1,720,971 research outputs found
Caracterização da microbiota do trato gastrointestinal de bezerros leiteiros
No full textAt birth, calves display an underdeveloped gastrointestinal tract (GIT) whose maturation is strictly related to microbiota colonization. However, little is known about the factors that affect the establishment of archaeal, bacterial and fungal communities in the GIT of calves, as well as the changes in their structure and abundance during calf development into a functional ruminant. To address these gaps in knowledge, this work employed next-generation sequencing to characterize the GIT microbiota of Holstein- Gyr crossbred dairy calves across pre-weaning development. The first study aimed to assess changes on the rumen archaeal, bacterial and fungal communities of crossbred dairy calves (n=45) across pre-weaning development (7, 28, 49, 63 days) on two different diets (M: only raw milk at 10% of body weight at birth (BW) and MC: raw milk (10% BW) plus starter concentrate ad libitum). In the second study, we characterized changes in the bacterial communities across GIT regions (rumen, jejunum, cecum and colon) of MC-fed calves (n=17) at 7, 28, 49, 63 days of age. The results of first study revealed that archaeal, bacterial and fungal communities co-occur in the rumen since early calf development but are impacted differently by pre-weaning diet and age. The inclusion of starter concentrate in the calf diet significantly affected rumen bacterial community by promoting increases of genera, direct and indirectly, related to degradation of readily fermentable carbohydrates (i.e. Megasphaera, Sharpea and Succinivribrio) and depressing those reliant on milk nutrients like lactose (i.e. Lactobacillus, Bacteroides and Parabacteroides). These bacterial changes resulted in apparent diet-driven archaeal differences due to altered fermentation patterns and availability of hydrogen in the rumen that favoured the colonization of members from genus Methanosphaera instead of Methanobrevibacter. No such differences were found for fungi community represented by members from genus Caecomyces and family Neocallimastigaceae, likely due to high inter-animal variation and low fibre content of concentrate used our study. Altogether, this study showed that manipulation of the microbiota in the developing rumen is possible through dietary intervention. Our results may be useful in designing strategies to promote colonization of target communities (i.e. butyrate- producers and lactate-utilizing) linked to functional development of the calf. In regards to second study, bacterial communities in the calf GIT differ qualitatively and quantitatively among compartments and respond differently to age advance that encompass the GIT development (i.e. rumen) and progressive replacement of milk- based to grain-diet (i.e. increase of starter concentrate intake). In the rumen, bacterial community was composed majority by members from genera Prevotella, Butyrivibrio and Ruminococcus whose abundance increased proportionally with age possibly due greater availability of readily fermentable carbohydrates in the rumen. Members from genus Lactobacillus were overrepresented in the jejunum but their predominance was replaced by members from Clostridiaceae family in older calves. The cecum and colon displayed similar abundance at taxa level and the abundance of genera Blautia, Paraprevotella, Prevotella, Phascolarctobacterium and Succiniclasticum increased significantly with age. In summary, our results showed that although there are bacterial communities “common” to distinct regions, a closer look at their structure, abundance and dynamic reveals marked segregation and ecological succession in the calf GIT. Our study adds new insights into bacterial colonization across GIT of pre-ruminant that may be considered in formulating strategies to promote the colonization of target communities aiming improve health (i.e. bacteria with probiotic capability) and performance of dairy calves in the pre-weaning period.Ao nascimento, os bezerros exibem um trato gastrointestinal subdesenvolvido (TGI) cuja maturação é estritamente relacionada à colonização da microbiota. No entanto, pouco se sabe sobre os fatores que afetam o estabelecimento de comunidades de archaeas, bacterias e de fungos anaeróbicos no TGI dos bezerros, bem como as mudanças na estrutura e abundância desses grupos microbianos durante o período de transição da fase de pré-ruminante para verdadeiro ruminante. Para abordar essas lacunas no conhecimento, este trabalho empregou sequenciamento de próxima geração para caracterizar a microbiota do TGI de bezerros leiteiros mestiços (Holandês-Gir) durante o período pré-desmame. O primeiro estudo avaliou mudanças nas comunidades de archaeas metanogênicas, bacterias e fungos anaeróbicos no rúmen de bezerros leiteiros (n = 45) alimentados com duas dietas diferentes (M: somente leite cru (10% do peso vivo (PV)) e MC: leite cru (10% PV e concentrado ad libitum) e que foram abatidos aos 7, 28, 49, 63 dias de idade. No segundo estudo, caracterizamos as alterações nas comunidades bacterianas entre regiões GIT (rúmen, jejuno, ceco e cólon) de bezerros alimentados com MC (n = 17) que foram abatidos aos 7, 28, 49, 63 dias de idade. Os resultados do primeiro estudo revelaram que as comunidades de archaeas metanogênicas, bacterias e fungos coexistem no rúmen desde a primeira semana de vida, mas são afetadas diferentemente pela dieta e idade. A inclusão de concentrado na dieta de bezerros afetou significativamente a comunidade bacteriana do rúmen: observou-se um aumento na abundância de gêneros relacionados, direta e indiretamente, à degradação de amido (i.e. Megasphaera, Sharpea e Succinivribrio) e um decréscimo acentuado na abundancia de gêneros (i.e. Lactobacillus, Bacteroides e Parabacteroides) relacionados com a degradação de nutrientes do leite. Alterações na comunidade bacteriana, indiretamente afetaram a comunidade de metanogênicas: fermentação de carboidratos não fibrosos alterou padrões de fermentação (acetato:propionato) e disponibilidade de hidrogênio que por sua vez, favoreceu a colonização de Methanosphaera em vez de Methanobrevibacter. Na comunidade de fungos anaeróbicos, a abundância do genêro Caecomyces e família Neocallimastigaceae não variou significativamente com a dieta ou idade, provavelmente devido à alta variação inter-animal e baixo teor de fibra de concentrado usado em nosso estudo. In suma, este estudo mostrou que a manipulação da microbiota no rúmen em desenvolvimento é possível através da intervenção dietética. Nossos resultados podem ser úteis na elaboração de estratégias para promover a colonização de comunidades-alvo (isto é, produtores de butirato e utilizadoras de lactato) que estão ligadas ao desenvolvimento de papilas e equilíbrio do pH ruminal. Em relação ao segundo estudo, as comunidades bacterianas diferem qualitativa e quantitativamente entre os compartimentos (rúmen, jejuno, cécum e colón) do trato gastrointestinal e também respondem diferentemente ao avanço da idade que inclui a substituição progressiva da dieta líquida para a dieta sólida (i.e. aumento do consumo de concentrado). No rúmen, a comunidade bacteriana foi composta em sua maioria pelos gêneros Prevotella, Butyrivibrio e Ruminococcus cuja abundância aumentou proporcionalmente com a idade devido a maior disponibilidade de carboidratos não fibrosos no rúmen. No jejuno, o gênero Lactobacillus foi abundante desde a primeira semana de vida, mas sua dominância foi substituída por membros da família Clostridiaceae em bezerros mais velhos. As comunidades do ceco e do cólon foram compostas pelos gêneros Blautia, Paraprevotella, Prevotella Phascolarctobacterium and Succiniclasticum cuja abundância aumentou com a idade. Em resumo, nossos resultados mostraram que, embora comunidades bacterianas coexistam em regiões distintas do TGI, uma análise mais detalhada da estrutura, abundância e dinâmica dessas comunidades revela uma marcante segregação e sucessão ecológica no TGI de bezerros. Nosso estudo acrescenta novos insights sobre a colonização bacteriana no TGI de pré-ruminantes que podem servir como base para formulação de estratégias para promover a colonização de comunidades-alvo (i.e. bactérias probióticas) para melhorar a saúde e desempenho de bezerros leiteiros no período pré-desmame.Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superio
Going Beyond Counting First Authors in Author Co-citation Analysis
Get PDFThe present study examines one of the fundamental aspects of author co-citation analysis (ACA) - the way co-citation
counts are defined. Co-citation counting provides the data on which all subsequent statistical analyses and mappings
are based, and we compare ACA results based on two different types of co-citation counting - the traditional type that
only counts the first one among a cited work's authors on the one hand and a non-traditional type that takes into
account the first 5 authors of a cited work on the other hand. Results indicate that the picture produced through this non-traditional author co-citation counting contains more coherent author groups and is therefore considerably clearer. However, this picture represents fewer specialties in the research field being studied than that produced through the traditional first-author co-citation counting when the same number of top-ranked authors is selected and analyzed. Reasons for these effects are discussed
Variations on the Author
Get PDF“Variations on the Author” discusses two of Eduardo Coutinho’s recent films (Um Dia na Vida, from 2010, and Últimas Conversas, posthumously released in 2015) and their contribution to the general question of documentary authorship. The director’s filmography is characterized by a consistent yet self-effacing form of authorial self-inscription: Coutinho often features as an interviewer that rather than express opinions propels discourses; an interviewer that is good at listening. This mode of self-inscription characterizes him as an author who is not expressive but who is nonetheless markedly present on the screen. In Um Dia na Vida, however, Coutinho is completely absent form the image, while Últimas Conversas, on the contrary, includes a confessional prologue that moves the director from the margins to the center of his films. This article examines the ways in which these works stand out in the filmography of a director who offers new insights into the notion of cinematic authorship
Appropriate Similarity Measures for Author Cocitation Analysis
Get PDFWe provide a number of new insights into the methodological discussion about author cocitation analysis. We first argue that the use of the Pearson correlation for measuring the similarity between authors’ cocitation profiles is not very satisfactory. We then discuss what kind of similarity measures may be used as an alternative to the Pearson correlation. We consider three similarity measures in particular. One is the well-known cosine. The other two similarity measures have not been used before in the bibliometric literature. Finally, we show by means of an example that our findings have a high practical relevance.information science;Pearson correlation;cosine;similarity measure;author cocitation analysis
Dispelling the Myths Behind First-author Citation Counts
Get PDFWe conducted a full-scale evaluative citation analysis study of scholars in the XML research field to explore just how different from each other author rankings resulting from different citation counting methods actually are, and to demonstrate the capability of emerging data and tools on the Web in supporting more realistic citation counting methods. Our results contest some common arguments for the continued
use of first-author citation counts in the evaluation of scholars, such as high correlations between author rankings by first-author citation counts and other citation
counting methods, and high costs of using more realistic citation counting methods that are not well-supported by the ISI databases. It is argued that increasingly available digital full text research papers make it possible for citation analysis studies to go beyond what the ISI databases have directly supported and to employ more
sophisticated methods
koamabayili/VECTRON-author-checklist: VECTRON author checklist
No full textWe have done our best to complete the author checklist relating to the use of animals in the hut study. Note that the objective for the hut study was to evaluate the IRS treatment applications for residual efficacy against Anopheles mosquitoes, including the local An. coluzzii mosquito population. Cows were only used to attract mosquitoes into the huts and no tests were carried out directly on the cows. The author checklist is intended for use with studies where experiments are carried out on animals, which is why we have had such difficulty in completing this for the hut study, as many of the questions do not relate to how the cows were used
Comparação entre bases purinas e 15N para quantificar a produção de proteína microbiana em bovinos de corte e os efeitos do dia de gestação e do sistema de alimentação em vacas Holandês × Gir
No full textMicrobial nitrogen yield (MN) is of great importance to protein metabolism in ruminants. The quantification of its flow to the small intestine is therefore important in calculating the amount of digestible MN available to the animal. Thus, an experiment was designed to evaluate the use of microbial markers (MM), sampling sites (SS), and marker systems (MS) to estimate MN in bulls and to develop equations to correct MN estimates. The MM systems that were evaluated were 1) purine bases (PB) and 2) 15 N labeling. The SS that were evaluated were 1) reticulum, 2) omasum, and 3) abomasum, and the studied MS were 1) single, 2) double, and 3) triple. Eight crossbred (Holstein × Zebu) bulls (353 ± 36.9 kg of BW; 24 ± 1 mo) with ruminal and abomasal cannulas were utilized in this experiment. For PB, the greatest (P 0.05) were observed between MS and MM or SS; thus, the equation that was established to correct the MN value used only the MS. In conclusion, we have demonstrated that there is no difference when using 15N to estimate MN yield if the omasum or abomasum are used. Therefore, the omasum can be used as an accurate SS to predict MN. The triple MS presented with greater values than the single and double MS. Thus, if single or double MS is used, the value must be corrected by the equation that was obtained by using the triple MS. Another study was conducted with the aim of investigating how the feeding regimen (FR) alters apparent total tract digestibility, performance, N balance, excretion of purine derivatives, fat deposition, maternal and fetal visceral organ mass, and the expression of genes that are responsible for placental development, nutrient transfer, and angiogenic factors in Holstein × Gyr cows at different days of gestation (DG). Forty-four pregnant multiparous Holstein × Gyr cows with an average initial body weight of 480 ± 10.1 kg and an initial age of 5 ± 0.5 years were allocated to 1 of 2 FR: ad libitum (AL; n = 20) and maintenance level (ML; n = 24). Maintenance level was considered to be 1.15% of body weight on a dry matter (DM) basis and met 100% of the energy requirements, while AL provided 190% of the total net energy requirements. Cows were individually fed a corn silage-concentrate based diet composed of 93% roughage and 7% concentrate (DM basis) as a total mixed ration. Pregnant cows were slaughtered at 4 DG: 139 (n = 11), 199 (n = 11), 241 (n = 11), and 268 d (n = 11). Overall, DM intake decreased as DG increased. The decrease that was observed in DM intake may be associated with the reduction in ruminal volume caused by the rapid increase in fetal size during late gestation. We observed an interaction for DM and organic matter apparent total tract digestibility between FR and DG; at 150, 178, and 206 d of gestation, ML-fed cows had greater DM and organic matter apparent total tract digestibility values than AL-fed cows. Rib fat thickness, mesentery, and kidney, pelvic, and heart fat were greater in AL- than in ML-fed cows at all DG, with the exception of rib fat thickness on d-139. Ad libitum-fed cows excreted more N in their feces and urine compared to ML-fed cows. Pregnant cows that were fed at maintenance had greater digestibility during some DG, excreted less N in feces and less N and urea in urine, and deposited less fat in the body. Mass of the heart, liver, and gastrointestinal tract were heavier in AL- than in ML-fed cows. Feeding regimen did not influence fetal body weight in this study. The majority of the visceral organ masses were similar in fetuses from cows that were fed AL and ML. This data indicates that maternal feed-restriction does not affect the development of most fetal organs and fetal development; however, some maternal organs are affected according to the FR that is provided. Mammary gland mass was heavier in AL- than in ML-fed cows, and the heaviest mass was observed at 268 d of gestation. The negative impact on mammary gland mass caused by the ML probably will not affect the subsequent lactation because the crude protein concentration in the mammary gland increased with this FR. However, we suggest that the AL diet should be provided in pregnant dry cows with caution since the amount of fat in the mammary gland increased at 268 d of gestation. Placenta was heavier in ML- than in AL-fed cows at 268 d of gestation; the lightest mass was observed at 139 d of gestation, and the heaviest mass was observed at 268 d in ML-fed cows. However, in AL-fed cows, the heaviest placenta was observed from 199 d of gestation. Placentomes were heavier in ML-fed cows during gestation, and the number of placentomes was greater in ML-fed cows at 268 d of gestation. We observed that IGFR1 and IGFR2 genes were involved in placental adaptations when ML was provided, as their expression in placentome cells were greater in ML-fed cows at 268 d of gestation. The genes that are responsible for angiogenesis were also greater in ML-fed cows. VEGFA, GUCYB3, HIFA, FGF2, and NOS3 were altered by FR and DG interaction and they were greater in ML-fed cows at 268 d of gestation. Also, VEGFB and ANGPT2 did not present an interaction between FR and DG, but they were greater in ML-fed cows. We recommend ML (1.15% of body weight with 93% of roughage) as a FR for pregnant dry cows; however, during the last month of gestation, AL seems to be the most appropriate FR to avoid loss of body weight; however if AL diets in pregnant dry cows were to be provided, it had to be with caution since the amount of fat in the mammary gland increased at 268 d of gestation. Moreover, we suggest that the placenta from ML-fed cows develop adaptations to the reduced nutrient supply by altering its structure and gene expression, thereby developing mechanisms for a potential increase in the nutrient transfer efficiency to the fetus.A produção de proteína microbiana (PM) é de grande importância para o metabolismo proteico em animais ruminantes. Assim, um experimento foi conduzido para avaliar o uso de marcadores microbianos (MM), locais de coleta (LC) e sistemas de marcadores (SM) para estimar a PM em bovinos não castrados e desenvolver equações para corrigir as estimativas de PM. Os MM utilizados foram 1) bases purinas (BP) e 2) 15N. Os LC avaliados foram: 1) retículo, 2) omaso e 3) abomaso e os SM estudados foram: 1) simples, 2) duplo e 3) triplo. Oito bovinos cruzados (Holandês × Zebu) não castrados (353 ± 36.9 kg de PC; 24 ± 1 meses) com fístulas ruminal e abomasal foram uilizados. Quando as BP foram utilizadas, os maiores (P 0,05) entre os SM e MM ou LC; assim, a equação recomendada para corrigir os valores de PM utiliza apenas a variável SM. Em suma, nós concluimos que não há diferença ao utilizar 15N para estimar a PM desde que o local de coleta seja o omaso ou o abomaso. Dessa forma, o omaso pode ser utilizado como um acurado LC para estimar a PM. O SM triplo apresentou os maiores valores em relação aos sistemas simples e duplo. Assim, caso os sistemas simples ou duplo sejam utilizados, o valor da PM deverá ser corrigida pela equação obtida utilizando os valores do SM triplo. Um outro estudo foi conduzido objetivando investigar como o sistema de alimentação (SA) e os dias de gestação (DG) alteram a digestibilidade aparente, o desempenho, o balanço de nitrogênio, a excreção de derivados de purina, a deposição de gordura, a massa de órgaos maternos e fetais e a expressão de genes responsáveis pelo desenvolvimento, transferência de nutrientes e fatores angiogênicos na placenta em vacas leiteiras Holandes × Gir. Quarenta e quarto vacas múltiparas Holandês × Gir com um PC inicial de 480 ± 10.1 kg e com idade inicial de 5 ± 0.5 anos foram distribuídas em 1 dos 2 SA: ad libitum (AL; n = 20) e nível de mantenca (NM; n = 24). O nível de mantença foi considerado sendo 1,15% do PC (% MS) e supriu 100% da exigência de energia, enquanto que a dieta AL forneceu 190% da exigência de energia. As vacas foram individualmente alimentas com uma dieta a base de silagem de milho e concentrado na relação 93:7 (% MS). As vacas gestantes foram abatidas em 4 diferentes DG: 139 (n = 11), 199 (n = 11), 241 (n = 11) e 268 d (n = 11). De maneira geral, o consumo de MS diminuiu conforme os DG aumentaram. A diminuição que foi observada para o consumo de MS pode estar associada com a diminuição do volume ruminal causado pelo rápido aumento no tamanho do feto durante o final da gestação. Nós observamos uma interação entre a digestibilidade da MS e da matéria orgânica entre SA e DG; aos 150, 178 e 206 DG, as vacas alimentadas a nível de mantença apresentaram um maior valor para a digestibilidade aparente da MS e da matéria orgânica em relação às vacas que foram alimentadas AL. A espessura de gordura de cobertura, o mesenterio e a gordura interna foram maiores para as vacas alimentadas AL em relação às vacas alimentadas a NM, sendo a única exceção, a espessura de gordura de coberta aos 139 dias, que foi similar para os dois SA. As vacas alimentadas AL apresentaram maior excreção de N nas fezes em relação às vacas alimentadas a NM. A glândula mamária foi mais pesada em vacas alimentadas AL em relação às vacas alimentadas a NM, e o maior valor foi observado aos 268 dias de gestação. O SA não influenciou o peso fetal. A maior parte dos órgãos fetais tiveram pesos similares para as vacas alimentadas AL e a NM. Estes dados indicam que a restrição alimentar não afeta o desenvolvimento da maior parte dos órgãos fetais e o próprio desenvolimento fetal. Entretanto, o peso de alguns órgãos maternos foram afetados de acordo com o SA oferecido. Além disso, o efeito negativo sobre a glândula mamária causado pelo SA a NM provavelmente não afetará as subsequentes lactações, porque a concentração de proteína bruta na glândula mamária aumentou com o fornecimento da dieta a NM. Nós sugerimos que a dieta AL para vacas leiteiras deve ser fornecida com cuidado devido ao aumento de gordura observado nessa vacas a 268 dias de gestação. A placenta foi mais pesada em vacas alimentadas a NM em relação às vacas alimentadas AL aos 268 dias de gestação. Ainda, a placenta foi mais leve aos 139 dias e mais pesada aos 268 dias de gestação em vacas alimentadas a NM. Entretanto, para as vacas alimentadas AL, a placenta foi mais pesada a partir de 199 dias de gestação. Os placentomas foram mais pesados em vacas alimentadas a NM durante a gestação e o número de placentomas foi maior em vacas alimentadas a NM aos 268 dias de gestação. Nós observamos que os genes IGFR1 e IGFR2 foram responsáveis por adaptações placentárias quando a dieta a NM foi fornecida, pois as suas expressões em células de placentomas foram maiores em vacas alimentadas a NM aos 268 dias de gestação. Os genes reponsáveis pela angiogênese também tiveram maior expressão em vacas alimentadas a NM. A expressão dos genes VEGFA, GUCYB3, HIFA, FGF2 e NOS3 foi alterada pela interação entre SA e DG sendo maior em vacas alimentadas a NM aos 268 dias de gestação. Ainda, VEGFB e ANGPT2 não apresentaram interação entre SA e DG, mas tiveram maior expressão em vacas alimentadas a NM. Assim, nós recomendamos o NM (1,15 % do PC - dieta composta por 93% de volumoso) como o SA para vacas gestantes secas. No entanto, durante o último mês de gestação, o SA AL parece ser o mais apropriado para evitar a perda de peso. No entanto, caso a dieta AL seja fornecida a vacas secas gestantes, isso deverá ser feito com cautela porque há um aumento na gordura da glândula mamária aos 268 dias de gestação. Ainda, nós sugerimos que a placenta de vacas alimentadas a NM desenvolve adaptações ao reduzido suprimento de nutrientes alterando sua estrutura e a expressão genética; desenvolvendo assim, mecanismos para um potencial aumento na transferência de nutrientes ao feto.Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológic
Author-wise bibliometric analysis based on entropy.
No full textAuthor-wise bibliometric analysis based on entropy.</p
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