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The Hodge-Deligne polynomials of some moduli spaces of coherent systems
Full text linkAfter proving the existence of (non-split, non-degenerate) universal families of extensions of coherent systems (in the spirit of Lange). we are able to describe wallcrossing for some moduli spaces of coherent systems. This allows us to compute the Hodge-Deligne polynomials of the moduli spaces of coherent systems of type (1,d,n) for n=2,3 and of type (2,d,2) for d odd big enoug
Applicazioni della Spettroscopia Raman a Molecole di Rilevanza Biologica
No full textLa spettroscopia Raman può fornire utili informazioni sulla struttura molecolare di campioni biologici senza richiedere complesse preparazioni del campione. Si tratta di una tecnica spettroscopica ottica potenzialmente poco invasiva e non distruttiva. Sfruttando condizioni di risonanza (o quasi risonanza) è possibile ottenere informazioni molecolari dettagliate su specifici siti funzionali attivi di macromolecole organiche, come nel caso del cromoforo retinilidenico della batteriorodopsina.
In questo seminario verrà illustrato il legame tra l'attività di pompa protonica della batteriorodopsina e le variazioni di coniugazione del sistema π del cromoforo retinilidenico. Infatti, la spettroscopia Raman è capace di cogliere variazioni di coniugazione attraverso il forte accoppiamento esistente tra specifici moti vibrazionali e gli elettroni π delocalizzati. Specifiche simulazioni da principi primi permettono di
interpretare nel dettaglio i risultati delle misure in termini di meccanismi operanti alla scala molecolare.
La spettroscopia Raman può essere anche utilizzata per studiare farmaci, come ad esempio l'apomorfina. Lo spettro Raman della molecola di farmaco costituisce una sorta di “firma” che, una volta interpretata, può essere sfruttata per riconoscere la presenza della molecola in fluidi biologici.
Da questo punto di vista risulta estremamente interessante per le applicazioni il grande innalzamento di sensibilità apportato dalla tecnica SERS (Surface Enhanced Raman Spectroscopy) con la quale è possibile rivelare anche basse concentrazioni di analita (fino a 10-9 M). Tuttavia
l'utilizzo della tecnica SERS comporta uno sforzo interpretativo aggiuntivo, visto che solitamente lo spettro SERS differisce dalla spettro Raman della stessa molecola. Per questo motivo l'interpretazione chimico-fisica dettagliata dello spettro SERS risulta necessaria per stabilire un legame affidabile tra il dato spettroscopico misurato e la molecola da
analizzare. Anche in questo caso l'utilizzo di simulazioni da principi primi è di grande aiuto nell'interpretazione dei dati sperimentali. Il caso della molecola di apomorfina verrà esaminato nel dettaglio, sia dal punto di vista della misura Raman che di quella SERS
Investigation of graphitic materials with Raman spectroscopy
No full textContributo orale su invito alla conferenza Nanoscience and Nanotechnology 2009, INFN-Laboratori Nazionali di Frascati, Italy, 19-22 October 200
The connection between robustness angles and dissymmetry factors in vibrational circular dichroism spectra
No full textTo analyze vibrational circular dichroism (VCD) spectra the angle between the electric and magnetic dipole transition moments was introduced as robustness index. We demonstrate that VCD for each normal mode can be made robust by a suitable translation of the coordinate system origin to a robust point. Normal modes differ in how VCD band robustness varies under translations from these respective robust points. It is shown that variation in robustness of a VCD band depends on a parameter inversely proportional to the dissymmetry factor g. Thus, robustness varies slowly for VCD bands with large dissymmetry factors and vice versa
Raman spectroscopy of disordered and nano-structured carbon materials: the molecular approach
No full textA description of the characteristic features of the first order Raman spectra of carbon materials containing carbon atoms in sp2 hybridisation state is reported. The interpretation (in term of
structural diagnosis) reached through experimental and theoretical investigations on molecular models (Polycyclic aromatic hydrocarbons) are illustrated
A topological model for predicting adsorption energies of polycyclic aromatic hydrocarbons on late-transition metal surfaces
Full text linkA theoretical Raman study on Polycyclic Aromatic Hydrocarbons of environmental interest
No full textWe consider the potential use of Raman spectroscopy for the analysis of Polycyclic Aromatic Hydrocarbons (PAHs) that are found in diesel soots (Fetzer et al. 1986). Through first-principles calculations we have simulated the Raman spectra of several PAHs and we have discussed the possible discrimination of different molecular structures based on the analysis of the Raman spectrum
Molecular interactions of DNA with transfectants: a study based on infrared spectroscopy and quantum chemistry in aid to fluorescence spectroscopy and dynamic light scattering analyses
No full textCationic polymers are promising non-viral agents because of their easiness of use, inexpensiveness and favorable safety profile. Being inherently cationic, they do spontaneously assemble in water with nucleic acids to give polyplexes. The more popular techniques and methods routinely applied for the characterization of such nanosupensions, unfortunately, do not afford direct observation of anion-cation interactions. We thus tackle the issue of probing at the very molecular level the interplay occurring between the PO4- groups of double stranded DNA and the NH3+ groups of the simple and representative transfectant poly(L-Lysine). By means of IR spectroscopy and Density Functional Theory (DFT) calculations we assigned the red shift of the anti-symmetric PO stretching wavenumber to the intermolecular water- mediated NH3+:PO4- interaction. These changes observed in moving from ineffective, low nitrogen (N) to DNA phosphate (P) ratios (N/Ps) to more effective conditions are in overall good agreement with changes in polyplex behavior unveiled by means of other analytical techniques such as dynamic light scattering, laser Doppler micro-electrophoresis, and fluorescence spectroscopy, but provide direct insight into the basic intermolecular DNA:transfectant interplay. The application of IR spectroscopic analysis to other non-viral gene delivery vectors may become an appealing approach to disclose molecular details on PO4- :cationic polymer interaction, taking into account conformational constraints and steric hindrance effects that the other techniques actually overlook
Two dimensional correlation Raman spectroscopy of perfluoropolyethers: Effect of peroxide groups
No full textPerfluoropolyethers (PFPEs) have been investigated with Raman spectroscopy and density functional theory (DFT) calculations. The two dimensional correlation spectroscopy (2DCOS) approach has been applied to a set of PFPEs containing different concentrations of peroxide (-OO-) groups, thus allowing to eval-
uate the effect on the Raman spectra due to the presence of oxygen–oxygen bonds in the molecular structure. Careful analysis of the vibrational normal modes obtained with DFT calculations supports the detailed interpretation of the 2DCOS maps
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