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Émergence du virus chikungunya en Amérique et en Europe
No full textChikungunya virus (CHIKV), transmitted mainly by the mosquitoes Aedes aegypti and Aedes albopictus, is a major public health problem. Since 2004, CHIKV epidemics have been reported in Africa, Asia, the Indian Ocean Islands, and Europe. Only the Americas seemed spared despite high densities of mosquitoes and multiple introductions of the virus to the continent by travelers returning from countries where CHIKV was circulating. We have assessed the risk of CHIKV emergence in the Americas by evaluating the vector competence of 35 local populations of Ae. aegypti and Ae. albopictus infected with different strains of CHIKV. These populations were shown to be susceptible to CHIKV infection, highlighting the predominant role of salivary glands as a "filter" of transmission. Genotyping of Ae. albopictus from the Americas using microsatellites allowed the identification of a genetic cluster of populations characterized by a low transmission of CHIKV strains of the East-Central-South-African genotype. In October 2013, Asian strains of CHIKV began circulating in the Caribbean. Thus, we evaluated the susceptibility of 11 populations of Ae. aegypti and Ae. albopictus to the Asian CHIKV genotype and showed that the two species were sufficiently competent to ensure dissemination of the virus throughout the continent. Furthermore, we showed that Ae. albopictus was likely to facilitate the spread of CHIKV to Europe. However, the vector competence of French Ae. albopictus to the Asian CHIKV genotype was negatively affected by temperatures lower than those usually found in tropical countries.Le virus chikungunya (CHIKV), transmis par les moustiques Aedes aegypti et Aedes albopictus, constitue un problème majeur de santé publique. Depuis 2004, des épidémies de CHIKV ont été rapportées en Afrique, en Asie, dans les îles de l'Océan Indien, et en Europe. Seule l'Amérique semblait épargnée malgré la présence de fortes densités de moustiques vecteurs et de multiples importations du virus dans le continent par des voyageurs de retour de pays où le virus circulait. Nous avons abordé dans cette thèse le risque d'émergence du CHIKV en Amérique à partir d'une évaluation de la compétence vectorielle de 35 populations d'Ae. aegypti et Ae. albopictus locaux avec différentes souches de CHIKV. Ces populations sont compétentes vis-à-vis du CHIKV avec un rôle des glandes salivaires comme "filtre" de la transmission. De plus, le génotypage des Ae. albopictus d'Amérique par microsatellites a permis d'identifier un cluster génétique de populations se caractérisant par une faible transmission des souches de CHIKV de génotype Est-Centre-Sud-africain. En octobre 2013, des souches asiatiques de CHIKV ont été signalées dans la Caraïbe. Nous avons alors évalué la réceptivité de 11 populations d'Ae. aegypti et Ae. albopictus d'Amérique vis-à-vis de CHIKV de génotype asiatique et avons mis en évidence que les deux espèces étaient compétents pour assurer la diffusion du virus sur le continent. On note aussi qu'Ae. albopictus peut faciliter la propagation du CHIKV vers l'Europe. Néanmoins, la compétence vectorielle d'Ae. albopictus de France vis-à-vis de CHIKV asiatique est affectée négativement par des températures plus basses que celles habituellement observées dans les pays tropicaux
Chikungunya virus emergence in the Americas and Europe
No full textLe virus chikungunya (CHIKV), transmis par les moustiques Aedes aegypti et Aedes albopictus, constitue un problème majeur de santé publique. Depuis 2004, des épidémies de CHIKV ont été rapportées en Afrique, en Asie, dans les îles de l'Océan Indien, et en Europe. Seule l'Amérique semblait épargnée malgré la présence de fortes densités de moustiques vecteurs et de multiples importations du virus dans le continent par des voyageurs de retour de pays où le virus circulait. Nous avons abordé dans cette thèse le risque d'émergence du CHIKV en Amérique à partir d'une évaluation de la compétence vectorielle de 35 populations d'Ae. aegypti et Ae. albopictus locaux avec différentes souches de CHIKV. Ces populations sont compétentes vis-à-vis du CHIKV avec un rôle des glandes salivaires comme "filtre" de la transmission. De plus, le génotypage des Ae. albopictus d'Amérique par microsatellites a permis d'identifier un cluster génétique de populations se caractérisant par une faible transmission des souches de CHIKV de génotype Est-Centre-Sud-africain. En octobre 2013, des souches asiatiques de CHIKV ont été signalées dans la Caraïbe. Nous avons alors évalué la réceptivité de 11 populations d'Ae. aegypti et Ae. albopictus d'Amérique vis-à-vis de CHIKV de génotype asiatique et avons mis en évidence que les deux espèces étaient compétents pour assurer la diffusion du virus sur le continent. On note aussi qu'Ae. albopictus peut faciliter la propagation du CHIKV vers l'Europe. Néanmoins, la compétence vectorielle d'Ae. albopictus de France vis-à-vis de CHIKV asiatique est affectée négativement par des températures plus basses que celles habituellement observées dans les pays tropicaux.Chikungunya virus (CHIKV), transmitted mainly by the mosquitoes Aedes aegypti and Aedes albopictus, is a major public health problem. Since 2004, CHIKV epidemics have been reported in Africa, Asia, the Indian Ocean Islands, and Europe. Only the Americas seemed spared despite high densities of mosquitoes and multiple introductions of the virus to the continent by travelers returning from countries where CHIKV was circulating. We have assessed the risk of CHIKV emergence in the Americas by evaluating the vector competence of 35 local populations of Ae. aegypti and Ae. albopictus infected with different strains of CHIKV. These populations were shown to be susceptible to CHIKV infection, highlighting the predominant role of salivary glands as a "filter" of transmission. Genotyping of Ae. albopictus from the Americas using microsatellites allowed the identification of a genetic cluster of populations characterized by a low transmission of CHIKV strains of the East-Central-South-African genotype. In October 2013, Asian strains of CHIKV began circulating in the Caribbean. Thus, we evaluated the susceptibility of 11 populations of Ae. aegypti and Ae. albopictus to the Asian CHIKV genotype and showed that the two species were sufficiently competent to ensure dissemination of the virus throughout the continent. Furthermore, we showed that Ae. albopictus was likely to facilitate the spread of CHIKV to Europe. However, the vector competence of French Ae. albopictus to the Asian CHIKV genotype was negatively affected by temperatures lower than those usually found in tropical countries
Influence of breeding sites on the bacterial microbiota, the vector competence and survival of the Aedes aegypti mosquito
No full textLe moustique Aedes aegypti est le principal vecteur des virus de la dengue (DENV) et du Zika (ZIKV). Il devient urgent de développer de nouveaux outils pour réduire la transmission des virus à l’homme par ce culicidé. Un domaine prometteur concerne les bactéries associées aux moustiques vecteurs : le microbiote bactérien. Nous émettons l’hypothèse que la variabilité naturelle des propriétés biotiques et abiotiques des gîtes peut façonner le microbiote des moustiques, et influencer indirectement des traits phénotypiques liés à leur aptitude à transmettre les virus. Nous avons montré que les larves d’Ae. aegypti de Guadeloupe et de Guyane ont un microbiote qui leur est propre, influencé par les propriétés physico-chimiques et les communautés bactériennes présentes dans l’eau de leurs gîtes respectifs. Nous avons montré qu'Ae. aegypti de Guadeloupe est capable de transmettre le DENV et différentes souches de ZIKV avec des efficacités contrastées selon la souche virale. Enfin, les larves d'Ae. aegypti ont été exposé à des microbiotes bactériens contrastés afin d'évaluer leur impact sur le microbiote des adultes, leur compétence vectorielle et leur survie. Nous avons trouvé des différences significatives dans la transmission de ZIKV entre les moustiques issus de gites aux microbiote bactériens distincts. Des différences de survie selon le microbiote du gîte larvaire et le repas sanguin infectieux ont également été observé. Ces travaux de thèse améliorent les connaissances sur la dynamique des communautés bactériennes d’Ae. aegypti et son impact dans sa capacité vectorielle, dans le but d'identifier des bactéries pour réduire la transmission des virus par Ae. aegypti.The Aedes aegypti mosquito is the main vector for dengue (DENV) and Zika (ZIKV). It becomes urgent to develop new tools to reduce the transmission of these viruses to humans by the mosquito. One promising area concerns bacteria associated with mosquito vectors: the bacterial microbiota. The natural variability in the biotic and abiotic breeding site properties may shape the microbiota of mosquitoes, and indirectly influence phenotypic traits related to their ability to transmit viruses. We showed that Ae. aegypti larvae from Guadeloupe and French Guiana have their own microbiota, influenced by the physico-chemical properties and bacterial communities from the water of their respective breeding sites. We then showed that Ae. aegypti from Guadeloupe is capable of transmitting DENV and different strains of ZIKV with contrasted efficiencies depending on the viral strain. Next, we exposed Ae. aegypti larvae to contrasting bacterial microbiota in order to evaluate their impact on the bacterial microbiota of adult, their vector competence and their survival. We found significant differences in the transmission of ZIKV between mosquitoes from different breeding conditions. We observed differences in survival, driven by the microbiota of breeding sites and the infectious bloodmeal. Taken together, our results show that differences on breeding sites microbiota can impact vector competence and survival of adult mosquitoes. This thesis work improves knowledge of the dynamics of bacterial communities associated with Ae. aegypti and its impact on the vectorial competence of this vector, with the goal of identifying candidate bacteria to reduce virus transmission by Ae. aegypti
Transmisión de arbovirus en poblaciones de Aedes aegypti (Diptera Culicidae) de La Habana, Cuba
No full textLa transmission vectorielle des arbovirus (dengue, chikungunya et Zika) par Aedesaegypti, et notamment leur transmission verticale, demeure un sujet insuffisamment étudié malgré son importance pour comprendre l'épidémiologie de ces maladies. L'objectif général de cette thèse était de caractériser la transmission verticale et horizontale des virus de la dengue, du chikungunya et du Zika dans les populations d'Ae. aegypti à La Havane dans des conditions naturelles et en laboratoire. Pour atteindre cet objectif, nous avons déterminé la dynamique spatio-temporelle de la transmission verticale des virus de la dengue et du Zika dans les populations d'Ae. aegypti de La Havane dans des conditions naturelles. En utilisant des techniques moléculaires (PCR et séquençage des nucléotides), des stades immatures provenant de plusieurs territoires de La Havane ont été examinés, ce qui a révélé la présence dans ces populations des vecteurs des quatre sérotypes de la dengue et du virus Zika. Ces résultats ont démontré pour la première fois l'existence d'une transmission verticale naturelle de ces flavivirus dans les populations cubaines de vecteurs. La fréquence relativement élevée de transmission verticale identifiée et les taux d'infection obtenus pour les virus de la dengue dans certaines des zones étudiées suggère leur circulation soutenue dans les populations d'Ae. aegypti étudiées. En outre, des études de laboratoire ont été réalisées pour évaluer la capacité des populations locales à transmettre horizontalement et verticalement les virus de la dengue-1, du chikungunya et du Zika. Les tests de compétence vectorielle réalisées ont mis en lumière des taux modérés (<25%) et similaires d'infection, de dissémination et de transmission des virus de la dengue-1 et du Zika parmi les populations évaluées, ce qui a confirmé l'implication de cette espèce dans la transmission de ces virus au cours des foyers autochtones et des épidémies qui se sont produits à La Havane. Par ailleurs, la capacité de ce vecteur à transmettre le virus du chikungunya à partir de trois jours après l'exposition à ce virus a été démontrée, ce qui souligne un véritable risque d'épidémies liées à cet alphavirus à Cuba. Des évaluations de transmission verticale realisées avec les mêmes populations de moustiques en laboratoire ont démontré leur capacité similaire à transmettre verticalement les trois virus pendant les premier et deuxième cycles gonadotrophiques, ratifiant les résultats trouvés sur le terrain. Enfin, les femelles Ae. aegypti infectées verticalement ont délivré des particules virales infectieuses de chikungunya et de Zika dans leur salive, ce qui démontre le potentiel de cette voie de transmission à générer des vecteurs capables d'infecter des hôtes vertébrés. La présence du virus de la dengue-1 a également été détectée dans la tête des femelles infectées verticalement, ce qui laisse supposer que ce mécanisme pourrait également concerner ce flavivirus. L’ensemble des résultats obtenus indique que la transmission verticale chez Ae. aegypti est un mode de transmission épidémiologiquement pertinent qui mérite une étude plus approfondie et, en même temps, renforce l'importance du contrôle des stades immatures de vecteurs et de leur suivi entomovirologique pour la prévention et la surveillance de la circulation des arbovirus à Cuba.Vector-borne transmission of arboviruses (dengue, chikungunya and Zika) by Aedes aegypti is a key phenomenon to understand the epidemiology of these diseases, however, it remains insufficiently studied. The aim of this thesis was to characterize the vertical and horizontal transmission of dengue, chikungunya, and Zika viruses in Ae. aegypti populations from Havana, Cuba under natural and laboratory conditions. To fulfill this objective, the spatiotemporal dynamics of dengue and Zika viruses vertical transmission by Ae. aegypti populations was determined in Havana under natural conditions. Using molecular techniques (PCR and nucleotide sequencing), immature Ae. aegypti forms from several territories in Havana were examined, detecting the four dengue serotypes and Zika virus. These findings demonstrated for the first time the occurrence of natural vertical transmission of these flaviviruses in Cuban vector populations. The relatively high frequency of occurrence and infection rates of dengue viruses in some of the studied areas suggested a sustained circulation of these viruses in Ae. aegypti populations. In addition, laboratory studies were conducted to evaluate the ability of local populations to transmit horizontally and vertically dengue-1, chikungunya and Zika viruses. Vector competence assays showed moderate (<25%) similar infection, dissemination and transmission rates of dengue-1 and Zika viruses among the examined populations, which ratified the involvement of this species in the transmission of these flaviviruses during the outbreaks that have taken place in Havana. Additionally, it was proven the ability of this vector to transmit chikungunya virus from three days post-exposure, which alerts to the risk of outbreaks and epidemics of this alphavirus in Cuba. Vertical transmission assays performed with the same mosquito populations demonstrated their similar ability to transmit vertically the three viruses during the first and second gonadotrophic cycles, ratifying the results found in the field. Finally, we verified that vertically infected Ae. aegypti females expel infectious chikungunya and Zika viral particles in saliva, demonstrating the capability of the vertical transmission route to generate potential infective vectors able to infect vertebrate hosts. The presence of dengue-1 virus was also detected in the heads of vertically infected females, which alerts to the possible occurrence of this mechanism also with this flavivirus. All these results point to vertical transmission in Ae. aegypti as an epidemiologically relevant transmission mode for arboviruses that deserves further investigation, while reinforcing the importance of controlling pre-adult vector populations and their entomo-virological monitoring as a promising tool for the prevention and surveillance of arbovirus circulation in Cuba.La transmisión vectorial de arbovirus (dengue, chikungunya y Zika) por Aedes aegypti es un fenómeno clave para comprender la epidemiología de estas enfermedades, sin embargo, es una temática insuficientemente estudiada. El objetivo general de esta tesis fue caracterizar la transmisión vertical y horizontal de los virus del dengue, chikungunya y Zika en poblaciones de Ae. aegypti de localidades de La Habana en condiciones naturales y de laboratorio. Para dar cumplimiento a este objetivo, se determinó la dinámica espacio-temporal de la transmisión vertical de los virus del dengue y Zika en poblaciones habaneras de Ae. aegypti, en condiciones naturales. Mediante técnicas moleculares (PCR y secuenciación nucleotídica) se examinaron estadios inmaduros de varios territorios de La Habana, comprobando la presencia de los cuatro serotipos de dengue y el virus Zika. Estos hallazgos demostraron por primera vez la ocurrencia de transmisión vertical natural de estos flavivirus en poblaciones cubanas del vector. Las relativamente altas frecuencia de aparición y tasas de infección por los virus del dengue en algunas de las áreas estudiadas sugirieron una circulación sostenida de estos virus en las poblaciones de Ae. aegypti. Además, se desarrollaron estudios de laboratorio para evaluar la habilidad de poblaciones locales para transmitir horizontal y verticalmente de los virus dengue-1, chikungunya y Zika. Los ensayos de competencia vectorial mostraron tasas de infección, diseminación y transmisión de los virus dengue-1 y Zika moderadas (<25%) y similares entre las poblaciones evaluadas, lo que ratificó la implicación de esta especie en la transmisión de estos durante los brotes/epidemias ocurridos en La Habana. Adicionalmente, se comprobó la habilidad de este vector para transmitir el virus chikungunya desde los tres días post exposición, lo cual constituyó una alerta sobre el riesgo latente de brotes de este alfavirus en Cuba. Los ensayos de transmisión vertical desarrollados con las mismas poblaciones de mosquito, demostraron la habilidad similar de ambas para transmitir verticalmente los tres virus durante el primer y segundo ciclos gonadotróficos, ratificando los resultados encontrados en el terreno. Por último, se comprobó que hembras de Ae. aegypti infectadas verticalmente excretaron partículas virales infecciosas de chikungunya y Zika en la saliva, lo cual demuestra la capacidad de esta vía de transmisión para generar vectores con potencialidad para infectar hospederos vertebrados. También se detectó la presencia del virus dengue-1 en cabezas de hembras infectadas verticalmente, lo que alerta sobre la posible ocurrencia de este mecanismo también con este flavivirus. El conjunto de resultados obtenidos señala a la transmisión vertical en Ae. aegypti como un modo de transmisión de arbovirus epidemiológicamente relevante que amerita continuar siendo estudiado y a la vez, refuerza la importancia del control de las poblaciones pre-adultas del vector y del monitoreo entomo-virológico de las mismas como una herramienta promisoria para la prevención y la vigilancia de la circulación de arbovirus en Cuba
Going Beyond Counting First Authors in Author Co-citation Analysis
No full textThe present study examines one of the fundamental aspects of author co-citation analysis (ACA) - the way co-citation
counts are defined. Co-citation counting provides the data on which all subsequent statistical analyses and mappings
are based, and we compare ACA results based on two different types of co-citation counting - the traditional type that
only counts the first one among a cited work's authors on the one hand and a non-traditional type that takes into
account the first 5 authors of a cited work on the other hand. Results indicate that the picture produced through this non-traditional author co-citation counting contains more coherent author groups and is therefore considerably clearer. However, this picture represents fewer specialties in the research field being studied than that produced through the traditional first-author co-citation counting when the same number of top-ranked authors is selected and analyzed. Reasons for these effects are discussed
Variations on the Author
No full text“Variations on the Author” discusses two of Eduardo Coutinho’s recent films (Um Dia na Vida, from 2010, and Últimas Conversas, posthumously released in 2015) and their contribution to the general question of documentary authorship. The director’s filmography is characterized by a consistent yet self-effacing form of authorial self-inscription: Coutinho often features as an interviewer that rather than express opinions propels discourses; an interviewer that is good at listening. This mode of self-inscription characterizes him as an author who is not expressive but who is nonetheless markedly present on the screen. In Um Dia na Vida, however, Coutinho is completely absent form the image, while Últimas Conversas, on the contrary, includes a confessional prologue that moves the director from the margins to the center of his films. This article examines the ways in which these works stand out in the filmography of a director who offers new insights into the notion of cinematic authorship
Appropriate Similarity Measures for Author Cocitation Analysis
No full textWe provide a number of new insights into the methodological discussion about author cocitation analysis. We first argue that the use of the Pearson correlation for measuring the similarity between authors’ cocitation profiles is not very satisfactory. We then discuss what kind of similarity measures may be used as an alternative to the Pearson correlation. We consider three similarity measures in particular. One is the well-known cosine. The other two similarity measures have not been used before in the bibliometric literature. Finally, we show by means of an example that our findings have a high practical relevance.information science;Pearson correlation;cosine;similarity measure;author cocitation analysis
Dispelling the Myths Behind First-author Citation Counts
No full textWe conducted a full-scale evaluative citation analysis study of scholars in the XML research field to explore just how different from each other author rankings resulting from different citation counting methods actually are, and to demonstrate the capability of emerging data and tools on the Web in supporting more realistic citation counting methods. Our results contest some common arguments for the continued
use of first-author citation counts in the evaluation of scholars, such as high correlations between author rankings by first-author citation counts and other citation
counting methods, and high costs of using more realistic citation counting methods that are not well-supported by the ISI databases. It is argued that increasingly available digital full text research papers make it possible for citation analysis studies to go beyond what the ISI databases have directly supported and to employ more
sophisticated methods
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