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Going Beyond Counting First Authors in Author Co-citation Analysis
Get PDFThe present study examines one of the fundamental aspects of author co-citation analysis (ACA) - the way co-citation
counts are defined. Co-citation counting provides the data on which all subsequent statistical analyses and mappings
are based, and we compare ACA results based on two different types of co-citation counting - the traditional type that
only counts the first one among a cited work's authors on the one hand and a non-traditional type that takes into
account the first 5 authors of a cited work on the other hand. Results indicate that the picture produced through this non-traditional author co-citation counting contains more coherent author groups and is therefore considerably clearer. However, this picture represents fewer specialties in the research field being studied than that produced through the traditional first-author co-citation counting when the same number of top-ranked authors is selected and analyzed. Reasons for these effects are discussed
Biogeografia e conservação de Byttnerioideae, Helicteroideae e Sterculioideae (Malvaceae) na América do Sul, com uma sinopse taxonômica na Mata Atlântica
Get PDFMapping and discussing biogeographical patterns are essential to understand the origin and evolution of lineages, especially important for current understudied taxonomical groups, such as the Malvaceae. Malvaceae is particularly diverse in South America, with high levels of species richness and endemism, but whose basic questions of biogeography, conservation and taxonomy are outdated and unassessed. Moreover, the current availability of larger online repositories allows the development of new comparative surveys with particularly diverse groups at a continental scale. In this thesis, we used as model three selected subfamilies of Malvaceae--Byttnerioideae, Helicteroideae and Sterculioideae--summing 271 species in 11 genera for South America, to assess questions of biogeography, collection bias, taxonomy and conservation of the groups and of the areas where the taxa occur. Specifically, we (1) built an occurrence database for all selected species via an extensive literature survey and consulting herbarium collections, towards synthetizing the overall distribution pattern of the subfamilies in South America, as well as to estimate bioregions and areas with low sampling efforts; (2) selected species with a particular disjunct pattern to bring insights on the discussion of the biogeography of open seasonally dry areas; (3) used the manual revisited database to compare its performance with an modeled and automatized built dataset when representing species inside South American protected areas network; (4) selected two genera--Ayenia and Byttneria--to provide a taxonomical synopsis of the group in the Atlantic Forest, a novel and important contribution for the region and for the group; and (5) performed a recircumscription and a nomenclatural historic of a misapplied name--Pterygota brasiliensis Allemão--also summarizing the distribution of the genus in the globe. This master thesis resulted in four manuscripts and one annex for publication and brought new subsidies and insights towards further assessments with Malvaceae groups on biogeography, evolution and conservation of the family and of different South American vegetationsMapear e discutir padrões biogeográficos é a base para o entendimento da evolução e diversificação das linhagens, especialmente importante para grupos pouco estudados, como é o caso de Malvaceae. Malvaceae é particularmente diversa na América do Sul, com altos índices de riqueza específica e endemismo, mas cujas questões básicas de biogeografia, conservação e taxonomia estão desatualizadas ou inexploradas. Paralelamente, a disponibilidade de dados nos repositórios online possibilita novos estudos de síntese com grupos diversos e em escala continental. Neste projeto, utilizamos como modelo três subfamílias de Malvaceae -- Byttnerioideae, Helicteroideae e Sterculioideae -- totalizando 271 espécies em 11 gêneros na América do Sul, para responder questões de síntese de padrões biogeográficos, viés de coleta, taxonomia e conservação dos grupos e das áreas onde os táxons ocorrem. Especificamente, nós (1) construímos uma base de dados de ocorrência para as espécies das três subfamílias, com base na consulta da literatura especializada e nas coleções dos herbários, buscando sintetizar o padrão espacial das subfamílias de Malvaceae na América do Sul, bem como estimando biorregiões e eventuais áreas com baixo esforço de coleta; (2) selecionamos espécies com padrão curiosamente disjunto para trazer novos insights na discussão sobre a biogeografia das áreas abertas e sazonalmente secas Neotropicais; (3) utilizamos a base de dados de ocorrência produzida para comparar a sua performance bom dados modelados ou obtidos automaticamente na representatividade das espécies na rede de unidades de conservação sul-americanas; (4) selecionamos dois gêneros -- Ayenia e Byttneria -- para realizar uma sinopse taxonômica na Mata Atlântica, uma contribuição necessária e importante à região e ao grupo; e (5) realizamos uma recircunscrição e um histórico nomenclatural sobre um nome mal aplicado -- Pterygota brasiliensis Allemão -- e revisamos a distribuição do gênero no planeta. Esta tese resultou em quatro capítulos e um anexo em formato de publicação, trazendo contribuições significativas sobre a evolução e conservação do grupo e das vegetações sul-americanas, bem como subsídios a estudos futuros com grupos de Malvaceae Neotropicai
Variations on the Author
Get PDF“Variations on the Author” discusses two of Eduardo Coutinho’s recent films (Um Dia na Vida, from 2010, and Últimas Conversas, posthumously released in 2015) and their contribution to the general question of documentary authorship. The director’s filmography is characterized by a consistent yet self-effacing form of authorial self-inscription: Coutinho often features as an interviewer that rather than express opinions propels discourses; an interviewer that is good at listening. This mode of self-inscription characterizes him as an author who is not expressive but who is nonetheless markedly present on the screen. In Um Dia na Vida, however, Coutinho is completely absent form the image, while Últimas Conversas, on the contrary, includes a confessional prologue that moves the director from the margins to the center of his films. This article examines the ways in which these works stand out in the filmography of a director who offers new insights into the notion of cinematic authorship
Unraveling cacaos: systematics and evolution of Theobroma L and Herrania Goudot (Malvaceae, Byttnerioideae)
Get PDFA Amazônia é a maior e mais rica floresta tropical do mundo, fonte de uma grande quantidade de espécies de plantas e o principal repositório de serviços ecossistêmicos relevantes globalmente. A floresta é também o berço de muitas espécies vegetais nativas da região Neotropical, e uma quantidade significativa delas desempenhou um importante papel na história da humanidade desde o início do Holoceno. Estudar a origem e a história natural desses grupos é, portanto, a base para construir uma compreensão holística sobre a Amazônia, e o grupo dos cacaus, com espécies tradicionalmente alocadas em dois gêneros Theobroma e Herrania mostra-se como um ótimo modelo de estudo. Neste projeto de doutorado, propus revisar o estado nomenclatural e taxonômico das espécies silvestres de cacaus, estudando a evolução morfológica e genômica populacional de táxons selecionados. Especificamente, os objetivos desta tese são (1) revisar morfologia e distribuição dos táxons de Theobroma e Herrania atualmente reconhecidos, reavaliando as delimitações taxonômicas a nível específico; (2) buscar sinapomorfias morfológicas e discutir a evolução de tais caracteres; (3) avaliar como a diversidade genômica de populações de cacau (T. cacao) se comporta em relação aos seus níveis de divergência de genes sob seleção; e (4) explorar a origem e história natural do cupuaçu (T. grandiflorum), uma espécie economicamente relevante no Brasil, conhecida por seus frutos enormes e apreciada por sua polpa. Esta tese está organizada em nove capítulos e quatro partes: tratamento taxonômico, filogenética e evolução, genômica populacional e mobilização de dados e estudos derivados, cada parte abordando um ou mais objetivos associados a este projeto. Primeiramente, meus resultados para a revisão taxonômica consistem em descrições completas e atualizadas para um total de 35 espécies de Theobroma/Herrania alocadas em seis seções, além de três espécies novas. Em segundo lugar, uma nova filogenia revelou a parafilia de Theobroma e subsidiou o restabelecimento de Theobroma incluindo Herrania como uma de suas seções. Em terceiro lugar, usando uma abordagem de sequenciamento de alto rendimento, pude rastrear os efeitos diferenciais de seleção natural/artificial em diferentes populações de cacau. Além disso, demonstrei pela primeira vez que o cupuaçu não uma espécie selvagem, mas sim uma forma domesticada criada a partir de seu parente próximo, o cupuí (T. subincanum), de modo que eu pude não apenas rastrear onde e quando o cupuaçu se originou, mas também mostrar a existência de um único evento de domesticação ocorrido no Médio-Alto Amazonas no Holoceno Médio, mediado por povos indígenas que manipulavam a floresta muito antes da colonização europeia. Finalmente, apresento um banco de dados de coleções de espécimes preservados de Theobroma, e descrevo um estudo que discute a área nativa de T. cacao, sob uma perspectiva de sensoriamento remoto. Os resultados desta tese não apenas impactam profundamente o entendimento sobre as espécies de cacaus nativas, a evolução da flora e dos povos da Amazônia, mas iluminam uma série de aspectos acerca da origem e história natural dos parentes silvestres de espécies cultivadas.Amazonia is the largest and most biodiverse rainforest of the world, source of a large amount of plant species, and the main repository of ecosystem services relevant globally. The forest is the cradle of many plants from Tropical Americas, and a significant amount of these have played a major role in human history since early Holocene. Studying the origin and history of such groups is, therefore, the basis to build an integrative understanding of Amazonia, and the cacao group, with species traditionally allocated to two generaTheobroma and Herrania is one such example. In this PhD project, I revisited the nomenclatural and taxonomic status of the wild cacao species, associated to an assessment of morphological, evolutionary and populational genomics of selected taxa. Specifically, I aimed at (1) revisit the morphology and distribution of current taxa, reevaluating taxonomic delimitations at species levels; (2) look for morphological synapomorphies and discuss how the evolution of such characters might have occurred; (3) evaluate how genetic variation of populations of cacao (T. cacao) behave regarding its divergence levels of genes under selection; and (4) depict the origin and geographic history of cupuaçu (T. grandiflorum), a tree crop economically relevant in Brazil, known for its humongous fruit and appreciated for its pulp. This dissertation is organized in nine chapters and four parts: taxonomic treatment, phylogenetics and evolution, populational genomics and data mobilization and by-product studies, each one tackling one or more goals associated to this project. First, results for the taxonomic revision consist of complete and updated descriptions of a total of 35 species of Theobroma/Herrania divided into six sections, including three new species here described. Second, a new phylogeny revealed the paraphyly of Theobroma, all of which subsidized a reestablishment of Theobroma including Herrania as a section of the first. Third, using a high-throughput sequencing approach, I could track differential effects of selection on different populations of cacao. Additionally, for the first time I demonstrated that cupuaçu is actually not a natural species, but a domesticated form selected from a wild close relative, cupuí (T. subincanum), so that I could not only track where and when this happened, but also pinpointed a single domestication event that happened in the Middle-Upper Amazon Basin in the mid-Holocene, mediated by indigenous people that had the forest as its source of livelihood long before European colonization. Finally, I compiled a biodiversity dataset of preserved specimen collections of Theobroma, and I present a by-product study that discussed the native area of T. cacao under a remote sensing approach. Results not only deeply impact our understanding on the evolution of wild cacao species, the flora and the people from Amazonia, but shed light on the study of the origin and history of wild crop relatives as a whole
Appropriate Similarity Measures for Author Cocitation Analysis
Get PDFWe provide a number of new insights into the methodological discussion about author cocitation analysis. We first argue that the use of the Pearson correlation for measuring the similarity between authors’ cocitation profiles is not very satisfactory. We then discuss what kind of similarity measures may be used as an alternative to the Pearson correlation. We consider three similarity measures in particular. One is the well-known cosine. The other two similarity measures have not been used before in the bibliometric literature. Finally, we show by means of an example that our findings have a high practical relevance.information science;Pearson correlation;cosine;similarity measure;author cocitation analysis
Dispelling the Myths Behind First-author Citation Counts
Get PDFWe conducted a full-scale evaluative citation analysis study of scholars in the XML research field to explore just how different from each other author rankings resulting from different citation counting methods actually are, and to demonstrate the capability of emerging data and tools on the Web in supporting more realistic citation counting methods. Our results contest some common arguments for the continued
use of first-author citation counts in the evaluation of scholars, such as high correlations between author rankings by first-author citation counts and other citation
counting methods, and high costs of using more realistic citation counting methods that are not well-supported by the ISI databases. It is argued that increasingly available digital full text research papers make it possible for citation analysis studies to go beyond what the ISI databases have directly supported and to employ more
sophisticated methods
koamabayili/VECTRON-author-checklist: VECTRON author checklist
No full textWe have done our best to complete the author checklist relating to the use of animals in the hut study. Note that the objective for the hut study was to evaluate the IRS treatment applications for residual efficacy against Anopheles mosquitoes, including the local An. coluzzii mosquito population. Cows were only used to attract mosquitoes into the huts and no tests were carried out directly on the cows. The author checklist is intended for use with studies where experiments are carried out on animals, which is why we have had such difficulty in completing this for the hut study, as many of the questions do not relate to how the cows were used
Author-wise bibliometric analysis based on entropy.
No full textAuthor-wise bibliometric analysis based on entropy.</p
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