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Epidémiologie des infections à Streptococcus pneumoniae de patients hospitalisés aux Hôpitaux Universitaires de Genève de 1994 à 2003
Notre étude épidémiologique rétrospective (3356 patients de tous âges hospitalisés de 1994 à 2003 aux Hôpitaux Universitaires de Genève) sur les infections pneumococciques invasives et non invasives s'est intéressée à la prévalence de la résistance aux antibiotiques, surtout à la pénicilline en fonction du type de prélèvements biologiques, de la tranche d'âge et du sérotype. Le nombre d'infections a été en moyenne de 330 (± 26) par an. Les enfants ont présenté davantage d'infections ORL contrairement aux personnes âgées (infections bronchopulmonaires). Durant l'étude, nous avons constaté une augmentation continue de l'incidence de la résistance à la pénicilline statistiquement significative entre 1994 et 1998 et 1994 et 2003. Les enfants ont été significativement plus à risque de développer une infection pneumococcique causée par des souches résistantes, essentiellement au niveau des voies respiratoires supérieures et inférieures avec une haute prévalence des sérotypes 14 et 23 F, contenus dans le vaccin conjugué heptavalent
Going Beyond Counting First Authors in Author Co-citation Analysis
The present study examines one of the fundamental aspects of author co-citation analysis (ACA) - the way co-citation
counts are defined. Co-citation counting provides the data on which all subsequent statistical analyses and mappings
are based, and we compare ACA results based on two different types of co-citation counting - the traditional type that
only counts the first one among a cited work's authors on the one hand and a non-traditional type that takes into
account the first 5 authors of a cited work on the other hand. Results indicate that the picture produced through this non-traditional author co-citation counting contains more coherent author groups and is therefore considerably clearer. However, this picture represents fewer specialties in the research field being studied than that produced through the traditional first-author co-citation counting when the same number of top-ranked authors is selected and analyzed. Reasons for these effects are discussed
Variations on the Author
“Variations on the Author” discusses two of Eduardo Coutinho’s recent films (Um Dia na Vida, from 2010, and Últimas Conversas, posthumously released in 2015) and their contribution to the general question of documentary authorship. The director’s filmography is characterized by a consistent yet self-effacing form of authorial self-inscription: Coutinho often features as an interviewer that rather than express opinions propels discourses; an interviewer that is good at listening. This mode of self-inscription characterizes him as an author who is not expressive but who is nonetheless markedly present on the screen. In Um Dia na Vida, however, Coutinho is completely absent form the image, while Últimas Conversas, on the contrary, includes a confessional prologue that moves the director from the margins to the center of his films. This article examines the ways in which these works stand out in the filmography of a director who offers new insights into the notion of cinematic authorship
Les réservoirs à calcium dans les cellules granulocytaires humaines: caractérisation de la Ca²⁺-ATPase intracellulaire
Le calcium ionisé est un second messager cellulaire impliqué dans divers processus d'activation cellulaire. La régulation de la concentration du calcium ionisé intracellulaire dépend entre autres de structures subcellulaires spécialisées capables de stocker le calcium et de le relâcher suite à une stimulation par des agonistes. L'objectif de ce travail était I) caractérisation et purification des compartiments intracellulaires stockant le calcium et II) compréhension de la fonction des différentes protéines de ces organelles. Le travail s'est porté sur la lignée leucémique humaine HL-60. Ces cellules constituent un excellent modèle pour la compréhension du comportement des neutrophiles. Résultats: 1) Purification des réservoirs calciques en fonction de marqueurs caractéristiques de l'organelle (Calréticuline, liaison à l'InsP₃, Ca²⁺-ATPase de type Serca) ; 2) Association fonctionnelle et immunocytochimique de la Ca²⁺-ATPase et du canal sensible à l'InsP₃ ; 3) Régulation de la Ca²⁺-ATPase ; 4) Cycle constant du calcium entre les organelles et le cytoplasme, même au repos
Impact des antibiotiques et des déterminants de résistance sur l'expression et le contrôle moléculaire des facteurs de virulence des souches nosocomiales de "Staphylococcus aureus"
La forte pression sélective des antibiotiques et l'augmentation croissante de la résistance à de nombreux antibiotiques ont un impact significatif sur la virulence des souches nosocomiales des staphylocoques dorés les plus adaptées au milieu hospitalier, surtout celles qui sont résistantes à la méticilline. Les souches de "S. aureus" résistantes aux fluoroquinolones deviennent plus adhérentes à des surfaces recouvertes de fibronectine après croissance en présence d'une concentration sub-inhibitrice de ciprofloxacine. Cette augmentation d'adhérence est due à deux protéines bactériennes liant spécifiquement la fibronectine, dont la synthèse est stimulée par la ciprofloxacine par l'intermédiaire du système RecA-LexA de réparation de l'ADN bactérien. Ce travail décrit la contribution du facteur de transcription alternatif Sigma B à l'augmentation de l'adhérence à la fibronectine ainsi que son interaction avec le système RecA-LexA stimulé par la ciprofloxacine. Les systèmes Sigma B et RecA-LexA ont un effet combiné sur l'adhérence de "S. aureus" à la fibronectine
Impact de la résistance antibiotique et des fluoroquinolones sur l'adhérence à la fibronectine de "Staphylococcus aureus" : étude fonctionnelle et mécanismes moléculaires
"Staphylococcus aureus" est un pathogène majeur de l'homme ayant la particularité d'accumuler des déterminants de résistance aux antibactériens. "S. aureus" exprime à sa surface des adhésines régulées, liant spécifiquement des protéines du plasma ou de la matrice-extracellulaire. Cette espèce peut ainsi provoquer des infections localisées, résultant souvent de blessures ou de la présence de biomatériaux implantés. Cette étude décrit un phénomène nouveau, impliquant les souches combinant les mutations de résistance aux fluoroquinolones. Ces souches hautement résistantes voient leur adhérence à la fibronectine augmenter significativement après croissance en présence de concentrations sous-inhibitrices de ciprofloxacine. Cet accroissement d'adhérence s'explique par une augmentation des adhésines induites au niveau du promoteur du gène codant l'adhésine de type B. L'inactivation de "recA" par mutagenèse spécifique a permis d'identifier le rôle important joué par ce facteur clé de la recombinaison homologue et de la réponse SOS dans l'augmentation de l'adhérence par la ciprofloxacine
Appropriate Similarity Measures for Author Cocitation Analysis
We provide a number of new insights into the methodological discussion about author cocitation analysis. We first argue that the use of the Pearson correlation for measuring the similarity between authors’ cocitation profiles is not very satisfactory. We then discuss what kind of similarity measures may be used as an alternative to the Pearson correlation. We consider three similarity measures in particular. One is the well-known cosine. The other two similarity measures have not been used before in the bibliometric literature. Finally, we show by means of an example that our findings have a high practical relevance.information science;Pearson correlation;cosine;similarity measure;author cocitation analysis
Utilisation de microarrays pour la détermination de l'origine communautaire ou hospitalière du "Staphylococcus aureus"
Les "staphylococcus aureus" résistants à la méthicilline (SARM) ont longtemps été considérés comme des pathogènes hospitaliers. Des études récentes montrent son émergence au sein de la communauté. L'identification de marqueurs génétiques spécifiques de ces populations est indispensable pour la compréhension de l'épidémiologie des SARM. Nous avons utilisé un microarray couvrant > 99% des quatre génomes de S. aureus séquencés afin d'évaluer le contenu génomique complet des SARM hospitaliers et communautaires. Nous avons comparé cette approche avec d'autres méthodes de typage moléculaire, l'antibiogramme, le toxinogramme et le type d'élément conférant à la résistance à la méthicilline, sur une collection de 15 souches cliniques. Le contenu des différents clusters obtenus par les différentes méthodes est très conservé. Cependant seuls les microarrays permettent d'identifier des marqueurs spécifiques de l'origine des souches. L'approche par microarrays nous a aussi permis de définir pour les 2 populations de staphylocoques des gènes ou régions chromosomiques spécifiques, issues de transferts horizontaux
Molecular regulation of tst superantigen expression by global regulatory systems in Staphylococcus aureus
Staphylocoque doré est un dangereux pathogène, capable de diverses formes d'infections, dont le Toxic Shock Syndrome. Ce travail étudie la régulation génique de tst, codant TSST-1, la toxine du Toxic Shock, au niveau moléculaire. Bien que situé sur un élément génétique mobile, les résultats montrent que tst est finement régulée et de manière complexe par les voies de régulation endogènes suivantes : SarA (S. aureus accessory regulator), le facteur de stress sigmaB, SarS, le senseur du quorum agr/Rot et le système deux composant SrrAB. A l'exception du senseur du quorum agr les autres voies semblent être répressives, soit directement comme le facteur de transcription SarA, qui se lie au promoteur de tst, soit indirectement comme sigmaB. La voie SrrAB (Staphylococcal respiratory response) active l'expression de TSST-1 en aérobiose et la réprime en anaérobiose, cela grâce à la phosphorylation de l'aspartate D53 de SrrA par l'histidine H369 de la kinase SrrB
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