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A dengue outbreak in a rural community in Northern Coastal Ecuador: An analysis using unmanned aerial vehicle mapping
Full text linkDengue is recognized as a major health issue in large urban tropical cities but is also observed in rural areas. In these environments, physical characteristics of the landscape and sociodemographic factors may influence vector populations at small geographic scales, while prior immunity to the four dengue virus serotypes affects incidence. In 2019, a rural northwestern Ecuadorian community, only accessible by river, experienced a dengue outbreak. The village is 2–3 hours by boat away from the nearest population center and comprises both Afro-Ecuadorian and Indigenous Chachi households. We used multiple data streams to examine spatial risk factors associated with this outbreak, combining maps collected with an unmanned aerial vehicle (UAV), an entomological survey, a community census, and active surveillance of febrile cases. We mapped visible water containers seen in UAV images and calculated both the green-red vegetation index (GRVI) and household proximity to public spaces like schools and meeting areas. To identify risk factors for symptomatic dengue infection, we used mixedeffect logistic regression models to account for the clustering of symptomatic cases within households. We identified 55 dengue cases (9.5% of the population) from 37 households. Cases peaked in June and continued through October. Rural spatial organization helped to explain disease risk. Afro-Ecuadorian (versus Indigenous) households experience more symptomatic dengue (OR = 3.0, 95%CI: 1.3, 6.9). This association was explained by differences in vegetation (measured by GRVI) near the household (OR: 11.3 95% 0.38, 38.0) and proximity to the football field (OR: 13.9, 95% 4.0, 48.4). The integration of UAV mapping with other data streams adds to our understanding of these dynamics
Going Beyond Counting First Authors in Author Co-citation Analysis
Full text linkThe present study examines one of the fundamental aspects of author co-citation analysis (ACA) - the way co-citation
counts are defined. Co-citation counting provides the data on which all subsequent statistical analyses and mappings
are based, and we compare ACA results based on two different types of co-citation counting - the traditional type that
only counts the first one among a cited work's authors on the one hand and a non-traditional type that takes into
account the first 5 authors of a cited work on the other hand. Results indicate that the picture produced through this non-traditional author co-citation counting contains more coherent author groups and is therefore considerably clearer. However, this picture represents fewer specialties in the research field being studied than that produced through the traditional first-author co-citation counting when the same number of top-ranked authors is selected and analyzed. Reasons for these effects are discussed
Cancer epidemiology in French Guiana : Data analysis of the cancer registry of Frence Guiana
No full textL'objectif du registre des cancers de Guyane est de collecter l ensemble des tumeurs invasives et/ou in situ survenues depuis le 1er janvier 2003 chez des patients vivant en Guyane, quels que soient la localisation de la tumeur, le lieu de diagnostic et de traitement. Cette thèse a pour but de décrire la population atteinte d un cancer afin d améliorer les connaissances sur cette maladie et ainsi de permettre aux actions de santé publique d être plus efficaces.De 2003 à 2009, le taux d incidence des cancers standardisé sur l âge était, dans les deux sexes, 30% inférieur en Guyane par rapport à la France métropolitaine et n était pas différent de celui d Amérique du Sud.Nous avons comparé l incidence, la mortalité et la survie relative des patientes atteintes d un cancer invasif du sein (CIS) et des patientes atteintes d un cancer invasif du col de l utérus (CIC) entre la Guyane et la métropole.Le ratio incidence/mortalité indiquait que les cancers du sein étaient de plus mauvais pronostic en Guyane par rapport à la métropole.La survie relative des femmes atteintes d un CIS était inférieure en Guyane par rapport à la France métropolitaine.En Guyane, le taux standardisé d incidence du cancer du col de l utérus était 4 fois plus élevé qu en métropole. Les femmes vivant dans l intérieur de la Guyane semblaient être diagnostiquées à un stade plus tardif et plus souvent sur symptômes que les femmes du littoral. L accès aux soins des migrants est un challenge et une source d inégalité de santé. La détection précoce des cancers à travers des programmes de prévention est cruciale pour améliorer la survie par cancer et notamment chez les patients étrangers.The objective of the cancer registry of French Guiana is to compile all patients living in French Guiana with malignant invasive pathology and/or in situ lesions starting January 1st 2003 in persons living in French Guiana, whatever the tumoral location and the place of diagnosis and care. This study aimed to describe the population with invasive cancer to improve the knowledge about this disease in order to target public health interventions more effectively.The age standardised incidence rate was 30% times lower than in France in both sexes and the same than in South America.We compared incidence and relative survival of patients with invasive breast cancer (IBC) and patients with invasive cervical cancer (ICC) between women from French Guiana and metropolitan France.The ratio between incidence and mortality showed that the prognosis of IBC in French Guiana was worse than in metropolitan France.The relative survival rate among women with IBC in French Guiana was lower than among women in metropolitan France.In French Guiana, the age-standardized incidence rate of cervical cancer was four times higher than in France. Women living in remote areas seemed to be diagnosed later and more often following symptoms.Access to care for migrants is challenging and sustains health inequalities. Early detection through prevention programs is crucial for increasing cancer survival notably for foreign-born patients. Further studies with more patients and other variables could improve the knowledge about these disease
Histoplasmosis among people living with HIV in French Guiana
No full textL’histoplasmose est une infection fongique invasive. Elle était décrite comme une des principales infections opportunistes et une des premières causes de décès au stade SIDA en Guyane française.Plusieurs travaux scientifiques ont été menés. Classée première infection opportuniste au stade SIDA, l’incidence de l’histoplasmose était estimé à 1,5 p100 personne-années infectées par le VIH. Le nombre de cas incidents était stable à un niveau élevé et la proportion de décès précoces <10%. Avec une surincidence des cas en fin de saison sèche et début de petite saison des pluies, le principal processus menant à une maladie symptomatique était une nouvelle infection. La comparaison des cas de tuberculose et d’histoplasmose retrouvait respectivement, un profil clinique respiratoire dans un contexte inflammatoire marqué et, un profil disséminé accompagné de cytopénies et d’anomalies hépatiques chez des patients plus immunodéprimés. L’évaluation de la détection sérique de l’antigène galactomananne était pertinente pour le diagnostic de l’histoplasmose. Une redéfinition des critères de sévérité et le développement d’arguments pour une stratégie thérapeutique empirique à visée antifongique étaient proposés.Des résultats préliminaires démontraient la présence (au Suriname et au Guyana) et une incidence importante de l’histoplasmose chez les patients infectés par le VIH du Suriname. A l’échelle de l’Amérique Latine, la mortalité liée à l’histoplasmose était estimée équivalente voire supérieure à celle de la tuberculose chez les patients infectés par le VIH. L’histoplasmose y était jugée négligée, méconnue, responsable de nombreux décès évitables.Histoplasmosis is an invasive fungal infection, known as one of the first AIDS-defining condition and AIDS-related deaths in French Guiana.Several scientific programmes were conducted. Ranked as the main AIDS-defining condition, histoplasmosis incidence was estimated at 1.5 p100 person-years HIV-infected. The high number of incident cases was stable and the proportion of early deaths was <10%. Following a significant increase in incidence between the end of the long dry season and the beginning of the short wet season, new infection might be the main pathophysiological mechanism leading to symptomatic disease in endemic areas. Comparison of tuberculosis and histoplasmosis in HIV-infected patients found a respiratory clinical picture in a context of pronounced inflammation and, a disseminated disease along with cytopenia and liver test abnormalities in individuals with greater immunosuppression, respectively. An evaluation of galactomannan antigen detection in serum was relevant for histoplasmosis diagnosis. Reframed severity criteria and arguments for an empiric strategy using antifungal therapy were proposed.Preliminary results showed the presence (in Suriname and Guyana) and a high incidence of histoplasmosis among HIV-infected patients in Suriname. In the whole Latin American region, we estimated that AIDS-related histoplasmosis deaths were similar or greater than AIDS-related tuberculosis deaths. HIV-associated histoplasmosis is in fact neglected, largely unknown and responsible for numerous avoidable deaths in Latin America
Variations on the Author
Full text link“Variations on the Author” discusses two of Eduardo Coutinho’s recent films (Um Dia na Vida, from 2010, and Últimas Conversas, posthumously released in 2015) and their contribution to the general question of documentary authorship. The director’s filmography is characterized by a consistent yet self-effacing form of authorial self-inscription: Coutinho often features as an interviewer that rather than express opinions propels discourses; an interviewer that is good at listening. This mode of self-inscription characterizes him as an author who is not expressive but who is nonetheless markedly present on the screen. In Um Dia na Vida, however, Coutinho is completely absent form the image, while Últimas Conversas, on the contrary, includes a confessional prologue that moves the director from the margins to the center of his films. This article examines the ways in which these works stand out in the filmography of a director who offers new insights into the notion of cinematic authorship
Epidemiology of infectious disease and outbreak in amazonian remote
No full textLes études dans les régions isolées de la Guyane française sont rares. L'objectif principal de ce travail est d'analyser les principales données épidémiologiques résultant de des investigations sur les maladies infectieuses et épidémiques menées dans les centres de santé des régions isolées et frontalières de la Guyane. L’étude portant sur les personnes vivant avec le VIH a mit en évidence sur le plan spatial l'importance des zones fluviales frontalières qui constituent des zones actives de l’épidémie en termes de passage et de possible propagation mais aussi en termes de prévention, dépistage et traitement. Les investigations des épidémies de shigellose, de grippe et surtout de béribéri chez les orpailleurs soulignent le lien entre conditions de vie dégradées et problématiques de santé. La description des cas groupés de cryptosporidiose chez les enfants immunocompétents amérindiens reflètent les composantes multifactorielles des épidémies en zones isolées mettant en jeux des comportements humains spécifiques au sein d’écosystèmes tropicaux. La sévérité et la diversité des co-infections associés au besoin primaire de sécurité nutritionnelle rappellent les difficultés mais aussi l’urgence de l’adaptation des politiques de santé publiques aux populations éloignées. Enfin, l’étude menée sur le paludisme autochtone a tenté de discuter d’une nouvelle approche afin d’identifier et de traiter les infections asymptomatiques dans une zone de transmission endémique. La description des enjeux sanitaires et de l'état de santé des populations isolées dans les régions éloignées est cruciale pour la mise en œuvre d'une politique de santé optimisé en Guyane.Public health data in isolated areas of French Guiana are scarce. However, a number of different communities live in tropical forest areas.The principal objective of this study is to analyse the main epidemiological data that have resulted from clinical practice and investigations conducted at health centres in isolated areas of French Guiana and its borders. The results of HIV studies have highlighted particular events that promote the spread of outbreaks. Illegal gold miners therefore represent a significant number of cases. The importance of specific geographical border areas in epidemic dynamics has also been demonstrated. Investigations on shigellosis, influenza and, most importantly, on thiamine deficiency outbreaks in gold miners underline that precarious conditions lead to poor health. Cryptosporidiosis outbreaks among immunocompetent children also reflect the multifactorial dynamics of infectious diseases, including human behaviour and the characteristics of tropical ecosystems. The severity and diversity of parasitic, viral and bacterial co-infection associated to the need for nutrition security indicates the complexity of delivering medical care to remote populations. Finally, a study on malaria has attempted to offer a novel approach to identifying and treating asymptomatic infections in an Amerindian endemic transmission area. A description of the health status of neglected populations in remote areas is crucial to implementing a health policy in French Guiana. Considering the importance of controlling communicable disease and the severity and range of specific illnesses, new strategies are needed and should be discussed with the communities involved
Characteristics of autoimmune and systemic diseases in the Antilles-Guyana in their environment
No full textLes maladies auto-immunes et systémiques sont des maladies sur lequel le champ de la recherche pose son œil de façon appuyée depuis 15 ans, du fait de l’émergence de thérapies biologiques ciblées. Ces pathologies sont volontiers hétérogènes, au mieux de fréquence ou caractéristiques particulières dans les populations d’origine Africaine. La connaissance de l’épidémiologie, et des caractéristiques de ces maladies est un préalable essentiel à la mise en place de recherche plus fondamentale pour aider à décomposer leurs physiopathologies souvent extrêmement complexes. En effet, la comparaison de différences marquées entre deux expressions dans des populations différentes d’une même maladie peut permettre d’aider à en dénouer le fil. Nous proposons dans ce travail une estimation des caractéristiques du lupus cutané et du lupus systémique en Guyane Française qui retrouve une faible fréquence de la maladie, la plus faible jamais retrouvée dans une population subsaharienne. Nous décrivons en Martinique sur le plan épidémiologique comme clinique une forme rare de myosite appelée syndrome des anti-synthétases semblant très particulière, l’épidémiologie et la description de la maladie de Kikuchi-Fujimoto pour la première fois dans la littérature, l’épidémiologie et les caractéristiques à base de population de la maladie de Behcet, des principales vascularites (périartérite noueuse, micropolyangéite, granulomatose éosinophile avec polyangéite, granulomatose avec polyangéite), de l’hypertension pulmonaire des connectivites qui semblent plus fréquentes que chez les Européens. Les néphropathies du lupus systémiques sont décrites dans la population Guadeloupéenne montrant une grande fréquence des néphropathies prolifératives. Le protocole EUROLUPUS qui permet le traitement de ces néphropathies prolifératives du lupus systémique avec de faibles doses de cyclophosphamide et de corticoïdes, est évalué en Martinique sur 30 patients alors qu’il ne l’a jamais été dans une population d’origine Africaine. Il semble y être aussi efficace que chez les patients d’origine Européenne, alors que les néphropathies y ont un pronostic meilleur. La maladie de Sjögren primaire est décrite en Martinique très proche de ce qu’on trouve en Europe sur le plan du tableau clinique et évolutif alors que cela n’est l’objet d’aucune étude dans une population d’origine noire Africaine. Nous avons par ailleurs montré en Martinique l’amélioration de la prise en charge du lupus systémique en Martinique au travers de la régression au fil du temps d’une des complications de la corticothérapie les plus pénibles pour les patients, l’ostéonécrose aseptique. La sclérodermie systémique est décrite à base de population avec épidémiologie dans les deux départements de Guadeloupe et Martinique, montrant des caractéristiques proches de celles retrouvées chez les AfroAméricains. Nous avons aussi montré la fréquence et la gravité des atteintes ORL des myopathies inflammatoires sur ces 2 départements avec une fréquence inhabituelle de certaines maladies auto-immunes dont le lupus systémique et les myosites inflammatoires associées aux anticorps anti-SRP, et l’absence de myosite à inclusion. Au total, nous apportons une somme de connaissance descriptive de ces maladies auto-immunes et systémiques permettant la mise en place de recherches plus fondamentales avec des bases solides par rapport aux profils hétérogènes de ces maladies.Auto-immunes and systemic diseases are priorities for researchers since 15 years. This is related to the emergence of biological therapies, associated to great efficacy. Although, these diseases are heterogeneous, depending of different parameters such as ethnicity or geography. In the African descent population, we encounter unusual or particular manifestations of these diseases. Also, the knowledge of epidemiology and population based descriptions are crucial to properly initiate works on these populations, but also to understand a particularly complex physiopathology by using differences between populations. We describe in this work the population based characteristics of pure cutaneous lupus and systemic lupus, including an epidemiology of the incidence of the lowest incidence ever found in a population of African heritage. We also describe a population based series of anti-synthetase syndrome, confirming that the presentation is totally different compared to caucasians, and allows in Martinique the incidence, never explored before. We also provide the first evaluation of Kikuchi-Fujimoto disease in a population of African origin, and the first incidence ever realized. We do the same evaluation of the epidemiology of Behcet’s disease in a black origin population that shows that this disease was at a similar frequency in Martinique and in Europe. Micropolyangeitis, polyarteritis, eosinophilic granulomatosis with polyangeitis and Granulomatosis with polyangeitis were evaluated in an epidemiologic study in Martinique, with addition of some cases from other French American region for a more powerful characteristics description. These diseases seem less frequent than in Europe, associated with less severity except for micropolyangeitis. EUROLUPUS, a protocol with low dose IV cyclophosphamide and low dose steroids, used to treat proliferative nephritis of systemic lupus is shown to have the same efficacy in Martinique than in patients of European origin. Primary Sjögren syndrome, evaluated in Martinique, is very similar in expression than what is found in Europe. The decrease overtime of aseptic osteonecrosis, a steroid side effect, is a witness of better control of systemic lupus activity with less usage permitted by protocols and new immunosuppressive drugs such as mycophenolate. Systemic sclerosis is described as very close to African American in a population based study in Martinique and Guadeloupe. We finally show that the rare ENT involvement of idiopathic inflammatory myositis is frequent in our population, associated with poor outcome, and surprisingly frequently related to systemic lupus and necrotizing myositis associated to SRP antibody but not to inclusion body myositis. To conclude, we allow an amount of description of these diseases in our region, including pioneer studies. This works tends to be the basis for studies to be continued in a more fundamental way in our countries
Appropriate Similarity Measures for Author Cocitation Analysis
Full text linkWe provide a number of new insights into the methodological discussion about author cocitation analysis. We first argue that the use of the Pearson correlation for measuring the similarity between authors’ cocitation profiles is not very satisfactory. We then discuss what kind of similarity measures may be used as an alternative to the Pearson correlation. We consider three similarity measures in particular. One is the well-known cosine. The other two similarity measures have not been used before in the bibliometric literature. Finally, we show by means of an example that our findings have a high practical relevance.information science;Pearson correlation;cosine;similarity measure;author cocitation analysis
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