1,721,041 research outputs found
Going Beyond Counting First Authors in Author Co-citation Analysis
Full text linkThe present study examines one of the fundamental aspects of author co-citation analysis (ACA) - the way co-citation
counts are defined. Co-citation counting provides the data on which all subsequent statistical analyses and mappings
are based, and we compare ACA results based on two different types of co-citation counting - the traditional type that
only counts the first one among a cited work's authors on the one hand and a non-traditional type that takes into
account the first 5 authors of a cited work on the other hand. Results indicate that the picture produced through this non-traditional author co-citation counting contains more coherent author groups and is therefore considerably clearer. However, this picture represents fewer specialties in the research field being studied than that produced through the traditional first-author co-citation counting when the same number of top-ranked authors is selected and analyzed. Reasons for these effects are discussed
Analysis of synaptic-like microvesicle exocytosis of B-cells using a live imaging technique.
No full textPancreatic β-cells play central roles in blood glucose homeostasis. Beside insulin, these cells release neurotransmitters and other signaling molecules stored in synaptic-like microvesicles (SLMVs). We monitored SLMV exocytosis by transfecting a synaptophysin-pHluorin construct and by visualizing the cells by Total Internal Reflection Fluorescence (TIRF) microscopy. SLMV fusion was elicited by 20 mM glucose and by depolarizing K(+) concentrations with kinetics comparable to insulin secretion. SLMV exocytosis was prevented by Tetanus and Botulinum-C neurotoxins indicating that the fusion machinery of these organelles includes VAMP-2/-3 and Syntaxin-1, respectively. Sequential visualization of SLMVs by TIRF and epifluorescence microscopy showed that after fusion the vesicle components are rapidly internalized and the organelles re-acidified. Analysis of single fusion episodes revealed the existence of two categories of events. While under basal conditions transient fusion events prevailed, long-lasting episodes were more frequent upon secretagogue exposure. Our observations unveiled similarities between the mechanism of exocytosis of insulin granules and SLMVs. Thus, diabetic conditions characterized by defective insulin secretion are most probably associated also with inappropriate release of molecules stored in SLMVs. The assessment of the contribution of SLMV exocytosis to the manifestation of the disease will be facilitated by the use of the imaging approach described in this study
Variations on the Author
Full text link“Variations on the Author” discusses two of Eduardo Coutinho’s recent films (Um Dia na Vida, from 2010, and Últimas Conversas, posthumously released in 2015) and their contribution to the general question of documentary authorship. The director’s filmography is characterized by a consistent yet self-effacing form of authorial self-inscription: Coutinho often features as an interviewer that rather than express opinions propels discourses; an interviewer that is good at listening. This mode of self-inscription characterizes him as an author who is not expressive but who is nonetheless markedly present on the screen. In Um Dia na Vida, however, Coutinho is completely absent form the image, while Últimas Conversas, on the contrary, includes a confessional prologue that moves the director from the margins to the center of his films. This article examines the ways in which these works stand out in the filmography of a director who offers new insights into the notion of cinematic authorship
Appropriate Similarity Measures for Author Cocitation Analysis
Full text linkWe provide a number of new insights into the methodological discussion about author cocitation analysis. We first argue that the use of the Pearson correlation for measuring the similarity between authors’ cocitation profiles is not very satisfactory. We then discuss what kind of similarity measures may be used as an alternative to the Pearson correlation. We consider three similarity measures in particular. One is the well-known cosine. The other two similarity measures have not been used before in the bibliometric literature. Finally, we show by means of an example that our findings have a high practical relevance.information science;Pearson correlation;cosine;similarity measure;author cocitation analysis
Dispelling the Myths Behind First-author Citation Counts
Full text linkWe conducted a full-scale evaluative citation analysis study of scholars in the XML research field to explore just how different from each other author rankings resulting from different citation counting methods actually are, and to demonstrate the capability of emerging data and tools on the Web in supporting more realistic citation counting methods. Our results contest some common arguments for the continued
use of first-author citation counts in the evaluation of scholars, such as high correlations between author rankings by first-author citation counts and other citation
counting methods, and high costs of using more realistic citation counting methods that are not well-supported by the ISI databases. It is argued that increasingly available digital full text research papers make it possible for citation analysis studies to go beyond what the ISI databases have directly supported and to employ more
sophisticated methods
Rôle of circular RNAs in the control of p-cell fonctions and in the development of diabetes
No full textLes cellules du corps humain utilisent principalement le sucre (glucose) comme source d'énergie. Après l'ingestion de glucose par les aliments, l'insuline le rend disponible au foie, aux tissus adipeux et aux muscles pour utilisation. L'insuline est une protéine relâchée dans le sang par les cellules (3 des îlots de Langerhans du pancréas en réponse à une augmentation de la glycémie. Si la production d'insuline est insuffisante ou si les tissus ont perdu leur sensibilité à l'insuline (insulinorésistance), le taux de sucre sanguin (glycémie) augmente et entraîne le développement du diabète. Il existe différents types de diabète: le diabète de type 2 est la forme la plus répandue (90 % des cas), suivi du diabète de type 1 (5 à 10 % des cas). Cette dernière est causée par la destruction des cellules sécrétant l'insuline par le système immunitaire de l'organisme. Le diabète de type 2, quant à lui, résulte d'un dysfonctionnement des cellules (3, qui est dû à des facteurs génétiques et environnementaux tels que le manque d'exercice ou une mauvaise alimentation.
On sait déjà que les protéines produites à partir des ARN messagers sont d'importants régulateurs de la fonction des cellules p. Ces ARN messagers proviennent de la transcription des gènes. Cependant, il a été démontré que la majorité des gènes ne produisent pas des ARN messagers codant pour les protéines, mais des ARN non-codants. Il s'agit notamment de petites molécules d'ARN (micro-ARN) qui agissent comme contrôleurs des ARN messagers. Récemment, une nouvelle classe d'ARN non-codants a été découverte qui, contrairement à celles déjà connues possède une structure circulaire (ARN circulaire). La fonction de ces ARN circulaires est encore largement inconnue. Cependant, il a déjà été démontré qu'ils peuvent séquestrer les micro-ARNs et ainsi réguler indirectement la synthèse des protéines. Nous avons constaté que la production de certains de ces ARN circulaires est modifiée dans des modèles animaux qui possèdent des caractéristiques semblables à celles du diabète de type 2 chez l'homme. Afin d'étudier le fonctionnement de ces ARN circulaires, nous avons simulé cette production altérée dans les cellules (3 de rongeur et analysé les effets sur la division cellulaire, la mort cellulaire et la production et la sécrétion d'insuline. Ainsi, nous avons identifié des ARN circulaires qui peuvent réguler la fonction des cellules (3 et contribuer au développement du diabète. L'ensemble des données obtenues durant ma thèse indiquent que les ARN circulaires ont une fonction clé dans le contrôle des cellules p.
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Situées à l'intérieur des îlots pancréatiques, les cellules (3 sont des cellules hautement différenciées qui sécrètent l'insuline en réponse à l'élévation du taux sanguin de glucose suivant l'ingestion d'un repas. L'insuline abaisse la glycémie en induisant l'absorption du glucose dans les tissus cibles tels que le tissu adipeux, les muscles squelettiques. En réponse à certains changements physiologiques tels que l'obésité et la grossesse, les cellules (3 doivent augmenter leur production d'insuline afin de compenser pour la diminution de la sensibilité des tissus cibles à cette hormone. Cependant chez les personnes génétiquement prédisposées, les cellules p ne sont pas en mesure de s'adapter à l'élévation des besoins en insuline, ce qui conduit à une hyperglycémie chronique et au développement du diabète de type 2. L'ensemble des mécanismes conduisant à l'incapacité d'adaptation des cellules (3 demeurent encore méconnus à ce jour. Une meilleure compréhension permettrait de prévenir et de traiter le diabète sucré. La très grande majorité des molécules d'ARN sont dites « non-codantes » et sont maintenant connues pour jouer un rôle important dans la régulation de divers processus biologiques incluant la fonction de la cellule (3. Les ARN non-codants sont répertoriés en différentes classes et les mieux connus à ce jour sont les microARNs et les longs ARN non- codants. Cependant, le rôle des ARN circulaires (circARNs), qui ont été nouvellement découverts, reste à être élucidé. Dans une première étude, nous nous sommes intéressés au rôle des circARNs dans la régulation des fonctions des cellules p. Nous avons étudiés des circARNs déjà annotés dont le circulaire HIPK3 (circHIPK3) qui provient de l'exon 2 de Hipk3, ainsi que cirRS-7 qui est aligné dans le sens inverse du gène Cdrl. Nous avons observé que l'expression de ces deux circRNAs était diminuée dans les îlots pancréatiques de modèles d'animaux diabétiques. L'inhibition de circHIPK3 dans les îlots de rats entraîne une diminution de la sécrétion d'insuline, de la prolifération et de la survie. Nous avons constaté que circHIPK3 régule l'expression de plusieurs acteurs clés des fonctions des cellules p comme Aktl, Slc2a2 et Mtpn en agissant comme << éponge » pour plusieurs microARNs, dont miR-124. De son côté/ciRS-7 est connu pour agir comme éponge pour miR-7, l'un des microARNs les plus abondants des cellules p. Ainsi, l'inhibition de ciRS-7 semble favoriser la diminution de la sécrétion d'insuline et entraîne une réduction de la capacité proliférative.
Dans un second projet, nous avons utilisé des données de séquençage d'ARN pour annoter de novo tous les circRNAs détectables dans des îlots de souris, obtenant ainsi une liste d'environ 20'000 circRNAs dont 12'000 n'avaient pas été décrits au paravent. Certains de ces circRNAs proviennent de gènes exprimés plus abondamment dans les îlots pancréatiques que dans d'autres tissus et agissent comme régulateurs clés des fonctions des cellules p comme le gène à l'insuline [Ins], le transporteur de zinc (Slc30a8] ou le récepteur au GLP1 (Glplr]. En fait, nous avons observé que les gènes Slc30a8 et Glplr génèrent plusieurs transcrits circulaires à partir de presque tous leurs exons et que plusieurs transcrits circulaires sont également produits à partir de l'intron 2 du gène de l'insuline 2 (Ins2) murin. L'expression d'Ins2 circulaire est réduite chez les souris diabétiques db/db, alors que sa contrepartie linéaire reste inchangée. Les ARN circulaires généré à partir de l'intron de l'insuline semblent jouer un rôle fonctionnel important dans la cellule p. En effet, l'inhibition spécifique de ces transcrits cause une diminution de la sécrétion d'insuline. L'ensemble des données obtenues durant ma thèse démontrent que les circRNAs contribuent largement au contrôle des fonctions de la cellule p et que leur dérégulation pourrait contribuer au développement du diabète de type 2.
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Located within the pancreatic islets, the (3-cells are highly differentiated cells specialised to secrete insulin in response to risingglucose levels in the blood after meal intake. Insulin lowers glucose levels by facilitating the uptake and the storage of glucose into its target tissues, adipose tissue, skeletal muscle, and liver. This allows insulin, together with its counteracting hormone glucagon, to maintain blood glucose levels within a narrow range. There are circumstances such as obesity and pregnancy under which insulin sensitivity decreases causinga rise in the insulin demand. In predisposed individuals, (3-cells are not able to compensate for the increased insulin needs which leads to hyperglycaemia and to the development of diabetes. To improve the treatment of diabetes, the mechanisms underlying (3-cell failure and the manifestation of this metabolic disease need to be precisely understood. It has already been demonstrated that non-coding RNAs, such as microRNAs, act as key regulators of various signalling pathways and contribute to the tight régulation of (3-cell activities. However, the rôle of the newly discovered class of circular RNAs remains to be elucidated.
In a first study, we investigated the rôle of previously annotated circRNAs in the régulation of (3-cell functions. We found that both circular HIPK3 (circHIPK3) which originales from exon 2 oïHipk3, as well as, cirRS-7 which aligns antisense to Cdrl display decreased expression in diabetes animal models. We observed that silencing of circHIPK3 in rat islets results in a decrease in insulin sécrétion, (3-cell prolifération, and survival. We found that circHIPK3 régulâtes the expression of several key players in (3-cell functions, such as Aktl, Slc2a2, and Mtpn by sequestering several microRNAs, including miR-124. Furthermore, silencing of ciRS-7, which has been shown to act as a sponge for miR-7, one of the most abundant microRNAs in (3-cells, tends to decrease insulin sécrétion and leads to a diminished proliferative capacity.
In a second project, we de novo annotated using RNA sequencing data ail the circRNAs détectable in mouse islets, obtaining a list of ~20'000 circRNAs of which 12'000 were not previously described. Some of these circRNAs originate from genes that are highly enriched in islets and act as key regulator of p-cell functions like Iris, Slc30a8, or Glplr. In fact, we observed that the Slc30ci8 and Glplr genes generate several circular trascripts from almost ail exons. In addition, we identified several abundant circular transcripts produced from the second intron of the insulin 2 gene. Interestingly, circular Ins2 showed decreased expression in diabetic db/db mice, while its linear counterpart was unaffected. In addition, silencing one of these circular intronic RNAs resulted in changes in the level of several genes involved in insulin exocytosis and caused a réduction in insulin sécrétion. These data demonstrate that circRNAs largely contribute to the control of (3-cell functions and that their dysregulation may potentially participate in the development of type 2 diabetes
koamabayili/VECTRON-author-checklist: VECTRON author checklist
No full textWe have done our best to complete the author checklist relating to the use of animals in the hut study. Note that the objective for the hut study was to evaluate the IRS treatment applications for residual efficacy against Anopheles mosquitoes, including the local An. coluzzii mosquito population. Cows were only used to attract mosquitoes into the huts and no tests were carried out directly on the cows. The author checklist is intended for use with studies where experiments are carried out on animals, which is why we have had such difficulty in completing this for the hut study, as many of the questions do not relate to how the cows were used
Regulation of SNARE Complex Assembly by Second Messengers: Roles of Phospholipases, Munc13 and Munc18
No full text- …
