1,720,971 research outputs found
Going Beyond Counting First Authors in Author Co-citation Analysis
Get PDFThe present study examines one of the fundamental aspects of author co-citation analysis (ACA) - the way co-citation
counts are defined. Co-citation counting provides the data on which all subsequent statistical analyses and mappings
are based, and we compare ACA results based on two different types of co-citation counting - the traditional type that
only counts the first one among a cited work's authors on the one hand and a non-traditional type that takes into
account the first 5 authors of a cited work on the other hand. Results indicate that the picture produced through this non-traditional author co-citation counting contains more coherent author groups and is therefore considerably clearer. However, this picture represents fewer specialties in the research field being studied than that produced through the traditional first-author co-citation counting when the same number of top-ranked authors is selected and analyzed. Reasons for these effects are discussed
Variations on the Author
Get PDF“Variations on the Author” discusses two of Eduardo Coutinho’s recent films (Um Dia na Vida, from 2010, and Últimas Conversas, posthumously released in 2015) and their contribution to the general question of documentary authorship. The director’s filmography is characterized by a consistent yet self-effacing form of authorial self-inscription: Coutinho often features as an interviewer that rather than express opinions propels discourses; an interviewer that is good at listening. This mode of self-inscription characterizes him as an author who is not expressive but who is nonetheless markedly present on the screen. In Um Dia na Vida, however, Coutinho is completely absent form the image, while Últimas Conversas, on the contrary, includes a confessional prologue that moves the director from the margins to the center of his films. This article examines the ways in which these works stand out in the filmography of a director who offers new insights into the notion of cinematic authorship
Appropriate Similarity Measures for Author Cocitation Analysis
Get PDFWe provide a number of new insights into the methodological discussion about author cocitation analysis. We first argue that the use of the Pearson correlation for measuring the similarity between authors’ cocitation profiles is not very satisfactory. We then discuss what kind of similarity measures may be used as an alternative to the Pearson correlation. We consider three similarity measures in particular. One is the well-known cosine. The other two similarity measures have not been used before in the bibliometric literature. Finally, we show by means of an example that our findings have a high practical relevance.information science;Pearson correlation;cosine;similarity measure;author cocitation analysis
Modélisation mécaniste de la dynamique de biomarqueurs chez les poissons téléostéens : lien entre exposition et effetsprécoces
No full textBiomarkers are useful tools for the diagnosis of environmental risk in aquatic ecosystems. Nevertheless, the measurement of these sub-individual markers still presents some limitations for the assessment of ecosystem health, including the characterisation of the complex dynamics of responses of these non-lethal effects as a function of time or dose, or the extrapolation of responses from one scale of biological organisation to another. One of the solutions that seems promising for characterising the dynamics of these responses from a change of scale perspective would be to integrate the biomarkers into mechanistic models that make it possible to predict these dynamics and explain the mechanisms underlying the effects. This thesis proposes to build mechanistic models of physiologically based toxicokinetics and toxicodynamics (PBTK-TD) to better characterise and understand the response dynamics of biomarkers. In this context, the problem of biomarker dynamics was divided in two. First, the "toxico-kinetic" or TK makes it possible to link the external dose, present in the environment, to the internal dose, present in the organism. Second, the "toxico-dynamic" or TD, makes the link between the internal dose and the effect. Accordingly, the first step in this thesis was to collect a set of TK and TD data in our model species, the three-spined stickleback, on a family of compounds, the bisphenols, and more specifically, BPA, BPS and BPF. These data, collected from short-term exposures (seven days of contamination and seven days of depuration) and long-term exposure (21 days), were used to compare the modulating effects of bisphenols on biomarkers. In particular, markers of innate immunity were strongly impacted by these substances. Differences in kinetics between BPA and BPS were also highlighted. Subsequently, the data collected during the exposures were used to build a physiologically based TK model (PBTK) for BPA, then a PBTK model coupled with TD sub-models (PBTK-TD) describing the dynamics of certain immunomarkers in the stickleback. Finally, a last PBTK-TD model was built to demonstrate the feasibility of this modelling approach for integrating exposure conditions more representative of those in the natural environment, i.e. for a mixture of substances. Taken as a whole, this thesis demonstrates the attractiveness of coupling the experimental approach consisting in measuring biomarkers and modelling.Les biomarqueurs sont des outils d'un grand intérêt mis en oeuvre pour établir un diagnostic de risque environnemental pour les écosystèmes aquatiques. Néanmoins, la mesure de ces marqueurs sub-individuels présentent encore certaines limitations pour l'évaluation de la qualité des écosystèmes, parmi lesquelles la caractérisation des dynamiques parfois complexes de réponses de ces effets non-léthaux en fonction du temps ou de la dose ou encore l'extrapolation des réponses d'une échelle d'organisation biologique à une autre. Une des solutions semblant prometteuses pour caractériser la dynamique de ces réponses dans une optique de changement d’échelle serait d’intégrer les biomarqueurs à des modèles mécanistiques permettant de prédire cette dynamique et d’expliquer les mécanismes sous-jacents à l’apparition des effets. Ainsi, ce travail de thèse propose de construire des modèles mécanistiques de toxicocinétique et toxicodynamie à base physiologique (PBTK-TD) pour mieux caractériser et mieux comprendre les dynamiques de réponse des biomarqueurs. Dans ce cadre, pour aborder cette problématique, une stratégie décomposée en deux sous-parties a été utilisée. Tout d’abord une étude de la partie « toxico-cinétique » ou TK a permis de relier la dose externe, présente dans l’environnement, à la dose interne, présente dans l’organisme. Puis, la partie « toxico-dynamique » ou TD a été développé pour faire le lien entre la dose interne et l’effet. Dans un premier temps, ce travail de thèse a consisté à collecter un ensemble de données TK et TD chez notre espèce-modèle, l’épinoche à trois épines, sur une famille de molécules, les bisphénols, et plus particulièrement, le BPA, le BPS et le BPF. Ces données récoltées à partir d’expositions de courte durée (sept jours de contamination et sept jours de dépuration) et d’une exposition de longue durée (21 jours) ont tout d’abord permis de comparer les effets de modulation des bisphénols sur les biomarqueurs. Les marqueurs de l’immunité innée ont notamment été fortement impactés par ces substances. Des différences de cinétique entre le BPA et le BPS ont par ailleurs été mise en avant. Par la suite, les données collectées au cours des expositions ont été utilisée pour construire un modèle TK à base physiologique (PBTK) pour le BPA, puis un modèle PBTK couplé à des sous-modèles TD (PBTK-TD) décrivant la dynamique de certains immunomarqueurs. Enfin, un dernier modèle PBTK-TD a été construit pour démontrer la faisabilité de cette démarche de modélisation pour intégrer des conditions d’exposition plus représentatives de celles du milieu naturel, i.e. pour un mélange de substances. Considéré dans son ensemble, ce travail de thèse démontre l’attractivité du couplage entre l’approche expérimentale par la mesure de biomarqueurs et la modélisation
Modélisation mécaniste de la dynamique de biomarqueurs chez les poissons téléostéens : lien entre exposition et effetsprécoces
No full textBiomarkers are useful tools for the diagnosis of environmental risk in aquatic ecosystems. Nevertheless, the measurement of these sub-individual markers still presents some limitations for the assessment of ecosystem health, including the characterisation of the complex dynamics of responses of these non-lethal effects as a function of time or dose, or the extrapolation of responses from one scale of biological organisation to another. One of the solutions that seems promising for characterising the dynamics of these responses from a change of scale perspective would be to integrate the biomarkers into mechanistic models that make it possible to predict these dynamics and explain the mechanisms underlying the effects. This thesis proposes to build mechanistic models of physiologically based toxicokinetics and toxicodynamics (PBTK-TD) to better characterise and understand the response dynamics of biomarkers. In this context, the problem of biomarker dynamics was divided in two. First, the "toxico-kinetic" or TK makes it possible to link the external dose, present in the environment, to the internal dose, present in the organism. Second, the "toxico-dynamic" or TD, makes the link between the internal dose and the effect. Accordingly, the first step in this thesis was to collect a set of TK and TD data in our model species, the three-spined stickleback, on a family of compounds, the bisphenols, and more specifically, BPA, BPS and BPF. These data, collected from short-term exposures (seven days of contamination and seven days of depuration) and long-term exposure (21 days), were used to compare the modulating effects of bisphenols on biomarkers. In particular, markers of innate immunity were strongly impacted by these substances. Differences in kinetics between BPA and BPS were also highlighted. Subsequently, the data collected during the exposures were used to build a physiologically based TK model (PBTK) for BPA, then a PBTK model coupled with TD sub-models (PBTK-TD) describing the dynamics of certain immunomarkers in the stickleback. Finally, a last PBTK-TD model was built to demonstrate the feasibility of this modelling approach for integrating exposure conditions more representative of those in the natural environment, i.e. for a mixture of substances. Taken as a whole, this thesis demonstrates the attractiveness of coupling the experimental approach consisting in measuring biomarkers and modelling.Les biomarqueurs sont des outils d'un grand intérêt mis en oeuvre pour établir un diagnostic de risque environnemental pour les écosystèmes aquatiques. Néanmoins, la mesure de ces marqueurs sub-individuels présentent encore certaines limitations pour l'évaluation de la qualité des écosystèmes, parmi lesquelles la caractérisation des dynamiques parfois complexes de réponses de ces effets non-léthaux en fonction du temps ou de la dose ou encore l'extrapolation des réponses d'une échelle d'organisation biologique à une autre. Une des solutions semblant prometteuses pour caractériser la dynamique de ces réponses dans une optique de changement d’échelle serait d’intégrer les biomarqueurs à des modèles mécanistiques permettant de prédire cette dynamique et d’expliquer les mécanismes sous-jacents à l’apparition des effets. Ainsi, ce travail de thèse propose de construire des modèles mécanistiques de toxicocinétique et toxicodynamie à base physiologique (PBTK-TD) pour mieux caractériser et mieux comprendre les dynamiques de réponse des biomarqueurs. Dans ce cadre, pour aborder cette problématique, une stratégie décomposée en deux sous-parties a été utilisée. Tout d’abord une étude de la partie « toxico-cinétique » ou TK a permis de relier la dose externe, présente dans l’environnement, à la dose interne, présente dans l’organisme. Puis, la partie « toxico-dynamique » ou TD a été développé pour faire le lien entre la dose interne et l’effet. Dans un premier temps, ce travail de thèse a consisté à collecter un ensemble de données TK et TD chez notre espèce-modèle, l’épinoche à trois épines, sur une famille de molécules, les bisphénols, et plus particulièrement, le BPA, le BPS et le BPF. Ces données récoltées à partir d’expositions de courte durée (sept jours de contamination et sept jours de dépuration) et d’une exposition de longue durée (21 jours) ont tout d’abord permis de comparer les effets de modulation des bisphénols sur les biomarqueurs. Les marqueurs de l’immunité innée ont notamment été fortement impactés par ces substances. Des différences de cinétique entre le BPA et le BPS ont par ailleurs été mise en avant. Par la suite, les données collectées au cours des expositions ont été utilisée pour construire un modèle TK à base physiologique (PBTK) pour le BPA, puis un modèle PBTK couplé à des sous-modèles TD (PBTK-TD) décrivant la dynamique de certains immunomarqueurs. Enfin, un dernier modèle PBTK-TD a été construit pour démontrer la faisabilité de cette démarche de modélisation pour intégrer des conditions d’exposition plus représentatives de celles du milieu naturel, i.e. pour un mélange de substances. Considéré dans son ensemble, ce travail de thèse démontre l’attractivité du couplage entre l’approche expérimentale par la mesure de biomarqueurs et la modélisation
Modélisation mécaniste de la dynamique de biomarqueurs chez les poissons téléostéens : lien entre exposition et effetsprécoces
No full textBiomarkers are useful tools for the diagnosis of environmental risk in aquatic ecosystems. Nevertheless, the measurement of these sub-individual markers still presents some limitations for the assessment of ecosystem health, including the characterisation of the complex dynamics of responses of these non-lethal effects as a function of time or dose, or the extrapolation of responses from one scale of biological organisation to another. One of the solutions that seems promising for characterising the dynamics of these responses from a change of scale perspective would be to integrate the biomarkers into mechanistic models that make it possible to predict these dynamics and explain the mechanisms underlying the effects. This thesis proposes to build mechanistic models of physiologically based toxicokinetics and toxicodynamics (PBTK-TD) to better characterise and understand the response dynamics of biomarkers. In this context, the problem of biomarker dynamics was divided in two. First, the "toxico-kinetic" or TK makes it possible to link the external dose, present in the environment, to the internal dose, present in the organism. Second, the "toxico-dynamic" or TD, makes the link between the internal dose and the effect. Accordingly, the first step in this thesis was to collect a set of TK and TD data in our model species, the three-spined stickleback, on a family of compounds, the bisphenols, and more specifically, BPA, BPS and BPF. These data, collected from short-term exposures (seven days of contamination and seven days of depuration) and long-term exposure (21 days), were used to compare the modulating effects of bisphenols on biomarkers. In particular, markers of innate immunity were strongly impacted by these substances. Differences in kinetics between BPA and BPS were also highlighted. Subsequently, the data collected during the exposures were used to build a physiologically based TK model (PBTK) for BPA, then a PBTK model coupled with TD sub-models (PBTK-TD) describing the dynamics of certain immunomarkers in the stickleback. Finally, a last PBTK-TD model was built to demonstrate the feasibility of this modelling approach for integrating exposure conditions more representative of those in the natural environment, i.e. for a mixture of substances. Taken as a whole, this thesis demonstrates the attractiveness of coupling the experimental approach consisting in measuring biomarkers and modelling.Les biomarqueurs sont des outils d'un grand intérêt mis en oeuvre pour établir un diagnostic de risque environnemental pour les écosystèmes aquatiques. Néanmoins, la mesure de ces marqueurs sub-individuels présentent encore certaines limitations pour l'évaluation de la qualité des écosystèmes, parmi lesquelles la caractérisation des dynamiques parfois complexes de réponses de ces effets non-léthaux en fonction du temps ou de la dose ou encore l'extrapolation des réponses d'une échelle d'organisation biologique à une autre. Une des solutions semblant prometteuses pour caractériser la dynamique de ces réponses dans une optique de changement d’échelle serait d’intégrer les biomarqueurs à des modèles mécanistiques permettant de prédire cette dynamique et d’expliquer les mécanismes sous-jacents à l’apparition des effets. Ainsi, ce travail de thèse propose de construire des modèles mécanistiques de toxicocinétique et toxicodynamie à base physiologique (PBTK-TD) pour mieux caractériser et mieux comprendre les dynamiques de réponse des biomarqueurs. Dans ce cadre, pour aborder cette problématique, une stratégie décomposée en deux sous-parties a été utilisée. Tout d’abord une étude de la partie « toxico-cinétique » ou TK a permis de relier la dose externe, présente dans l’environnement, à la dose interne, présente dans l’organisme. Puis, la partie « toxico-dynamique » ou TD a été développé pour faire le lien entre la dose interne et l’effet. Dans un premier temps, ce travail de thèse a consisté à collecter un ensemble de données TK et TD chez notre espèce-modèle, l’épinoche à trois épines, sur une famille de molécules, les bisphénols, et plus particulièrement, le BPA, le BPS et le BPF. Ces données récoltées à partir d’expositions de courte durée (sept jours de contamination et sept jours de dépuration) et d’une exposition de longue durée (21 jours) ont tout d’abord permis de comparer les effets de modulation des bisphénols sur les biomarqueurs. Les marqueurs de l’immunité innée ont notamment été fortement impactés par ces substances. Des différences de cinétique entre le BPA et le BPS ont par ailleurs été mise en avant. Par la suite, les données collectées au cours des expositions ont été utilisée pour construire un modèle TK à base physiologique (PBTK) pour le BPA, puis un modèle PBTK couplé à des sous-modèles TD (PBTK-TD) décrivant la dynamique de certains immunomarqueurs. Enfin, un dernier modèle PBTK-TD a été construit pour démontrer la faisabilité de cette démarche de modélisation pour intégrer des conditions d’exposition plus représentatives de celles du milieu naturel, i.e. pour un mélange de substances. Considéré dans son ensemble, ce travail de thèse démontre l’attractivité du couplage entre l’approche expérimentale par la mesure de biomarqueurs et la modélisation
Mechanistic modelling of biomarker dynamics in teleost fish : link between exposure and early effects
No full textLes biomarqueurs sont des outils d'un grand intérêt mis en oeuvre pour établir un diagnostic de risque environnemental pour les écosystèmes aquatiques. Néanmoins, la mesure de ces marqueurs sub-individuels présentent encore certaines limitations pour l'évaluation de la qualité des écosystèmes, parmi lesquelles la caractérisation des dynamiques parfois complexes de réponses de ces effets non-léthaux en fonction du temps ou de la dose ou encore l'extrapolation des réponses d'une échelle d'organisation biologique à une autre. Une des solutions semblant prometteuses pour caractériser la dynamique de ces réponses dans une optique de changement d’échelle serait d’intégrer les biomarqueurs à des modèles mécanistiques permettant de prédire cette dynamique et d’expliquer les mécanismes sous-jacents à l’apparition des effets. Ainsi, ce travail de thèse propose de construire des modèles mécanistiques de toxicocinétique et toxicodynamie à base physiologique (PBTK-TD) pour mieux caractériser et mieux comprendre les dynamiques de réponse des biomarqueurs. Dans ce cadre, pour aborder cette problématique, une stratégie décomposée en deux sous-parties a été utilisée. Tout d’abord une étude de la partie « toxico-cinétique » ou TK a permis de relier la dose externe, présente dans l’environnement, à la dose interne, présente dans l’organisme. Puis, la partie « toxico-dynamique » ou TD a été développé pour faire le lien entre la dose interne et l’effet. Dans un premier temps, ce travail de thèse a consisté à collecter un ensemble de données TK et TD chez notre espèce-modèle, l’épinoche à trois épines, sur une famille de molécules, les bisphénols, et plus particulièrement, le BPA, le BPS et le BPF. Ces données récoltées à partir d’expositions de courte durée (sept jours de contamination et sept jours de dépuration) et d’une exposition de longue durée (21 jours) ont tout d’abord permis de comparer les effets de modulation des bisphénols sur les biomarqueurs. Les marqueurs de l’immunité innée ont notamment été fortement impactés par ces substances. Des différences de cinétique entre le BPA et le BPS ont par ailleurs été mise en avant. Par la suite, les données collectées au cours des expositions ont été utilisée pour construire un modèle TK à base physiologique (PBTK) pour le BPA, puis un modèle PBTK couplé à des sous-modèles TD (PBTK-TD) décrivant la dynamique de certains immunomarqueurs. Enfin, un dernier modèle PBTK-TD a été construit pour démontrer la faisabilité de cette démarche de modélisation pour intégrer des conditions d’exposition plus représentatives de celles du milieu naturel, i.e. pour un mélange de substances. Considéré dans son ensemble, ce travail de thèse démontre l’attractivité du couplage entre l’approche expérimentale par la mesure de biomarqueurs et la modélisation.Biomarkers are useful tools for the diagnosis of environmental risk in aquatic ecosystems. Nevertheless, the measurement of these sub-individual markers still presents some limitations for the assessment of ecosystem health, including the characterisation of the complex dynamics of responses of these non-lethal effects as a function of time or dose, or the extrapolation of responses from one scale of biological organisation to another. One of the solutions that seems promising for characterising the dynamics of these responses from a change of scale perspective would be to integrate the biomarkers into mechanistic models that make it possible to predict these dynamics and explain the mechanisms underlying the effects. This thesis proposes to build mechanistic models of physiologically based toxicokinetics and toxicodynamics (PBTK-TD) to better characterise and understand the response dynamics of biomarkers. In this context, the problem of biomarker dynamics was divided in two. First, the "toxico-kinetic" or TK makes it possible to link the external dose, present in the environment, to the internal dose, present in the organism. Second, the "toxico-dynamic" or TD, makes the link between the internal dose and the effect. Accordingly, the first step in this thesis was to collect a set of TK and TD data in our model species, the three-spined stickleback, on a family of compounds, the bisphenols, and more specifically, BPA, BPS and BPF. These data, collected from short-term exposures (seven days of contamination and seven days of depuration) and long-term exposure (21 days), were used to compare the modulating effects of bisphenols on biomarkers. In particular, markers of innate immunity were strongly impacted by these substances. Differences in kinetics between BPA and BPS were also highlighted. Subsequently, the data collected during the exposures were used to build a physiologically based TK model (PBTK) for BPA, then a PBTK model coupled with TD sub-models (PBTK-TD) describing the dynamics of certain immunomarkers in the stickleback. Finally, a last PBTK-TD model was built to demonstrate the feasibility of this modelling approach for integrating exposure conditions more representative of those in the natural environment, i.e. for a mixture of substances. Taken as a whole, this thesis demonstrates the attractiveness of coupling the experimental approach consisting in measuring biomarkers and modelling
Dispelling the Myths Behind First-author Citation Counts
Get PDFWe conducted a full-scale evaluative citation analysis study of scholars in the XML research field to explore just how different from each other author rankings resulting from different citation counting methods actually are, and to demonstrate the capability of emerging data and tools on the Web in supporting more realistic citation counting methods. Our results contest some common arguments for the continued
use of first-author citation counts in the evaluation of scholars, such as high correlations between author rankings by first-author citation counts and other citation
counting methods, and high costs of using more realistic citation counting methods that are not well-supported by the ISI databases. It is argued that increasingly available digital full text research papers make it possible for citation analysis studies to go beyond what the ISI databases have directly supported and to employ more
sophisticated methods
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