1,721,012 research outputs found
Going Beyond Counting First Authors in Author Co-citation Analysis
Get PDFThe present study examines one of the fundamental aspects of author co-citation analysis (ACA) - the way co-citation
counts are defined. Co-citation counting provides the data on which all subsequent statistical analyses and mappings
are based, and we compare ACA results based on two different types of co-citation counting - the traditional type that
only counts the first one among a cited work's authors on the one hand and a non-traditional type that takes into
account the first 5 authors of a cited work on the other hand. Results indicate that the picture produced through this non-traditional author co-citation counting contains more coherent author groups and is therefore considerably clearer. However, this picture represents fewer specialties in the research field being studied than that produced through the traditional first-author co-citation counting when the same number of top-ranked authors is selected and analyzed. Reasons for these effects are discussed
Variations on the Author
Get PDF“Variations on the Author” discusses two of Eduardo Coutinho’s recent films (Um Dia na Vida, from 2010, and Últimas Conversas, posthumously released in 2015) and their contribution to the general question of documentary authorship. The director’s filmography is characterized by a consistent yet self-effacing form of authorial self-inscription: Coutinho often features as an interviewer that rather than express opinions propels discourses; an interviewer that is good at listening. This mode of self-inscription characterizes him as an author who is not expressive but who is nonetheless markedly present on the screen. In Um Dia na Vida, however, Coutinho is completely absent form the image, while Últimas Conversas, on the contrary, includes a confessional prologue that moves the director from the margins to the center of his films. This article examines the ways in which these works stand out in the filmography of a director who offers new insights into the notion of cinematic authorship
Appropriate Similarity Measures for Author Cocitation Analysis
Get PDFWe provide a number of new insights into the methodological discussion about author cocitation analysis. We first argue that the use of the Pearson correlation for measuring the similarity between authors’ cocitation profiles is not very satisfactory. We then discuss what kind of similarity measures may be used as an alternative to the Pearson correlation. We consider three similarity measures in particular. One is the well-known cosine. The other two similarity measures have not been used before in the bibliometric literature. Finally, we show by means of an example that our findings have a high practical relevance.information science;Pearson correlation;cosine;similarity measure;author cocitation analysis
Dispelling the Myths Behind First-author Citation Counts
Get PDFWe conducted a full-scale evaluative citation analysis study of scholars in the XML research field to explore just how different from each other author rankings resulting from different citation counting methods actually are, and to demonstrate the capability of emerging data and tools on the Web in supporting more realistic citation counting methods. Our results contest some common arguments for the continued
use of first-author citation counts in the evaluation of scholars, such as high correlations between author rankings by first-author citation counts and other citation
counting methods, and high costs of using more realistic citation counting methods that are not well-supported by the ISI databases. It is argued that increasingly available digital full text research papers make it possible for citation analysis studies to go beyond what the ISI databases have directly supported and to employ more
sophisticated methods
HOX-Transkriptionsfaktoren in der malignen Hämatopoiese – Analysen zur Spezifität und zum molekularen Transformationsmechanismus
Get PDFHomeobox (HOX) genes code for transcription factors that serve as master regulators not only during embryogenesis but also in hematopoiesis. In human leukemia with poor prognosis they are often overexpressed or targeted by chromosomal translocations. Ectopic overexpression of HOXA paralogs in primary murine hematopoietic progenitors leads to a block in differentiation and increased self renewal capacity. HOXA transformed cells are leukemogenic in a murine model. The leukemic phenotype is dependent on the specific HOX gene used for initial transformation. The molecular mechanism of this transformation is largely unknown. To investigate the role of specific domains in this process swap mutants were created that switched domains between HOXA paralogs. Functional analyses of the chimeric proteins using bone marrow assays and transplantation experiments revealed that solely the C-terminal strongly conserved homeodomain region determined target gene specificity and thus the leukemic phenotype. Furthermore, it could be shown that the amino termini of HOXA paralogs are transactivating which is essential for transformation. A known hexapeptide motif for binding the cofactor Pbx was dispensable for in vitro transformation. However, deletion of these six amino acids severely affected the oncogenic properties of HOXA9 in vivo. Based on these results dimer formation of HOX and cofactors Pbx and Meis1 was investigated in a systematic approach using coimmunoprecipitation. Stable DNA-independent dimers consisting of Meis1 and Pbx proteins could be detected. Meis1 was stabilized upon coexpression of Pbx proteins and this effect was contingent on a Meis1 interaction domain in Pbx3 that could be identified by deletion studies. The last part of this thesis focuses on the gene Vav2 that was previously identified as a HOXA target gene. It could be shown that Vav2 is directly regulated by both HOXA1 and HOXA9 on mRNA- and protein levels. Additionally, HOXA proteins regulate the activity of the small GTPase Rac1 in transformed cells through control of Vav2 expression. Loss of Vav2 lead to a strong decrease in Rac1-GTP levels in HOXA transformed cells. However, this deficiency did not affect latency and aggressivity of HOXA induced murine leukemia in vivo.Homöoboxgene (HOX-Gene) codieren für Transkriptionsfaktoren, die als Masterregulatoren während der Hämatopoiese dienen. In einer Reihe von humanen Leukämien mit schlechter Prognose sind HOX-Gene überexprimiert oder können Ziele von chromosomalen Translokationen sein. Die Überexpression einzelner HOXA-Paraloger in primären murinen hämatopoietischen Vorläuferzellen führt zu einem Differenzierungsblock und erhöhter Selbsterneuerungskapazität. So transformierte Zellen wirken leukämogen im Mausmodell. Der Phänotyp der Leukämie unterscheidet sich hierbei je nach verwendetem HOX-Gen. Der molekulare Mechanismus dieser Transformation ist weitestgehend unklar. Im Rahmen dieser Arbeit wurden Proteindomänen zwischen HOXA-Proteinen ausgetauscht. Durch funktionelle Analyse der chimären Proteine in Knochenmarktransformationstests und Transplantationsversuchen konnte geklärt werden, dass einzig die carboxyterminale stark konservierte Homöodomänenregion die Zielgenspezifität und damit den unterschiedlichen Phänotyp der Leukämie bestimmt. Weiter konnte in Reportergenversuchen für die Aminotermini von HOXA-Proteinen eine transaktivierende Funktion nachgewiesen werden, die essentiell für die Transformation ist.
Ein bekanntes Hexapeptidmotiv für die Bindung des Cofaktors Pbx war nicht nötig für die Transformation in vitro. Die Deletion der sechs Aminosäuren beeinträchtigte jedoch die onkogene Wirkung von HOXA9 in vivo. Aufgrund dieser Erkenntnis wurde die Dimerbildung von HOX-Proteinen mit den Cofaktoren Meis1 bzw. Pbx-Proteinen in Coimmunopräzipitationsexperimenten systematisch untersucht. Einzig Meis1 und Pbx-Proteine bildeten stabile zelluläre Dimere. Außerdem wurde Meis1 in der Anwesenheit von Pbx-Proteinen stabilisiert. Deletionsversuche führten zur Identifikation einer Meis1-Interaktionsdomäne in Pbx3. Versuche mit der generierten Mutante könnten in Zukunft dazu beitragen, eine mögliche Beteiligung von trimeren Komplexen aus HOX, Meis1 und Pbx3 im Prozess der malignen Transformation aufzuklären.
Der letzte Teil dieser Arbeit beschäftigt sich mit dem kürzlich identifizierten HOXA-Zielgen Vav2. Es konnte eine direkte Regulation von Vav2 auf RNA- und Proteinebene durch HOXA1 und HOXA9 gezeigt werden. Über die Kontrolle der Vav2-Expression regulieren HOXA-Proteine die Aktivität der kleinen GTPase Rac1 in transformierten Zellen. Ein Verlust von Vav2 führte zwar zu einer starken Abnahme von Rac1-GTP in HOXA-transformierten Zellen. Diese Defizienz hatte jedoch im Mausmodell keinen Einfluss auf Latenz und Aggressivität einer HOX-induzierten Leukämie
Interaktionen von Lymphendothelzellen und mesenchymalen Stammzellen in vitro
Get PDFThe formation of distant metastasis is the main cause of morbidity and mortality for patients with cancer. Cancer cells can disseminate from the primary site via hematogenous and lymphatic routes, which is the main obstacle for the development of effective cancer therapies. Although surgical and radio therapy are able to control many primary tumors, the occurrence of metastasis still means a bad prognosis for the patients. A better understanding of the underlying mechanisms of metastasis could help to develop more effective therapies. In the future, an approach for prevention or reduction of lymphatic metastasis could aim the lymphatic vessels themselves. However, little is known so far about development, function and molecular mechanisms of lymphangiogenesis.
Therefore the aim of the present study was the evaluation of the in vitro interactions of human mesenchymal stem cells and lymphatic endothelial cells, which is the basis for ongoing experiments to understand the formation of lymphatic vessels in pathological diseases as well as the lymphatic metastasis more detailed. MSC are an interesting candidate for studying these processes, because there is already evidence from blood- angiogenesis that MSC and blood endothelial cells interact with each other and thus contribute to neoangiogenesis.
In the first part of the study, the interactions of MSC and LEC by cytokines or cell-cell contacts were analyzed by in vitro angiogenesis assays. Processes of lymphangiogenesis like proliferation, migration, transmigration and sprouting were examined by adding the known pro(lymph)angiogenic growth factors VEGF-C, bFGF, HGF or MSC conditioned medium to the cells or by combination of the two cell types. Furthermore, the contribution of MSC to the formation of new vessels by forming tubular structures (tube formation) in vitro was analyzed. In the second part of the study the results of the growth factor experiments were validated by adding specific neutralizing antibodies to the single growth factors or the MSC CM. However, their influence on lymphatic endothelial cells is largely unexplored.
Lymphangiogenic processes like proliferation, migration, transmigration and tube formation could be potently enhanced both by the single growth factors VEGF-C, bFGF, HGF and MSC secreted factors. This stimulative effect was confirmed by addition of specific neutralizing antibodies inhibiting the lymphangiogenic response. It became clear that the examined factors are involved differently in the individual processes of lymphangiogenesis. Stimulation of LEC with the single growth factors in basal medium in combination with the corresponding antibodies elucidated that VEGF-C as well as bFGF and HGF directly act on lymphangiogenesis, because the lymphatic response of LEC was completely silenced afterwards. Addition of the antibodies to MSC CM showed that only VEGF-C and its receptor VEGFR-3 are essential for all of the examined processes (proliferation, migration, transmigration, tube formation). There is also an essential role of bFGF and HGF for proliferation and tube formation but not for the migratory behavior of LEC. To clarify the exact roles of the different growth factors further experiments, also with alternative factors, as well as a detailed analysis of the composition of the MSC CM are necessary.
In contrast to the processes of proliferation, migration and tube formation the present results have shown that stimulation of LEC sprouting was not as much as expected both in fibrin and collagen gels.
This study presents for the first time the positive influence of conditioned medium of primary human MSC on the lymphangiogenic response of primary human LEC. The results from the in vitro experiments are the basis for the following in vivo establishment of a lymphatic vessel network. Understanding the mechanisms of lymphangiogenesis and the role of growth factors involved could help to get deeper insights into the mechanisms of lymphangiogenesis in pathological processes as well as lymphatic metastasis. Stimulation with growth factors and modification by the use of transfected LEC serve to further investigate manipulation of the lymphangiogenic cascade with the aim to validate novel therapeutic strategies.Neben der Metastasierung über das Blutgefäßsystem metastasieren maligne Tumore in andere Organe über die Lymphgefäße. Dies wird als die Haupttodesursache bei Krebspatienten und als größtes Hindernis bei der Entwicklung effektiver Krebstherapien angesehen. Obwohl die chirurgische Therapie und Radiotherapie heute in der Lage ist, viele Primärtumoren zu kontrollieren, bedeutet das Auftreten von Metastasen immer noch eine schlechte Prognose. Ein besseres Verständnis über die Mechanismen der Metastasierung könnte helfen, effektivere Therapien zu entwickeln. Ein Ansatz zur Verhinderung oder Reduktion der lymphogenen Metastasierung könnte zukünftig auf die Lymphgefäße selbst zielen. Allerdings ist bisher nur wenig über die Entwicklung, Funktion und die molekularen Mechanismen der Lymphangiogenese bekannt.
Ziel der vorliegenden Arbeit war es, die Interaktion von humanen mesenchymalen Stammzellen und Lymphgefäßendothelzellen näher zu untersuchen, um später die Neubildung von Lymphgefäßen in pathologischen Vorgängen sowie die lymphogene Metastasierung besser verstehen zu können. MSC stellen dabei einen interessanten Kandidaten für die Untersuchung dieser Prozesse dar, da es bereits Hinweise aus der Blutangiogenese gibt, dass MSC und Blutendothelzellen miteinander interagieren und so zur Neoangiogenese beitragen. Ihr Einfluss auf Lymphendothelzellen ist jedoch weitestgehend unerforscht.
Es wurden zunächst die Interaktionen von MSC und Lymphgefäßendothelzellen über Zytokine oder Zell-Zellkontakte mittels klassischer in vitro Angiogeneseversuche analysiert. Durch Zugabe der bekannten pro-(lymph)angiogenen Wachstumsfaktoren VEGF-C, bFGF und HGF bzw. MSC konditioniertem Medium oder dem Zusammenführen der beiden Zellpopulationen wurden Komponenten der Lymphangiogenese wie Proliferation, Migration, Transmigration und Sprossung untersucht. Des Weiteren wurde die Beteiligung bzw. der Einbau der MSC am Gefäßaufbau durch das Bilden röhrenförmiger Strukturen in vitro genauer betrachtet. In einem weiteren Versuchsabschnitt wurden die Ergebnisse der Wachstumsfaktorversuche mit spezifischen, neutralisierenden Antikörpern gegen die Wachstumsfaktoren überprüft.
Mit Hilfe der durchgeführten Wachstumsfaktor- und Antikörperversuche konnte gezeigt werden, dass sowohl die einzeln zugegebenen Wachstumsfaktoren VEGF-C, bFGF und HGF als auch die durch MSC sekretierten Faktoren im MSC CM eine stimulierende Wirkung auf die Prozesse der Proliferation, Migration, Transmigration und Bildung röhrenförmiger Strukturen haben. Dies konnte zudem durch die Zugabe spezifischer, neutralisierender Antikörper bestätigt werden, da es hier zu einer Hemmung der stimulierenden Wirkung kam. Dabei wurde deutlich, dass die untersuchten Faktoren unterschiedlich an den einzelnen Prozessen der Lymphangiogenese beteiligt sind. So konnte zunächst nach Zugabe der einzelnen Faktoren festgestellt werden, dass VEGF-C, bFGF und HGF direkt auf die Lymphangiogenese wirken, da eine Neutralisierung durch die entsprechenden Antikörper eine lymphangiogene Antwort der LEC unterdrückte. Die Ergebnisse nach Zugabe der Antikörper zum MSC CM zeigten jedoch, dass nur VEGF-C und sein Rezeptor VEGFR-3 essentiell für alle untersuchten Prozesse (Proliferation, Migration, Transmigration, Bildung röhrenförmiger Strukturen) sind, da deren Wirkung nicht durch andere, im MSC CM enthaltene Faktoren kompensiert werden konnte. Für bFGF und HGF konnte ebenfalls eine essentielle Rolle für die Proliferation und Bildung röhrenförmiger Strukturen durch die LEC nachgewiesen werden, nicht jedoch für das migratorische Verhalten der Zellen. Um den Einfluss dieser Faktoren genauer aufzuklären, sind weitere Versuche, unter anderem auch mit alternativen pro-lymphangiogenen Faktoren, notwendig. Hierfür ist eine detailierte Analyse der Zusammensetzung des MSC CM unumgänglich.
Im Gegensatz zu den Prozessen der Proliferation, Migration und der Bildung röhrenförmiger Strukturen, welche durch MSC sekretierte Faktoren deutlich stimuliert werden konnten, war ein derartiger Effekt für die Sprossung der LEC Sphäroide sowohl nach Einbettung in Kollagen- als auch Fibringele nicht zu beobachten.
Mit der vorliegenden Arbeit konnte erstmals eine pro-lymphangiogene Wirkung von humanen MSC auf humane LEC nachgewiesen werden. Dies schafft die Grundlage für die Etablierung eines Lymphgefäßnetzwerkes in vivo, mit Hilfe dessen die Neubildung von Lymphgefäßen in pathologischen Vorgängen wie z. B. Tumorleiden sowie die lymphangiogene Metastasierung genauer untersucht werden kann. Diese Erkenntnisse können dann für eine möglicherweise therapeutische Hemmung der Lymphgefäßnetzwerkbildung und somit vermindertes Tumorwachstum und Metastasierung genutzt werden
koamabayili/VECTRON-author-checklist: VECTRON author checklist
No full textWe have done our best to complete the author checklist relating to the use of animals in the hut study. Note that the objective for the hut study was to evaluate the IRS treatment applications for residual efficacy against Anopheles mosquitoes, including the local An. coluzzii mosquito population. Cows were only used to attract mosquitoes into the huts and no tests were carried out directly on the cows. The author checklist is intended for use with studies where experiments are carried out on animals, which is why we have had such difficulty in completing this for the hut study, as many of the questions do not relate to how the cows were used
Der Polycomb-Repressor-Komplex als transkriptionelle Barriere bei der Leukämogenese durch MLL-Fusionsproteine
Get PDFMLL Fusionsproteine induzieren eine sehr aggressive Leukämieform. Die maligne Transformation beruht dabei auf der Rekrutierung eines Komplexes (EAP =Elongation Assisting Proteins), der die transkriptionelle Elongation von MLL-Zielgenen konstitutiv aktiviert, was zur Blockade der Differenzierung und so zur Akkumulation hämatopoetischer Vorläuferzellen führt. Für die maximale Induktion von MLL-Zielgenen muss neben der Transkriptions-Aktivierung jedoch zusätzlich noch die inhibitorische Aktivität eines generellen Transkriptionsrepressorkomplexes (Polycomb-Komplex) neutralisiert werden.
Im Rahmen dieser Promotionsarbeit sollte der molekulare Mechanismus, der über die Interaktion mit ENL zur Inhibierung des Polycombkomplexes führt, aufgeklärt werden. Dabei konnte der transkriptionsstimulierende Polymerase-Associated-Factor-Komplex (PAFc) als ENL-Interaktionspartner identifiziert werden, der in transienten Reportergenstudien essentiell für die Neutralisierung der Polycomb-vermittelten Elongationsrepression war. Die Interaktion zwischen MLL-ENL und dem PAF-Komplex, sowie die durch diesen katalysierte H2B-Ubiquitinylierung, war essentiell für das Aufrechterhalten des Transformationspotentials sowie die konstitutive Expression der MLL-Zielgene. Die Ubiquitinylierung führte zur Auflockerung der lokalen Chromatinstruktur und ermöglichte somit die ektope Expression der MLL-ENL Zielgene.
Weiterhin konnte eine Isoform des BCL6-Corepressors (BCoR) als Interaktionspartner von ENL in EAP-Komplex-Aufreinigungen nachgewiesen werden. Dieses Protein wirkt in transienten Reportergenstudien ebenfalls reprimierend auf die Elongation, wobei dieser Effekt, anders als bei CBX8, nicht durch die Interaktion mit ENL aufgehoben werden kann. Vor diesem Hintergrund sollte der Einfluss von BCoR auf die Transformation hämatopoetischer Zellen untersucht werden. Die Überexpression BCoRs hatte einen negativen Einfluss auf die Proliferation, die Zellviabilität und führte zu einer schwächeren Expression der MLL-ENL Zielgene Hoxa9, Meis1 und Myc. Die beobachteten Effekte waren jedoch unabhängig von der physikalischen Interaktion zwischen ENL und BCoR. Die Ergebnisse deuten darauf hin, dass es sich bei BCoR um einen generellen, übergeordneten Repressor handeln könnte, der die Expression wichtiger Entwicklungsgene während der Differenzierung dauerhaft abschalten kann
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