1,721,002 research outputs found
Molecular and morphological diagnosis of plant parasitic nematodes in wheat growing areas of Eastern Anatolia Region
No full textBitki paraziti nematodların buğdayda önemli ekonomik kayıplara yol açtığı bilinmektedir. Bu çalışmanın amacı, Doğu Anadolu Bölgesi'nde buğday üretiminin yoğun olarak yapıldığı alanlarda zararlı nematod türlerinin morfolojik ve moleküler olarak belirlenmesidir. Bu amaçla, Doğu Anadolu Bölgesi'ne ait toplam 7 ilden (Erzurum, Erzincan, Iğdır, Kars, Malatya, Elazığ ve Sivas) 258 toprak örneği alınmış, morfolojik ve moleküler olarak incelenmiştir. Morfolojik tanılama cins düzeyinde ışık mikroskobu kullanılarak gerçekleşmiştir. Moleküler tanılama için DNA'lar ekstrakte edilerek PCR analizleri yapılmış olup elde edilen PCR ürünleri DNA Dizi analizine tabi tutulmuştur. Elde edilen verilere göre; toplam 2 takım (Rhabditia ve Dorylaimida) içerisinde 9 familyaya (Dolichodoridae, Tylenchidae, Hoplolaimidae, Pratylenchidae, Tylenchulidae, Anguinidae, Aphelenchidae, Aphelenchoididae ve Longidoridae) ait 20 cins (Ditylenchus, Trophurus, Paratylenchus, Filenchus, Rotylenchus, Tylenchus, Pratylenchoides, Scutylenchus, Bitylenchus, Tylenchorinchus, Amplimerlinius, Xiphineme, Zygotylenchus Helicotylenchus, Pratylenchus, Telotylenchus, Merlinius, Geocenomus, Aphelenchus ve Aphelenchoides), 7 tür (Helicotylenchus digonicus, Scutylenchus quadrifer, Ditylenchus myseliophagus, Amplimerlinius macrurus, H. canadensis , H. vulgaris ve Pratylenchoides alkani) morfolojik olarak tespit edilmiştir. Helicotylenchus vulgaris moleküler tekniklerle tür düzeyinde belirlenmiştir. Yapılan bu çalışmaların, bölgedeki nematod mücadele yöntemlerine yardımcı olacağı düşünülmektedir. Anahtar Kelimeler: Triticum spp., nematod, dişi larva, mikroskobi, DNA, PCR, teşhis.It is well known that plant parasitic nematodes cause important economic losses in wheat crop. The aim of this study is to determine the plant parasitic nematodes using morphological and molecular techniques in intense wheat planted fields in East Anatolia. For this purpose, 258 soil samples were collected from 7 different provinces of the East Anatolia Region (Erzincan, Erzurum, Igdır, Kars, Malatya, Elazıg, Sivas) and they were identified as morphologically and molecularly. Morphological identifications were done by using light microscope on the level of genus. DNA extractions were peformed for PCR analyzes and products were subjected to DNA sequencing and analysis. According to the obtained data, overall 7 species (Helicotylenchus digonicus, Scutylenchus quadrifer, Ditylenchus myseliophagus, Amplimerlinius macrurus, H. canadensis, H. vulgaris and Pratylenchoides alkani) 20 genera (Ditylenchus, Trophurus, Paratylenchus, Filenchus, Rotylenchus, Tylenchus, Pratylenchoides, Scutylenchus, Bitylenchus, Tylenchorinchus, Amplimerlinius, Xiphineme, Zygotylenchus Helicotylenchus, Pratylenchus, Telotylenchus, Merlinius, Geocenomus, Aphelenchus ve Aphelenchoides), in 9 family (Dolichodoridae, Tylenchidae, Hoplolaimidae, Pratylenchidae, Tylenchulidae, Anguinidae, Aphelenchidae, Aphelenchoididae ve Longidoridae) from 2 phyla (Rhabditia and Dorylaimida) were identified morphologically. Helicotylenchus vulgaris was identified on the species level by molecular techniques. It is thought that this study will help to wheat nematode control in these regions. Key Words: Triticum spp., nematod, female juvenile, mikroskobe, DNA, PCR, diagnosis
Akdeniz tahıl kist nematodu (ATKN), Heterodera latipons 'un diyapoz döneminde meydana gelen biyokimyasal ve fizyolojik değişiklikler
Get PDFFen Bilimleri Enstitüsü, Bitkisel Üretim ve Teknolojileri Ana Bilim DalıBu çalışmada, Heterodera latipons'un diyapoz döneminde 2 farklı toplama zamanında farklı morfolojik, fizyolojik ve biyokimyasal değişiklikleri incelenmiş ve yapılan gözlemler sonucunda tüm özelliklerinde önemli farklılıklar tespit edilmiştir. Yapılan morfolojik analizlerde, diyapoz döneminde kist rengi, alt-kristal tabaka ve yumurta kabuğu kalınlığının değişiminin yanı sıra yumurtadan çıkış süresi ve yumurtadan çıkan 2. dönem larva sayılarında da değişiklikler gözlenmiştir. Biyokimyasal analizlerin sonuçlarında ise, Ekim 2021'de toplanan kistlerde toplam karbonhidrat, glikojen, trehaloz, gliserol ve protein içeriğinin Haziran 2021'de toplanan kistlere göre daha yüksek olduğu tespit edilmiştir. Yapılan SDS-PAGE analizlerinde, hem Haziran hem Ekim döneminde alınan örneklerde büyük bir proteinin (yaklaşık 100 kDa) varlığı gözlemlenirken, küçük bir proteinin (yaklaşık 20 kDa) ise Ekim ayında toplanan örneklerde bulunduğu. Ayrıca, H. latipons 'un Madaba Ürdün izolatında tre geninin kısmi nükleotid dizisi (şeker hidrolizini katalize eden bir enzimi kodlayan) dünyada ilk defa tespit edilmiştir. Anahtar Sözcükler: Diyapoz, Heterodera latipons, Biyokimyasal, Gen, Trehalase, TreIn the present study, different morphological, biochemical, and physiological changes were studied at two different collection dates doing the diapause period of Heterodera latipons. Our observations revealed dramatic changes in all investigated features. Morphological changes included changes in cyst color, sub-crystalline layer, and thickness of the eggshell. Slight changes in the time of hatching and the number of hatched J2s were observed. The results of biochemical changes showed that the total contents of carbohydrates, glycogen, trehalose, glycerol and protein were higher in samples collected in October 2021 than those in samples collected in June 2021. The SDS-PAGE pattern indicated the presence of a large protein (ca. 100 kDa) in both the June and October sampling dates, whereas a small protein (ca. 20 kDa) was present in October but absent in the June sampling date. Furthermore, partial tre gene sequence (encoding an enzyme catalyzing sugar hydrolysis) was detected in the H. latipons Madaba Jordanian isolate. The information in our study might lead to understanding the arrested development in higher organisms and creating new strategies for control. Keywords: Diapause, Heterodera latipons, Biochemical, Genes, Trehalase, Tr
Bazı uluslararası yazlık buğday hatlarının tahıl kıst nematodu (Heterodera filipjevi)'na karşı dayanıklılığının belirlenmesi
No full textBuğday dünyada üretilen en önemli ürünlerden olup üretimi çok farklı biyotik ve abiyotik faktörler tarafından etkilenmektedir. Tahıl kist nematodları buğdayda önemli zararlar yapan bitki parazitidir. Tahıl Kist nematodları (Heterodera filipjevi) buğdayda %50 ye ulaşan zararlar meydana getirmektedir ve en kolay ve ekonomik mücadele yöntemi de dayanıklı çeşit kullanımıdır. Modern buğday tarımında çeşit seçiminde ana kriter hastalık etmenlerine dayanıklılıktır. Bu çalışmada Uluslararası Mısır ve Buğday Araştırma Merkezi (CIMMYT-Türkiye) tarafından sağlanan 257 uluslararası yazlık buğday hatları Heterodera filipjevi'ye karşı dayanıklılık durumları kontrollü koşullarda (70% bağıl nem, 25°C, ve 16 saat ışıklandırma) iki ayrı denemede uluslararası standart kontrol bitkileri ile testlenmiştir. Test edilen buğday hatları tarla toprağı, kum ve organik madde içeren tüplerde yetiştirilerek her bir bitkiye 250 larva/1 ml şeklinde inokule edilmiştir. Yapılan testler sonucunda 11 hat (4.28%) dayanıklı olarak belirlenmiş, 36 (%14.01) hat ise orta dayanıklı bulunmuştur. Yapılan bu çalışmayla Heterodera filipjevi'e karşı buğday ıslah programlarında kullanılacak yeni genetik kaynaklar belirlenmiştir.Wheat is one of the most important crops produced worldwide and its production can be decreased due to various biotic and abiotic factors. Cereal cyst nematodes (CCNs) are plant-parasites that cause significant harm to wheat. The CCN Heterodera filipjevi can cause yield losses of up to 50% and the most inexpensive and practical control strategy is the use of resistant hosts. Resistance to biotic stresses such as CCNs is considered the main criteria in modern wheat selection. In this study, 257 international spring wheat lines provided by International Maize and Wheat Improvement Center – Turkey (CIMMYT) that are genotyped in Mexico for drought and heat resistance, were screened for their resistant response to the CCN Heterodera filipjevi under controlled conditions (70% relative humidity, 25°C, and a photoperiod of 16 hours) and compared to check cultivars with known resistance. A mixture of sand, field soil, and organic matter (70:29:1 v/v/v) was used as growing media, a 3-day germinated seed of a single line was inoculated with 250 J2/1 ml in a "Cone-tainer" ™ test tube. The experiment was held in 2 separate trials with 3 replication/trail. The results reveal that 11 (4.28%) lines show resistance and 36 (14.01%) lines show moderate resistance response. This study has been able to add new genetic sources of resistance to Heterodera filipjevi for future breeding programs
Identification of plant parasitic nematodes in potato fields in Nigde and research on resistance of some genotypes against potato golden cyst nematode (Globodera rostochiensis, wollenweber)
Get PDFKapal
Biological activities of some plant extracts against the root knot nematode [Meloidogyne incognita (Kofoid & White) Chitwood]
No full textKök-ur Nematodları Türkiye’de seralarda ve sebze alanlarında önemli verim kayıplarına neden olmaktadır. Türkiye’de özellikle seralarda Meloidogyne incognita ırk 2 konukçu bitkiler arasında bulanan domatese önemli ölçüde zarar vermektedir. Bu çalışma bazı bitkisel ekstraktların laboratuar koşullarında Kök-ur nematodu ırk 2, 2.dönem larvalarına karşı kimyasal nematisitlere alternatif olabilecek bitkisel kökenli preparatların biyolojik etkinliğini belirlemek amacıyla yürütülmüştür. Yapılan in vitro doz çalışmalarıda kimyasal nematisit Fluopyram (400 g /l) tüm dozlarda canlı nematod sayısı 0 olurken, diğerlerinde % 10, 5, 2.5, 1.7, 0.5 dozlarında sırasıyla Kıllı ayı pençesi %83.8; %45.9; %12.8; %13.9; %5.4, Adaçayı %100; %38.7; %10.3; %11; %9.6, Engerek otu %97.2; %71; %19.5; %8; % 2 oranında öldürmüştür. Aynı bitki ekstraktları saksı denemeleri sonucunda köklerin urluluk derecesi değerleri Zeck skalasına göre Kıllı ayı pençesinde 4, Adaçayında 5 ve Engerek otunda ise 6 olarak bulunmuştur. Yapılan bu çalışmanın sonucunda bu üç bitkinin sera veya tarla koşullarında da testlenerek Kök-ur nematodunun mücadelesinde kullanılabileceği düşünülmektedir.Root-knot nematodes (RKNs), Meloidogyne spp., cause significant yield losses in vegetable fields and greenhouses in Turkey. Especially,Tomato is affected by RKNs resulting in considerable yield losses in greenhouses in Turkey. This study was conducted to determine the biological effect of some plant extracts, as alternatives to chemical pesticides against the RKN, Meloidogyne incognita race 2, under laboratory conditions. In the in vitro dose studies The chemical nematicides Fluopyram (400 g / l), the alive nematode number was 0 at all doses, while plant exratcts at the doses of 10, 5, 2.5, 1.7, 0.5 %, killing rate of plant extracts, consequently, Acanthus hirsutus 83.8%; 45.9%; 12.8%; 13.9%; 5.4%, Salvia sclarea 100%; 38.7%; 10.3%; %11; 9.6%, and Echium vulgare 97.2%; 71%; 19.5 %; 8; 2%. In pot experiments, the same plant extracts reduced root galling by Acanthus hirsutus 4, Salvia sclarea 5 and Echium vulgare 6, according to the Zeck scale. In the results these three plant extracts can be used the control of RKN’s after tested in field conditions
Morphological and molecular diagnosis of cereal cyst nematodes (Heterodera spp) and root lesion nematodes (Pratylenchus spp) in wheat fields in Azerbaijan
No full textBu çalışmada 2018-2019 yılları arasında Azerbaycan'ın Ağcabedi, Berde, Beylegan, Bilasuvar, Celilabad, Salyan ve Terter illerinde buğday ekili alanlarından dünyadaki ekonomik anlamda zarar yapan Kök yara ve Tahıl kist nematodlarının belirlenmesi amacıyla 145 toprak örneği alınarak laboratuvarda incelenmiştir. Alınan toprak örneklerinden elde edilen Tahıl kist ve Kök yara nematodlarının bireyleri morfolojik ve morfometrik olarak teşhis edilmiştir. Topraktan elde edilen kistlerin DNA' ları ekstrakte edilerek PCR analizi yapıldıktan sonra, sekansları çıkarılıp veri bankasında karşılaştırılarak türleri belirlenmiştir. Çalışma sonucunda 145 toprak örneğinin 49' unda Kök yara nematodları, 38' inde Tahıl kist nematodlarıyla bulaşıklık görülmüştür. Kök yara nematodlarıyla en yüksek bulaşıklık Ağcabedi ilinde % 44,5 oranında, Tahıl kist nematodlarıyla en yüksek bulaşıklık ise Berde ilinde % 63,6 oranında görülmüştür. Bununla birlikte Ağcabedi, Berde, Beylegan illerinde Pratylenchus neglectus ve P. thornei türleri, Celilabad ve Salyan illerinde P. thornei türü ilk kez tesbit edilmiştir. Ağcabedi ve Berde illerinde ise Heterodera avenae nematodu ilk kez tesbit edilmiştir. Anahtar sözcükler: Bitki paraziti nematodlar, Azerbaycan, buğday, Pratylenchus spp, Heterodera sppIn this study, 145 soil samples were collected from wheat fields in Aghjabedi, Berde, Beylegan, Bilasuvar, Jalilabad, Salyan and Terter provinces of Azerbaijan between the years 2018-2019. The samples have been examined in the laboratory in order to identify the Root lesion and Cereal cyst nematodes. According to morphological and morphometric examination of the sample, it was identified the cyst nematodes and root lesion nematodes are present. Cyst samples were sent for sequencing after preforming DNA extraction and PCR analysis and the species of the cyst were determined. As a result of the study, 49 of 145 soil samples were found to be infected with Root lesion nematodes and 38 samples were found to be infected with Cereal cyst nematodes. Regarding Root lesion nematodes, the highest contamination was 44,5 % in Aghjabedi and regarding Cereal cyst nematodes the highest contamination was 63,6 % in Berde. Additionally, Pratylenchus neglectus and P. thornei in Aghjabedi, Berde, Beylegan provinces and P. thornei species in Jalilabad and Salyan provinces were detected for the first time. Heterodera avenae was detected for the first time in Aghjabedi and Berde provinces. Keywords: Plant parasitic nematodes, Azerbaijan, wheat, Pratylenchus spp, Heterodera sp
Prevelance and population dynamics of Heterodera schachtii (Schmidt, 1871) in sugar beet and cabbage production areas of Niğde and screening of resistant cultivars
Get PDFFen Bilimleri Enstitüsü, Bitki Koruma Ana Bilim Dalı, Bitki Koruma Bilim DalıNiğde ilinde lahana (Brassica oleracea) ve şeker pancarı (Beta vulgaris var. saccharifera) üretimi yoğun olarak yapılmaktadır. Şeker pancarı kist nematodu (Heterodera schachtii) şeker pancarı ve lahana üretimini önemli ölçüde etkilemektedir. Bu tez çalışması, 2021-2023 yılları arasında Niğde ilinde lahana ve şeker pancarı ekim alanlarından yapılmış, şeker pancarından 104, lahanadan 100 toprak örneği alınmıştır. Örnekleme yapılan yetiştiricilik alanlarından elde edilen H. schachtii'ye ait kistleri morfolojik ve moleküler düzeyde teşhis edilmiştir. Örnekleme yapılan alanlar içerisinde kist yoğunluğu fazla olan iki tarlada popülasyon takibi yapılmıştır. Ayrıca kontrollü koşullarda, H. schachtii'nin bir dölündeki yaşam döngüsü araştırılmıştir. Lahanadan 10 çeşit, şeker pancarından 27 çeşit/genotip seçilerek çeşit reaksiyonları belirlenmiştir. Niğde ilinde örnekleme yapılan şeker pancarı ve lahana üretim alanlarının sırasıyla, %40 ve 41' nin H. schachtii ile bulaşık olduğu; söz konusu alanlarda ortalama kist yoğunluğunun sırasıyla 38 adet/250 gr toprak ve 146 adet/250 gr toprak olarak belirlenmiştir. Örnekleme yapılan alanlara ait her popülasyon için 12 numune seçilerek, ITS-rDNA ve COI-mtDNA gen bölgeleri çoğaltılarak elde edilen sekans dizilimlerinden tür teşhisleri yapılmış ve filogenetik ilişkisi belirlenmiştir. Örnekleme yapılan lahana ve şeker pancarı alanlarında H. schachtii'nin popülasyon takiplerinde, toprakta bulunan kist sayılarının en yüksek olduğu aylar Ekim ve Kasım en düşük olduğu aylar ise Mart ve Nisan ayları olarak belirlenmiştir. Toprakta bulunan 2. dönem juvenillerin (J2) sayılarının en yüksek olduğu ay Mart, en düşük olduğu ay ise Kasım ayı olarak gözlemlenmiştir. Popülasyon takibi esnasında alınan kistlerin her ay kesilerek içlerinde bulunan J2'lerin sayımı sonrasında J2 ve yumurta sayılarının en yüksek olduğu ay Kasım en düşük olduğu aylar ise Mart ve Nisan ayları olarak belirlenmiştir. Heterodera schachtii'nin yaşam döngüsünün belirlenmesi ile ilgili çalışmada, köke J2 olarak giren bireylerin üçüncü dönem de (J3) şişkinleşip kökü yararak çıkış yaptığı ve dördüncü döneme (J4) geçtiği görülmüştür. Konukçu reaksiyonu çalışmalarında, 10 lahana çeşidinde ve 27 şeker pancarın çeşidinde H. schachtii'ye karşı dayanıklılık gösteren herhangi bir çeşide rastlanılmamıştır. Lahana çeşitlerinden Sazlıca ve Balsarma çeşitlerinin H. schachtii'ye orta derecede tolerant olduğu bulunurken; diğer çeşitlerin ise yüksek derecede tolerant olduğu tespit edilmiştir. Şeker pancarı çeşit/genotipleri arasında, Vienetta ve ERÜ 180 yüksek tolerant, Regesta, ERÜ 250 ve ERÜ 148 orta tolerant, Turbata ve ERÜ 144 ise hassas çeşit/genotipler olarak değerlendirilirken; diğer yirmi çeşit yüksek derecede tolerant çeşit olarak belirlenmiştir. Çalışma sonucunda ilçede yoğun olarak tespit edilen H. schachtii'nin popülasyon yoğunluğunu azaltmak için, bölge çiftçisine ekim nöbeti ile tolerant çeşitlerin kullanılması gerektiği önerilmektedir.Niğde province is known to be a major producer of cabbage (Brassica oleracea) and sugar beet (Beta vulgaris var. saccharifera) in Türkiye and both crops are severely infested by the sugar beet cyst nematode (Heterodera schachtii). This study examined 104 soil samples from sugar beet and 100 soil samples from cabbage cultivation areas in Niğde province between 2021 and 2023. Cysts of H. schachtii collected from sampling sites were identified morphologically and molecularly and population fluctuation studies were conducted in two fields with high cyst nematode densities. Under controlled conditions, the life cycle of H. schachtii in one generation was followed. The susceptibility reaction of 10 cabbage varieties and 27 sugar beet varieties/genotypes to H. schachtii were screened. It was found that 40% and 41% of the sugar beet and cabbage production areas sampled in Niğde province were infected with H. schachtii, respectively. The average cyst densities in these areas were determined to be 38 cysts/250 g of soil and 146 cysts/250 g of soil, respectively. For each population from the sampled areas, 12 samples were selected and species identification was carried out based on amplification and sequencing of the ITS-rDNA and COI-mtDNA gene regions and their phylogenetic relationships were determined. The highest number of cysts in the soil samples was observed in October and November, while the lowest number was observed in March and April. The number of second-stage juveniles (J2) in the soil was highest in March and lowest in November. Cysts were cut open, and the number of J2s and eggs were recorded based on a monthly interval; monthly population tracking showed that the highest numbers were in November, while the lowest were in March and April. During the study of H. schachtii's life cycle was observed individual nematode juveniles enter the roots as J2s, exit the root as third-stage juveniles (J3), and then develop into the fourth-stage juveniles (J4). During the host-susceptibility reaction studies, there is no species among the 10 cabbage varieties and 27 sugar beet varieties/genotypes were found to be resistant to H. schachtii. While Sazlıca and Balsarma cabbage varieties were found to be moderately tolerant to H. schachtii, other varieties were determined to be highly tolerant. Among the sugar beet varieties/genotypes, Vienetta and ERÜ 180 were highly tolerant. While Regesta, ERÜ 250, and ERÜ 148 were found to be moderately tolerant and Turbata and ERÜ 144 were susceptible. The other twenty varieties were identified as highly tolerant. The study suggests that local farmers should use tolerant varieties and practice crop rotation to reduce the population density of H. schachtii, which is widely infested in the province
Going Beyond Counting First Authors in Author Co-citation Analysis
Get PDFThe present study examines one of the fundamental aspects of author co-citation analysis (ACA) - the way co-citation
counts are defined. Co-citation counting provides the data on which all subsequent statistical analyses and mappings
are based, and we compare ACA results based on two different types of co-citation counting - the traditional type that
only counts the first one among a cited work's authors on the one hand and a non-traditional type that takes into
account the first 5 authors of a cited work on the other hand. Results indicate that the picture produced through this non-traditional author co-citation counting contains more coherent author groups and is therefore considerably clearer. However, this picture represents fewer specialties in the research field being studied than that produced through the traditional first-author co-citation counting when the same number of top-ranked authors is selected and analyzed. Reasons for these effects are discussed
Bazı yazlık buğday çeşitlerinin pratylenchus thornei sher et allen (tylenchida : pratylenchidae)'ye karşı dayanıklılığının araştırılması
No full textTEZ6688Tez (Doktora) -- Çukurova Üniversitesi, Adana, 2008.Kaynakça (s.93-100) var.xii, 117 s. : rnk.res. ; 29 cm.In this study the yield loss of root lesion nematode (Pratylenchus thornei Sher et Allen) was investigated under natural field conditions in Adana. Under controlled laboratory conditions a P. thornei resistance assay for wheat was optimized, and 181 spring wheat varieties/lines were screened. The genetic control and location of two known different resistant sources (AUS4930 7.2 and the synthetic hexaploid wheat line, CROCBu çalışmada Kök yara nematodu (Pratylenchus thornei Sher et Allen)'nun tarla koşullarında oluşturduğu verim kaybı, 181 yazlık buğday çeşit ve hattının dayanıklılığı ile dayanıklılık denemelerinde kullanılacak en uygun çalışma metodları araştırılmıştır. Ayrıca iki farklı dayanıklılık kaynağı AUS 4930 7.2 ve sentetik hexaploid buğday çeşidi olan CROCBu çalışma Ç.Ü. Bilimsel Araştırma Projeleri Birimi Tarafından Desteklenmiştir. Proje No:ZF2004D2
- …
