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Papaya—I
This chapter reviews the viruses that have been reported infecting papaya (Carica papaya L.) worldwide, focusing on papaya mosaic, papaya leaf distortion mosaic, papaya apical necrosis, and papaya leaf curl diseases. These diseases are responsible for serious losses of crop quality and production throughout the world; some aspects such as distribution, etiology, and epidemiology are discussed.Instituto de Patología VegetalFil: Cabrera Mederos, Dariel. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Unidad de Fitopatología y Modelización Agrícola (UFyMA); ArgentinaFil: Cabrera Mederos, Dariel. Instituto Nacional de Tecnología Agropecuaria (INTA). Instituto de Patología Vegetal; ArgentinaFil: Giolitti, Fabian. Instituto Nacional de Tecnología Agropecuaria (INTA). Instituto de Patología Vegetal; ArgentinaFil: Giolitti, Fabian. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Unidad de Fitopatología y Modelización Agrícola (UFyMA); ArgentinaFil: Cruz, Maylín. Laboratorio Provincial de Sanidad Vegetal; CubaFil: Leiva Mora, Michel. Universidad Técnica de Ambato. Facultad de Ciencias Agropecuarias. Laboratorio de Biotecnología; EcuadorFil: Trucco, Veronica Milagros. Instituto Nacional de Tecnología Agropecuaria (INTA). Instituto de Patología Vegetal; ArgentinaFil: Trucco, Veronica Milagros. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Unidad de Fitopatología y Modelización Agrícola (UFyMA); ArgentinaFil: Portal, Orelvis. Universidad Central “Marta Abreu” de Las Villas. Facultad de Ciencias Agropecuarias. Departamento de Biología; CubaFil: Portal, Orelvis. Universidad Central “Marta Abreu” de Las Villas. Centro de Investigaciones Agropecuarias. Facultad de Ciencias Agropecuarias; Cub
Descripción y manejo de las principales enfermedades virales que afectan la papaya
La papaya (Carica papaya L.) se encuentra distribuida a lo largo de las regiones tropicales y subtropicales (Yeh et al., 2007). La adaptación de esta planta y la aceptación de sus frutos le confieren considerables ventajas comerciales locales y de exportación. Los principales países productores de papaya son India, Brasil, Indonesia, México y Nigeria, que concentran el 77% de la producción mundial. La superficie destinada al cultivo comercial de este frutal en Cuba es de aproximadamente 6.000 ha por año, con producciones superiores a las 170.000 t y rendimientos que oscilan entre 17-30 t ha-1. Estos volúmenes de producción ubican a Cuba entre los primeros 10 países productores de papaya (FAO, 2021). En Argentina la papaya se puede considerar como un cultivo emergente, sin embargo, en el norte del país se presentan condiciones adecuadas para su
producción. Esta planta se cultiva principalmente en las provincias de Salta, Jujuy, Formosa, Corrientes y Misiones. Además, se pueden encontrar plantas de papaya en pequeños patios o parcelas en otras provincias como Chaco, Entre Ríos y Santa Fe.Instituto de Patología VegetalFil: Cabrera Mederos, Dariel. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Unidad de Fitopatología y Modelización Agrícola (UFyMA); ArgentinaFil: Cabrera Mederos, Dariel. Instituto Nacional de Tecnología Agropecuaria (INTA). Instituto de Patología Vegetal; ArgentinaFil: Giolitti, Fabian. Instituto Nacional de Tecnología Agropecuaria (INTA). Instituto de Patología Vegetal; ArgentinaFil: Giolitti, Fabian. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Unidad de Fitopatología y Modelización Agrícola (UFyMA); ArgentinaFil: Jaramillo, Margarita. Universidad Nacional de Tucumán. Cátedra de Fitopatología; ArgentinaFil: Leiva Mora, Michel. Universidad Técnica de Ambato. Facultad de Ciencias Agropecuarias. Laboratorio de Biotecnología; EcuadorFil: Portal, Orelvis. Universidad Central “Marta Abreu” de Las Villas. Facultad de Ciencias Agropecuarias. Departamento de Biología; CubaFil: Portal, Orelvis. Universidad Central “Marta Abreu” de Las Villas. Centro de Investigaciones Agropecuarias. Facultad de Ciencias Agropecuarias; Cub
Distribution and molecular characterization of the viruses SCYLV, SCMV in Saccharum sp. and PRSV-P in Carica papaya in Cuba
Entre las enfermedades más importantes en Saccharum sp., se destacan sugarcane yellow leaf virus (SCYLV) y sugarcane mosaic virus (SCMV). En Carica papaya L., papaya ringspot virus (PRSV-P) causa una de las enfermedades más destructivas. El objetivo de esta investigación fue determinar la distribución en Cuba de estos virus y su caracterización molecular. Se realizaron prospecciones y diagnóstico molecular mediante RT-PCR. En el caso de SCMV se realizó secuenciación directa. Se realizaron análisis filodinámicos con 34 secuencias de aislados cubanos de PRSV-P y 107 secuencias de aislados del continente americano e islas del Caribe. SCYLV y PRSV-P se encuentran ampliamente distribuidos en Cuba. De SCYLV se informa la existencia de las razas BRA-PER, CUB y REU, y de SCMV una sola raza. Los aislados cubanos de PRSV-P y del continente americano e islas del Caribe mostraron un ancestro común. SCYLV y PRSV-P constituyen un peligro potencial para los agricultores.Among the most important diseases in Saccharum spp., sugarcane yellow leaf virus (SCYLV) and sugarcane mosaic virus (SCMV) stand out. In Carica papaya L., papaya ringspot virus (PRSV-P) causes one of the most destructive diseases. The objective of this research was to determine the distribution in Cuba of these viruses and their molecular characterization. Prospecting and molecular diagnosis were carried out by RT-PCR. In the case of SCMV, direct sequencing was performed. Phylodynamic analyzes were performed with 34 sequences from Cuban PRSV-P isolates and 107 sequences from isolates from the American continent and Caribbean islands. SCYLV and PRSV-P are widely distributed in Cuba. From SCYLV the existence of the races BRA-PER, CUB and REU was reported, and from SCMV a single race. The Cuban isolates of PRSV-P and from the American continent and Caribbean islands showed a common ancestor. SCYLV and PRSV-P constitute a potential hazard to farmers.Instituto de Patología VegetalFil: Aday-Díaz, Osmany. Instituto de Investigaciones de la Caña de Azúcar; CubaFil: Puchades Izaguirre, Yaquelin. Instituto de Investigaciones de la Caña de Azúcar; CubaFil: Cabrera Mederos, Dariel. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Unidad de Fitopatología y Modelización Agrícola (UFyMA); ArgentinaFil: Cabrera Mederos, Dariel. Instituto Nacional de Tecnología Agropecuaria (INTA). Instituto de Patología Vegetal; ArgentinaFil: González Ramírez, José Efraín. Instituto de Investigaciones de Viandas Tropicales. Departamento de Virología de Plantas; CubaFil: Portal, Orelvis. Universidad Central “Marta Abreu” de Las Villas. Centro de Investigaciones Agropecuarias. Facultad de Ciencias Agropecuarias; CubaFil: Portal, Orelvis. Universidad Central “Marta Abreu” de Las Villas. Facultad de Ciencias Agropecuarias. Departamento de Biología; Cub
Distribution in Cuba and Molecular Characterization of the virus SCYLV, SCMV in Saccharum sp. and PRSV-P in Carica Papaya
Entre las enfermedades más importantes en Saccharum sp., se destacan sugarcane yellow leaf virus (SCYLV) y sugarcane mosaic virus (SCMV). En Carica papaya L., papaya ringspot virus (PRSV-P) causa una de las enfermedades más destructivas. El objetivo de esta investigación fue determinar la distribución en Cuba de estos virus y su caracterización molecular. Se realizaron prospecciones y diagnóstico molecular mediante RT-PCR. En el caso de SCMV se realizó secuenciación directa. Se realizaron análisis filodinámicos con 34 secuencias de aislados cubanos de PRSV-P y 107 secuencias de aislados del continente americano e islas del Caribe. SCYLV y PRSV-P se encuentran ampliamente distribuidos en Cuba. De SCYLV se informan la existencia de las razas BRA-PER, CUB y REU, y de SCMV una sola raza. Los aislados cubanos de PRSVP y del continente americano e islas del Caribe mostraron un ancestro común. SCYLV y PRSV-P constituyen un peligro potencial para los agricultores.Fil: Aday Díaz, Osmany. Instituto de Investigaciones de la Caña de Azúcar; CubaFil: Puchades Izaguirre, Yaquelin. Instituto de Investigaciones de la Caña de Azúcar; CubaFil: Cabrera Mederos, Dariel. Instituto Nacional de Tecnología Agropecuaria. Centro de Investigaciones Agropecuarias. Instituto de Patología Vegetal; Argentina. Instituto Nacional de Tecnologia Agropecuaria. Centro de Investigaciones Agropecuarias. Unidad de Fitopatologia y Modelizacion Agricola. - Consejo Nacional de Investigaciones Cientificas y Tecnicas. Centro Cientifico Tecnologico Conicet - Cordoba. Unidad de Fitopatologia y Modelizacion Agricola.; ArgentinaFil: González Ramírez, José Efraín. Instituto de Investigaciones de Viandas Tropicales; CubaFil: Portal, Orelvis. Universidad Central “Marta Abreu” de Las Villas; Cuba1er Simposio Internacional Protección de PlantasEl CarmenEcuadorUniversidad Técnica de Ambato. Facultad de Ciencias AgropecuariasCentro de Gestión Internacional de Capacitación y Postgrad
Filodinámica del virus de la mancha anillada de la papaya en carica papaya L en Cuba
Papaya is broadly cultivated in tropical and subtropical regions. However, they are affected by the Papaya ringspot virus (PRSV), which is the most economically important virus affecting papaya worldwide. This study aimed to determine the phylodynamics of PRSV on papaya in Cuba. For this purpose, orchardand garden papaya crops grown in 47 Cuban municipalities were surveyed from 2008 to 2013, revealing thewidespread distribution of PRSV in Cuba. Phylodynamic analyses performed with the coat protein partial geneof all Cuban PRSV-P isolates (34 sequences) and 107 sequences of isolates from the American continent and theCaribbean islands showed a most recent common ancestor in 1942 (HPD95 % = 1911- 1967). The substitutionrate was estimated to be 7.7 × 10-4 substitutions per site per year (HPD95 % = 4.6 × 10-4-1.1 × 10-3), whichis equivalent to those detected in other RNA viruses. Demographic reconstruction of PRSV showed that viraldiversity increased in the 1985-1990 period, which coincides with the implementation of extensive productionpractices. Moreover, in Cuba viral dispersion introductions were observed to occurre from Mexico and otherunknown ancestral localization. The spatio-temporal diffusion analysis proposed Mexico as an ancestral area forthe origin of diversification in the American continent and suggests new dispersion events between Americanand Caribbean isolates. The observed widespread distribution, clear geographic grouping of Cuban isolates, virusgrowth and genetic diversity provide strong evidence of the PRSV dispersion patterns.Fil: Cabrera Mederos, Dariel. Instituto Nacional de Tecnologia Agropecuaria. Centro de Investigaciones Agropecuarias. Unidad de Fitopatologia y Modelizacion Agricola. - Consejo Nacional de Investigaciones Cientificas y Tecnicas. Centro Cientifico Tecnologico Conicet - Cordoba. Unidad de Fitopatologia y Modelizacion Agricola.; ArgentinaFil: Giolitti, Fabián José. Instituto Nacional de Tecnología Agropecuaria. Centro de Investigaciones Agropecuarias. Instituto de Patología Vegetal; ArgentinaFil: Torres, Carolina Cecilia. Universidad de Buenos Aires. Facultad de Farmacia y Bioquímica; Argentina. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas; ArgentinaFil: Portal, Orelvis. Universidad Central Marta Abreu de Las Villas; CubaTercer Seminario Internacional de Sanidad AgropecuariaVaraderoCubaCentro Nacional de Sanidad Agropecuari
Distribution and phylodynamics of papaya ringspot virus on Carica papaya in Cuba
Orchard and garden papaya crops grown in 47 Cuban municipalities were surveyed from 2008 to 2013, revealing the widespread distribution of papaya ringspot virus (PRSV) in Cuba. Phylodynamic analyses performed with the partial coat protein gene of all Cuban PRSV‐P isolates (34 sequences) and 107 sequences of isolates from the American continent and the Caribbean islands showed a most recent common ancestor in 1942 (95% highest posterior density, HPD 95% = 1911–1967). The substitution rate was estimated to be 7.7 × 10−4 substitutions per site per year (HPD 95% = 4.6 × 10−4 to 1.1 × 10−3), which is equivalent to those detected in other RNA viruses. Demographic reconstruction of PRSV showed that viral diversity increased in the 1985–1990 period, which coincides with the implementation of extensive production practices. Moreover in Cuba, viral dispersion occurred from Mexico and other unknown ancestral locations. The spatiotemporal diffusion analysis proposed Mexico as an ancestral area for the origin of diversification in the American continent and suggests new dispersion events between American and Caribbean isolates. The observed widespread distribution, clear geographic grouping of Cuban isolates, virus growth and genetic diversity provide strong evidence of the PRSV dispersion patterns, which has implications for the control strategies of PRSV.Instituto de Patología VegetalFil: Cabrera Mederos, Dariel. Instituto Nacional de Tecnología Agropecuaria (INTA). Instituto de Patología Vegetal; Argentina. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas; Argentina. Universidad Central “Marta Abreu” de Las Villas. Facultad de Ciencias Agropecuarias. Departamento de Agronomía; CubaFil: Giolitti, Fabian. Instituto Nacional de Tecnología Agropecuaria (INTA). Instituto de Patología Vegetal; ArgentinaFil: Torres, Carolina. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas; Argentina. Universidad de Buenos Aires. Facultad de Farmacia y Bioquímica. Cátedra de Virología; ArgentinaFil: Portal, Orelvis. Universidad Central “Marta Abreu” de Las Villas. Facultad de Ciencias Agropecuarias. Departamento de Biología; Cub
Going Beyond Counting First Authors in Author Co-citation Analysis
The present study examines one of the fundamental aspects of author co-citation analysis (ACA) - the way co-citation
counts are defined. Co-citation counting provides the data on which all subsequent statistical analyses and mappings
are based, and we compare ACA results based on two different types of co-citation counting - the traditional type that
only counts the first one among a cited work's authors on the one hand and a non-traditional type that takes into
account the first 5 authors of a cited work on the other hand. Results indicate that the picture produced through this non-traditional author co-citation counting contains more coherent author groups and is therefore considerably clearer. However, this picture represents fewer specialties in the research field being studied than that produced through the traditional first-author co-citation counting when the same number of top-ranked authors is selected and analyzed. Reasons for these effects are discussed
Cucumber mosaic virus infecting ‘Cavendish’ banana in Argentina
Banana plants (Musa sp.) showing severe mosaic symptoms in leaves were observed in Laguna Naineck, Formosa, Argentina. Electron microscopy observations of leaf dip preparations revealed isometric particles ca. 30 nm in diameter, which were identified as cucumber mosaic virus (CMV) by enzyme-linked immunosorbent assay (ELISA) test and reverse transcription-polymerase chain reaction (RT-PCR). CMV was mechanically transmitted to healthy Nicotiana glutinosa plants. Sequence analysis of coat protein gene showed highest nucleotides identity with other CMV isolates from United States of America, Serbia, Russia, Democratic Republic of Congo, Iran and Brazil, ranging between 96.9–98.3%. Phylogenetic analysis indicated that the virus isolate named Laguna Naineck (MH716245) belongs to the CMV group IA. To our knowledge, this is the first report of CMV in banana in Argentina. Moreover, constitutes the first Argentine CMV isolate available in the international nucleotide sequence databases.Fil: Cabrera Mederos, Dariel. Instituto Nacional de Tecnología Agropecuaria. Centro de Investigaciones Agropecuarias. Instituto de Patología Vegetal; Argentina. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas; ArgentinaFil: Jaramillo Zapata, Margarita. Universidad San Pablo-T; ArgentinaFil: Villarreal Filipovich, José. Centro de Validación de Tecnologías Agropecuarias; ArgentinaFil: Nome, Claudia. Instituto Nacional de Tecnología Agropecuaria. Centro de Investigaciones Agropecuarias. Instituto de Patología Vegetal; ArgentinaFil: Torres, Carolina. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas; ArgentinaFil: Portal, Orelvis. Universidad Central Marta Abreu de Las Villas; CubaFil: Giolitti, Fabián José. Instituto Nacional de Tecnología Agropecuaria. Centro de Investigaciones Agropecuarias. Instituto de Patología Vegetal; Argentin
Effect of plantain barrier plants on potyvirus-associated diseases in yam cultivation
Yam belongs to a very diverse plant genus (Dioscorea L.) that includes more than 600 species, both wild and cultivated. In Cuba, different species are distributed in the central and eastern regions, where the most widespread cultivars belong to the species water yam (Dioscorea alata L.) and white yam (Dioscorea cayenensis subsp. rotundata (Poir.) J. Miège). The major constraints faced by yam production areas are those caused by viral diseases. In this sense, potyviruses have the greatest economic impact, since they can cause losses of more than 50% in agricultural yields. The movement of propagules between plantations without phytosanitary certification has facilitated the spread of viruses throughout the production areas. Understanding the relationships between the host, virus, vector, and ecosystem is fundamental for successful disease management and for increasing agricultural yields. The objective of the present work was to determine the effect of using virus-free planting material and plantain barriers on the production of two yam cultivars. For this purpose, potyvirus-free certified and non-certified planting material were evaluated inside and outside a live barrier based on plantain ‘Burro CEMSA’. The virus incidence and production of these plants were determined in each of the experiments conducted. It was possible to reduce the field incidence of viral diseases (average infection decreased from 60 to 15%). The barrier also prevented yield losses of 50–57% for both cultivars, compared to the farmer’s usual practices.CITMA, PN131LH001.63, José Efraín González RamírezPeer reviewe
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