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Modelisation de la dynamique de repartition de l'azote chez un jeune arbre fruitier pendant la phase de croissance exponentielle. II. - Validation. Analyse de l'erreur. Simulation
No full textUn modèle de transfert de l’azote endogène chez de jeunes arbres fruitiers a été proposé par les auteurs dans un article précédent (Habib & Monestiez, 1987). Des simulations numériques sont confrontées à des données d’expériences indépendantes de celles ayant servi à la mise au point du modèle. Cette confrontation permet de considérer que le modèle est globalement validé. Cependant, l’analyse des résultats a mis en évidence certains défauts de modélisation qui sont discutés. Par ailleurs, les résidus « mesure-modèle » sont analysés. En particulier, il est démontré que les masses totales d’azote des organes végétaux peuvent être prévues avec une bonne précision ; par contre, il n’est pas possible de diminuer l’erreur résiduelle concernant les teneurs en azote. A titre d’illustration, il est montré comment ce type de modèle pourrait être employé pour préparer un plan d’expériences. Le cas d’un essai de calendrier de fertilisation est rapidement commenté.A model of nitrogen partitioning in young fruit trees was presented in earlier work. Numerical simulations of the model have now been compared to experimental data. These data are independent of those being used to model and fit the parameters. Simulations and experiments were in quite good agreement and the model is considered as being validated. Nevertheless some failings of the model are pointed out and discussed. The residual error « experimental data - simulated data » is analysed. The total amount of nitrogen in the vegetative parts could be predicted with good precision, but the residual error of the nitrogen content could not be lowered. An example is shown how this kind of model could be used to prepare an experimental design. An experiment on the time of application of nitrogen fertiliser is briefly discussed
Embroussaillement des parcours: processus biologiques de la régénération du buis et patrons locaux de répartition spatiale
No full textNational audienc
Essai de caracterisation phytoecologique des formations herbacees paturees de Grande-Terre (Guadeloupe)
No full textDans le but de caractériser les types de prairies naturelles (ou « savanes ») de la Grande-Terre (Guadeloupe), 350 relevés ont été effectués, selon un plan d’échantillonnage stratifié en fonction de la pluviométrie et de la profondeur du sol. Outre les espèces présentes (et leurs abondances), 61 variables ont été notées pour chaque relevé. La technique d’interprétation utilisée est celle des profils écologiques, conduisant à la constitution de groupes écologiques plurifactoriels d’espèces. Il est montré que les variables du milieu les plus explicatives ressortissent au macroclimat (pluviométrie surtout) et aux caractères édaphiques et topographiques. Les communautés végétales mises en évidence sont caractérisées par leur composition en groupes écologiques, et par leurs conditions de milieu. Une présentation synthétique des résultats est faite grâce à l’Analyse Factorielle des Correspondances (AFC). Les types de savanes ainsi caractérisés sont en outre évalués par le calcul des moyennes des valeurs pastorales des relevés constitutifs. Les « paysages prairiaux » des petites régions de Grande-Terre sont décrits.In order to characterize the types of natural meadows (or "savannas") in Grande-Terre (Guadeloupe) - fig. 1 -, 350 samples were taken. Sampling was stratified according to annual rainfall and soil depth. Besides the species present (and their abundance), 61 factors were noted for each sample. The results were interpreted by the ecological series method, which gives plurifactorial ecological species groups (tables 1a and 16). The most explanatory environmental factors were macroclimate (mainly rainfall), and edaphic and topographic characteristics. The plant communities defined (tables 3a and 3b) were characterized by their composition in ecological species groups (table 2), and by their prevalent environmental conditions. These entities could be represented synthetically by Factor Analysis of Correspondences (AFC) (fig. 2 through 5). The pasture types resulting from this study were evaluated by computing the average pasture value of the component samples, according to rough quality indices of species. A "pastoral landscape" of the regions of Grande-Terre was accordingly described (table 4)
A spatial covariance model with a single wave effect and a finite range
No full textInternational audienceWe propose a new spatial covariance model with a single wave effect and a finite range. The construction of this model is based on a radial kernel composed of two concentric spheres and the finite range enables us to obtain an exact simulation from the circulant embedding method. This model responds to the lack of efficient covariance functions to model patterns characterized by concentration areas surrounded by gaps. We compare the single wave model to other existing hole effect models such as the Bessel model, the damped cosine model and the cardinal sine mode
Modelisation de la dynamique de repartition de l'azote chez un jeune arbre fruitier pendant la phase de croissance exponentielle. I. Estimation de parametres
No full textL’arbre fruitier est analysé comme étant un système ouvert représenté par un ensemble de compartiments anatomiques (racines, tronc, rameaux, feuilles) dont les variables descriptives, d’état ou de commande, sont en évolution dynamique. A partir de cette représentation schématique de la réalité, il est proposé un modèle d’organisation de ces compartiments qui permet de rendre compte de la dynamique des transferts d’azote dans l’arbre. Cette dynamique est basée sur une équation régissant les débits d’azote entre les organes végétaux et qui dépend de 2 termes principaux : le premier traduisant la disponibilité de cet azote (teneur en N de la source) et le second l’intensité de la demande (accroissement en matière sèche des puits). Le sous-modèle, correspondant à cette dynamique, comprend 3 paramètres qui sont, chacun, associés à un organe, source d’un débit d’azote. Les valeurs de ces paramètres peuvent être interprétées comme traduisant le caractère plus ou moins important de réserve des compartiments correspondants. L’étude de sensibilité réalisée confirme la nécessité structurelle des 3 paramètres. Son ajustement à un ensemble de données expérimentales conduit à un écart-type résiduel de l’ordre de 0,08 g de N pour des masses mesurées variant de 0,1 à 2 g selon les organes végétaux et les dates de mesures.The fruit tree has been analysed as an open system formed ol anatomical compartments (roots, trunk, shoots, leaves) whose state or command variables are in dynamic evolution. On the basis of this scheme, a model of compartment organization is proposed which shows up the dynamics of nitrogen transfers in the tree. These dynamics are based on an equation determining the rate of these nitrogen transfers between plant parts. This equation is made up of 2 main variables : one showing the availability of nitrogen at source, which is represented by nitrogen content (DM basis), and the other showing the degree of demand made by the sink, which is represented by the increase in dry matter. The sub-model of nitrogen transfers contains 3 parameters each of which is associated with a plant part, acting as a source of nitrogen. The fit of the parameters can be interpreted as showing the relative importance of the corresponding compartments as nitrogen reserves. A sensitivity study showed the structural necessity of these 3 parameters. The model has been fitted to experimental data. It leads to a mean residual error of 0.08 g N which is to be compared with measured amounts of nitrogen between 0.1 and 2 g, according to anatomical compartments and time
Statistical modeling of environmental functional data : application to the analyse of oceanographic profiles.
No full textAfin d'étudier les processus biogéochimiques de l'Océan Austral, des balises posées sur des éléphants de mer ont permis de récolter en 2009-2010 des profils de variables océanographiques (Chlorophylle a (Chl a), température, salinité, lumière) dans une zone s'étalant du sud des îles Kerguelen jusqu'au continent Antarctique. Cette thèse se penche en particulier sur les données de Chl a, car celle-ci est contenue dans les organismes photosynthétiques qui jouent un rôle essentiel de pompe à carbone. Mais les profils verticaux de Chl a, récoltés peu fréquemment, ne permettent pas d'obtenir une cartographie de cette variable dans cette zone de l'océan. Cependant, nous disposons de profils de lumière, échantillonnés plus souvent. L'objectif était alors de développer une méthodologie permettant de reconstruire de manière indirecte les profils de Chl a à partir des profils de lumière, et qui prenne en compte les caractéristiques de ce type de données qui se présentent naturellement comme des données fonctionnelles. Pour cela, nous avons abordé la décomposition des profils à reconstruire ou explicatifs sur une base de splines, ainsi que les questions d'ajustement associées. Un modèle linéaire fonctionnel a été utilisé, permettant de prédire des profils de Chl a à partir des dérivées des profils de lumière. Il est montré que l'utilisation d'un tel modèle permet d'obtenir une bonne qualité de reconstruction pour accéder aux variations hautes fréquences des profils de Chl a à fine échelle. Enfin, une interpolation par krigeage fonctionnel permet de prédire la concentration en Chl a de nuit, car les mesures de lumière acquises à ce moment-là ne peuvent pas être exploitées.To study biogeochemical processes in the Southern Ocean, tags placed on elephant seals allowed to collect during 2009-2010 oceanographic variables profiles (Chlorophyll a (Chl a), temperature, salinity, light) in an area ranging from southern Kerguelen until the Antarctic continent. This thesis focuses on Chl a data as it is contained in photosynthetic organisms and these ones play an essential role in the oceanic carbon cycle. The infrequently collected vertical Chl a profiles don't provide a mapping of this variable in this area of the ocean. However, we have light profiles sampled more often. The aim of this thesis was then to develop a methodology for reconstructing indirectly Chl a profiles from light profiles, and that takes into account characteristics of this kind of data that naturally occur as functional data. For this, we adressed the profiles decomposition to rebuild or explanations on splines basis, as well as issues related adjustment. A functional linear model was used to predict Chl a profiles from light profiles derivatives. It was shown that the use of such a model provides a good quality of reconstruction to access high frequency variations of Chl a profiles at fine scale. Finally, a functional kriging interpolation predicted the Chl a concentration during night, as light measurements acquired at that time can't be exploited. In the future, the methodology aims to be applied to any type of functional data
Mise au point d'un modele probabiliste applique a l'etude de l'epidemiologie des virus transmis sur le mode non-persistant : premiers resultats de simulation
No full textNational audienc
Overview of GeoLifeCLEF 2018: location-based species recommendation
No full textThe GeoLifeCLEF challenge provides a testbed for the systemoriented evaluation of a geographic species recommendation service. The aim is to investigate location-based recommendation approaches in the context of large scale spatialized environmental data. This paper presents an overview of the resources and assessments of the GeoLifeCLEF task 2018, summarizes the approaches employed by the participating groups, and provides an analysis of the main evaluation results
Assessing uncertainty in the United Kingdom nitrogen dioxide monitoring network with ordinary and indicator kriging
No full textOrdinary and indicator kriging of monthly mean nitrogen dioxide concentration in the United Kingdom
No full text- …
