1,720,975 research outputs found
Going Beyond Counting First Authors in Author Co-citation Analysis
The present study examines one of the fundamental aspects of author co-citation analysis (ACA) - the way co-citation
counts are defined. Co-citation counting provides the data on which all subsequent statistical analyses and mappings
are based, and we compare ACA results based on two different types of co-citation counting - the traditional type that
only counts the first one among a cited work's authors on the one hand and a non-traditional type that takes into
account the first 5 authors of a cited work on the other hand. Results indicate that the picture produced through this non-traditional author co-citation counting contains more coherent author groups and is therefore considerably clearer. However, this picture represents fewer specialties in the research field being studied than that produced through the traditional first-author co-citation counting when the same number of top-ranked authors is selected and analyzed. Reasons for these effects are discussed
Primary fibroblast co-culture stimulates growth and metabolism in Sdhb-impaired mouse pheochromocytoma MTT cells
Pheochromocytomas and paragangliomas (PGLs) due to mutations of succinate dehydrogenase (SDH) B, a subunit of the SDH complex with a role in the Krebs cycle and the respiratory chain, tend to be larger at diagnosis and more prone to metastatic disease than other tumors. This presentation contrasts with the behavior of some cell line models of SDHB impairment, which show reduced growth compared to wild type. We hypothesize that reduced growth of SDHB-impaired monolayer culture models might reflect lack of support from sources within the tumor microenvironment. The present study therefore investigates how the microenvironment, modeled here by fibroblast co-culture, modulates cell metabolism, growth and invasion in an Sdhb-impaired mouse pheochromocytoma cell line. We employed two different constructs of short hairpin RNA to knockdown Sdhb and compared growth in a monolayer with and without fibroblast co-culture. Sdhb-silenced cells showed functional impairment of SDH with elevated succinate to fumarate ratio and decreased oxidative capacity. Cell growth was delayed with an increase in doubling time of 2 h or 20 h. Clonogenic cell survival and viability, on the other hand, were either unchanged or increased compared to control. In standard monolayer culture, no differences in pro-metastatic features were present. Co-culture with primary mouse fibroblast reversed the difference of proliferation between control and Sdhb knockdown but was unable to significantly influence invasiveness under these culture conditions. Metabolic studies identified that lactate secreted by fibroblasts was taken up preferentially by Sdhb-silenced cells. In summary, the present study identified a potential role for the tumor microenvironment in influencing phenotypic features of SDHB-mutated PGLs, providing a basis for the use of therapies targeted towards the tumor microenvironment
Variations on the Author
“Variations on the Author” discusses two of Eduardo Coutinho’s recent films (Um Dia na Vida, from 2010, and Últimas Conversas, posthumously released in 2015) and their contribution to the general question of documentary authorship. The director’s filmography is characterized by a consistent yet self-effacing form of authorial self-inscription: Coutinho often features as an interviewer that rather than express opinions propels discourses; an interviewer that is good at listening. This mode of self-inscription characterizes him as an author who is not expressive but who is nonetheless markedly present on the screen. In Um Dia na Vida, however, Coutinho is completely absent form the image, while Últimas Conversas, on the contrary, includes a confessional prologue that moves the director from the margins to the center of his films. This article examines the ways in which these works stand out in the filmography of a director who offers new insights into the notion of cinematic authorship
Appropriate Similarity Measures for Author Cocitation Analysis
We provide a number of new insights into the methodological discussion about author cocitation analysis. We first argue that the use of the Pearson correlation for measuring the similarity between authors’ cocitation profiles is not very satisfactory. We then discuss what kind of similarity measures may be used as an alternative to the Pearson correlation. We consider three similarity measures in particular. One is the well-known cosine. The other two similarity measures have not been used before in the bibliometric literature. Finally, we show by means of an example that our findings have a high practical relevance.information science;Pearson correlation;cosine;similarity measure;author cocitation analysis
Dispelling the Myths Behind First-author Citation Counts
We conducted a full-scale evaluative citation analysis study of scholars in the XML research field to explore just how different from each other author rankings resulting from different citation counting methods actually are, and to demonstrate the capability of emerging data and tools on the Web in supporting more realistic citation counting methods. Our results contest some common arguments for the continued
use of first-author citation counts in the evaluation of scholars, such as high correlations between author rankings by first-author citation counts and other citation
counting methods, and high costs of using more realistic citation counting methods that are not well-supported by the ISI databases. It is argued that increasingly available digital full text research papers make it possible for citation analysis studies to go beyond what the ISI databases have directly supported and to employ more
sophisticated methods
koamabayili/VECTRON-author-checklist: VECTRON author checklist
We have done our best to complete the author checklist relating to the use of animals in the hut study. Note that the objective for the hut study was to evaluate the IRS treatment applications for residual efficacy against Anopheles mosquitoes, including the local An. coluzzii mosquito population. Cows were only used to attract mosquitoes into the huts and no tests were carried out directly on the cows. The author checklist is intended for use with studies where experiments are carried out on animals, which is why we have had such difficulty in completing this for the hut study, as many of the questions do not relate to how the cows were used
Einfluss von ephrin-A1 auf das Proliferations- sowie Migrationsverhalten von Endothelzellen
Die Eph-Familie, welche die Eph-Rezeptoren und die ephrin-Liganden umfasst, repräsentiert die größte Subgruppe der Rezeptortyrosinkinasen. Sowohl die Eph-Rezeptoren als auch die ephrin-Liganden sind Membran-assoziierte Proteine, deren Interaktion einen Typ der Zellkontakt-vermittelten Kommunikation darstellt und vielfältigste zelluläre Funktionen beeinflusst. Die aktuellen Eph/ephrin-bezogenen Forschungsschwerpunkte liegen vor allem im Bereich der Entwicklungs- und Tumorbiologie, wie z.B. dem Einfluss der Eph-Familie auf Angiogenese und Axonaussprossung. Die Rolle des Eph/ephrin-Systems in der Entwicklung der Atherosklerose und bei Reparaturmechanismen wie der Reendothelialisierung ist jedoch noch weitgehend unerforscht. Die vorliegende Arbeit befasst sich anhand von in vitro Experimenten mit HUVEC und HUAEC mit dem Einfluss des Liganden ephrin-A1 und des Rezeptors EphA2 auf die endotheliale Proliferation und Migration als elementare Mechanismen der Reendothelialisierung.:INHALTSVERZEICHNIS I
ABKÜRZUNGSVERZEICHNIS V
ABBILDUNGSVERZEICHNIS IX
TABELLENVERZEICHNIS XI
1 EINLEITUNG 1
1.1 Die Rolle des Endothels in der Atherosklerose 1
1.2 Die Migration von Endothelzellen 6
1.3 Die Eph-Familie 9
1.4 Potentielle Funktionen der Eph-Familie in der endothelialen Proliferation und Migration 14
1.5 Zielstellung der Arbeit 16
2 MATERIAL 17
2.1 Geräte 17
2.2 Zellkulturmaterial 18
2.3 Verwendete Kulturmedien 18
2.4 Verwendete Zelllinien und E. coli Stämme 19
2.5 Verwendete Kit-Systeme 19
2.6 Verwendete Oligonukleotide 20
2.7 Verwendete Plasmide 21
2.8 Konstruierte Plasmide 23
2.9 Chemikalien 23
2.10 Puffer, Gele, Lösungen 23
3 METHODEN 24
3.1 Zellbiologische Methoden 24
3.2 Proteinbiochemische Methoden 28
3.3 Molekularbiologische und gentechnische Methoden 32
3.4 Scratch Assay 44
3.5 Beurteilung der Zellproliferation mittels BrdU-Inkorporation 44
3.6 Wundheilungsassay 45
3.7 Migrationsassay 48
3.8 Baculovirale Talin-RFP- und Aktin-GFP-Expression 49
3.9 Datenanalyse und statistische Auswertung 49
4 ERGEBNISSE 50
4.1 Molekularbiologische und proteinbiochemische Charakterisierung verschiedener Eph/ephrine in proliferierenden Endothelzellen 50
4.2 Molekularbiologische Charakterisierung von ephrin-A1, EphA2 und EphA4 unter Kontaktinhibition in HUVEC 56
4.3 Einfluss eines Zellzyklusarrests auf die Expression verschiedener ephrin-Liganden und Eph-Rezeptoren in Endothelzellen 58
4.4 Hemmung von ephrin-A1 und EphA2 mittels siRNA 63
4.5 Einfluss einer siRNA-vermittelten Hemmung von ephrin-A1 und EphA2 auf die Proliferation von HUVEC 65
4.6 Überexpression von ephrin-A1 mittels eines adenoviralen Vektors 67
4.7 Einfluss einer Überexpression von ephrin-A1 auf die Proliferation von HUVEC 68
4.8 Reinitiation von Proliferation und Migration in HUVEC mittels Scratch Assay 69
4.9 Einfluss der Modulation des ephrin-A1- sowie EphA2-Gehaltes auf das Wundheilungsverhalten von HUVEC 73
4.10 Charakterisierung des Migrationsverhaltens von HUVEC unter veränderter ephrin-A1-Expression mittels live cell imaging 75
4.11 Einfluss einer veränderten ephrin-A1-Expression auf den EphA2-Phosphorylierungsstatus 78
4.12 Grenzzonenverhalten von HUVEC an ephrin-A1-beschichteten Oberflächen 80
4.13 Fluoreszenzmikroskopische Charakterisierung fokaler Adhäsionen und des Aktin-Zytoskelettes unter modulierter ephrin A1 Expression 81
5 DISKUSSION 84
5.1 Die Eph-Familie im Kontext der Reendothelialisierung 84
5.2 Einfluss des Eph/ephrin Systems auf das Proliferationsverhalten von Zellen 86
5.3 Auswirkungen einer ephrin-A1-EphA2-Wechselwirkung auf die Proliferation 90
5.4 Einfluss der Eph-Familie auf die zelluläre Migration und Wundheilung 93
5.5 Zusammenfassende Betrachtung und Ausblick 106
6 ZUSAMMENFASSUNG 109
6.1 In deutscher Sprache 109
6.2 In englischer Sprache 111
7 LITERATURVERZEICHNIS 113
8 DANKSAGUNG 133
9 ANHANG 134
10 ERKLÄRUNGEN 138
10.1 Erklärungen zur Eröffnung des Promotionsverfahrens 138
10.2 Erklärung über die Einhaltung der aktuellen gesetzlichen Vorgaben im Rahmen der Dissertation 140The Eph-family represents the largest subgroup of tyrosine kinase receptors. Both the Eph-receptors and the ephrin-ligands are membrane-associated proteins whose interaction is a way of contact-dependent communication that influences a wide variety of cellular functions. In scientific research the Eph-family is known for its impact on developmental and tumour-biology, whereas the role of Eph-receptors and ephrin-ligands in atherosclerosis and repair mechanisms is still not well understood. The aim of the present study was to examine the influence of the ligand ephrin-A1 and its interaction with its receptor EphA2 on endothelial proliferation and migration by performing cellcultural experimentation using HUVEC and HUAEC.:INHALTSVERZEICHNIS I
ABKÜRZUNGSVERZEICHNIS V
ABBILDUNGSVERZEICHNIS IX
TABELLENVERZEICHNIS XI
1 EINLEITUNG 1
1.1 Die Rolle des Endothels in der Atherosklerose 1
1.2 Die Migration von Endothelzellen 6
1.3 Die Eph-Familie 9
1.4 Potentielle Funktionen der Eph-Familie in der endothelialen Proliferation und Migration 14
1.5 Zielstellung der Arbeit 16
2 MATERIAL 17
2.1 Geräte 17
2.2 Zellkulturmaterial 18
2.3 Verwendete Kulturmedien 18
2.4 Verwendete Zelllinien und E. coli Stämme 19
2.5 Verwendete Kit-Systeme 19
2.6 Verwendete Oligonukleotide 20
2.7 Verwendete Plasmide 21
2.8 Konstruierte Plasmide 23
2.9 Chemikalien 23
2.10 Puffer, Gele, Lösungen 23
3 METHODEN 24
3.1 Zellbiologische Methoden 24
3.2 Proteinbiochemische Methoden 28
3.3 Molekularbiologische und gentechnische Methoden 32
3.4 Scratch Assay 44
3.5 Beurteilung der Zellproliferation mittels BrdU-Inkorporation 44
3.6 Wundheilungsassay 45
3.7 Migrationsassay 48
3.8 Baculovirale Talin-RFP- und Aktin-GFP-Expression 49
3.9 Datenanalyse und statistische Auswertung 49
4 ERGEBNISSE 50
4.1 Molekularbiologische und proteinbiochemische Charakterisierung verschiedener Eph/ephrine in proliferierenden Endothelzellen 50
4.2 Molekularbiologische Charakterisierung von ephrin-A1, EphA2 und EphA4 unter Kontaktinhibition in HUVEC 56
4.3 Einfluss eines Zellzyklusarrests auf die Expression verschiedener ephrin-Liganden und Eph-Rezeptoren in Endothelzellen 58
4.4 Hemmung von ephrin-A1 und EphA2 mittels siRNA 63
4.5 Einfluss einer siRNA-vermittelten Hemmung von ephrin-A1 und EphA2 auf die Proliferation von HUVEC 65
4.6 Überexpression von ephrin-A1 mittels eines adenoviralen Vektors 67
4.7 Einfluss einer Überexpression von ephrin-A1 auf die Proliferation von HUVEC 68
4.8 Reinitiation von Proliferation und Migration in HUVEC mittels Scratch Assay 69
4.9 Einfluss der Modulation des ephrin-A1- sowie EphA2-Gehaltes auf das Wundheilungsverhalten von HUVEC 73
4.10 Charakterisierung des Migrationsverhaltens von HUVEC unter veränderter ephrin-A1-Expression mittels live cell imaging 75
4.11 Einfluss einer veränderten ephrin-A1-Expression auf den EphA2-Phosphorylierungsstatus 78
4.12 Grenzzonenverhalten von HUVEC an ephrin-A1-beschichteten Oberflächen 80
4.13 Fluoreszenzmikroskopische Charakterisierung fokaler Adhäsionen und des Aktin-Zytoskelettes unter modulierter ephrin A1 Expression 81
5 DISKUSSION 84
5.1 Die Eph-Familie im Kontext der Reendothelialisierung 84
5.2 Einfluss des Eph/ephrin Systems auf das Proliferationsverhalten von Zellen 86
5.3 Auswirkungen einer ephrin-A1-EphA2-Wechselwirkung auf die Proliferation 90
5.4 Einfluss der Eph-Familie auf die zelluläre Migration und Wundheilung 93
5.5 Zusammenfassende Betrachtung und Ausblick 106
6 ZUSAMMENFASSUNG 109
6.1 In deutscher Sprache 109
6.2 In englischer Sprache 111
7 LITERATURVERZEICHNIS 113
8 DANKSAGUNG 133
9 ANHANG 134
10 ERKLÄRUNGEN 138
10.1 Erklärungen zur Eröffnung des Promotionsverfahrens 138
10.2 Erklärung über die Einhaltung der aktuellen gesetzlichen Vorgaben im Rahmen der Dissertation 14
Author-wise bibliometric analysis based on entropy.
Author-wise bibliometric analysis based on entropy.</p
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