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Analyse génétique et moléculaire des interactions plante-plante modulant la sensibilité à la septoriose dans des mélanges intraspécifiques de blé
No full textCultivar mixtures are increasingly recognized for their potential to enhance yield stability and reduce disease severity in crops, making them a growing practice and an increasingly studied research topic. While reduced plant susceptibility to pathogens in mixtures has traditionally been attributed to epidemiological processes, a novel mechanism involving plant-plant interactions has recently been identified as a modulator of disease severity. This thesis aims to uncover the physiological and genetic drivers behind these interactions, with a focus on how wheat susceptibility to Zymoseptoria tritici is modulated in binary mixtures. To achieve this, this thesis investigates the genetic determinants of plant-plant interactions, analyzes wheat responses to neighboring plants, and identifies the nature of signals exchanged between plants in intraspecific wheat mixtures. This work is part of the national research project MoBiDiv (MObilizing and Breeding Intra and inter-specific crop DIVersity for a systemic change towards pesticide-free agriculture). By employing a novel deep-learning-based image analysis, we first confirmed the hypothesis that wheat varietal mixtures modulate Septoria severity through specific plant-plant interactions, affecting the mean and variance of symptoms. Secondly, we developed a novel GWAS approach to simultaneously analyze the two plants composing the mixture, thereby enabling the detection of allelic interactions between different loci. This first co-GWAS between two plants allowed the identification of intergenomic epistatic interactions with significant effects on Septoria severity and biomass. Finally, we demonstrated that in two binary mixture models, the modulation of severity to Septoria is associated with transcriptomic and metabolomic changes due to root signals from a specific neighboring genotype. The findings provide novel insights into the complex architecture of plant-plant interactions in wheat mixtures, offering promising prospects for the improvement of mixture design with the objective of optimizing disease resistance and crop performance.Les mélanges variétaux sont de plus en plus reconnus pour leur potentiel à améliorer la stabilité des rendements et à réduire la sévérité des maladies, ce qui en fait une pratique en forte croissance et un sujet de recherche en plein essor. Alors que la réduction de la sensibilité des plantes aux pathogènes dans les mélanges a traditionnellement été attribuée à des processus épidémiologiques, un nouveau mécanisme impliquant des interactions plante-plante a récemment été identifié comme modulateur de la sévérité des maladies. Cette thèse vise à élucider les mécanismes physiologiques et génétiques sous-jacents à ces interactions, en se concentrant sur comment la sensibilité du blé à Zymoseptoria tritici est modulée dans les mélanges binaires. Pour cela, cette thèse explore les déterminants génétiques des interactions entre plantes, analyse les réponses du blé à ses voisins, et identifie la nature des signaux échangés entre plantes dans les mélanges intraspécifiques de blé. Ce travail s’inscrit dans le cadre du projet national de recherche MoBiDiv (mobiliser et sélectionner la diversité cultivée intra et inter-spécifique pour un changement systémique vers une agriculture sans pesticide). Grâce à une nouvelle méthode d’analyse d'images basée sur du deep learning, nous avons d'abord confirmé l'hypothèse selon laquelle les mélanges variétaux de blé modulent la sévérité de la septoriose par des interactions plante-plante spécifiques, affectant la moyenne et la variance des symptômes. Ensuite, nous avons développé une approche innovante de GWAS permettant d’analyser simultanément les deux plantes composant le mélange, ce qui a rendu possible la detection d’interactions alléliques entre différents loci. Cette première co-GWAS entre deux plantes a permis l'identification d’interactions épistatiques intergénomiques ayant des effets significatifs sur la sévérité de la septoriose et la biomasse. Enfin, nous avons démontré que, dans deux modèles de mélange binaire, la modulation de la sévérité de la septoriose est associée à des changements transcriptomiques et métabolomiques induits par des signaux racinaires d’un génotype voisin particulier. Ces résultats fournissent de nouvelles connaissances sur l’architecture complexe des interactions plante-plante dans les mélanges de blé et ouvrent des perspectives prometteuses pour améliorer la conception des mélanges, dans le but d’optimiser la résistance aux maladies et les performances des cultures
Analyse génétique et moléculaire des interactions plante-plante modulant la sensibilité à la septoriose dans des mélanges intraspécifiques de blé
No full textCultivar mixtures are increasingly recognized for their potential to enhance yield stability and reduce disease severity in crops, making them a growing practice and an increasingly studied research topic. While reduced plant susceptibility to pathogens in mixtures has traditionally been attributed to epidemiological processes, a novel mechanism involving plant-plant interactions has recently been identified as a modulator of disease severity. This thesis aims to uncover the physiological and genetic drivers behind these interactions, with a focus on how wheat susceptibility to Zymoseptoria tritici is modulated in binary mixtures. To achieve this, this thesis investigates the genetic determinants of plant-plant interactions, analyzes wheat responses to neighboring plants, and identifies the nature of signals exchanged between plants in intraspecific wheat mixtures. This work is part of the national research project MoBiDiv (MObilizing and Breeding Intra and inter-specific crop DIVersity for a systemic change towards pesticide-free agriculture). By employing a novel deep-learning-based image analysis, we first confirmed the hypothesis that wheat varietal mixtures modulate Septoria severity through specific plant-plant interactions, affecting the mean and variance of symptoms. Secondly, we developed a novel GWAS approach to simultaneously analyze the two plants composing the mixture, thereby enabling the detection of allelic interactions between different loci. This first co-GWAS between two plants allowed the identification of intergenomic epistatic interactions with significant effects on Septoria severity and biomass. Finally, we demonstrated that in two binary mixture models, the modulation of severity to Septoria is associated with transcriptomic and metabolomic changes due to root signals from a specific neighboring genotype. The findings provide novel insights into the complex architecture of plant-plant interactions in wheat mixtures, offering promising prospects for the improvement of mixture design with the objective of optimizing disease resistance and crop performance.Les mélanges variétaux sont de plus en plus reconnus pour leur potentiel à améliorer la stabilité des rendements et à réduire la sévérité des maladies, ce qui en fait une pratique en forte croissance et un sujet de recherche en plein essor. Alors que la réduction de la sensibilité des plantes aux pathogènes dans les mélanges a traditionnellement été attribuée à des processus épidémiologiques, un nouveau mécanisme impliquant des interactions plante-plante a récemment été identifié comme modulateur de la sévérité des maladies. Cette thèse vise à élucider les mécanismes physiologiques et génétiques sous-jacents à ces interactions, en se concentrant sur comment la sensibilité du blé à Zymoseptoria tritici est modulée dans les mélanges binaires. Pour cela, cette thèse explore les déterminants génétiques des interactions entre plantes, analyse les réponses du blé à ses voisins, et identifie la nature des signaux échangés entre plantes dans les mélanges intraspécifiques de blé. Ce travail s’inscrit dans le cadre du projet national de recherche MoBiDiv (mobiliser et sélectionner la diversité cultivée intra et inter-spécifique pour un changement systémique vers une agriculture sans pesticide). Grâce à une nouvelle méthode d’analyse d'images basée sur du deep learning, nous avons d'abord confirmé l'hypothèse selon laquelle les mélanges variétaux de blé modulent la sévérité de la septoriose par des interactions plante-plante spécifiques, affectant la moyenne et la variance des symptômes. Ensuite, nous avons développé une approche innovante de GWAS permettant d’analyser simultanément les deux plantes composant le mélange, ce qui a rendu possible la detection d’interactions alléliques entre différents loci. Cette première co-GWAS entre deux plantes a permis l'identification d’interactions épistatiques intergénomiques ayant des effets significatifs sur la sévérité de la septoriose et la biomasse. Enfin, nous avons démontré que, dans deux modèles de mélange binaire, la modulation de la sévérité de la septoriose est associée à des changements transcriptomiques et métabolomiques induits par des signaux racinaires d’un génotype voisin particulier. Ces résultats fournissent de nouvelles connaissances sur l’architecture complexe des interactions plante-plante dans les mélanges de blé et ouvrent des perspectives prometteuses pour améliorer la conception des mélanges, dans le but d’optimiser la résistance aux maladies et les performances des cultures
Analyse génétique et moléculaire des interactions plante-plante modulant la sensibilité à la septoriose dans des mélanges intraspécifiques de blé
No full textCultivar mixtures are increasingly recognized for their potential to enhance yield stability and reduce disease severity in crops, making them a growing practice and an increasingly studied research topic. While reduced plant susceptibility to pathogens in mixtures has traditionally been attributed to epidemiological processes, a novel mechanism involving plant-plant interactions has recently been identified as a modulator of disease severity. This thesis aims to uncover the physiological and genetic drivers behind these interactions, with a focus on how wheat susceptibility to Zymoseptoria tritici is modulated in binary mixtures. To achieve this, this thesis investigates the genetic determinants of plant-plant interactions, analyzes wheat responses to neighboring plants, and identifies the nature of signals exchanged between plants in intraspecific wheat mixtures. This work is part of the national research project MoBiDiv (MObilizing and Breeding Intra and inter-specific crop DIVersity for a systemic change towards pesticide-free agriculture). By employing a novel deep-learning-based image analysis, we first confirmed the hypothesis that wheat varietal mixtures modulate Septoria severity through specific plant-plant interactions, affecting the mean and variance of symptoms. Secondly, we developed a novel GWAS approach to simultaneously analyze the two plants composing the mixture, thereby enabling the detection of allelic interactions between different loci. This first co-GWAS between two plants allowed the identification of intergenomic epistatic interactions with significant effects on Septoria severity and biomass. Finally, we demonstrated that in two binary mixture models, the modulation of severity to Septoria is associated with transcriptomic and metabolomic changes due to root signals from a specific neighboring genotype. The findings provide novel insights into the complex architecture of plant-plant interactions in wheat mixtures, offering promising prospects for the improvement of mixture design with the objective of optimizing disease resistance and crop performance.Les mélanges variétaux sont de plus en plus reconnus pour leur potentiel à améliorer la stabilité des rendements et à réduire la sévérité des maladies, ce qui en fait une pratique en forte croissance et un sujet de recherche en plein essor. Alors que la réduction de la sensibilité des plantes aux pathogènes dans les mélanges a traditionnellement été attribuée à des processus épidémiologiques, un nouveau mécanisme impliquant des interactions plante-plante a récemment été identifié comme modulateur de la sévérité des maladies. Cette thèse vise à élucider les mécanismes physiologiques et génétiques sous-jacents à ces interactions, en se concentrant sur comment la sensibilité du blé à Zymoseptoria tritici est modulée dans les mélanges binaires. Pour cela, cette thèse explore les déterminants génétiques des interactions entre plantes, analyse les réponses du blé à ses voisins, et identifie la nature des signaux échangés entre plantes dans les mélanges intraspécifiques de blé. Ce travail s’inscrit dans le cadre du projet national de recherche MoBiDiv (mobiliser et sélectionner la diversité cultivée intra et inter-spécifique pour un changement systémique vers une agriculture sans pesticide). Grâce à une nouvelle méthode d’analyse d'images basée sur du deep learning, nous avons d'abord confirmé l'hypothèse selon laquelle les mélanges variétaux de blé modulent la sévérité de la septoriose par des interactions plante-plante spécifiques, affectant la moyenne et la variance des symptômes. Ensuite, nous avons développé une approche innovante de GWAS permettant d’analyser simultanément les deux plantes composant le mélange, ce qui a rendu possible la detection d’interactions alléliques entre différents loci. Cette première co-GWAS entre deux plantes a permis l'identification d’interactions épistatiques intergénomiques ayant des effets significatifs sur la sévérité de la septoriose et la biomasse. Enfin, nous avons démontré que, dans deux modèles de mélange binaire, la modulation de la sévérité de la septoriose est associée à des changements transcriptomiques et métabolomiques induits par des signaux racinaires d’un génotype voisin particulier. Ces résultats fournissent de nouvelles connaissances sur l’architecture complexe des interactions plante-plante dans les mélanges de blé et ouvrent des perspectives prometteuses pour améliorer la conception des mélanges, dans le but d’optimiser la résistance aux maladies et les performances des cultures
Analysis of Mathieu Equation Stable Solutions in the First Zone of Stability
No full textAbstractThe paper presents the results of a homogeneous Mathieu equation studies. Mathieu equation solutions are oscillations, modulated in amplitude and frequency. In the computational experiments we found dependences of the given oscillations on the ratio of the coefficients. These dependences are shown in graphs that can be used for an approximate estimation of the Mathieu equation solutions without integration
Pensar las escalas para pensar las luchas: Autor: Mathieu UHEL
No full textA través de un título sugerente, “pensar las escalas para pensar las luchas”, Mathieu Uhel entreteje la construcción teórico-crítica del concepto escala, generada por la geografía radical anglosajona de finales del siglo XX, con la necesidad/utilidad práctica de la escala para concienciar las luchas sociales. El artículo cumple un doble propósito: por un lado, delinear los elementos de lectura sobre el concepto escala; y, con ello, promover la atención de esta problemática en las luchas contemporáneas. En un primer apartado, Uhel ubica las discusiones académicas en torno a la escala, como herramienta metodológica útil para comprender la complejidad de las sociedades capitalistas; en el segundo apartado, el autor avanza la exposición en torno al contexto de la dimensión escalar del imperialismo capitalista; finalmente, el autor se centra en el rol de la actividad política a escala nacional en la tensa relación entre las imposiciones del capital y la lucha social.Por meio de um título sugestivo, “pensando escalas para pensar lutas”, Mathieu Uhel entrelaça a construção teórico-crítica do conceito de escala, gerado pela geografia radical anglo-saxônica do final do século XX, com a necessidade / utilidade prática escala para aumentar a consciência das lutas sociais. O artigo tem um duplo propósito: por um lado, delinear os elementos de leitura sobre o conceito de escala; e, com isso, promover atenção a esse problema nas lutas contemporâneas. Na primeira seção, Uhel localiza as discussões acadêmicas em torno da escala, como uma ferramenta metodológica útil para compreender a complexidade das sociedades capitalistas; na segunda seção, o autor avança a exposição em torno do contexto da dimensão escalar do imperialismo capitalista; por fim, o autor enfoca o papel da atividade política em escala nacional na tensa relação entre as imposições do capital e a luta social.Mathieu Uhel\u27s suggestive title, “Thinking about scales to think about struggles”, he interweaves the theoretical-critical construction of concept scale, generated by radical Anglo-Saxon geography in the late 20th century, with it´s practical utility to social struggles. The article serves two purposes: on the one hand, Uhel locates academic discussion around scale; and, with this, he promotes attention to this problem in contemporary struggles. In the first section, Uhel locates academic discussions around scale, as a useful methodological tool to understand the complexity of capitalist societies; in the second section, the author advances the argument around the context of the scalar dimension of capitalist imperialism; finally, the author focuses on the role of political activity on a national scale in the tense relationship between the impositions of capital and the social movement
Les médias et les TIC dans le Programme de formation de l’école québécoise
No full textÀ la suite du colloque du 23 octobre, Éduquer aux médias : une priorité collective — un événement organisé par Normand Landry, Anne-Sophie Letellier, Mario Richard, Christian Agbobli et Raymond Corriveau, présenté par le Conseil de presse et la TÉLUQ — un ouvrage réunissant des essais de plusieurs horizons fera le point sur ces questions.
Les contributeurs : Christian Agbobli ; Guy Amyot ; Mathieu Bégin ; Raymond Corriveau ; Martine Delvaux ; Michael Hoechsmann ; Normand Landry ; Anne-Sophie Letellier ; Thierry Plante ; Mario Richard ; Leslie Regan Shade ; Tamara Shepherd ; Simon Tremblay-Pepin et Carolyn Wilson.
Le livre : Éducation aux médias : fondations, enjeux et perspectives. Sous la direction de Normand Landry et Anne-Sophie Letellier. PUM, 2017
Mathieu Ichou, Les Enfants d’immigrés à l’école
No full textIt is common to hear in the fields of educational and immigration sociology that on average, the children of immigrants do not perform as well in school as children of native-born parents. Mathieu Ichou offers an innovative sociological analysis on a topic that is heavily exploited by political and media discourse, and subject to much scientific controversy. The author takes distance from the homogenized vision of a “second generation” of students who have totally failed academically, and rep..
Essai sur la modélisation des interactions entre la croissance et le développement d'une plante- Cas du modèle GreenLab
No full textBASED ON AMAP MODEL, GREENLAB IS A PLANT GROWTH MODEL COMBINING BOTH ARCHITECTURE AND FUNCTIONING. SOME IMPROVEMENTS IN THE PLANT GROWTH MODELING ARE PRESENTED HERE, BY INTEGRATING INTERACTIONS BETWEEN ORGANOGENESIS AND PHOTOSYNTHESIS. ACCORDING THE ENVIRONMENTAL CONDITIONS, PLANT PRODUCES MORE OR LESS BIOMASS, WHICH MODIFIES NOT ONLY ORGANS VOLUMES BUT ALSO THEIR NUMBERS (SIZE OF THE BRANCHING SYSTEM, NUMBER OF FRUITS). TAKING THESE PHENOMENA INTO ACCOUNT ALLOW TO REPRESENT DIFFERENT PHASIS OF PLANT GROWTH OR PLANT PLASTICITY IN ITS ENVIRONMENT THANKS TO ONE VARIABLE, THE RATIO OF BIOMASS DIVIDED BY DEMAND. THE LATTER HAS BEEN CHOSEN AS A FACTOR CONTROLLING DIFFERENT EVENTS IN THE PLANT GROWTH.LE MODELE GREENLAB COMBINE LA MODELISATION DE L'ARCHITECTURE ET DU FONCTIONNEMENT DES PLANTES. BASE SUR DES OBSERVATIONS BOTANIQUES, DANS LA SUITE DES MODELES AMAP, IL EST ECRIT SOUS FORME D'UN SYSTEME DYNAMIQUE DISCRET.LES TRAVAUX DE CETTE THESE VISENT A AMELIORER LA MODELISATION DE LA CROISSANCE EN INTEGRANT LES INTERACTIONS ENTRE LA CROISSANCE ET LE DEVELOPPEMENT. EN FONCTION DES CONDITIONS EXTERIEURES, LA PLANTE PRODUIT PLUS OU MOINS DE MATIERE, CE QUI A UNE INFLUENCE NON SEULEMENT SUR LE VOLUME DE SES ORGANES, MAIS AUSSI SUR LEUR NOMBRE (FEUILLES, FRUITS), SUR LA RAMIFICATION ET SUR LES CARACTERISTIQUES FONCTIONNELLES DE CERTAINS ORGANES. LA PRISE EN COMPTE DE CES PHENOMENES PERMET DE REPRESENTER LES DIFFERENTES PHASES DE CROISSANCE D'UN ARBRE OU LES CAPACITES D'ADAPTATION D'UNE PLANTE DANS SON ENVIRONNEMENT, CELA GRACE A L'EVOLUTION DYNAMIQUE DU RAPPORT DE L'OFFFRE SUR LA DEMANDE, VARIABLE DE CONTROLE DES DIFFERENTS EVENEMENTS DUS AUX INTERACTIONS ENTRE LA CROISSANCE ET LE DEVELOPPEMENT.LA CROISSANCE DE LA PLANTE EST MODELISEE DE MANIERE DISCRETE. L'ECRITUTE DU SYSTEME DYNAMIQUE DISCRET CORRESPONDANT A L'AIDE D'UN FORMALISME ADAPTE PERMET DE MENER DES ETUDES DE COMPORTEMENT DU MODELE, ET DE TESTER LA SENSIBILITE AUX PARAMETRES.CE MODELE CONCEPTUEL DE CROISSANCE DE PLANTES PEUT ETRE APPLIQUEE A DIFFERENTES PLANTES REELLES EN CHERCHANT DES JEUX DE PARAMETRES D'ENTREE DU MODELE PERMETTANT DE REPRODUIRE AU MIEUX LA CROISSANCE DE CES PLANTES.
Essai sur la modélisation des interactions entre la croissance et le développement d'une plante- Cas du modèle GreenLab
No full textBASED ON AMAP MODEL, GREENLAB IS A PLANT GROWTH MODEL COMBINING BOTH ARCHITECTURE AND FUNCTIONING. SOME IMPROVEMENTS IN THE PLANT GROWTH MODELING ARE PRESENTED HERE, BY INTEGRATING INTERACTIONS BETWEEN ORGANOGENESIS AND PHOTOSYNTHESIS. ACCORDING THE ENVIRONMENTAL CONDITIONS, PLANT PRODUCES MORE OR LESS BIOMASS, WHICH MODIFIES NOT ONLY ORGANS VOLUMES BUT ALSO THEIR NUMBERS (SIZE OF THE BRANCHING SYSTEM, NUMBER OF FRUITS). TAKING THESE PHENOMENA INTO ACCOUNT ALLOW TO REPRESENT DIFFERENT PHASIS OF PLANT GROWTH OR PLANT PLASTICITY IN ITS ENVIRONMENT THANKS TO ONE VARIABLE, THE RATIO OF BIOMASS DIVIDED BY DEMAND. THE LATTER HAS BEEN CHOSEN AS A FACTOR CONTROLLING DIFFERENT EVENTS IN THE PLANT GROWTH.LE MODELE GREENLAB COMBINE LA MODELISATION DE L'ARCHITECTURE ET DU FONCTIONNEMENT DES PLANTES. BASE SUR DES OBSERVATIONS BOTANIQUES, DANS LA SUITE DES MODELES AMAP, IL EST ECRIT SOUS FORME D'UN SYSTEME DYNAMIQUE DISCRET.LES TRAVAUX DE CETTE THESE VISENT A AMELIORER LA MODELISATION DE LA CROISSANCE EN INTEGRANT LES INTERACTIONS ENTRE LA CROISSANCE ET LE DEVELOPPEMENT. EN FONCTION DES CONDITIONS EXTERIEURES, LA PLANTE PRODUIT PLUS OU MOINS DE MATIERE, CE QUI A UNE INFLUENCE NON SEULEMENT SUR LE VOLUME DE SES ORGANES, MAIS AUSSI SUR LEUR NOMBRE (FEUILLES, FRUITS), SUR LA RAMIFICATION ET SUR LES CARACTERISTIQUES FONCTIONNELLES DE CERTAINS ORGANES. LA PRISE EN COMPTE DE CES PHENOMENES PERMET DE REPRESENTER LES DIFFERENTES PHASES DE CROISSANCE D'UN ARBRE OU LES CAPACITES D'ADAPTATION D'UNE PLANTE DANS SON ENVIRONNEMENT, CELA GRACE A L'EVOLUTION DYNAMIQUE DU RAPPORT DE L'OFFFRE SUR LA DEMANDE, VARIABLE DE CONTROLE DES DIFFERENTS EVENEMENTS DUS AUX INTERACTIONS ENTRE LA CROISSANCE ET LE DEVELOPPEMENT.LA CROISSANCE DE LA PLANTE EST MODELISEE DE MANIERE DISCRETE. L'ECRITUTE DU SYSTEME DYNAMIQUE DISCRET CORRESPONDANT A L'AIDE D'UN FORMALISME ADAPTE PERMET DE MENER DES ETUDES DE COMPORTEMENT DU MODELE, ET DE TESTER LA SENSIBILITE AUX PARAMETRES.CE MODELE CONCEPTUEL DE CROISSANCE DE PLANTES PEUT ETRE APPLIQUEE A DIFFERENTES PLANTES REELLES EN CHERCHANT DES JEUX DE PARAMETRES D'ENTREE DU MODELE PERMETTANT DE REPRODUIRE AU MIEUX LA CROISSANCE DE CES PLANTES.
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