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Estudo da associação entre o polimorfismo K121Q no gene E-NPP1 e doença renal do diabetes e rejeição aguda em transplantados renais
Get PDFA E-NPP1 (ecto-nucleotide pyrophosphatase / phosphodiesterase 1) faz parte de uma família de enzimas responsáveis por hidrolisar nucleotídeos extracelulares, conhecidas como ectonucleotidases. Esta enzima foi inicialmente identificada como um marcador de superfície de linfócitos B recebendo o nome de plasma-cell differentiation antigen-1 (PC-1). O efeito do aumento da expressão de E-NPP1 foi descrito inicialmente em uma paciente com uma rara resistência extrema à insulina. Nessa paciente, a inibição marcada da função do receptor da insulina foi devido ao aumento da expressão de E-NPP1. Estudos subsequentes realizados em células humanas confirmaram esse achado. De acordo com o papel da E-NPP1 na resistência à insulina, diversos estudos posteriores demonstraram a associação de polimorfismos no gene E-NPP1 com diabetes mellitus (DM), o que parece ser dependente do grupo étnico analisado. O polimorfismo K121Q (rs1044498) é de longe o mais estudado neste gene e causa a troca de uma lisina (K) para glutamina (Q) no códon 121 (éxon 4). O polimorfismo K121Q parece interferir com interações proteína-proteína uma vez que ele ocorre no segundo domínio somatomedin-B-like da E-NPP1, o qual é importante para essa função. De fato, estudos in vitro demonstraram que o alelo Q interage mais fortemente com o receptor da insulina do que o alelo K, reduzindo a autofosforilação deste receptor. O alelo Q também reduz a fosforilação do substrato do receptor da insulina 1 (insulin receptor substrate 1 – IRS1) induzida por insulina, a atividade de quinase do fosfatidilinositol-3, a síntese de glicogênio e a proliferação celular. Além disso, um estudo demonstrou que sicilianos portadores do alelo Q tiveram menor sensibilidade à insulina do que 12 indivíduos não-portadores. Resultados similares foram obtidos em estudos realizados em finlandeses e suecos, mas não em dinamarqueses. O polimorfismo K121Q também parece estar associado com doença renal do diabetes (DRD), embora os estudos ainda sejam contraditórios. Diante disso, realizamos uma revisão sistemática e metanálise dos estudos disponíveis na literatura visando avaliar se o polimorfismo K121Q no gene E-NPP1 está realmente associado com a DRD. A metanálise incluiu 7 estudos observacionais elegíveis, totalizando 3571 indivíduos analisados [1606 com DRD (casos) e 1965 sem DRD (controles)]. A análise quantitativa destes estudos demonstrou a associação significativa entre o genótipo Q/Q do polimorfismo K121Q e risco para DRD nas populações europeia [razão de chances (RC) = 1,79, IC 95% 1,22 – 2,76] e asiática (RC = 2,15, IC 95% 1,23 – 3,75). Interessantemente, alguns estudos demonstraram que alguns membros da família das ectonucleotidases estão associados com dano renal, imunidade e rejeição crônica. Entretanto, até o momento, a E-NPP1, mesmo estando associada com DRD, ainda não foi avaliada no contexto da rejeição aguda (RA) em pacientes transplantados. Dessa forma, também tivemos como objetivo avaliar a associação do polimorfismo K121Q no gene E-NPP1 com RA em pacientes transplantados renais. Em um estudo de casocontrole, o polimorfismo K121Q foi genotipado em 454 pacientes transplantados renais do sul do Brasil, sendo 96 pacientes com RA (casos) e 358 sem RA (controles). A frequência do alelo Q foi maior no grupo de indivíduos com RA do que no grupo sem RA (24,5% vs. 17,0%, p = 0,024). Após controle por possíveis fatores de confusão, o genótipo Q/Q permaneceu como um preditor independente para RA comparado a portadores do alelo K [Harzard ratio (HR) = 2,76, IC 95% 1,44 – 5,30]. 13 Em conclusão, nosso estudo de revisão sistemática e metanálise confirmou a associação do genótipo Q/Q do polimorfismo K121Q no gene E-NPP1 com risco para DRD. Além disso, nosso estudo em pacientes transplantados renais demonstrou, pioneiramente, a associação do genótipo Q/Q deste polimorfismo com risco para RA. Estudos adicionais são necessários para replicar este achado em outras populações, bem como identificar o mecanismo molecular explicando esta associação.E-NPP1(ectonucleotide pirophosphatase/phosphodiesterase 1) belongs to a family of enzymes responsible for hydrolyzing extracellular nucleotides, known as ectonucleotidases. This enzyme was initially identified as a surface marker of Blymphocytes, called plasma-cell differentiation antigen-1 (PC-1). The effect of E-NPP1 upregulation was initially described in a patient with a rare severe insulin resistance. In this patient, a marked inhibition of the insulin receptor function occurred due to an increase in E-NPP1 expression. Further studies in human cells have confirmed this finding. According to the role of E-NPP1 in insulin resistance, several studies have demonstrated the association of E-NPP1 gene polymorphisms with diabetes mellitus (DM), which seems to be dependent on the ethnic group analyzed. The K121Q polymorphism (rs1044498) is by far the most studied variant in this gene, and exchanges a lysine (K) by a glutamine (Q) in codon 121 (exon 4). The K121Q polymorphism seems to interfere in protein-protein interactions since it occurs in the second domain somatomedin-B-like of the E-NPP1, which is important for that function. In fact, in vitro studies demonstrated that the Q allele interacts more strongly with the insulin receptor than the K allele; thus, reducing the autophosphorylation of this receptor. The Q allele also reduces the insulin-induced phosphorylation of the insulin receptor substrate 1 (IRS1), the kinase activity of fosfatidilinositol-3, glycogen synthesis, and cellular proliferation. Moreover, a study demonstrated that Sicilians who carried the Q allele had less sensibility to insulin than non-carriers. Similar results were also obtained in studies performed in Finish and Swedish, but not in Danish people. 15 The K121Q polymorphism also seems to be associated with diabetic kidney disease (DKD), although studies are still controversial. Therefore, we performed a systematic review and meta-analysis of the studies available in literature to evaluate if the E-NPP1 K121Q polymorphism is indeed associated with DKD. Meta-analysis included 7 observational studies, totalizing 3571 individuals analyzed [1606 with DKD (cases) and 1965 without DKD (controls)]. The quantitative analysis of the studies demonstrated a significant association between the Q/Q genotype of the K121Q polymorphism and risk for DKD in European [odds ratio (OR) = 1.79, 95% CI 1.22 – 2.76)] and Asian (OR = 2.15, 95% CI 1.23 – 3.75) populations. Interestingly, some studies demonstrated that other members of the Ectonucleotidase family are associated with kidney damage, immunity and chronic rejection. Even though the E-NPP1 has being associated with DKD, so far, it has not been evaluated in the context of acute rejection (AR) in transplant patients. Thus, we also aimed to evaluate the association between the K121Q polymorphism in the ENPP1 gene and AR in kidney transplant patients. In a case-control study, the K121Q polymorphism was genotyped in 454 kidney transplant patients from South of Brazil, being 96 patients with AR (cases) and 358 without AR (controls). The Q allele frequency was higher in individuals with AR compared to those without AR (24.5% vs. 17.0%, P = 0.024). After adjustment for possible co-variables, the Q/Q genotype remained as an independent predictor of AR compared to K allele carriers [Hazard ratio (HR) = 2.76, 95% CI 1.44 – 5.30]. In conclusion, our systematic review and meta-analysis confirmed the association between the Q/Q genotype of the E-NPP1 K121Q polymorphism and risk for DKD. Moreover, our study in kidney transplant patients demostrated, for the first 16 time, the association between the Q/Q genotype of this polymorphism and risk for AR. Additional studies are needed to replicate this finding in other populations as well as to identify the molecular mechanism behind this association
Estudo do efeito do polimorfismo K121Q no gene ENPP-1 na expressão desta proteína em células renais
Get PDFA Nefropatia Diabética (ND) é uma complicação crônica do Diabetes Mellitus (DM) que atinge em torno de 30% destes indivíduos, sendo responsável por mais de um terço dos novos casos de insuficiência renal em indivíduos no início do programa de diálise. Esta complicação é também associada a um aumento significativo da mortalidade nesses pacientes. Estudos epidemiológicos e de agregação familial têm demonstrado que além dos conhecidos fatores ambientais, ND é uma doença multifatorial com um componente genético. Grandes esforços têm sido feitos para identificar estes genes, mas os resultados ainda são inconsistentes com diferentes genes associados a um efeito pequeno em populações específicas. A identificação de tais genes que permitem a detecção de indivíduos de alto risco para desenvolver ND pode permitir-nos ter uma melhor compreensão da sua fisiopatologia. A ENPP1 (ecto-nucleotide pyrophosphatase / phosphodiesterase 1) é uma proteína expressa na membrana celular de vários tecidos, incluindo os rins. Constatouse que níveis aumentados de expressão da ENPP1 inibem a atividade tirosina-quinase do receptor da insulina em vários tipos celulares, causando resistência à insulina. A expressão aumentada de ENPP1 inibe a sinalização da insulina em vários tipos celulares in vitro, parecendo estar fortemente associada ao receptor da insulina na superfície celular. O polimorfismo K121Q (A/C) do gene ENNP1 está associado com resistência à insulina e com o desenvolvimento da ND em diferentes populações. Apesar do papel da proteína ENPP1 na patogênese de DN ser de importância vital, ainda são desconhecidos os efeitos do polimorfismo K121Q na expressão deste gene em tecido de rim humano. No presente estudo, analisamos a expressão gênica e protéica da ENPP1 em biópsias de tecido renal humano de acordo com os diferentes genótipos do polimorfismo K121Q. Foram incluídos 107 pacientes submetidos à nefrectomia terapêutica para se obter a amostra esperada em cada grupo. Após os critérios de exclusão, 57 amostras (9 Q/Q, 27 Q/K, 20 K/K) foram elegíveis para o estudo e técnica de imunohistoquímica a fim de analisar a expressão protéica da ENPP1. Posteriormente foram selecionadas 34 amostras (9 Q/Q, 12 Q/K, 13 K/K) para investigar a expressão do gene ENPP1, através da técnica de PCR em tempo real. A expressão gênica da ENPP1 no rim não diferiu significativamente entre os portadores do alelo Q vs. K/K (QQ/KQ vs. K/K; 1.0 (0.1 – 1.6) vs. 0.72 (0.1 – 2.1) AU (unidades arbitrárias), respectivamente; P = 0.483). Da mesma forma, a expressão protéica da ENPP1 não diferiu em portadores (K/Q + Q/Q) quando comparados a não portadores (K/K) do genótipo de risco (2.86 ± 0.32 vs. 2.78 ± 0.35 AU; P = 0.417). Em conclusão, nosso resultado sugere que o polimorfismo K121Q não está associado a mudanças de expressão gênica ou protéica no rim humano
Going Beyond Counting First Authors in Author Co-citation Analysis
Get PDFThe present study examines one of the fundamental aspects of author co-citation analysis (ACA) - the way co-citation
counts are defined. Co-citation counting provides the data on which all subsequent statistical analyses and mappings
are based, and we compare ACA results based on two different types of co-citation counting - the traditional type that
only counts the first one among a cited work's authors on the one hand and a non-traditional type that takes into
account the first 5 authors of a cited work on the other hand. Results indicate that the picture produced through this non-traditional author co-citation counting contains more coherent author groups and is therefore considerably clearer. However, this picture represents fewer specialties in the research field being studied than that produced through the traditional first-author co-citation counting when the same number of top-ranked authors is selected and analyzed. Reasons for these effects are discussed
Variations on the Author
Get PDF“Variations on the Author” discusses two of Eduardo Coutinho’s recent films (Um Dia na Vida, from 2010, and Últimas Conversas, posthumously released in 2015) and their contribution to the general question of documentary authorship. The director’s filmography is characterized by a consistent yet self-effacing form of authorial self-inscription: Coutinho often features as an interviewer that rather than express opinions propels discourses; an interviewer that is good at listening. This mode of self-inscription characterizes him as an author who is not expressive but who is nonetheless markedly present on the screen. In Um Dia na Vida, however, Coutinho is completely absent form the image, while Últimas Conversas, on the contrary, includes a confessional prologue that moves the director from the margins to the center of his films. This article examines the ways in which these works stand out in the filmography of a director who offers new insights into the notion of cinematic authorship
Appropriate Similarity Measures for Author Cocitation Analysis
Get PDFWe provide a number of new insights into the methodological discussion about author cocitation analysis. We first argue that the use of the Pearson correlation for measuring the similarity between authors’ cocitation profiles is not very satisfactory. We then discuss what kind of similarity measures may be used as an alternative to the Pearson correlation. We consider three similarity measures in particular. One is the well-known cosine. The other two similarity measures have not been used before in the bibliometric literature. Finally, we show by means of an example that our findings have a high practical relevance.information science;Pearson correlation;cosine;similarity measure;author cocitation analysis
Dispelling the Myths Behind First-author Citation Counts
Get PDFWe conducted a full-scale evaluative citation analysis study of scholars in the XML research field to explore just how different from each other author rankings resulting from different citation counting methods actually are, and to demonstrate the capability of emerging data and tools on the Web in supporting more realistic citation counting methods. Our results contest some common arguments for the continued
use of first-author citation counts in the evaluation of scholars, such as high correlations between author rankings by first-author citation counts and other citation
counting methods, and high costs of using more realistic citation counting methods that are not well-supported by the ISI databases. It is argued that increasingly available digital full text research papers make it possible for citation analysis studies to go beyond what the ISI databases have directly supported and to employ more
sophisticated methods
koamabayili/VECTRON-author-checklist: VECTRON author checklist
No full textWe have done our best to complete the author checklist relating to the use of animals in the hut study. Note that the objective for the hut study was to evaluate the IRS treatment applications for residual efficacy against Anopheles mosquitoes, including the local An. coluzzii mosquito population. Cows were only used to attract mosquitoes into the huts and no tests were carried out directly on the cows. The author checklist is intended for use with studies where experiments are carried out on animals, which is why we have had such difficulty in completing this for the hut study, as many of the questions do not relate to how the cows were used
Author-wise bibliometric analysis based on entropy.
No full textAuthor-wise bibliometric analysis based on entropy.</p
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