1,721,136 research outputs found
รูปแบบการแสดงออกของโปรตีนในซีรัมของผู้ป่วยโรคไวรัสตับอักเสบบีชนิดเรื้อรัง ก่อนและหลังรับการรักษาด้วยยา PEG-Interferon alfa-2b
Get PDFThesis (M.Sc.)--Chulalongkorn University, 2011Chronic hepatitis B (CHB) virus infection may develop to liver fibrosis, cirrhosis, and hepatocellular carcinoma, and the disease remains a public health problem worldwide. Immunomodulatory therapies such as pegylated interferon is a major approach for the treatment of CHB patients but only 30% of them response to IFN type I treatment. Proteomic approach was employed to analyze the serum proteome in CHB patients receiving PEG-Interferon alfa-2b to predict treatment response. Nineteen patients with HBeAg + CHB were included. These patients were followed up for more than 3 years after treatment and were defined as sustained responders (n=9) and non responders (n=10). The 2-DE and MS/MS analysis were performed to compare the serum proteome before, after initial PEG-Interferon alfa-2b treatment for 24 weeks and 48 weeks. Quantitative intensity of 2-D gel from patients of the two groups before treatment showed 7 differentially expressed proteins. In addition, 13 protein spots were found to significantly changed in sustained responders, and 6 protein spots significantly changed at the end of the 24-week in nonresponders. These proteins are including CD5 antigen-like precursor, α-2-HS-glycoprotein and Apolipoprotein A-I. Functional characterizations of all proteins with respect to immunity protection, lipid metabolism, and acute phase protein.การติดเชื้อไวรัสตับอักเสบบีเรื้อรังอาจจะพัฒนาไปเป็นผังผืดในตับโรคตับแข็งและมะเร็งตับ และเป็นปัญหาทางด้านสาธารณสุขของประชาชนทั่วโลก วิธีการรักษาผู้ป่วยติดเชื้อไวรัสตับอักเสบบีเรื้อรังคือการรักษาด้วยภูมิคุ้มกันเช่น ยา PEG-Interferon alfa-2b แต่มีเพียง 30 %ของผู้ป่วยที่ตอบสนองต่อการรักษา คณะผู้วิจัยจึงใช้วิธีทางโปรติโอมิกมาศึกษาโปรตีนในซีรัมของผู้ป่วยติดเชื้อไวรัสตับอักเสบบีเรื้อรัง 19 คนที่ได้รับการรักษาด้วยยา PEG-Interferon alfa-2b เพื่อทำนายการตอบสนองต่อการรักษา ผู้ป่วยกลุ่มนี้ได้รับการติดตามผลการรักษาเป็นเวลา 3 ปีเพื่อจัดกลุ่มว่าเป็นกลุ่มที่ตอบสนองต่อการรักษา(n=9) หรือกลุ่มที่ไม่ตอบสนองต่อการรักษา (n=10) วิธีการศึกษาได้ทำโดยการใช้วิธีทูดีเจลและแมสสเปกโตรเมตรีมาศึกษาโปรติโอมิกในผู้ป่วยทั้งสองกลุ่มก่อนรักษา หลังการรักษาด้วยยาเพคอินเตอฟิรอนเป็นเวลา 24 สัปดาห์และ 48 สัปดาห์ จากการวิเคราะห์ความเข้มของจุดโปรตีนของคนไข้ทั้งสองกลุ่มพบว่า มีการแสดงออกของ 7 จุดโปรตีนที่แตกต่างก่อนได้รับการรักษา เมื่อติดตามการรักษาไปถึง 24 สัปดาห์พบว่ามีการเปลี่ยนแปลงอย่างมีนัยสำคัญของ 13 จุดโปรตีนในกลุ่มที่ตอบสนองต่อการรักษา และมีการเปลี่ยนแปลงอย่างมีนัยสำคัญของ 6 จุดโปรตีนในกลุ่มที่ไม่ตอบสนองต่อการรักษา โปรตีนที่สำคัญเหล่านี้ได้แก่ CD5 antigen-like precursor, α-2-HS-glycoprotein และ Apolipoprotein A-I หน้าที่ของโปรตีนเหล่านี้ได้แก่ การป้องกันทางภูมิคุ้มกัน เมตาบอลิซึมของไขมัน และโปรตีนระยะเฉียบพลั
การศึกษาการตอบสนองทางระบบภูมิคุ้มกันในผู้ป่วยติดเชื้อไวรัสตับอักเสบบี
Get PDFThesis (Ph.D.)--Chulalongkorn University, 2012Hepatitis B infection is a major cause of liver diseases. Approximately 2 billion people worldwide and 400 million of them remain chronically infected. Defect or exhausted innate and adaptive immune responses lead to HBV persistence. It is believed that the vigorous and multispecific T-cell response are important to viral control in resolved HBV infection. Here, we firstly identified novel HLA-C-restricted CTL epitope of HBV antigen from resolved patient. The specific CTL response to amino acids 171-180 of envelope antigen restricted to HLA-Cw*08:01 molecule revealed responsiveness in 53% of tested patients with resolved HBV infection. The cross-activity of this CTL response was detected in HBV genotype B and C. The comparative specific CTL response against Env171-180 versus the known-HLA-A or -B-restricted epitopes indicated that the frequency and magnitude of HLA-Cw*08:01-restricted Env171-180 response are greater or at least comparable to known HLA-A*02, A*11, A*24 and B*51 restricted CTL responses. Moreover, we investigated whether gene expression patterns in peripheral blood mononuclear cells (PBMC) were different between sustained virological responder and non-responder to Pegylated-interferon alpha in chronic HBV infection with positive or negative HBeAg. The Illumina Sentrix Humanref-8 v2 BeadChips microarray was used for the analysis of global gene expression. We found that most of the significantly different genes were at higher level in the responder compared to the non-responder groups both at pretreatment and/or during treatment at week 24. Some interesting immune-related genes are previously reported to have anti-viral activity such as response to virus (IFI16, MX1, MX2), viral defense or viral genome sensor (GBP3, IFI16), regulation of viral reproduction (APOBEC3F) and proteasome (PSMB8). Another factor which influences the chronic status of HBV infection is host factor. Several polymorphisms of immune genes, such as cytokine genes, were previously reported to be individually associated with disease progression; however, the analysis of these polymorphisms together as the combination of Th1 and Th2 genotypes has never been investigated. In this study, twenty-two polymorphisms of cytokine and cytokine receptor genes were studied for their association with the risk of chronicity. Although the combined analysis of the role of Th1 and Th2 genotypes gave no positive association with chronic hepatitis B infection. Our genotype data showed that the patients with low IL-10 as well as low IL-4 producing allele has lower risk for chronic state suggesting a protective role of Th2. Taken together, host factors affect the distinct immune responses resulting in the different clinical outcomes of HBV infection. The more information in HBV pathogenesis and immune response is necessary for the further development of novel therapy for chronic HBV infection.การติดเชื้อไวรัสตับอักเสบบีเป็นสาเหตุหลักของการเป็นโรคตับซึ่งพบว่าประมาณสองพันล้านคนทั่วโลกติดเชื้อไวรัสตับอักเสบบีและสี่ร้อยล้านคนจากจำนวนผู้ติดเชื้อนี้อยู่ในภาวะติดเชื้อแบบเรื้อรัง ความบกพร่องของระบบภูมิคุ้มกันทั้งแบบ innate และ adaptive immunity จะเป็นสาเหตุให้เกิดการติดเชื้อแบบเรื้อรัง ปัจจัยหนึ่งที่ส่งผลต่อผลการรักษาทางคลินิก (clinical outcomes) เนื่องจากเป็นที่ทราบกันดีว่าการตอบสนองของเซลล์เม็ดเลือดขาวชนิดทีที่มีความแรงและมีความจำเพาะที่หลากหลาย (multispecificity) มีความสำคัญในการควบคุมไวรัสซึ่งพบได้ในกลุ่มผู้ป่วยที่เคยได้รับเชื้อไวรัสตับอักเสบบีและหายแล้ว ในการทดลองนี้มีรายงานเป็นครั้งแรกในการค้นพบเซล์เม็ดเลือดขาวชนิดทีที่จดจำอีพิโทปในส่วนของ envelope ตำแหน่ง 171-180 ของไวรัสตับอักเสบบีที่จำเพาะต่อโมเลกุล HLA-Cw*08:01 และเป็นอีพิโทปตัวใหม่ที่ยังไม่เคยมีการค้นพบมาก่อน จากการทดลองพบการตอบสนองของทีเซลล์นี้ถึง 53% จากผู้ป่วยที่มี HLA-Cw*08:01 และการตอบสนองนี้ยังพบ cross-activity ระหว่างไวรัสตับอักเสบบีชนิด B และ C อีกด้วย นอกจากนี้ยังได้ทำการเปรียบเทียบการตอบสนองของ envelope ตำแหน่ง 171-180 นี้กับอีพิโทปอื่นๆที่จำเพาะต่อโมเลกุล HLA-A (A*02, A*11, A*24) หรือ HLA-B (B*51) ที่เคยค้นพบมาก่อนหน้านี้ พบว่าอีพิโทปใหม่ที่มีความจำเพาะกับ HLA-C ที่เราค้นพบนี้มีจำนวนผู้ป่วยที่ตอบสนองและความแรงในการตอบสนองที่ดีกว่าหรือเทียบเท่ากับอีพิโทปอื่นๆที่จำเพาะต่อโมเลกุล HLA-Aหรือ HLA-B นอกจากนี้เรายังทำการศึกษาดูระดับการแสดงออกของยีนในผู้ป่วยตับอักเสบบีเรื้อรังว่ามีความแตกต่างของรูปแบบการแสดงออกของยีนในเซลล์เม็ดเลือดขาวระหว่างผู้ป่วยที่มี HBeAg และผู้ที่ไม่มี HBeAg ที่ตอบสนองกับผู้ที่ไม่ตอบสนองต่อการรักษาด้วยยา Pegylated-interferon alpha หรือไม่โดยใช้เทคนิค Illumina Sentrix Humanref-8 v2 BeadChips microarray ในการวิเคราะห์ระดับการแสดงออกของทุกยีนในเซลล์ PBMC จากการทดลองเราพบว่ายีนส่วนใหญ่ที่มีการแสดงออกที่แตกต่างกันอย่างมีนัยสำคัญนี้ในผู้ป่วยที่ตอบสนองกับยาจะมีระดับการแสดงออกที่สูงกว่าผู้ที่ไม่ตอบสนองทั้งในช่วงก่อนและระหว่างการรักษาสัปดาห์ที่ 24 เราพบบางยีนที่น่าสนใจซึ่งมีความเกี่ยวของกับระบบภูมิคุ้มกันและเคยมีรายงานถึงบทบาทในการยับยั้งไวรัสอีกด้วย เช่น การตอบสนองต่อไวรัส (IFI16, MX1, MX2), การคุ้มกันไวรัสหรือเซนเซอร์ของจีโนมไวรัส (GBP3, IFI16), การควบคุมการเพิ่มจำนวนของไวรัส (APOBEC3F) and proteasome (PSMB8) อีกปัจจัยหนึ่งที่มีความสำคัญต่อระยะของตับอักเสบเรื้อรังจากเชื้อไวรัสตับอักเสบบีคือปัจจัยจากตัวผู้ป่วย (host factor) ในอดีตมีการศึกษาถึงความสัมพันธ์ของความหลากหลายของยีนทีละตำแหน่งกับการดำเนินโรคเช่นยีนในกลุ่มไซโตไคน์ แต่ยังไม่เคยศึกษามีการความสัมพันธ์ของความหลากหลายของยีนหลายๆตำแหน่งร่วมกันเป็นกลุ่มยีนไซโตไคน์ที่เกี่ยวกับ Helper T cell 1 และ Helper T cell 2 ซึ่งในการทดลองนี้เราได้ดูความสัมพันธ์ดังกล่าวในความหลากหลายจำนวน 22 ตำแหน่งของยีนไซโตไคน์และยีนตัวรับสัญญาณไซโตไคน์ ปรากฏว่าเราไม่พบความสัมพันธ์ระหว่างจีโนไทป์ของยีนกลุ่ม Helper T cell 1 และ Helper T cell 2 กับความเสี่ยงในการเกิดภาวะตับอักเสบเรื้อรังจากเชื้อไวรัสตับอักเสบบี สำหรับผลจีโนไทป์ของยีนพบว่าผู้ป่วยที่มีรูปแบบจีโนไทป์ของยีน IL-4 และ IL-10 ที่สัมพันธ์ไปกับการผลิต IL-4 และ IL-10 ที่ลดลงจะมีความเสี่ยงที่ต่ำต่อการเกิดภาวะตับอักเสบเรื้อรัง แสดงถึงบทบาทในการป้องกันการเกิดภาวะตับอักเสบเรื้อรังของ Helper T cell 2 ดังนั้นจะเห็นได้ว่า host factors จะมีผลต่อการตอบสนองทางภูมิคุ้มกันและ clinical outcome ในการติดเชื้อไวรัสตับอักเสบ และหากเรามีข้อมูลองค์ความรู้เกี่ยวกับพยาธิสภาพและภูมิคุ้มกันต่อเชื้อนี้ก็จะเป็นประโยชน์ต่อการพัฒนาการวิธีการรักษาใหม่ๆโดยเฉพาะในผู้ป่วยตับอักเสบบีแบบเรื้อรั
Going Beyond Counting First Authors in Author Co-citation Analysis
Get PDFThe present study examines one of the fundamental aspects of author co-citation analysis (ACA) - the way co-citation
counts are defined. Co-citation counting provides the data on which all subsequent statistical analyses and mappings
are based, and we compare ACA results based on two different types of co-citation counting - the traditional type that
only counts the first one among a cited work's authors on the one hand and a non-traditional type that takes into
account the first 5 authors of a cited work on the other hand. Results indicate that the picture produced through this non-traditional author co-citation counting contains more coherent author groups and is therefore considerably clearer. However, this picture represents fewer specialties in the research field being studied than that produced through the traditional first-author co-citation counting when the same number of top-ranked authors is selected and analyzed. Reasons for these effects are discussed
การศึกษารูปแบบสูตรการคำนวณคะแนนเพื่อประเมินความรุนแรงของการอักเสบของตับและพังผืด เพื่อใช้ทำนายภาวะแทรกซ้อนของโรคตับและการเสียชีวิตในผู้ป่วยโรคไขมันในตับ ที่ไม่ได้เกิดจากอัลกอฮอล์ร่วมกับอ้วนลงพุง
Get PDFThesis (Ph.D.)--Chulalongkorn University, 2011Background: The prognostic indicators for long-term outcomes of non alcoholic fatty liver disease (NAFLD) patients have not been well studied. We aimed to validate the NAFLD Fibrosis Score in the Thai NAFLD population and to assess whether the severity of liver fibrosis estimated by the NAFLD Fibrosis Score can predict the mortality of patients with NAFLD in long-term follow up. Methods: We divided our study into 2 phases; the first phase is a cross sectional study to collect 115 Thai NAFLD patients prospectively during 2007-2010 in King Chulalongkorn Memorial Hospital (KCMH) to validate the NAFLD Fibrosis Score. The second phase is a historical cohort design by using the existing data of NAFLD patients diagnosed during 1980 and 2000 drawn from the Rochester Epidemiology Project to analyze. Of 479 patients with NAFLD, 302 patients were included. We used the NAFLD Fibrosis Score for separating NAFLD patients with and without advanced liver fibrosis. Results: According to the first phase study, 115 Thai NAFLD patients with mean age of 50.5 ± 12.4 years were included. Seventy seven of the Thai NAFLD patients (67%) were in a group of low risk of advance fibrosis by using NAFLD Fibrosis Score. Advanced fibrosis was shown in 15 (13%) patients. Using the ROC curve, the NAFLD Fibrosis Score at baseline of >-1.5 was used for predicting significant liver fibrosis with a sensitivity of 53%, specificity of 70%, PPV of 21% and NPV of 91%. For phase 2 study, a total of 302 NAFLD patients (mean age 47.3 ± 12.9 years) were followed-up for an average of 11.9 ± 3.9 years. A low probability of advanced fibrosis (score <-1.5 at baseline) was found in 60% while intermediate or high probability of advanced fibrosis (score ≥-1.5) was found in 40%. At the end of follow up, 55 patients (18%) developed primary endpoints including 39 patients (13%) who died during follow-up. In a multivariate analysis a higher NAFLD Fibrosis Score at baseline and presence of new onset of CHD were significantly predictive of death (OR = 2.6 and 9.2, respectively; p <0.0001). Conclusions: The NAFLD Fibrosis Score has a high NPV in Thai NAFLD patients. A higher NAFLD Fibrosis Score at baseline and presence of new onset of CHD were significantly predictive of death.ที่มา: การพยากรณ์โรคในระยะยาวของผู้ป่วยโรคไขมันในตับที่ไม่ได้เกิดจากอัลกอฮอล์ร่วมกับอ้วนลงพุง ไม่มีข้อมูลการศึกษามาก่อน การศึกษานี้มุ่งศึกษาการใช้รูปแบบสูตรคำนวณคะแนนเพื่อประเมินความรุนแรงของการเกิดพังผืดในตับ เพื่อใช้ทดสอบความแม่นยำในผู้ป่วยไทยและใช้ทำนายภาวะแทรกซ้อนของโรคตับ และการเสียชีวิตในผู้ป่วยโรคไขมันในตับที่ไม่ได้เกิดจากอัลกอฮอล์ร่วมกับอ้วนลงพุง วิธีการศึกษา: ได้ทำการศึกษาเป็น 2 ระยะโดยระยะที่ 1 รวบรวมผู้ป่วยโรคไขมันในตับที่วินิจฉัยในช่วงเวลาปี พ.ศ. 2550 ถึง พ.ศ. 2553 จากโรงพยาบาลจุฬาลงกรณ์ จำนวน 115 ราย เพื่อทดสอบความแม่นยำของรูปแบบสูตรคำนวณคะแนน เพื่อประเมินความรุนแรงของการเกิดพังผืดในตับ ส่วนการศึกษาในระยะที่ 2 เป็นการใช้ฐานข้อมูลที่มีอยู่เดิมของผู้ป่วยโรคไขมันในตับที่เมโยคลินิก สหรัฐอเมริกา จำนวน 302 รายจากทั้งหมด 479 รายที่มีข้อมูลครบถ้วนเพื่อการติดตามในระยะยาว และคำนวณคะแนนเพื่อประเมินความรุนแรงของการเกิดพังผืดในตับได้
ผลการศึกษา: ระยะที่ 1 ผู้ป่วยไทยโรคไขมันในตับจำนวน 115 รายมีอายุเฉลี่ย 50.5 ± 12.4 ปี และ 67% มีคะแนนเสี่ยงต่อการมีพังผืดในตับน้อยและมีค่าความไวและค่าความจำเพาะที่ 53% และ 70% ตามลำดับ ส่วนค่า NPV อยู่ที่ 91% ผลการศึกษาระยะที่ 2 กลุ่มผู้ป่วยโรคไขมันในตับที่เมโยคลินิก สหรัฐอเมริกา จำนวน 302 ราย มีอายุเฉลี่ย 47.3 ± 12.9 ปี ติดตามการรักษาเป็นเวลานานเฉลี่ย 11.9 ± 3.9 ปี จากการคำนวณคะแนนเสี่ยงต่อการมีพังผืดในตับพบว่า มีผู้ป่วยที่อยู่ในกลุ่มที่มีคะแนนเสี่ยงต่อการมีพังผืดในตับน้อย (คะแนน <-1.5) ถึง 60% และมีผู้ป่วยที่อยู่ในกลุ่มที่มีคะแนนเสี่ยงต่อการมีพังผืดในตับมาก (คะแนน ≥-1.5) 40% ที่สิ้นสุดการศึกษาพบว่ามีผู้ป่วย 55 รายหรือ 18% มีจุดสิ้นสุดของการติดตามโดยมีผู้ป่วย 39 ราย (13%) เสียชีวิต จากการวิเคราะห์ความแปรปรวนพหุคูณพบว่า ผู้ป่วยที่อยู่ในกลุ่มที่มีคะแนนเสี่ยงต่อการมีพังผืดในตับมาก และการพบภาวะหลอดเลือดหัวใจตีบที่เกิดขึ้นใหม่เพิ่มความเสี่ยงต่อโอกาสเสียชีวิต โดยมีค่า odd ratio เท่ากับ 2.6 and 9.2 ตามลำดับ p<0.0001 สรุปผลการศึกษา: รูปแบบสูตรคำนวณคะแนนเพื่อประเมินความรุนแรงของการเกิดพังผืดในตับที่ทดสอบในผู้ป่วยไทย มีความแม่นยำเพียงพอและผู้ป่วยที่อยู่ในกลุ่มที่มีคะแนนเสี่ยงต่อการมีพังผืดในตับมาก และการพบภาวะหลอดเลือดหัวใจตีบที่เกิดขึ้นใหม่เพิ่มความเสี่ยงต่อโอกาสเสียชีวิ
Variations on the Author
Get PDF“Variations on the Author” discusses two of Eduardo Coutinho’s recent films (Um Dia na Vida, from 2010, and Últimas Conversas, posthumously released in 2015) and their contribution to the general question of documentary authorship. The director’s filmography is characterized by a consistent yet self-effacing form of authorial self-inscription: Coutinho often features as an interviewer that rather than express opinions propels discourses; an interviewer that is good at listening. This mode of self-inscription characterizes him as an author who is not expressive but who is nonetheless markedly present on the screen. In Um Dia na Vida, however, Coutinho is completely absent form the image, while Últimas Conversas, on the contrary, includes a confessional prologue that moves the director from the margins to the center of his films. This article examines the ways in which these works stand out in the filmography of a director who offers new insights into the notion of cinematic authorship
Appropriate Similarity Measures for Author Cocitation Analysis
Get PDFWe provide a number of new insights into the methodological discussion about author cocitation analysis. We first argue that the use of the Pearson correlation for measuring the similarity between authors’ cocitation profiles is not very satisfactory. We then discuss what kind of similarity measures may be used as an alternative to the Pearson correlation. We consider three similarity measures in particular. One is the well-known cosine. The other two similarity measures have not been used before in the bibliometric literature. Finally, we show by means of an example that our findings have a high practical relevance.information science;Pearson correlation;cosine;similarity measure;author cocitation analysis
Dispelling the Myths Behind First-author Citation Counts
Get PDFWe conducted a full-scale evaluative citation analysis study of scholars in the XML research field to explore just how different from each other author rankings resulting from different citation counting methods actually are, and to demonstrate the capability of emerging data and tools on the Web in supporting more realistic citation counting methods. Our results contest some common arguments for the continued
use of first-author citation counts in the evaluation of scholars, such as high correlations between author rankings by first-author citation counts and other citation
counting methods, and high costs of using more realistic citation counting methods that are not well-supported by the ISI databases. It is argued that increasingly available digital full text research papers make it possible for citation analysis studies to go beyond what the ISI databases have directly supported and to employ more
sophisticated methods
koamabayili/VECTRON-author-checklist: VECTRON author checklist
No full textWe have done our best to complete the author checklist relating to the use of animals in the hut study. Note that the objective for the hut study was to evaluate the IRS treatment applications for residual efficacy against Anopheles mosquitoes, including the local An. coluzzii mosquito population. Cows were only used to attract mosquitoes into the huts and no tests were carried out directly on the cows. The author checklist is intended for use with studies where experiments are carried out on animals, which is why we have had such difficulty in completing this for the hut study, as many of the questions do not relate to how the cows were used
- …
