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Bio-indication diatomique pour la mesure de la qualité des milieux aquatiques : avancées et perspectives
No full text[Departement_IRSTEA]GMA [TR1_IRSTEA]12 - MILEAU / ALTERMILLes Diatomées sont des algues brunes unicellulaires microscopiques, planctoniques et benthiques, prédominantes dans les eaux courantes des sources à l'embouchure. Leur rémanence (squelette siliceux) et leur diversité, leur sensibilité face à de nombreux facteurs physiques et chimiques, en font d'excellents indicateurs bio-intégrateurs de la qualité des eaux des milieux lotiques. Depuis 1994, l'Indice Biologique Diatomées (IBD) est utilisé en France en routine par les Agences de l'Eau pour la surveillance de la qualité des rivières, mais cet indice est voué à évoluer très rapidement et de façon substantielle. En effet la Directive Européenne sur l'Eau (2000/60/EC) exige que les pays membres atteignent le "bon état écologique "d'ici 15 ans. Or, ceci suppose que la qualité de l'eau soit évaluée de façon équivalente au sein de l'Europe. Sachant que plus d'une vingtaine de méthodes basées sur les diatomées y sont répertoriées, un important effort de standardisation devra être effectué (rôle des Commissions Européennes de Normalisation). D'autre part, aucune méthode ne peut être actuellement utilisée partout en Europe car la pertinence des indices dépend beaucoup de notre capacité à distinguer les variations naturelles observées au sein des communautés diatomiques des variations d'origine anthropique. La recherche actuelle se penche donc sur l'étude de l'effet des paramètres environnementaux sur la structure des assemblages diatomiques, afin d'aboutir à la définition de zones écologiquement homogènes, pour lesquelles seront décrits des assemblages-types caractérisant des situations de référence (non anthropisées) dans un premier temps, puis différents degrés d'altération. Cette démarche, qui fait intervenir des outils de modélisation innovants tels que les réseaux artificiels de neurones, constitue un axe privilégié de développement en bio-indication diatomique. C'est un des principaux sujets du programme européen de recherches 5ème PCRD PAEQANN, dont les premiers résultats obtenus sur un jeu de données pilote seront ici présentés
Biodiversité et vulnérabilité des communautés de diatomées benthiques en milieu lotique
No full text[Departement_IRSTEA]Eaux [TR1_IRSTEA]BELCABiodiversité et vulnérabilité des communautés de diatomées benthiques en milieu lotique
The role of biomolecules produced by invasive macrophytes in lake ecosystem processes
No full textEgeria densa and Lagarosiphon major are the main invasive hydrophytes in French Atlantic Lakes. These exotic species can modify trophic levels by producing large quantities of biomass in lakes; previous investigations revealed the occurrence of endogenous metabolites in these plants known to be able to affect epiphytic communities, phytoplankton, or other plants, through allelopathic activity. Nevertheless, the actual excretion and environmental occurrence of these metabolites remain poorly documented. In order to gain knowledge of the concrete occurrence and potential ecological impact of E. densa and L. major exometabolome, untargetedmetabolomics using high-resolution mass spectrometer and chemometrics approaches is relevant through its ability to depict, as a first step, the exometabolome chemical landscape
Suivi hydrobiologique du Luzou, année 2013 : communautés de diatomées benthiques
No full text[Departement_IRSTEA]Eaux [TR1_IRSTEA]BELCA [Type_IRSTEA]Rapport d'expertiseLa masse d’eau « Luzou » a été identifiée lors de l'état des lieux 2004 actualisé 2006, comme risquant de ne pas atteindre le Bon Etat en 2015. Toutefois, le décalage entre les pressions identifiées sur ce secteur et la réponse du compartiment biologique (diatomées notamment), a conduit l’Agence à solliciter l’Irstea de Bordeaux pour mener une étude (sur la période 2009-2010) visant à préciser les réponses des différents compartiments biologiques au regard des pressions qui s’exercent sur cette masse d’eau. Cette étude avait conclu que l’impact chimique des rejets du complexe MLPC sur les différents types de communautés végétales et animales du Luzou était très net et délétère : rupture brutale de la diversité biologique et de la biomasse de la faune piscicole et des macroinvertébrés benthiques ; apparition de taxons et de formes biologiques résistants à la pollution (formes tératogènes chez les diatomées, Chironomides, Chevaines, Sphaerotilus, …). Au moment de la rédaction de ce rapport, une publication scientifique à ce sujet est en cours d’écriture. Suite à ce constat, l’Agence de l’Eau a sollicité l’Irstea de Bordeaux afin de réaliser un suivi annuel des flores diatomiques et de la physico-chimie de l’eau sur la période 2012-2014. Les résultats de la campagne 2012 ont confirmé les précédents, avec un taux accru de tératogénicité (8%). Pour la campagne 2013, un contexte particulier doit être signalé : les conditions hydrologiques ont été inhabituelles avec un printemps très pluvieux et un niveau d’eau consécutivement très haut (rivière en crue hors du lit principal) ; à l’aval direct des effluents les cagettes portant les lames de verre ont été systématiquement sorties de l’eau par malveillance, rendant les résultats quantitatifs à cette station inexploitables (au minimum, peu fiables). Enfin, nous précisons que MLPC à ce jour n’a pas encore mis en place de système plus poussé d’épuration de ces effluents avant rejet
Guide iconographique pour la mise en oeuvre de l'Indice Biologique Diatomée 2007
No full text[Departement_IRSTEA]Eaux [TR1_IRSTEA]BELCA [Relecteur_IRSTEA]Dreal ; Bart van de VijverSince its revision in 2007, the Biological Diatom Index is calculated on the basis of a list of 1478 taxa (including 476 synonyms and 190 abnormal forms), which ecological profiles have been previously determined. A new iconographic guide has then been achieved, accompanying the implementation of the index. This guide illustrates more than 900 taxa taken into account for the calculations, and which names correspond to those cited in the AFNOR standard. When appropriate, a most recently name is proposed in synonymy. Some additional taxa are illustrated.Depuis sa révision en 2007, l'Indice Biologique Diatomée se calcule sur la base d'une liste de 1478 taxons (dont 476 synonymes anciens et 190 formes anormales), dont les profils écologiques ont été au préalable déterminés. Un guide iconographique a donc été réalisé, accompagnant la mise en oeuvre de l'indice. Ce guide illustre plus de 900 taxons répartis en 188 planches et retenus pour le calcul de l'IBD. Les dénominations utilisées correspondent à celles figurant dans la norme AFNOR. Le cas échéant, une dénomination secondaire plus récente est proposée en synonymie. Certains taxons non retenus dans la norme ont tout de même été illustrés, lorsque cela paraissait utile du point de vue taxinomique. Il faut noter que plus de 200 combinaisons nouvelles (sur 812 taxons IBD) sont apparues depuis 2007 ce qui devrait justifier une nouvelle révision de la norme. 768 taxons représentés dans le guide sont retenus dans la norme et 213 supplémentaires (non retenus par la norme) sont illustrés. Ils représentent des combinaisons nouvelles ou des taxons proches susceptibles de donner lieu à des confusions ou encore des formes halophiles ou tropicales dont l'intégration dans les futurs indices en cours d'élaboration est envisagée
Suivi hydrobiologique du Luzou, année 2012 : communautés de diatomées benthiques
No full text[Departement_IRSTEA]Eaux [TR1_IRSTEA]BELCA [Type_IRSTEA]Rapport d'expertiseLa masse d’eau « Luzou » a été identifiée lors de l'état des lieux 2004 actualisé 2006, comme risquant de ne pas atteindre le Bon Etat en 2015. Toutefois, le décalage entre les pressions identifiées sur ce secteur et la réponse du compartiment biologique (diatomées notamment), a conduit l’Agence à solliciter l’Irstea de Bordeaux pour mener une étude (sur la période 2009-2010) visant à préciser les réponses des différents compartiments biologiques au regard des pressions qui s’exercent sur cette masse d’eau. Cette étude avait conclu que l’impact chimique des rejets du complexe MLPC sur les différents types de communautés végétales et animales du Luzou était très net et délétère : rupture brutale de la diversité biologique et de la biomasse de la faune piscicoles et des macro-invertébrés benthiques ; apparition de taxons et de formes biologiques résistants à la pollution (formes tératogènes chez les diatomées, Chironomides, Chevaines, Sphaerotilus, …). Suite à ce constat, l’entreprise MLPC a pris la décision de mettre en place un système d’épuration de ses effluents toxiques. L’Agence sollicite à nouveau l’Irstea de Bordeaux afin de réaliser un suivi annuel de la physico-chimie de l’eau et des flores diatomiques, et de suivre ainsi une éventuelle remédiation de milieu
Guide iconographique pour la mise en oeuvre de l'Indice Biologique Diatomée 2007
No full text[Departement_IRSTEA]Eaux [TR1_IRSTEA]BELCA [Relecteur_IRSTEA]Dreal ; Bart van de VijverSince its revision in 2007, the Biological Diatom Index is calculated on the basis of a list of 1478 taxa (including 476 synonyms and 190 abnormal forms), which ecological profiles have been previously determined. A new iconographic guide has then been achieved, accompanying the implementation of the index. This guide illustrates more than 900 taxa taken into account for the calculations, and which names correspond to those cited in the AFNOR standard. When appropriate, a most recently name is proposed in synonymy. Some additional taxa are illustrated.Depuis sa révision en 2007, l'Indice Biologique Diatomée se calcule sur la base d'une liste de 1478 taxons (dont 476 synonymes anciens et 190 formes anormales), dont les profils écologiques ont été au préalable déterminés. Un guide iconographique a donc été réalisé, accompagnant la mise en oeuvre de l'indice. Ce guide illustre plus de 900 taxons répartis en 188 planches et retenus pour le calcul de l'IBD. Les dénominations utilisées correspondent à celles figurant dans la norme AFNOR. Le cas échéant, une dénomination secondaire plus récente est proposée en synonymie. Certains taxons non retenus dans la norme ont tout de même été illustrés, lorsque cela paraissait utile du point de vue taxinomique. Il faut noter que plus de 200 combinaisons nouvelles (sur 812 taxons IBD) sont apparues depuis 2007 ce qui devrait justifier une nouvelle révision de la norme. 768 taxons représentés dans le guide sont retenus dans la norme et 213 supplémentaires (non retenus par la norme) sont illustrés. Ils représentent des combinaisons nouvelles ou des taxons proches susceptibles de donner lieu à des confusions ou encore des formes halophiles ou tropicales dont l'intégration dans les futurs indices en cours d'élaboration est envisagée
Evaluation des Très Grands Cours d'Eau de France : proposition de dispositif à stabiliser (13-06-2016)
No full textNational audienceLa présente communication rappelle tout d’abord la situation particulière des très grands cours d’eau, qui sont concernés par une absence totale de situations de référence en France. Cette particularité a retardé de plusieurs années la proposition d’un cadre valide pour l’évaluation de leur état écologique à partir des diatomées benthiques. Après que le cas des cours d’eau plus petits ait pu être réglé, la mise en place d’un dispositif d’évaluation adapté à cette typologie de taille (> 10 000 km2) est devenue une priorité dans le cadre de la DCE. Dans cet objectif, une nouvelle fiche-action ONEMA-Irstea N° 23 à portée triennale (2016-2018) a pu être planifiée courant 2015. L’action prévue dans cet objectif a visé à proposer un dispositif national d’évaluation basée sur des relations pression-impact trouvées dans notre jeu de données national. La France a eu dans le même temps la chance de pouvoir rentrer dans un exercice d’intercalibration européen en voie de démarrage, ce qui, sur le principe, ouvrait l’opportunité de caler d’emblée notre système national sur un niveau d’évaluation partagé par la majorité des pays-membres Européens. La communication expose la teneur du prototype national d’évaluation initialement envisagé et les évolutions qu’il a fallu intégrer par itérations successives en fonction des résultats d’étape procurés par l’exercice d’intercalibration en cours. Au stade actuel, après une erreur de versioning de jeu de données de la coordinatrice qui a entraîné des difficultés de compréhension du déroulement du processus et du positionnement de notre jeu national pendant environ 3 mois, l’exercice est cette fois sur de bons rails et nous amène des bons points de comparaison entre notre niveau d’évaluation et celui des autres pays-membres participants. A ce stade, la France évalue les TGCE de manière un peu plus sévère que nos partenaires et doit adapter sa pratique d’évaluation pour rentrer dans les biais tolérés. L’objectif de cette présentation est donc de discuter de 3 leviers d’action possibles pour rentrer dans les seuils tolérés, afin de décider collégialement de la solution la plus adéquate en fonction de notre contexte national
The role of biomolecules produced by invasive macrophytes in lake ecosystem processes
No full textEgeria densa and Lagarosiphon major are the main invasive hydrophytes in French Atlantic Lakes. These exotic species can modify trophic levels by producing large quantities of biomass in lakes; previous investigations revealed the occurrence of endogenous metabolites in these plants known to be able to affect epiphytic communities, phytoplankton, or other plants, through allelopathic activity. Nevertheless, the actual excretion and environmental occurrence of these metabolites remain poorly documented. In order to gain knowledge of the concrete occurrence and potential ecological impact of E. densa and L. major exometabolome, untargetedmetabolomics using high-resolution mass spectrometer and chemometrics approaches is relevant through its ability to depict, as a first step, the exometabolome chemical landscape
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