lent - gemeente Nijmegen. Archeologische Berichten Nijmegen - Briefrapport 260
No full textIn de Geldershofstraat en Pastoor van Laakstraat in Lent (gemeente Nijmegen) is in de nazomer van 2016 het wegdek vernieuwd en het riool gerenoveerd. Het plangebied ligt binnen een terrein met een zeer hoge archeologische waarde (Lentseveld). De eerdere archeologische waarnemingen rond het plangebied betreffen onder andere bewoningssporen uit de bronstijd, laat-Romeinse tijd en Merovingische periode.Ten noorden van de Geldershofstraat ligt een erf uit de volle middeleeuwen. Verder ligt de Pastoor van Laakstraat ter hoogte van een oude restgeul. Hier is tussen 1607 en 1611 het kanaal de Grift aangelegd. Dit kanaal is tot 1741 in gebruik geweest als trekvaart. Op basis van de archeologische waarden in de directe omgeving van het plangebied was er een gerede kans dat tijdens de rioolrenovatie archeologische waarden geroerd zouden worden. Om deze waarden ex situ veilig te stellen, is tijdens de graafwerkzaamheden een archeologische begeleiding onder protocol opgraven uitgevoerd. Doel van de archeologische begeleiding was het documenteren, registreren en veiligstellen van de archeologische resten die zich in de ondergrond van het onderzoeksgebied bevinden, om daarmee informatie te behouden die van belang is voor kennisvorming over het verleden.
Bij het archeologisch onderzoek zijn geen sporen uit de bronstijd of laat-Romeinse tijd en Merovingische periode aangetroffen. Wel zijn enkele Romeinse vondsten,waaronder munten en bouwkeramiek, geborgen uit een secundaire context. De archeologische resten zijn aangetroffen rond de 8,8 en 9,0m + NAP en dateren uit de middeleeuwen en nieuwe tijd. De middeleeuwse sporen doorsnijden een tot 60 cm dik oeverpakket uit – vermoedelijk – de volle middeleeuwen. Het betreft greppels en kuilen in de periferie van een nederzetting of erf uit de Ottoonse tijd en volle middeleeuwen. Ook zijn enkele scherven Mayen-, Badorf-, Pingsdorf- en kogelpotaardewerk geborgen. Na de volle middeleeuwen lijkt het terrein enkele eeuwen buiten gebruik te zijn. De post-middeleeuwse sporen betreffen onder andere de dempingen van de oostelijke oever van de 17e-eeuwse Grift Nadat het kanaal de Grift gedempt was, is ter plaatse een boomgaard aangeplant. Een deel van de sporen wordt geassocieerd met een 19e-eeuws boerderijerf en omliggende verkaveling: restanten van bakstenen en betonnen funderingen van het hoofdgebouw en bijgebouw, een bakstenen waterput en enkele afvalkuilen, al dan niet met fragmenten dierlijk bot. Het oorlogsverleden van Lent is zichtbaar door de vondst van een 17e of 18e-eeuwse vuurketshouder en de wisselloop van –vermoedelijk- een Duits MG14 machinegeweer. Andere vondsten betreffen onderdelen van gereedschap, huisraad en speelgoed uit de 19e en begin 20e eeuw
SPATIOTEMPORAL ASPECTS OF MicroRNA-MEDIATED GENE REGULATION
No full textMicroRNA-mediated modulation of translation has been recently discovered as a new dimension in gene expression regulation. In this chapter we review how this regulation operates in time between the fast protein modification and degradation steps on the one hand and the slow transcriptional reprogramming associated with more stable changes in gene expression patterns on the other hand. We also discuss the additional layer of complexity associated with spatial redistribution of the RNA silencing machinery in subcellular structures. Various stress conditions induce both a transient change in microRNA expression within the first few hours after exposure and a redistribution of the RNA silencing machinery from P-bodies to Stress Granules, which differ in their function and protein content. Insight into the spatiotemporal aspects of the microRNA response will be indispensable for a full understanding of this level of gene regulation
Plangebied middenspanning Ameland en Holwerd
No full textTijdens het veldwerk is gebleken dat op Ameland zeer waarschijnlijk voorafgaand aan de aanleg van de Zuidergrieweg de voormalige binnendijk is afgetopt door een minimaal 2,4 m dik dijkpakket af te graven. Aangenomen wordt dat er van deze binnendijk geen restant meer aanwezig is. De rest van deelgebied 1 op Ameland bestaat uit natuurlijke kwelder- en wadafzettingen waarin geen archeologisch relevant niveau aanwezig is. Ook in deelgebied 2 te Holwerd bestaat de ondergrond uit natuurlijke kwelder- en wadafzettingen. Dit geldt voor de noordwestelijke hoek van het deelgebied. In de bocht van de Ternaarderwei toont boring 44 een afwijkende (ophogings)laag die mogelijk in verband staat met de randzone van de dorpsterp van Holwerd. Ook ter plaatse van de boringen die gestaakt zijn vanwege de (verharding van de) oude weg kan deze afwijkende ophogingslaag nog binnen 0,80 m –mv aanwezig zijn. Daarnaast is de dijk waar de Ternaarderwei op is aangelegd een archeologisch relevant niveau. In de boringen zijn zowel de puinlaag uit 1853 als de oudere zeedijk waargenomen maar een onderscheid tussen beide lagen is moeilijk te maken
The RAG1 and RAG2 proteins establish the 12/23 rule in V(D)J recombination
Get PDFV(D)J recombination requires a pair of signal sequences with spacer
lengths of 12 and 23 base pairs. Cleavage by the RAG1 AND RAG2 proteins
was previously shown to demand only a single signal sequence. Here, we
established conditions where 12- and 23-spacer signal sequences are both
necessary for cleavage. Coupled cutting at both sites requires only the
RAG1 and RAG2 proteins, but depends on the metal ion. In Mn2+, a single
signal sequence supports efficient double strand cleavage, but cutting in
Mg2+ requires two signal sequences and is best with the canonical 12/23
pair. Thus, the RAG proteins determine both aspects of the specificity of
V(D)J recombination, the recognition of a single signal sequence and the
correct 12/23 coupling in a pair of signals
- …
