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    Desvendando o microbioma do solo em pastagens com Brachiaria: explorando influências varietais e fertilizante nitrogenados

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    Degradation of pasturelands is a critical issue confronting Brazil, a country with a prominent role in global beef production. Such degradation, resulting from practices such as overgrazing and inefficient soil management, leads to reduced land productivity and adverse environmental impacts, including soil degradation, deforestation, and increased carbon emissions. Efficient management strategies are essential to address these challenges, enhancing pasture resilience and productivity while minimizing ecological footprints. This thesis assessed the effect of Brachiaria varieties and different N fertilizers on the soil microbiome and physicochemical characteristics, followed by their effects on plant development and potential environmental consequences. Chapter 1 examined the effects of four Brachiaria varieties on soil microbial communities and nutrient cycling, utilizing a combination of molecular techniques and traditional soil analyses. The study revealed that Brachiaria varieties significantly enhance soil quality by improving porosity, organic carbon content, and phosphorus availability, while also influencing the soil\'s prokaryotic and fungal communities, especially those involved in the N cycle. Notably, the Brachiaria varieties were found to selectively enhance microbial communities beneficial for increase the availability of soil nutrients, pathogen resistance, and stress resilience, with the Ipyporã variety showing a distinct potential for improving soil quality and supporting intercropping systems. Chapter 2 explored into the rehabilitation of degraded Brazilian pastures through N fertilization, highlighting its potential to modify the soil microbiome and improve plant growth. Through the application of different N sources, including ammonium sulfate, urea, and castor meal, the study assessed their impact on the soil microbiome, nitrification processes, and Brachiaria plant growth. Findings indicated that while all N sources increase soil N availability and alter soil chemistry, ammonium sulfate is particularly effective in promoting prokaryotic over fungal growth, thus maintaining N related functions. Conversely, urea and castor meal appear to favor fungal communities associated with plant diseases, suggesting that the choice of N fertilizer profoundly affects soil microbial balance, nitrification efficiency, and plant root development. Overall, this thesis underscores the complex interplay between genetic selection of forage varieties, fertilization practices, and soil microbial communities in tropical pasture ecosystems. It highlights the importance of selecting appropriate Brachiaria varieties and N fertilizers to enhance soil health, support sustainable livestock production, and mitigate the environmental impacts of pasture degradation.A degradação das pastagens representa um desafio crítico para o Brasil, país de destaque na produção mundial de carne bovina. Esta degradação, causada por práticas como o pastejo intensivo e o manejo inadequado do solo, resulta na diminuição da produtividade agropecuária e em impactos ambientais negativos, tais como a degradação do solo, desmatamento e o aumento das emissões de carbono. Manejos agropecuários eficazes são fundamentais para enfrentar esses desafios, promovendo a resiliência e a produtividade das pastagens enquanto se minimiza o impacto ecológico. Esta tese avaliou o efeito de variedades de Brachiaria geneticamente aprimoradas e de diferentes fertilizantes nitrogenados no microbioma e nas características físico-químicas do solo, seguido de seus efeitos no desenvolvimento de plantas e potenciais consequências para o meio ambiente. O Capítulo 1 examinou os efeitos de quatro variedades de Brachiaria nas comunidades microbianas do solo e ciclagem de nutrientes, utilizando uma combinação de técnicas moleculares e análises físico-químicas do solo. O estudo revelou que essas variedades melhoram significativamente a qualidade do solo ao aumentar a porosidade, o conteúdo de carbono orgânico e a disponibilidade de fósforo, a passo que também moldaram as comunidades procariontes e fúngicas do solo, especialmente aquelas envolvidas no ciclo de N. Além disso, as variedades de Brachiaria recrutaram comunidades microbianas benéficas para a liberação de nutrientes, resistência a patógenos e outros estresses, com a variedade Ipyporã obtendo um destaque para melhorar a qualidade do solo, e surgir como uma alternativa promissora para sistemas de cultivo intercalar. O Capítulo 2 explorou a reabilitação de pastagens brasileiras degradadas através da fertilização com N, destacando seu potencial para modificar o microbioma do solo e melhorar o crescimento das plantas. Por meio da aplicação de diferentes fontes de N, incluindo sulfato de amônio, ureia e torta de mamona, o estudo avaliou seu impacto no microbioma do solo, nitrificação e biomassa de plantas. Para isso, utilizou-se uma combinação de técnicas moleculares e análises físico-químicas do solo. Os resultados indicaram que, o sulfato de amônio, fertilizante mais eficaz em liberar N ao sistema, promoveu o crescimento de procariontes em detrimento de fungos, favorecendo funções relacionadas ao ciclo N. Entretanto, a ureia e a torta de mamona favoreceram o crescimento fúngico, especialmente aqueles ligados a doenças de plantas e reduziram funções relacionadas ao ciclo do N. O sulfato de amônio afetou significativamente a nitrificação, provavelmente devido seu impacto nas bactérias oxidantes de amônia. Todos os fertilizantes promoveram o crescimento radicular de plantas. De maneira geral, esta tese destacou a interação complexa entre a seleção genética de variedades forrageiras, práticas de fertilização e comunidades microbianas do solo em ecossistemas de pastagens tropicais. Foi ressaltado a importância da seleção de variedades de Brachiaria e a adequada fonte do fertilizante nitrogenado para melhorar as características físicas e químicas do solo, apoiar a produção agropecuária sustentável, e mitigar os impactos ambientais da degradação das pastagens brasileiras

    Effect of soil use over time on nitrogen cycle microbial communities in tropical soils

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    Os micro-organismos possuem funções essenciais para a manutenção da vida no planeta atuando em processos biogeoquímicos, como o ciclo do N. A fixação biológica de N, nitrificação e desnitrificação são processos responsáveis por controlar o fluxo de entrada e saída do N na biosfera e são mediados pela microbiota do solo. A Floresta Amazônica, considerada um dos maiores reservatórios de biodiversidade do planeta, vem sendo desmatada e convertida em áreas de exploração agropecuária. Essas mudanças são responsáveis por modificações nas propriedades químicas do solo e consequentemente alteram a microbiota presente nesses ambientes. No entanto, o impacto dessas alterações ao longo do tempo ainda permanece pouco esclarecida, principalmente em ambientes tropicais. Com base na hipótese de que micro-organismos relacionados ao ciclo do N em solos tropicais são influenciados pelo uso do solo ao longo do tempo, o presente estudo teve como objetivo avaliar parâmetros do solo, abundância de genes marcadores relacionados ao ciclo do N e composição taxonômica de Bacteria e Archaea em solos com diferentes idades de uso da terra, rizosfera e solo de floresta primária da região amazônica. Os solos foram coletados em três áreas de agricultura, com 2, 5 e 20 anos de uso do solo e uma floresta primária, localizados na Mesorregião do Baixo Amazonas, próximos ao município de Belterra-PA. Um experimento em mesoscomo também foi realizado, para avaliação da microbiota presente na rizosfera de plantas de soja. Os solos coletados foram caracterizados quimicamente e, à partir do DNA total extraído das amostras, foram realizadas análises de quantificação dos genes marcadores filogenéticos 16S rRNA de Bacteria e Archaea; dos genes funcionais nifH, AOA, AOB, nirK e nirS; e sequenciamento em larga escala de amplicons dos genes 16S rRNA de Archaea e Bacteria. A floresta primária apresentou solo com maior acidez e menor disponibilidade de nutrientes, quando comparada com os solos de agricultura e rizosfera. De modo geral, os filos bacterianos que apresentaram maior abundância relativa foram Proteobacteria, Actinobacteria, Acidobacteria e Chloroflexi (com 24, 22, 14 e 12% respectivamente). As bactérias do solo de floresta apresentaram uma menor diversidade (Índice de Shannon e Chao, P 98%). O solo sob uso agrícola de 2 anos apresentou maior número do cópias por grama de solo dos genes 16S rRNA de Bacteria (5,11x1010) e Archaea (1,53x108) (P 98%). The land soil with 2 years had the highest number of copies per gram of soil of 16S rRNA genes of Bacteria (5,11x1010) and Archaea (1,53x108) (P < 0,05). Bacteria amoA gene showed greater abundance in bulk soil (P < 0,01) and correlated positively with soil exchangeable bases, while the Archaea amoA gene showed greater abundance in rhizospheric soils (P < 0,01) and correlated negatively with the available N. Bacteria amoA gene showed greater abundance in bulk soil (P < 0,01) and correlated positively with soil exchangeable bases, while the Archaea amoA gene showed greater abundance in rhizospheric soils (P < 0,01) and correlated negatively with the available N. The results suggest that in Amazon soils the ammonia oxidation is predominantly driven by Archaea. In conclusion, the land use over time influenced the abundance of microorganisms while the land use change altered the microbial composition in Amazonian soil

    Going Beyond Counting First Authors in Author Co-citation Analysis

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    The present study examines one of the fundamental aspects of author co-citation analysis (ACA) - the way co-citation counts are defined. Co-citation counting provides the data on which all subsequent statistical analyses and mappings are based, and we compare ACA results based on two different types of co-citation counting - the traditional type that only counts the first one among a cited work's authors on the one hand and a non-traditional type that takes into account the first 5 authors of a cited work on the other hand. Results indicate that the picture produced through this non-traditional author co-citation counting contains more coherent author groups and is therefore considerably clearer. However, this picture represents fewer specialties in the research field being studied than that produced through the traditional first-author co-citation counting when the same number of top-ranked authors is selected and analyzed. Reasons for these effects are discussed

    Variations on the Author

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    “Variations on the Author” discusses two of Eduardo Coutinho’s recent films (Um Dia na Vida, from 2010, and Últimas Conversas, posthumously released in 2015) and their contribution to the general question of documentary authorship. The director’s filmography is characterized by a consistent yet self-effacing form of authorial self-inscription: Coutinho often features as an interviewer that rather than express opinions propels discourses; an interviewer that is good at listening. This mode of self-inscription characterizes him as an author who is not expressive but who is nonetheless markedly present on the screen. In Um Dia na Vida, however, Coutinho is completely absent form the image, while Últimas Conversas, on the contrary, includes a confessional prologue that moves the director from the margins to the center of his films. This article examines the ways in which these works stand out in the filmography of a director who offers new insights into the notion of cinematic authorship

    Appropriate Similarity Measures for Author Cocitation Analysis

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    We provide a number of new insights into the methodological discussion about author cocitation analysis. We first argue that the use of the Pearson correlation for measuring the similarity between authors’ cocitation profiles is not very satisfactory. We then discuss what kind of similarity measures may be used as an alternative to the Pearson correlation. We consider three similarity measures in particular. One is the well-known cosine. The other two similarity measures have not been used before in the bibliometric literature. Finally, we show by means of an example that our findings have a high practical relevance.information science;Pearson correlation;cosine;similarity measure;author cocitation analysis

    Dispelling the Myths Behind First-author Citation Counts

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    We conducted a full-scale evaluative citation analysis study of scholars in the XML research field to explore just how different from each other author rankings resulting from different citation counting methods actually are, and to demonstrate the capability of emerging data and tools on the Web in supporting more realistic citation counting methods. Our results contest some common arguments for the continued use of first-author citation counts in the evaluation of scholars, such as high correlations between author rankings by first-author citation counts and other citation counting methods, and high costs of using more realistic citation counting methods that are not well-supported by the ISI databases. It is argued that increasingly available digital full text research papers make it possible for citation analysis studies to go beyond what the ISI databases have directly supported and to employ more sophisticated methods

    Author Index

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    koamabayili/VECTRON-author-checklist: VECTRON author checklist

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    We have done our best to complete the author checklist relating to the use of animals in the hut study. Note that the objective for the hut study was to evaluate the IRS treatment applications for residual efficacy against Anopheles mosquitoes, including the local An. coluzzii mosquito population. Cows were only used to attract mosquitoes into the huts and no tests were carried out directly on the cows. The author checklist is intended for use with studies where experiments are carried out on animals, which is why we have had such difficulty in completing this for the hut study, as many of the questions do not relate to how the cows were used
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