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Automatic eyeblink and muscular artifact detection and removal from EEG signals using k-nearest neighbor classifier and long hhort-term memory networks
No full textElectroencephalogram (EEG) is often corrupted with artifacts originating from sources such as eyes and muscles. Hybrid artifact removal methods often require human intervention for the adjustment of different parameters. We propose a robust method that can automatically detect and remove eyeblink and muscular artifacts from EEG using a k-nearest neighbor (kNN) classifier and a long short-term memory (LSTM) network. Our method adopts a sliding window of 0.5 s to detect and remove the artifacts from EEG. Features, such as the variance, peak-to-peak amplitude, and average rectified value, are calculated for each EEG segment to identify corrupted segments using the kNN classifier. The kNN classifier detects the presence of artifacts, after which the corresponding EEG window is forwarded to the LSTM network for artifact removal. The LSTM network is trained with the corrupted segments of 0.5 s as input and clean segments of 0.5 s as output. Our method achieved an accuracy of 97.4% in identifying corrupted EEG segments and an average correlation coefficient, structural similarity, signal-to-artifact ratio, and normalized mean squared error of 0.69, 0.76, 1.52 dB, and 0.0013, respectively, in cleaning the EEG. Our results outperformed other hybrid methods reported in the literature based on a combination of ensemble empirical mode decomposition and canonical correlation analysis, a combination of independent component analysis and wavelet decomposition, and tensor decomposition. The mean absolute error of our method is also better in comparison to other methods. Our method can be applied to single and multiple channels and does not require any tuning of parameters
Epithelial plasticity in prostate cancer: principles and clinical perspectives
No full textAbstract not availableRajdeep Das, Philip A. Gregory, Brett G. Hollier, Wayne D. Tilley, Luke A. Selt
Seminário sobre aquacultura 14 a 16 de dezembro de 1983
No full textA necessidade de desenvolver a aquacultura em Portugal obriga à escolha das espécies mais indicadas para tal finalidade. A propósito o autor chama a atenção para as graves consequências que podem advir das introduções e/ou transferências de animais aquáticos, quer para as espécies locais e meio ambiente, como para a para a saúde pública.Concerning the need to choose the most convenient species to cultivate in order to implement aquaculture in Portugal, the author draws the attention to the deleterious consequences of introductions and transfers of aquatic animals.Caixa Geral de Depósito
Novel androgen receptor coregulator GRHL2 exerts both oncogenic and antimetastatic functions in prostate cancer
No full textAbstract not availableSteve Paltoglou, Rajdeep Das, Scott L. Townley, Theresa E. Hickey, Gerard A. Tarulli, Isabel Coutinho, Rayzel Fernandes, Adrienne R. Hanson, Iza Denis, Jason S. Carroll, Scott M. Dehm, Ganesh V. Raj, Stephen R. Plymate, Wayne D. Tilley and Luke A. Selt
Redox-Responsive Nanocapsules for the Spatiotemporal Release of Miltefosine in Lysosome: Protection against Leishmania
No full textLeishmaniasis, a vector-borne disease, is caused by intracellular parasite Leishmania donovani. Unlike most intracellular pathogens, Leishmania donovani are lodged in parasitophorous vacuoles and replicate within the phagolysosomes in macrophages. Effective vaccines against this disease are still under development, while the efficacy of the available drugs is being questioned owing to the toxicity for nonspecific distribution in human physiology and the reported drug-resistance developed by Leishmania donovani. Thus, a stimuli-responsive nanocarrier that allows specific localization and release of the drug in the lysosome has been highly sought after for addressing two crucial issues, lower drug toxicity and a higher drug efficacy. We report here a unique lysosome targeting polymeric nanocapsules, formed via inverse mini-emulsion technique, for stimuli-responsive release of the drug miltefosine in the lysosome of macrophage RAW 264.7 cell line. A benign polymeric backbone, with a disulfide bonding susceptible to an oxidative cleavage, is utilized for the organelle-specific release of miltefosine. Oxidative rupture of the disulfide bond is induced by intracellular glutathione (GSH) as an endogenous stimulus. Such a stimuli-responsive release of the drug miltefosine in the lysosome of macrophage RAW 264.7 cell line over a few hours helped in achieving an improved drug efficacy by 200 times as compared to pure miltefosine. Such a drug formulation could contribute to a new line of treatment for leishmaniasis.A. Das acknowledges SERB (India) Grants (CRG/2020/000492 and JCB/2017/000004) and DBT Grant (BT/PR22251/NNT/28/1274/2017) for supporting this research. N. Mukherjee acknowledges SERB (India) Grant PDF/2016/001437 and K. Das acknowledges the grant EMR/2015/001674 for supporting this research. Financial support from DST (DST/INSPIRE/03/2017/002477) is acknowledged by R.T. This manuscript bears CSMCRI registration no 7/2021.Pramanik, SK (corresponding author), CSIR Cent Salt & Marine Chem Res Inst, Bhavnagar 364002, Gujarat, India.
Mukherjee, N (corresponding author), CSIR Indian Inst Chem Biol, Canc Biol & Inflammatory Disorder Div, Kolkata 700032, India.
Chattopadhy, S (corresponding author), BITS Pilani, Pilani 403726, Goa, India.
Das, A (corresponding author), Indian Inst Sci Educ & Res Kolkata, Mohanpur 741246, W Bengal, India.
[email protected]; [email protected]; [email protected]
Interview with Indra Das
No full textIndra Das is most well-recognized as the author of The Devourers (2015), a novel that won the Lambda Literary Award for straddling the genres of sci-fi, speculative, and fantasy fiction alongside LGBT themes. Das’s short fiction is widely published is horror and sci-fi anthologies, as well as magazines like Tor.com, Strange Horizons, and Asimov’s Science Fiction. He spoke candidly with Alok Amatya over email about the current literary landscape, the work of writing transgressive genre fiction, and his own experiences as an upcoming global author
Gemeindeentwicklung durch das Theater: Erfahrungen aus Assam
No full textEs gibt in Indien eine Bewegung, die nennt sich „Theater an den Wurzeln“ (Theatre of Roots). Damit soll das Theaterspiel an die lokalen Gemeinschaften herangetragen werden und dort für eine bewusstere Auseinandersetzung mit der gesellschaftlichen Umwelt sorgen. Der Theaterpraktiker Sukracharjya Rabha vertiefte diesen Ansatz und wollte die Theaterpraxis materiell, ökonomisch und ökologisch in einer lokalen Gemeinschaft etablieren. Erste Schritte zur Umsetzung seiner Vision war das jährliche Theaterfestival „Unter dem Sal-Baum“, das er leitete. Ein zweiter Schritt war die Installation der Theatergruppe Badungduppa Kalakendra. Der Autor hat sie besucht
"PULS." - Ein Blog als Online-Magazin für Medizinstudierende der Goethe-Universität Frankfurt
No full textIm Herbst 2009 forderten Studierende im Rahmen landesweiter Proteste auch am Fachbereich Medizin/Zahnmedizin der Goethe-Universität Frankfurt mehr Transparenz und Kommunikation zu Angelegenheiten ihres Studiums. Einen innovativen Lösungsansatz, um diesen Forderungen nachzukommen, bietet eines der Web 2.0 Werkzeuge: ein auf einer Blog-Software basierendes Online-Magazin für Studierende und andere Mitglieder des Fachbereichs.
Das öffentlich zugängliche Online-Magazin "PULS." (https://newsmagazin.puls.med.uni-frankfurt.de/wp/) wird mit einer freien Blog-Software (wordpress Version 3.1.3.) realisiert und von einer Online-Redakteurin konzipiert und geschrieben. Die Beiträge entstehen nach eigenen Recherchen sowie aus Anregungen und Gesprächen mit verschiedenen Personengruppen des Fachbereichs. Die datenschutzkonforme Auswertung der Zugriffe erfolgt über eine open-source Webanalyse-Software (Piwik). Zusätzlich werden jährlich mit dem Online-Umfrage-Tool Survey Monkey die Nutzer anonym befragt.
"PULS." ist seit dem 14.02.2010 ununterbrochen online und hat seitdem 806 Beiträge (Stand: 27.11.2012) publiziert und wird von ca. 2400 Besuchern monatlich gelesen. Das Themenspektrum ist zentriert auf die Anliegen der Frankfurter Medizin- und Zahnmedizinstudierenden. Die enge Zusammenarbeit mit verschiedenen Gruppierungen des Fachbereichs – Dekanat, Studierende und Lehrende – garantiert darüber hinaus ein fachbereichs-relevantes Themenspektrum. Das Online-Magazin begleitet komplexe Projekte und Entscheidungen mit Hintergrundinformationen und kommuniziert sie verständlich. Eine jährliche Nutzer-Evaluierung zeigt eine wachsende Leserzahl und eine sehr hohe Zustimmung für das Online-Magazin, seine Inhalte und seinen Stil. Das Web 2.0-Medium "Blog" und seine web-typische Sprache entsprechen dem Medienverhalten der Zielgruppe, d.h. den Studierenden des Fachbereichs Medizin.
"PULS." hat sich als ein geeignetes und strategisches Instrument erwiesen, um größere Transparenz, mehr Kommunikation und letztendlich eine stärkere Identifikation der Studierenden mit ihrem Fachbereich voranzutreiben
Die Türkei und das andere Europa : Phantasmen der Identität im Beitrittsdiskurs /
No full textDiese Studie analysiert das dialogische Zusammenspiel zwischen den europäischen und türkischen Diskursen um den möglichen EU-Beitritt der Türkei. Die Differenzen stellen in der Perspektive postkolonialer Theorien ein ambivalentes und formatives Moment für die Bildung einer europäischen Identität dar: Die Europäer nehmen die Beitrittsverhandlungen zum Anlass, über ihr Selbstverständnis zu reflektieren, wobei diverse Ost-West-Repräsentationen kommuniziert und strukturiert werden. Die muslimischen Migranten in Europa und die Minderheiten in der Türkei fungieren dabei als interne Symptome, die die Unvollständigkeit der europäischen bzw. türkischen Identitäten sichtbar machen.Diese Studie analysiert das dialogische Zusammenspiel zwischen den europäischen und türkischen Diskursen um den möglichen EU-Beitritt der Türkei. Die Differenzen stellen in der Perspektive postkolonialer Theorien ein ambivalentes und formatives Moment für die Bildung einer europäischen Identität dar: Die Europäer nehmen die Beitrittsverhandlungen zum Anlass, über ihr Selbstverständnis zu reflektieren, wobei diverse Ost-West-Repräsentationen kommuniziert und strukturiert werden. Die muslimischen Migranten in Europa und die Minderheiten in der Türkei fungieren dabei als interne Symptome, die die Unvollständigkeit der europäischen bzw. türkischen Identitäten sichtbar machen.Bülent Küçük (Dr. phil.) ist Soziologe und arbeitet im Forschungsprojekt "Eurosphere" an der Sabancà Universität in Istanbul. Seine Forschungsschwerpunkte sind Öffentlichkeits-, Diskurs- und Postkoloniale Theorien.Online resource; title from PDF title page (publisher's Web site, viewed October 7 2015).Includes bibliographical references.JSTO
The role of microRNA-194 and microRNA-375 in prostate cancer metastasis
No full textProstate cancer (PCa) is a major public health problem worldwide. In Australia, it is the most common non-dermatological cancer and second leading cause of cancer related death in men. The risk of being diagnosed with PCa increases with age, and 1 in 6 men are estimated to be affected in their lifetime. Given that Australia has an ageing population, it is projected that the number of men living with PCa will increase from 120,000 to 267,000 by 2017. While significant advances have been made in the treatment of localised, organ-confined prostate tumours, the disease becomes incurable once it has metastasized. Thus, identifying mechanisms that contribute to PCa spread is an urgent requirement.
A considerable body of research has demonstrated that aberrant expression of microRNAs (miRs), a class of small non-coding regulatory RNAs, can be an important factor in prostate cancer metastasis. Previous studies in our laboratory identified serum miR-194 and miR-375 as novel markers of disease progression in men with PCa. However, whether these two miRNAs play a direct role in the biology of prostate tumors is unknown. My PhD aimed to assess the role of miR-194 and miR-375 in PCa progression and metastasis.
My work demonstrated that miR-194 enhanced pro-metastatic features of PCa cells, including migration, invasion and epithelial mesenchymal transition (EMT), in vitro and also augmented metastasis in vivo. I identified and validated SOCS2 as a novel, direct and biologically relevant target of miR-194. My research supports a model whereby targeting of SOCS2 by miR-194 leads to activation of the JAK2/STAT3 and ERK1/2 signalling pathways, two key pathways involved in promoting PCa metastasis. Further, I have demonstrated that miR-194 is regulated by GATA2, an oncogenic transcription factor in PCa.
On the other hand, my work demonstrated that miR-375 is a potent tumour suppressor miRNA, as it can inhibit EMT, invasion and growth of prostate cancer cells. I identified YAP1, a transcriptional coactivator and a potent oncogene, as a direct and biological relevant target of miR-375. Additionally, I demonstrated that miR-375 was under the direct transcriptional control of EMT-promoting factor, ZEB1. Collectively, these findings provide greater understanding of the role of miR-194 and miR-375 in prostate cancer metastasis. This information could inform the potential application of these miRNAs as biomarkers, and could lead to efforts to target miR-194 to prevent prostate cancer metastasis.Thesis (Ph.D.) (Research by Publication) -- University of Adelaide, School of Medicine, 2016
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