1,720,964 research outputs found
Gene-environment interactions in Inflammatory Bowel Disease:Emphasis on smoking and autophagy
Get PDFInflammatoire darmziekten (IBD), bestaande uit de ziekte van Crohn (ZvC) en colitis ulcerosa (CU) worden gekenmerkt door chronische ontsteking van het darmslijmvlies. Er ligt een genetische gevoeligheid ter grondslag aan het ontstaan van IBD, maar het zijn juist omgevingsfactoren die deze gevoeligheid voor en het beloop van de ziekte kunnen beïnvloeden. Een belangrijke omgevingsfactor die aantoonbaar van invloed is op IBD is roken. Roken verergert de mate van ontstekingen bij de ZvC, maar opvallend genoeg blijken patiënten met CU juist een gunstig effect te hebben op de ontstekingen bij deze ziekte. Als we darmepitheel cellen en T-lymfocyten bloot te stellen aan sigarettenrook, zien we dat het inflammatie-geïnduceerde apoptose remt wat de ZvC verergerd, maar in CU juist gunstig is. Heat shock eiwitten lijken hierin een belangrijke rol te spelen en dan met name HSPA6. We laten zien dat sigarettenrook het HSPA6 expressie verhoogt (op zowel RNA als eiwit niveau) en het anti-apoptotisch eiwit, Bcl-Xl stabiliseert. Deze bevindingen samen met de significante associatie in het HSPA6 gen met CU suggereren dat HSPA6 bijdraagt aan het anti-apoptotisch effect van sigarettenrook in CU. Welke componenten in sigarettenrook precies verantwoordelijk zijn voor dit effect, en hoe deze aangrijpen, is nog onduidelijk. De T300A variant van het ATG16L1 gen is één van de bekendste en sterkste ZvC-geassocieerde risicovarianten en een mogelijke interactie met sigarettenrook is nog niet eerder aangetoond. ATG16L1 is essentieel is voor (niet-selectieve) autofagie, een proces dat een rol speelt in de overleving van de cel, maar het is ook belangrijk voor de afbraak van bacteriën. We laten zien dat de opname van E. coli en pathogene E. coli (AIEC) in monocyten met de T300A mutatie, significant is verhoogt. Sigarettenrook onderdrukt deze verhoogde opname van E. coli, maar niet van AIEC. Verder laten we zien dat monocyten met de T300A mutatie die zijn gestimuleerd met inflammatoire triggers of sigarettenrook minder goed in staat zijn AIEC af te breken, resulterend in een verstoorde balans van de darmflora en verergering van de ZvC.Crohn’s disease (CD) and ulcerative colitis (UC) are autoimmune chronic inflammatory disorders of the intestine that are collectively known as inflammatory bowel diseases (IBDs). It finds its origin in an exaggerated inflammatory response to gut luminal contents, caused by an inaccurate response to environmental factors due to the specific genetic makeup of the individual. A typical environmental factor from the Western life style is cigarette smoking, which is beneficial for UC, but detrimental for CD. In this thesis, we aimed to identify smoke-induced mechanisms that could explain the dichotomy in UC and CD. We found that cigarette smoking protects intestinal epithelial cells and T-cells against inflammation-induced apoptosis. This generalized effect of cigarette smoke may lead to mucosal healing in UC, but at the same time further impair proper T-cell termination in CD. To extend our search for genes/proteins responsible for the smoke-induced anti-apoptotic signaling, we found that smoke dose-dependently enhanced the expression of heat shock protein HSPA6 and that HSPA6 physically interacts with and stabilizes the anti-apoptotic protein, Bcl-XL. Further, we found that HSPA6 resides in an UC susceptibility locus. These results reveal a potential mechanism in the smoke-dependent effect on UC. It remains to be determined which smoke-contained component(s) are responsible for the induction of HSPA6 and contribute to the anti-apoptotic effect of cigarette smoking and potential protection against colitis.The T300A variant in ATG16L1 is one of the most well known CD-associated variants and a potential interaction with cigarette smoking was not yet identified. ATG16L1 is essential for non-selective autophagy, a process important for cell survival, but it also plays a crucial role in confering resistance to infection by elimination intracellular pathogens, thereby defining mucosal tolerance. Here, we show that uptake of E. coli and of the pathogenic variant (AIEC) was increased in monocytes carrying the T300A variant and cigarette smoke only impaired the uptake of AIEC. Further, monocytes carrying the T300A variant showed impaired killing of AIEC, especially in combination with inflammatory triggers or cigarette smoke, resulting in modulation of intestinal flora, thereby further aggravating CD pathology
Gene-environment interactions in Inflammatory Bowel Disease: Emphasis on smoking and autophagy
Get PDFInflammatoire darmziekten (IBD), bestaande uit de ziekte van Crohn (ZvC) en colitis ulcerosa (CU) worden gekenmerkt door chronische ontsteking van het darmslijmvlies. Er ligt een genetische gevoeligheid ter grondslag aan het ontstaan van IBD, maar het zijn juist omgevingsfactoren die deze gevoeligheid voor en het beloop van de ziekte kunnen beïnvloeden. Een belangrijke omgevingsfactor die aantoonbaar van invloed is op IBD is roken. Roken verergert de mate van ontstekingen bij de ZvC, maar opvallend genoeg blijken patiënten met CU juist een gunstig effect te hebben op de ontstekingen bij deze ziekte. Als we darmepitheel cellen en T-lymfocyten bloot te stellen aan sigarettenrook, zien we dat het inflammatie-geïnduceerde apoptose remt wat de ZvC verergerd, maar in CU juist gunstig is. Heat shock eiwitten lijken hierin een belangrijke rol te spelen en dan met name HSPA6. We laten zien dat sigarettenrook het HSPA6 expressie verhoogt (op zowel RNA als eiwit niveau) en het anti-apoptotisch eiwit, Bcl-Xl stabiliseert. Deze bevindingen samen met de significante associatie in het HSPA6 gen met CU suggereren dat HSPA6 bijdraagt aan het anti-apoptotisch effect van sigarettenrook in CU. Welke componenten in sigarettenrook precies verantwoordelijk zijn voor dit effect, en hoe deze aangrijpen, is nog onduidelijk. De T300A variant van het ATG16L1 gen is één van de bekendste en sterkste ZvC-geassocieerde risicovarianten en een mogelijke interactie met sigarettenrook is nog niet eerder aangetoond. ATG16L1 is essentieel is voor (niet-selectieve) autofagie, een proces dat een rol speelt in de overleving van de cel, maar het is ook belangrijk voor de afbraak van bacteriën. We laten zien dat de opname van E. coli en pathogene E. coli (AIEC) in monocyten met de T300A mutatie, significant is verhoogt. Sigarettenrook onderdrukt deze verhoogde opname van E. coli, maar niet van AIEC. Verder laten we zien dat monocyten met de T300A mutatie die zijn gestimuleerd met inflammatoire triggers of sigarettenrook minder goed in staat zijn AIEC af te breken, resulterend in een verstoorde balans van de darmflora en verergering van de ZvC
Going Beyond Counting First Authors in Author Co-citation Analysis
Get PDFThe present study examines one of the fundamental aspects of author co-citation analysis (ACA) - the way co-citation
counts are defined. Co-citation counting provides the data on which all subsequent statistical analyses and mappings
are based, and we compare ACA results based on two different types of co-citation counting - the traditional type that
only counts the first one among a cited work's authors on the one hand and a non-traditional type that takes into
account the first 5 authors of a cited work on the other hand. Results indicate that the picture produced through this non-traditional author co-citation counting contains more coherent author groups and is therefore considerably clearer. However, this picture represents fewer specialties in the research field being studied than that produced through the traditional first-author co-citation counting when the same number of top-ranked authors is selected and analyzed. Reasons for these effects are discussed
Variations on the Author
Get PDF“Variations on the Author” discusses two of Eduardo Coutinho’s recent films (Um Dia na Vida, from 2010, and Últimas Conversas, posthumously released in 2015) and their contribution to the general question of documentary authorship. The director’s filmography is characterized by a consistent yet self-effacing form of authorial self-inscription: Coutinho often features as an interviewer that rather than express opinions propels discourses; an interviewer that is good at listening. This mode of self-inscription characterizes him as an author who is not expressive but who is nonetheless markedly present on the screen. In Um Dia na Vida, however, Coutinho is completely absent form the image, while Últimas Conversas, on the contrary, includes a confessional prologue that moves the director from the margins to the center of his films. This article examines the ways in which these works stand out in the filmography of a director who offers new insights into the notion of cinematic authorship
Appropriate Similarity Measures for Author Cocitation Analysis
Get PDFWe provide a number of new insights into the methodological discussion about author cocitation analysis. We first argue that the use of the Pearson correlation for measuring the similarity between authors’ cocitation profiles is not very satisfactory. We then discuss what kind of similarity measures may be used as an alternative to the Pearson correlation. We consider three similarity measures in particular. One is the well-known cosine. The other two similarity measures have not been used before in the bibliometric literature. Finally, we show by means of an example that our findings have a high practical relevance.information science;Pearson correlation;cosine;similarity measure;author cocitation analysis
Dispelling the Myths Behind First-author Citation Counts
Get PDFWe conducted a full-scale evaluative citation analysis study of scholars in the XML research field to explore just how different from each other author rankings resulting from different citation counting methods actually are, and to demonstrate the capability of emerging data and tools on the Web in supporting more realistic citation counting methods. Our results contest some common arguments for the continued
use of first-author citation counts in the evaluation of scholars, such as high correlations between author rankings by first-author citation counts and other citation
counting methods, and high costs of using more realistic citation counting methods that are not well-supported by the ISI databases. It is argued that increasingly available digital full text research papers make it possible for citation analysis studies to go beyond what the ISI databases have directly supported and to employ more
sophisticated methods
koamabayili/VECTRON-author-checklist: VECTRON author checklist
No full textWe have done our best to complete the author checklist relating to the use of animals in the hut study. Note that the objective for the hut study was to evaluate the IRS treatment applications for residual efficacy against Anopheles mosquitoes, including the local An. coluzzii mosquito population. Cows were only used to attract mosquitoes into the huts and no tests were carried out directly on the cows. The author checklist is intended for use with studies where experiments are carried out on animals, which is why we have had such difficulty in completing this for the hut study, as many of the questions do not relate to how the cows were used
Author-wise bibliometric analysis based on entropy.
No full textAuthor-wise bibliometric analysis based on entropy.</p
- …
