1,721,003 research outputs found

    Caracterización y aplicación de bacteriófagos líticos en salmonella enterica utilizando un modelo in vitro

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    Salmonella enterica es uno de los patógenos trasmitidos por alimentos más comunes a nivel mundial y se conocen más de 2500 serovares, sin embargo solo algunos de éstos son responsables por la mayoría de los casos de salmonelosis en humanos. En México este patógeno ha sido reportado en diferentes fuentes, incluyendo carne y vegetales. También la emergencia de aislamientos resistente a múltiples fármacos (MDR) principalmente de S. enterica serovar Typhimurium constituyen una preocupación para la Salud Pública. Una alternativa para lidiar con esto, es el uso de bacteriófagos cuyo potencial ha sido evaluado en años recientes. Los bacteriófagos son virus capaces de lisar diferentes bacterias y aunque generalmente se limitan a ciertas cepas o serovares también hay aquéllos que son capaces de lisar más de un serovar o bacteria de diferente especie y género. El objetivo de este estudio fue aislar, seleccionar y caracterizar bacteriófagos líticos como agentes de control de aislamientos regionales de Salmonella MDR. Un total de 243 aislamientos de S. enterica de diversas fuentes y de dos entidades federativas fueron evaluados en cuanto a su susceptibilidad a diferentes antimicrobianos mediante la prueba de difusión en disco con especial énfasis en antibióticos β-lactámicos y quinolonas, así mismo, se buscaron algunos genes de resistencia antimicrobiana mediante PCR. Para la detección de los bacteriófagos se emplearon aguas residuales obtenidas de ríos en el Estado de México, las cuales fueron sometidas a filtración y enriquecimiento con serovares de S. enterica multirresistentes a los antibióticos con el fin de encontrar bacteriófagos líticos. xii Se encontró una resistencia antimicrobiana para la tetraciclina (TET) del 41.6%, seguido de la ampicilina (AMP) (21.7%), ácido nalidixico (NAL) (21.8%), gentamicina (GEN) (9%), cefotaxina (CTX), ceftazidima (CAZ) y cefoxitina (FOX) (6.6%), mientras que los niveles más bajos de resistencia se observaron para la amikacina (AK) (0.8%). En el caso del ciprofloxacino (CIP), sólo se encontró susceptibilidad intermedia (1.2%). Se realizó una caracterización adicional de 16 aislamientos resistentes a múltiples fármacos. Un total de 10 patrones de MDR fueron identificados, el patrón predominante fue CTX-CAZ-FOXAMP- NA-GEN-TET. La prueba de PCR detectó el gen blaCMY en todos los aislamientos MDR, también se encontró en tres aislamientos la co-presencia con genes blaTEM. Ninguno de los aislamientos fue para positivo para los genes qnr. La relación genética entre los 16 aislamientos MDR mostró que los aislamientos del Estado de México mostraron un índice de similitud mayor en comparación con los aislamientos del Estado de Jalisco. Un bacteriófago, PHA17, fue seleccionado para posterior caracterización. El PHA17 fue capaz de lisar al menos 42% de la colección empleada (219 aislamientos), incluyendo aislamientos de Salmonella Typhi y no tipificables. Otra característica sobresaliente fue la capacidad de lisar aislamientos MDR (de los 16 aislamientos, 13 fueron susceptibles al fago PHA17). En cuanto a la supervivencia de PHA17 a diferentes condiciones de temperatura y de pH revelaron que fue estable a 42°C y 60°C por 24 h, mientras que para el pH fue estable entre pH 4.0 y pH 7.0 por al menos 3 h. Los resultados sugieren que este bacteriófago podría ser empleado como una forma de control de Salmonella spp. con diferentes propósitos (inocuidad alimentaria, aplicaciones clínicas, entre otros), sin embargo se necesita una caracterización genética más exhaustiva

    PREVALENCIA DE GENES DE RESISTENCIA EN BACTERIÓFAGOS Y AISLAMIENTOS DE E. coli EN AVES DE CORRAL EN EL CENTRO-NORTE DEL ESTADO DE MÉXICO

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    Tesis DoctoralLa epidemiología de patógenos multirresistentes portadores de ARG´s es extremadamente compleja, ya que están vinculados a multiples factores abióticos y bióticos (humanos, animales domesticos y de vida silvestre). En el presente estudio se recolectaron 197 aislamientos de Escherichia coli de pollos, pavos y patos de un total de de 322 muestras procedentes de unidades de producción de traspatio en la zona norte del Estado de México, México. Se registraron 108/197 (54.8%) aislamientos multirresistentes. 80.7% de los aislamientos presentaron resistencia a ampicilina (AM), 64.4% a tetraciclina (TE), 56.3% a carbenicilina (CB) y 26.9% a ácido nalidíxico (NA) y trimetoprim-sulfametoxasol (SXT). Además, 56.3% de los aislamientos presentaron el gen blaTEM, 20.8%,19.2%, 7.6% y 10.1% el tetB, tetA sulI y sulII respectivamente, 9.6% qnrA y 5.5% el qnrB. Para la transducción in vitro se utilizaron bacteriófagos portadores de ARG´s recolectados de aislamientos de E. coli multirresistentes de aves silvestres procedentes de la Ciénega Chimalipan de Lerma. El gen qnrA fue transducido a 5/13 (38.4%) cepas de E. coli, el tetB a 3/13 (23%) y, blaTEM y sulII a 2/13 (15.3%). Se reporta la frecuencia de genes de resistencia vinculados a resistencia fenotípica en aves domésticas y por primera vez se realiza la transducción de ARG’s de cepas de E. coli aislada de aves silvestres a cepas de E. coli aisladas de aves domesticas, con esto, se logra determinar el posible rol de los bacteriófagos en la transmisión de factores de resistencia

    Going Beyond Counting First Authors in Author Co-citation Analysis

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    The present study examines one of the fundamental aspects of author co-citation analysis (ACA) - the way co-citation counts are defined. Co-citation counting provides the data on which all subsequent statistical analyses and mappings are based, and we compare ACA results based on two different types of co-citation counting - the traditional type that only counts the first one among a cited work's authors on the one hand and a non-traditional type that takes into account the first 5 authors of a cited work on the other hand. Results indicate that the picture produced through this non-traditional author co-citation counting contains more coherent author groups and is therefore considerably clearer. However, this picture represents fewer specialties in the research field being studied than that produced through the traditional first-author co-citation counting when the same number of top-ranked authors is selected and analyzed. Reasons for these effects are discussed

    Genetic characterization of Escherichia coli isolated from cattle carcasses and feces in Mexico State

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    Meat of bovine origin is one of the major vehicles in the transmission of verotoxigenic Escherichia coli (VTEC) to human consumers. This pathogen can produce serious human illness, including bloody diarrhea and hemolytic uremic syndrome. The aim of the current study was to characterize E. coli isolates (mainly VTEC strains) belonging to several serotypes in samples from cattle carcasses and feces of three municipal slaughter plants from Mexico State. The genetic diversity and molecular relatedness among the isolates was evaluated with multiple-locus variable-number tandem repeat analysis (MLVA). To our knowledge, and with the exception of E. coli O157:H7, this is the first time that serotypes analyzed here have been subtyped by MLVA in Mexico. MLVA typing grouped the 37 strains from this study into 30 distinct genotypes, 26 of which were unique. These findings indicate that cattle carcasses and feces from slaughter plants in Mexico are a source of VTEC that are genetically diverse in terms of serotypes and virulence profiles. The presence of these pathogens in carcasses indicates the high probability of the spread of VTEC strains during slaughter and processing.Fil: Reyes Rodríguez, Nydia E.. Universidad Nacional Autónoma de México; MéxicoFil: Soriano Vargas, Edgardo. Universidad Nacional Autónoma de México; MéxicoFil: Barba León, Jeannette. Universidad de Guadalajara; MéxicoFil: Navarro, Armando. Universidad Nacional Autónoma de México; MéxicoFil: Talavera Rojas, Martín. Universidad Nacional Autónoma de México; MéxicoFil: Sanso, Andrea Mariel. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Centro Científico Tecnológico Conicet - Tandil. Centro de Investigación Veterinaria de Tandil. Universidad Nacional del Centro de la Provincia de Buenos Aires. Centro de Investigación Veterinaria de Tandil. Provincia de Buenos Aires. Gobernación. Comision de Investigaciones Científicas. Centro de Investigación Veterinaria de Tandil; ArgentinaFil: Bustamante, Ana Victoria. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Centro Científico Tecnológico Conicet - Tandil. Centro de Investigación Veterinaria de Tandil. Universidad Nacional del Centro de la Provincia de Buenos Aires. Centro de Investigación Veterinaria de Tandil. Provincia de Buenos Aires. Gobernación. Comision de Investigaciones Científicas. Centro de Investigación Veterinaria de Tandil; Argentin

    Variations on the Author

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    “Variations on the Author” discusses two of Eduardo Coutinho’s recent films (Um Dia na Vida, from 2010, and Últimas Conversas, posthumously released in 2015) and their contribution to the general question of documentary authorship. The director’s filmography is characterized by a consistent yet self-effacing form of authorial self-inscription: Coutinho often features as an interviewer that rather than express opinions propels discourses; an interviewer that is good at listening. This mode of self-inscription characterizes him as an author who is not expressive but who is nonetheless markedly present on the screen. In Um Dia na Vida, however, Coutinho is completely absent form the image, while Últimas Conversas, on the contrary, includes a confessional prologue that moves the director from the margins to the center of his films. This article examines the ways in which these works stand out in the filmography of a director who offers new insights into the notion of cinematic authorship

    Appropriate Similarity Measures for Author Cocitation Analysis

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    We provide a number of new insights into the methodological discussion about author cocitation analysis. We first argue that the use of the Pearson correlation for measuring the similarity between authors’ cocitation profiles is not very satisfactory. We then discuss what kind of similarity measures may be used as an alternative to the Pearson correlation. We consider three similarity measures in particular. One is the well-known cosine. The other two similarity measures have not been used before in the bibliometric literature. Finally, we show by means of an example that our findings have a high practical relevance.information science;Pearson correlation;cosine;similarity measure;author cocitation analysis

    Avibacterium paragallinarum: protección, tipificación y filogenia de aislamientos de América

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    Avibacterium paragallinarum es el agente causal de la coriza infecciosa, una enfermedad del tracto respiratorio superior que afecta a pollos y gallinas. Av. paragallinarum se clasifica serológicamente en nueve serovariedades (A-1, A-2, A-3, A-4, B-1, C-1, C-2, C-3 y C-4) distribuidas en 3 serogrupos (A, B y C). La distribución de estas serovariedades en el mundo es muy diversa. En México, hasta el año 2002, se habían identificado aislamientos de las serovariedades A-1, A-2, B-1 y C-2. Recientemente, en el año 2011, se identificó la serovariedad C-1 de Av. paragallinarum en este país. Todos los aislamientos obtenidos procedían de parvadas inmunizadas contra coriza infecciosa. Con base en lo anterior, se evaluó la protección conferida por bacterinas comerciales frente a un aislamiento de la serovariedad C-1. Se registraron diferencias significativas en la protección conferida por las bacterinas evaluadas, de 25% a 83%, lo cual explicó en parte los brotes observados en campo. Actualmente, la técnica para la tipificación serológica de aislamientos de Av. paragallinarum es la inhibición de la hemoaglutinación (IH). PCR múltiple En el presente trabajo se tipificaron 12 cepas de referencia y 69 aislamientos de diferentes serovariedades provenientes de Ecuador, México, Panamá y Perú, serológicamente y mediante una PCR múltiple (mPCR). Tres de 6 (50%) cepas de referencia del serogrupo A, 2 (100%) del serogrupo B y 1 de 4 (25%) de las cepas de referencia del serogrupo C fueron correctamente tipificadas por la mPCR. De manera similar, 16 de 17 aislamientos del serogrupo A, 10 de 12 aislamientos del serogrupo B y 18 de 37 aislamientos del serogrupo C fueron correctamente tipificados mediante la mPCR. Basados en estos resultados, se puede concluir que la mPCR no es recomendada para reemplazar a la prueba de IH para la tipificación de aislamientos de Av. paragallinarum. Adicionalmente, en el presente trabajo, se amplificaron y secuenciaron los genes hagA y 16S rRNA de aislamientos de Av. paragallinarum de diferentes serovariedades permitiendo establecer la relación filogenética entre aislamientos de Bolivia, Ecuador, México, Panamá y Perú. El análisis filogenético, confirmó que algunos aislamientos de Av. paragallinarum de estos países están relacionados con cepas de referencia previamente informadas. Sin embargo, de manera particular el análisis basado en el gen 16S rRNA permitió la identificación de un genogrupo de aislamientos del continente Americano. En conclusión, el presente estudio muestra la necesidad de seguimiento de brotes de coriza infecciosa para determinar la posible prevalencia o emergencia de serovariedades de Av. paragallinarum. Asimismo, es necesaria la evalución frecuente de las bacterinas disponibles en un país para explicar los brotes. Es necesario el análisis de más aislamientos de otros países del continente Americano para confirmar el genogrupo identificado

    Avibacterium paragallinarum: protección, tipificación y filogenia de aislamientos de América.

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    Avibacterium paragallinarum es el agente causal de la coriza infecciosa, una enfermedad del tracto respiratorio superior que afecta a pollos y gallinas. Av. paragallinarum se clasifica serológicamente en nueve serovariedades (A-1, A-2, A-3, A-4, B-1, C-1, C-2, C-3 y C-4) distribuidas en 3 serogrupos (A, B y C). La distribución de estas serovariedades en el mundo es muy diversa. En México, hasta el año 2002, se habían identificado aislamientos de las serovariedades A-1, A-2, B-1 y C-2. Recientemente, en el año 2011, se identificó la serovariedad C-1 de Av. paragallinarum en este país. Todos los aislamientos obtenidos procedían de parvadas inmunizadas contra coriza infecciosa. Con base en lo anterior, se evaluó la protección conferida por bacterinas comerciales frente a un aislamiento de la serovariedad C-1. Se registraron diferencias significativas en la protección conferida por las bacterinas evaluadas, de 25% a 83%, lo cual explicó en parte los brotes observados en campo. Actualmente, la técnica para la tipificación serológica de aislamientos de Av. paragallinarum es la inhibición de la hemoaglutinación (IH). PCR múltiple En el presente trabajo se tipificaron 12 cepas de referencia y 69 aislamientos de diferentes serovariedades provenientes de Ecuador, México, Panamá y Perú, serológicamente y mediante una PCR múltiple (mPCR). Tres de 6 (50%) cepas de referencia del serogrupo A, 2 (100%) del serogrupo B y 1 de 4 (25%) de las cepas de referencia del serogrupo C fueron correctamente tipificadas por la mPCR. De manera similar, 16 de 17 aislamientos del serogrupo A, 10 de 12 aislamientos del serogrupo B y 18 de 37 aislamientos del serogrupo C fueron correctamente tipificados mediante la mPCR. Basados en estos resultados, se puede concluir que la mPCR no es recomendada para reemplazar a la prueba de IH para la tipificación de aislamientos de Av. paragallinarum. Adicionalmente, en el presente trabajo, se amplificaron y secuenciaron los genes hagA y 16S rRNA de aislamientos de Av. paragallinarum de diferentes serovariedades permitiendo establecer la relación filogenética entre aislamientos de Bolivia, Ecuador, México, Panamá y Perú. El análisis filogenético, confirmó que algunos aislamientos de Av. paragallinarum de estos países están relacionados con cepas de referencia previamente informadas. Sin embargo, de manera particular el análisis basado en el gen 16S rRNA permitió la identificación de un genogrupo de aislamientos del continente Americano. En conclusión, el presente estudio muestra la necesidad de seguimiento de brotes de coriza infecciosa para determinar la posible prevalencia o emergencia de serovariedades de Av. paragallinarum. Asimismo, es necesaria la evalución frecuente de las bacterinas disponibles en un país para explicar los brotes. Es necesario el análisis de más aislamientos de otros países del continente Americano para confirmar el genogrupo identificado

    EVALUACIÓN DE PRÁCTICAS DE ORDEÑO Y CONTEO DE CÉLULAS SOMÁTICAS DE GANADO BOVINO EN SISTEMAS DE PRODUCCIÓN DE LECHE EN PEQUEÑA ESCALA EN EL NOROESTE DEL ESTADO DE MÉXICO

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    La producción de leche, indicador fundamental en la economía del Noroeste del Estado de México, sin embargo presenta problemas en cuanto al déficit de calidad sanitaria. El presente trabajo se llevó a cabo con el objetivo de evaluar el efecto de la implementación de buenas prácticas de ordeño sobre la composición fisicoquímica de la leche, la calificación en la prueba de California contra mastitis, y en el conteo de células somáticas en la leche realizada en unidades de producción de leche en pequeña escala del municipio de Aculco, Estado de México. Se analizaron muestras de leche provenientes de cuatro unidades de producción en seis muestreos hechos cada doce días, comparando la implementación de buenas prácticas de ordeño en dos unidades de producción, con el ordeño tradicional en otras dos unidades. Se seleccionaron cinco vacas Holstein (cinco por unidad de producción), representando 10 vacas por tratamiento, Las vacas se seleccionaron en etapas similares de lactación y número de partos. Los tratamientos fueron: Tx1 CBPO = Implementación de buenas prácticas de ordeño y Tx2NBPO = Ordeño tradicional. El experimento tuvo una duración de 12 semanas. Cada muestreo se hizo durante el ordeño de la mañana y se realizó la prueba de California contra mastitis (CMT) a cada vaca, así como el conteo de células somáticas (CCS) a cada vaca en evaluación, usando un equipo DCC marca DeLaval; y se tomó una muestra de leche individual por vaca para la realización del análisis de composición mediante un aparato de ultrasonido (Lacticheck). Las unidades de producción participantes también fueron visitadas durante el ordeño de la tarde para evaluar las prácticas de ordeño. Los resultados de la prueba de California para mastitis se analizaron mediante una prueba de Xi cuadrada. El análisis de los datos de CC se realizó mediante un diseño de parcelas divididas con tratamientos como parcela principal y periodo de muestreo como parcela menor; para lo cual se hizo una transformación logarítmica de los datos de CCS para ajustarlos a una distribución normal para el análisis estadístico (y=Log10). No hubo diferencias estadísticas significativas (P>0.05) para la composición química de la leche. Los cuartos de vacas con buenas prácticas de ordeño presentaron menor calificación en la prueba CMT a un nivel de probabilidad de 0.054. Los resultados mostraron un CCS promedio en el TX1BPO de 290.5X103 células/mL; variando de 514.4X103 células/mL en el primer muestreo a 137.2X103 células/mL al final del experimento y para el Tx2NBPO en el primer muestreo fue 525.950 CS/ml, variando de 753.4X103 células/mL a 568.8X103 células/mL respecto del sexto muestreo de 622.6X103 células/mL a 847.2X103 células/mL. Los resultados del CCS no existieron diferencias entre tratamientos (P>0.05), ambos tratamientos se encuentran dentro de los valores límites permitidos por la NMX-F-700-CPFOCALEC-2012, lo cual sugiere que bajo condiciones de manejo estrictas, las fincas lecheras pueden lograr estándares de CCS mucho menores en la calidad de la leche para su consumo
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