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Determinación de la capacidad celulolítica in vitro de consorcios de hongos provenientes de suelo del bosque alto andino y tusas de palma de aceite (eleaeis guinensis jacq) en descomposición sobre dos sustratos: tusa y celulosa microcristalina
La celulosa es el principal constituyente de la biomasa y en términos de producción anual, uno de los polímeros más importantes sobre la tierra. Sin embargo, su degradación es difícil debido a la estructura misma de la celulosa y a su asociación con otros polímeros como la lignina y la hemicelulosa (O'Sullivan 1997, Lynd 2002, Mansfield y Meder, 2003). En Colombia la agroindustria de la palma de aceite genera grandes volúmenes de biomasa, entre las cuales la tusa es el principal residuo sólido producto de la extracción de aceite a partir de los racimos de frutos frescos cosechados. Así, en 2008 se disponía de alrededor de 496.225 ton de tusa (García, Cárdenas y Yáñez 2009) y su uso como acondicionador del suelo no es muy atractivo debido al alto costo del transporte en campo y a su difícil degradación. Una alternativa para el aprovechamiento de la tusa, que genera valor agregado a la cadena de producción, es la transformación de la celulosa a azúcares más simples, los cuales pueden ser fermentados para producir alcohol (Alam, y otros 2009). Dicha transformación se inicia con la hidrólisis de la celulosa mediante el uso de métodos químicos o biológicos. Los métodos químicos implican el uso de ácidos o bases fuertes en grandes cantidades que de ser liberados al ambiente causaría una gran contaminación ambiental. En contraste, los métodos biológicos ofrecen una alternativa al usar microorganismos capaces de producir celulasas las cuales son enzimas que hidrolizan la celulosa hasta obtener moléculas más simples como la glucosa. Se han reportado microorganismos con actividad celulítica in vitro sobre tusa como los hongos Aspergillus niger (Prasertsan y otros, 1997), Trichoderma reeseii (Rodríguez y Piñeros, 2007), Chaetomium spp. (Umikalsom, y otros 1997). Sin embargo, es necesario identificar nuevos microorganismos con altos niveles de actividad celulolítica en ColombiaMaestrí
Determinación de la capacidad celulolítica in vitro de consorcios de hongos provenientes de suelo del bosque alto andino y tusas de palma de aceite (eleaeis guinensis jacq) en descomposición sobre dos sustratos: tusa y celulosa microcristalina
La celulosa es el principal constituyente de la biomasa y en términos de producción anual, uno de los polímeros más importantes sobre la tierra. Sin embargo, su degradación es difícil debido a la estructura misma de la celulosa y a su asociación con otros polímeros como la lignina y la hemicelulosa (O'Sullivan 1997, Lynd 2002, Mansfield y Meder, 2003). En Colombia la agroindustria de la palma de aceite genera grandes volúmenes de biomasa, entre las cuales la tusa es el principal residuo sólido producto de la extracción de aceite a partir de los racimos de frutos frescos cosechados. Así, en 2008 se disponía de alrededor de 496.225 ton de tusa (García, Cárdenas y Yáñez 2009) y su uso como acondicionador del suelo no es muy atractivo debido al alto costo del transporte en campo y a su difícil degradación. Una alternativa para el aprovechamiento de la tusa, que genera valor agregado a la cadena de producción, es la transformación de la celulosa a azúcares más simples, los cuales pueden ser fermentados para producir alcohol (Alam, y otros 2009). Dicha transformación se inicia con la hidrólisis de la celulosa mediante el uso de métodos químicos o biológicos. Los métodos químicos implican el uso de ácidos o bases fuertes en grandes cantidades que de ser liberados al ambiente causaría una gran contaminación ambiental. En contraste, los métodos biológicos ofrecen una alternativa al usar microorganismos capaces de producir celulasas las cuales son enzimas que hidrolizan la celulosa hasta obtener moléculas más simples como la glucosa. Se han reportado microorganismos con actividad celulítica in vitro sobre tusa como los hongos Aspergillus niger (Prasertsan y otros, 1997), Trichoderma reeseii (Rodríguez y Piñeros, 2007), Chaetomium spp. (Umikalsom, y otros 1997). Sin embargo, es necesario identificar nuevos microorganismos con altos niveles de actividad celulolítica en Colombi
Optimización del proceso de producción, purificación y caracterización de una lacasa a partir de un hongo nativo con potencial aplicación en procesos biotecnológicos
La producción de enzimas lignolíticas es una propiedad que exhiben algunos organismos como los hongos. Entre ellas las lacasas se destacan como enzimas oxidasas de cobre (E.C. 1.10.3.2) que catalizan la oxidación por un electrón de compuestos fenólicos, aminas aromáticas, y otros sustratos ricos en electrones con la concomitante reducción de O2 a H2O, con una amplia inespecificidad de sustrato que las hace llamativas para diferentes aplicaciones industriales. Este trabajo buscó potenciar la producción de una lacasa seleccionada entre 7 hongos productores evaluados, con miras a su purificación y caracterización. La cepa seleccionada fue el organismo Xylaria sp. (CH003) el cual fue encontrado sobre madera en descomposición en el Parque Natural Chicaque ubicado entre los municipios de Soacha y San Antonio, Cundinamarca, Colombia. La actividad lacasa fue valorada utilizando azino-bis(3-etilbenzotiazolina)-6-sulfonato (ABTS) en cultivos del hongo llevados a cabo en fermentación sumergida, encontrando una alta actividad (1021±114 U/L). El medio de cultivo fue optimizado mediante el método de un factor a la vez para fuentes de carbono y nitrógeno, un arreglo ortogonal de Taguchi, y el uso de inductores. Los resultados mostraron que el salvado de trigo (50g/L), KNO3 (1,4g/L) y el inductor 2,5-xilidina (1mM) son componentes importantes del medio de cultivo para elevar la actividad enzimática a un valor de 20535±1405 U/L. Una vez optimizado el medio para la producción de lacasas, la enzima fue purificada mediante diafiltración, cromatografía de intercambio aniónico DEAE, y de exclusión por tamaño. Se obtuvo un factor de purificación de 7,45 y un rendimiento de 0,51% y una vez purificada presentó una actividad específica de 388 U/mg. De acuerdo al análisis electroforético 2D se sugiere la presencia de una proteína de ~38KDa, con un pI de 4,9. Por espectrometría de masas se detectó la presencia de los péptidos GPASAPYDEDK y LVNTAIDTMFK que han sido reportados para lacasas. La enzima purificada presentó un rango de pH y temperatura óptima de reacción entre 3-4 y 50-60°C, respectivamente. Sin embargo, se observó una mayor estabilidad a 30 °C durante tres horas de incubación, manteniendo el 97,2% de actividad, y también una alta estabilidad a valores de pH de 6,7 y 8 reteniendo más del 80% de la actividad luego de tres horas. Usando ABTS se determinó una Km de 297μM y una Vmax de 581,4 μM/min a un pH y temperatura de reacción de 4,5 y 22°C. La enzima fue inhibida por el ion Fe2+, pero inducida por el ion Cu2+. Adicionalmente la enzima no fue altamente inhibida por EDTA (1 y 10mM) en donde conservó casi el 80% de su actividad, pero sí fuertemente inhibida por azida de sodio (1 y 10mM), DTT (0,1mM) y KCN (5mM), en donde la actividad se redujo a menos del 5%.Abstract. The production of ligninolytic enzymes is a property exhibited by certain organisms as fungi. Among these enzymes, laccases are known as multicopper oxidases (E.C. 1.10.3.2) that catalyze oxidation by one electron of phenolic compounds, aromatic amines, and other electron-rich substrates with concomitant reduction of O2 to H2O, with broad substrate non-specificity, which make them appealing for different industrial applications. This work enhanced laccase production from one fungi selected among 7 enzyme producing organisms, in order to purify efficiently the enzyme and characterize it. The selected strain was the organism Xylaria sp. (CH003) which was founded on decaying wood in Natural Park Chicaque located between towns Soacha and San Antonio, Cundinamarca, Colombia. Laccase activity was measured using azino-bis(3- ethylbenzothiazoline)-6-sulfonate (ABTS) in cultures carried out through submerged fermentation, finding a high activity value associated with this strain (1021 ±114 U/L). Culture media was optimized through one-factor-at the time method for different carbon and nitrogen sources, a Taguchi orthogonal design, and use of inductors. Results showed that wheat bran and KNO3 at a concentration 50g/L and 1,4g/L, respectively, besides inductor 2,5-xylidine (1mM) are important components to raise laccase activity to 20535±1405 U/L. Laccase from Xylaria sp. produced with this strategy was purified through diafiltration, anion exchange chromatography (DEAE) and gel filtration. It was obtained a purification factor of 7,45 and a yield of 0,51%, and once purified laccase showed a specific activity of 388 U/mg. According electrophoretic analysis in 2D electrophoresis was suggested an enzyme of ~38 KDa, and pI of 4,9. Mass spectrometry analysis found peptides GPASAPYDEDK and LVNTAIDTMFK previously reported for laccases. The purified enzyme had optimal pH and temperature among 3-4 and 50-60°C, respectively. However it was observed major stability at 30° retaining 97,2% of the activity, and pH values of 6,7 and 8, retaining more than 80% of activity after three hours of incubation. Kinetic parameters as Km and Vmax was determined using ABTS as substrate finding values of 297μM and 581,4 μM/min respectively, at a pH of 4,5 and temperature of 22°C. Enzyme was inhibited by Fe2+ ion, but induced by Cu2+ ion. Additionally enzyme was not inhibited strongly by EDTA (1 and 10mM), since it kept almost 80% of activity, but highly inhibited by sodium azide (1 and 10mM), DTT (0,1mM), and KCN (5mM), where activity was decreased at less than 5%.Maestrí
Going Beyond Counting First Authors in Author Co-citation Analysis
The present study examines one of the fundamental aspects of author co-citation analysis (ACA) - the way co-citation
counts are defined. Co-citation counting provides the data on which all subsequent statistical analyses and mappings
are based, and we compare ACA results based on two different types of co-citation counting - the traditional type that
only counts the first one among a cited work's authors on the one hand and a non-traditional type that takes into
account the first 5 authors of a cited work on the other hand. Results indicate that the picture produced through this non-traditional author co-citation counting contains more coherent author groups and is therefore considerably clearer. However, this picture represents fewer specialties in the research field being studied than that produced through the traditional first-author co-citation counting when the same number of top-ranked authors is selected and analyzed. Reasons for these effects are discussed
Variations on the Author
“Variations on the Author” discusses two of Eduardo Coutinho’s recent films (Um Dia na Vida, from 2010, and Últimas Conversas, posthumously released in 2015) and their contribution to the general question of documentary authorship. The director’s filmography is characterized by a consistent yet self-effacing form of authorial self-inscription: Coutinho often features as an interviewer that rather than express opinions propels discourses; an interviewer that is good at listening. This mode of self-inscription characterizes him as an author who is not expressive but who is nonetheless markedly present on the screen. In Um Dia na Vida, however, Coutinho is completely absent form the image, while Últimas Conversas, on the contrary, includes a confessional prologue that moves the director from the margins to the center of his films. This article examines the ways in which these works stand out in the filmography of a director who offers new insights into the notion of cinematic authorship
Appropriate Similarity Measures for Author Cocitation Analysis
We provide a number of new insights into the methodological discussion about author cocitation analysis. We first argue that the use of the Pearson correlation for measuring the similarity between authors’ cocitation profiles is not very satisfactory. We then discuss what kind of similarity measures may be used as an alternative to the Pearson correlation. We consider three similarity measures in particular. One is the well-known cosine. The other two similarity measures have not been used before in the bibliometric literature. Finally, we show by means of an example that our findings have a high practical relevance.information science;Pearson correlation;cosine;similarity measure;author cocitation analysis
Efecto del 1-Metilciclopropeno (1-MCP) en el comportamiento poscosecha de banano bocadillo (Musa acuminata AA, Simmonds)
El banano bocadillo o bananito (Musa acuminata AA, Simmonds) es considerado un fruto tropical exótico con alto potencial para ser exportado por Colombia, sin embargo, es altamente perecedero y no cuenta con prácticas adecuadas de manejo de poscosecha, lo que disminuye su potencial de comercialización. Su corta vida en poscosecha está relacionada con el carácter climatérico y con una serie de procesos fisiológicos y bioquímicos que aceleran su proceso de maduración. Dichos procesos son regulados principalmente por la hormona vegetal etileno, la cual a su vez, puede ser inhibido mediante el uso de diferentes compuestos químicos como el 1-metilciclopropeno (1-MCP), disminuyendo la velocidad de maduración y permitiendo prolongar la vida poscosecha de diferentes frutas y hortalizas. El 1-MCP se une a los receptores celulares del etileno y bloquea y/o retrasa la señalización de la maduración, afectando la expresión de genes, la velocidad de los procesos bioquímicos y fisiológicos que ocurren durante la maduración. De manera general, el 1-MCP retrasa el desarrollo de color, el ablandamiento, el metabolismo de azúcares y ácidos, la respiración, entre otros. Además, el 1-MCP disminuye la producción de etileno, debido a la inhibición de la expresión de los genes que codifican para la biosíntesis de etileno (ACS y ACO). Existen pocos estudios reportados en bananito relacionados con el efecto del 1-MCP ó etileno en la poscosecha de esta fruta, además, hasta la fecha no se ha reportado ningún estudio sobre la expresión de los genes que codifican para enzimas de la biosíntesis de etileno en bananito. Por esta razón, se evaluó el efecto de la aplicación de diferentes concentraciones de 1-MCP en el comportamiento poscosecha de estos frutos, además, se determinó el efecto de la aplicación de etileno y su interacción con el 1-MCP, para finalmente caracterizar la expresión de genes relacionados con la biosíntesis de etileno, como consecuencia de la aplicación de etileno y 1-MCP. Este trabajo pretende contribuir al entendimiento de los procesos de maduración del bananito como un primer paso para lograr aumentar su vida poscosecha y mejorar su potencial de exportación. (Texto tomado de la fuente)Baby banana or banana “Sucrier” (Musa acuminata AA, Simmonds) is considered an exotic tropical fruit with high potential to be exported by Colombia, however, it is highly perishable and has no proper postharvest handling practices, reducing their potential for marketing. Its short postharvest life is related to the climacteric character and a series of physiological and biochemical processes that accelerate the ripening process. Much of these processes are mainly regulated by the plant hormone ethylene, which in turn, can be inhibited by using different chemical compounds such as 1-methylcyclopropene (1-MCP), resulting in decreased ripening rate and allowing extend postharvest life of different fruits and vegetables. 1-MCP binds to cellular ethylene receptors and delays and/or blocks ripening signaling, affecting genes expression levels involved in the ripening and therefore the speed of biochemical and physiological processes. In general, the 1-MCP delays the development of color, softening, sugars and acids metabolism, and respiration, among others. Furthermore, 1-MCP reduces ethylene production due to the inhibition of genes expression encoding for ethylene biosynthesis (ACS and ACO). Few studies has been reported in baby banana related to the effect of 1-MCP or ethylene in the fruit postharvest, and also nowadays it has not been reported any studies on the regulation of expression of genes encoding biosynthesis ethylene in baby banana. For this reason, we evaluated the effect of the application of different concentrations of 1-MCP in the postharvest behavior of this fruit. Besides, the effect of the application of ethylene and its interaction with 1-MCP was also studied. Finally, the changes in the expression of some ethylene biosynthesis genes as a result of the application of ethylene and 1-MCP were characterized. This work will contribute to the understanding of the ripening processes in baby banana, as a first step to achieve extend postharvest life and increase their export potential.Otr
Dispelling the Myths Behind First-author Citation Counts
We conducted a full-scale evaluative citation analysis study of scholars in the XML research field to explore just how different from each other author rankings resulting from different citation counting methods actually are, and to demonstrate the capability of emerging data and tools on the Web in supporting more realistic citation counting methods. Our results contest some common arguments for the continued
use of first-author citation counts in the evaluation of scholars, such as high correlations between author rankings by first-author citation counts and other citation
counting methods, and high costs of using more realistic citation counting methods that are not well-supported by the ISI databases. It is argued that increasingly available digital full text research papers make it possible for citation analysis studies to go beyond what the ISI databases have directly supported and to employ more
sophisticated methods
- …
