1,721,048 research outputs found
Going Beyond Counting First Authors in Author Co-citation Analysis
No full textThe present study examines one of the fundamental aspects of author co-citation analysis (ACA) - the way co-citation
counts are defined. Co-citation counting provides the data on which all subsequent statistical analyses and mappings
are based, and we compare ACA results based on two different types of co-citation counting - the traditional type that
only counts the first one among a cited work's authors on the one hand and a non-traditional type that takes into
account the first 5 authors of a cited work on the other hand. Results indicate that the picture produced through this non-traditional author co-citation counting contains more coherent author groups and is therefore considerably clearer. However, this picture represents fewer specialties in the research field being studied than that produced through the traditional first-author co-citation counting when the same number of top-ranked authors is selected and analyzed. Reasons for these effects are discussed
Variations on the Author
No full text“Variations on the Author” discusses two of Eduardo Coutinho’s recent films (Um Dia na Vida, from 2010, and Últimas Conversas, posthumously released in 2015) and their contribution to the general question of documentary authorship. The director’s filmography is characterized by a consistent yet self-effacing form of authorial self-inscription: Coutinho often features as an interviewer that rather than express opinions propels discourses; an interviewer that is good at listening. This mode of self-inscription characterizes him as an author who is not expressive but who is nonetheless markedly present on the screen. In Um Dia na Vida, however, Coutinho is completely absent form the image, while Últimas Conversas, on the contrary, includes a confessional prologue that moves the director from the margins to the center of his films. This article examines the ways in which these works stand out in the filmography of a director who offers new insights into the notion of cinematic authorship
Appropriate Similarity Measures for Author Cocitation Analysis
No full textWe provide a number of new insights into the methodological discussion about author cocitation analysis. We first argue that the use of the Pearson correlation for measuring the similarity between authors’ cocitation profiles is not very satisfactory. We then discuss what kind of similarity measures may be used as an alternative to the Pearson correlation. We consider three similarity measures in particular. One is the well-known cosine. The other two similarity measures have not been used before in the bibliometric literature. Finally, we show by means of an example that our findings have a high practical relevance.information science;Pearson correlation;cosine;similarity measure;author cocitation analysis
Dispelling the Myths Behind First-author Citation Counts
No full textWe conducted a full-scale evaluative citation analysis study of scholars in the XML research field to explore just how different from each other author rankings resulting from different citation counting methods actually are, and to demonstrate the capability of emerging data and tools on the Web in supporting more realistic citation counting methods. Our results contest some common arguments for the continued
use of first-author citation counts in the evaluation of scholars, such as high correlations between author rankings by first-author citation counts and other citation
counting methods, and high costs of using more realistic citation counting methods that are not well-supported by the ISI databases. It is argued that increasingly available digital full text research papers make it possible for citation analysis studies to go beyond what the ISI databases have directly supported and to employ more
sophisticated methods
O-GlcNAcylation : comment la O-GlcNAc transférase régule la physiologie hépatique?
No full textLa O-GlcNAcylation est une modification post-traductionnelle dynamique et réversible médiée par l'activité de seulement deux enzymes appelées O-GlcNAc transférase (OGT) et O-GlcNAcase (OGA). L'OGT catalyse l'ajout d'une seule N-acétylglucosamine (GlcNAc) de la molécule UDP-GlcNAc aux résidus sérine ou thréonine sur des protéines spécifiques modifiant leur stabilité, leur localisation et leur activation transcriptionnelle, tandis que l'élimination de l'O-GlcNAc est contrôlée par l'enzyme OGA. La perturbation des niveaux physiologiques de l'O-GlcNAcylation est liée à des fonctions cellulaires anormales et à des pathologies telles que la glucotoxicité, le syndrome métabolique et le cancer. Afin de déterminer les conséquences métaboliques d'une suppression ciblée de l'enzyme OGT dans les hépatocytes in vivo, nous avons développé un modèle de souris avec une ablation hépatique spécifique de l'enzyme OGT (OGTdelta) en croisant des souris OGTlox / lox avec des souris Alb-cre. De manière surprenante, ces souris ne présentent pas de perturbation majeure de l'homéostasie métabolique mais présentent un phénotype hépatique sévère avec la présence de nombreux nodules de régénération visibles après le sevrage. Les analyses RT-PCR et Western blot ont montré que l'expression des cyclines A2, B1 et D1 était significativement augmentée dans le foie des souris OGTdelta par rapport aux contrôles, suggérant un état prolifératif exacerbé à huit semaines. Des analyses histologiques ont révélé la présence de cellules pro-inflammatoires et des signes de fibrose dans les travées entourant les nodules de régénération. Ceci était associé à une augmentation significative des marqueurs de l'inflammation (TNFa) et de la fibrose (TGFb, Col3a1 et Col6a1), suggérant une lésion hépatique significative chez les souris OGTdelta. Fait intéressant, alors que l'OGT était significativement réduite dans le foie des jeunes souris (quatre semaines), nous avons observé une ré-expression de l'OGT dans le foie de souris plus âgées (huit semaines) suggérant un phénotype de «compétition cellulaire» contre les cellules déficientes pour l'OGT. Dans le but de comprendre les mécanismes à l'origine de la ré-expression de l'OGT ainsi que le phénotype hépatique sévère observé à huit semaines, nous avons effectué une analyse transcriptomique comparant des souris âgées de quatre et huit semaines (OGTF vs OGTdelta). Ces analyses suggèrent que la perte d'OGT à quatre semaines provoque un stress ER et des dommages à l'ADN. La validation de ces données par RT-qPCR et Western blot révèle une augmentation des marqueurs de réponse antioxydante (Nrf2), de dommage à l'ADN (gammaH2AX) et au stress du réticulum endoplasmique (CHOP). De plus, plusieurs voies REACTOME sont enrichies dans le foie de souris OGTdelta âgées de huit semaines par rapport aux témoins tels que la formation de matrice extracellulaire, le système immunitaire inné, la modulation de plusieurs modificateurs épigénétiques et oncogènes ainsi que des récepteurs de tyrosine kinase, ce qui suggère le développement potentiel de tumeurs dans le foie des souris OGTdelta . Le suivi de ces souris jusqu'à l'âge d'un an révèle un dimorphisme sexuel où les mâles restaurent un foie de phénotype normal, alors que les femmes développent plusieurs structures ressemblant à des tumeurs. L'ensemble de nos résultats suggère un rôle essentiel pour l'OGT dans la physiologie hépatique.O-GlcNAcylation is a dynamic and reversible post-translational modification mediated through the activity of only two enzymes called O-GlcNAc transferase (OGT) and O-GlcNAcase (OGA). OGT catalyzes the addition of a single N-acetylglucosamine (GlcNAc) from the molecule UDP-GlcNAc to serine or threonine residues on specific proteins modifying its stability, localization and transcriptional activation, while removal of O-GlcNAc is controlled by the OGA enzyme. Disruption of physiological levels of O-GlcNAcylation is related to abnormal cellular functions and pathologies including glucotoxicity, metabolic syndrome and cancer. To determine the metabolic consequences of a targeted deletion of the OGT enzyme in hepatocytes in vivo, we developed a model of mice with a liver-specific ablation of OGT (OGTdelta) by crossing OGTlox/lox with Alb-Cre mice. Surprisingly, these mice did not exhibit major disruption of metabolic homeostasis but showed a severe liver phenotype with the presence of numerous regeneration nodules visible after weaning. RT-PCR and western blot analyzes showed that the expression of cyclins A2, B1 and D1 was significantly increased in the liver of OGTdelta mice compared to controls suggesting an exacerbated proliferative state at eight-weeks. Histological analyzes revealed the presence of pro-inflammatory cells and signs of fibrosis in the spans surrounding the regeneration nodules. This was associated with a significant increase in markers of inflammation (TNFa) and fibrosis (TGFb,Col3a1 and Col6a1), suggesting significant liver injury in OGTdelta mice. Interestingly, while OGT was significantly reduced in livers of young mice (four week-old), we observed re-expression of OGT in livers of older mice (eight week-old) suggesting a « cell competition » phenotype against cell deficient for OGT. To better understand the mechanisms driving rescued expression of OGT as well as the phenotype of liver injury, we performed a microarray analysis comparing four- and eight-week-old mice (OGTF vs OGTdelta). These analyses suggested that loss of OGT at four weeks causes ER stress and DNA damage response. RT-qPCR and western blot validation further demonstrated an increase in ER stress (CHOP), antioxidant response (Nrf2) and DNA damage (gammaH2AX) markers. Furthermore, several REACTOME pathways were enriched in liver of eight week-old OGTdelta mice compared to controls such as extracellular matrix formation, innate immune system, modulation of several epigenetics modifiers and oncogenes as well as tyrosine kinase receptors suggesting the potential development of tumors in the liver of OGTdelta mice. Follow up of these mice over one year revealed a sexual dimorphism with females developing several tumor-like structures while males showed a normal liver phenotype. Altogether, our results suggest an essential role for OGT in liver physiology
Role of O-GlcNAc transferase (OGT) in liver physiopathology
No full textLa O-GlcNAcylation est une modification post-traductionnelle dynamique et réversible contrôlée par l'activité de deux enzymes, la O-GlcNAc transférase (OGT) et la O-GlcNAcase (OGA). Ces deux enzymes interviennent dans le cycle dynamique de la O-GlcNAcylation sur une grande variété de protéines cytosoliques, nucléaires et mitochondriales d'une manière sensible aux nutriments et au stress (Yang et Qian, 2017). En conséquence, il a été proposé que la O-GlcNAcylation fonctionne comme un capteur de nutriments et de stress régulant les processus cellulaires allant de la transcription et de la traduction à la transduction du signal et au métabolisme. La perturbation de l'homéostasie de l'O-GlcNAcylation a été impliquée dans la pathogenèse de plusieurs maladies humaines, notamment le cancer, le diabète et la neurodégénérescence (Nie et Yi, 2019). Une étude récente a suggéré que l'OGT agit comme un suppresseur de la nécroptose des hépatocytes (une forme spécifique de nécrose régulée) et que la suppression de l'OGT dans le foie des souris déclenche une fibrose hépatique (Zhang et al., 2019). Dans ce contexte, nous avons cherché à déterminer les conséquences d'une délétion ciblée de l'enzyme OGT dans les hépatocytes in vivo et à explorer l'effet d'un changement alimentaire sur le phénotype hépatique. En utilisant des souris présentant un déficit ciblé en OGT dans les hépatocytes (OGTLKO), notre étude révèle que l'OGT est essentiel à l'homéostasie du foie. En utilisant des souris présentant un déficit ciblé en OGT dans les hépatocytes (OGTLKO), notre étude révèle que l'OGT est essentiel à l'homéostasie du foie. Nous avons démontré que l'absence d'OGT est associée à un stress oxydatif, à une inflammation et à une fibrose modérée à 2 semaines, entraînant une fibrose hépatique avancée et l'apparition de nodules de régénération à 8 semaines. Étant donné que l'apport en glucides induit un stress oxydatif (Du et al., 2010 ; Mohanty et al., 2000 ; de Carvalho Vidigal et al., 2012 ; Dickinson et al., 2008), nous avons émis l'hypothèse que le stress oxydatif élevé observé dans le foie pendant 4 semaines était lié à l'augmentation des sucres dans le régime au sevrage. Pour tester cette hypothèse, les souris OGTLWT et OGTLKO ont été sevrés avec un régime pauvre en glucides compensé par une augmentation des lipides (LFHC: 21 % de glucides, 60 % de lipides, 19 % de protéines), ou un régime cétogène (KD: 1 % de glucides, 94% de lipides, 5 % de protéines) ou un régime standard (SD: 69 % de glucides, 4 % de lipides, 26% de protéines). Alors que les régimes LCHF et KD prévenaient le stress oxydatif hépatique chez les souris OGTLKO, seul le KD permettait la réversion complète du phénotype OGTLKO (y compris les lésions hépatiques et la fibrose), ce qui suggère que la réduction de l'apport en glucides au sevrage prévient l'effet délétère de l'absence de l'OGT dans le foie. Compte tenu du phénotype hépatique observé chez les souris OGTLKO nous avons voulu caractériser un modèle original avec une délétion inductible de l'OGT hépatocytaire (OGTINDLKO) et nous avons démontré que le rôle de l'OGT dans le maintien de l'homéostasie hépatique est indépendant de l'âge de la souris. Enfin, vu rôle de l'OGT dans les processus métaboliques de lipogenèse hépatique, nous avons exploré le niveau de l'OGT et de la O-GlcNAcylation dans une population de patients avec une NAFLD et ayant subi une chirurgie bariatrique pour une obesité morbide (Cohorte Abos-CHU de Lille).O-GlcNAcylation is a dynamic and reversible post-translational modification controlled by the activity of two enzymes, O-GlcNAc transferase (OGT) and O-GlcNAcase (OGA). These two enzymes mediate the dynamic cycle of O-GlcNAcylation on a wide variety of cytosolic, nuclear and mitochondrial proteins in a nutrient and stress sensitive manner (Yang and Qian, 2017). Accordingly, O-GlcNAcylation has been proposed to act as a nutrient and stress sensor regulating cellular processes ranging from transcription and translation to signal transduction and metabolism. Disruption of O-GlcNAcylation homeostasis has been implicated in the pathogenesis of several human diseases, including cancer, diabetes, and neurodegeneration (Nie and Yi, 2019). A recent study suggested that OGT acts as a suppressor of hepatocyte necroptosis (a specific form of regulated necrosis) and that suppression of OGT in mouse liver triggers liver fibrosis (Zhang et al., 2019 ). In this context, we sought to determine the consequences of a targeted deletion of the OGT enzyme in hepatocytes in vivo and to explore the effect of a dietary change on the liver phenotype. Using mice with targeted OGT deficiency in hepatocytes (OGTLKO), our study reveals that OGT is essential for liver homeostasis. We demonstrated that the absence of OGT is associated with oxidative stress, inflammation and moderate fibrosis at 2 weeks, leading to advanced liver fibrosis and the appearance of regenerative nodules at 8 weeks. Since carbohydrate intake induces oxidative stress (Du et al., 2010; Mohanty et al., 2000; de Carvalho Vidigal et al., 2012; Dickinson et al., 2008), we hypothesized that the elevated oxidative stress observed in the liver at 4 weeks was related to the increase in sugars in the diet at weaning. To test this hypothesis, OGTLWT and OGTLKO mice were weaned on a low carbohydrate diet compensated by increased fat (LFHC: 21% carbohydrate, 60% fat, 19% protein), or a ketogenic diet (KD carbs: 1% carbohydrate, 94% fat, 5% protein) or a standard diet (SD: 69% carbohydrate, 4% fat, 26% protein). While both LCHF and KD diets prevented hepatic oxidative stress in OGTLKO mice, only KD allowed complete reversal of the OGTLKO phenotype (including liver damage and fibrosis), suggesting that reducing carbohydrate intake at weaning prevents the deleterious effect of the absence of OGT in the liver. Given the hepatic phenotype observed in OGTLKO mice, we wanted to characterize an original model with an inducible deletion of hepatocyte OGT (OGTINDLKO) and we demonstrated that the role of OGT in maintaining hepatic homeostasis is independent of the age of the mouse. Finally, given the role of OGT in the metabolic processes of hepatic lipogenesis, we explored the level of OGT and O-GlcNAcylation in a population of patients with NAFLD who had undergone bariatric surgery for morbid obesity ( Abos-CHU Lille cohort)
koamabayili/VECTRON-author-checklist: VECTRON author checklist
No full textWe have done our best to complete the author checklist relating to the use of animals in the hut study. Note that the objective for the hut study was to evaluate the IRS treatment applications for residual efficacy against Anopheles mosquitoes, including the local An. coluzzii mosquito population. Cows were only used to attract mosquitoes into the huts and no tests were carried out directly on the cows. The author checklist is intended for use with studies where experiments are carried out on animals, which is why we have had such difficulty in completing this for the hut study, as many of the questions do not relate to how the cows were used
Author-wise bibliometric analysis based on entropy.
No full textAuthor-wise bibliometric analysis based on entropy.</p
- …
