1,720,973 research outputs found
O Ρόλος της Δραστικότητας της Lp-PLA2 Φωσφολιπάσης στη Λεμφωμαγένεση του Συνδρόμου Sjogren
No full textΕΙΣΑΓΩΓΗ- ΣΚΟΠΟΣ: Μία από τις κυριότερες επιπλοκές του συνδρόμου Sjogren (σS) αποτελεί η ανάπτυξη Β-κυτταρικού non Hodgkin λεμφώματος (B-NHL), στην παθογένεια του οποίου η συμβολή των ιστικών μακροφάγων φαίνεται να είναι σημαντική βάσει προηγούμενων ιστοπαθολογικών μελετών. Ένα προϊόν των ιστικών μακροφάγων με εμπλοκή τόσο σε καρδιαγγειακά όσο και κακοήθη νοσήματα, συμπεριλαμβανομένων του Β-NHL λεμφώματος, αποτελεί η εκκριτική φωσφολιπάση Lp-PLA2, η οποία ανευρίσκεται στην κυκλοφορία συνδεδεμένη με λιποπρωτεΐνες. Σκοπός της μελέτης είναι η διερεύνηση του ρόλου της Lp-PLA2 ως πιθανού βιοδείκτη για την ανάπτυξη Β-NHL στα πλαίσια του σS. ΥΛΙΚΟ: Η δραστικότητα της Lp-PLA2 μετρήθηκε αρχικά στον ορό 48 ασθενών με σS, 9 ασθενών με σS-λέμφωμα και 40 υγιών μαρτύρων με την μέθοδο των Blank et al. Στη συνέχεια, σε μια ανεξάρτητη κοορτή 25 ασθενών με σS, 17 ασθενών με σS-λέμφωμα και 10 υγιών μαρτύρων, η δραστικότητα της Lp-PLA2 προσδιορίστηκε με μια εμπορικώς διαθέσιμη ELISA. Διενεργήθηκε στατιστική ανάλυση με τα λογισμικά SPSS και GraphPad. Η mRNA και η πρωτεϊνική έκφραση της Lp-PLA2 προσδιορίστηκε, επίσης, σε επίπεδο ιστού βιοψίας ελασσόνων σιελογόνων αδένων σε διαθέσιμα δείγματα από τους συμμετέχοντες στη μελέτη (μάρτυρες, ασθενείς με σS και σS-λέμφωμα), με τις τεχνικές της ποσοτικής αλυσιδωτής αντίδρασης πολυμεράσης πραγματικού χρόνου και ανοσοαποτύπωσης κατά Western, αντιστοίχως. ΑΠΟΤΕΛΕΣΜΑΤΑ: Η δραστικότητα της Lp-PLA2 ήταν στατιστικώς σημαντικά αυξημένη στους ασθενείς με σS-λέμφωμα σε σχέση με τους ασθενείς με σS χωρίς λέμφωμα (p=0,003 και p=0,005, αντιστοίχως), καθώς και με τους υγιείς μάρτυρες (p=0,03 και p=0,06, αντιστοίχως). Η mRNA και η πρωτεϊνική έκφραση της Lp-PLA2 στη βιοψία ελασσόνων σιελογόνων αδένων ασθενών με σS που εμφάνιζαν λέμφωμα ήταν σημαντικά αυξημένη σε σχέση με τους ασθενείς με σS χωρίς λέμφωμα και τους ξηροστομικούς μάρτυρες (p<0.05). ΣΥΜΠΕΡΑΣΜΑΤΑ: Η εκτίμηση της Lp-PLA2 δραστικότητας σε ασθενείς με σS θα μπορούσε να είναι ένας χρήσιμος ορολογικός βιοδείκτης για την ανάπτυξη Β-NHL στο πλαίσιο του σS.Background: One of the major complications of primary Sjogren's syndrome (SS) is the development of B-cell non-Hodgkin's lymphoma (B-NHL). The contribution of tissue macrophages in the pathogenesis of B-NHL, based on previous histopathological studies, is significant. Extracellular lipoprotein-associated phospholipase A2 (Lp-PLA2) is a product of tissue macrophages which is found in the circulation associated with lipoproteins and has been involved in both cardiovascular and malignant diseases, including B-NHL lymphoma. Objective: The purpose of the current study was to investigate the role of serum Lp-PLA2 activity as a potential biomarker for the development of B-NHL in the setting of primary SS. Methods: Lp-PLA2 activity in serum was determined by measuring [3H]PAF degradation products by liquid scintillation. The samples were obtained from 48 primary SS patients, 9 primary SS patients with lymphoma (SS-lymphoma) and 40 healthy controls. Additionally, an independent cohort of 25 primary SS patients, 17 primary SS-lymphoma and 10 healthy controls were tested using a commercially available ELISA kit. Lp-PLA2 mRNA and protein expression in minor salivary gland tissue samples derived from our cohort patients were also evaluated by Real-Time PCR and Western Blot, respectively. Results: The activity of Lp-PLA2 showed statistically significant increase in patients with primary SS-lymphoma compared to primary SS patients without lymphoma [mean±SD (nmol/min/ml): 62.0±13.4 vs 47.7±14.7, p=0.003 and 19.7±4.7 vs 15.2±3.2, p=0.005, respectively], as well as healthy controls [mean±SD (nmol/min/ml): 62.0±13.4 vs 52.0±16.3, p=0.03 and 19.7±4.7 vs 15.7±3.1, p=0.06, respectively]. No statistically significant difference in Lp-PLA2 activity was observed between primary SS patients without lymphoma development and healthy controls. Lp-PLA2 mRNA and protein expression were found to be increased in SS patients with lymphoma, compared to SS without lymphoma and sicca controls (p<0.05). Conclusions: Evaluation of extracellular Lp-PLA2 activity in primary SS patients may serve as a useful serological biomarker for B-NHL development in the context of primary SS
Molecular staging of melanoma by Multiplex PCR
No full textMalignant melanoma (MM) is a form of skin cancer originating from melanocytes (cells that produce the photoprotective pigment melanin). MM has a great metastatic potential via the lymphatic root or the bloodstream almost everywhere in the body, thus ranking as one of the most aggressive forms of cancer. Therefore, early diagnosis, accurate staging and appropriate therapy are essential for increasing life expectancy of melanoma patients. Prognosis of melanoma patients is based on histological data and the clinical image of the patients leading to misdiagnosis and downstaged subjects. Recently, the use of molecular markers has been tested for more precise staging of the disease. These markers may help diagnose early melanoma for better clinical management, better treatment follow-up, and more accurate detection of recurrence. Therefore, the detection of circulating melanoma cells (CMCs) in peripheral blood could screen-out patients with higher risk of relapse at the time of the diagnosis. The aims of this study are:• The design of a prognostic model for melanoma, using the detection of melanoma markers in blood specimens that may help reveal the minimal residual disease.• The correlation of CMCs detection with clinicopathological data, the prognosis (progression-free survival and overall survival) and the response to multiple protocols of treatment.• The creation of an easy and low cost technique that can be applied in any hospital lab to discriminate in a brief protocol, patients with subclinical residual disease.In this work, a group of melanoma specific markers has been studied that can be detected in mRNA samples from blood of melanoma patients. These markers were: tyrosinase (TYR), melanoma antigen recognized by T cells 1 (MELAN-A/MART-1), micropthalmia transcription factor isoform 4 (MITF-M) and GAPDH as internal control. A protocol has been set up to find the efficiency of our technique by spiking the melanoma cell line SK-MEL 28 cells in peripheral blood mononuclear cells (PBMCs) of healthy donors. Then a multiplex PCR protocol has been developed in which we could detect 1 SK-MEL 28 cell in 1.000.000 PBMCs for TYR and 1 SK-MEL 28 cell in 10.000.000 PBMCs for MART-1 and MITF-M. This protocol was tested in 81 melanoma patients of all stages in a blind study. Then the clinicopathological data of patients were collected correlated with our protocols’ results and statistic analysis was performed.The conclusions of this work are summarized as follows: the multiplex PCR protocol is correlated statistically with the stage of the disease as well as with the viability of patients. Specifically we can discriminate early staged patients from advanced staged patients with the number of markers that have been detected (p<0.001). Moreover the number of the markers detected correlates with survival or subclinical minimal residual disease that causes metastasis (p<0.01). We have set up a non interventional, low cost, easy and reliable protocol that could help the clinician to specify more accurately the stage of the disease and the prognosis of each patient.Το κακόηθες μελάνωμα είναι μία μορφή καρκίνου του δέρματος που αναπτύσσεται από τα μελανοκύτταρα (κύτταρα του δέρματος που παράγουν τη φωτοπροστατευτική χρωστική μελανίνη) και διαθέτει υψηλή ικανότητα μετάστασης μέσω του λεμφικού συστήματος και μέσω του αίματος (αιματογενής διασπορά) σε οποιοδήποτε σημείο του σώματος με πολύ υψηλή, πλέον, την πιθανότητα θνησιμότητας. Η έγκαιρη διάγνωση, η ακριβής σταδιοποίηση και η κατάλληλη αντιμετώπιση αποτελούν τις προϋποθέσεις για καλή πρόγνωση της νόσου. Όσον αφορά τα κύρια κριτήρια πρόγνωσης και σταδιοποίησης του μελανώματος αυτά προέρχονται από ιστοπαθολογικά δεδομένα και την κλινική εικόνα του ασθενούς, δεδομένα περιορισμένης αξίας που συχνά οδηγούν σε λανθασμένη διάγνωση και υψηλό ποσοστό υποσταδιοποιημένων ασθενών. Τα τελευταία χρόνια, έχουν γίνει προσπάθειες να καθορισθούν μοριακοί (καρκινικοί) δείκτες, η ανίχνευση των οποίων στο αίμα θα μπορούσε να συμβάλλει στην πρώιμη διάγνωση της νόσου, στην αξιολόγηση της αποτελεσματικότητας της θεραπευτικής αγωγής και στην παρακολούθηση των ασθενών μετά τη θεραπεία τους για την έγκαιρη διάγνωση τυχόν υποτροπής. Υπό αυτό το πρίσμα, η ανίχνευση των κυκλοφορούντων καρκινικών κυττάρων στο αίμα είναι ένας υποψήφιος μάρτυρας υποκλινικής-υπολειπόμενης νόσου, που δύναται να οδηγήσει σε μεταστάσεις και δεν ανιχνεύεται μέχρι σήμερα με τις συμβατικές μεθόδους. Η μελέτη αυτή έχει σαν σκοπό:• Το σχεδιασμό ενός προγνωστικού μοντέλου για το μελάνωμα, χρησιμοποιώντας την ανίχνευση έκφρασης ειδικών μοριακών καρκινικών δεικτών στο αίμα, αποβλέποντας στον καθορισμό της ελάχιστης υπολειπόμενης νόσου.• Συσχέτιση της ύπαρξης των CΜCs με κλινικο-εργαστηριακά δεδομένα του πρωτοπαθούς όγκου, την εξέλιξη της νόσου (progression-free survival και overall survival) καθώς και σε μελλοντική μελέτη της αντικειμενικής απόκρισης της νόσου σε δεδομένα θεραπευτικά σχήματα.• Την δημιουργία μιας τεχνικής εφικτής στην καθημερινή κλινική χρήση η οποία και θα μπορεί σύντομα και με ακρίβεια να καθορίσει την ύπαρξη ασθενών με υποκλινική υπολειπομένη νόσο.Στην παρούσα εργασία μελετήθηκε μια ομάδα εξειδικευμένων δεικτών για το μελάνωμα με σκοπό την ανίχνευση τους σε μεταγραφικό επίπεδο (RNA) σεπεριφερικό αίμα ασθενών με μελάνωμα. Επιλέχθηκαν η τυροσινάση (TYR: tyrosinase), το αντιγόνο μελανώματος αναγνωριζόμενο από τα Τ κύτταρα 1 (MELAN-A/MART-1: melanoma antigen recognized by T cells 1), την πρωτεΐνη με ενεργότητα αναστολής μελανώματος και το μεταγραφικό παράγοντα MITF (MITF-M, ισομορφή 4) και ως εσωτερικό μάρτυρα του πειράματος χρησιμοποιήθηκε ο δείκτης γκυκεραλδεϋδη-3-φωσφορική δεϋδρογονάση GAPDH. Επίσης, αναπτύχθηκε ένα πρωτόκολλο για εύρεση της ευαισθησίας της μεθόδου, με αραιώσεις κυττάρων μελανώματος SK-MEL 28 σε μονοπύρηνα φυσιολογικού δότη. Με την ανάπτυξη της multiplex PCR, όπου σε μία αντίδραση χρησιμοποιήσαμε όλους τους δείκτες (TYR, MART-1, MITF-M και GAPDH) προσδιορίσαμε ότι μπορούμε να ανιχνεύσουμε τα mRNA αντίγραφα για την τυροσινάση μέχρι 1 κύτταρο SK-MEL 28 σε υπόβαθρο 1.000.000 μονοπύρηνων κυττάρων αίματος, ενώ ανιχνεύουμε τα mRNA αντίγραφα για το MART-1 και το MITF-M μέχρι 1 κύτταρο SK-MEL 28 σε υπόβαθρο 10.000.000 μονοπύρηνων κυττάρων αίματος. Στη συνέχεια προχωρήσουμε σε ασθενείς οι οποίοι πάσχουν από μελάνωμα. Συλλέξαμε 81 δείγματα μελανώματος χωρίς να γνωρίζουμε εκ των προτέρων τα κλινικοπαθολογικά χαρακτηριστικά κάθε ασθενούς. Απομονώσαμε το γενετικό υλικό (RNA) σε αυτά τα δείγματα και εφαρμόσαμε το πρωτόκολλο μας όπως ακριβώς αυτό είχε στηθεί κατά την εύρεση της ευαισθησίας της μεθόδου μας. Μετά το πέρας των αναλύσεων μας, συλλέξαμε τα κλινικοπαθολογικά χαρακτηριστικά των ασθενών. Το επόμενο βήμα ήταν η συσχέτιση με τα αποτελέσματα της multiplex PCR, η στατιστική επεξεργασία των αποτελεσμάτων και η τελική αξιολόγηση της μεθόδου μας.Η ιδιαίτερη αξία της multiplex PCR έγκειται στην ανίχνευση των δεικτών μας ανάλογα του σταδίου και κυρίως ως προς την επίπτωση αυτής της ανίχνευσης στην επιβίωση. Στα αποτελέσματα μας αποδεικνύουμε ότι μπορούμε να ταυτίσουμε την ανίχνευση των δεικτών με τη νόσο ακόμα και με τα αρχικά στάδια, ενώ ταυτόχρονα μπορούμε να διακρίνουμε τις περιπτώσεις προχωρημένων σταδίων καθώς και ότι το στάδιο σχετίζεται με τον αριθμό των δεικτών που ανιχνεύονται (p<0,001). Επίσης, αποδείχθηκε ότι ο αριθμός των δεικτών που ανιχνεύονται σχετίζεται θετικά με την επιβίωση ή την πορεία για υποτροπή (p<0,01). Με αυτά τα αποτελέσματα αποδεικνύουμε ότι έχουμε στήσει μια μη επεμβατική, φθηνή, αξιόπιστη, γρήγορη, εύκολη και απλή διαδικασία που μπορεί να μας βοηθήσει να προσδιορίσουμε ακριβέστερα το στάδιο και την πρόγνωση του ασθενούς (υποτροπή, πιθανότητα θανάτου)
Going Beyond Counting First Authors in Author Co-citation Analysis
Full text linkThe present study examines one of the fundamental aspects of author co-citation analysis (ACA) - the way co-citation
counts are defined. Co-citation counting provides the data on which all subsequent statistical analyses and mappings
are based, and we compare ACA results based on two different types of co-citation counting - the traditional type that
only counts the first one among a cited work's authors on the one hand and a non-traditional type that takes into
account the first 5 authors of a cited work on the other hand. Results indicate that the picture produced through this non-traditional author co-citation counting contains more coherent author groups and is therefore considerably clearer. However, this picture represents fewer specialties in the research field being studied than that produced through the traditional first-author co-citation counting when the same number of top-ranked authors is selected and analyzed. Reasons for these effects are discussed
Variations on the Author
Full text link“Variations on the Author” discusses two of Eduardo Coutinho’s recent films (Um Dia na Vida, from 2010, and Últimas Conversas, posthumously released in 2015) and their contribution to the general question of documentary authorship. The director’s filmography is characterized by a consistent yet self-effacing form of authorial self-inscription: Coutinho often features as an interviewer that rather than express opinions propels discourses; an interviewer that is good at listening. This mode of self-inscription characterizes him as an author who is not expressive but who is nonetheless markedly present on the screen. In Um Dia na Vida, however, Coutinho is completely absent form the image, while Últimas Conversas, on the contrary, includes a confessional prologue that moves the director from the margins to the center of his films. This article examines the ways in which these works stand out in the filmography of a director who offers new insights into the notion of cinematic authorship
Appropriate Similarity Measures for Author Cocitation Analysis
Full text linkWe provide a number of new insights into the methodological discussion about author cocitation analysis. We first argue that the use of the Pearson correlation for measuring the similarity between authors’ cocitation profiles is not very satisfactory. We then discuss what kind of similarity measures may be used as an alternative to the Pearson correlation. We consider three similarity measures in particular. One is the well-known cosine. The other two similarity measures have not been used before in the bibliometric literature. Finally, we show by means of an example that our findings have a high practical relevance.information science;Pearson correlation;cosine;similarity measure;author cocitation analysis
Dispelling the Myths Behind First-author Citation Counts
Full text linkWe conducted a full-scale evaluative citation analysis study of scholars in the XML research field to explore just how different from each other author rankings resulting from different citation counting methods actually are, and to demonstrate the capability of emerging data and tools on the Web in supporting more realistic citation counting methods. Our results contest some common arguments for the continued
use of first-author citation counts in the evaluation of scholars, such as high correlations between author rankings by first-author citation counts and other citation
counting methods, and high costs of using more realistic citation counting methods that are not well-supported by the ISI databases. It is argued that increasingly available digital full text research papers make it possible for citation analysis studies to go beyond what the ISI databases have directly supported and to employ more
sophisticated methods
koamabayili/VECTRON-author-checklist: VECTRON author checklist
No full textWe have done our best to complete the author checklist relating to the use of animals in the hut study. Note that the objective for the hut study was to evaluate the IRS treatment applications for residual efficacy against Anopheles mosquitoes, including the local An. coluzzii mosquito population. Cows were only used to attract mosquitoes into the huts and no tests were carried out directly on the cows. The author checklist is intended for use with studies where experiments are carried out on animals, which is why we have had such difficulty in completing this for the hut study, as many of the questions do not relate to how the cows were used
Author-wise bibliometric analysis based on entropy.
No full textAuthor-wise bibliometric analysis based on entropy.</p
- …
