86 research outputs found
Proteomics profiling of CLL versus healthy B-cells identifies putative therapeutic targets and a subtype-independent signature of spliceosome dysregulation
No full textChronic lymphocytic leukaemia (CLL) is a heterogeneous B-cell cancer exhibiting a wide spectrum of disease courses and treatment responses. Molecular characterisation of RNA and DNA from CLL cases has led to the identification of important driver mutations and disease sub-types, but the precise mechanisms of disease progression remain elusive. To further our understanding of CLL biology we performed isobaric labelling and mass spectrometry proteomics on 14 CLL samples, comparing them with B-cells from healthy donors (HDB). Of 8694 identified proteins, ~6000 were relatively quantitated between all samples (q<0.01). A clear CLL signature, independent of subtype, of 544 significantly overexpressed proteins relative to HDB was identified, highlighting establishedhallmarks of CLL (eg. CD5, BCL2, ROR1 and CD23 overexpression). Previously unrecognised surface markers demonstrated overexpression (eg. CKAP4, PIGR, TMCC3 and CD75) and three of these (LAX1, CLEC17A and ATP2B4) were implicated in B-cell receptor signalling, which plays an important role in CLL pathogenesis. Several other proteins (eg. Wee1, HMOX1/2, HDAC7 and INPP5F) were identified with significant overexpression that also represent potential targets. Western blotting confirmed overexpression of a selection of these proteins in an independent cohort. mRNA processing machinery were broadly upregulated across the CLL samples. Spliceosome components demonstrated consistent overexpression (p=1.3x10-21) suggesting dysregulation in CLL, independent of SF3B1 mutations. This study highlights the potential of proteomics in the identification of putative CLL therapeutic targets and reveals a subtype-independent protein expression signature in CLL
Mutations inSETBP1are recurrent in myelodysplastic syndromes and often coexist with cytogenetic markers associated with disease progression
No full textWhole exome sequencing was performed in a patient with myelodysplastic syndrome before and after progression to acute myeloid leukaemia. Mutations in several genes, including SETBP1, were identified following leukaemic transformation. Screening of 328 patients with myeloid disorders revealed SETBP1 mutations in 14 patients (4·3%), 7 of whom had -7/del(7q) and 3 had i(17)(q10), cytogenetic markers associated with shortened overall survival and increased risk of leukaemic evolution. SETBP1 mutations were frequently acquired at the time of leukaemic evolution, coinciding with increase of leukaemic blasts. These data suggest that SETBP1 mutations may play a role in MDS and chronic myelomonocytic leukaemia disease progression
Extracció de greix de pell de xai amb gas dens: demostració de la viabilitat a nivell de planta pilot
No full textPremi al millor Projecte de Fi de Carrera presentat durant el curs 2006-2007 en l'àmbit de Química que atorga BASFEs realitza aquest projecte per resoldre la necessitat de millorar l’actual sistema de
desgreixatge de la pell dels animals a les indústries d’adob.
Totes les pells, sigui quin sigui el seu origen, tenen una certa quantitat de greix natural que,
si no s’extreu correctament, dificulta enormement els processos de curtició i acabat de les
pells. Actualment, el procés de desgreixatge s’efectua mitjançant sistemes aquosos amb l’ús
de tensioactius. Aquest mètode provoca un elevat grau de contaminació en les aigües
residuals de les indústries de la pell.
L’objectiu del projecte és estudiar la viabilitat de la planta pilot d’extracció de greix de pell
d’animal amb diòxid de carboni a pressió.
Es descriu la planta pilot utilitzada, l’execució dels experiments, les condicions d’extracció
estudiades, el disseny d’experiments, i s’analitzen els resultats obtinguts amb l’ajut d’un
software estadístic.
A continuació es simula el procés d’extracció amb un programa informàtic de simulació que
reflexa tot el procés experimental portat a terme a la planta pilot, així com també apareixen
els fluxos de diòxid de carboni, la concentració de les substàncies i la velocitat del procés.
També es detalla l’impacte mediambiental que ocasiona aquest projecte i l’avaluació
econòmica que representa la planta pilot i l’execució dels experiments.
Així doncs, el projecte proposat és viable, tant econòmica com mediambientalment, el nou
procés proposat implica una inversió inicial elevada ja que es tracta de canviar part de la
instal·lació de les empreses, així com una formació tècnica dels treballadors, però a mig i a
llarg termini serà menys costosa i més sostenible que la tecnologia convencional que utilitzen
les empreses avui dia, i la implantació del nou procés de desgreixatge no implica una
modificació de la resta d’operacions de tractament de la pell.
Finalment, en forma d’annexos es presenta una explicació del tractament complet que rep la
pell, el dispositiu experimental, els mètodes analítics determinats, els experiments
preliminars, l’estudi estadístic dels resultats obtinguts, la simulació dels experiments amb el
programa de simulació i els càlculs mediambientals i econòmics del projecte.Award-winnin
Extracció de greix de pell de xai amb gas dens: demostració de la viabilitat a nivell de planta pilot
No full textPremi al millor Projecte de Fi de Carrera presentat durant el curs 2006-2007 en l'àmbit de Química que atorga BASFEs realitza aquest projecte per resoldre la necessitat de millorar l’actual sistema de
desgreixatge de la pell dels animals a les indústries d’adob.
Totes les pells, sigui quin sigui el seu origen, tenen una certa quantitat de greix natural que,
si no s’extreu correctament, dificulta enormement els processos de curtició i acabat de les
pells. Actualment, el procés de desgreixatge s’efectua mitjançant sistemes aquosos amb l’ús
de tensioactius. Aquest mètode provoca un elevat grau de contaminació en les aigües
residuals de les indústries de la pell.
L’objectiu del projecte és estudiar la viabilitat de la planta pilot d’extracció de greix de pell
d’animal amb diòxid de carboni a pressió.
Es descriu la planta pilot utilitzada, l’execució dels experiments, les condicions d’extracció
estudiades, el disseny d’experiments, i s’analitzen els resultats obtinguts amb l’ajut d’un
software estadístic.
A continuació es simula el procés d’extracció amb un programa informàtic de simulació que
reflexa tot el procés experimental portat a terme a la planta pilot, així com també apareixen
els fluxos de diòxid de carboni, la concentració de les substàncies i la velocitat del procés.
També es detalla l’impacte mediambiental que ocasiona aquest projecte i l’avaluació
econòmica que representa la planta pilot i l’execució dels experiments.
Així doncs, el projecte proposat és viable, tant econòmica com mediambientalment, el nou
procés proposat implica una inversió inicial elevada ja que es tracta de canviar part de la
instal·lació de les empreses, així com una formació tècnica dels treballadors, però a mig i a
llarg termini serà menys costosa i més sostenible que la tecnologia convencional que utilitzen
les empreses avui dia, i la implantació del nou procés de desgreixatge no implica una
modificació de la resta d’operacions de tractament de la pell.
Finalment, en forma d’annexos es presenta una explicació del tractament complet que rep la
pell, el dispositiu experimental, els mètodes analítics determinats, els experiments
preliminars, l’estudi estadístic dels resultats obtinguts, la simulació dels experiments amb el
programa de simulació i els càlculs mediambientals i econòmics del projecte.Award-winnin
Extracció de greix de pell de xai amb gas dens: demostració de la viabilitat a nivell de planta pilot
No full textPremi al millor Projecte de Fi de Carrera presentat durant el curs 2006-2007 en l'àmbit de Química que atorga BASFEs realitza aquest projecte per resoldre la necessitat de millorar l’actual sistema de
desgreixatge de la pell dels animals a les indústries d’adob.
Totes les pells, sigui quin sigui el seu origen, tenen una certa quantitat de greix natural que,
si no s’extreu correctament, dificulta enormement els processos de curtició i acabat de les
pells. Actualment, el procés de desgreixatge s’efectua mitjançant sistemes aquosos amb l’ús
de tensioactius. Aquest mètode provoca un elevat grau de contaminació en les aigües
residuals de les indústries de la pell.
L’objectiu del projecte és estudiar la viabilitat de la planta pilot d’extracció de greix de pell
d’animal amb diòxid de carboni a pressió.
Es descriu la planta pilot utilitzada, l’execució dels experiments, les condicions d’extracció
estudiades, el disseny d’experiments, i s’analitzen els resultats obtinguts amb l’ajut d’un
software estadístic.
A continuació es simula el procés d’extracció amb un programa informàtic de simulació que
reflexa tot el procés experimental portat a terme a la planta pilot, així com també apareixen
els fluxos de diòxid de carboni, la concentració de les substàncies i la velocitat del procés.
També es detalla l’impacte mediambiental que ocasiona aquest projecte i l’avaluació
econòmica que representa la planta pilot i l’execució dels experiments.
Així doncs, el projecte proposat és viable, tant econòmica com mediambientalment, el nou
procés proposat implica una inversió inicial elevada ja que es tracta de canviar part de la
instal·lació de les empreses, així com una formació tècnica dels treballadors, però a mig i a
llarg termini serà menys costosa i més sostenible que la tecnologia convencional que utilitzen
les empreses avui dia, i la implantació del nou procés de desgreixatge no implica una
modificació de la resta d’operacions de tractament de la pell.
Finalment, en forma d’annexos es presenta una explicació del tractament complet que rep la
pell, el dispositiu experimental, els mètodes analítics determinats, els experiments
preliminars, l’estudi estadístic dels resultats obtinguts, la simulació dels experiments amb el
programa de simulació i els càlculs mediambientals i econòmics del projecte.Award-winnin
Longitudinal copy number, whole exome and targeted deep sequencing of 'good risk' IGHV-mutated CLL patients with progressive disease
No full textDisease progression in IGHV-M CLL with 'good-risk' cytogenetics is frequently associated with co-evolution of 'poor risk' driver mutations and DNA methylation changes.Drug resistance in IGHV-M CLL may be consequent upon the emergence of an IGHV-U cloneThe biological features of IGHV-M CLL responsible for disease progression are still poorly understood. We undertook a longitudinal study close to diagnosis, pre-treatment and post relapse in thirteen patients presenting with cMBL or Stage A disease and good risk biomarkers (IGHV-M genes, no del(17p) or del(11q) and low CD38 expression) who nevertheless developed progressive disease, of whom ten have required therapy. Using cytogenetics, FISH, genome-wide DNA methylation and copy number analysis together with whole exome, targeted deep- and Sanger sequencing, at diagnosis we identified mutations in established CLL driver genes in nine (69%), non-coding mutations (PAX5 enhancer region) in three, and genomic complexity in two patients. Branching evolutionary trajectories predominated (n=9/13), revealing intra-tumoural epi- and genetic heterogeneity and sub-clonal competition prior to therapy. Of the patients subsequently requiring treatment, two had sub-clonal TP53 mutations that would not be detected by standard methodologies, three qualified for the very-low risk category defined by integrated mutational and cytogenetic analysis and yet had established or putative driver mutations and one patient developed progressive, therapy-refractory disease associated with the emergence of an IGHV-U clone. These data suggest that extended genomic and immunogenetic screening may have clinical utility in patients with apparent good risk disease.Leukemia accepted article preview online, 05 February 2016. doi:10.1038/leu.2016.10
State-of-the-art of Heliostat Field Layout Algorithms and their Comparison
No full textAbstractIn this paper a complete review of the most relevant algorithms for the generation of heliostat field layouts is presented. For each of the reviewed algorithms, a description of the layout generation approach, all the input parameters required and the main formulation is provided. The algorithms have been compared for different scenarios covering a range of tower heights, heliostat sizes and acceptance angles (defining to what extent the resulting field is North configuration or surrounding). A robust methodology has been developed, which ensures a fair comparison of the algorithms by analysing the performance of optimized solar fields according to each layout generation method. For this, all the input parameters of each layout generation algorithm are optimized for each scenario prior to comparing the solar field performances. The main conclusion of the present study is that all the analysed layout generation algorithms lead to similar solar field efficiencies when compared for the considered scenarios once they are optimized. Further work is required to check if the algorithms also show similar efficiencies, or to what extent they are similar, when wider scenarios are considered (larger solar field powers, locations, etc.)
Relevancia funcional de VEGFA y sus receptores en cáncer de pulmón
No full textLa expresión de VEGFA y sus receptores en las células tumorales de pulmón puede indicar que
además de la regulación paracrina sobre las células endoteliales, exista otra de tipo autocrino
implicada en la progresión tumoral. La activación del loop autocrino en las células tumorales
puede afectar de manera diferente al fenotipo tumoral dependiendo de la histología de cada
tumor.
Para contrastar esta hipótesis se propusieron los siguientes objetivos:
1. Determinación del valor pronóstico de VEGFA y sus receptores en estadios precoces de
NSCLC.
2. Análisis de la expresión de VEGFA, sus isoformas y receptores en células de pulmón
normal y líneas celulares tumorales. Estudio del loop autocrino en las líneas de pulmón.
3. Generación de modelos celulares de modificación de la expresión de VEGF-R2 y
evaluación de su efecto sobre las células tumorales.
4. Estudio del efecto de las terapias anti-VEGFA/VEGFR en modelos murinos de cáncer de
pulmón (diferencias entre ADC y CE).
5. Estudio del papel de las isoformas b de VEGFA en NSCLC
Large T cell clones expressing immune checkpoints increase during multiple myeloma evolution and predict treatment resistance
No full textLarge T cell; Immune checkpoints; Multiple myelomaCèl·lules T grans; Punts de control immunitari; Mieloma múltipleCélulas T grandes; Puntos de control inmunitario; Mieloma múltipleTumor recognition by T cells is essential for antitumor immunity. A comprehensive characterization of T cell diversity may be key to understanding the success of immunomodulatory drugs and failure of PD-1 blockade in tumors such as multiple myeloma (MM). Here, we use single-cell RNA and T cell receptor sequencing to characterize bone marrow T cells from healthy adults (n = 4) and patients with precursor (n = 8) and full-blown MM (n = 10). Large T cell clones from patients with MM expressed multiple immune checkpoints, suggesting a potentially dysfunctional phenotype. Dual targeting of PD-1 + LAG3 or PD-1 + TIGIT partially restored their function in mice with MM. We identify phenotypic hallmarks of large intratumoral T cell clones, and demonstrate that the CD27− and CD27+ T cell ratio, measured by flow cytometry, may serve as a surrogate of clonal T cell expansions and an independent prognostic factor in 543 patients with MM treated with lenalidomide-based treatment combinations.This work was supported by grants from the Instituto de Salud Carlos III/Subdireccion General de Investigacion Sanitaria and co-financed by FEDER funds (CB16/12/00233, CB16/12/00369, PI17/01243, PI19/00818 and PI20/00048), and together with Fundación Científica de la Asociación Española Contra el Cáncer (FCAECC) for iMMunocell Transcan-2 (AC17/00101), FCAECC Predoctoral Grant Junta Provincial Navarra, the Cancer Research UK (C355/A26819), FCAECC and Italian Association for Cancer Research (AIRC) under the Accelerator Award Program (EDITOR), 2017 Multiple Myeloma Research Foundation Immunotherapy Networks of Excellence, Black Swan Research Initiative of the International Myeloma Foundation, European Hematology Association nonclinical advanced research grant (3680644), European Research Council 2015 Starting Grant (MYELOMANEXT grant 680200), the Cancer Research Innovation in Science Cancer Foundation (PR_EX_2020-02), the Leukemia Lymphoma Society, unrestricted grants from Bristol-Myers Squibb/Celgene and Takeda, Roche imCORE program (NAV-4 and NAV-15), Fondazione Regionale per la Ricerca Biomedica (Regione Lombardia) (Project ID 065 JTC 2016), ERA-NET TRANSCAN-2, and by My First AIRC Grant 2020 (n. 24534, 2021/2026), and by the Riney Family Multiple Myeloma Research Program Fund
IL-4 enhances expression and function of surface IgM in CLL cells
No full textKinase-inhibitors targeting the B-cell receptor (BCR) are now prominent in the treatment of CLL. We have focused here on IL-4, a cytokine which protects normal and malignant B cells from apoptosis, and increases surface (s)IgM expression on murine splenic B cells. First we have demonstrated that IL-4 treatment increased sIgM expression in vitro on peripheral blood B cells obtained from healthy individuals. In CLL, IL-4 target genes are overexpressed in cells purified from the lymph nodes of patients compared to cells derived from matched blood and bone marrow samples. As for normal B cells, IL-4 increased sIgM expression on CLL cells in vitro, especially in samples expressing unmutated V-genes (U-CLL). IL-4-induced sIgM expression was associated with increased receptor signalling activity, measured by anti-IgM-induced calcium mobilisation, and with increased expression of CD79B mRNA and protein, and the "mature" glycoform of sIgM. Importantly, the ability of the BCR-associated kinase inhibitors idelalisib and ibrutinib, approved for treatment of CLL and other B-cell malignancies, to inhibit anti-IgM-induced signalling was reduced following IL-4 pre-treatment in samples from the majority of patients. In contrast to stimulatory effects on sIgM, IL-4 decreased CXCR4 and CXCR5 expression. Therefore CLL cells, particularly within the progressive U-CLL subset, may harness the ability of IL-4 to promote BCR signalling and B-cell retention within lymph nodes. Effects of IL-4 were mediated via JAK3/STAT6 and we propose a potential role for JAK inhibitors in combination with BCR-kinase inhibitors for the treatment of CLL
- …
