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Carbohydrate microarray technology applied to high-throughput mapping of plant cell wall glycans using comprehensive microarray polymer profiling (CoMPP)
No full textPlasma N-glycome signature of Down syndrome
No full textIn recent years, plasma N-glycans have emerged as biomarkers for health and disease. Here, we studied N-glycomic changes in Down Syndrome (DS). Because of the progeroid phenotype of DS, we focused on the dissection of syndrome- and aging-associated glycomic changes, as well as the interaction thereof. We analyzed the plasma N-glycome of 76 DS persons, 37 siblings (DSS), and 42 mothers (DSM) of DS persons by DNA-sequencer-aided, fluorophore-assisted-carbohydrate-electrophoresis, as well as by matrix-assisted laser desorption ionization-time-of-flight-mass spectrometry (MALDI-TOF-MS). The results showed an overall decrease of galactosylation and alpha 2,3 sialylation, a concomitant increase of the level of fucosylated N-glycans as well as of monogalactosylated diantennary N-glycans in DS, while the GlycoAgeTest and the ratio of the two core-fucosylated, monogalactosylated diantennary isomers (galactose positioned on alpha 1,6 arm versus alpha 1,3 arm) were the strongest DS discriminators Hypogalactosylation is a characteristic of both DS and aging of control individuals. A decrease in alpha 2,3-sialylated species is also common to DS and aging of controls. However, regarding to alpha 2,6-sialylated tri- and tetragalactosylated N-glycan species, we found those to be lowered in DS but showed an increase with age in the same persons, while these glycans were not affected by aging in control individuals. In conclusion, we identified specific glycomic changes associated with DS, aging in DS, as well as aging in controls, identifying glycomic features in line with accelerated aging in DS. Notably, our data demonstrate an aging phenotype in DS which only in part overlaps with aging in controls but reveals DS-specificity
High-Throughput Analysis of the Plasma N-Glycome by UHPLC
No full textThe understanding of glycosylation alterations in health and disease has evolved significantly and glycans are considered to be relevant biomarker candidates. High-throughput analytical technologies capable of generating high-quality, large-scale glycoprofiling data are in high demand. Here, we describe an automated sample preparation workflow and analysis of N-linked glycans from plasma samples using hydrophilic interaction liquid chromatography with fluorescence detection on an ultrahigh-performance liquid chromatography (UHPLC) instrument. Samples are prepared in 96-well plates and the workflow features rapid glycoprotein denaturation, enzymatic glycan release, glycan purification on solid-supported hydrazide, fluorescent labeling, and post-labeling cleanup with solid-phase extraction. The development of a novel approach for plasma N-glycan analysis and its implementation on a robotic platform significantly reduces the time required for sample preparation and minimizes technical variation. It is anticipated that the developed method will contribute to expanding high-throughput capabilities to analyze protein glycosylation. © Springer Science+Business Media New York 2017
MassIVE MSV000090430 - Supporting information for HLA-specific IgG glycosylation analysis in kidney transplantation
No full textCharakterisierung stadienspezifisch exprimierter Glykolipide des Humanparasiten Schistosoma mansoni
No full textCharakterisierung stadienspezifisch exprimierter Glykolipide des Humanparasiten Schistosoma mansoni
No full textIn der vorliegenden Arbeit wurde die Struktur sowie die antigenen Eigenschaften der Glykolipide des Humanparasiten S. mansoni analysiert. Kleine sowiekomplexe Glykolipide wurden aus adulten Würmern, aus Cercarien und aus Eiern aufgereinigt. Die Hauptkomponenten der Ceramid-Monohexoside wurdendurch Analyse der vorhandenen Fettsäuren und Sphingoidbasen strukturell aufgeklärt. Beim CMH des Adultwurmes überwogen die SphingoidbasenC18-Sphingosin und C18-Phytosphingosin, bei Cercarien waren es C18-, C19- und C20-Phytosphingosin, und CMH von Eiern hatte fast ausschließlich C18-und C20-Phytosphingosin. In allen drei Stadien dominierte C16-[alpha]-Hydroxyfettsäure über C16-Fettsäure (Palmitinsäure). AuchC18-[alpha]-Hydroxyfettsäure wurde in allen Stadien gefunden. Bei Cercarien kamen zusätzlich Ceramide mit C24-, C26- und C28-Fettsäuren sowie denentsprechenden Hydroxyfettsäuren vor. Während diese Ceramide mit über 40 C-Atomen beim CMH von Cercarien nur Nebenkomponenten bildeten, warendies die hauptsächlichen Ceramide bei CDH und komplexen Glykolipiden von Cercarien. Bei der Analyse des Kohlenhydratteils der kleinen Glykolipide wurde bei allen Stadien als CMH-Hauptkomponente Glc1Cer und als NebenkomponenteGal1Cer gefunden. Das CDH aller Stadien hatte die Struktur GalNAc[beta]4Glc1Cer. Die Analyse der komplexen Glykolipide ergab eine stadienspezifische Expression des Lex-Antigens auf Glykolipiden von S. mansoni Cercarien. Im Gegensatzdazu war Protein-gebundenes Lex hauptsächlich im Ei-Stadium exprimiert. Ein weiteres Fucose-haltiges Antigen war durch den monoklonalen AntikörperM2D3H definiert und kam auf den Glykolipiden aller untersuchten Stadien vor. Sowohl auf Lipid- als auch auf Protein-Ebene war die Expression diesesM2D3H-Epitops im Ei-Stadium am stärksten. Dieses Epitop wurde auch stark durch chronisches S. mansoni Infektionsserum erkannt. Es konnte nachgewiesen werden, daß dieses Fucose-haltige M2D3H-Epitop auch auf dem Hämocyanin der Schnecke Megathura crenulata vorkommt undfür die starke Erkennung des Hämocyanins durch S. mansoni Infektionsserum verantwortlich ist. Die komplexen Glykolipide von Cercarien wurden strukturell als PA-Oligosaccharide analysiert. Im einzelnen wurden folgende Strukturen identifiziert:GalNAc[beta]4Glc1Cer (CDH), GlcNAc[beta]3GalNAc[beta]4Glc1Cer (CTH), Gal[beta]4GlcNAc[beta]3GalNAc[beta]4Glc1Cer (CTetH);Gal[beta]4[Fuc[alpha]3]GlcNAc[beta]3GalNAc[beta]4Glc1Cer (CPH; Lex-Pentasaccharid-Struktur);Gal[beta]4[Fuc[alpha]3]GlcNAc[beta]3GlcNAc[beta]3GalNAc[beta]4Glc1Cer (CHH; Lex-Hexasaccharid-Struktur);Fuc[alpha]3Gal[beta]4[Fuc[alpha]3]GlcNAc[beta]3GalNAc[beta]4Glc1Cer (CHH; Pseudo-Ley-Hexasaccharid-Struktur). Die letzte Struktur unterscheidetsich vom Ley-Antigen darin, daß die Fucose an die 3-Position und nicht wie in Ley an die 2-Position der Galactose geknüpft ist
From proteomics over glycomics to glycoproteomics: instrumental analytics to explore biological models in oncology and immunology
No full textProteins and molecular pathways relevant for the malignant properties of tumor-initiating pancreatic cancer cells Lisa Samonig, Andrea Loipetzberger, Constantin Blöchl, Marc Rurik, Oliver Kohlbacher, Fritz Aberger and Christian G. Huber> NLRP3/eIF2 axis drives cell cycle progression in acute myeloid leukemia authors: Michela Luciano, Constantin Blöchl [und 23 weitere]Scalable enrichment of immunomodulatory human acute myeloid leukemia cell line-derived extracellular vesicles Heide-Marie Binder, Nicole Maeding, Martin Wolf, André Cronemberger Andrade, Balazs Vari, Linda Krisch, Fausto Gueths Gomes, Constantin Blöchl [und 11 weitere]Proteolytic profiling of streptococcal pyrogenic exotoxin B (SpeB) by complementary HPLC-MS approaches Constantin Blöchl, Christoph Holzner, Michela Luciano, Renate Bauer, Jutta Horejs-Hoeck, Ulrich Eckhard, Hans Brandstetter and Christian G. HuberIdentification and characterization of the proteolytic flagellin from the common freshwater bacterium Hylemonella gracilis Ulrich Eckhard, Constantin Blöchl, Benjamin G. L. Jenkins, Michael J. Mansfield, Christian G. Huber, Andrew C. Doxey & Hans BrandstetterIntegrated N- and O-glycomics of acute myeloid leukemia (AML) cell lines Constantin Blöchl, Di Wang, Katarina Madunić, Guinevere S. M. Lageveen-Kammeijer, Christian G. Huber, Manfred Wuhrer and Tao ZhangGlycosphingolipid-glycan signatures of acute myeloid leukemia cell lines reflect hematopoietic differentiation Di Wang, Tao Zhang, Katarina Madunić, Antonius A. de Waard, Constantin Blöchl [und 6 weitere]Dissection of N-, O- and glycosphingolipid glycosylation changes in PaTu-S pancreatic adenocarcinoma cells upon TGF-β challenge Jing Zhang, Zejian Zhang, Stephanie Holst, Constantin Blöchl, Katarina Madunic, Manfred Wuhrer, Peter ten Dijke and Tao ZhangTowards middle-up analysis of polyclonal antibodies: subclass-specific N-glycosylation profiling of murine immunoglobulin G (IgG) by means of HPLC-MS Constantin Blöchl, Christof Regl, Christian G. Huber, Petra Winter, Richard Weiss & Therese Wohlschlagereingereicht von Constantin Blöchl, MSc.Enthält LiteraturangabenKumulative Dissertation aus 9 ArtikelnDissertation Paris-Lodron Universität Salzburg 202
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