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Wikis: Tool for Altering Tacit Knowledge Explicit
Get PDFThe paper presentsives an overview of the concept and dimensions of knowledge and its management in libraries using ICT based systems. Explores how Wikis can be used in libraries to commute the implicit knowledge explicit among the professionals and the users. Discusses in detail the scope of Wikis implementation in libraries. Explains the relative advantage and weakness of Wikis as a knowledge management tool in libraries
FIGURE 4 in Establishment of taxonomic status of Macrobrachium indicum Jayachandran & Joseph (Decapoda: Palaemonidae) through molecular characterization with a note on related species
No full textFIGURE 4. NJ tree constructed for various species of Macrobrachium based on COI gene.Published as part of Mary, Ajina S., Jayachandran, K.V., Landge, Asha T., Gladston, Y. & Pavan-Kumar, A., 2019, Establishment of taxonomic status of Macrobrachium indicum Jayachandran & Joseph (Decapoda: Palaemonidae) through molecular characterization with a note on related species, pp. 174-182 in Zootaxa 4652 (1) on page 180, DOI: 10.11646/zootaxa.4652.1.11, http://zenodo.org/record/399558
Loss of susceptibility as a novel breeding strategy for durable and broad-spectrum resistance
Get PDFRecent studies on plant immunity have suggested that a pathogen should suppress induced plant defense in order to infect a plant species, which otherwise would have been a nonhost to the pathogen. For this purpose, pathogens exploit effector molecules to interfere with different layers of plant defense responses. In this review, we summarize the latest findings on plant factors that are activated by pathogen effectors to suppress plant immunity. By looking from a different point of view into host and nonhost resistance, we propose a novel breeding strategy: disabling plant disease susceptibility genes (S-genes) to achieve durable and broad-spectrum resistanc
Role of SOCS proteins in FLT3-ITD and BCR/ABL mediated leukemogenesis
No full textAcute myeloid/lymphoid leukemia is a fatal hematological malignancy characterized by accumulation of nonfunctional, immature blasts, which interferes with the production of normal blood cells. Activating mutations of receptor tyrosine kinases are common genetic lesions in leukemia. FLT3-ITD is a frequent activating mutation found in AML patients, leading to uncontrolled proliferation of leukemic blasts. FLT3-ITD directly activates STAT5, leading to the induction of STAT5 target gene expression like PIM kinases and SOCS genes. STAT5 and PIM kinases have been shown to play a crucial role in the FLT3-ITD mediated transformation. On the other hand, the role of SOCS proteins in FLT3-ITD mediated transformation has not been studied to date. SOCS proteins are part of a negative feedback mechanism that controls Jak kinases downstream of cytokine receptors. One of the SOCS family members, SOCS1 has been reported to suppress oncogenecity of several activating kinases implicated in hematologic malignancies. In this thesis the role of these SOCS proteins in FLT3-ITD mediated transformation (in vitro) and leukemogenesis (in vivo) is systematically explored. Expression of FLT3-ITD in cell lines of myeloid (32D) and lymphoid (Ba/F3) origin, led to CIS, SOCS1 and SOCS2 expression. FLT3-ITD expression in primary murine bone marrow stem/progenitor cells led to a 59 fold induction of SOCS1 expression. Furthermore, FLT3-ITD positive AML cell lines (MV4-11, MOLM-13) show kinase dependent CIS, SOCS1, and SOCS3 expression. Importantly SOCS1 is highly expressed in AML patients with FLT3-ITD compared to healthy individuals. SOCS1 protein was expressed in FLT3-ITD transduced murine bone marrow stem cells and SOCS1 expression was abolished with kinase inhibition in MOLM-13 cell line. In conclusion, SOCS1 was highly regulated by FLT3-ITD in myeloid, lymphoid cell lines, in bone marrow stem/progenitors and in AML patient samples. SOCS1 co-expression did not affect FLT3-ITD mediated signaling and proliferation, but abolished IL-3 mediated proliferation and protected 32D cells from interferon-α and interferon-γ mediated growth inhibition. FLT3-ITD expressing 32D cells showed diminished STAT1 activation in response to interferons (α and γ). Alone, SOCS1 strongly inhibited cytokine induced colony formation of bone marrow stem and progenitors, but not FLT3-ITD induced colony formation. Most importantly, in the presence of growth inhibitory interferon-γ, SOCS1 co-expression with FLT3-ITD led to increased colony formation compared to FLT3-ITD alone. Taken together, FLT3-ITD induced and exogenously expressed SOCS1, shielded cells from external cytokines, signals, while not affecting FLT3-ITD induced proliferation/signaling. In further experiments the in vivo effects of SOCS1 were studied in a bone marrow transplantation model. SOCS1 bone marrow transplants were unable to engraft/proliferate in mice. FLT3-ITD was shown to induce a myeloproliferative disease. Both control (empty vector), SOCS1 transplanted mice were normal and did not show any disease phenotype. FLT3-ITD alone and SOCS1 co-expressing FLT3-ITD developed either myeloproliferative disease or acute lymphoblastic leukemia with equal distribution. SOCS1 co-expression with FLT3-ITD led to a decreased latency. Mice transplanted with FLT3-ITD alone and SOCS1 co-expressing FLT3-ITD displayed enlarged spleens, liver and hypercellular bone marrow indicating infiltration of leukemic cells. Mice were also anemic and showed decreased platelet counts. Importantly SOCS1 co-expression particularly shortened the latency of myeloproliferative disease but not of acute lymphoblastic leukemia. In summary, in the context of FLT3-ITD, SOCS1 acts as a ‘conditional oncogene’ and cooperates with FLT3-ITD in the development of myeloproliferative disease. With these data we propose the following model: FLT3-ITD induces SOCS gene expression, which shields cells against proliferation and differentiation signals from cytokines, while not affecting FLT3-ITD mediated proliferative signals. This leaves cells under the dictate of FLT3-ITD thereby contributing to leukemogenesis. Similar to FLT3-ITD, BCR/ABL (P190) (an oncogenic fusion kinase often found in acute lymphoblastic leukemia) induces SOCS gene expression in K562 and long-term cultured cells from patients with acute lymphoblastic leukemia. SOCS1 co-expression does not affect BCR/ABL mediated proliferation while abrogating IL-3 mediated proliferation. These findings suggest that SOCS proteins may play a general co-operative role in the context of oncogenes which aberrantly activate STAT3/5 independently of JAK kinases. This study reveals a novel molecular mechanism of FLT3-ITD mediated leukemogenesis and suggests SOCS genes as potential therapeutic targets.Akute Leukämien sind unbehandelt tödlich verlaufende, hämatologische Erkrankungen, bei denen es zu einer Anreicherung unreifer und funktionsloser Blasten im Knochenmark kommt, was wiederum mit der gesunden Hämatopoese interferiert. Ursache dieser Leukämien sind chomosomale Translokationen oder Funtionsgewinn- bzw. Funktionsverlustmutationen. Die Mehrheit dieser Mutationen tritt in Genen auf, die Proliferation und/oder Differenzierung regulieren. Im Rahmen dieser Dissertation wurde die Rolle einer dieser Mutationen der Rezeptortyrosinkinase FLT3 in der Leukämogenese bearbeitet, genannt FLT3-ITD (interne Tandemduplikation). FLT3 wird in frühen hämatopoetischen Stamm- und Progenitorzellen exprimiert und spielt eine wichtige Rolle für das Überleben und die Proliferation lymphatischer und myeloischer Linien. Die Bindung des FLT3 Liganden an den Wildtyp-FLT3 Rezeptor führt zur dessen Dimerisierung und Aktivierung, wobei diese Aktivierung wiederum unterschiedliche Signalwege wie z.B. PI3K/Akt und Erk aktiviert. FLT3-ITD ist eine aktivierende Mutation der FLT3 Rezeptortyrosinkinase, die bei etwa 25 % der AML-Patienten gefunden wird und zur unkontrollierten Proliferation leukämischer Blasten führt. Diese Mutation führt zu einer Ligand-unabhängigen, konstitutiv aktiven Form des Rezeptors, so dass die nachfolgenden Signalwege (PI3K/Akt, Erk und STAT5) permanent angeschaltet sind. Ein Genexpressionsprofil in FLT3-ITD exprimierenden 32D Zellen im Vergleich zu Ligand aktivierten Wildtyp-FLT3 exprimierenden Zellen zeigt eine erhöhte Expression von STAT5 Zielgenen wie PIM Kinasen und SOCS Proteinen. Interessanterweise aktiviert FLT3-ITD STAT5 dabei unabhängig von Jak und Src Kinasen und verleiht IL-3 abhängigen Zelllinien wie 32D und Ba/F3 ein Faktor unabhängiges Wachstum. Weiterhin verursacht eine FLT3-ITD Expression im Gegensatz zum Wildtyp-FLT3 in Maustransplantationsexperimenten eine myeloproliferative Erkrankung. Vergleichbar mit FLT3-ITD ist BCR/ABL auch ein onkogenes Fusionsprotein, das durch eine Translokation zwischen den Chromosomen 9 und 22, bezeichnet als t(9;22), zustande kommt. Das BCR/ABL Protein wird in ca. 90 % aller chronischen myeloischen Leukämien (CML) und in 10-20 % aller akuten lymphatischen Leukämien (ALL) gefunden. Wie FLT3-ITD verleiht auch BCR/ABL 32D und Ba/F3 Zellen ein IL-3 unabhängiges Wachstum. Außerdem führt es zu einer konstitutiven Aktivierung der PI3K/AKT, Ras/MAPK und STAT5 Signalwege. Die BCR/ABL vermittelte Aktivierung von STAT5 erfolgt hierbei entweder durch direkte Phosphorylierung oder über die Src Kinase HCK. Im Knochenmarktransplantationsmodell induziert BCR/ABL eine myeloproliferative Erkrankung, die einer CML ähnelt. Die Produktion hämatopoetischer Zellen unterliegt einer strengen Kontrolle durch hämatopoetische Zytokine. Die Zytokinrezeptoren besitzen keine intrinsische Kinaseaktivität. Die Signalweiterleitung erfolgt hier über Jak Kinasen. Auf diese Weise kontrollieren Zytokinrezeptoren wichtige Prozesse des Immunsystems und der Blutzellhomöostase. SOCS Proteine sind Teil eines negativen Rückkopplungsmechanismus, der die Aktivierung von STAT Proteinen durch Zytokinrezeptoren kontrolliert. SOCS Proteine binden an Jak Kinasen und inhibieren deren Kinaseaktivität über verschiedene Mechanismen, was zur Termination der Zytokinsignale führt. Von einem Mitglied der SOCS Familie, SOCS1, ist bekannt, dass es durch die Hemmung einiger aktivierender Kinasen bei hämatologischen Erkrankungen tumorsupressive Eigenschaften hat. Die Rolle der SOCS Proteine in der FLT3-ITD vermittelten Transformation ist bis heute nicht hinreichend analysiert. Insbesondere ist unklar wie transformierte Zellen der strengen Kontrolle des Zytokinnetzwerks entgehen können, das normalerweise die korrekte Funktion hämatopoetischer Zellen garantiert. In der vorliegenden Arbeit wurde die Rolle von SOCS Proteinen in der FLT3-ITD vermittelten Transformation (in vitro) und Leukämieentstehung (in vivo) systematisch untersucht. Weiterhin wurde die SOCS Genexpression und die Folgen der BCR/ABL vermittelten Transformation analysiert. Schlussfolgerung 1: FLT3-ITD induziert die Expression von SOCS Genen in Zelllinien und murinen Knochenmarkzellen; SOCS1 ist in Patienten mit FLT3-ITD induziert. Zunächst wurden bestehende microarray Daten durch quantitative real time PCR validiert. Die Expression von FLT3-ITD in myeloischen (32D) und lymphatischen (Ba/F3) Zelllinien induziert die Expression von CIS, SOCS1 und SOCS2. In primärem murinen Knochenmarksstamm-/progenitorzellen führt die Expression von FLT3-ITD zu einem sehr starken Anstieg der SOCS1 Expression (59-fach). Zudem zeigen Zelllinien, die von FLT3-ITD positiven AML-Patienten gewonnen wurden (MV4-11, MOLM-13), eine Kinase abhängige CIS, SOCS1 und SOCS3 Expression. Interessanterweise wird außerdem SOCS1 im Knochenmark von AML-Patienten mit FLT3-ITD Mutationen im Vergleich zu Kontrollen von gesunden Spender stark überexprimiert. Das SOCS1 Protein wird ferner in FLT3-ITD transduziertem murinen Knochenmark exprimiert und die Expression geht in MOLM-13 Zellen nach Behandlung mit Kinaseinhibitoren verloren. Zusammenfassend wird die Expression von SOCS1 in hohem Maße durch FLT3-ITD in myeloischen und lymphatischen Zelllinien sowie in hämatopoetischen Stamm- und Progenitorzellen und AML-Patienten hochreguliert. Schlussfolgerung 2: Die SOCS1 Expression verhindert Zytokinrezeptor vermittelte Effekte aber nicht die FLT3-ITD induzierte Signalgebung und Proliferation. Aufgrund der hohen SOCS1 Induktion durch FLT3-ITD im primären murinen Knochenmark und in Patientenproben wurde dessen Rolle in der FLT3-ITD vermittelten Transformation untersucht. Die Koexpression von SOCS1 beeinträchtigt nicht die durch FLT3-ITD induzierten Signalwege (MAPK/ERK, PI3K/AKT und STAT5) oder die Proliferation, jedoch unterbindet es die IL-3 vermittelte Proliferation und schützt 32D Zellen vor der Wachstumshemmung durch Interferon α und γ. So zeigten FLT3-ITD exprimierende 32D Zellen eine verminderte STAT1-Aktivierung durch Interferon α und γ. In einem kompetitiven Proliferationsassay wirkte die SOCS1 Expression alleine wachtumsinhibierend, koexprimiert mit FLT3-ITD trat allerdings der gegenteilige Effekt auf. Im murinen Knochenmark führte SOCS1 zu einer starken Hemmung der Zytokin induzierten Kolonienbildung hämatopoetischer Stamm- und Progenitorzellen, jedoch nicht der FLT3-ITD induzierten Kolonienbildung, was auf eine SOCS1 Resistenz von FLT3-ITD hindeutet. Interessanterweise führte SOCS1 in Anwesenheit des wachstumhemmenden Interferons γ zu einer Verstärkung der FLT3-ITD induzierten Kolonienbildung. Zusammenfassend führt die FLT3-ITD induzierte oder exogene SOCS1 Expression zu einer Abschirmung der Zellen von exogenen Zytokinsignalen, während die FLT3-ITD vermittelten, zellulären Effekte unbeeinflusst bleiben. Schlussfolgerung 3: SOCS1 Expression verstärkt die myeloproliferative Erkrankung, die durch FLT3-ITD induziert wird: SOCS1 als „konditionales Onkogen“. Für FLT3-ITD wurde bereits die Entstehung einer myeloproliferativen Erkrankung und einer akuten lymphozytischen B- und T-Zellleukämie im murinen Knochenmark gezeigt. Im transgenen Mausmodell löst FLT3-ITD entweder eine myeloproliferative oder eine lymphatische Erkrankung aus. In dieser Arbeit wurde die Rolle von SOCS1 in der FLT3-ITD vermittelten Leukämie im Knochmarktransplantationsmodell in vivo untersucht. Die Übertragung der in vitro gefundenen Effekte von SOCS1 auf FLT3-ITD in das Mausmodell in vivo zeigte, dass es bei der Transplantation von SOCS1 exprimierendem Knochenmark nicht zu einem Anwachsen oder zur Proliferation in der Maus kommt, was einen kompetitiven Wachstumsnachteil dieser Zellen demonstriert. SOCS1 und FLT3-ITD koexprimierende Transplantate zeigten jedoch eine höhere Proliferationsrate in vivo als ausschließlich Flt3-ITD exprimierende Zellen. Sowohl Kontroll- als auch SOCS1 transplantierte Mäuse waren unauffällig und ohne erkennbaren Phänotyp. Mäuse mit Flt3-ITD transduzierten oder FLT3-ITD und SOCS1 koexprimierenden Transplantaten entwickelten zu gleichen Teilen entweder eine myeloproliferative Erkrankung oder eine akute lymphatische Leukämie. Die Koexpression von SOCS1 mit FLT3-ITD führte zu einer verkürzten Latenzzeit. Mäuse mit FLT3-ITD transduzierten Transplantaten (mit oder ohne SOCS1) zeigten vergrößerte Milzen und Lebern sowie ein hyperzelluläres Knochenmark als Anhaltspunkt für eine Infiltration mit leukämischen Blasten. Ferner waren die Mäuse anämisch und hatte eine verminderte Thrombozytenzahl. Interessanterweise verkürzte die Koexpression von SOCS1 die Latenzzeit für die myeloproliferative Erkrankung, aber nicht für die akute lymphatische Leukämie. Zusammenfassend wirkt SOCS1 im Zusammenhang mit FLT3-ITD als konditionales Onkogen und kooperiert mit FLT3-ITD bei der Entstehung der myeloproliferativen Erkrankung. Schlußfolgerung 4: SOCS Gene werden durch BCR/ABL induziert. SOCS1 Expression beeinflusst nicht die BCR/ABL vermittelte Transformation. Eine Aktivierung von STAT5 wurde im Zusammenhang mit mehreren hämatologischen, malignen Erkrankungen, die durch onkogene Kinasen ausgelöst wurden, beobachtet. Da BCR/ABL STAT5 stark aktiviert, wurde die SOCS Genexpression in BCR/ABL positiven Zelllinien und im Knochenmark mittels quantitativer PCR analysiert. Im Vergleich zu BCR/ABL negativen ALL Zellen wurde in BCR/ABL positiven, primären ALL Zellen eine Induktion von CIS, SOCS2 und SOCS3 beobachtet. Die Inhibition der ABL Kinaseaktivität in BCR/ABL positiven, primären ALL Zellen durch Zugabe von Imatinib führte zu einer Verminderung der SOCS Expression, was eine Kinase abhängige Expression dieser Proteine demonstriert. Ebenso konnte auch in der BCR/ABL positiven Zelllinie K562 durch die Inhibition der ABL Kinaseaktivität mittels Imatinib eine Reduktion von CIS, SOCS1 und SOCS3 demonstriert werden. Die Expression von BCR/ABL im primären murinen Knochenmark induzierte eine hohe Expression von CIS, SOCS1 und SOCS3. Die Koexpression von SOCS1 beeinflusste nicht die BCR/ABL vermittelte Proliferation, während aber die IL-3 vermittelte Proliferation unterdrückt wurde, was auf eine SOCS1 Resistenz von BCR/ABL deutet. Mit diesen Ergebnissen schlagen wir ein Modell vor, bei dem FLT3-ITD die Expression von SOCS Genen induziert, welche wiederum die Zelle von pro- oder antiproliferativen sowie Differenzierungssignalen exogener Zytokine abschirmen, ohne die FLT3-ITD vermittelten Signale zu beeinflussen. So verbleibt die Zelle einzig unter der Kontrolle von FLT3-ITD, was zur Leukämieentstehung beiträgt. Dieses Model erklärt das ‚SOCS Paradoxon’, in dem die scheinbar gegensätzlichen Ergebnisse der erhöhten Expression der Tumorsupressorproteine der SOCS Familie im Kontext mit onkogenen Kinasen wie FLT3-ITD stehen. Die vorliegende Untersuchung zeigt einen neuen molekularen Mechanismus der FLT3-ITD vermittelten Leukämieentstehung. Mechanistisch setzen SOCS Proteine die externe Kontrolle durch Zytokine außer Kraft und wirken so positiv in der Leukämogenese. Dies deutet auf eine Rolle von SOCS Proteinen als mögliche therapeutische Zielstrukturen hin. Diese Beobachtungen legen nahe, dass SOCS Proteine generell mit Onkogenen kooperieren, die eine aberrante Aktivierung von STAT3/5 unabhängig von JAK Kinasen, induzieren
Characterization of the first hexacoordinate phosphorus compound with S→P←S bonds
Get PDFThe first example of a hexacoordinate phosphorus compound [S{6-t-Bu-4-Me-C6H2O}2]2P+(Cl-· C3H4N2) with two S→P bonds is reported. This compound can be construed as an oxophosphonium salt with double intramolecular coordination by sulfur atoms. X-ray structure reveals a facial arrangement of the ligands with two coordinating sulfur atoms cis to each other. The S→P distance of 2.334 (1) Å is one among very short coordinate bond distances between sulfur and phosphorus
The RhoA transcriptional program in pre-T cells
Get PDFThe GTPase RhoA is essential for the development of pre-T cells in the thymus. To investigate the mechanisms used by RhoA to control thymocyte development we have used Affymetrix gene profiling to identify RhoA regulated genes in T cell progenitors. The data show that RhoA plays a specific and essential role in pre-T cells because it is required for the expression of transcription factors of the Egr-1 and AP-1 families that have critical functions in thymocyte development. Loss of RhoA function in T cell progenitors causes a developmental block that pheno-copies the consequence of losing pre-TCR expression in Recombinase gene 2 (Rag2) null mice. Transcriptional profiling reveals both common and unique gene targets for RhoA and the pre-TCR indicating that RhoA participates in the pre-TCR induced transcriptional program but also mediates pre-TCR independent gene transcription
Time-based control techniques for integrated DC-DC conversion
Get PDFTime-based control techniques for the design of high switching frequency buck converters are presented. Using time as the processing variable, the proposed controller operates with CMOS-level digital-like signals but without adding any quantization error. A ring oscillator is used as an integrator in place of conventional opamp-RC or Gm-C integrators while a delay line is used to perform voltage-to-time conversion and to sum time signals. A simple flip-flop generates a pulse-width modulated signal from the time-based output of the controller. Hence time-based control eliminates the need for a wide bandwidth error amplifier, pulse width modulator (PWM) in analog controllers or high-resolution analog-to-digital converter (ADC) and digital PWM in digital controllers. As a result, it can be implemented in a small area and with minimal power.
First, a time-based single-phase buck converter is proposed and fabricated in a 180nm CMOS process, the prototype buck converter occupies an active area of 0.24mm^2, of which the controller occupies only 0.0375mm^2. It operates over a wide range of switching frequencies (10-25 MHz) and regulates output to any desired voltage in the range of 0.6V to 1.5V with 1.8V input voltage. With a 500mA step in the load current, the settling time is less than 3.5us and the measured reference tracking bandwidth is about 1MHz. Better than 94% peak efficiency is achieved while consuming a quiescent current of only 2uA/MHz.
Second, the techniques are extended to a high switching frequency multi-phase buck converter. Efficiency degradation due to mismatch between the phases is mitigated by generating precisely matched duty-cycles by combining a time-based multi-phase generator (MPG) with a time-based PID compensator (T-PID). The proposed approach obviates the need for a complex current sensing and calibration circuitry needed to implement active current sharing in an analog controller. It also eliminates the need for a high-resolution analog-to-digital converter and digital pulse width modulator needed for implementing passive current sharing in a digital controller. Fabricated in a 65nm CMOS process, the prototype multi-phase buck converter occupies an active area of 0.32mm^2, of which the controller occupies only 0.04mm^2. The converter operates over a wide range of switching frequencies (30-70 MHz) and regulates output to any desired voltage in the range of 0.6V to 1.5V from 1.8V input voltage. With a 400mA step in the load current, the settling time is less than 0.6us and the measured duty-cycle mismatch is less than 0.48%. Better than 87% peak efficiency is achieved while consuming a quiescent current of only 3uA/MHz.
Finally, light load operation is discussed. The light load efficiency of a time-based buck converter is improved by adding proposed PFM control. At the same time, the proposed seamless transition techniques provide a freedom to change the control mode between PFM and PWM without deteriorating output voltage which allows for a system to manage its power efficiently. Fabricated in a 65nm CMOS, the prototype achieves 90% peak efficiency and > 80% efficiency over an ILOAD range of 2mA to 800mA. VO changes by less than 40mV during PWM to PFM transitions.Submission published under a 24 month embargo labeled 'Closed Access', the embargo will last until 2018-12-01The student, Seong Joong Kim, accepted the attached license on 2016-11-08 at 17:34.The student, Seong Joong Kim, submitted this Dissertation for approval on 2016-11-08 at 17:35.This Dissertation was approved for publication on 2016-11-09 at 15:08.DSpace SAF Submission Ingestion Package generated from Vireo submission #10226 on 2017-02-28 at 14:41:24Made available in DSpace on 2017-03-01T17:01:13Z (GMT). No. of bitstreams: 3
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Twenty years′ follow-up of a de-epithelialised turnover flap
No full textThe authors have used the de-epithelialised turnover flap (Thatte′s Flap) for covering compound defects over the tendo-achilles in 31 patients in the period covering 1980-2000. Two of these patients have come up for follow-up after 20 years. In this late follow-up, the results are good and the tendon which was bridged by the dermis of the flap is functioning to allow the patients to stand on their toes. The de-epithelialised turnover flap is a simple and easy technique giving good long-term results. In spite of all the new advances in flap coverage, the de-epithelialised turnover flap is a good alternative for the tendo-achilles area in the armamentarium of a plastic surgeon
Image analysis techniques for characterizing disc space narrowing in cervical vertebra interfaces
No full textImage analysis techniques are introduced for evaluating disc space narrowing of cervical vertebrae interfaces from x-ray images. Four scale-invariant, distance transform- based features are presented for characterizing the spacing between adjacent vertebrae. K-means and self-organizing map clustering techniques are applied to estimate the degree of disc space narrowing using a four grade (0-3) scoring system, where 0 and 3 represent normal spacing and significant narrowing, respectively. For a data set of 294 vertebrae interfaces, experimental results yield average correct grade assignment of greater than 82.10% for each of the four grades using a one-grade window around the correct grade --Abstract, page iii
SoVeAt: a tool for visualizing sound velocity data for Naval applications
Get PDFThis report discusses various functionalities of Sound Velocity Atlas (SoVeAT) tool developed for use by
Naval Operations Data Processing and Analysis Centre (NODPAC) a wing of Indian Navy. The subsurface
profile data of temperature and salinity (T/S) used in developing this tool is the Argo data which is
obtained from INCOIS Argo mirror archives which is obtained from two Global Data Assembly Centre’s
(GDAC) namely Coriolis in France and USGODAE in USA. These data sets are processed, quality
controlled and merged to form a unique data set for enhancing the Sound Velocity climatology of Indian
Ocean (30E - 120 E and 69 S - 30 N). With this sound velocity data derived from Argo T/S, Graphic User
Interface (GUI) based tool is built for visualizing parameters viz., Sound Velocity, Temperature, Salinity
and bathymetry. This tool has capability to generate climatology dynamically between any chosen
periods apart from visualizing various plots which are useful for Navy while at sea. Also provision for
adding newly observed T/S data is provided making this most robust sound velocity tool for use by the
Indian Navy
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