341 research outputs found
Silicon (Si) mitigates the negative effects of iron deficiency in common bean (Phaseolus vulgaris L.) by improving photosystem activities and nutritional status
No full textSilicon (Si) is the second most abundant element in the Earth's crust after oxygen. Its beneficial impact on crop development and yield, particularly under stressful conditions such as iron (Fe) deficiency, has been well documented. Fe deficiency is a critical constraint that limits crop production globally. The objective of this study was to investigate the effects of silicon (Na2SiO3) on common bean (Phaseolus vulgaris L. ‘Coco Rose’ variety) under iron-deficient conditions. The common bean plants were subjected to six treatments, which included three sufficient iron treatments (50 μM Fe) each paired with three varying silicon concentrations (0, 0.25, and 0.5 mM Si), and three iron-deficient treatments (0.1 μM Fe) each associated with the same silicon concentrations (0, 0.25, and 0.5 mM Si). The results indicate that iron deficiency had a negative impact on almost all the measured parameters. However, under silicon treatments, especially with 0.5 mM Si, the depressive effects of iron deficiency were significantly mitigated. The addition of 0.5 mM Si alleviated leaf chlorosis and improved biomass production, nutritional status, photosynthetic pigment content, photosynthetic gas exchange, and photosystem (PSI and PSII) activities. Interestingly, a greater beneficial effect of silicon was observed on PSII compared to PSI. This was accompanied by a significant augmentation in leaf iron concentration by 42%. Therefore, by enhancing the photosystem activities and nutritional status, among other mechanisms, silicon is capable of mitigating the adverse effects of iron-deficient conditions, making it a successful and effective solution to cope with this nutritional stressThis work was funded by the Tunisian Ministry of Higher Education and Scientific Research under grant LR15CBBC02. A portion of the work was also supported by the PHC Maghreb 2019 network (Partenariat Hubert CURIEN Maghreb 2019 no. 19MAG41) and the Young Researchers Encouragement Program (Programme d’Encouragement des Jeunes Chercheurs - 21PEJCD1P22 for Tarek SLATNI and 21PEJCD4P1 for Walid ZORRIG
Recherche et caractérisation de déterminants contrôlant l'accumulation de cadmium chez la laitue "Lactuca sativa".
No full textCadmium is an extremely toxic pollutant causing a great number of diseases. It is a widespread metal which concentration rises in cultivated soils, thus exposing food or feed crops to it and ultimately causing potential major sanitary problems as a consequence of its entry in the food chain. Among the vegetable species used for food, lettuce shows a higher capacity of accumulating cadmium.Our objective was to identify molecular determinants controlling cadmium accumulation in lettuce.We aim at characterizing mechanisms controlling cadmium accumulation in lettuce, which is a food crop showing one of the highest capacities to accumulate this toxic compound.Starting from a phenotypic and transcriptomic analysis of 18 lettuce genotypes representing the genetic diversity of the species, we identified trends linking cadmium and zinc accumulation in roots an shoots, cadmium translocation from roots to shoot, cadmium tolerance, and expression of a dozen of candidate genes proposed to be involved in cadmium transport. A positive correlation linked cadmium accumulation and the mRNA accumulation of an heavy metal efflux transporter. Interestingly, measurements of 109Cd influx in roots and 109Cd efflux from roots revealed that the genotype displaying the least cadmium accumulation could be discriminated from the genotype displaying the highest one by its markedly increased ability to efflux cadmium from the roots to the culture medium. Progeny analysis from crosses between the genotypes displaying extreme performances for cadmium accumulation or cadmium translocation from roots to shoots revealed that these traits could be supported by single genetic determinism.In conclusion, starting from the analysis of cadmium accumulation in a large set of lettuce genotypes, a major determinant limiting cadmium accumulation in this species was revealed, that is the ability to efflux cadmium from the root to the culture medium. A candidate gene has been identified for this function, which paves the way towards the breeding for lettuce with reduced cadmium accumulation in leaves.As a non-essential element for plants, cadmium has been assumed to be taken up by making use of non-specificity of essential elements transporters. Numerous physiological studies have described that cadmium uptake is negatively associated with iron pathway, by competing for absorption sites in roots. The principal candidate for this transport in lettuce is a possible “orthologue” of Arabidopsis thaliana IRT1. In fact, AtIRT1 is a major transporter responsible for iron uptake from the soil, and is known to have a broad substrate range, including cadmium. IRT1-overexpressing A. thaliana plants were then shown to accumulate more cadmium in root tissue. In this work, NCBI sequence libraries were analysed and two lettuce “orthologues” of AtIRT1 were found (LsIRTa and LsIRTb). Cloning “orthologues” of AtIRT1 was carried out for five lettuce varieties. Moreover, LsIRTs expression in plants from 14 lettuce accessions were analysed by PCRQ and were compared to cadmium accumulation in plants. Interestingly, our results revealed that expression of LsIRTa is significantly correlated with root cadmium content. LsIRTa seems to be involved in the control of cadmium accumulation in roots.This result has been supported by tow physiological experiments. The first experiment showed that increasing iron in the growth medium resulted in a strong decrease in root cadmium content. And conversely, the second experiment revealed that root iron content decrease in response to increasing concentrations of cadmium in the medium. These results suggest that cadmium competes with iron for uptake through ion transporters in lettuce root cells. As mentioned above, a candidate gene for this transport has been identified (LsIRTa), which paves the way towards the breeding for lettuce with reduced cadmium accumulation.Les activités humaines agricoles, urbaines et industrielles, sans cesse croissantes, sont à l'origine d'une contamination de notre environnement par les métaux lourds. Alors que de nombreuses molécules organiques peuvent être dégradées, les métaux lourds ne le peuvent pas et leur concentration augmente régulièrement dans les sols et les eaux. Ceci expose les plantes à des concentrations croissantes de métaux lourds. L’accumulation de métaux lourds dans les plantes présente un risque toxique pour l’Homme, car les plantes cultivées sont le point d’entrée dans la chaîne alimentaire. Par comparaison aux autres espèces, la laitue « Lactuca sativa » a tendance à présenter des teneurs élevées en cadmium, un métal lourd très toxique dont la concentration croît régulièrement dans les sols cultivés pour des raisons environnementales. En termes de sécurité alimentaire, il est donc important de produire des variétés accumulant des teneurs en cadmium réduites, et la laitue est un bon modèle pour débuter ce type d’approche.L’objectif de notre thèse était de caractériser aux niveaux physiologique, génétique, et moléculaire, les déterminants majeurs contrôlant l’accumulation du cadmium chez la laitue. Notre objectif a été décliné en différentes opérations. Tout d’abord une analyse de diversité nous a permis de décrire la capacité d’accumulation de cadmium de 18 génotypes de laitue et de sélectionner des génotypes présentant des performances extrêmes vis-à-vis du cadmium. Ainsi, des génotypes présentant des performances extrêmes du point de vue de la tolérance au cadmium, de l’accumulation de cadmium et de la capacité de translocation du cadmium des racines vers les parties aériennes ont été sélectionnés.Dans une deuxième étape, nos variétés extrêmes pour les caractères d’accumulation de cadmium et de translocation de cadmium des racines vers la partie aérienne ont été utilisées pour développer une approche physiologique. L’objectif de cette approche était de montrer l’origine de leur variabilité afin de comprendre les déterminants physiologiques contrôlant l’accumulation du cadmium chez la laitue.Dans le cadre de cette approche, des expériences d’efflux faites en utilisant du cadmium radioactif (109Cd) ont montré que la variété la moins accumulatrice de cadmium se caractérise par un efflux de cadmium marqué plus important par comparaison aux autres variétés. Cette variété possède vraisemblablement un mécanisme d’efflux plus efficace par comparaison aux autres variétés qui pourraient être le déterminant majeur permettant d’obtenir une plus faible accumulation de cadmium chez cette variété.Notre étude a permis de montrer une forte corrélation positive entre teneur en cadmium et teneur en zinc. Ce qui a permis d’émettre l’hypothèse d’un transport très associé entre le cadmium et le zinc. De même, une corrélation positive entre le niveau de translocation de cadmium des racines vers la partie aérienne et le niveau relatif du citrate entre les racines et les feuilles a été montrée. Cette corrélation suggère que le citrate pourrait être impliqué dans le transport du cadmium.Enfin, notre étude physiologique a permis de mettre en évidence un effet dépressif de l’augmentation des concentrations de fer et de calcium dans le milieu de culture sur l’accumulation du cadmium chez nos plantes de laitue.Ceci permet de penser que l'absorption de cadmium peut se faire d’une manière non spécifique via des transporteurs de fer et/ou de calcium.Dans le but de mieux comprendre les mécanismes impliqués dans l’accumulation du cadmium chez la laitue nous avons élaboré une approche génétique. Cette approchea visé à préciser le déterminisme, simple ou complexe, des caractères d’accumulation de cadmium et de translocation du cadmium des racines vers les parties aériennes. Pour cela des croisements ont été réalisés entre les génotypes les plus extrêmes pour ces caractères. À la suite de ces croisements, les populations F1 et F2 ont été analysées.Les résultats de l’analyse des plantes F1 ont montré qu’on est en présence d’une dominance forte, voire absolue, des caractères qui assurent la sensibilité au cadmium, la forte accumulation du cadmium et la forte translocation du cadmium des racines vers les parties aériennes. De même, pour ces trois caractères étudiés, les plantes F1 issues des deux sens de croisement ont montré un comportement identique vis-à-vis du cadmium ce qui prouve que nos caractères ne sont pas des liés au sexe.Les analyses des plantes F2 pour les deux caractères accumulation de cadmium et translocation de cadmium des racines vers les parties aériennes ont permis de montrer que la distribution phénotypique n’est pas bimodale pour les deux caractères étudiés, indiquant que ces caractères ne présentent pas des cas typiques de monohybridisme. Ces deux caractères sont donc contrôlés par plus qu’un seul gène pour chacun d’entre eux.Dans le but de mieux comprendre les mécanismes impliqués dans l’accumulation du cadmium chez la laitue, nous avons complété les approches d’analyse de la diversité, de physiologie et de génétique par une approche moléculaire. Cette approche avait comme objectif l'identification de corrélations, si elles existent, entre l'accumulation de cadmium dans les racines et/ou les feuilles et le niveau d’expression de gènes candidats décrits chez les espèces modèles comme impliqués dans le contrôle de l’accumulation de cadmium. Cette approche a permis de cloner et de séquencer des fragments d’ADN correspondant à 9 gènes candidats de laitue et d’évaluer le niveau de leurs expressions par PCR quantitative. Ensuite, l’expression de ces gènes a été comparée aux teneurs en cadmium et en zinc mesurées dans les racines et/ou les feuilles.À la suite ce cette étude nous avons pu mettre en évidence une éventuelle implication d’un gène de laitue (que nous avons nommé LsIRTa) dans l’accumulation du cadmium. Ce gène est très probablement un orthologue fonctionnel du gène AtIRT1 qui code un transporteur représentant la principale voie d'absorption du fer par les cellules racinaires d’Arabidopsis thaliana. D’autre part, nos résultats ont montré une corrélation positive entre l’expression d’un autre gène (que nous avons nommé LsPDRa) et l’accumulation du zinc et du cadmium au niveau foliaire, ce gène est donc très probablement impliqué dans l’accumulation de ces deux métaux à ce niveau, ce qui confirme davantage notre hypothèse de transport associé entre le cadmium et le zinc
Research of determinants controlling cadmium accumulation in lettuce "Lactuca sativa".
No full textCadmium is an extremely toxic pollutant causing a great number of diseases. It is a widespread metal which concentration rises in cultivated soils, thus exposing food or feed crops to it and ultimately causing potential major sanitary problems as a consequence of its entry in the food chain. Among the vegetable species used for food, lettuce shows a higher capacity of accumulating cadmium.Our objective was to identify molecular determinants controlling cadmium accumulation in lettuce.We aim at characterizing mechanisms controlling cadmium accumulation in lettuce, which is a food crop showing one of the highest capacities to accumulate this toxic compound.Starting from a phenotypic and transcriptomic analysis of 18 lettuce genotypes representing the genetic diversity of the species, we identified trends linking cadmium and zinc accumulation in roots an shoots, cadmium translocation from roots to shoot, cadmium tolerance, and expression of a dozen of candidate genes proposed to be involved in cadmium transport. A positive correlation linked cadmium accumulation and the mRNA accumulation of an heavy metal efflux transporter. Interestingly, measurements of 109Cd influx in roots and 109Cd efflux from roots revealed that the genotype displaying the least cadmium accumulation could be discriminated from the genotype displaying the highest one by its markedly increased ability to efflux cadmium from the roots to the culture medium. Progeny analysis from crosses between the genotypes displaying extreme performances for cadmium accumulation or cadmium translocation from roots to shoots revealed that these traits could be supported by single genetic determinism.In conclusion, starting from the analysis of cadmium accumulation in a large set of lettuce genotypes, a major determinant limiting cadmium accumulation in this species was revealed, that is the ability to efflux cadmium from the root to the culture medium. A candidate gene has been identified for this function, which paves the way towards the breeding for lettuce with reduced cadmium accumulation in leaves.As a non-essential element for plants, cadmium has been assumed to be taken up by making use of non-specificity of essential elements transporters. Numerous physiological studies have described that cadmium uptake is negatively associated with iron pathway, by competing for absorption sites in roots. The principal candidate for this transport in lettuce is a possible “orthologue” of Arabidopsis thaliana IRT1. In fact, AtIRT1 is a major transporter responsible for iron uptake from the soil, and is known to have a broad substrate range, including cadmium. IRT1-overexpressing A. thaliana plants were then shown to accumulate more cadmium in root tissue. In this work, NCBI sequence libraries were analysed and two lettuce “orthologues” of AtIRT1 were found (LsIRTa and LsIRTb). Cloning “orthologues” of AtIRT1 was carried out for five lettuce varieties. Moreover, LsIRTs expression in plants from 14 lettuce accessions were analysed by PCRQ and were compared to cadmium accumulation in plants. Interestingly, our results revealed that expression of LsIRTa is significantly correlated with root cadmium content. LsIRTa seems to be involved in the control of cadmium accumulation in roots.This result has been supported by tow physiological experiments. The first experiment showed that increasing iron in the growth medium resulted in a strong decrease in root cadmium content. And conversely, the second experiment revealed that root iron content decrease in response to increasing concentrations of cadmium in the medium. These results suggest that cadmium competes with iron for uptake through ion transporters in lettuce root cells. As mentioned above, a candidate gene for this transport has been identified (LsIRTa), which paves the way towards the breeding for lettuce with reduced cadmium accumulation.Les activités humaines agricoles, urbaines et industrielles, sans cesse croissantes, sont à l'origine d'une contamination de notre environnement par les métaux lourds. Alors que de nombreuses molécules organiques peuvent être dégradées, les métaux lourds ne le peuvent pas et leur concentration augmente régulièrement dans les sols et les eaux. Ceci expose les plantes à des concentrations croissantes de métaux lourds. L’accumulation de métaux lourds dans les plantes présente un risque toxique pour l’Homme, car les plantes cultivées sont le point d’entrée dans la chaîne alimentaire. Par comparaison aux autres espèces, la laitue « Lactuca sativa » a tendance à présenter des teneurs élevées en cadmium, un métal lourd très toxique dont la concentration croît régulièrement dans les sols cultivés pour des raisons environnementales. En termes de sécurité alimentaire, il est donc important de produire des variétés accumulant des teneurs en cadmium réduites, et la laitue est un bon modèle pour débuter ce type d’approche.L’objectif de notre thèse était de caractériser aux niveaux physiologique, génétique, et moléculaire, les déterminants majeurs contrôlant l’accumulation du cadmium chez la laitue. Notre objectif a été décliné en différentes opérations. Tout d’abord une analyse de diversité nous a permis de décrire la capacité d’accumulation de cadmium de 18 génotypes de laitue et de sélectionner des génotypes présentant des performances extrêmes vis-à-vis du cadmium. Ainsi, des génotypes présentant des performances extrêmes du point de vue de la tolérance au cadmium, de l’accumulation de cadmium et de la capacité de translocation du cadmium des racines vers les parties aériennes ont été sélectionnés.Dans une deuxième étape, nos variétés extrêmes pour les caractères d’accumulation de cadmium et de translocation de cadmium des racines vers la partie aérienne ont été utilisées pour développer une approche physiologique. L’objectif de cette approche était de montrer l’origine de leur variabilité afin de comprendre les déterminants physiologiques contrôlant l’accumulation du cadmium chez la laitue.Dans le cadre de cette approche, des expériences d’efflux faites en utilisant du cadmium radioactif (109Cd) ont montré que la variété la moins accumulatrice de cadmium se caractérise par un efflux de cadmium marqué plus important par comparaison aux autres variétés. Cette variété possède vraisemblablement un mécanisme d’efflux plus efficace par comparaison aux autres variétés qui pourraient être le déterminant majeur permettant d’obtenir une plus faible accumulation de cadmium chez cette variété.Notre étude a permis de montrer une forte corrélation positive entre teneur en cadmium et teneur en zinc. Ce qui a permis d’émettre l’hypothèse d’un transport très associé entre le cadmium et le zinc. De même, une corrélation positive entre le niveau de translocation de cadmium des racines vers la partie aérienne et le niveau relatif du citrate entre les racines et les feuilles a été montrée. Cette corrélation suggère que le citrate pourrait être impliqué dans le transport du cadmium.Enfin, notre étude physiologique a permis de mettre en évidence un effet dépressif de l’augmentation des concentrations de fer et de calcium dans le milieu de culture sur l’accumulation du cadmium chez nos plantes de laitue.Ceci permet de penser que l'absorption de cadmium peut se faire d’une manière non spécifique via des transporteurs de fer et/ou de calcium.Dans le but de mieux comprendre les mécanismes impliqués dans l’accumulation du cadmium chez la laitue nous avons élaboré une approche génétique. Cette approchea visé à préciser le déterminisme, simple ou complexe, des caractères d’accumulation de cadmium et de translocation du cadmium des racines vers les parties aériennes. Pour cela des croisements ont été réalisés entre les génotypes les plus extrêmes pour ces caractères. À la suite de ces croisements, les populations F1 et F2 ont été analysées.Les résultats de l’analyse des plantes F1 ont montré qu’on est en présence d’une dominance forte, voire absolue, des caractères qui assurent la sensibilité au cadmium, la forte accumulation du cadmium et la forte translocation du cadmium des racines vers les parties aériennes. De même, pour ces trois caractères étudiés, les plantes F1 issues des deux sens de croisement ont montré un comportement identique vis-à-vis du cadmium ce qui prouve que nos caractères ne sont pas des liés au sexe.Les analyses des plantes F2 pour les deux caractères accumulation de cadmium et translocation de cadmium des racines vers les parties aériennes ont permis de montrer que la distribution phénotypique n’est pas bimodale pour les deux caractères étudiés, indiquant que ces caractères ne présentent pas des cas typiques de monohybridisme. Ces deux caractères sont donc contrôlés par plus qu’un seul gène pour chacun d’entre eux.Dans le but de mieux comprendre les mécanismes impliqués dans l’accumulation du cadmium chez la laitue, nous avons complété les approches d’analyse de la diversité, de physiologie et de génétique par une approche moléculaire. Cette approche avait comme objectif l'identification de corrélations, si elles existent, entre l'accumulation de cadmium dans les racines et/ou les feuilles et le niveau d’expression de gènes candidats décrits chez les espèces modèles comme impliqués dans le contrôle de l’accumulation de cadmium. Cette approche a permis de cloner et de séquencer des fragments d’ADN correspondant à 9 gènes candidats de laitue et d’évaluer le niveau de leurs expressions par PCR quantitative. Ensuite, l’expression de ces gènes a été comparée aux teneurs en cadmium et en zinc mesurées dans les racines et/ou les feuilles.À la suite ce cette étude nous avons pu mettre en évidence une éventuelle implication d’un gène de laitue (que nous avons nommé LsIRTa) dans l’accumulation du cadmium. Ce gène est très probablement un orthologue fonctionnel du gène AtIRT1 qui code un transporteur représentant la principale voie d'absorption du fer par les cellules racinaires d’Arabidopsis thaliana. D’autre part, nos résultats ont montré une corrélation positive entre l’expression d’un autre gène (que nous avons nommé LsPDRa) et l’accumulation du zinc et du cadmium au niveau foliaire, ce gène est donc très probablement impliqué dans l’accumulation de ces deux métaux à ce niveau, ce qui confirme davantage notre hypothèse de transport associé entre le cadmium et le zinc
The phylogenetic tree gathering the plant Zn/Cd/Pb/Co P1B-ATPases appears to be structured according to the botanical families
No full textW.Z. was supported by a scholarship from the Tunisian Ministry of Higher Education and Scientific Research (LR10CBBC02), and then by a scholarship from the "Agence universitaire de la francophonie" (AUF). We thank Dr F. Gosti and Dr L. Marques for critical reading of the manuscript, and A. Adiveze, H. Afonso, C. Baracco, H. Baudot, F. Bourgeois, C. Dasen, X. Dumont, C. Fizames, J. Garcia, S. Gelin, F. Lecocq, V. Papy, V. Rafin, G. Ruiz and C. Zicler, for technical and administrative supports.International audiencePlant Zn/Cd/Pb/Co P1B-ATPases (HMAs) play different roles, among which are the control of metal transport from the roots to the shoot and/or from the cytoplasm into the cell vacuole. Transferring the knowledge acquired on HMAs from model species to HMAs from other species requires one to identify orthologues in these other species. Through an extensive screening of the public sequence databases, 96 plant P1B-ATPases showing orthology to any of the AtHMA1, AtHMA2, AtHMA3 or AtHMA4 isoforms were identified from 32 plant species belonging to 15 botanical families. The number of paralogues within a species varied greatly from species to species, even within a specific botanical family, suggesting that gene duplication events occurred after speciation. The phylogenetic tree gathering the Zn/Cd/Pb/Co P1B-ATPases was strongly structured according to the botanical family to which the sequences could be related to. In particular, no strict orthology relationship links the Brassicaceae HMAs to the non-Brassicaceae or the Poaceae ones. Recent data showed that the sole rice HMA characterised to date displays different functional properties from the Arabidopsis HMAs. Altogether, data suggest that it might be risky to directly transfer the knowledge acquired through the study of HMAs in model plant species to HMAs from other species
Knowledge Type Identification in API Documentation
No full text<p>This release contains the source code and instruction on how to obtain the dataset to reproduce the results presented in the following paper</p>
<pre><code>@inproceedings{FMM19,
title={On Using Machine Learning to Identify Knowledge in API Reference Documentation},
author={Fucci, Davide and M. Alizadeh B., Alireza and Maalej, Walid},
booktitle={27th ACM Joint European Software Engineering Conference and Symposium on the Foundations of Software Engineering},
pages={103--112},
year={2019},
doi={10.1145/3338906.3338943}
organization={IEEE}
}
</code></pre>
The formation of the classical tafsīr tradition : the Qurʼān commentary of al-Thaʻlabī (d. 427/1035) by Walid A. Saleh.
No full text"This work is both an introduction to the genre of classical tafsir and a detailed study of one of its major architects, al-Thalabi (d. 427/1035). The book offers a detailed study of the hermeneutical principles that governed al-Thalabi's approach to the Quran, principles which became the norm in later exegetical works. It is divided into three main sections: the first outlines the life and times of the author; the second is a detailed study of his major exegetical work, al-Kashf; the third charts a brief history of the genre of tafsir through documenting the reactions of later exegetes to al-Kashf. This work brings together material never examined before and tries to offer anew way of understanding the history of classical Quran exegesis."--Jacket.Includes bibliographical references (pages 251-259) and indexes."This work is both an introduction to the genre of classical tafsir and a detailed study of one of its major architects, al-Thalabi (d. 427/1035). The book offers a detailed study of the hermeneutical principles that governed al-Thalabi's approach to the Quran, principles which became the norm in later exegetical works. It is divided into three main sections: the first outlines the life and times of the author; the second is a detailed study of his major exegetical work, al-Kashf; the third charts a brief history of the genre of tafsir through documenting the reactions of later exegetes to al-Kashf. This work brings together material never examined before and tries to offer anew way of understanding the history of classical Quran exegesis."--Jacket
Recherche des déterminants contrôlant l'accumulation du cadmium chez la laitue "Lactuca sativa"
No full textLes activités humaines agricoles, urbaines et industrielles, sans cesse croissantes, sont à l'origine d'une contamination de notre environnement par les métaux lourds. Alors que de nombreuses molécules organiques peuvent être dégradées, les métaux lourds ne le peuvent pas et leur concentration augmente régulièrement dans les sols et les eaux. Ceci expose les plantes à des concentrations croissantes de métaux lourds. L'accumulation de métaux lourds dans les plantes présente un risque toxique pour l'Homme, car les plantes cultivées sont le point d'entrée dans la chaîne alimentaire. Par comparaison aux autres espèces, la laitue Lactuca sativa a tendance à présenter des teneurs élevées en cadmium, un métal lourd très toxique dont la concentration croît régulièrement dans les sols cultivés pour des raisons environnementales. En termes de sécurité alimentaire, il est donc important de produire des variétés accumulant des teneurs en cadmium réduites, et la laitue est un bon modèle pour débuter ce type d'approche. L'objectif de notre thèse était de caractériser aux niveaux physiologique, génétique, et moléculaire, les déterminants majeurs contrôlant l'accumulation du cadmium chez la laitue. Notre objectif a été décliné en différentes opérations. Tout d'abord une analyse de diversité nous a permis de décrire la capacité d'accumulation de cadmium de 18 génotypes de laitue et de sélectionner des génotypes présentant des performances extrêmes vis-à-vis du cadmium. Ainsi, des génotypes présentant des performances extrêmes du point de vue de la tolérance au cadmium, de l'accumulation de cadmium et de la capacité de translocation du cadmium des racines vers les parties aériennes ont été sélectionnés. Dans une deuxième étape, nos variétés extrêmes pour les caractères d'accumulation de cadmium et de translocation de cadmium des racines vers la partie aérienne ont été utilisées pour développer une approche physiologique. L'objectif de cette approche était de montrer l'origine de leur variabilité afin de comprendre les déterminants physiologiques contrôlant l'accumulation du cadmium chez la laitue. Dans le cadre de cette approche, des expériences d'efflux faites en utilisant du cadmium radioactif (109Cd) ont montré que la variété la moins accumulatrice de cadmium se caractérise par un efflux de cadmium marqué plus important par comparaison aux autres variétés. Cette variété possède vraisemblablement un mécanisme d'efflux plus efficace par comparaison aux autres variétés qui pourraient être le déterminant majeur permettant d'obtenir une plus faible accumulation de cadmium chez cette variété. Notre étude a permis de montrer une forte corrélation positive entre teneur en cadmium et teneur en zinc. Ce qui a permis d'émettre l'hypothèse d'un transport très associé entre le cadmium et le zinc.Cadmium is an extremely toxic pollutant causing a great number of diseases. It is a widespread metal which concentration rises in cultivated soils, thus exposing food or feed crops to it and ultimately causing potential major sanitary problems as a consequence of its entry in the food chain. Among the vegetable species used for food, lettuce shows one of the highest capacities of accumulating cadmium. Our objectives are to characterize mechanisms controlling cadmium accumulation in this species and identify the corresponding genetic determinants, ultimately aiming at breeding lettuce for cadmium under-accumulation.A phenotypical analysis of cadmium accumulation was carried out on 18 lettuce genotypes representing the genetic diversity of the species, revealing a great variability of response, both with respect to cadmium accumulation and cadmium translocation from roots to shoot. The lettuce genotypes displayed independent variations for both traits, and also between these traits and cadmium tolerance. In contrast, a very strong positive correlation linked cadmium and zinc accumulation. Increasing calcium and iron concentration in the culture medium had a protective effect against cadmium accumulation, however this characteristic did not discriminate the lettuce genotypes presenting extreme cadmium accumulation phenotypes. Interestingly, experiments measuring 109Cd influx in roots, 109Cd efflux from roots and 109Cd translocation from roots to shoots revealed that the genotype displaying the least cadmium accumulation could be discriminated from the genotype displaying the highest one by its markedly increased ability to efflux cadmium from the roots to the culture medium. Progeny analysis from crosses between the genotypes displaying extreme performances for cadmium accumulation, cadmium translocation from roots to shoots and cadmium tolerance revealed that none of these traits was supported by a single genetic determinism. QTL mapping is under development. Surprisingly, the genetic analysis demonstrated that the ability to limit cadmium accumulation (and thus probably to increase cadmium efflux from the roots) was recessive.In conclusion, phenotypic analysis of cadmium accumulation in a large set of lettuce genotypes revealed that a major determinant limiting cadmium accumulation in these species is the ability to efflux cadmium from the root to the culture medium.MONTPELLIER-SupAgro La Gaillarde (341722306) / SudocSudocFranceF
Exploring Author Context for Detecting Intended vs Perceived Sarcasm
No full textWe investigate the impact of using author context on textual sarcasm detection. We define author context as the embedded representation of their historical posts on Twitter and suggest neural models that extract these representations. We experiment with two tweet datasets, one labelled manually for sarcasm, and the other via tag-based distant supervision. We achieve state-of-the-art performance on the second dataset, but not on the one labelled manually, indicating a difference between intended sarcasm, captured by distant supervision, and perceived sarcasm, captured by manual labelling.<br/
Exploring Author Context for Detecting Intended vs Perceived Sarcasm
No full textWe investigate the impact of using author context on textual sarcasm detection. We define author context as the embedded representation of their historical posts on Twitter and suggest neural models that extract these representations. We experiment with two tweet datasets, one labelled manually for sarcasm, and the other via tag-based distant supervision. We achieve state-of-the-art performance on the second dataset, but not on the one labelled manually, indicating a difference between intended sarcasm, captured by distant supervision, and perceived sarcasm, captured by manual labelling.<br/
Flaubert lecteur de l'Histoire naturelle de Pline
No full textThis article questions the relationship between flaubertian writing and the latin text that represents one of the major sources of Salammbo’s composition. It intends more specifically to examine the way in which the details taken from Pliny’s Natural History and which were diversely used by Flaubert during the composition of the “ roman carthaginois” were processed. In fact, various methods and techniques were implemented in the genesis : – combining data stemming from the author''s reading with issues of his own experience – condensating data – deliberately pursuing strangeness and seeking inaccuracy – description serving narration. With Flaubert, the ancient works lose their exemplary nature and become sources of documentation and the Ancients cease being the ideals they were during the renaissance and the classical periods. Analyzing these methods and processes can bring us to reflect on the poetic aspect of Flaubert’s writing largely based on documentation.Cet article s’interroge sur la relation qu’entretient l’écriture flaubertienne avec le texte latin et qui constitue l’un des ressorts clefs de la composition de Salammbô : il se propose plus précisément d’examiner la façon dont sont transformés les détails empruntés à l’Histoire naturelle de Pline, et qui sont diversement exploités par Flaubert pendant la composition du roman carthaginois. En effet, différentes méthodes et techniques sont utilisées au cours de la genèse de l’oeuvre : combinaison entre des données tirées des lectures de l’auteur et d’autres provenant de son expérience propre, condensation de données, recherche de l’étrangeté, imprécision volontaire, description au service de la narration. Avec Flaubert, les ouvrages anciens perdent leur exemplarité pour devenir sources de documentation et les Anciens cessent d’être des modèles comme ils l’étaient à la Renaissance et à l’époque classique. L’analyse de ces méthodes et procédés peut nous amener à réfléchir sur la poétique d''une écriture flaubertienne fondée en grande partie sur la documentation.Ezzine Walid. Flaubert lecteur de l'Histoire naturelle de Pline. In: Ktèma : civilisations de l'Orient, de la Grèce et de Rome antiques, N°35, 2010. pp. 393-401
- …
